The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
|
| molecule tags |
Ribosome
|
| total genus |
20
|
| structure length |
95
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| sequence length |
95
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| Q | PF01157 | Ribosomal_L21e | Ribosomal protein L21e |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3CCQ Q; 1YIT Q; 1Q7Y R; 3CC2 Q; 3CCU Q; 3CPW P; 1YHQ Q; 2QA4 Q; 1KQS P; 3I55 Q; 1VQ4 Q; 1Q81 R; 2QEX Q; 1YJ9 Q; 1K8A R; 1VQP Q; 1YJN Q; 1M1K R; 1YJW Q; 1W2B P; 3CCM Q; 1YIJ Q; 1QVG P; 3CCL Q; 1Q86 R; 1N8R R; 1M90 R; 1S72 Q; 3CCE Q; 3CMA Q; 2OTJ Q; 3CCR Q; 1VQ5 Q; 3CME Q; 3CCJ Q; 1KC8 R; 3OW2 P; 3I56 Q; 3CCS Q; 1VQN Q; 3CC7 Q; 3G6E Q; 3CCV Q; 1K9M R; 1YI2 Q; 1VQ7 Q; 1QVF P; 3G71 Q; 3CC4 Q; 1VQ6 Q; 1VQO Q; 1VQ9 Q; 1VQK Q; 1KD1 R; 1VQL Q; 3G4S Q; 1JJ2 P; 3CD6 Q; 3CXC P; 1Q82 R; 2OTL Q; 1VQ8 Q; 1VQM Q; 1NJI R; 1K73 R; #chains in the Genus database with same CATH topology 1K0S A; 2B86 A; 1VQ6 T; 2CS7 A; 2RHU A; 3E9G A; 5FW9 A; 1ZQ1 A; 3QZ5 B; 3JCM P; 1OQK A; 2ZZD A; 1XNI A; 1F1B B; 2LTO A; 3EFS A; 3OMC A; 2K2V A; 3ULR B; 5GAN g; 2E6Z A; 5KYY B; 2HKQ B; 2LT1 A; 5FU7 B; 2KVQ G; 3RBB B; 1YIT Q; 4M7D G; 1AZG B; 1QVF A; 4XQ3 A; 2LQW A; 2A7Y A; 1SEM A; 2ZPF B; 1OPL A; 1T0J A; 4M77 A; 1K8A C; 8AT1 B; 2GBQ A; 1I81 A; 2YWW A; 3JB9 I; 4AFZ C; 3CMA A; 1C6V X; 3M57 A; 3HHT B; 1AWO A; 1M3A A; 1VQ9 T; 1AT1 B; 4RCC A; 3BW1 A; 2DL4 A; 3KXT A; 4C8Q B; 5IHK A; 2CT3 A; 1U06 A; 1NLO C; 1Q7Y U; 2JS2 A; 2FL7 A; 2X3X D; 4E7I A; 3EG9 B; 3OYJ A; 1S72 A; 1E6H A; 1K8A U; 2IG0 A; 2DIL A; 5I22 A; 3SD4 A; 1YN8 A; 3OYM A; 5GAO n; 1VQN T; 4LDU A; 2A3L A; 1U1T A; 3OYE A; 3H8Z A; 4X1V A; 2LDM A; 3RUX A; 2JS0 A; 3CMA Q; 5DY9 A; 3OYB A; 2C0O A; 1KJW A; 1TOV A; 2K79 A; 3QPH A; 3AHU A; 2RF0 A; 4JJB A; 4KUL A; 4KRT A; 4VUB A; 1HYO A; 3M56 A; 1VQ5 T; 2R57 A; 1VQ7 A; 2K9G A; 2MOX A; 2CGH A; 1JJ2 A; 4M75 G; 3JCM V; 2HBP A; 4V2S A; 1AVZ C; 5A0D A; 4M78 D; 4TVR A; 3HSB A; 1SHF A; 1W4S A; 2HAX A; 3CCE T; 4K11 A; 1ZLM A; 1N9R A; 2A08 A; 2XKO C; 4HT9 A; 4N4G A; 3X20 B; 1VQL A; 1ARK A; 2BTT A; 5GAM h; 3PMT A; 4BY6 B; 3S3N A; 2I2L A; 2PUO B; 4OMO A; 4P5N A; 3GOX A; 1BK2 A; 1WA7 A; 1ZSZ B; 1W6X A; 1AD5 A; 3FRN A; 4M78 A; 5GAO l; 4Z8A A; 3CEY A; 1YJW T; 4HXJ A; 2V26 A; 3QKJ A; 2Y4X A; 2NUT A; 1YI2 T; 2DO3 A; 2ZPI B; 3CBM A; 1Y96 B; 1X6G A; 2JTM A; 3CCQ A; 2PNI A; 3VS5 A; 4GLM A; 4MDW A; 2C06 A; 4E47 A; 1N6A A; 1OU9 A; 1PWT A; 1PC0 A; 1MHN A; 2QAZ A; 4F16 A; 2JTE A; 4PJO E; 1VQL Q; 1PRM C; 1UB4 A; 3OYN A; 4JUV A; 2HQH A; 2LQK A; 1MUZ A; 2XDD A; 2X4J A; 2P0P A; 3VS3 A; 2JZ2 A; 1VQ6 A; 5GAM j; 3CQT A; 3ZFJ A; 2PVD B; 3TEE A; 4E7Z A; 2RNA A; 2RMO A; 2YDL A; 3OW2 S; 2DA9 A; 3A8L B; 3I9Q A; 3VUZ A; 4OMM A; 1GXI E; 1D1A A; 4J9I A; 5GAO p; 3S6W A; 5FRO A; 3H9N A; 2PU9 B; 1OV3 A; 5CR2 A; 5LJ3 h; 2CZ6 B; 2GFU A; 2ZCF B; 2QGF B; 3I56 T; 2VV5 A; 5DLQ E; 3M9Q A; 2H8H A; 1I5O B; 1X2Q A; 3M55 A; 3CC2 T; 2CH4 A; 3C94 A; 2F1L A; 1AZE A; 3OYG A; 4QQG A; 3CBP A; 3RNJ A; 3KFV A; 1JBM A; 1JEG A; 1IXD A; 4PFO A; 1TS9 A; 3CCJ A; 2VKN A; 1WJS A; 3AT1 B; 3G6E T; 3QDR B; 2EAY A; 4LE9 A; 4ANJ A; 5A0L A; 2EIF A; 4DOW A; 1UGS B; 1NZ9 A; 1NEB A; 2FHD A; 5J3B A; 3S3M A; 1U5S A; 3BE3 A; 2HDA A; 3SWN C; 1NJI U; 3VYG A; 4BD3 A; 1VUB A; 5LJ3 j; 1YJ9 T; 3A98 A; 3VU3 C; 2PQW A; 2CZ1 B; 4C92 B; 5FRM A; 2AZV A; 1QVG A; 1JXO A; 4RG8 A; 1VQN A; 1D3B A; 1K73 R; 4NL3 A; 2Z0W A; 4N0A A; 1OOT A; 1N5Z A; 4E6R A; 2V1Q A; 4R56 A; 4JJN K; 4C8Q F; 4GLK A; 3DB4 A; 2EQK A; 3CCJ Q; 2EYX A; 3U23 A; 2YT6 A; 3ASK A; 1GBQ A; 2X3W D; 2YRV A; 2QQA A; 4C5H A; 1VQ5 A; 2DL3 A; 2IIM A; 4OGE A; 1M27 C; 1UEB A; 1YCS B; 2K4Y A; 3TCJ A; 4L59 A; 2DXU A; 1SSF A; 3G4S T; 2RI5 A; 4KUI A; 4CI0 C; 5HK0 A; 2KRO A; 1M90 R; 4BDY A; 2G3R A; 1VQN Q; 3A8H B; 3QZ9 B; 3CCE A; 3L2W A; 3PVQ A; 1Z9Z A; 1M8M A; 1B3Q A; 4FT2 A; 2KT8 A; 1AEY A; 5J39 A; 3CCV T; 4CC3 A; 1W70 A; 