The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
|
sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
GSVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGACHGQTGMFPRNYVTPVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Distinct Binding Modes of Two Epitopes in Gab2 that Interact with the Sh3C Domain of Grb2.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
GROWTH FACTOR RECEPTOR-BOUND PROTEIN 2
|
| total genus |
14
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-06-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2FG0 A; 2ESW A; 5IXB A; 2D8J A; 4J9C A; 2DBK A; 3EG3 A; 2GNC A; 1ZBJ A; 1X27 A; 2BZX A; 2HSP A; 3PVQ A; 2GGR A; 3VS1 A; 1K0S A; 1K4U S; 1UTI A; 4JJC A; 1YNZ A; 4ZNX A; 2L0A A; 1JU5 C; 1SHF A; 2DA9 A; 1UGV A; 1T3L A; 2GQI A; 1T0H A; 3VRZ A; 2AZV A; 2JTE A; 2O88 A; 1K1Z A; 2J6F A; 2HBW A; 4J9F A; 1NM7 A; 3M0S A; 2A36 A; 2YSQ A; 2FO0 A; 3RBB B; 2XMF A; 2DNU A; 2W0Z A; 4K11 A; 3O5Z A; 2KRS A; 1H3H A; 2A37 A; 3UF4 A; 2DL4 A; 1OOT A; 2KT8 A; 1Y0M A; 1WLP B; 1WXT A; 1Z9Z A; 1SSH A; 2AZS A; 5L23 A; 3TVT A; 2AK5 A; 2LQN A; 2C0T A; 1ABQ A; 2V1Q A; 4J9B A; 4AFS C; 2E5K A; 2J6K A; 4CC2 A; 1OV3 A; 2RQR A; 4HVW A; 1VYV A; 4LUE A; 2VKN A; 1SRM A; 1T3S A; 4CC3 A; 2V1R A; 5IHI A; 5HCK A; 2KGT A; 2D8H A; 2RN8 A; 1HSQ A; 2RQV A; 4DEY A; 2DVJ A; 1YWP A; 2LJ1 A; 3REA B; 2CSI A; 3I35 A; 2MOX A; 2AKK A; 3EGU A; 2KRO A; 2EGE A; 1FMK A; 4GLM A; 1ABO A; 1ARK A; 2YT6 A; 2W10 A; 3I9Q A; 1M3C A; 4WCI A; 4AG2 C; 1ZUK A; 2CSQ A; 2ROL A; 1PKT A; 1A0N B; 1S1N A; 4R0K A; 1AZG B; 1M8M A; 4RTZ A; 1OPL A; 4RTX A; 2CT4 A; 2ENM A; 2KEA A; 3THK A; 3VS5 A; 4IIO A; 1WXB A; 3M0T A; 2JM9 A; 2EKH A; 2LX7 A; 4RTV A; 2RQT A; 1PKS A; 2YDL A; 3VS2 A; 4A63 B; 5FW9 A; 2IIM A; 3C0C A; 1HD3 A; 2BTT A; 3EG1 A; 3VS4 A; 3H0I A; 4JPB W; 1LCK