The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
60
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structure length |
60
|
Chain Sequence |
GPLGSPQCKALYAYDAQDTDELSFNANDIIDIIKEDPSGWWTGRLRGKQGLFPNNYVTKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Myosin 1E SH3
rcsb |
| molecule tags |
Motor protein
|
| source organism |
Mus musculus
|
| molecule keywords |
MYOSIN 1E SH3
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| total genus |
13
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-07-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5IXB A; 3M0Q A; 4DEX A; 3M0T A; 1UUE A; 1UJ0 A; 5L23 A; 3H0H A; 5IHI A; 1YCS B; 3VS7 A; 2ABL A; 1KJW A; 2VKN A; 1AWO A; 2RPN A; 1ZSG A; 2DVJ A; 2DJQ A; 3H0I A; 2LJ1 A; 2YUN A; 3UA6 A; 1MUZ A; 1SPK A; 1OEB A; 2HDA A; 2FG0 A; 2CUD A; 1WYX A; 1AZE A; 1YP5 A; 4LUE A; 4E6R A; 1K4U S; 2SRC A; 3PVL A; 1NEG A; 1PWT A; 1E6H A; 4ESR A; 1CSK A; 4RTT A; 2KYB A; 3R6N A; 4JJB A; 1XOV A; 2FEI A; 1AWJ A; 1WXT A; 4Y92 A; 1AWW A; 1I07 A; 2V1R A; 2RQR A; 4JJC A; 5IHK A; 1GRI A; 1K0S A; 2KGT A; 1PNJ A; 1RLQ C; 1WXB A; 1AWX A; 4Z8A A; 2GNC A; 4CC3 A; 2O9S A; 2LP5 A; 4LNP A; 1SEM A; 2KNB B; 3QWY A; 1AD5 A; 1EFN A; 2LQN A; 1I1J A; 2RF0 A; 5IXF A; 4CC4 B; 1Y57 A; 2KRM A; 1AVZ C; 4J9F A; 2LZ6 B; 5HCK A; 2YUP A; 4KRT A; 1E7O A; 4IIO A; 1RLP C; 1VYT A; 1JQQ A; 1HD3 A; 1AOJ A; 1X2Q A; 2FRW A; 2YDL A; 3NPF A; 3LH5 A; 1WIE A; 2K2M A; 3QWX X; 1YN8 A; 3ZL7 C; 2JTE A; 1GBQ A; 1ZLM A; 1PRM C; 2FPF A; 2I0N A; 2VVK A; 1JEG A; 2VWF A; 3UA7 A; 3O5Z A; 1J3T A; 2GBQ A; 1UG1 A; 3UF4 A; 2DBK A; 2PZ1 A; 1X43 A; 1X2K A; 2AZS A; 1WFW A; 1WX6 A; 2ED0 A; 1K76 A; 4R0K A; 3RBB B; 1VYU A; 4JPB W; 2DL8 A; 3H0F A; 1T0H A; 2LMJ A; 2JM9 A; 4HCK A; 3VS5 A; 1OPK A; 1BBZ A; 1UGV A; 2BZY A; 1OOT A; 1B07 A; 2C0I A; 1SHF A; 1IO6 A; 1ZUU A; 3VS3 A; 1VYV A; 1AZG B; 2W10 A; 1QCF A; 3TSW A; 2KE9 A; 4J9I A; 1VA7 A; 2PNI A; 4AFQ C; 3UAT A; 1M3C A; 2JS0 A; 2J6O A; 1YWO A; 1ARK A; 1MV0 B; 2J05 A; 