The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
|
| molecule tags |
Ribosome
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| total genus |
18
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| structure length |
95
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| sequence length |
95
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| Q | PF01157 | Ribosomal_L21e | Ribosomal protein L21e |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VQP Q; 1Q86 R; 3CCM Q; 3CXC P; 1W2B P; 1YIT Q; 1YJ9 Q; 3CMA Q; 1VQO Q; 2QEX Q; 3CCE Q; 1Q81 R; 3CCU Q; 2QA4 Q; 3CCR Q; 1K9M R; 1KD1 R; 1M1K R; 1S72 Q; 3CC2 Q; 1JJ2 P; 1VQM Q; 1VQ4 Q; 1VQ9 Q; 3OW2 P; 1YJN Q; 3CPW P; 3CCJ Q; 1YJW Q; 1QVG P; 2OTL Q; 2OTJ Q; 1NJI R; 3CC7 Q; 1VQL Q; 1VQK Q; 3CCV Q; 3CC4 Q; 1N8R R; 1VQ7 Q; 1Q7Y R; 3G71 Q; 3G4S Q; 1YIJ Q; 1YHQ Q; 1KQS P; 1K8A R; 3CCQ Q; 1VQ6 Q; 1QVF P; 3G6E Q; 3CD6 Q; 3CCL Q; 3CCS Q; 3I55 Q; 1VQ5 Q; 3I56 Q; 1KC8 R; 3CME Q; 1VQ8 Q; 1VQN Q; 1M90 R; 1Q82 R; 1YI2 Q; 1K73 R; #chains in the Genus database with same CATH topology 2QEX T; 4KBM B; 5FU7 B; 2DIL A; 2EYZ A; 3KFV A; 4XU1 A; 3FEO A; 5C0M A; 1TU0 B; 3G71 A; 4P5N A; 2PNI A; 2DK3 A; 4M77 C; 4DOV A; 1VQN A; 2EWN A; 2E6Z A; 5IHN A; 3DB3 A; 1OX8 A; 1ZUY A; 1BB9 A; 3HTR A; 3GF5 A; 3REA B; 1BCM A; 5I11 A; 2KT8 A; 3OYA A; 4IIO A; 4C8Q A; 4M7A B; 3CME Q; 2F1L A; 3OW2 A; 1Z9Z A; 4J9C A; 3CMA T; 5KYX A; 2GF7 A; 5KYY A; 5CKD A; 1KSW A; 4M77 D; 2CH4 A; 4IUR A; 3OS0 A; 3I55 A; 4M75 D; 2H8H A; 1RAD B; 4JS5 A; 3A98 A; 5IXF A; 1WGS A; 1YHQ Q; 4PJL A; 1VQ6 Q; 1QLY A; 3VS7 A; 1KD1 U; 1FMK A; 4AFZ C; 2DTH A; 5CKB A; 3OW2 S; 3H0I A; 2DVE A; 2K3Y A; 2CH4 W; 1LNX A; 4ZN3 A; 3OYI A; 2X3X D; 3OSV A; 1O75 A; 4OMF B; 1R0B G; 1SKU B; 2LQN A; 1VQM T; 2KT1 A; 2LCC A; 1IGU A; 2LCL A; 1Q82 U; 1Y0M A; 3CME A; 4MDW A; 1D3B B; 1NJI C; 4A4H A; 2KAF A; 4AG1 C; 4M78 G; 1EIF A; 5CKF A; 2LNH B; 1R0C B; 2GBQ A; 3BE3 A; 3SHW A; 2RJC A; 1OPL A; 4PKC C; 3CCJ A; 4XAX B; 4LUE A; 2HSP A; 4DQ2 A; 1H92 A; 2W0Z A; 4LDV A; 3JCM V; 3LWH A; 2D8J A; 4OVA A; 3SDZ A; 1YCY A; 1OX9 A; 4FCY A; 1JEG A; 1YIT A; 2RQT A; 2JTF A; 1I81 A; 1K9A A; 3OYN A; 4E7S A; 3FJP A; 3RBB B; 4BDY A; 2JXB A; 2AHJ B; 4XU3 A; 2HBW A; 3CC2 T; 2JM8 A; 3SWN C; 3QDR B; 3O5Z A; 3J7A F; 2EQM A; 1CKA A; 3CBO A; 2EYY A; 3REB B; 1AHJ B; 3H0H A; 3JCM X; 4NS5 A; 1KQ2 A; 4J9I A; 1WLP B; 1FXX A; 4QKU A; 2V26 A; 3URG A; 4B9W A; 3J80 E; 3G7Z A; 2ZPB B; 3CCU T; 3UPU A; 2AZS A; 1OU8 A; 2RI3 A; 1X2Q A; 3PFS A; 2PUK B; 5J39 A; 2Y4Y A; 2K7A A; 2KI7 A; 2B86 A; 2FEI A; 2P4R A; 2R5M A; 3QUI A; 1QCO A; 1YCS B; 4KH0 B; 1AEY A; 1WHM A; 5D6X A; 3CCL Q; 5HCK A; 2K3X A; 4ZTF A; 4JJB A; 4PL6 A; 1PHT A; 1Q82 R; 4MZP A; 1MUZ A; 4MZT A; 3PNW C; 5LJ3 d; 4M75 G; 2HEQ A; 1RAC B; 1GL5 A; 4OMM A; 2XU8 A; 1PWT A; 2JTE A; 1YJW T; 2RD1 A; 1PC0 A; 2JOY A; 1M4Z A; 4FYX B; 4RTX A; 3RKW A; 3MET A; 3OBY A; 4J7I A; 3OMC A; 1QCF A; 2GFU A; 2L89 A; 2DL3 A; 2CT3 A; 2ECZ A; 2DET A; 5CQX A; 3OBW A; 2XD0 A; 4B9X A; 4F17 A; 3S3N A; 4HXJ A; 2QGF B; 1M8V A; 1KK7 A; 2XDD A; 5LJ3 h; 1VQ9 Q; 1VQK T; 1T3S A; 4BE2 A; 3CCL A; 1WA7 A; 3CCV Q; 2CUD A; 1PSE A; 5FRO A; 2ABL A; 4HKE A; 2K5F A; 2D9T A; 1QQJ A; 3QWY A; 5GAN 3; 2C0I A; 2KSS A; 2J6K A; 3MO8 A; 3CPW A; 2E65 A; 1N5Z A; 3HHT B; 3RNJ A; 1ZLM A; 1ABO A; 2KRM A; 3JCM P; 5GAM f; 1YN8 A; 1SF9 A; 4C92 C; 1GBR A; 4PLI A; 2KEA A; 1HK9 A; 2MAM A; 2NUZ A; 3MPU B; 1Q7Y R; 5GAN d; 3MHX A; 2RI2 A; 2HDA A; 2V8K A; 4PJO A; 5CCA A; 3CCM T; 5LJ5 g; 1AWO A; 1ZUU A; 2KYM A; 3QJY A; 4JZ3 A; 5ECA A; 1PD0 A; 2HSE B; 2MF2 A; 2J7I A; 3CCV A; 4M7D E; 3EG1 A; 8ATC B; 2RMO A; 3HKS A; 2OTL T; 2K5L A; 2CP5 A; 4C92 D; 2LJ3 A; 1HXD A; 1T0H A; 2RQR A; 3MCA B; 4BE0 A; 1ZSZ A; 4DOW A; 1KJW A; 5IHK A; 2K4Y A; 4JRI A; 2X4J A; 5GAN h; 1PKT A; 3VV0 A; 4N0A C; 4DA4 A; 1GCQ C; 4J6W A; 1PKS A; 1W2B P; 3FLG A; 1WX6 A; 3UA6 A; 4JLG A; 1HJD A; 2ED0 A; 2MK5 A; 3RUX A; 4HCC A; 1YBY A; 3L2Z A; 4ESR A; 2JVV A; 2DFU