The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
PLDQPSCKALYDFEPENDGELGFREGDLITLTNQIDENWYEGMLHGQSGFFPLSYVQVLVPLPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain of rat endophilin A2
rcsb |
| molecule keywords |
Endophilin-A2
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| molecule tags |
Endocytosis
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| source organism |
Rattus norvegicus
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| total genus |
11
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| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-01-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KNB B; 2A28 A; 2LJ3 A; 2ENM A; 4J9D A; 5FW9 A; 2D8H A; 1H3H A; 2RPN A; 5IHI A; 5IXF A; 4Z89 A; 2GBQ A; 1WI7 A; 2CSQ A; 2JTE A; 1NG2 A; 2CH4 W; 2O88 A; 1YN8 A; 3EG3 A; 4AFS C; 1J3T A; 1K4U S; 1ZLM A; 1ZX6 A; 1N5Z A; 1OPK A; 1IO6 A; 1ZSG A; 1X43 A; 4OML A; 4J9H A; 1AWX A; 1WXU A; 3VRZ A; 1X27 A; 1SHG A; 2ROL A; 3EG0 A; 4AFZ C; 5FWC A; 1U3O A; 1FMK A; 4HVW A; 2OJ2 A; 1MUZ A; 2E5K A; 2YSQ A; 4CC7 A; 2CT4 A; 2CUD A; 3IQL A; 2ROT A; 1M3A A; 2XMF A; 2DMO A; 2A37 A; 2DVJ A; 1TUD A; 2MOX A; 4OMM A; 2JM9 A; 1NM7 A; 1OEB A; 2O9V A; 3TSZ A; 1HJD A; 2RQT A; 3M0T A; 1PWT A; 1WA7 A; 4J9E A; 1GBR A; 3NHN A; 2YT6 A; 1VYV A; 2FRW A; 4AFU C; 3M0S A; 1WFW A; 1UUE A; 2KYM A; 3M0R A; 2EGE A; 1YNZ A; 2DE0 X; 4AG2 C; 1NEB A; 2ESW A; 1NLP C; 1JXM A; 1WXB A; 2CUB A; 2FO0 A; 3EHR A; 2AKK A; 5IXB A; 4JZ3 A; 1Y0M A; 1BU1 A; 4R0K A; 2EW3 A; 4DEX A; 2JM8 A; 3SEM A; 1M27 C; 2SRC A; 1WIE A; 4J9G A; 1QKW A; 3TVT A; 2LMJ A; 1UEC A; 2DA9 A; 3I9Q A; 2A08 A; 4E6R A; 1T0H A; 1ZUK A; 1QWE A; 4ORZ A; 1X69 A; 2EYX A; 2DM1 A; 1AD5 A; 1WX6 A; 1QKX A; 1RUW A; 2EVR A; 1PRM C; 1T3L A; 4HCK A; 4Z88 A; 4FSS A; 5I22 A; 2L3S A; 1ARK A; 3H0I A; 4CC2 A; 1SPK A; 3JV3 A; 1UDL A; 2MCN A; 2KRM A; 4D8K A; 4HVU A; 1VYU A; 1U06 A; 1FYN A; 3VS7 A; 1AWO A; 3REA B; 2VVK A; 3GBQ A; 2HBW A; 1BK2 A; 2PNI A; 2ABL A; 1MV3 A; 3A98 A; 3PVQ A; 2DL8 A; 1Z9Q A; 1I1J A; 2X3X D; 1M30 A; 3EG2 A; 5HCK A; 2JXB A; 4A63 B; 1JXO A; 3VS4 A; 1QLY A; 2AZV A; 2CRE A; 2J6F A; 2DNU A; 2KBT A; 3VRY A; 2O9S A; 2L3P A; 3NPF A; 3VS0 A; 3PVL A; 3FJ5 A; 1YWP A; 2NWM A; 3M0P A; 2DRK A; 4LE9 A; 2AKL A; 1G2B A; 3QWX X; 2A36 A; 1B3Q A; 2PZ1 A; 3TSW A; 1T0J A; 2V1Q A; 3VS1 A; 1WYX A; 1ABQ A; 2LJ1 A; 4LUE A; 1AVZ C; 2GNC A; 1NEG A; 4Y92 A; 4LUD A; 3SHW A; 1WLP B; 1KSW A; 4RTY A; 1NLO C; 2RQW A; 4IIM A; 1QCF A; 2W10 A; 3VS3 A; 4RTW A; 2J7I A; 4OMO A; 2V1R A; 1M8M A; 2X3W D; 2KXC A; 1W70 A; 2HSP A; 3C0C A; 3I5R A; 2G6F X; 2F2V A; 2GGR A; 2LQW A; 4J9I A; 4F16 A; 1W6X A; 1YWO A; 1UJ0 A; 1Y57 A; 4RTT A; 1HSQ A; 1GCQ A; 1PKT A; 1NYG A; 5EC7 A; 2JT4 A; 4JPB W; 1BBZ A; 2LP5 A; 1SRL A; 1QWF A; 2EYY A; 2C0I A; 2LCS A; 4OMN A; 1ABO A; 2RQR A; 5GJW B; 1I07 A; 5IHN A; 2F2X A; 2M0Y A; 2RN8 A; 2OI3 A; 4HVV A; 2BZY A; 3EHQ A; 2KT1 A; 5ECA A; 3R6N A; 2EBP A; 2CH4 A; 2LQN A; 1UGV A; 4ZNX A; 1GBQ A; 1A0N B; 2HDA A; 4GBQ A; 2RMO A; 2DBK A; 3H41 A; 1X6B A; 2JMA A; 4J9F A; 2DBM A; 3UA7 A; 2DYB A; 2IIM A; 2YUQ A; 1JQQ A; 1BB9 A; 2I0N A; 3VS2 A; 2L2P A; 4JZ4 A; 1H8K A; 2OAW A; 2KRS A; 1CSK A; 4CC4 B; 2KR3 A; 2K7A A; 1SEM A; 3REB B; 1GL5 A; 2NUZ A; 2LNH B; 2D8J A; 1KFZ A; 3QWY A; 2J05 A; 2P4R A; 1JO8 A; 1YP5 A; 1NYF A; 2YDL A; 1UFF A; 2JS0 A; 1MV0 B; 1AZG B; 1E6H A; 2FPF A; 5I11 A; 4LNP A; 1EFN A; 4DEY A; 1X2K A; 1RLQ C; 2EQI A; 2RNA A; 2CT3 A; 2FEI A; 4ESR A; 3VS6 A; 1G83 A; 1RI9 A; 2LZ6 B; 2JW4 A; 4RTU A; 2GQI A; 2DL3 A; 5IH2 A; 2YUO A; 2EYW A; 3O5Z A; 1SHF A; 2BZ8 A; 1GRI A; 3I5S A; 3UF4 A; 1ZBJ A; 2HCK A; 2KE9 A; 2D0N A; 1VYT A; 2ED1 A; 2MIO A; 4JJC A; 1GFD A; 2B86 A; 2RF0 A; 1OOT A; 1WXT A; 3RNJ A; 1I0C A; 4QT7 A; 4AG1 C; 4KRT A; 1JU5 C; 4M4Z A; 2J6O A; 1GCP A; 2D1X A; 3PE0 A; 2CSI A; 3KFV A; 4J9C A; 2J06 A; 2DL5 A; 2K6D A; 3EGU A; 4GLM A; 4IIO A; 1KJW A; 1M3C A; 1V1C A; 1M3B A; 4AFQ C; 2L3Q A; 1VA7 A; 1PNJ A; 1AWJ A; 1ZUU A; 2DX1 A; 1UJY A; 1UHC A; 1RLP C; 2BTT A; 2M51 A; 1GCQ C; 4EIK