The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Ribosome
|
| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
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| total genus |
19
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| structure length |
95
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| sequence length |
95
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| Q | PF01157 | Ribosomal_L21e | Ribosomal protein L21e |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1N8R R; 3CCL Q; 3CCJ Q; 1VQK Q; 3OW2 P; 1Q82 R; 3CCS Q; 1YIJ Q; 2QEX Q; 1QVG P; 1M90 R; 3CCQ Q; 1KQS P; 3CC4 Q; 1YJN Q; 2OTL Q; 1W2B P; 1VQ7 Q; 1YJW Q; 1K73 R; 3CMA Q; 1M1K R; 1YI2 Q; 1YJ9 Q; 3CCU Q; 1VQO Q; 1VQ5 Q; 1NJI R; 1VQ8 Q; 1YIT Q; 3CC7 Q; 3CME Q; 3CCM Q; 1VQN Q; 3I56 Q; 3CCR Q; 1K9M R; 3I55 Q; 1VQ4 Q; 1KC8 R; 1Q81 R; 1JJ2 P; 1VQL Q; 1VQP Q; 2OTJ Q; 2QA4 Q; 3CC2 Q; 3G4S Q; 3CCV Q; 1Q7Y R; 3CCE Q; 1QVF P; 1VQ6 Q; 3CXC P; 1S72 Q; 3CD6 Q; 3G71 Q; 1Q86 R; 3G6E Q; 1VQM Q; 1KD1 R; 1K8A R; 1VQ9 Q; 1YHQ Q; 3CPW P; #chains in the Genus database with same CATH topology 1WX6 A; 2FRW A; 2WSC E; 2YDL A; 2DVJ A; 2MAM A; 1HJD A; 2XIC A; 5GMK j; 2L0A A; 1FWZ A; 1B07 A; 2LMJ A; 4L59 A; 2JS2 A; 2QQ9 A; 1YHQ A; 2ZPH B; 2QTV A; 1KC8 U; 3P8B B; 4FSS A; 3V8J A; 2BE7 D; 4A54 A; 3CCE Q; 2P0Q A; 5CKB A; 3MKD A; 2YRV A; 3OS0 A; 3JB9 J; 1KD1 R; 1Y57 A; 4E7H A; 3C4S A; 1BCM A; 2KR3 A; 1H3Z A; 3PFS A; 4RTY A; 2VAS A; 1G3Y A; 3FC3 A; 2P0K A; 4BE1 A; 4XAX B; 2OTJ A; 3E9F A; 3MJX A; 2KT8 A; 2JM9 A; 1ZSG A; 5GAM j; 2HKQ B; 2P4R A; 2BZX A; 2SRC A; 1U06 A; 2CS7 A; 5GMK m; 3QUI A; 2JVV A; 1M1K C; 2KAF A; 1Q86 U; 4M7A C; 5L23 A; 2LQW A; 3I56 A; 2D9T A; 2L2P A; 6AT1 B; 5LJ3 f; 1UGS B; 1W1F A; 4MZT A; 2DER A; 2GTO A; 1YJW Q; 1M3C A; 5KYW B; 2EWN A; 1N8R C; 2C06 A; 5FU7 B; 4J9H A; 2RI3 A; 3CCS A; 2J05 A; 3A8G B; 1H92 A; 3S3O A; 1VQN A; 1UTI A; 2K3X A; 4M77 A; 1DJ7 B; 1YIJ Q; 1TTH B; 2EGE A; 1M90 R; 2YUQ A; 3NTH