4C8Q E; 2AKL A; 2ZPG B; 4RTV A; 4A4K A; 4OVA A; 1M1K R; 3UA6 A; 2PTK A; 3OYY A; 4F14 A; 1N8R R; 4IUU A; 2HCK A; 4RTT A; 1XTD A; 1VQ5 Q; 1X75 C; 1WHL A; 4XTX A; 3V7S A; 1YJW A; 2DYI A; 2BKD N; 1WXU A; 4LDV A; 3CCS A; 2RH2 A; 2RHX A; 4QVZ A; 3EGU A; 1JXM A; 4LDW A; 5LJ5 j; 1VQM T; 4PJN A; 2OTL T; 1ZUU A; 5HY6 A; 2VC8 A; 3LGF A; 2I0N A; 2KYM A; 1UGV A; 4FSX A; 4E7J A; 5LJ5 g; 1Y7X A; 4OMP A; 2QI2 A; 3L1A A; 1AWX A; 3CC7 T; 1KK7 A; 4KH1 B; 2KNB B; 4F04 B; 1G3W A; 5CKE A; 1GL5 A; 1Q81 R; 5KCO A; 3JB9 G; 3I5R A; 1T3S A; 3OBW A; 2HD0 A; 1B34 A; 2JJ9 A; 1YJW Q; 4ORZ A; 2H3J A; 1T0H A; 1B7T A; 3ZBD A; 1PSF A; 1HJD A; 1KG1 A; 3CCS Q; 1GFD A; 4KGV B; 2QXF A; 2A36 A; 1X27 A; 2JTF A; 2E12 A; 3I56 A; 2YSQ A; 3EFO A; 4A4F A; 4PJO A; 2DEU A; 4OMN A; 2D9T A; 2AZS A; 2OAW A; 5I11 A; 3I55 A; 2K6D A; 1KQ2 A; 2O4X B; 2DET A; 5KE3 A; 5KYW A; 1Y71 A; 1WHK A; 4EMK A; 3OYD A; 2K3X A; 2OAU A; 1PSE A; 1ZX6 A; 1W2B S; 4HVW A; 1FMK A; 3G6E A; 2J05 A; 3OBY A; 2CZ0 B; 1K9M U; 2HQX A; 4RUG A; 2P0Q A; 2WSE E; 1SHG A; 2KBT A; 3UF4 A; 8ATC B; 3Q1J A; 1O75 A; 5AT1 B; 2KXD A; 5FWB A; 5FU7 C; 4IKF A; 2LJ0 A; 4BI8 B; 1ZSG A; 1V29 B; 4FCY A; 3SB2 A; 3I55 Q; 2QDY B; 2JVV A; 5IN1 A; 4M7D B; 4Y91 A; 3E1S A; 2EQM A; 3CCU T; 2IPO B; 4HCZ A; 1QMC A; 4M7A B; 3GLX A; 3G6E Q; 1PD0 A; 4RTU A; 3CCL T; 4QW2 A; 3CD6 Q; 1D1C A; 2RM4 A; 2XID A; 3C95 A; 3NHN A; 4FU6 A; 4C92 F; 2DYB A; 2LNV A; 3HKS A; 3G4S A; 2WSF E; 1ZUK A; 5CKH A; 1NE8 A; 4LD6 A; 2AK5 A; 4J83 A; 4RTZ A; 2DAQ A; 1QP2 A; 2YHT A; 4JDS A; 4CC4 B; 2ZAE A; 3QWX X; 4JRI A; 1EX4 A; 1H8K A; 1KC8 R; 1UUE A; 2QK0 A; 4JRK A; 1VOM A; 4O5V A; 3JCM g; 3FIF A; 4DBQ A; 1DJ7 B; 3CCV A; 3ZEH A; 5KYY A; 2KK4 A; 2LT4 A; 2BZX A; 3M54 A; 1NBE B; 3A5Z B; 3A8M B; 2YRD A; 1VQ8 A; 4DEY A; 3MP6 A; 1OPK A; 2GQV A; 2J6F A; 4C8Q D; 1LJO A; 2GCX A; 1EIF A; 3BDU A; 5CQX A; 1MV0 B; 4EIK A; 2RD1 A; 4EMH A; 4C92 E; 4QKU A; 1VQP T; 4E7L A; 4FYW B; 2CDT A; 1JQQ A; 2KQW A; 2HEQ A; 