The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
|
| molecule tags |
Ribosome
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| total genus |
19
|
| structure length |
95
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| sequence length |
95
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| Q | PF01157 | Ribosomal_L21e | Ribosomal protein L21e |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QA4 Q; 2QEX Q; 3CCJ Q; 1YIT Q; 1VQN Q; 3CMA Q; 3CCM Q; 3G71 Q; 1KC8 R; 1Q86 R; 3CCS Q; 1VQK Q; 3CCR Q; 1S72 Q; 1YIJ Q; 3CPW P; 1Q7Y R; 1M90 R; 1Q81 R; 1VQ9 Q; 1M1K R; 1YI2 Q; 1QVF P; 1YJN Q; 1YHQ Q; 1VQ6 Q; 2OTJ Q; 2OTL Q; 1VQO Q; 1KQS P; 3OW2 P; 3CC2 Q; 3G6E Q; 3CXC P; 1VQL Q; 3CCE Q; 1VQ4 Q; 3G4S Q; 3I55 Q; 1YJ9 Q; 1KD1 R; 1K9M R; 1QVG P; 1K73 R; 1N8R R; 1VQP Q; 1VQ8 Q; 1NJI R; 1YJW Q; 1VQM Q; 3CCQ Q; 1JJ2 P; 3CME Q; 1W2B P; 1K8A R; 1VQ5 Q; 3CCL Q; 3CC4 Q; 1Q82 R; 1VQ7 Q; 3CCU Q; 3I56 Q; 3CCV Q; 3CC7 Q; 3CD6 Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 1YI2 A; 5C6S A; 3RMS A; 2DO3 A; 4OMM A; 2GGR A; 2MPX C; 5CKF A; 4ZGD B; 1S1N A; 5GAN 7; 1VIE A; 2RQW A; 3EG0 A; 2CZ6 B; 3OS0 A; 4O5V A; 3CC4 A; 1WGS A; 3MJX A; 1YJW Q; 4FYW B; 5FWC A; 1D1C A; 2QEX A; 1YIT A; 1QKX A; 4DBH A; 2QGG A; 4JRP A; 1W2B A; 4A4F A; 5AT1 B; 3NGP A; 1K73 U; 1V76 A; 2M0Y A; 2CSI A; 5LJ5 d; 1GFC A; 1R77 A; 2X51 A; 2QK0 A; 4PJL A; 1LVK A; 1U1S A; 2PTK A; 4DA4 A; 2LCS A; 3OSS C; 1U5S A; 2M0O A; 3X28 B; 2CYZ B; 1SSH A; 4FIB A; 2FL7 A; 1Q7Y U; 1UG1 A; 3QUI A; 3ZEH A; 4E7K A; 3M0Q A; 2NUT B; 4M7A G; 3QZ5 B; 5C0M A; 2HEQ A; 2HQH A; 2LQN A; 1PNJ A; 2CSQ A; 1G5V A; 3EGX A; 2MCN A; 1X2K A; 1O9S A; 2AZV A; 2QQR A; 5GAM g; 1K1Z A; 1M2V B; 2F5K A; 5L8R E; 1N8R C; 2LJ0 A; 4OGC A; 2OAW A; 2J6F A; 2E70 A; 4A4H A; 4MML A; 3H0H A; 2D1X A; 4PK4 A; 3CC2 A; 1PRL C; 1CKA A; 1I81 A; 3HKS A; 1M4Z A; 2DVE A; 1Z9Z A; 4LXC A; 3JCM g; 1I8F A; 1T3S A; 4BI4 A; 5KYU A; 3OS1 A; 2FPE A; 4OVA A; 3HHT