A; 4RMO A; 1SEM A; 2EJ9 A; 4AT1 B; 2GTJ A; 3T9N A; 1TG0 A; 3PIO A; 4GLK A; 1HSQ A; 4VUB A; 2HKN A; 1GFD A; 2CGH A; 2DL8 A; 2L0A A; 2KGT A; 1K0S A; 5KH6 A; 2V8J A; 1Y57 A; 2XHC A; 3QSU A; 4ELY C; 2JZ2 A; 4M7D F; 2EKH A; 4WF2 A; 4J7F A; 3M9Q A; 3TEE A; 2EYQ A; 3JB9 I; 3JCM h; 2DD4 A; 1FYN A; 4J6Y A; 3EFR A; 3M53 A; 2KYB A; 2E3I A; 1GCP A; 2DVJ A; 5LL6 S; 3ZFJ A; 4FM4 B; 2V8I A; 3PT9 A; 1PD1 A; 1C0M A; 4HVU A; 3EG2 A; 1JXM A; 1UHF A; 1QP2 A; 4M77 F; 2ED1 A; 1MV0 B; 2NUT A; 2ZPE B; 3S6W A; 3JCM b; 1V76 A; 4RG2 A; 1YWP A; 3L2R A; 2HQH A; 2YUN A; 4FL6 A; 3C95 A; 3Q1J A; 1YHQ T; 1VQ6 T; 4MML A; 2ENM A; 3VUB A; 4EMG A; 1ZHI A; 5FU6 B; 1NYG A; 3FIF A; 2EQU A; 2X51 A; 3FC3 A; 1N8R U; 2M16 A; 1VQ7 A; 3V8K A; 4M7D B; 2FB7 A; 2F2V A; 3H9N A; 5KE3 A; 3JAM E; 2AZV A; 4EPC A; 3M4Y A; 4RTU A; 4CC4 B; 2YSQ A; 3MEV A; 1VIE A; 4J9B A; 3JB9 J; 4M7A G; 1RI9 A; 4HCK A; 2Y4X A; 4C8Q C; 1A0N B; 4M77 B; 2H3E B; 3GPL A; 2CUB A; 3MEW A; 3JB9 D; 3ULR B; 4Z8A A; 1HD3 A; 3EG9 B; 2DKG A; 3JV3 A; 3CCS A; 1EFN A; 5GMK l; 3X26 B; 4ZGD B; 1MMN A; 4JDS A; 4X9D A; 4PJM A; 1UEC A; 3G4S Q; 4HVV A; 2D0Q B; 3M54 A; 1M1K U; 3CQT A; 4DBF A; 3GP8 A; 2O9V A; 1OZ3 A; 4QQ6 A; 2MPX C; 1GRI A; 2K3B A; 4CI0 C; 2K6D A; 1YJ9 Q; 2QA4 T; 2FYK A; 2VWF A; 1D09 B; 1U06 A; 1NG2 A; 5LJ3 f; 3OB9 A; 4FYY B; 4C5I A; 3I9Q A; 3R6O A; 3CC4 Q; 2YWW A; 3RIR A; 4KGZ B; 2V1Q A; 2F2W A; 3G6E T; 3OYL A; 1B34 B; 3RMS A; 3TU4 K; 4KGV B; 2NWM A; 4LDW A; 5GJV B; 5J26 A; 2DL7 A; 3A8O B; 2DEU A; 4FSS A; 1MV3 A; 3L2U A; 1M3C A; 2DZ9 A; 2P84 A; 1N8R R; 3A5Z B; 4JS4 A; 2WSF E; 1VQ8 Q; 4RCC A; 3JCM e; 1QKX A; 2LQK A; 2PQW A; 2KXD A; 1PRL C; 3O8V A; 2EBP A; 4A54 A; 3RER A; 4J9D A; 3CCR T; 1O9S A; 1WYX A; 5CIU A; 1JRI A; 3NTI A; 3CBP A; 1WXT A; 2BUD A; 1GFC A; 5I2M A; 4Q5W A; 2V1R A; 3SWN B; 5GAN f; 1QWE A; 2NUT B; 1VQ4 A; 3EFS A; 1K0X A; 4C0Z A; 4Y92 A; 1UE9 A; 1Q81 C; 1VQ9 T; 4RTW A; 5KYW A; 1KFZ A; 2DNU A; 1XJW B; 3RKY A; 4FT2 A; 2CS7 A; 1M30 A; 1SRL