1JXO A; 2CSI A; 3EG1 A; 1UFF A; 5FW9 A; 1WXU A; 1WI7 A; 3REB B; 2EVR A; 2EGC A; 4J9G A; 4HXJ A; 4D8K A; 1GFC A; 1Z9Q A; 4RTX A; 2F2V A; 1U5S A; 2J7I A; 2KT8 A; 2LQW A; 3SEM A; 1KFZ A; 2KRN A; 1T0J A; 2DMO A; 1ZUK A; 4JZ4 A; 2AKK A; 2D8H A; 1K9A A; 3I5R A; 3REA B; 1X69 A; 3VS4 A; 2DBM A; 1UJY A; 2J6F A; 1G2B A; 2DLP A; 2RNA A; 1U06 A; 4LUD A; 1BB9 A; 1HSQ A; 1UE9 A; 2JMC A; 2DF6 A; 1E6G A; 1W6X A; 2DRK A; 1SHG A; 1FMK A; 1CKB A; 3THK A; 2J06 A; 2NWM A; 1M3B A; 1G83 A; 4K11 A; 1M27 C; 3SHW A; 1NM7 A; 1NYG A; 5ECA A; 3M0S A; 4OMM A; 2MIO A; 2MOX A; 1JU5 C; 3PE0 A; 2ESW A; 2EYZ A; 4WCI A; 3VRY A; 3VS2 A; 2AK5 A; 3EGU A; 4CC7 A; 1AEY A; 1HJD A; 2DNU A; 5I11 A; 1X6G A; 1MV3 A; 2M51 A; 1TUC A; 2KR3 A; 2ENM A; 4OMN A; 2BTT A; 2LX7 A; 1JO8 A; 5IHN A; 2RQW A; 4AG1 C; 1TG0 A; 1I0C A; 4AG2 C; 2DX1 A; 2GGR A; 2KBT A; 4LE9 A; 1UHF A; 4GLM A; 2CH4 A; 3ULR B; 3I9Q A; 2K9G A; 2O9V A; 4CC2 A; 2LNH B; 2ECZ A; 2GTO A; 2A37 A; 2CT3 A; 2D0N A; 3TSZ A; 1W70 A; 1GBR A; 1U3O A; 2RN8 A; 2FPE A; 2L0A A; 2HCK A; 1BU1 A; 4RTW A; 1JXM A; 2X3W D; 2EQI A; 1SSH A; 1T3L A; 1X6B A; 2KT1 A; 1PHT A; 1PKS A; 2NUZ A; 4A63 B; 1KIK A; 1M8M A; 4D8D A; 4AFU C; 1YWP A; 2AKL A; 2CUB A; 2OI3 A; 2O31 A; 4FSS A; 4OMP A; 2CH4 W; 4OMO A; 2ED1 A; 4HVV A; 2H8H A; 3EG2 A; 2EGA A; 3JV3 A; 2YT6 A; 2RQT A; 4HVW A; 3C0C A; 1FYN A; 1Z9Z A; 2V1Q A; 2L3P A; 1NEB A; 2DE0 X; 2W0Z A; 2EGE A; 2J6K A; 1GL5 A; 2C0T A; 2E5K A; 1LCK A; 3I5S A; 2DL5 A; 2D1X A; 2A36 A; 4F16 A; 1SRM A; 4RTZ A; 2EYX A; 1H3H A; 3M0P A; 2DA9 A; 2JT4 A; 2A08 A; 1QWE A; 3NMZ C; 1OV3 A; 1UHC A; 1H8K A; 4RUG A; 1NG2 A; 2EYY A; 4OML A; 1K0X A; 2L2P A; 2O88 A; 2XMF A; 2IIM A; 2ROL A; 2EBP A; 2OJ2 A; 1UEC A; 2OAW A; 2BZ8 A; 1UTI A; 3EHQ A; 2L3S A; 2C0O A; 2K79 A; 1GFD A; 3PVQ A; 4EIK A; 3VS6 A; 1ABO A; 1N5Z A; 1Y0M A; 2DM1 A; 1QKW A; 2L3Q A; 2GQI A; 4Z88 A; 4JZ3 A; 4Z89 A; 1TUD A; 3I35 A; 1W1F A; 2M0Y A; 1NYF A; 2DL4 A; 1WA7 A; 1ZUY A; 2RQU A; 4RTV A; 2F2W A; 1H92 A; 2G6F X; 2RQV A; 2JW4 