The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
64
|
structure length |
64
|
Chain Sequence |
PLDQPSCKALYDFEPENDGELGFREGDLITLTNQIDENWYEGMLHGQSGFFPLSYVQVLVPLPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain of rat endophilin A2
rcsb |
| molecule keywords |
Endophilin-A2
|
| molecule tags |
Endocytosis
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| source organism |
Rattus norvegicus
|
| total genus |
11
|
| structure length |
64
|
| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-01-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K2M A; 3VS6 A; 2EPD A; 1PKT A; 1X43 A; 1BU1 A; 4HVV A; 1T3S A; 2J06 A; 2O9S A; 4J9C A; 4AFQ C; 2EYW A; 2L0A A; 4OML A; 2JMC A; 1Y57 A; 2CSI A; 1TUC A; 3H0H A; 2ED0 A; 2ROT A; 2KBT A; 2NWM A; 4JPB W; 3VRY A; 2DMO A; 2IIM A; 2V1Q A; 1MV3 A; 3M0R A; 4J9G A; 1UJ0 A; 4Z89 A; 1GL5 A; 1AWO A; 1AVZ C; 2ROL A; 2FPD A; 4OMM A; 2RQW A; 4AFZ C; 2B86 A; 1SHG A; 2F2X A; 1ABO A; 1SSH A; 4J9F A; 2LJ1 A; 1UE9 A; 1Z9Q A; 4D8K A; 4CC2 A; 2KEA A; 2HCK A; 3SEM A; 3H41 A; 2CT4 A; 2YUN A; 1ZSG A; 2DL5 A; 2BTT A; 3VS5 A; 2RNA A; 1WI7 A; 3PE0 A; 3PVQ A; 1X69 A; 4HCK A; 2JXB A; 1HSQ A; 1I1J A; 1AZG B; 3NMZ C; 1WIE A; 1M8M A; 2DM1 A; 2RQT A; 4F17 A; 5IH2 A; 2K9G A; 1NG2 A; 1H3H A; 1A0N B; 2ED1 A; 2EGA A; 1ZLM A; 1KJW A; 1K9A A; 1YCS B; 2DL4 A; 2O88 A; 3A98 A; 3QWX X; 3REA B; 2DL8 A; 1N5Z A; 1GBQ A; 2LQW A; 2SEM A; 1NLO C; 2DJQ A; 2LX7 A; 2YUP A; 2GTO A; 1PRM C; 5FWB A; 2FPE A; 2L3Q A; 2SRC A; 4DEX A; 5IHN A; 4AG1 C; 4JJC A; 3O5Z A; 2K79 A; 2KXC A; 4CC3 A; 2AZV A; 4LE9 A; 1WDX A; 2JM8 A; 2ESW A; 4K11 A; 1KIK A; 1CSK A; 2JS2 A; 1UUE A; 1MUZ A; 1WXT A; 1AWW A; 3UA7 A; 2XMF A; 2D1X A; 1U3O A; 1MV0 B; 2LQN A; 2DLP A; 1RI9 A; 2RQU A; 2KRN A; 2JTE A; 1BK2 A; 4AG2 C; 4HVW A; 2J6K A; 4ORZ A; 1NEG A; 1YWP A; 