A; 4AFU C; 1G2B A; 1JBM A; 2NUP B; 1BI3 A; 1GXI E; 1SG5 A; 1NJI U; 3D7S B; 3PMT A; 1M90 C; 5GJW B; 4J5Y A; 3VKI A; 5AT1 B; 4UC4 A; 2LQW A; 2YRD A; 2MOX A; 3M0P A; 2EW3 A; 2DF6 A; 1FMW A; 3EGD A; 3UA7 A; 2QDL A; 1OU9 A; 1YFN A; 4TVR A; 1X75 C; 1ZBJ A; 4OB3 B; 2D6F A; 2E3H A; 2M02 A; 1OZ2 A; 3QPH A; 3GNG A; 2COZ A; 1WDX A; 1VQN Q; 1Z9Q A; 5IAY A; 5FU6 C; 2CDT A; 2I2L A; 3MEA A; 4C92 F; 3TCJ A; 2LX9 A; 3MKD A; 2Y90 A; 3I56 A; 2OAU A; 5D7U A; 3P8B B; 4PFO A; 2PZ1 A; 1KQS P; 1TUG B; 1D0Z A; 3VS5 A; 3I55 Q; 2CP0 A; 5HY6 A; 3FDR A; 4C0F A; 5EG2 A; 3OMG A; 5GMK j; 1Y96 B; 4F7U F; 2KRN A; 3HRS A; 3FB9 A; 4L5G A; 4XK8 E; 3UDC A; 5GAM g; 1TTH B; 2RM4 A; 1S72 Q; 2ROT A; 3GBQ A; 1WZO A; 1W70 A; 2JTM A; 1UG1 A; 1SRM A; 4F04 B; 2BZX A; 4ZNX A; 4Y91 A; 4M7D D; 2PVO B; 3LWI A; 4M4Z A; 4R0K A; 4QVC A; 4BD3 A; 2DAQ A; 1JB0 E; 2DA9 A; 2EFI A; 2JW4 A; 1VQP T; 4PJO C; 4A63 B; 2IVW A; 3VJP A; 1Q86 C; 1LPL A; 2SRC A; 4C92 B; 1AZG B; 4JPB W; 4J9E A; 1BK2 A; 2EJF A; 1IRE B; 1UGV A; 3CC7 T; 3CCJ Q; 3OYH A; 1NJI R; 1W6X A; 1QMC A; 4J6X A; 4OMQ A; 4LNP A; 3HL8 A; 2HAX A; 4F7U B; 1S72 A; 2IPO B; 1KQ1 A; 1YIT Q; 2EGC A; 4XTW A; 3RKX A; 3JCM Q; 2QQB A; 4CC3 A; 1IZ6 A; 4E2F B; 2MIO A; 2GGR A; 2E1H A; 2AIR B; 2E4H A; 2G6F X; 1RI0 A; 2RNA A; 2HKQ B; 4C8Q E; 3RMQ A; 1D0X A; 4BI4 A; 4QVZ A; 4Z02 A; 2X35 A; 2DXT A; 3HFN A; 2QAS A; 5GAO m; 1Y71 A; 4LDY A; 1Y07 A; 3OYD A; 2FO0 A; 2HQE A; 2C06 A; 1UUE A; 5A0D A; 3QZ5 B; 1TWB A; 3CBM A; 4CC7 A; 4ZN1 A; 4FIB A; 1BI1 A; 2OTJ Q; 2DXC A; 2EVR A; 1UJ0 A; 1WNL A; 1X43 A; 5GAO q; 5A2Q E; 1R77 A; 1ABQ A; 4RTY A; 1RLP C; 3JB9 F; 2LX7 A; 2COW A; 4LN2 A; 4LXC A; 1BIA A; 1M1G A; 2JJ9 A; 3M4G A; 1YIJ A; 4II1 A; 2ESW A; 1NBE B; 1HYO A; 2G3R A; 3JCM W; 3G4S T; 2CYZ B; 3CCQ T; 3EGU A; 3EGX A; 2MYS A; 3LLR A; 2CZ7 B; 4C8Q F; 2ZPI B; 4QW2 A; 4AMC A; 3EG3 A; 3QWX X; 2DMO A; 3INZ A; 2CP7 A; 3TRE A; 1YJ9 T; 3N5B B; 5IT9 E; 3EAE A; 2K9G A; 2E5K A; 2XG8 D; 2OTJ A; 2QTX A; 2JM9 A; 3MJX A; 