A; 1YNZ A; 1V1C A; 1WLP B; 4X1V A; 1M3A A; 2K3B A; 2KRO A; 3H41 A; 2CSQ A; 4F14 A; 2GTJ A; 2HSP A; 3EG0 A; 1K1Z A; 1NLP C; 3EG3 A; 3IQL A; 5GJW B; 5IH2 A; 2BZX A; 1ABQ A; 1ZX6 A; 2LJ0 A; 4AFS C; 2EYW A; 2DRM A; 2JMA A; 2HBW A; 1NLO C; 1PRL C; 1X27 A; 1BK2 A; 2HEQ A; 2YUO A; 4F17 A; 2JXB A; 1QKX A; 2DIL A; 1A0N B; 2FO0 A; 1GCQ A; 4M4Z A; 2K7A A; 2KYM A; 4J9B A; 2YSQ A; 2FRY A; 1PKT A; 2A28 A; 1OPL A; 2YUQ A; 4ORZ A; 3A98 A; 2DL7 A; 1GCP A; 2MCN A; 4OMQ A; 2D8J A; 3U23 A; 3CQT A; 1M30 A; 2KEA A; 4HVU A; 2LCS A; 4IIM A; 3GBQ A; 2ROT A; 5GJV B; 2K6D A; 4AFZ C; 1QWF A; 2B86 A; 2EPD A; 5I22 A; 2CDT A; 4RTU A; 5FWC A; 1GCQ C; 2CRE A; 4LN2 A; 1QLY A; 4ZNX A; 2P4R A; 2O2O A; 2KXC A; 2LJ3 A; 2DL3 A; 3EHR A; 3TVT A; 2AZV A; 4JJD A; 5FWB A; 1RUW A; 1S1N A; 2X3X D; 3M0R A; 4DEY A; 4J9H A; 4J9C A; 1RI9 A; 1ZBJ A; 2RMO A; 4RTY A; 2JS2 A; 2PTK A; 2EW3 A; 3RNJ A; 1KSW A; 3M0U A; 3VS0 A; 1B3Q A; 2DYB A; 2CT4 A; 2KXD A; 3FJ5 A; 3VS1 A; 5EC7 A; 3KFV A; 1CKA A; 2FPD A; 1SRL A; 2EKH A; 3NGP A; 1WDX A; 2KRS A; 2JM8 A; 4GBQ A; 4J9E A; 1UDL A; 4J9D A; 3NHN A; 2QDL A; 1T3S A; 2F2X A; 2SEM A; 4QT7 A; 3VRZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4DEX A; 1BCO A; 4BI4 A; 3FC3 A; 4O6J A; 4HCZ A; 4M75 E; 2AIR B; 3H0H A; 1NBE B; 1JJ2 P; 2ABL A; 3OW2 P; 1DJ7 B; 2KMT A; 1JJ2 S; 2EFI A; 3CC4 Q; 4XAX B; 1VQM Q; 1ZSG A; 2DJQ A; 1VQL A; 3EFO A; 4F7U A; 2LJ1 A; 2YUN A; 3GPL A; 4PJL A; 2CUD A; 2L3R A; 2XDB A; 1YP5 A; 1H64 1; 4JRQ A; 3M4Y A; 3KXT A; 4M7A F; 4IUT A; 3PVL A; 3O8V A; 5GAM f; 2HL5 C; 1E6H A; 4ESR A; 1CSK A; 2KYB A; 2M0O A; 1ZHI A; 2XID A; 1G3W A; 2K5F A; 1Q81 C; 1AWW A; 2PVD B; 5GAN 7; 5KYY A; 1WZO A; 3QZ9 B; 4KH0 B; 5IHK A; 1K9M R; 1PNJ A; 2OTJ T; 1AWX A; 2GNC A; 2LP5 A; 4LNP A; 1S72 A; 5M9O A; 5IXF A; 3CBM A; 2DVE A; 4E7L A; 1AVZ C; 2HSE B; 4KRT A; 1E7O A; 1WHH A; 4II1 A; 4IIO A; 2DD5 A; 1JQQ A; 1HD3 A; 3QZ5 B; 1AOJ A; 2VAS A; 2HKN A; 3CC4 A; 2DEU A; 1VQM A; 2JTE A; 1N8R U; 3LLR A; 4X9C A; 3CXC P; 2FZK B; 