A; 1GBR A; 1BK2 A; 2K6D A; 4HCK A; 5FWB A; 2RPN A; 2KR3 A; 1RLQ C; 4JJB A; 1X2K A; 4OML A; 2RF0 A; 2PTK A; 2SRC A; 1PRM C; 4LE9 A; 3VS3 A; 4RTT A; 2GBQ A; 1UG1 A; 2KYM A; 4OMP A; 4CC4 B; 4OMO A; 1ZSG A; 2O9V A; 1M30 A; 2LQW A; 2O2O A; 4F17 A; 1UEC A; 1ZX6 A; 3NMZ C; 1WXU A; 2BZY A; 1SEM A; 1JXM A; 1E6H A; 1NYF A; 1I1J A; 2J05 A; 3LH5 A; 3VS7 A; 1SRL A; 2EGA A; 2KRN A; 1K9A A; 3EG0 A; 2CH4 A; 1UE9 A; 3M0P A; 2KE9 A; 4OMM A; 2JXB A; 4J9I A; 2KRM A; 2LP5 A; 4J9G A; 1M27 C; 1AWJ A; 1QWE A; 2BZ8 A; 2MCN A; 1KJW A; 2CRE A; 4D8K A; 2VVK A; 2CT3 A; 4QT7 A; 4HVV A; 2EPD A; 1OEB A; 2EYX A; 5FWC A; 4CC7 A; 4JZ3 A; 2FPF A; 2DM1 A; 1CKA A; 2L3P A; 2RNA A; 2OAW A; 3JV3 A; 1GCQ C; 1KSW A; 1NG2 A; 1VYT A; 2I0N A; 1UFF A; 2JS2 A; 2O9S A; 3M0R A; 3H41 A; 2KXC A; 1NLO C; 2O31 A; 1GL5 A; 2DF6 A; 3QWX X; 2DBM A; 1RUW A; 1UHC A; 3EHR A; 1B3Q A; 2F2W A; 2GTO A; 1J3T A; 3EG2 A; 2KT1 A; 3RNJ A; 2F2V A; 3NHN A; 2H8H A; 1NEG A; 1CKB A; 3VS0 A; 3R6N A; 1VYU A; 2RQU A; 1VA7 A; 4LN2 A; 1AOJ A; 1X6G A; 4LNP A; 2JT4 A; 1AVZ C; 2X3X D; 2G6F X; 1SPK A; 2JMA A; 1U5S A; 4D8D A; 1Y57 A; 5IH2 A; 1I07 A; 2DRK A; 2EYZ A; 1HJD A; 2FEI A; 2DMO A; 4J9D A; 1QWF A; 2F2X A; 1W6X A; 2X3W D; 3H0H A; 4RTU A; 1RLP C; 3FJ5 A; 1YWO A; 4EIK A; 1TG0 A; 1H8K A; 2M51 A; 2KNB B; 4FSS A; 1JO8 A; 1JEG A; 1MV3 A; 2YUO A; 1X69 A; 2LMJ A; 3CQT A; 1PWT A; 1X6B A; 2DL8 A; 2LNH B; 2ECZ A; 2K7A A; 2JMC A; 3A98 A; 4AFZ C; 1T0J A; 1TUD A; 2B86 A; 4F14 A; 2YUN A; 3TSZ A; 1KIK A; 1JXO A; 3PE0 A; 4AFU C; 1JQQ A; 1NEB A; 1WI7 A; 1WX6 A; 1AWO A; 4J9H A; 1UHF A; 1WA7 A; 2MIO A; 4J9E A; 5IHN A; 4Z88 A; 3IQL A; 2JM8 A; 3M0Q A; 4RUG A; 1AD5 A; 1GCQ A; 1UDL A; 1YP5 A; 3ZL7 C; 1OPK A; 2J7I A; 2P4R A; 2HDA A; 2RQW A; 4GBQ A; 1EFN A; 2PZ1 A; 5I11 A; 2LZ6 B; 4Z89 A; 4JJD A; 2CUD A; 1K0X A; 1GFC A; 4LUD A; 2FPD