The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
PLDQPSCKALYDFEPENDGELGFREGDLITLTNQIDENWYEGMLHGQSGFFPLSYVQVLVPLPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain of rat endophilin A2
rcsb |
| molecule keywords |
Endophilin-A2
|
| molecule tags |
Endocytosis
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| source organism |
Rattus norvegicus
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| total genus |
11
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| structure length |
64
|
| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-01-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KRM A; 1T3L A; 2NWM A; 2FEI A; 1X6B A; 2JXB A; 2KBT A; 2KNB B; 4E6R A; 1WXB A; 5I11 A; 1K4U S; 4ZNX A; 1RUW A; 2DE0 X; 4M4Z A; 4HVV A; 2P4R A; 5IH2 A; 1ABO A; 4LNP A; 5I22 A; 1G2B A; 2D8H A; 1ARK A; 1HSQ A; 1A0N B; 3EHR A; 2O2O A; 2BTT A; 3U23 A; 1SRM A; 4CC3 A; 3UA6 A; 1PRL C; 2ROL A; 5IXF A; 1PKT A; 2EGE A; 1WIE A; 2J6K A; 2DIL A; 3I5S A; 3R6N A; 2O31 A; 4J9D A; 2K3B A; 1XOV A; 1BU1 A; 2PZ1 A; 5GJW B; 5IHK A; 5FWB A; 4AFS C; 1OEB A; 3H0F A; 2DL8 A; 2L2P A; 2LJ1 A; 1QCF A; 2K6D A; 2CSQ A; 2M51 A; 2KR3 A; 1H3H A; 3EG1 A; 1CSK A; 1V1C A; 1ZUY A; 1MV0 B; 1UGV A; 4DEX A; 1AWW A; 2DL3 A; 2HDA A; 3A98 A; 2YUQ A; 4IIO A; 2EYY A; 4GLM A; 2J6O A; 4QT7 A; 1M27 C; 3REB B; 1TUC A; 1GBR A; 1K0X A; 2RQR A; 1M8M A; 2DLP A; 1SHG A; 1UHC A; 1X69 A; 3CQT A; 3H41 A; 2DNU A; 2OAW A; 1GBQ A; 4F17 A; 1JXM A; 2CRE A; 2FRW A; 1UG1 A; 2ED1 A; 3REA B; 1KJW A; 1ZX6 A; 4RTY A; 2YT6 A; 1JXO A; 1AWO A; 3M0S A; 3UF4 A; 1JEG A; 1UE9 A; 5EC7 A; 3M0P A; 2HCK A; 1WLP B; 4OMO A; 5FWC A; 1M3B A; 4OMM A; 4CC2 A; 1X2Q A; 1SSH A; 1UDL A; 2DL4 A; 2PNI A; 3NPF A; 1WA7 A; 2DRK A; 4KRT A; 3VS2 A; 2FPE A; 2J7I A; 1SRL A; 1SHF A; 1I07 A; 2CSI A; 1TUD A; 2LQN A; 2M0Y A; 