1VA7 A; 2L5Q A; 3M55 A; 1KD1 R; 4M7D G; 2LNV A; 1G8X A; 3CC4 T; 5GAN 7; 1E6H A; 2ZPF B; 3H8Z A; 2XK0 A; 1NPR A; 1R8O B; 1MMG A; 1W2B A; 5D6W A; 4JJN K; 3JCM c; 1VYV A; 1X2K A; 4RCB A; 3CCE A; 3VS0 A; 4K11 A; 3UF4 A; 4M78 A; 5A0G A; 2LQ8 A; 1D0Y A; 3M59 A; 1KC8 C; 1H3H A; 2MMP A; 4WCI A; 2CP2 A; 4M77 G; 4KUL A; 1K8A U; 1UJY A; 2CT4 A; 1WHJ A; 3A8L B; 3OS2 A; 1EZZ B; 2XID A; 1W2B S; 1BU1 A; 2GQI A; 1D1C A; 1VIF A; 4C8Q B; 3A8M B; 2E70 A; 2OAW A; 1IRX A; 3OYJ A; 1VQ8 T; 4PLL A; 4HT9 A; 3CD6 Q; 3WXM B; 5KYX B; 8AT1 B; 3PMI A; 5KYY B; 3GNF B; 1NM7 A; 1UDL A; 5LJ3 g; 1M2V A; 2F5T X; 5KYU A; 3J81 E; 3V8J A; 1X6O A; 3BFM A; 2BIV A; 2RQV A; 4JJC A; 4DBQ A; 2R58 A; 2KVQ G; 4M78 E; 4A53 A; 2RA2 A; 1X6B A; 2KRO A; 1MNE A; 4XQ3 A; 3OYB A; 4FW2 A; 1G5V A; 2LP5 A; 5GAO r; 3NFC A; 1OYX A; 3OQ5 A; 1AWJ A; 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1MMA A; 2F69 A; 2LZ6 B; 2P0P A; 3CCJ T; 3LH0 A; 3OYY A; 3NTK A; 4V2S A; 4IUQ A; 1YI2 A; 4IIM A; 3M0Q A; 2LMJ A; 4PJO F; 2QEX A; 3KBG A; 1T3L A; 1AT1 B; 1ZA1 B; 2VGM A; 3CCS Q; 1MMD A; 4Z88 A; 1YIT T; 2QG9 B; 9ATC B; 1AWX A; 4MZM A; 2A7Y A; 2EAY A; 2FL7 A; 4ZGE B; 2SEM A; 3EFO A; 1G3W A; 2JUF A; 2YUO A; 2CRE A; 1GBQ A; 2HL3 A; 1VQM Q; 3SEM A; 3CPW P; 1WQW A; 1Q81 U; 2XMF A; 3EH2 A; 4NL2 A; 4O6J A; 3CMA A; 2RJF A; 4FW1 A; 1CKB A; 1TH7 A; 4AG2 C; 4E7J A; 5FRM A; 3OYG A; 2KE9 A; 2P0Q A; 1KHI A; 1MND A; 1UGS B; 2CSQ A; 4C92 G; 4A4K A; 4ZGJ B; 1JXO A; 1T0J A; 3LGF A; 1BKB A; 4C5E A; 1M90 U; 2O31 A; 1I5O B; 1UGR B; 3TSZ A; 4OP0 A; 4PJO B; 1NEB A; 1H8K A; 5CQY A; 3I5S A; 1ZBX A; 1C6V X; 1SPK A; 1MHN A; 4HCZ A; 2LDM A; 2O4X A; 3NPF A; 1NYF A; 4C8Q D; 1VQM A; 4F7U G; 2D8H A; 3BDU A; 2M1H A; 2VV5 A; 1ACM B; 4CRI A; 5M9O A; 5LJ5 e; 4DBH A; 1K9M C; 4GY5 A; 5KE2 A; 2ZGW A; 1EX4 A; 1ZSZ B; 2HQX A; 2BZY A; 4Y28 E; 1XNI A; 1D1B A; 2LJ1 A; 3HPW A; 3E1S A; 3LYI A; 3L42 A; 4LDU A; 1H64 1; 3C94 A; 3AHU A; 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