A; 1UJY A; 2LJ0 A; 3SHW A; 3M0U A; 3UAT A; 1NYG A; 1FYN A; 1TUC A; 2DRM A; 1X2Q A; 1BB9 A; 3I5R A; 3PVL A; 2FPE A; 1G83 A; 3VRY A; 2HCK A; 2EBP A; 2K9G A; 4HXJ A; 3VS6 A; 3SEM A; 4Z8A A; 2FRY A; 3UA7 A; 4RTW A; 1CSK A; 4X1V A; 4ESR A; 2DJQ A; 2RMO A; 1W1F A; 1PHT A; 2EGC A; 1AEY A; 2EQI A; 1W70 A; 3EHQ A; 2VWF A; 2SEM A; 4IIM A; 1N5Z A; 3KFV A; 1AWX A; 4OMQ A; 3GBQ A; 1E6G A; 1Z9Q A; 2AKL A; 1H92 A; 1G2B A; 5ECA A; 4F16 A; 2L3Q A; 4E6R A; 3U23 A; 2DL3 A; 1E7O A; 2C0I A; 2KBT A; 1KFZ A; 4AG1 C; 2LJ3 A; 1YCS B; 1QKX A; 2DYB A; 4Y92 A; 1YN8 A; 2KXD A; 1RI9 A; 1SHG A; 2FRW A; 2GTJ A; 2A28 A; 2ED0 A; 2LCS A; 2ED1 A; 1I0C A; 1UUE A; 2DE0 X; 2K79 A; 2KYB A; 4HVU A; 2DL7 A; 5IHK A; 2M0Y A; 2NUZ A; 3UA6 A; 2DLP A; 4KRT A; 2CDT A; 1U3O A; 1BBZ A; 3NPF A; 2NWM A; 1AZE A; 2QDL A; 2EYW A; 1MUZ A; 2ROT A; 2YUQ A; 2YUP A; 3REB B; 1QKW A; 3QWY A; 4ORZ A; 1ZLM A; 1QLY A; 1NLP C; 5GJV B; 2PNI A; 2C0O A; 2DL5 A; 1PRL C; 5IXF A; 2JS0 A; 5GJW B; 1ZUY A; 1ZUU A; 4DEX A; 2CUB A; 2J06 A; 2JW4 A; 3H0F A; 1GBQ A; 4OMN A; 1BU1 A; 5I22 A; 1WIE A; 2K3B A; 4JZ4 A; 2OJ2 A; 4M4Z A; 2DX1 A; 3TSW A; 1B07 A; 1GFD A; 1QCF A; 1GCP A; 1AWW A; 2D1X A; 1WFW A; 2D0N A; 1X43 A; 1WDX A; 1M3A A; 2ABL A; 2A08 A; 2L3S A; 1IO6 A; 2EW3 A; 4RTY A; 1V1C A; 1K76 A; 3NGP A; 2EYY A; 3I5S A; 1M3B A; 2L2P A; 2DIL A; 2EVR A; 2K2M A; 1MV0 B; 4AFQ C; 2J6O A; 1XOV A; 1GRI A; 1WYX A; 1U06 A; 2HEQ A; 1PNJ A; 2OI3 A; 2CH4 W; 3ULR B; 1UJ0 A; 5EC7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2RJE A; 3EAE A; 3M57 A; 3M55 A; 2CP3 A; 2DBK A; 3VUZ A; 3ZFJ A; 2QYZ A; 2R5M A; 4OB3 B; 4M77 C; 4JJC A; 4JUV A; 3UWN A; 4OVA A; 1ACM B; 3CCS Q; 2GFA A; 2FHD A; 3CCU Q; 3LYI A; 4QQG A; 2XK0 A; 3I56 A; 4BDZ A; 1T0H A; 2O88 A; 2COZ A; 2JTE A; 3I55 Q; 3M5A A; 5DLQ E; 1VQO A; 1G3W A; 5DM7 R; 2E70 A; 