The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
64
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structure length |
64
|
Chain Sequence |
GSPEETLVIALYDYQTNDPQELALRCDEEYYLLDSSEIHWWRVQDKNGHEGYAPSSYLVEKSPN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
NMR structure note: murine Itk SH3 domain
rcsb |
molecule tags |
Transferase
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source organism |
Mus musculus
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molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase ITK/TSK
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total genus |
9
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structure length |
64
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sequence length |
64
|
ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
pdb deposition date | 2007-12-08 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1PNJ A; 3UA6 A; 3VS1 A; 2AKK A; 2KT1 A; 2CH4 W; 3PE0 A; 1QWF A; 4KRT A; 2V1Q A; 1QKW A; 2K79 A; 2RQR A; 2O2O A; 2CSI A; 1WDX A; 3H0I A; 2OJ2 A; 2K2M A; 1VA7 A; 2DJQ A; 2KXD A; 4Y92 A; 1ZX6 A; 1YNZ A; 1NEB A; 1QWE A; 2PZ1 A; 3FJ5 A; 4CC4 B; 1AZE A; 4RTX A; 1JXO A; 3O5Z A; 1YP5 A; 5IH2 A; 2YT6 A; 3A98 A; 4OMQ A; 4AFZ C; 2J6K A; 1UGV A; 4A63 B; 1SRM A; 3IQL A; 3QWX X; 2RN8 A; 1GFD A; 4F17 A; 1SHG A; 4EIK A; 2HBW A; 3THK A; 3M0S A; 4J9E A; 1ZSG A; 1T0J A; 4JPB W; 1UUE A; 2MCN A; 4IIO A; 1MV0 B; 2K3B A; 2KRO A; 3REA B; 1MUZ A; 2E5K A; 1WA7 A; 2YUN A; 1PRM C; 2DL5 A; 3H0F A; 3NHN A; 1KIK A; 1BBZ A; 2KRN A; 2P4R A; 2CSQ A; 1E6G A; 2DIL A; 2DE0 X; 2EBP A; 2HDA A; 1UJY A; 2VKN A; 2JTE A; 2KR3 A; 1VYU A; 1OV3 A; 1BU1 A; 2NWM A; 4LUE A; 1AZG B; 1E7O A; 4QT7 A; 2DBK A; 2DNU A; 2FRY A; 2HSP A; 1ABQ A; 2GGR A; 1W1F A; 4OMO A; 3TSW A; 3RBB B; 2CUB A; 1AD5 A; 2GNC A; 2KNB B; 1VYT A; 3TVT A; 2FEI A; 2EPD A; 1K4U S; 3ULR B; 2SEM A; 2L2P A; 2GQI A; 1UDL A; 1G2B A; 1I0C A; 1RLQ C; 1OOT A; 1T3S A; 4HXJ A; 1UHF A; 1EFN A; 2DM1 A; 2DF6 A; 3NGP A; 4OMP A; 1UHC A; 2X3W D; 3VS7 A; 2LJ3 A; 