B; 4D8D A; 2X3W D; 3OYN A; 1ZA1 B; 2EYW A; 3H8Z A; 3EG9 B; 4HCC A; 2YDL A; 4DEX A; 1VQL T; 1MND A; 1V1C A; 2NUP B; 1X01 A; 2HD0 A; 4PJO A; 1M30 A; 2L8D A; 5GAM e; 4BI3 A; 5DLO A; 1RAF B; 1VQL Q; 2AHJ B; 3I56 T; 1GL5 A; 4EMK B; 2CZ7 B; 2XD0 A; 2K79 A; 1J3T A; 2ZPE B; 1Q95 G; 1ZX6 A; 3WVE B; 3EGX B; 2PZ1 A; 2RJD A; 3I56 Q; 2W10 A; 3CCR A; 3INZ A; 1LPL A; 3PIP A; 1VQ6 A; 4PLL A; 4CC2 A; 1NLO C; 1C6V X; 4M78 F; 3SWN B; 4JJB A; 4EPC A; 4IUU A; 2QAZ A; 1VQP A; 1K8A U; 1SG5 A; 1X6G A; 1VQ8 A; 3JCM e; 1T0H A; 2EJ9 A; 2CP5 A; 1PC0 A; 2A3L A; 2KQW A; 2VB6 A; 1KHC A; 5GMK j; 1SRM A; 2OTL T; 2QDY B; 5KYW A; 2AIR B; 2JZ2 A; 3QG1 A; 5GAN 5; 4JRQ A; 2D8J A; 4KT0 E; 2GFU A; 2QI2 A; 5GAO n; 2OTL Q; 1NZ9 A; 3S3N A; 1QLY A; 3ME9 A; 1Q82 U; 2K3B A; 3CCV A; 1G3T A; 3JB9 F; 2C0T A; 4PJO B; 3VS5 A; 4DOW A; 1VQK A; 1B7T A; 1AZG B; 1D1B A; 2GQV A; 3GNG A; 4OB1 B; 1LCK A; 2ESW A; 2YSQ A; 1AOJ A; 1UEB A; 2PVD B; 3PE0 A; 3RNJ A; 2JTE A; 4LD6 A; 4Q5W A; 2MIO A; 4QVC A; 2YRV A; 2HSP A; 4AT1 B; 2HL3 A; 1WHH A; 4F7U F; 2FZG B; 1VQ9 A; 2WSC E; 4RTU A; 1YJ9 T; 1UJY A; 2QQA A; 3G4S A; 5IH2 A; 4M75 B; 4M78 A; 1RAB B; 1YJ9 Q; 3JAM E; 1HSQ A; 2ZPI B; 1ZUK A; 3M59 A; 3OY9 A; 2L3R A; 4OMP A; 4AG1 C; 1X6O A; 2ZPH B; 3LLR A; 2QA4 A; 2KDS A; 2FHD A; 2RHU A; 2LNV A; 4HCZ A; 2OTJ T; 2FYK A; 4OB0 B; 4BE2 A; 1ZUU A; 1GXI E; 4E6R A; 2KRO A; 2BZ8 A; 2LT1 A; 5FU7 B; 2COZ A; 5HK3 A; 4C5E A; 5KE2 A; 2DE0 X; 2JM9 A; 3F70 A; 4A63 B; 1KK7 A; 1I0C A; 3RDV A; 4PJO G; 2CUB A; 3CC7 A; 1X75 C; 1AWO A; 2AT1 B; 2XMF A; 4KGZ B; 4ELZ C; 4OP0 A; 1D3B B; 2G3R A; 4PJJ A; 3VUZ A; 5D6Y A; 3HRU A; 3REA B; 1M1F A; 2C0O A; 4PFZ A; 5CKD A; 2DM1 A; 3OBY A; 2QAS A; 5IXB A; 1GBR A; 4JJD A; 2EBP A; 2X3X D; 2HKQ B; 2YLB A; 4C92 F; 4D8K A; 3QWX X; 2IPO B; 4NL2 A; 1JXO A; 4P5N A; 3OYL A; 5L23 A; 3UT1 A; 1DJ7 B; 3DLM A; 2J6O A; 4C5G A; 5CO7 A; 1WX6 A; 1OU9 A; 4M75 G; 3CCE A; 1V29 B; 4C92 D; 1JBM A; 3G1J A; 4F7U A; 2CP6 A; 3BDU A; 4LDV A; 1BK2 