2JW4 A; 1W1F A; 2KRN A; 4RTV A; 2D8J A; 1WDX A; 3RBB B; 3TSW A; 2W0Z A; 3EG2 A; 2IIM A; 1NYG A; 2KGT A; 1M30 A; 1LCK A; 1YN8 A; 2FO0 A; 1X43 A; 2NUZ A; 2L3S A; 1WYX A; 2A37 A; 2LX7 A; 1GCQ C; 1K9A A; 3VS4 A; 3VS0 A; 2RQV A; 1SPK A; 1MUZ A; 1YP5 A; 4AFQ C; 2GQI A; 3M0T A; 1T0J A; 1WXT A; 3EHQ A; 2DJQ A; 2CH4 W; 1GFD A; 1ZSG A; 2DL5 A; 2KT1 A; 2LNH B; 4DEY A; 2EKH A; 2LZ6 B; 2AZS A; 1PKS A; 3RNJ A; 4J9I A; 3TSZ A; 2PTK A; 1KSW A; 2RF0 A; 3PVQ A; 3H0I A; 4D8K A; 3QWY A; 3VS3 A; 2DM1 A; 2LP5 A; 2KE9 A; 2HBW A; 4OML A; 2JTE A; 2DRM A; 4HXJ A; 4RTX A; 4HCK A; 2KEA A; 2JMA A; 1U5S A; 2CUB A; 5L23 A; 1GRI A; 2F2X A; 1QWE A; 2RN8 A; 2H8H A; 1UHF A; 3NMZ C; 2EW3 A; 1ABQ A; 3M0R A; 2V1Q A; 2EBP A; 2ENM A; 2GGR A; 1Z9Q A; 1CKA A; 4OMP A; 3C0C A; 1PWT A; 1YNZ A; 1OPL A; 2J06 A; 4K11 A; 1ZUU A; 1AD5 A; 1EFN A; 2FPF A; 2AZV A; 4JPB W; 2RQU A; 2L3P A; 2J6F A; 1ZBJ A; 2CT3 A; 2X3W D; 2VWF A; 2KYB A; 2JS2 A; 1NEG A; 2EPD A; 4AG1 C; 3PVL A; 2LCS A; 2DBM A; 2DA9 A; 3VS5 A; 2BZY A; 1JU5 C; 1WFW A; 1T3S A; 2D1X A; 2FRY A; 2F2V A; 2GBQ A; 3NGP A; 2K9G A; 4LUE A; 1NLO C; 1VYT A; 2EYX A; 1X2K A; 4JJC A; 2L3Q A; 2A28 A; 4CC7 A; 1AZE A; 2EVR A; 2G6F X; 2JM9 A; 1OOT A; 1AOJ A; 2LJ0 A; 1WX6 A; 1H8K A; 4AG2 C; 2MIO A; 2C0I A; 2ECZ A; 2I0N A; 2DVJ A; 3I5R A; 1QLY A; 4Z8A A; 1MV3 A; 2O88 A; 2JM8 A; 2A36 A; 4RTT A; 3JV3 A; 4Z89 A; 1GCQ A; 1UJY A; 1YCS B; 1E7O A; 2EGC A; 2E5K A; 1G83 A; 1Y57 A; 2YUP A; 3O5Z A; 3UA7 A; 2C0T A; 2AK5 A; 1ZLM A; 2KXD A; 2CH4 A; 2KT8 A; 1S1N A; 1M3C A; 4X1V A; 4GBQ A; 2CT4 A; 4AFZ C; 2ROT A; 2RQT A; 2K2M A; 3EG3 A; 1UTI A; 1ZUK A; 1SEM A; 1RLQ C; 2KYM A; 1U06 A; 1E6H A; 4JJB A; 1BB9 A; 2VVK A; 5ECA A; 4OMN A; 2D0N A; 2SEM A; 4Y92 A; 4EIK A; 2K79 A; 3I35 A; 3IQL A; 1K76 A; 3FJ5 A; 2FG0 A; 1RI9 A; 1W70 A; 3TVT A; 1B3Q A; 1PHT A; 2VKN A; 1OPK A; 4F14 