A; 2DTI A; 1YCY A; 4NS5 A; 2L8D A; 4OML A; 2CUD A; 5GAO m; 3OW2 A; 5A2Q E; 2LQN A; 3CEY A; 4PJO C; 3CME Q; 2QK0 A; 2P0P A; 5CO7 A; 5KYX A; 3M53 A; 1KHI A; 1N9R A; 3CCV Q; 3REA B; 2ED1 A; 3C94 A; 1K8A R; 4X9C A; 2FO0 A; 2DX1 A; 4RKU E; 1K9M C; 1YJW T; 3CCQ Q; 1JRI A; 2QAZ A; 4JJB A; 1JBM A; 3HP9 A; 1W4S A; 2K7A A; 2GQV A; 4C8Q A; 5I22 A; 1QVG A; 1KC8 R; 3S6W A; 5LJ5 e; 2LJ0 A; 4OB0 B; 2ZPF B; 4ME7 A; 3QBY A; 4M75 G; 4O5V A; 4DA4 A; 2KQW A; 1WHG A; 3X26 B; 5IHN A; 2KNB B; 1V76 A; 2KRS A; 4CI0 C; 1VYU A; 1YIT T; 3CME T; 1R77 A; 1RAH B; 5L8R E; 1AOJ A; 4M7D A; 1M3B A; 2ED0 A; 3E9G A; 4AMC A; 3JB9 D; 2JMA A; 1Q86 R; 1IHW A; 3CBO A; 3CCQ T; 2BTT A; 3SHW A; 1WIE A; 3OMG A; 3OW2 S; 2E41 A; 4L6V 5; 3ZBD A; 3CPW A; 3AHU A; 1BCO A; 1TU0 B; 1VQO Q; 2GGR A; 2QXF A; 4PL6 A; 3GP8 A; 1M5Q 1; 5LJ3 j; 4XK8 E; 3KBG A; 2OTL T; 5D6X A; 4IUU A; 1BI2 A; 1H64 1; 5EG2 A; 4N0A C; 4HA8 A; 3CCM A; 4QQ6 A; 3CC4 Q; 2MMP A; 4E7Z A; 3S3N A; 2Y90 A; 2KE9 A; 2EGA A; 4ATO A; 1D3B A; 4OB3 B; 2COY A; 3MHX A; 2IG0 A; 2KRO A; 1M30 A; 4NOY A; 4C92 E; 2K5I A; 2NUZ A; 1AZE A; 3TSZ A; 3JRZ A; 3I35 A; 2I2L A; 4IUQ A; 1VQ4 A; 3JCM e; 5CCA A; 4PJO D; 3I5S A; 4JRI A; 1VQO T; 4HCC A; 4M77 E; 4J9G A; 3CMA Q; 1X43 A; 4EDU A; 3CCR Q; 4E47 A; 1BI3 A; 4ZTF A; 2EGC A; 2X3W D; 3LH5 A; 2JW4 A; 5DM7 R; 2HBW A; 2COW A; 1QWF A; 1VQ9 Q; 1RAG B; 1X27 A; 4HT8 A; 4BDY A; 1OZ2 A; 1Y71 A; 3V8L A; 4XU3 A; 4C92 G; 2DO3 A; 1X6O A; 2RK1 A; 2NUT B; 1IGU A; 5CKD A; 1NEG A; 4HVU A; 2YHT A; 2EKO A; 3NFC A; 3QII A; 4OMQ A; 1ZSZ C; 3L2Z A; 3SB2 A; 4MDX A; 1LPL A; 2E5Q A; 3F70 A; 4J7F A; 3VV0 A; 4GLM A; 2ZGW A; 2DVE A; 1J3T A; 3QHS A; 3OYK A; 4MML A; 5KYW A; 1VQM A; 1GCQ C; 1VQ5 Q; 1BB9 A; 1BBZ A; 1I0C A; 3G7Z A; 1MND A; 3MET A; 4ELZ C; 2A0F B; 2V8J A; 1VQP Q; 1M2V B; 3WVE B; 3EGD B; 1VQ9 T; 4M7D E; 2ZCF B; 1OUL A; 2VGM A; 3ME9 A; 4ZGE B; 4A4H A; 2X4J A; 2E6Z A; 2KGT A; 3L42 A; 4BY6 C; 5LJ5 f; 2RQW A; 3GOX A; 2KMT A; 2AT1 B; 1GXI E; 2LP5 A; 1W70 A; 4M75 