2M51 A; 1GL5 A; 2DA9 A; 2DL4 A; 2OAW A; 3EHR A; 4CC3 A; 1X69 A; 2D8H A; 4AFQ C; 4J9C A; 2KEA A; 1K1Z A; 3ZL7 C; 5L23 A; 1W70 A; 2GTO A; 2BZX A; 1JEG A; 1ARK A; 2KXC A; 2M0Y A; 3REB B; 1NLO C; 4J9B A; 1WLP B; 1U06 A; 4RTV A; 4D8K A; 2A36 A; 4RTT A; 1YCS B; 1UTI A; 2VWF A; 1G83 A; 1PRL C; 4CC2 A; 4D8D A; 2BZY A; 3NPF A; 2J6F A; 1XOV A; 2RF0 A; 1UJ0 A; 1QLY A; 1ZUY A; 1QKX A; 1ZUK A; 3VS3 A; 5ECA A; 1S1N A; 1RI9 A; 4LUD A; 2O9V A; 1AEY A; 2CRE A; 3I35 A; 3M0P A; 1Y57 A; 4R0K A; 5GJW B; 4LN2 A; 4AFU C; 1HJD A; 1TUC A; 1ZLM A; 2K7A A; 1QCF A; 1I07 A; 2J05 A; 1UFF A; 5IXB A; 1SEM A; 1U3O A; 1YWO A; 1ZBJ A; 2JS2 A; 2JT4 A; 4J9H A; 2LP5 A; 1AWW A; 1GFC A; 1NLP C; 1LCK A; 3SHW A; 2EGC A; 2KRM A; 2EGE A; 1VYV A; 4E6R A; 1Y0M A; 3JV3 A; 4CC7 A; 1H3H A; 2CT4 A; 2I0N A; 2KYM A; 4HVV A; 5IHI A; 1PWT A; 2LJ1 A; 5I11 A; 2SRC A; 2RQW A; 2ECZ A; 4RTY A; 1CKB A; 1V1C A; 4OMM A; 1AVZ C; 4Z88 A; 3VS0 A; 2K6D A; 1MV3 A; 4GBQ A; 2QDL A; 2EYW A; 2EW3 A; 2MOX A; 3QWY A; 1JO8 A; 2KRS A; 1H8K A; 2JW4 A; 2DL8 A; 1B07 A; 1CSK A; 4WCI A; 1WIE A; 5EC7 A; 4ZNX A; 1K9A A; 2A08 A; 4HCK A; 3VRZ A; 2ESW A; 2EYX A; 2LMJ A; 3H0H A; 1BK2 A; 1WXT A; 3CQT A; 1M8M A; 2RMO A; 4FSS A; 4RTW A; 1OPK A; 2F2X A; 1YWP A; 1FMK A; 2O31 A; 3UA7 A; 1GBR A; 2IIM A; 2RQV A; 1HD3 A; 3RNJ A; 1RUW A; 1X27 A; 2W0Z A; 2OI3 A; 2DVJ A; 4RUG A; 1KSW A; 3EGU A; 1OEB A; 4OML A; 1M3C A; 1WX6 A; 2CUD A; 2O88 A; 2YUP A; 2PNI A; 2LNH B; 2W10 A; 3U23 A; 1AOJ A; 2MIO A; 4AG1 C; 1FYN A; 1KFZ A; 4RTZ A; 2NUZ A; 1SPK A; 1JXM A; 2HEQ A; 2YDL A; 4OMN A; 3UF4 A; 3EHQ A; 1X43 A; 1YN8 A; 2V1R A; 2LCS A; 4ORZ A; 2EQI A; 3R6N A; 5GJV B; 4IIM A; 2X3X D; 4LE9 A; 5FWC A; 3M0R A; 1X6B A; 2O9S A; 1PKT A; 3I5S A; 2C0I A; 2J7I A; 3VS6 A; 1J3T A; 1H92 A; 2BTT A; 2FPD A; 1AWX A; 1CKA A; 2DBM A; 4DEY A; 2HCK A; 3EG3 A; 2A28 A; 1RLP C; 1GCQ C; 4F14 A; 2KYB A; 1B3Q A; 5I22 A; 2DRM A; 1M3B A; 3EG2 A; 2ENM A; 2G6F X; 3M0Q A; 1N5Z A; 2AK5 A; 1K76 A; 3M0T A; 2RPN A; 1A0N B; 1X2K A; 2EGA A; 2XMF A; 4JJD A; 2DRK A; 1WI7 A; 5FWB A; 1GCQ A; 2LJ0 A; 4K11 A; 