1UEC A; 2FRY A; 1TUD A; 4J9H A; 3IQL A; 1U06 A; 1W70 A; 2RF0 A; 2GBQ A; 2FO0 A; 2J6F A; 2J7I A; 1RLP C; 3M0U A; 1ZX6 A; 2AKK A; 2EYZ A; 1NLP C; 1QWE A; 1Z9Z A; 4Y92 A; 2FEI A; 1SRL A; 1W6X A; 1WYX A; 2JT4 A; 1SPK A; 2V1R A; 1I0C A; 3M0P A; 1RLQ C; 1CKB A; 4JJD A; 2DF6 A; 2GTJ A; 1ABQ A; 2HSP A; 4EIK A; 3FJ5 A; 1QCF A; 2RMO A; 1JXO A; 3EG3 A; 3M0Q A; 3NGP A; 2CH4 A; 1K1Z A; 2DBM A; 1Y0M A; 1OEB A; 1UFF A; 2AKL A; 2RQR A; 1NYF A; 3EG1 A; 1YWO A; 2GGR A; 3RBB B; 2YDL A; 1UTI A; 5IHK A; 3RNJ A; 1ZUY A; 2LJ3 A; 3QWY A; 1K0S A; 4RTX A; 2KNB B; 4HXJ A; 3H0F A; 4RTT A; 1VYU A; 2YSQ A; 1UHC A; 1G83 A; 2A37 A; 2E5K A; 2BZY A; 3U23 A; 1WA7 A; 3PVL A; 3TSZ A; 2GNC A; 1KFZ A; 1NEB A; 2K7A A; 1PNJ A; 1GCQ C; 2BZ8 A; 2YUQ A; 5IHI A; 5ECA A; 2EVR A; 3EHQ A; 1U5S A; 4J9I A; 1ARK A; 2OI3 A; 1E7O A; 4IIO A; 1GFC A; 1YNZ A; 2DE0 X; 2F2W A; 2M51 A; 2J6O A; 2LCS A; 1KSW A; 2EQI A; 4OMQ A; 1OPK A; 4RTV A; 1NM7 A; 1QWF A; 2X3W D; 1T3L A; 4KRT A; 1T0H A; 3TSW A; 1XOV A; 1PWT A; 2CSQ A; 4J9B A; 4JJB A; 2FRW A; 2JMA A; 2KT8 A; 2HEQ A; 5I11 A; 1AWX A; 3ZL7 C; 2O2O A; 2O9V A; 2C0I A; 4LUE A; 4AFS C; 1T0J A; 4RUG A; 3UF4 A; 2HBW A; 3THK A; 5FW9 A; 4FSS A; 1HD3 A; 4HVU A; 1J3T A; 3UAT A; 2JS0 A; 2MCN A; 1NYG A; 4OMP A; 2CUB A; 2CRE A; 5I22 A; 1X2K A; 1H92 A; 2DIL A; 4ESR A; 2FG0 A; 2GQI A; 2KT1 A; 4M4Z A; 1PRL C; 1OPL A; 3C0C A; 2AK5 A; 1V1C A; 4R0K A; 2KGT A; 1QKX A; 2LZ6 B; 2NUZ A; 2MIO A; 1AD5 A; 2RQV A; 1M27 C; 2HDA A; 3EGU A; 2H8H A; 2EGE A; 2J05 A; 2YUO A; 4D8D A; 2KR3 A; 3VS7 A; 2YT6 A; 5EC7 A; 3I5R A; 1JXM A; 3NPF A; 2DVJ A; 1B07 A; 1M30 A; 4AFU C; 1SEM A; 4RTZ A; 1M3C A; 3VS4 A; 1E6H A; 1K0X A; 2KYM A; 1X2Q A; 1ZBJ A; 2ECZ A; 2LNH B; 2X3X D; 4X1V A; 1YN8 A; 1PHT A; 3CQT A; 3REB B; 2K3B A; 2VKN A; 3VS3 A; 2L3P A; 2D0N A; 1OOT A; 2A08 A; 1AOJ A; 2D8H A; 