A; 3NTK A; 3H6Z A; 1KJW A; 3L2Q A; 3E9G A; 5IHK A; 4HCK A; 3KXT A; 2DIL A; 1ZSZ A; 4RKU E; 3E1S A; 2DMO A; 5A0G A; 2QTX A; 1KSW A; 1PSF A; 4J9H A; 3ZFJ A; 4M7D F; 2DTH A; 1KC8 R; 4E47 A; 1S72 Q; 3FJP A; 5ECA A; 1ZHI A; 1MMD A; 3JCM Q; 2BUD A; 4Z89 A; 4IIO A; 4KH1 B; 2OI3 A; 4KUI A; 1QP3 A; 1ZQ1 A; 1VQM Q; 2ECZ A; 3CD6 A; 4BDY A; 2DA9 A; 3HFO A; 3FRN A; 1I1J A; 3MKD A; 2QDL A; 4M77 F; 1AD5 A; 1PRM C; 1ZA2 B; 1JB0 E; 3A8M B; 3I55 Q; 3LGL A; 2M02 A; 1BI2 A; 2KT1 A; 4C8Q F; 2JS0 A; 3CCJ T; 3P8D A; 2RN8 A; 3OYG A; 3A8G B; 4F7U B; 5KCO A; 1W2B S; 3C95 A; 4A4E A; 3CCU Q; 1D0Z A; 1UUE A; 3CCJ Q; 2QGF B; 2J6K A; 1FYN A; 3TVT A; 4LUE A; 4UC4 A; 3X24 B; 1IB8 A; 1W1F A; 3I35 A; 3UDC A; 1G3W A; 3WVD B; 2VAS A; 2RJE A; 3PVL A; 3OYY A; 4M7A F; 1Y96 B; 4IUT A; 2FO0 A; 4M4Z A; 1QVG A; 2BKD N; 1YWP A; 2DET A; 1RLP C; 5CR2 A; 4E7J A; 4PLI A; 2E41 A; 4E7L A; 4RTY A; 2E12 A; 2V26 A; 1M1K R; 4RUG A; 4JJN K; 3CCL T; 4M7D A; 1RAE B; 5GAM h; 3I5S A; 2JTM A; 1MMA A; 3MP1 A; 2KRS A; 4WTO B; 2KRM A; 1K4U S; 3JV3 A; 1GCQ A; 3CCL Q; 4OGE A; 3QDR B; 5GMK l; 3OSV A; 3J81 E; 5CKH A; 3CCS A; 4XTV A; 4J9E A; 3TEE A; 4BB7 A; 2OX7 A; 1N8R U; 1AZE A; 1KC8 C; 1CKB A; 3EGU A; 4X34 A; 4R56 A; 2HNI A; 1PD0 A; 4M77 A; 4RTV A; 2NUZ A; 1HXD A; 3JCM h; 4F7U G; 4ESR A; 4FYV B; 3JCM b; 2HAX A; 3BFM A; 4C92 E; 1OX8 A; 1EFN A; 4CC7 A; 4FT2 A; 2JUF A; 3DKM A; 3M4G A; 4C8Q A; 5GMK i; 1BB9 A; 1QWF A; 4WF2 A; 4L6V 5; 5J26 A; 3V7C A; 1KHI A; 4XTZ A; 2JXB A; 1QVP A; 1ZSG A; 1M90 R; 2KXD A; 5CKE A; 4LNP A; 3EFS A; 2H3E B; 4F04 B; 2MYS A; 2HDA A; 3Q1J A; 2RM4 A; 1BBZ A; 3OYC A; 2L3S A; 4LDY A; 3D7S B; 4KH0 B; 4AMC A; 1M1G A; 4J8O A; 1FMV A; 4M7A A; 3RKY A; 1VQO T; 4KGX B; 4N0A A; 3VYH B; 3VUB A; 2CZ0 B; 4XU1 A; 1JJ2 A; 2OJ2 A; 2VUB A; 2E6N A; 2E64 A; 1RUW A; 1VQ4 A; 3QHS A; 2ZCF B; 3BY7 A; 4HT8 A; 4IUP A; 2EAY A; 2MAM A; 2RD1 A; 2K9G A; 1NM7 A; 1XQH A; 1HD3 A; 2ZPG B; 4GLM A; 2YRC A; 2DF6 A; 2B86 A; 5GMK e; 1N5Z A; 4CC3 