A; 2K79 A; 2KRN A; 2SEM A; 2KXD A; 2K2M A; 4Z8A A; 1UHF A; 2W0Z A; 2YUN A; 1W1F A; 2KT8 A; 4JJB A; 1E6G A; 1TUC A; 1LCK A; 2HEQ A; 2DL4 A; 1PRL C; 1U5S A; 1OV3 A; 1PHT A; 2YUP A; 3EG1 A; 2DLP A; 2F2W A; 1YCS B; 2O2O A; 4LN2 A; 2RQU A; 2O31 A; 1X6G A; 2KYB A; 4RTZ A; 2RQV A; 2ED0 A; 3UAT A; 3I35 A; 2EKH A; 4RTV A; 3H0H A; 1K0X A; 2BZX A; 2CDT A; 1ZUY A; 2KRO A; 4CC3 A; 1TG0 A; 1GFC A; 1K9A A; 1X2Q A; 2FPE A; 3CQT A; 4J9B A; 2DJQ A; 3VS5 A; 2FG0 A; 1SSH A; 1H92 A; 4OMP A; 5FWB A; 2DF6 A; 4K11 A; 4F14 A; 4D8D A; 2VWF A; 1Z9Z A; 2EGC A; 1K1Z A; 4JJD A; 2K3B A; 3H0F A; 2ECZ A; 3M0Q A; 1UTI A; 3RBB B; 1SRM A; 1S1N A; 2GTJ A; 4F17 A; 2K9G A; 2AK5 A; 1PKS A; 1XOV A; 3LH5 A; 2C0O A; 4X1V A; 5L23 A; 5GJV B; 2JS2 A; 4HXJ A; 2DRM A; 1UG1 A; 3UA6 A; 2EGA A; 2DL7 A; 2L0A A; 2J6K A; 3M0U A; 3NMZ C; 2JMC A; 3ZL7 C; 2EPD A; 1AEY A; 3THK A; 2KEA A; 2QDL A; 4RTX A; 3U23 A; 2AZS A; 2KGT A; 4OMQ A; 3NGP A; 2LJ0 A; 5IHK A; 4WCI A; 1E7O A; 2H8H A; 1UE9 A; 1KIK A; 2GTO A; 1K76 A; 2FRY A; 1CKB A; 2LX7 A; 1K0S A; 2VKN A; 1B07 A; 1AOJ A; 1OPL A; 1T3S A; 2EYZ A; 4RUG A; 1AZE A; 2C0T A; 1WDX A; 1AWW A; 2PTK A; 1JEG A; 1CKA A; 3ULR B; 2DIL A; 1HD3 A; 2FPD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5J26 A; 4IUR A; 1Q82 U; 1VQ8 A; 5FU6 B; 2XDD A; 4QKU A; 2LJ3 A; 4IUU A; 3JCM d; 3EFS A; 4JLI A; 4Z89 A; 2GBQ A; 2JTE A; 1O75 A; 2CH4 W; 1K4U S; 1VQN T; 3MEA A; 3MJX A; 5GAN 4; 1IO6 A; 4N4G A; 2E6N A; 1K8A C; 1X27 A; 2MF2 A; 3OMG A; 2P4T A; 5LJ5 j; 2Z0W A; 1TXQ A; 1U3O A; 1FMK A; 4HVW A; 2OJ2 A; 2QGF B; 1MUZ A; 4RKU E; 2K5L A; 1BYM A; 2ROT A; 3CCQ A; 2XMF A; 3NTI A; 4N4I A; 3A8L B; 2D6F A; 2X4X A; 5GAM d; 4M7D D; 3CCM Q; 2OTL A; 4XTV A; 3R6O A; 4PJO C; 1OEB A; 2QEX T; 3TSZ A; 3OYH A; 1QVG S; 3CC2 Q; 5A0D A; 1VYV A; 2HNI A; 2PUO B; 1UUE A; 2KYM A; 1YNZ A; 2HQH A; 2ESW A; 2CUB A; 4ANJ A; 3I56 T; 2RI3 A; 4D6W A; 2AKK A; 5IXB A; 4JZ3 A; 4C0Z A; 2KK4 A; 3CCR Q; 2JOY A; 4PFP A; 1PCX A; 1XQH A; 1NJI R; 1O9S A; 1VQ8 Q; 1FWZ A; 4IUV A; 3TVT A; 