B; 4BE0 A; 5GAM e; 3BDU A; 4JS4 A; 2CH4 A; 4EMH A; 5C0M A; 2BE9 B; 4R55 A; 3RKX A; 3SWN C; 1YHQ Q; 2L5Q A; 3FIF A; 2NYS A; 2RQV A; 2L3S A; 2GQI A; 2COZ A; 4MDW A; 2QA4 A; 1VQ5 T; 2CZ7 B; 5J26 A; 3NHN A; 4OB2 B; 4V2S A; 2J7I A; 3BW1 A; 3RIR A; 1XOV A; 1D0Z A; 1UHF A; 4JZ3 A; 4KBM B; 3CCJ A; 4J8O A; 5CR2 A; 1WQ7 A; 2QQA A; 2OTJ Q; 2QTX A; 4E7K A; 3C12 A; 1NBE B; 2GCX A; 3S3M A; 4FYY B; 5LL6 S; 2DFU A; 2QGF B; 2QQR A; 2O9V A; 2V8K A; 3NMZ C; 2RHU A; 4L5G A; 4GBQ A; 3CCV A; 1WFW A; 3FJ5 A; 3OYL A; 2EJF A; 5I11 A; 4JJN K; 3H9N A; 1OI1 A; 3I56 Q; 2RI5 A; 3EH1 A; 5LJ5 g; 1WHJ A; 2RHY A; 2E6N A; 3I5R A; 1YHQ T; 2ABL A; 1GFC A; 1LNX A; 3UPU A; 3EG1 A; 2FPF A; 5HK3 A; 3QG1 A; 2EYQ A; 5LJ5 h; 2XMF A; 1VQ7 T; 3CCS Q; 3DKM A; 4AG2 C; 4BE2 A; 4Z8A A; 1E6H A; 3LGF A; 1IO6 A; 1YWO A; 2VGN A; 1HYO A; 1VQN Q; 4KUI A; 3JCM f; 4DEX A; 1U8R A; 3CC2 T; 1AWO A; 2B86 A; 5D6Y A; 1ZHI A; 1PHT A; 1KFZ A; 1BYM A; 1OOT A; 4II1 A; 2EFI A; 2ECZ A; 2JTM A; 4F04 B; 4KRT A; 1PG5 B; 3LX7 A; 5AYF A; 4ZNX A; 3I56 T; 1ZA2 B; 3L2W A; 3OYN A; 1MMN A; 1KQS A; 3QJY A; 2JOY A; 2D1X A; 3FLG A; 2E3H A; 4C92 B; 5LJ5 j; 3ZL7 C; 3OYE A; 2EYX A; 3CCS T; 1MMD A; 4OMP A; 3T9N A; 3KUF A; 1NZ9 A; 2KEA A; 2HCK A; 3SFM A; 4ELY C; 1O75 A; 3G4S T; 1X69 A; 2X35 A; 3PVQ A; 2F2W A; 1VA7 A; 1K73 C; 2DIG A; 2C0T A; 3P8H A; 4M77 C; 2XKO C; 1NEB A; 5IH2 A; 2DJZ A; 3JCM g; 3M0Q A; 2DXU A; 4MMK A; 4EMK A; 3UAT A; 2EVR A; 2X4Y A; 2HDA A; 3THK A; 1Q7Y C; 1W2B P; 3A5Z B; 4RTV A; 2FZC B; 3OMC A; 3HTR A; 2OAW A; 1C6V X; 2CKK A; 3JCM h; 4LDU A; 2NUT A; 1WI7 A; 4DOW A; 4J6W A; 1QVP A; 5CQY A; 4F17 A; 1ZBJ A; 2C0O A; 2JXB A; 3HRU A; 1YI2 A; 5GAM f; 3M54 A; 1GBR A; 3CMA A; 2JMC A; 4JRQ A; 3CCR A; 2QEX Q; 5GAN 5; 3HHT B; 2ZPE B; 2IVW A; 3SDZ A; 4PJO G; 4C8Q C; 4PFZ A; 2HQE A; 5KYU B; 1S1N A; 1TOV A; 3CCM Q; 2LT4 A; 1SSF A; 2Y4X A; 1M2V A; 3EGD A; 1U5S A; 1ZLM A; 1G8X A; 4M7A F; 4K11 A; 4CC3 A; 2R57 A; 1UHC A; 5DY9 A; 1SRM A; 2QQS A; 3M0U A; 4Z02 A; 2K2M A; 