A; 2C0O A; 3QWX X; 4WCI A; 1UJ0 A; 2GNC A; 4AFU C; 1KIK A; 2OJ2 A; 2HEQ A; 4JZ3 A; 5GJV B; 2CUD A; 3LH5 A; 2DMO A; 3EG0 A; 4RUG A; 4J9G A; 1WI7 A; 1VA7 A; 2DYB A; 1PNJ A; 2ED0 A; 2V1R A; 2O9S A; 1AVZ C; 1IO6 A; 1CKB A; 4ORZ A; 1UEC A; 4FSS A; 2F2W A; 2RMO A; 3PE0 A; 2LQW A; 3THK A; 1QWF A; 4LE9 A; 2X3X D; 3VRZ A; 3NHN A; 4HVU A; 3ULR B; 2KRS A; 2EQI A; 4J9F A; 4A63 B; 2B86 A; 1QKX A; 1WXU A; 2BZ8 A; 1NM7 A; 2YUO A; 2KRO A; 2QDL A; 1B07 A; 1BK2 A; 2HSP A; 1OV3 A; 2DX1 A; 1U3O A; 3M0U A; 1X6G A; 4J9C A; 1HJD A; 2AKK A; 2YUN A; 1GL5 A; 2MOX A; 1KFZ A; 2EYZ A; 1J3T A; 2W10 A; 2YDL A; 5IHI A; 3SHW A; 2K7A A; 4JJD A; 1RLP C; 3VS6 A; 2AKL A; 2MCN A; 1JO8 A; 2BZX A; 2EYW A; 1UUE A; 5FW9 A; 2DF6 A; 2J05 A; 1H92 A; 2YSQ A; 1JQQ A; 1VYU A; 1FYN A; 2EGA A; 1NEB A; 1FMK A; 5IXB A; 1I1J A; 4ESR A; 4CC4 B; 1AWX A; 4HVW A; 1NYF A; 2DL7 A; 4LUD A; 1YWP A; 4Z88 A; 2OI3 A; 4J9B A; 1X27 A; 3KFV A; 2LMJ A; 2SRC A; 2CDT A; 4D8D A; 1I0C A; 2JS0 A; 2L0A A; 1T0H A; 2JT4 A; 3SEM A; 3VS7 A; 2RQW A; 2LJ3 A; 4RTW A; 1NG2 A; 2GTO A; 3UAT A; 1YWO A; 5IHN A; 3I9Q A; 4R0K A; 4OMQ A; 3VS1 A; 1AEY A; 1N5Z A; 1PRM C; 4J9H A; 5HCK A; 4RTZ A; 3ZL7 C; 4RTU A; 1M3A A; 1AZG B; 1VYV A; 3EGU A; 4J9E A; 1UFF A; 2RPN A; 3M0Q A; 1K0S A; 2FPD A; 1BBZ A; 1HD3 A; 1Y0M A; 2GTJ A; 4JZ4 A; 1QKW A; 2JMC A; 2KXC A; 3GBQ A; 2ABL A; 1E6G A; 2RNA A; 4LN2 A; 2ESW A; 1K1Z A; 1W6X A; 1TG0 A; 2A08 A; 4IIM A; 1GCP A; 1NLP C; 2DBK A; 2O9V A; 1AWJ A; 1GFC A; 2XMF A; 3VRY A; 1Z9Z A; 4F16 A; 3H0H A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1T3L A; 3JCM d; 2NWM A; 2FEI A; 2KNB B; 5I11 A; 1WXB A; 4QW2 A; 2K5I A; 1QW1 A; 4M4Z A; 4M78 E; 4QQ6 A; 3CCL Q; 3CCJ A; 4XU1 A; 4ZGJ B; 1ABO A; 4LNP A; 5A2Q E; 1U8R A; 1EX4 A; 3EHR A; 3U23 A; 3LX7 A; 3UA6 A; 4C0Z A; 3CCL A; 1RAG B; 2EGE A; 1PSF A; 2CP3 A; 2J6K