1M2V B; 2LMJ A; 3VJP A; 2A08 A; 4ELZ C; 4ORZ A; 1AD5 A; 1QKX A; 4C0D C; 2EVR A; 4HCK A; 4FSS A; 2XDB A; 1V76 A; 3QJ6 A; 1Y7X A; 4DBR A; 4Y91 A; 4HVU A; 2M9U A; 2D9T A; 2RK2 A; 1AWO A; 3REA B; 3GBQ A; 3CCQ Q; 1WJQ A; 3SD4 A; 1MV3 A; 3A98 A; 3M53 A; 4C8Q G; 2OTL Q; 4F7U G; 2X3X D; 4FW1 A; 2AZV A; 4E7I A; 2J6F A; 2CKK A; 1Y07 A; 2DNU A; 2KBT A; 3VRY A; 5CCA A; 3CME A; 3FJ5 A; 4QQD A; 1N6A A; 4LE9 A; 1VQ9 T; 1G2B A; 5IT9 E; 4M7D B; 3TSW A; 4AMC A; 3A1P A; 1K9M C; 1M1K R; 4XU0 A; 2V1Q A; 1S72 T; 4OF1 A; 1RAG B; 2PVG B; 5A2Q E; 5GMK i; 2DTH A; 1VQ6 A; 4RTY A; 4F7U E; 3SFM A; 3CC4 T; 1ZHI A; 2LDM A; 3EGX B; 4RTW A; 3MP8 A; 4VUB A; 2MPX C; 4E2F B; 3JCM b; 1PD1 A; 4HCZ A; 2HSP A; 3CBP A; 2G6F X; 3JCM g; 4MZM A; 3KUF A; 2YRD A; 2QA4 T; 4M7D A; 2RB6 A; 1IXD A; 1GCQ A; 4A4K A; 1EZZ B; 4JPB W; 3QZ9 B; 1BBZ A; 2P0K A; 4N4H A; 1YI2 A; 5CQX A; 2JZ2 A; 2DAQ A; 3C94 A; 2EYY A; 2LCS A; 3DKM A; 4OMN A; 3EGX A; 3BDU A; 2LCC A; 5IHN A; 5DLQ E; 2M0Y A; 3CME Q; 1MMD A; 2RN8 A; 3QDF A; 1GXI E; 5GAM g; 2R5M A; 4HT9 A; 3HP9 A; 3QYH B; 5DY9 A; 1FMV A; 4C92 B; 1KD1 U; 2QQS A; 1NJI C; 1A0N B; 5FU7 C; 2HDA A; 2MK5 A; 2DBK A; 4MZP A; 1VQ5 T; 2CZ7 B; 4J9F A; 1VQ6 Q; 3EFO B; 3M57 A; 2IIM A; 4R56 A; 3L2V A; 3V7S A; 2COZ A; 3M58 A; 1V29 B; 4JZ4 A; 3OYI A; 3CCU T; 2QYZ A; 2KRS A; 1TH7 A; 3JCM W; 1CSK A; 4CC4 B; 2K2V A; 5M9O A; 1G3T A; 4X9C A; 4EDU A; 1IGQ A; 1K73 C; 2J05 A; 2P4R A; 3AT1 B; 3GOX A; 3L2R A; 3L2W A; 1NYF A; 1AZG B; 5I11 A; 3I56 A; 4E7L A; 1YI2 Q; 3EFO A; 1KQ2 A; 5C0M A; 2LRQ A; 5AYF A; 3E19 A; 7AT1 B; 2LZ6 B; 4FYV B; 4RTU A; 2DL3 A; 1W2B S; 2YUO A; 2EYW A; 1M1K C; 3O5Z A; 3H9N A; 2CZ1 B; 3CXC A; 4C8Q D; 3JSC A; 3E2U A; 3RKW A; 5CKF A; 1GRI A; 1VQN Q; 3I5S A; 3CBM A; 4KGX B; 1DJ7 B; 2DET A; 3GNG A; 1ZBJ A; 2HCK A; 2LC4 A; 2M02 A; 3C4S A; 2LNV A; 4JJC A; 1FMW A; 4XU3 A; 4B9X A; 2RF0 A; 1I0C A; 1KQS S; 4KRT A; 1JU5 C; 4BAC A; 4M4Z A; 2XID A; 4BY6 B; 2QQB A; 3PNW C; 2J06 A; 1RL2 A; 2DL5 A; 3EGU A; 2M1H A; 1M3B A; 4AFQ C; 5A0G A; 4RG8 