3QBY A; 2HBW A; 2YHT A; 1NM7 A; 2QTV A; 8AT1 B; 3M0S A; 2VXE A; 1RAG B; 2FO0 A; 2DNU A; 1VQ4 Q; 3H9N A; 2L3R A; 2QQ9 A; 3O5Z A; 1KC8 C; 2AIR B; 3CME T; 2YRC A; 2LC4 A; 2IG0 A; 2KT8 A; 2GF7 A; 4LD9 K; 1UB4 A; 1QQJ A; 4MMK A; 2AK5 A; 2LQN A; 3OYL A; 4J9B A; 2E5K A; 1D3B B; 3H6Z A; 2J6K A; 5KYY B; 5IAY A; 2ZCF B; 4N0A A; 3S6W A; 2E12 A; 4HVW A; 2L5Q A; 3X26 B; 7AT1 B; 1KC8 R; 2VKN A; 3EH1 A; 2V1R A; 3OQ5 A; 3GP8 A; 2RN8 A; 4DEY A; 3CEY A; 2MOX A; 3CCM A; 2KRO A; 1WHL A; 2EGE A; 4GLM A; 1ABO A; 3CCE T; 1D3B A; 3NTI A; 3I9Q A; 3CCL T; 5KYY A; 2CS7 A; 3RR6 A; 1ZUK A; 2O4X B; 4R0K A; 1VQM T; 1OPL A; 3OW2 P; 2EYQ A; 3VS5 A; 4IIO A; 4PJO G; 2LX7 A; 3J81 E; 4RTV A; 1WHH A; 1PKS A; 4M77 A; 4A63 B; 1KQ2 A; 3QO3 A; 3FRN A; 1TTH B; 1BCO A; 2JN0 A; 2AT1 B; 3BDU A; 4L6V 5; 4IUR A; 2KVQ G; 3H0I A; 3OYD A; 4RCC A; 1GBR A; 1BK2 A; 4HCK A; 1FX7 A; 2E10 A; 3CCE Q; 3X28 B; 1I81 A; 2QGG A; 3CD6 T; 4JJB A; 4OML A; 3G6E A; 1PRM C; 3OYC A; 1VQM Q; 4RTT A; 1XNI A; 1UG1 A; 1VIF A; 1WJQ A; 5GAN e; 5LJ3 d; 2KYM A; 2VB6 A; 2O9V A; 1M30 A; 3HRT A; 2O2O A; 2V8I A; 4F17 A; 3CCJ A; 1M8V A; 3KUF A; 2R5A A; 1ZX6 A; 1WXU A; 1QVF P; 4X9C A; 1E6H A; 2DVE A; 3VS7 A; 1I1J A; 5GAO l; 3LH5 A; 3SDZ A; 3I56 T; 1G8X A; 1G3Y A; 4KBM B; 4J9I A; 3LGL A; 4LDU A; 1N27 A; 1LVK A; 2M16 A; 2CZ0 B; 3HFN A; 4BI8 B; 1BYM A; 2OTL A; 1QWE A; 2BZ8 A; 4RG2 A; 4D8K A; 3CBM A; 2E4H A; 4QT7 A; 4JS4 A; 1D1C A; 4FW1 A; 3ASK A; 3T9N A; 3MP6 A; 4JZ3 A; 2DM1 A; 1CKA A; 3NTK A; 2L3P A; 2OX7 A; 1K73 R; 2COW A; 1NG2 A; 1UFF A; 2O9S A; 5HK0 A; 3M0R A; 1RAI B; 3A8H B; 1GL5 A; 3BE3 A; 1RUW A; 5EG2 A; 2GTO A; 2F2V A; 1PSF A; 3NHN A; 3VS0 A; 3L42 A; 2DYI A; 1PD0 A; 1VQN A; 2XG8 D; 4QVZ A; 2XKO C; 2R58 A; 1AOJ A; 1TSF A; 1PSE A; 4LNP A; 2JT4 A; 2PUO B; 2ZPB B; 2X3X D; 4E7H A; 2DEU A; 4C0Z A; 1SPK A; 2I2L A; 