5HCK A; 4JJB A; 1HSQ A; 1SHF A; 2JS0 A; 2LQW A; 1JQQ A; 1UG1 A; 1PKS A; 2CT3 A; 1I1J A; 2DX1 A; 2RNA A; 4J9F A; 3NMZ C; 1TG0 A; 1T0H A; 1OPL A; 2C0T A; 1GRI A; 2DLP A; 1AWJ A; 1E6H A; 1X6G A; 1JU5 C; 1M3A A; 5FW9 A; 1PHT A; 3I5R A; 2BZ8 A; 2L3Q A; 2GBQ A; 3PVL A; 2JXB A; 2DL3 A; 3H41 A; 2ED0 A; 1W6X A; 2F2W A; 1IO6 A; 1WXB A; 1GBQ A; 2RQT A; 2FO0 A; 2ABL A; 3KFV A; 4AFS C; 1UEC A; 2KE9 A; 2YSQ A; 4F16 A; 2JMC A; 2L0A A; 1WYX A; 1NG2 A; 2LX7 A; 1NYF A; 2D1X A; 1WXU A; 4RTU A; 2AZV A; 1U5S A; 3SEM A; 1WFW A; 2LQN A; 4J9I A; 3VS2 A; 2KT8 A; 2KGT A; 1Z9Z A; 1UE9 A; 1KJW A; 3I9Q A; 3PVQ A; 4HVW A; 3EG0 A; 2EYY A; 2DL7 A; 4J9G A; 4Z8A A; 2FPF A; 2JM9 A; 2YUO A; 2PTK A; 2K9G A; 2YUQ A; 2KBT A; 2F2V A; 4JZ3 A; 1ABO A; 4ESR A; 2FRW A; 2L3S A; 3TSZ A; 2JM8 A; 2FPE A; 1SSH A; 1X2Q A; 2AKL A; 2AZS A; 2EVR A; 1K0S A; 1ZUU A; 2A37 A; 3VRY A; 4DEX A; 2D8J A; 4X1V A; 3LH5 A; 3EG1 A; 2CDT A; 2ED1 A; 2LZ6 B; 2JMA A; 3C0C A; 1GCP A; 2C0O A; 4GLM A; 4AG2 C; 2J06 A; 2FG0 A; 2EYZ A; 2VVK A; 2D0N A; 5IXF A; 4JJC A; 3VS4 A; 2J6O A; 4Z89 A; 4JZ4 A; 1NYG A; 2L3P A; 4M4Z A; 5IHK A; 2CH4 A; 1BB9 A; 1SRL A; 5IHN A; 1K0X A; 3M0U A; 1Z9Q A; 2ROT A; 2RQU A; 3VS5 A; 4HVU A; 3UAT A; 1NEG A; 4J9D A; 2GTJ A; 2DYB A; 1TUD A; 1T3L A; 1M27 C; 2ROL A; 3GBQ A; 1AWO A; 1NM7 A; 2H8H A; 2B86 A; 2DMO A; 4LNP A; 2EKH A; 1M30 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3VS1 A; 4L6V 5; 2AKK A; 1TH7 A; 4L5G A; 1VQ7 Q; 3G4S A; 4PJO F; 2V1Q A; 3CCR A; 5DM7 R; 3CCM Q; 2H3J A; 2D6F A; 1WDX A; 2PUO B; 3X25 B; 3SWN A; 1UGS B; 5FRN A; 1WQ7 A; 4PJO B; 1VQO T; 1BIA A; 2X4Y A; 4N4G A; 2X9H A; 1PD0 A; 5DLO A; 1VQ6 A; 8ATC B; 1AZE A; 3L2W A; 1JXO A; 1YP5 A; 5IH2 A; 2YT6 A; 3EGX B; 2YLC A; 3NFC A; 2LCL A; 2O4X A; 2WAC A; 3A98 A; 4BE2 A; 4AFZ C; 4M7D E; 3S6W A; 1FWZ A; 3UDC A; 3G4S Q; 1W4S A; 3CCR Q; 1W2B A; 4EDU A; 3QG1 A; 1SHG A; 3M0S A; 1Y71 A; 3OW2 P; 1ZQ1 A; 2D0Q B; 1RAI B; 2XDD A; 1G3Y A; 4PFZ A; 3E19 A; 3SD4 A; 1KHI A; 1VQ6 Q; 1MV0 B; 3G7Z A; 3M54 A; 4M75 E; 2O01 E; 2HSE B; 3NTK A; 2RHX A; 2HMA A; 2LT1 A; 