A; 1Y7X A; 2CP7 A; 2LNV A; 1RI0 A; 3LLR A; 2PZ1 A; 3NTH A; 3QPH A; 1KD1 R; 1M1G A; 4F7U B; 2HQH A; 4GLK A; 2L2P A; 1YI2 T; 1IXD A; 1QCF A; 4B6M A; 2M51 A; 4C8Q B; 3C4S A; 1V1C A; 1ZUY A; 4DEX A; 2EQU A; 3DB4 A; 2NUT A; 4J6Y A; 3CC4 T; 1QP2 A; 2CZ7 B; 2EYY A; 5LJ3 g; 5J39 A; 3OSV A; 4BE2 A; 3G6E T; 1QVF A; 3MCA B; 5AYF A; 1VQN Q; 2LT4 A; 2OTL A; 2RQR A; 3UT1 A; 2PVO B; 5GAN 4; 4M77 G; 3I56 Q; 3EFO B; 3M56 A; 2M1H A; 1LOJ A; 5CVI A; 1PCX A; 1N8R R; 2KY9 A; 1SG5 A; 3PT9 A; 1UG1 A; 1VQN A; 3REA B; 4RTY A; 4XQ3 A; 3KUF A; 1Q82 C; 5KYX A; 2XU8 A; 1WPY A; 3CCM A; 3CEY A; 1RAH B; 3VS2 A; 3CME Q; 2J7I A; 5IT9 E; 1BCM A; 2CSI A; 1TUD A; 4B9X A; 1R77 A; 1W1F A; 3RER A; 2AHJ B; 4PKC C; 2D8J A; 2QGF B; 1WDX A; 4N4H A; 1M2V A; 1YIT Q; 2W0Z A; 1K9M U; 1P92 A; 4OMF B; 2FB7 A; 1K8A C; 2C06 A; 3P8H A; 1NBE B; 1YJW T; 2A37 A; 2QEX Q; 3JRZ A; 4JRP A; 3VS0 A; 3EG9 B; 5CQX A; 1SPK A; 4C0D C; 4IUV A; 2K4Y A; 4KH0 B; 1WXT A; 3EHQ A; 2DJQ A; 3OYB A; 2CP5 A; 1Y96 A; 1ZSG A; 2QQR A; 4JLG A; 5DLO A; 2DL5 A; 2LNH B; 1Q7Y U; 5AT1 B; 2KQW A; 2QEX A; 1WHG A; 5GAN 6; 4J9I A; 1WHJ A; 2G3R A; 2DM1 A; 1I4K 1; 1K9M R; 2KEA A; 3MP6 A; 4PFZ A; 3VYG A; 1PSE A; 3H6Z A; 1QWE A; 1R8O B; 2COZ A; 3NMZ C; 1YJN T; 2CS7 A; 4BI8 B; 2ENM A; 2GGR A; 1Z9Q A; 4JLI A; 3GOX A; 4N0A A; 4LDV A; 2P84 A; 1WQW A; 1MGQ A; 2J06 A; 4K11 A; 2X9H A; 1AD5 A; 3KXT A; 5D6W A; 2QTX A; 3CCQ A; 2RQU A; 2CT3 A; 4M78 G; 2VWF A; 4PJM A; 2KYB A; 4AT1 B; 1LNX A; 2EPD A; 4AG1 C; 2E70 A; 2LCS A; 3CPW P; 3R6O A; 2FRY A; 1BI1 A; 2GBQ A; 3ER0 A; 4X34 A; 1VQL T; 1VYT A; 3QDF A; 1KHI A; 4XTV A; 2BE9 B; 2MK5 A; 4JJC A; 1B7T A; 2MYS A; 2RB6 A; 4CC7 A; 4ZTF A; 4JJN K; 1XQH A; 2G6F X; 5GAO p; 4MDX A; 1OOT A; 3CXC P; 4ELY C; 4AG2 C; 5FRM A; 3L1A A; 4C92 F; 2JM8 A; 1Q95 G; 2A36 A; 4RTT A; 2DXU A; 3HFN A; 3CBM A; 1GCQ A; 2EGC A; 