3G4S Q; 4AFS C; 3MEU A; 5IAY A; 3FC3 A; 1M1G A; 1VQM A; 1BYM A; 2OTL A; 1PKS A; 2DJZ A; 5GAN h; 9ATC B; 1I5L A; 4C8Q A; 1WZO A; 2FPF A; 1W2B P; 1SSH A; 2DKG A; 2JNG A; 2DF6 A; 3HFO A; 1H92 A; 4M75 B; 5CO7 A; 4JJC A; 3RMS A; 3SHW A; 3L2Q A; 2KI7 A; 1YIJ T; 5GAM d; 2D8J A; 3QO3 A; 5HCK A; 4X9C A; 2D1X A; 3NTK A; 2QQB A; 1VQ8 Q; 1UG1 A; 2F69 A; 2X35 A; 4B9W A; 1MMN A; 4ZGD B; 1K9A A; 2LJ3 A; 1M9S A; 2RQR A; 3CCM Q; 3L42 A; 2QGG A; 5ECA A; 3M0S A; 1CKB A; 1X6B A; 1CKA A; 5FU6 B; 3WXM B; 1YJN T; 4OB1 B; 3URG A; 3BFM A; 1N8R C; 2OTL Q; 3DB3 A; 2CSI A; 2K5L A; 4A4E A; 5I2M A; 4MZM A; 3OYC A; 3OYK A; 1TUD A; 4HKE A; 3OSS C; 1R0C B; 1PG5 B; 3JB9 J; 4J6X A; 3VS0 A; 5GAN e; 4M7A G; 3PMI A; 1FMV A; 2VB6 A; 2RJD A; 4OF1 A; 4F7U G; 3G1J A; 2CYZ B; 2J6O A; 3QHS A; 3RKY A; 1IRE B; 3MP8 A; 1N8R U; 3QYG B; 2YUN A; 4ME7 A; 2MPX C; 4QVD A; 1WHJ A; 1PRL C; 2K57 A; 2SEM A; 2K5I A; 2MWO A; 3QDF A; 5LJ3 d; 4KGZ B; 1G3S A; 5KYN A; 2M02 A; 3RES A; 1ZSZ A; 3VS2 A; 4GY5 A; 1WXB A; 3JCM c; 2E4H A; 3FDR A; 2JUF A; 2ENM A; 3JCM X; 3MCA B; 1Y96 A; 4IUP A; 1KD1 C; 4NS5 A; 3CCU A; 2QA4 A; 4XTV A; 4M78 C; 3L2Z A; 3OS1 A; 5M9O A; 2HQE A; 3P8B B; 2AKK A; 3CCL A; 4ZGE B; 3X26 B; 3X28 B; 3I35 A; 3EGX B; 1FX7 A; 4JPB W; 4KBM B; 1KHC A; 1P92 A; 4IUR A; 3RR6 A; 2KSS A; 1KD1 U; 1HK9 A; 4JZ4 A; 4J9E A; 1S72 Q; 2JMC A; 4DBR A; 4M7D F; 3VS1 A; 4Y92 A; 2DIQ A; 4PFZ A; 2RK1 A; 2J6K A; 3WVD B; 3NGP A; 4M7A F; 2B8A A; 2VAS A; 2YLB A; 1TUG B; 4ZTJ A; 1NYF A; 4JRP A; 4AMC A; 2EGA A; 3OW2 A; 4QQD A; 3CCU Q; 2QA4 Q; 2LMJ A; 4A53 A; 2DRK A; 2MK5 A; 2LJ1 A; 1RI0 A; 2YUO A; 4ZGJ B; 4XU2 A; 2FVU A; 4FM4 B; 2RHI A; 1RLP C; 1GCP A; 4FW2 A; 3NTI A; 4ZNX A; 1VQ7 Q; 4DEX A; 2LCS A; 4JS4 A; 2KMT A; 4C92 D; 2OTJ T; 4OMQ A; 4NL2 A; 5LJ5 d; 3H0F A; 2LC4 A; 3C4S A; 3MHX A; 1PM3 A; 1OU8 A; 2QDL A; 5FRN A; 4BE2 A; 1M2V A; 3V8J A; 3CXC S; 2FRW A; 2V8J A; 2HZY A; 2QQS A; 4LN2 A; 4AFU C; 3OY9 A; 1VQ4 T; 4ATO A; 1YIJ A; 3C12 