3FIF A; 2V8J A; 4C92 E; 4P5N A; 3NHN A; 1WQW A; 5CQY A; 3JB9 F; 4E7L A; 3A8M B; 4PJO C; 4LDX A; 1E6G A; 2DIL A; 2GQV A; 4XTY A; 1M5Q 1; 3CCS A; 2MWP A; 2DE0 X; 3CCU Q; 2HDA A; 3CXC P; 3DLL A; 4IUQ A; 4J6X A; 1BU1 A; 2YRV A; 1YJN Q; 3JB9 I; 1ABQ A; 2K5I A; 1W1F A; 3QDF A; 4PJO A; 4FIB A; 3C94 A; 1TUG B; 2RH2 A; 3OYG A; 2V8I A; 4M78 E; 4M7D G; 3OYE A; 3FRN A; 3TVT A; 2FEI A; 1M2V B; 1Q81 U; 5GAN d; 1GXI E; 3CCS Q; 1T3S A; 4M7A B; 4HXJ A; 3CCQ A; 1D0X A; 1M4Z A; 3CPW S; 3EGX A; 3OY9 A; 2FZK B; 1TOV A; 2KMT A; 2XDP A; 4L59 A; 2X3W D; 5I2S A; 1PC0 A; 2DZ9 A; 3VS7 A; 2QI2 A; 2LQ8 A; 3EH1 A; 3A8H B; 1YIT A; 2D8H A; 3L1A A; 2FVU A; 3TRE A; 2KEA A; 3ZL7 C; 2OTJ A; 2GTO A; 2BZX A; 4BAC A; 5HK0 A; 4KUD K; 4R56 A; 2H3E B; 2MK5 A; 4RTT A; 3PIO A; 3CCQ Q; 3L42 A; 4EPC A; 1XOV A; 4C0D B; 1UJ0 A; 5J3B A; 3ER0 A; 2RJC A; 1I5O B; 4GY5 A; 1YIT Q; 1PSE A; 2CRE A; 1Y57 A; 4R0K A; 2OTJ Q; 3OS0 A; 4M78 G; 1HJD A; 5KYW A; 1ZLM A; 2J05 A; 3MCA B; 4KT0 E; 1UFF A; 1PCX A; 2JT4 A; 2DZC A; 4J9H A; 2LP5 A; 3WXM B; 1GFC A; 1NLP C; 1LCK A; 5LJ3 h; 3RUX A; 2KRM A; 3LWH A; 5GAO m; 2KQW A; 1WJS A; 3JV3 A; 4CC7 A; 1H3H A; 4B9W A; 2KYM A; 1R8O B; 1M2V A; 1R0C B; 2V8K A; 1YFN A; 4WF2 A; 1VQ5 A; 2RQW A; 5DLQ E; 2ECZ A; 2F5K A; 1MV3 A; 1H64 1; 2VUB A; 2QDL A; 3LGF A; 3V7S A; 3PMT A; 1JO8 A; 2KRS A; 4KBM B; 2JW4 A; 1YHQ A; 4QVD A; 2C06 A; 4FYX B; 1WIE A; 1VIF A; 4XTZ A; 2ESW A; 2LMJ A; 4C0D C; 1WXT A; 2OTL A; 3CQT A; 4XU0 A; 1M8M A; 4RTW A; 1G3W A; 3URG A; 3OA6 A; 3SB2 A; 3PT9 A; 3FC3 A; 3GF5 A; 3VU3 C; 4BD3 A; 4M75 A; 2DXU A; 1VQ5 Q; 2IIM A; 2RQV A; 5KCH A; 4C92 A; 2W0Z A; 1YJ9 T; 1NE8 A; 1OEB A; 2DXC A; 2NYS A; 1VQ4 A; 3U23 A; 2W10 A; 1D3B B; 2EWN A; 2ZPB B; 2BIV A; 1NZ9 A; 5LJ3 g; 4F7U E; 4BI3 A; 2OTL Q; 1WHL A; 1FYN A; 3PNW C; 1VQL A; 2V26 A; 1I4K 1; 2HEQ A; 1PG5 B; 5FRO A; 3UF4 A; 1X43 A; 3QBY A; 3JCM P; 2DYI A; 1N8R C; 3CD6 T; 1YJW T; 1K73 C; 3CCJ T; 3R6N A; 5KYN A; 4IIM A; 2QTX A; 4X9D A; 1BCO A; 2HKN A; 3M0R A; 1VQ4 Q; 4D6W A; 3VS6 A; 2A0F B; 1J3T A; 1QCO A; 2BTT A; 2FPD A; 1AWX A; 1M9S A; 