1BIA A; 2F5T X; 2YLB A; 1SKU B; 1VQ5 A; 2DRK A; 4ZGE B; 2EYZ A; 1Q95 G; 4J9D A; 2F2X A; 4IUQ A; 5GMK l; 4RTU A; 1RLP C; 4EIK A; 1IHW A; 4EDU A; 4PJO D; 4C92 C; 2M51 A; 2X4J A; 4DBH A; 4FSS A; 2DIG A; 2YUO A; 1ZSZ B; 1X69 A; 1WHM A; 4XTX A; 3CCQ Q; 1K9M U; 1VQK Q; 2EQU A; 1PWT A; 1X6B A; 2DL8 A; 4JRI A; 4C0G A; 4D6W A; 4AT1 B; 4BB7 A; 1Y07 A; 3G6E T; 3ME9 A; 1KK7 A; 3EGD A; 1TUD A; 2YUN A; 3G71 A; 3CCR T; 5CK9 A; 4ZGJ B; 2LCC A; 2ZPI B; 1WA7 A; 2EJG A; 2MIO A; 3CBP A; 3GOX A; 3MET A; 3RER A; 1Y96 B; 5GAN 5; 4XQ3 A; 4Z88 A; 2D9T A; 2JM8 A; 2EFI A; 1YI2 A; 1O75 A; 4M7D B; 1IRX A; 1OPK A; 2XDD A; 4BE2 A; 1TXQ A; 2A3L A; 2HDA A; 2A0F B; 1UGS B; 2GFU A; 2FPD A; 3FJP A; 2CP2 A; 3M0U A; 4FT4 A; 1OX8 A; 1NJI U; 1NYG A; 3O8V A; 2OTJ A; 1FYN A; 1RAH B; 3CC2 T; 3CCV Q; 1R77 A; 4Q5W A; 1BB9 A; 1QW1 A; 3PT9 A; 4C92 B; 3PVL A; 4QQD A; 1G83 A; 1D0Z A; 3TQ7 P; 1Y96 A; 3VRY A; 3EGX B; 2HCK A; 2F5K A; 3SEM A; 2RI2 A; 2BIV A; 2LQ8 A; 2ZGW A; 4ESR A; 2DJQ A; 2RA2 A; 5IT9 E; 1R0C B; 3LWH A; 1KQS P; 2X51 A; 4FT2 A; 2YXY A; 5GAM j; 2SEM A; 1HXD A; 1AWX A; 2CP5 A; 3GBQ A; 1E6G A; 2FB7 A; 1Z9Q A; 4IUU A; 4F7U G; 5ECA A; 5GAN 2; 4F16 A; 4NS5 A; 4E6R A; 5GAN 8; 4C92 A; 3CC2 Q; 1JJ2 S; 3EGX A; 4LD6 A; 2KI7 A; 2LJ3 A; 1QKX A; 3GPL A; 1DJ7 B; 4ATO A; 4VUB A; 2DYB A; 3OYF A; 2KXD A; 3M9Q A; 2GTJ A; 4ANJ A; 3QKJ A; 1D1B A; 2ED1 A; 2K4Y A; 2VGM A; 1I5L A; 2F69 A; 3M4G A; 3X25 B; 1UUE A; 4EMG A; 2DEQ A; 4KUD K; 1Q7Y U; 3RKY A; 1VQ5 T; 2M0Y A; 3OS0 A; 1YFN A; 2VUB A; 2H3J A; 4JS5 A; 2DLP A; 1RAA B; 3NPF A; 2QEX A; 2HKQ B; 2YUQ A; 3OSS C; 1M90 U; 2MWP A; 1H3Z A; 1BI3 A; 2RHX A; 1LJO A; 1NLP C; 4PJO E; 5A0D A; 1PRL C; 3EH2 A; 5IXF A; 3V7S A; 2QAS A; 1ZUU A; 3X24 B; 4DEX A; 2CUB A; 3H0F A; 1N8R U; 4OMN A; 5GAN d; 2BE9 B; 1Q82 R; 4M7A F; 4Y91 A; 1I5O B; 1AWW A; 4NOY