2FPF A; 1NPP A; 1JEG A; 2JNG A; 9ATC B; 1UG1 A; 2LNV A; 3UF4 A; 2R58 A; 3FIF A; 1X43 A; 1X2K A; 5KH6 A; 1QCN A; 2ZPG B; 3CPW A; 4RKU E; 3RBB B; 2YLC A; 4JRP A; 1D1B A; 3JB9 J; 1FXX A; 2DL8 A; 3LW5 E; 3CC7 Q; 1T0H A; 2LMJ A; 2JM9 A; 4RCB A; 3VS5 A; 3QJY A; 1OX8 A; 4FT2 A; 2BZY A; 3JCM h; 2OAU A; 1OOT A; 1IO6 A; 3OYB A; 3OS5 A; 2HBP A; 2QQS A; 1AZG B; 3RMS A; 1FMV A; 3BE3 A; 4KUI A; 2QEX Q; 1QCF A; 2P4T A; 3CD6 Q; 1PD0 A; 5CKF A; 3JCM J; 1NPR A; 3RKW A; 4N4G A; 4M7D C; 3CEY A; 1YWO A; 2HMA A; 1MV0 B; 4FW1 A; 3MP6 A; 1WXU A; 4LD9 K; 1B34 A; 1WI7 A; 3GP8 A; 2A3L A; 1NJI C; 1RAG B; 4HA8 A; 5GAN g; 2LC4 A; 4RTX A; 2J7I A; 5DLO A; 3X20 B; 1KFZ A; 2DMO A; 1ZUK A; 5CQX A; 1K9A A; 3I5R A; 2CP6 A; 1TWB A; 3F70 A; 2BE7 D; 4M78 G; 2M16 A; 1PSF A; 1Q82 U; 4M75 F; 2EKO A; 1I81 A; 3CCU Q; 3G6E Q; 2J6F A; 2DJZ A; 1PSE A; 2K4Y A; 1RAD B; 4LUD A; 1HSQ A; 1M2O A; 2PQW A; 5D7U A; 4MDW A; 5LJ5 d; 3OSV A; 1W6X A; 3P8B B; 1MGQ A; 4OB2 B; 3OYA A; 1FMK A; 1IGQ A; 2J06 A; 4PNO A; 2QEX A; 4M7A A; 4M7D B; 2NWM A; 1VIF A; 1K73 C; 1K73 R; 2D0Q B; 1M3B A; 5I21 A; 3CPF A; 3SHW A; 5C6S A; 1NYG A; 3JCM f; 3M0S A; 3CCL T; 3CC7 T; 3PE0 A; 1VQ9 A; 2JUF A; 2Z0W A; 3VS2 A; 1HJD A; 1HK9 A; 5KYU A; 5I11 A; 3MO8 A; 4BY6 C; 2RHY A; 1MV3 A; 2HAX A; 1TUC A; 2CP0 A; 2WSF E; 1G3Y A; 1JO8 A; 2EQJ A; 1I0C A; 2DX1 A; 1VQP A; 2DET A; 2KBT A; 2EQM A; 4XTU A; 4PLI A; 3CD6 T; 1B7T A; 2CH4 A; 2DAQ A; 2X4W A; 3I9Q A; 3CCQ Q; 2PU9 B; 2O9V A; 2LNH B; 2ECZ A; 5FRM A; 3JB9 G; 2GTO A; 4M78 E; 5FRN A; 2FB7 A; 4LDV A; 3SWN A; 3S3M A; 1U3O A; 2RN8 A; 2FPE A; 2L0A A; 1BU1 A; 3CCU A; 3H8Z A; 1T3L A; 3V7R A; 5GAM g; 1ZSZ C; 3R6O A; 2YRD A; 4M77 C; 1YWP A; 2CUB A; 2OI3 A; 4RG2 A; 4FSS A; 1QP3 A; 4NL3 A; 4C8Q D; 1UGQ B; 3A5Z B; 4JLI A; 2K3Y A; 2RQT A; 4KT0 E; 2XHC A; 2DZC A; 2DXC A; 1Z9Z A; 1Y96 A; 3MHX A; 3QYH B; 1VQO Q; 4BY6 B; 3G6E T; 3X24 B; 2C0T A; 3VUB A; 4PK4 A; 5LJ3 d; 2A36 A; 2JZ2 A; 1SRM A; 3WVD B; 2EYX A; 2V8K A; 3HSB A; 2QXF A; 2YWW A; 4LDU A; 2DER