2C0O A; 1OV3 A; 2DBK A; 2PZ1 A; 1M3B A; 1UG1 A; 2VVK A; 2RPN A; 2F2V A; 1X6B A; 4LNP A; 1E6G A; 1GCQ A; 1VA7 A; 2JW4 A; 1AEY A; 3M0S A; 4RTY A; 2VWF A; 1G2B A; 1BBZ A; 2AZS A; 2CDT A; 2P4R A; 1FYN A; 1UJY A; 2KRM A; 2KE9 A; 2ENM A; 2OAW A; 2DL7 A; 2KYB A; 3JV3 A; 4CC4 B; 2CT3 A; 2I0N A; 4GLM A; 1PKS A; 1BB9 A; 1RUW A; 1WXU A; 3GBQ A; 5FWC A; 3EG2 A; 3I5S A; 2BZX A; 2LMJ A; 2EYX A; 4F16 A; 2KXD A; 2EKH A; 1GFD A; 1WLP B; 1UHF A; 3UA6 A; 1VYT A; 4J9E A; 2L3S A; 1H8K A; 1FMK A; 1JO8 A; 4RTU A; 4F14 A; 2W0Z A; 2LJ0 A; 2RN8 A; 1CKA A; 5GJW B; 1GCP A; 1K4U S; 1SRM A; 2EBP A; 3I35 A; 3KFV A; 1WFW A; 1JQQ A; 3H0I A; 4GBQ A; 4LUD A; 3R6N A; 2FPF A; 1S1N A; 2CUD A; 3M0T A; 1M3A A; 4JZ3 A; 4E6R A; 1ZUK A; 1AZE A; 4Z88 A; 2W10 A; 1YP5 A; 1GRI A; 2DRK A; 4JZ4 A; 1EFN A; 1UDL A; 2K6D A; 3VS2 A; 2A36 A; 3VS1 A; 2LP5 A; 1K76 A; 2CH4 W; 3SHW A; 5IXB A; 1JEG A; 2A28 A; 2PTK A; 4A63 B; 2O31 A; 2DX1 A; 1GBR A; 2DA9 A; 4Z8A A; 2C0T A; 3VS0 A; 1X6G A; 2EW3 A; 5IXF A; 2D8J A; 3TVT A; 1WXB A; 1LCK A; 1ZUU A; 4OMO A; 1VYV A; 1W1F A; 2KRS A; 2PNI A; 3ULR B; 1SHF A; 1I07 A; 1TG0 A; 4LN2 A; 1QKW A; 1WX6 A; 4OMN A; 2ABL A; 4RTW A; 4DEY A; 2DRM A; 1X27 A; 2MOX A; 5HCK A; 4J9D A; 5L23 A; 2EGC A; 3NHN A; 3EG0 A; 5GJV B; 1QLY A; 4WCI A; 2M0Y A; 2JM9 A; 2KRO A; 1B3Q A; 3LH5 A; 3VRZ A; 2QDL A; 2G6F X; 2L2P A; 3I9Q A; 4ZNX A; 4CC7 A; 3EHR A; 2EYY A; 2DL3 A; 1JU5 C; 1HJD A; 2OJ2 A; 2DYB A; 1UGV A; 4IIM A; 4QT7 A; 1AWJ A; 2DNU A; 1IO6 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2E6Z A; 4FCY A; 4RG8 A; 5GAM j; 3VS6 A; 1C0M A; 3DLM A; 2DD5 A; 3CMA A; 2E65 A; 3MP8 A; 3GIB A; 4JPB W; 4JDS A; 2Y4X A; 4TVR A; 4GLK A; 3H8Z A; 5CCA A; 3HP9 A; 1YIT Q; 2M0O A; 1S72 A; 1AWO A; 1AVZ C; 5GMK e; 4C0D C; 2FPD A; 1VQ4 T; 2PUK B; 3HTR A; 1EZZ B; 3CCU T; 3CCS Q; 3HL8 A; 2VUB A; 