A; 3PFS A; 4J9G A; 3VRY A; 4QQ6 A; 3CME T; 4C92 A; 3DKM A; 2BE7 D; 2KE9 A; 3LYI A; 3OYF A; 1BIB A; 5IT9 E; 1D0Y A; 3OQ5 A; 3TRE A; 2E5Q A; 2DEQ A; 2EJG A; 2LX7 A; 5KH6 A; 2DJQ A; 3CPW P; 4C0D C; 2RA2 A; 1WI7 A; 3MET A; 2RI3 A; 2EFI A; 1K1Z A; 2EQJ A; 3VKI A; 5GAM g; 2L3R A; 2LVM A; 4M75 F; 1R0B G; 4BAC A; 1NM7 A; 1M3B A; 3ZL7 C; 5KCH A; 1ABO A; 3QII A; 4N0A C; 2R5A A; 1BI3 A; 3CCQ Q; 4N4I A; 4MZT A; 4ZN3 A; 1IHV A; 2O9V A; 2X9H A; 1MND A; 2HMA A; 1HXD A; 2QTV A; 1MMD A; 2CH4 W; 1VA7 A; 2LQN A; 3RMQ A; 1WHM A; 2F5T X; 2RN8 A; 2DX1 A; 1FMW A; 1QVF P; 1VQ6 Q; 1XJW B; 1RAB B; 1U1S A; 4PK4 A; 2XK0 A; 3MEA A; 4FSS A; 3EG1 A; 4HCK A; 3V7R A; 1QQJ A; 1GCQ C; 2DTO A; 1VQ9 A; 1VQK T; 3JB9 H; 3V8K A; 2JN0 A; 3P8H A; 4PFP A; 1Q86 R; 2E10 A; 1QW1 A; 2GTJ A; 1A0N B; 4J6Y A; 3T9N A; 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4EMK C; 4M7A D; 4EPC A; 1UE9 A; 1UDL A; 2K7A A; 3CME A; 1W2B A; 1X6O A; 1WIE A; 1U8R A; 2COW A; 1Q7Y R; 1M2O A; 3ER0 A; 1O9S A; 4M78 G; 1K8A R; 4ELZ C; 3M59 A; 3RKW A; 1YIT T; 3OYH A; 2LNH B; 2KRN A; 1QKX A; 4JJD A; 4JLI A; 2EYQ A; 2CKK A; 1YI2 Q; 3LLR A; 2XDB A; 3EGD A; 3P8D A; 3JCM W; 3MO8 A; 4QVC A; 1RAH B; 3RKX A; 7AT1 B; 4IUT A; 2COY A; 2X4W A; 5GAO r; 1HSQ A; 1SKU B; 2HKN A; 4J8O A; 1OEB A; 2MAM A; 4MDX A; 3QYH B; 2LCL A; 4OML A; 6AT1 B; 2JT4 A; 4J9B A; 5A2Q E; 3CC2 A; 2CSQ A; 2K3Y A; 4C5E A; 3SWN B; 4EDU A; 1QWF A; 3JSC A; 1NPP A; 2M9U A; 4X9D A; 2E3H A; 3JCM f; 4DQ2 A; 2GF7 A; 2R58 A; 1D09 B; 4NOY A; 3EH1 A; 2QQ9 A; 5CKD A; 3EG0 A; 2O2O A; 1K76 A; 3PIO A; 2YUP A; 1WJR A; 5CIU A; 4OP0 A; 1UHC A; 1KHI A; 3OMG A; 4J5Y A; 3F70 A; 2HSP A; 1Q95 G; 2LRQ A; 4LDX A; 3JCM Q; 1YJ9 A; 3I56 Q; 4M75 D; 1G3T A; 2FPE A; 3CMA T; 1YP5 A; 2RI2 A; 1MV3 A; 2KDS A; 2VXF A; 3OS2 A; 4RCB A; 3CC2 Q; 1MMG A; 2EGC A; 4AT1 B; 3MEW A; 1QVG P; 1UJY A; 1J3T A; 3E19 A; 1VYV A; 2LX9 A; 2HNI A; 3GBQ A; 3RIR A; 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