3PGG A; 5FU6 B; 4HKE A; 2CP3 A; 5CKF A; 3TEE A; 5D7U A; 2YT6 A; 4M75 A; 4M7D C; 4OB1 B; 5GAN e; 5GMK h; 2E10 A; 4R0K A; 1VQ4 Q; 2MWP A; 3O8V A; 3EFO B; 2CRE A; 1UGQ B; 3MO8 A; 3DB4 A; 3DB3 A; 2B8A A; 5GAN 2; 1EFN A; 2FYK A; 7AT1 B; 2MWO A; 4C0Z A; 2LDM A; 3UWN A; 1VQP A; 1BK2 A; 3CCM T; 1N27 A; 2XDP A; 5GAM g; 4E7L A; 1NYG A; 4AT1 B; 3QYH B; 4FIB A; 1RI9 A; 4O6J A; 2A36 A; 2O2O A; 5GAM h; 1GRI A; 1B34 B; 1JXM A; 1JEG A; 1SG5 A; 3FRN A; 2M0Y A; 3H41 A; 4J9C A; 2RJF A; 4PLI A; 2E3I A; 1G83 A; 5HY6 A; 4XQ3 A; 1QCN A; 3A98 A; 3QSU A; 3NGP A; 1RUW A; 4B9X A; 3PE0 A; 5C6S A; 3A8H B; 3BFM A; 3LGL A; 3TQ7 P; 1AWJ A; 2ROT A; 4OGC A; 1S72 T; 1K1Z A; 4M78 E; 3QPH A; 3QDR B; 2XI9 A; 1OU8 A; 1VQM Q; 3VJP A; 3GIB A; 1Y96 B; 4BDZ A; 1MNE A; 4PNO A; 1ZX6 A; 1MMA A; 2YRC A; 3M56 A; 1VQ8 T; 1VQ6 A; 4F7U F; 3PNW C; 1FMW A; 1KD1 C; 1QCF A; 4JJC A; 2LVM A; 3X20 B; 5GAN 3; 1T3S A; 3QO3 A; 4J5Y A; 1GFD A; 4C5G A; 1RAA B; 2PUO B; 1Q81 U; 4DBF A; 2CSI A; 1WXT A; 3G6E T; 3J81 E; 4BB7 A; 1C1A A; 1V1C A; 5DLQ E; 3OS5 A; 4YTL A; 3CCU A; 2O4X B; 1RAC B; 2JNG A; 2E65 A; 3RBB B; 1VOM A; 1K0S A; 1I8F A; 2L3R A; 5GMK l; 4J9D A; 4OF1 A; 2F2V A; 4M78 G; 1R0C B; 4LUD A; 1OQK A; 2HSP A; 4CRI A; 1TG0 A; 4AFZ C; 2HSE B; 2KDS A; 2X9H A; 3CCE T; 1B7T A; 3BDL A; 1UGR B; 1AD5 A; 3QWX X; 2QA4 Q; 1AT1 B; 4C92 A; 5KCO A; 2XDD A; 4FYX B; 3INZ A; 3KXT A; 2PVG B; 4HVW A; 4R56 A; 2VC8 A; 2A08 A; 3CCJ Q; 3M4G A; 4PLL A; 2ZAE A; 3JCM Q; 1ARK A; 5FU7 C; 1GL5 A; 4KUD K; 3LW5 E; 3OYJ A; 3OA6 A; 4M75 E; 1H8K A; 2D0N A; 1UEB A; 3CCL A; 1AHJ B; 2ESW A; 1M90 C; 4LD6 A; 3PIP A; 2GBQ A; 4PJO B; 1I4K 1; 1WJQ A; 5GAO l; 3WXM B; 2CP0 A; 1BI0 A; 2DD5 A; 1VYV A; 2LX9 A; 2FEI A; 4J9I A; 1U1T A; 2EYY A; 2ZPI B; 4FT4 A; 5A0D A; 2CT3 A; 1U1S A; 5GAN 6; 1K8A C; 2L3Q A; 2QA4 T; 1PM3 A; 2DL5 A; 5LJ3 g; 3MEA A; 1LVK A; 3OYA A; 1RLQ C; 5J39 A; 4JZ4 A; 2OJ2 A; 2DD4 A; 1SHG A; 3MPU B; 5GAN f; 4LUE A; 2VUB A; 5LJ3 h; 2QDL A; 1YIJ T; 3OBW A; 3I55 A; 4LDV A; 