1SSH A; 3Q1J A; 4J8O A; 1UE9 A; 1AHJ B; 1ZA1 B; 1UGQ B; 1G8X A; 2E4H A; 5GAN 6; 4X9C A; 4BE1 A; 1Q81 U; 3H41 A; 4E7J A; 4LDV A; 2DL5 A; 2RNA A; 2PVG B; 2H3E B; 1KK7 A; 4XTV A; 1W2B P; 1WHJ A; 3OA6 A; 1AZG B; 3TQ7 P; 2D9T A; 2KDS A; 1Q82 U; 4KT0 E; 1M8M A; 3LX7 A; 2EGA A; 3CME Q; 1YCS B; 1WGS A; 1V76 A; 4B6M A; 1GBQ A; 3V7R A; 4XTY A; 4M7D E; 4FM4 B; 4F04 B; 2DJQ A; 5LJ3 f; 3MHX A; 2HZY A; 3BW1 A; 1PRM C; 3BE3 A; 2L3Q A; 4AG1 C; 2D0Q B; 1VQP A; 4Q5W A; 4IUV A; 5KYY B; 1G3W A; 1QMC A; 4XQ3 A; 5LJ5 h; 1KIK A; 4M7D B; 3MPU B; 1MUZ A; 4M77 B; 3A8G B; 1MV0 B; 4Y28 E; 2RQU A; 1M1K R; 2KRN A; 4V2S A; 2J6K A; 2R57 A; 4M78 F; 4ME7 A; 3CXC P; 2EJG A; 4J9H A; 3IQL A; 1TXQ A; 1OU9 A; 1VQ8 Q; 2J6F A; 1B7T A; 1ZX6 A; 3MP1 A; 5L8R E; 4GY5 A; 1RL2 A; 2AKK A; 2EYZ A; 4MDX A; 4JLG A; 5J26 A; 2JT4 A; 1N27 A; 4C92 F; 2DF6 A; 2KSS A; 2DXB A; 2YLC A; 1JJ2 S; 1YI2 T; 2GTJ A; 2HSP A; 1QCF A; 1WHH A; 4QQD A; 4D6W A; 2RMO A; 1IGQ A; 1O75 A; 2XHC A; 1UGP B; 1VQM T; 2DVE A; 1OZ3 A; 2DBM A; 1UFF A; 3OW2 A; 2HQX A; 4M78 C; 2HL3 A; 5KYW A; 2O01 E; 1BCO A; 1PG5 B; 1UB4 A; 1ZUY A; 2LJ3 A; 1MMN A; 2QTX A; 2KNB B; 1VYU A; 2WSC E; 1M90 C; 4HT9 A; 4M78 G; 4DBH A; 3G4S T; 1YIT T; 1KFZ A; 4XU3 A; 3HFO A; 2HQH A; 3FDR A; 5C0M A; 1IXD A; 4CI0 C; 3EHQ A; 3I56 A; 1U5S A; 2CZ1 B; 1ARK A; 3PGG A; 4C92 C; 2OI3 A; 1GFC A; 1YNZ A; 2EJF A; 1VQK Q; 2M51 A; 3CCS T; 5GMK l; 1VQ6 Q; 1SG5 A; 2EQI A; 4LDX A; 1PD1 A; 3QBY A; 4RTV A; 4C92 G; 1NM7 A; 2BE9 B; 1T3L A; 2QA4 A; 4KRT A; 4BDZ A; 3TSW A; 2A0F B; 4JJB A; 2FZC B; 1VQ5 A; 1VQL A; 3ME9 A; 2F5K A; 2O9V A; 3OYK A; 1UGR B; 1QP3 A; 2R5M A; 1Q95 G; 2HBW A; 2YXY A; 2FVU A; 5FW9 A; 4O5V A; 3RER A; 3CCV Q; 1M2V A; 1HD3 A; 4EPC A; 4L6V 5; 3OQ5 A; 4HVU A; 2VXF A; 2JZ2 A; 4PLL A; 2K5F A; 4MML A; 3EGX A; 2OTL Q; 4EMK C; 4OMP A; 3CME T; 2CUB A; 