A; 4M77 B; 2CGH A; 3O8V A; 4K11 A; 2JMC A; 2KE9 A; 1KFZ A; 3P8B B; 2KVQ G; 5IHI A; 4C8Q B; 1IGU A; 1YJW A; 1M1K C; 3L2Z A; 3ULR B; 5DY9 A; 3CCM T; 1TXQ A; 1JJ2 P; 5I2M A; 1RL2 A; 2HBP A; 2DKG A; 1VYT A; 1WJR A; 2HCK A; 2XIC A; 1TOV A; 1N27 A; 4OB2 B; 1QMC A; 4AFQ C; 1WNL A; 3V7S A; 3QWY A; 2ZZD A; 2CRE A; 4FYY B; 3CBM A; 2EJF A; 2LJ1 A; 4E7S A; 2JMA A; 2XU8 A; 2PUK B; 2NUT A; 3LH5 A; 2YHT A; 5GAN j; 3I9Q A; 2D0N A; 2G6F X; 2ED1 A; 1QP2 A; 1TSF A; 1YWO A; 1M2V A; 4N4G A; 1F1B B; 2ABL A; 4N4I A; 1M90 C; 2EYZ A; 2JS2 A; 1K9M R; 2E10 A; 4M77 G; 3PTA A; 2KXC A; 2DAQ A; 3MET A; 3AHU A; 2DL4 A; 3BE3 A; 5A2Q E; 2MWO A; 1KQ2 A; 3HPW A; 5FRM A; 2RI2 A; 4PJO F; 1YFN A; 2QG9 B; 4C8Q G; 2RK1 A; 1NPR A; 1SHF A; 5GAO q; 3M0P A; 1UGQ B; 2EQK A; 1WXB A; 2F5T X; 2YWW A; 4DBF A; 3GF5 A; 4IIM A; 3EG9 A; 2MF2 A; 3OW2 A; 2DER A; 4PJO D; 3G71 T; 1FX7 A; 1W4S A; 2NUP A; 3EH2 A; 1NBE B; 1MV3 A; 1OPK A; 4C92 C; 3R6O A; 4BE0 A; 3OBW A; 3G71 Q; 4EMK A; 1VQL A; 3CEY A; 4A54 A; 5CAI A; 4FU6 A; 2GCX A; 3I5R A; 1UDL A; 3EHR A; 5IT9 E; 3KBG A; 5GAN 6; 5HY6 A; 3M9Q A; 3A98 A; 1OI1 A; 1I5O B; 4PFP A; 1JU5 C; 3I56 A; 1LOJ A; 1VUB A; 5GAM d; 4M75 F; 1W2B P; 2ZPB B; 2EJG A; 3SWN A; 4GY5 A; 1KG1 A; 3EAE A; 2AK5 A; 5A0L A; 1YHQ T; 1WXU A; 1YHQ Q; 4EMH A; 2XHC A; 3MP6 A; 2CP3 A; 3TCJ A; 5CQX A; 4M7D C; 3C12 A; 3OYB A; 3NMZ C; 2NLU A; 3PVQ A; 2EGA A; 2EYQ A; 2GFA A; 2KY9 A; 4C5H A; 2QEX T; 1IZ6 A; 2BZX A; 2DXU A; 3JCM d; 4GLK A; 2X4X A; 1Q81 U; 1YJN T; 1K0X A; 2O31 A; 4KBM B; 1ZBJ A; 2OTL A; 4MDW A; 5GAN f; 2DJQ A; 4RMO A; 3UPU A; 3CBP A; 3H9N A; 4Z88 A; 1YJN Q; 3E19 A; 1XOV A; 7AT1 B; 2EYX A; 5KYX B; 2DRK A; 2F2W A; 2KK4 A; 2JJ9 A; 3EHQ A; 2ROL A; 1K9M C; 4HCB A; 4ANJ A; 2A08 A; 4OB3 B; 1M8V A; 2EWN A; 3OYJ A; 2RJF A; 1K76 A; 1H3Z A; 2LP5 A; 3MEU A; 2M51 A; 3VJP A; 5FRO A; 2IVW A; 2E3H A; 4Y91 A; 1AEY A; 4LDU A; 1WHG A; 1TTH B; 1UE9 A; 1WHJ A; 3M57 A; 2JOY A; 4MDX A; 2D0Q B; 2DPP B; 4OMQ A; 3LYI A; 4LD9 