A; 1OUL A; 1IHV A; 2ABL A; 2A08 A; 1YI2 T; 3OYE A; 2HMA A; 3ER0 A; 2RB6 A; 2VGN A; 3M53 A; 4BE0 A; 5KYU B; 2FL7 A; 4IUP A; 4RTY A; 3CCS A; 3NGP A; 3FEO A; 5FU6 B; 2E6N A; 3CCU A; 1M3B A; 4FYW B; 2DFU A; 4OGC A; 2DIL A; 3I55 A; 1UGQ B; 3QPH A; 2OTJ T; 1GRI A; 3JCM V; 2K5L A; 3QII A; 4A54 A; 3V7R A; 3OSV A; 2CH4 W; 2FG0 A; 2ESW A; 1ZQ1 A; 1VQ4 A; 2D8J A; 4JJN K; 3PIP A; 2BZX A; 2HSP A; 1FMV A; 3HKS A; 5KYU A; 2GGR A; 1RAC B; 3VS1 A; 1K4U S; 1YNZ A; 1WHJ A; 2HD0 A; 4ZNX A; 4C8Q F; 4E47 A; 4B6M A; 2ZPH B; 1F1B B; 1SHF A; 2PQW A; 3E2U A; 1RAF B; 2E6Z A; 2GQI A; 4M78 G; 1K1Z A; 2O01 E; 2RHZ A; 3E9F A; 1G5V A; 3RES A; 4MZP A; 1VQ8 Q; 5CKE A; 4QQ6 A; 2ZPG B; 4PLI A; 2W0Z A; 4BUG A; 1M2V B; 4C5E A; 1VQ9 Q; 1KD1 U; 4K11 A; 2KRS A; 4DBF A; 3MEW A; 4DBR A; 3CME A; 1Q81 U; 1WLP B; 2AZS A; 3TVT A; 2PVG B; 3VUB A; 1ABQ A; 5HY6 A; 5HKC A; 4AMC A; 2RQR A; 3CC7 Q; 3JAM E; 2DKG A; 3CBO A; 1M2V A; 1D09 B; 1PM3 A; 2P0K A; 3LGF A; 5IHI A; 2QEX T; 5GAM h; 3MP8 A; 4RCB A; 2KGT A; 2LT4 A; 2MAM A; 3JCM P; 3HRU A; 2RQV A; 1YWP A; 2CSI A; 3I35 A; 4TVR A; 3EGU A; 4EPC A; 3CXC S; 3CXC A; 2HKN A; 2YT6 A; 2NUT B; 5C6S A; 2JUF A; 3QYG B; 3DB4 A; 3RDV A; 3OYI A; 3CCE A; 4M7D G; 4A4F A; 1O9S A; 2ROL A; 1YJW Q; 4RTZ A; 3CCL A; 4M77 F; 4HT9 A; 4RTX A; 4LDV A; 2CP0 A; 2ENM A; 2ZAE A; 3THK A; 1VQM A; 4RKU E; 3HRS A; 1SSF A; 3VS2 A; 4II1 A; 2ZPF B; 3E9G A; 1WJS A; 1YIJ Q; 3CPW S; 2ZZD A; 5CR2 A; 3CPW A; 3C0C A; 1EIF A; 4Z02 A; 1HD3 A; 2NUT A; 3EG1 A; 3VS4 A; 3CCU T; 4NL3 A; 3I55 T; 3PFS A; 1YHQ Q; 1BIB A; 4N4G A; 2EKO A; 2E64 A; 1X2K A; 2QGF B; 2DXB A; 3OYB A; 3CD6 A; 4LE9 A; 3VS3 A; 1K9M C; 4MZT A; 3JCM e; 1VQ4 T; 3V8K A; 1JB0 E; 4OMP A; 1TU0 B; 1ZSG A; 5GAN 4; 2RHI A; 1UEC A; 5CCA A; 2FZK B; 1IRE B; 1JXM A; 5M9O A; 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