3DLL A; 3EFO A; 4BY6 C; 2E70 A; 1KD1 C; 1OPL A; 4R0K A; 3L42 A; 4QKU A; 2MIO A; 4L59 A; 3RMQ A; 3OYE A; 2QDY B; 3EGU A; 3HFN A; 1D09 B; 2KR3 A; 1ZHI A; 2YT6 A; 2Z0W A; 3CCM A; 2ZPI B; 3CEY A; 3I5R A; 4M78 D; 1JXM A; 4O6J A; 3NPF A; 3URG A; 4XTX A; 1KC8 C; 1M3C A; 2RJE A; 1VQ8 T; 4M7A A; 2LTO A; 1YFN A; 2WSE E; 4ANJ A; 2LNH B; 3L2U A; 3V8L A; 4X1V A; 4VUB A; 2HKN A; 1K73 R; 2PVO B; 3REB B; 3SD4 A; 3RIR A; 4C92 D; 2L3P A; 4C8Q A; 4KGZ B; 1NPP A; 2C0O A; 2FZK B; 1M5Q 1; 1BI1 A; 5LJ5 g; 1ZBX A; 1O9S A; 4E7I A; 2HD0 A; 2IVW A; 3M54 A; 2COW A; 4M75 F; 3AT1 B; 4LNP A; 1U1T A; 2JN0 A; 1GCQ A; 1AEY A; 4PJO C; 2P4R A; 1UJY A; 2KE9 A; 2F5T X; 3CC2 Q; 1NJI U; 1XQH A; 4CC4 B; 2K57 A; 1BB9 A; 1RUW A; 3R6O A; 1WXU A; 1KQS A; 1K9M U; 4J83 A; 2F69 A; 4WF2 A; 4XTZ A; 3I5S A; 3GNG A; 3CPW A; 3CD6 T; 3FC3 A; 2LMJ A; 3QDR B; 4QVD A; 3HPW A; 3OS0 A; 3M4G A; 2XDD A; 2LRQ A; 2EKH A; 5GAN j; 1VQ7 Q; 2BIV A; 1VYT A; 2DEQ A; 2QI2 A; 4XU0 A; 2MMP A; 2P0Q A; 3CC7 Q; 2LT1 A; 3QXE B; 3PMT A; 2W0Z A; 1MNE A; 5A0D A; 2EBP A; 1OUL A; 4LDY A; 2LQ8 A; 3SWN C; 4GBQ A; 2V8I A; 3QPH A; 4M75 G; 1FX7 A; 1M3A A; 4RKU E; 3BDU A; 1ZUK A; 1MGQ A; 3S3O A; 2MI6 A; 4Z88 A; 1KHC A; 3OBW A; 3VS2 A; 2EIF A; 4QQG A; 4XK8 E; 1Q86 R; 1K76 A; 1TSF A; 2CH4 W; 2JTM A; 2OTJ T; 1RI0 A; 5IXB A; 5DM7 R; 3OW2 S; 3PT9 A; 4Z8A A; 4PJJ A; 2Y4Y A; 3S3N A; 5CKE A; 1RAG B; 5FU6 B; 5IXF A; 4M78 B; 3V7C A; 1KQ1 A; 4RG2 A; 5HK0 A; 1TTH B; 1HYO A; 3L1A A; 1ZUU A; 3OSS C; 2QXF A; 4KUL A; 4QW2 A; 2G3R A; 1N9R A; 2DO3 A; 5IN1 A; 1I07 A; 1TG0 A; 4IUT A; 1QKW A; 1WX6 A; 2MYS A; 2RA2 A; 3PFS A; 4OMN A; 1YJ9 Q; 2ABL A; 4RTW A; 3QUI A; 2MOX A; 1LNX A; 3CCJ A; 2DET A; 3V8K A; 1RAD B; 2ZCF B; 4HCZ A; 4C92 B; 1M1K C; 2YWW A; 4PLI A; 2KRO A; 1W4S A; 1WHL A; 2QDL A; 2G6F X; 4ZNX A; 4PJO D; 3EHR A; 2K3X A; 1JU5 C; 4AT1 