3BW1 A; 4C8Q B; 3S3O A; 2LCC A; 3EG3 A; 1IXD A; 3JCM X; 1VQ7 T; 4E7K A; 4MDX A; 3CCM T; 4XTW A; 5I22 A; 4IUT A; 3EG2 A; 1WJQ A; 3N5B B; 2VYT A; 3QJY A; 1N5Z A; 3M0T A; 1K76 A; 1X2K A; 1VQO Q; 2CYZ B; 4X9C A; 1QVG S; 1WI7 A; 3FB9 A; 5KYY B; 1U8R A; 4K11 A; 1MHN A; 4F7U G; 2XID A; 3G4S T; 4ZTJ A; 1KK7 A; 3CCR T; 4IUP A; 1TG0 A; 1T0H A; 4A4G A; 2MPX C; 3A8O B; 3CCL T; 2M16 A; 1D3B A; 1E6H A; 2RK2 A; 3UPU A; 5FW9 A; 3CC4 A; 3I5R A; 5GAM h; 1YBY A; 2BZ8 A; 3I56 A; 4JDS A; 4YTL A; 2M1H A; 1WXB A; 2VC8 A; 1KG1 A; 2YXY A; 1UEC A; 2YHT A; 4F16 A; 2DJZ A; 3X20 B; 2FZC B; 5L8R E; 1WYX A; 3MEU A; 5LJ3 e; 4OB3 B; 1NYF A; 2D1X A; 4RTU A; 2DAQ A; 2AZV A; 5A0D A; 4DBR A; 1XNI A; 5CQX A; 3BDL A; 1WHJ A; 4J7I A; 3C12 A; 4PKC C; 2JZ2 A; 2R5M A; 1KJW A; 2XK0 A; 3MHX A; 5EG2 A; 3CC4 Q; 1VQK A; 3HFN A; 4BY6 B; 3PVQ A; 2KI7 A; 1XTD A; 4J9G A; 3OW2 A; 3OYK A; 3SFM A; 3I56 Q; 2LC4 A; 1X01 A; 3CBP A; 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5KE3 A; 4J5Y A; 1SF9 A; 1VUB A; 1YCY A; 3V7R A; 4O6J A; 2DXT A; 2K57 A; 1OQK A; 3RIR A; 4V2S A; 2E5K A; 1WA7 A; 1PRM C; 5LL6 S; 2DFU A; 3H0F A; 3E9F A; 1KD1 R; 2HZY A; 4KUL A; 1VQ5 T; 1D09 B; 2EBP A; 3MET A; 2ZZD A; 1UJY A; 3ASK A; 2KR3 A; 1NPP A; 1VYU A; 1YHQ T; 4QKU A; 2P4T A; 1QCN A; 2GGR A; 2COW A; 4BE1 A; 4LD6 A; 2OTL T; 2HKQ B; 3RBB B; 2GNC A; 3E1S A; 1VYT A; 4HCB A; 1UDL A; 1G2B A; 4OF1 A; 2WSF E; 1OOT A; 3EAE A; 1M2O A; 1EFN A; 3CD6 Q; 2DF6 A; 3NGP A; 1UHC A; 4O5V A; 1VQ4 T; 2E3I A; 2LJ3 A; 2M51 A; 1GL5 A; 2DL4 A; 3EHR A; 3L2Z A; 3T9N A; 2QQB A; 2QG9 B; 1VQL T; 3OSS C; 4JLI A; 1B34 B; 3BE3 A; 2JN0 A; 3ME9 A; 2RHZ A; 4BI8 B; 3GNF B; 2DER A; 1JEG A; 1ARK A; 2KXC A; 3REB B; 1NLO C; 1SSF A; 4J9B A; 1WLP B; 2A36 A; 1YCS B; 1UTI A; 2VWF A; 4C5G A; 3CCL A; 4CC2 A; 2BZY A; 3NPF A; 1M1K R; 2EKO A; 1QLY A; 1U1T A; 3LWI A; 1H3Z A; 1NBE B; 3Q1J A; 1NPR A; 3QKJ A; 5GAN h; 4M77 E; 2QQA A; 4KGX B; 1S1N A; 4LUD A; 1TU0 B; 4JRI A; 2KK4 A; 3CCE A; 4QQD A; 4MZT A; 4LN2 A; 2KSS A; 1TUC A; 2K7A A; 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