1KC8 C; 2M9U A; 1WHK A; 5AT1 B; 3OS1 A; 1RLP C; 1N9S A; 2H3E B; 2K2V A; 4M4Z A; 3ER0 A; 1IRX A; 3TCJ A; 2CP7 A; 2EQU A; 3CCV T; 1Q81 R; 3A1P A; 1X2Q A; 1QWE A; 2ROL A; 3EHQ A; 2PZ1 A; 2D0Q B; 4Y28 E; 1FMK A; 2MI6 A; 5FLX E; 1Q81 C; 1PSE A; 1I81 A; 2KRN A; 1FX7 A; 2DJQ A; 1Q86 C; 2YRD A; 2LC4 A; 2MCN A; 4J83 A; 1SSH A; 2NUP B; 1Q95 G; 1AWX A; 1BIB A; 3GLX A; 4M7A D; 3EFO A; 2QEX A; 2J06 A; 4JDS A; 3PMI A; 4QQG A; 3EG3 A; 4PJL A; 2G3R A; 1M9S A; 3CBP A; 2DBK A; 3RMS A; 3HKS A; 1BKB A; 4QQD A; 2RO0 A; 3JAM E; 1TH7 A; 2W10 A; 1WA7 A; 1CKB A; 1WXU A; 2RH2 A; 1H3H A; 2DXT A; 4XU1 A; 4DEY A; 3EGU A; 5GAN g; 3M58 A; 3GNG A; 2BZ8 A; 3X25 B; 2JZ2 A; 1IRE B; 3OYI A; 3FJP A; 1JU5 C; 2LTO A; 2PVO B; 5GAN h; 1B34 A; 4F14 A; 1QVF P; 1ZBX A; 3BE3 A; 4Z89 A; 2K57 A; 2JS0 A; 2A7Y A; 4QKU A; 2QI2 A; 2X51 A; 2DZ9 A; 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3FDR A; 2HNI A; 2CP5 A; 3LWH A; 2MF2 A; 1VQ6 Q; 4LNP A; 1WPY A; 3CC7 A; 2LX7 A; 4FW1 A; 2A28 A; 3VKI A; 3ZFJ A; 1W2B S; 3G71 A; 3CCU Q; 2FPD A; 2CZ1 B; 4FSX A; 4LXC A; 2RNA A; 1UFF A; 2QG9 B; 3CXC S; 1VIF A; 1YIT A; 4X1V A; 4C8Q F; 4JPB W; 3EAE A; 3REB B; 1T0J A; 1UUE A; 1K9A A; 1LCK A; 2MIO A; 4CC4 B; 4QT7 A; 3LLR A; 4BD3 A; 2OI3 A; 2NUP A; 2OTJ T; 1UE9 A; 1QQJ A; 4KT0 E; 2FVU A; 1IGQ A; 1BU1 A; 3E19 A; 3LYI A; 5ECA A; 1M3A A; 1TSF A; 1YFN A; 4IKF A; 3R6N A; 3RER A; 2L3P A; 1TWB A; 1WLP B; 1RAF B; 3CCL Q; 2DPP B; 2RJD A; 3PTA A; 4M7D F; 2PVD B; 2EQM A; 4DQ2 A; 1ZA1 B; 4C0D B; 1XQH A; 1OEB A; 1M4Z A; 1GCP A; 2ATC B; 2DL4 A; 2OTL A; 3M59 A; 1D0Y A; 1N5Z A; 5IT9 E; 1JJ2 S; 1UGV A; 4NL2 A; 4ZGJ B; 5A0G A; 4Y91 A; 3OY9 A; 4A53 A; 3EFS A; 3VRZ A; 3JB9 G; 4FM4 B; 2DMO A; 1Q82 R; 3BY7 A; 5GMK i; 3RKY A; 1UB4 A; 1V29 B; 1VQN T; 4C92 C; 1X6B A; 1XNI A; 3I55 Q; 2IPO B; 4J6X A; 2W0Z A; 4PFO A; 3J7A F; 4M78 A; 4X34 A; 4PJO E; 4LE9 A; 4M7A G; 3JCM b; 3CCL T; 4PJM A; 4ZN3 A; 3X24 B; 3QKJ A; 3MEW A; 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