K; 4FYX B; 2Y4Y A; 4M78 D; 5FLX E; 4M7A C; 4C0Z A; 4N0A C; 1OUL A; 1WHK A; 2DIG A; 4M75 A; 2CS7 A; 2XKO C; 2C0I A; 2YUN A; 2L89 A; 4JRK A; 1Q7Y R; 3PFS A; 1YJ9 A; 2KYB A; 2A28 A; 3OYM A; 2JT4 A; 1MHN A; 4J9B A; 2YUP A; 1QVG S; 2RHI A; 4J9G A; 4E7H A; 2PU9 B; 5IAY A; 3GBQ A; 3HFN A; 2RH2 A; 3A5Z B; 5KYY B; 1A0N B; 4PJO E; 3RKX A; 5IN1 A; 3A1P A; 2LZ6 B; 3FJ5 A; 3JB9 D; 1E7O A; 1NEG A; 3V7R A; 2CP7 A; 1G3S A; 1X6B A; 1D3B A; 2RPN A; 3QBY A; 5FU6 C; 2F1L A; 3QJY A; 1B34 B; 1WHL A; 2H3J A; 3NHN A; 3JCM W; 4BD3 A; 4JDS A; 1VQ6 T; 3QXE B; 2V8J A; 3VS2 A; 2PUO B; 1JRI A; 2MI6 A; 3OYK A; 5IHN A; 1N9S A; 3H0F A; 1VQ8 T; 2AKK A; 3VS1 A; 8ATC B; 4C0D C; 4ME7 A; 1PG5 B; 2LX9 A; 1VQ8 Q; 1QVF A; 2EW3 A; 3URG A; 3QZ9 B; 3QKJ A; 2CDT A; 1ABQ A; 2ROT A; 1KC8 U; 4PKC C; 1M8M A; 2VWF A; 5GMK h; 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3VS7 A; 4KUD K; 4J6Y A; 1KQS A; 2DXT A; 2XG8 D; 5GAN e; 1OX9 A; 4M7D D; 3RER A; 1YIJ T; 2RA2 A; 4II1 A; 1Y7X A; 2EQI A; 1YIJ Q; 1UHF A; 2CH4 A; 3BDL A; 1BCO A; 4PJO C; 3MO8 A; 4LUD A; 5IXF A; 3CCL A; 2FRW A; 4PJM A; 1M2O A; 1TS9 A; 2ZPF B; 1WPY A; 3OMC A; 1KIK A; 3KFV A; 2DBM A; 4M77 D; 2QYZ A; 4QKU A; 1QCO A; 2HKN A; 2QQS A; 2YUO A; 1IXD A; 1IO6 A; 2DD5 A; 1ACM B; 3SDZ A; 2XDD A; 2RI3 A; 3A8H B; 3LH0 A; 4F7U E; 4C8Q D; 4ZTF A; 2LRQ A; 2VVK A; 2X4Y A; 4NOY A; 4DBR A; 1K0S A; 1MMN A; 2GTJ A; 1T0J A; 5J3B A; 3V8K A; 1NYG A; 4XU0 A; 1KD1 C; 1PWT A; 2CP0 A; 2K2V A; 1AT1 B; 1BI3 A; 1WXT A; 3M0T A; 3EG3 A; 4NS5 A; 4DEY A; 2L5Q A; 2R57 A; 2F2V A; 4M75 C; 1Y57 A; 2DK3 A; 4M7A D; 4Y92 A; 5I22 A; 3NPF A; 4ZGJ B; 5CIU A; 2HQE A; 1X27 A; 4V2S A; 1D0Y A; 1PHT A; 5GJV B; 2BE7 D; 3HP9 A; 4CRI A; 2O2O A; 3CMA T; 2O9S A; 3DB3 A; 1WLP B; 2EGE A; 4QQ6 A; 3CMA Q; 2EIF A; 2O4X B; 3EFO A; 3CCQ T; 4GBQ A; 5HCK A; 3CME T; 2HZY A; 4MZM A; 5LJ5 f; 2Y4X A; 3RBB B; 1QVG P; 2VKN A; 4O6J A; 2OAU A; 3EGD A; 3CCQ Q; 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