2E5K A; 4J7I A; 1VQ7 A; 3RR6 A; 2C0T A; 2K2V A; 1BYM A; 2CH4 A; 3OA6 A; 3JB9 I; 3H9N A; 2DTH A; 4GBQ A; 3OYL A; 3OSS C; 3CXC S; 3V8J A; 2ROT A; 1ZQ1 A; 1UTI A; 1ZUK A; 4II1 A; 3EAE A; 4ZN1 A; 5KYN A; 2M02 A; 5J26 A; 3HKS A; 3IQL A; 3FJ5 A; 2FG0 A; 1Q86 R; 2AIR B; 1B3Q A; 2VKN A; 3A5Z B; 3L42 A; 4C5G A; 2L8D A; 4PJO F; 3QWX X; 4L5G A; 4WCI A; 4M77 F; 4AFU C; 1KIK A; 2P0Q A; 2XKO C; 4ZGE B; 3G4S T; 2CUD A; 3LH5 A; 1NPP A; 2O01 E; 2EJG A; 4J9G A; 5GAN 5; 4M7A F; 1W2B A; 4F7U A; 4C92 B; 2XK0 A; 2DYB A; 1OI1 A; 4J6X A; 2EWN A; 1UEC A; 1YHQ Q; 2LQW A; 4MZP A; 1QWF A; 1ZSZ B; 1I5L A; 1ZA2 B; 3M4Y A; 2LX9 A; 3JCM c; 4FW1 A; 4ZN3 A; 3RUX A; 2L5Q A; 2EQI A; 3H8Z A; 2QA4 Q; 3LYI A; 2LVM A; 4FSX A; 1NM7 A; 2NUP A; 1F1B B; 2QDL A; 1B07 A; 1NPR A; 2R58 A; 5LJ5 g; 1YIT T; 2E6N A; 2VXE A; 1I81 A; 3JSC A; 1X6G A; 4J9C A; 4PJO B; 1K73 R; 1G3S A; 2QA4 A; 1ZA1 B; 4M77 B; 4ELZ C; 2W10 A; 5HK3 A; 3M58 A; 3CCE Q; 2DJZ A; 2YDL A; 5LJ5 d; 1OU9 A; 1V76 A; 4O5V A; 4X9D A; 2P0P A; 4M7A B; 1D1C A; 1UUE A; 3CCR A; 1WZO A; 3FC3 A; 3JCM J; 4PJL A; 1JQQ A; 1VYU A; 1FYN A; 3QBY A; 3SWN B; 3TQ7 P; 5CR2 A; 2CZ1 B; 3L2Q A; 3CD6 T; 4ATO A; 1I1J A; 1QCN A; 4L6V 5; 4ESR A; 5GAN e; 1VQM T; 3CCE A; 4Y91 A; 3VU3 C; 4LUD A; 1NJI R; 1YWP A; 4ANJ A; 1VQ9 A; 2XDP A; 3E9F A; 3RIR A; 3CC2 Q; 3OYH A; 4FT2 A; 2P0K A; 5FU7 C; 5I2S A; 1T0H A; 4KGV B; 5GAN h; 1NG2 A; 3SFM A; 5GMK i; 1IHW A; 1B34 B; 1JJ2 A; 2VGM A; 3VJP A; 4FYY B; 4R0K A; 4BAC A; 1N9R A; 4M7D A; 2L3R A; 5GAM g; 3EG9 A; 3EGU A; 1S72 T; 1OX8 A; 2H3J A; 2DER A; 1BKB A; 1QKW A; 5GAM d; 2MAM A; 3OYF A; 1YI2 Q; 4M78 F; 4M75 A; 1KHC A; 3OYK A; 1K1Z A; 1UGS B; 1AHJ B; 2O9V A; 2YRC A; 5KYW A; 1Z9Z A; 4TVR A; 2KBT A; 1X6B A; 3G6E Q; 4J5Y A; 1YI2 A; 3CC7 T; 2X4W A; 1K4U S; 4ZNX A; 2DE0 X; 4HVV A; 2EQK A; 2R5M A; 2P4R A; 4E7K A; 3X25 B; 