A; 3L2Z A; 3OS0 A; 3A1P A; 3CCQ A; 4WTO B; 1NE8 A; 4RUG A; 1VQ4 Q; 1YIT Q; 2R5M A; 2EJG A; 4DA4 A; 2XMF A; 1KQS A; 1OZ2 A; 3OYD A; 3EHQ A; 1ZSZ B; 2L3S A; 4M77 B; 5CK9 A; 1ABO A; 5HK3 A; 1Y71 A; 4Q5W A; 2R5A A; 2GFA A; 1KC8 U; 4ZTJ A; 2L3Q A; 1N8R R; 1M1G A; 3CPW P; 2XDP A; 1IZ6 A; 4B6M A; 4EMG A; 3CPW S; 2X35 A; 1ZUY A; 4RTV A; 2F2W A; 3VYH B; 4C92 B; 4M75 A; 1VQO A; 4BDZ A; 3NTI A; 3QDF A; 1WLP B; 2K3B A; 2CP7 A; 3DLM A; 1BIA A; 2GTJ A; 2MYS A; 3EG0 A; 3OQ5 A; 3P8D A; 1K1Z A; 1NLP C; 4C8Q G; 3WVE B; 4V2S A; 3VJP A; 1ABQ A; 2LJ0 A; 2JTF A; 1Q7Y U; 4OB1 B; 4MML A; 3OY9 A; 2VGN A; 1VQ6 Q; 2E70 A; 1VQ4 A; 1YIT A; 3HFO A; 3HL8 A; 2YSQ A; 1PKT A; 3ZBD A; 4X9D A; 2YUQ A; 2RI3 A; 2DL7 A; 1GCP A; 3UDC A; 1TH7 A; 2E64 A; 3CC2 Q; 2FHD A; 1BKB A; 2LCS A; 2DYI A; 5GJV B; 2K6D A; 2C06 A; 2B86 A; 1I4K 1; 1WJQ A; 2CRE A; 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4MZT A; 2LQN A; 3A8L B; 4CC4 B; 1Y57 A; 1N6A A; 3GIB A; 2LZ6 B; 3L2V A; 5GAN d; 2VC8 A; 4M7D D; 2LQK A; 3H9N A; 5J26 A; 1BI0 A; 3PGG A; 1X2Q A; 2FRW A; 3CCV A; 3QHS A; 1OQK A; 1WIE A; 4XU3 A; 2CS7 A; 3QWX X; 1GBQ A; 2QDY B; 1KQS P; 3A8O B; 1X01 A; 3UA7 A; 4XTY A; 2GBQ A; 1KQS S; 1VQL Q; 3QG1 A; 3I56 A; 2NUT A; 2RJD A; 2ZPB B; 3RDV A; 3LWI A; 2E65 A; 2GQV A; 3EG9 B; 2X4Y A; 4JPB W; 3H0F A; 1VQ8 T; 2B8A A; 1KC8 R; 3CCE A; 4HCK A; 3SFM A; 3CBP A; 5EG2 A; 4N4I A; 5DY9 A; 4P5N A; 2ATC B; 1SHF A; 4M78 A; 1VQ7 Q; 1ZUU A; 2OTL T; 3LWH A; 1D0X A; 3OBY A; 3TSW A; 4J9I A; 3E2U A; 1YI2 T; 2KSS A; 4C8Q F; 2PNI A; 3UAT A; 5GAO m; 5FRO A; 1S72 Q; 4J7F A; 4XTV A; 2J05 A; 3EG1 A; 2CSI A; 3JCM Q; 4J83 A; 4PJJ A; 1K8A C; 4N0A A; 1K8A R; 6AT1 B; 2EGC A; 1Q7Y R; 2YLB A; 2QA4 T; 4E47 A; 5LJ5 j; 2QYZ A; 3G71 T; 1KHI A; 2F2V A; 1M2V B; 2MI6 A; 4M7D G; 1U5S A; 2K2V A; 2LQW A; 2PUO B; 1SF9 A; 4NOY A; 3NTH A; 5IT9 E; 5J39 A; 5GAM d; 3C94 A; 4MZM A; 2VB6 A; 3REA B; 2GF7 A; 1RAC B; 2MWP A; 4NL2 A; 4RG8 A; 3VS4 A; 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