B; 1QVF S; 2E3H A; 4IIM A; 4QT7 A; 5KYY A; 2NUT B; 4OF1 A; 1TUG B; 1R77 A; 1MMD A; 5LJ5 j; 4M77 A; 3OYI A; 2EPD A; 3P8H A; 1X43 A; 2RJC A; 1T3S A; 4HVV A; 4J9C A; 2L0A A; 4OML A; 1Y57 A; 5CKH A; 2IG0 A; 1VQ4 Q; 1TUC A; 2DEU A; 3M9Q A; 3CCU Q; 2LNV A; 2ROT A; 2NYS A; 2NWM A; 3X26 B; 3S6W A; 4X9D A; 3VRY A; 2DMO A; 2IIM A; 2V1Q A; 2KVQ G; 1LOJ A; 2EAY A; 3LGF A; 3WVE B; 3JCM P; 1GL5 A; 1VQK A; 2DZ9 A; 4EMH A; 1TS9 A; 2K5L A; 3JCM b; 3OYC A; 1SHG A; 2F2X A; 2PVD B; 3OYA A; 4C0G A; 3UPU A; 2XIC A; 2A7Y A; 4B9X A; 4FYX B; 3SEM A; 4DBR A; 3CCR A; 3A8M B; 1N8R C; 4BI8 B; 1JJ2 A; 3J80 E; 2X9H A; 2QQA A; 4M7A E; 3CCV A; 2V8K A; 3TU4 K; 3QDF A; 2OTL A; 2JJ9 A; 3V7S A; 1BI2 A; 3KUF A; 1IZ6 A; 2K9G A; 3MEV A; 1H3H A; 1A0N B; 2QQB A; 3CC7 T; 4C8Q E; 4PFZ A; 4PKC C; 3M59 A; 2DL8 A; 1N5Z A; 2LQW A; 2KQW A; 2SEM A; 4ZN3 A; 4J6W A; 2DTH A; 5HKC A; 1ZSZ C; 2SRC A; 5LL6 S; 5IHN A; 1TH7 A; 3O5Z A; 1R8O B; 3RDV A; 2M02 A; 5GMK i; 2RI3 A; 4LE9 A; 5CIU A; 2JM8 A; 2XID A; 5A2Q E; 3J7A F; 3OYD A; 3MEW A; 1AWW A; 4J7I A; 2XMF A; 2D1X A; 3GP8 A; 2LQN A; 4IUU A; 2DLP A; 3VUZ A; 4AG2 C; 2LDM A; 1YWP A; 1UEC A; 3A8H B; 4A4F A; 1KQS S; 2BUD A; 4BUG A; 2XG8 D; 1C6V X; 5CO7 A; 3CCQ A; 3JCM J; 1MMG A; 2GBQ A; 3CPW S; 1AT1 B; 2E1H A; 1RLP C; 1YJ9 T; 4PK4 A; 4M75 E; 3D7S B; 5LJ3 d; 5CVI A; 2L5Q A; 4LDU A; 1W6X A; 1WYX A; 3M0P A; 2V1R A; 1VQM Q; 4JJD A; 1CKB A; 4OMF B; 5J39 A; 5LJ5 f; 2X4X A; 3RKW A; 5GMK m; 1YJN Q; 1JB0 E; 3ER0 A; 2DXT A; 4EIK A; 1Q7Y R; 4XTW A; 3VJP A; 4C5G A; 4M75 B; 3PMI A; 5AT1 B; 3VV0 A; 1K8A R; 2CH4 A; 3G4S Q; 1Y0M A; 2PQW A; 2AKL A; 1K73 C; 1NYF A; 1YWO A; 3RBB B; 2EYQ A; 4FW2 A; 4RTT A; 4L5G A; 1U8R A; 1G83 A; 2E5K A; 5GAO r; 3MEA A; 1RAE B; 2EQU A; 3CCE A; 3TSZ A; 3QZ9 B; 2BZ8 A; 3EG9 B; 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