3D7S B; 4QQD A; 2MPX C; 1D1A A; 2F5K A; 3CC4 A; 4JS5 A; 9ATC B; 4RCC A; 2A7Y A; 5IXF A; 1PKT A; 4RG8 A; 2DIL A; 1WHM A; 3I5S A; 1MMA A; 4AMC A; 3AT1 B; 2K3B A; 1XOV A; 3UWN A; 5D6X A; 4M78 B; 1BU1 A; 5IHK A; 4M7D D; 4AFS C; 5FRN A; 3H0F A; 3E19 A; 2RHU A; 4UC4 A; 4B9W A; 2LJ1 A; 3TU4 K; 3TCJ A; 3JCM f; 2QDY B; 1H3H A; 1CSK A; 4IUT A; 2RO0 A; 2LCC A; 2DL3 A; 2HDA A; 4LXC A; 4M75 D; 2YUQ A; 4FU6 A; 2JNG A; 2K57 A; 4QT7 A; 5CKE A; 1YJW Q; 3RMQ A; 2HKQ B; 1K0X A; 3EFR A; 2X51 A; 5KCH A; 2B8A A; 5CKF A; 1YHQ T; 1VQ4 T; 1RAA B; 2I2L A; 3CCV A; 2DYI A; 2O4X B; 3LH0 A; 4YTL A; 1VQ6 A; 4QVD A; 4N0A C; 3OYJ A; 1QVG S; 2CRE A; 1MND A; 5L8R E; 1UEB A; 2DO3 A; 2ED1 A; 3QO3 A; 1WHH A; 2ZGW A; 2EQJ A; 1AWO A; 3UF4 A; 1UE9 A; 3JCM P; 2XDB A; 1QCO A; 3OYG A; 2DD4 A; 3M0P A; 2XI9 A; 3OB9 A; 1Q81 R; 4KUL A; 1X2Q A; 1SSH A; 3G71 A; 2PU9 B; 4NOY A; 2Y4X A; 3X28 B; 3LWH A; 4JDS A; 1R0B G; 4EMG A; 1YJN Q; 3PIO A; 4PNO A; 2MMP A; 2FPE A; 4IKF A; 4C92 A; 3SD4 A; 1Y07 A; 1VQO A; 2VUB A; 1K9M C; 3OW2 P; 6AT1 B; 3BW1 A; 4LD6 A; 1WJS A; 2DXT A; 1ZSZ A; 2IIM A; 4A4F A; 2KGT A; 1M30 A; 3GF5 A; 3NTK A; 5LJ3 f; 2IVW A; 1VQK A; 3EH2 A; 2FO0 A; 3L2U A; 2RHZ A; 1GCQ C; 1KD1 U; 2VV5 A; 1UB4 A; 1O9S A; 3EGD B; 3S3O A; 4A4K A; 3E1S A; 1IB8 A; 1YP5 A; 3CC2 T; 1VQL Q; 1JB0 E; 3L2V A; 3OW2 S; 1T0J A; 1Q7Y C; 2CH4 W; 4PJO A; 2V26 A; 2QI2 A; 2AT1 B; 4FYV B; 1G8X A; 1PKS A; 3TSZ A; 1KSW A; 1QVF S; 3FDR A; 3JCM h; 2RF0 A; 3JCM Q; 3TEE A; 3QWY A; 8ATC B; 3QHS A; 1VQ8 T; 2DRM A; 4M7A A; 3P8D A; 1GRI A; 4LD9 K; 2KK4 A; 2QQ9 A; 1PD1 A; 5A0D A; 3M0R A; 1N8R U; 2LRQ A; 1KQS A; 2RK1 A; 2KAF A; 3C0C A; 4J8O A; 1G3T A; 1YNZ A; 2XHC A; 1OPL A; 4E47 A; 1EFN A; 1TUG B; 2L3P A; 3S3M A; 2DEU A; 2JS2 A; 1B34 A; 2M0O A; 3M4G A; 2DBM A; 5CO7 A; 4BB7 A; 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