A; 2L3Q A; 3CCL T; 1PNJ A; 1AWJ A; 1OU9 A; 1UJY A; 3QSU A; 1RLP C; 4EIK A; 3ASK A; 5GAN f; 3ME9 A; 3CCE T; 2RJC A; 3UPU A; 3DB4 A; 1VQ9 A; 1R8O B; 3OY9 A; 5CVI A; 1W1F A; 4LDY A; 1S72 A; 4OB2 B; 4DBQ A; 4FU6 A; 3I56 Q; 1TUC A; 4FT2 A; 4LDU A; 1PRL C; 3S6W A; 3TEE A; 2DFU A; 1OV3 A; 2YUP A; 3EG1 A; 2AT1 B; 3OQ5 A; 2P0Q A; 5LL6 S; 3CC4 A; 2DLP A; 2VGM A; 4RG2 A; 5CKB A; 2RQU A; 3OA6 A; 1ZSZ C; 3DLL A; 1M90 U; 3CD6 T; 1W4S A; 4RTV A; 3OYY A; 3KXT A; 4HKE A; 4L6V 5; 1YJ9 A; 1ZUY A; 4NOY A; 5GAO p; 2QA4 A; 1MMG A; 2HKQ B; 1K9A A; 1SKU B; 1QP3 A; 2BE9 B; 2FG0 A; 2RI5 A; 2VWF A; 3X26 B; 3HRS A; 5KH6 A; 1BKB A; 4BI3 A; 1YIT T; 3OYE A; 2ECZ A; 3RBB B; 4EPC A; 1NZ9 A; 1VQ9 Q; 2QAZ A; 2AK5 A; 1PKS A; 4C8Q C; 3HRT A; 3FJP A; 4X1V A; 1S72 Q; 3RER A; 2JS2 A; 4HXJ A; 3OYL A; 2K4Y A; 1UG1 A; 4J8O A; 1M4Z A; 1UGP B; 4JRK A; 2EGA A; 5KYW B; 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3M0R A; 3UDC A; 2EGE A; 4UC4 A; 2WSE E; 1OQK A; 3TCJ A; 4J6Y A; 2KAF A; 1Q82 R; 1BU1 A; 2GFU A; 4KUD K; 4OP0 A; 2IPO B; 2SRC A; 5KYU A; 3CD6 A; 2DA9 A; 2NUP A; 2WAC A; 2RO0 A; 4E6R A; 5KYY A; 1ZUK A; 4O5V A; 1PRM C; 1T3L A; 3V8L A; 2L3S A; 1ARK A; 1R0C B; 3H0I A; 4CC2 A; 3JV3 A; 1UDL A; 4C92 G; 2DTO A; 3CCL Q; 1JB0 E; 2O4X B; 1JRI A; 2MI6 A; 2PVO B; 3M55 A; 3MP1 A; 4MDX A; 3ZBD A; 4ZGJ B; 2X4W A; 1WPY A; 1N9S A; 1Z9Q A; 1M30 A; 2JXB A; 2EAY A; 5D6X A; 4A63 B; 3CCE Q; 3SDZ A; 3OS5 A; 1QVG A; 1JXO A; 3PIP A; 1QLY A; 3DB3 A; 3VYG A; 2Y4Y A; 5LJ5 e; 2L3P A; 4DOW A; 2E70 A; 3V8J A; 1YWP A; 2NWM A; 3CC2 A; 4L5G A; 4EMK C; 1M9S A; 2AKL A; 3QWX X; 1WHK A; 2A36 A; 1AHJ B; 1B3Q A; 1T0J A; 3VS1 A; 3MEV A; 1WYX A; 1ABQ A; 4EMK A; 3OYA A; 3N5B B; 4BDZ A; 5KYN A; 1KSW A; 1NLO C; 3WVD B; 8ATC B; 4PK4 A; 2O4X A; 1MMA A; 3GIB A; 3CD6 Q; 3ER0 A; 4J6X A; 2E5Q A; 3FRN A; 1D3B B; 4J6W A; 1LNX A; 2RM4 A; 2X3W D; 2X4Y A; 2KXC A; 3VU3 C; 1Q86 C; 1QVF S; 3I5R A; 4Z02 A; 2LQW A; 4F16 A; 1W6X A; 1UJ0 A; 4MML A; 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