The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Ribosome
|
| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
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| total genus |
19
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| structure length |
95
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| sequence length |
95
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| Q | PF01157 | Ribosomal_L21e | Ribosomal protein L21e |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VQM Q; 1VQN Q; 1YJN Q; 3G71 Q; 1YJ9 Q; 3CCS Q; 3CCL Q; 1Q7Y R; 1NJI R; 3CXC P; 1KQS P; 3CC2 Q; 1VQ6 Q; 3CC7 Q; 1VQK Q; 3I56 Q; 1YIT Q; 1KC8 R; 3G6E Q; 1M1K R; 3CC4 Q; 1N8R R; 3CCU Q; 2OTL Q; 1QVF P; 1VQ7 Q; 1KD1 R; 1Q86 R; 3OW2 P; 3I55 Q; 1W2B P; 1K9M R; 2OTJ Q; 1VQL Q; 1YI2 Q; 1JJ2 P; 3CPW P; 1S72 Q; 3G4S Q; 1YIJ Q; 1YHQ Q; 1K73 R; 1QVG P; 1K8A R; 1M90 R; 1VQ8 Q; 1VQO Q; 1VQ4 Q; 1YJW Q; 1Q82 R; 3CCE Q; 3CMA Q; 3CCM Q; 1Q81 R; 1VQ5 Q; 1VQ9 Q; 3CCJ Q; 3CCQ Q; 3CCV Q; 3CME Q; 1VQP Q; 2QA4 Q; 3CCR Q; 3CD6 Q; 2QEX Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 4D6W A; 4QQD A; 3RDV A; 3QSU A; 1YJW A; 3Q1J A; 4RG8 A; 2A28 A; 2CUD A; 2OTL T; 1VQ7 T; 5FU6 B; 5GAN 4; 3ZFJ A; 2K3B A; 3TEE A; 1EZZ B; 1XOV A; 4J9H A; 2COY A; 1YI2 A; 1RI0 A; 3PMI A; 1RAA B; 4C92 A; 1YN8 A; 2QGG A; 1ZSG A; 3L42 A; 1VQ9 A; 5LJ5 g; 2HEQ A; 3CQT A; 3RBB B; 5I2M A; 2LQW A; 5I2S A; 1WLP B; 2EQJ A; 2OTJ T; 2KRM A; 1I5O B; 4GBQ A; 3CMA Q; 4PJO F; 3D7S B; 1T3S A; 3M57 A; 2QK0 A; 1I8F A; 5HY6 A; 2D9T A; 2CT4 A; 3M0S A; 1ZUK A; 3CCR T; 2FZK B; 1GXI E; 1D0X A; 2QQA A; 2XKO C; 3JCM g; 1OI1 A; 3JCM V; 4RCB A; 3JCM c; 2Z0W A; 4PJO A; 3TCJ A; 1QCO A; 2NUT B; 2AK5 A; 2HQH A; 1YCY A; 1VUB A; 3DLM A; 1MND A; 3RUX A; 5CKD A; 4O5V A; 4D8D A; 3OS2 A; 3G4S A; 2DA9 A; 2OJ2 A; 4F7U G; 2V8I A; 3CCQ A; 2QEX A; 1VQM A; 5GMK e; 3S3N A; 1TSF A; 4FW1 A; 3TRE A; 5GAM g; 2L3P A; 2QQB A; 1M2V B; 5IHK A; 2F5K A; 2HCK A; 2O4X B; 2CS7 A; 1YHQ T; 3X28 B; 2M02 A; 4WTO B; 3QWY A; 3DB4 A; 3VUZ A; 1RLP C; 1X6G A; 2XIC A; 2DVJ A; 3VS1 A; 1BCM A; 1Y96 A; 3V8L A; 3JV3 A; 8ATC B; 2E70 A; 3HHT B; 2K7A A; 5FWB A; 1VYU A; 1ZBX A; 3GNF B; 3KUF A; 4E7L A; 1VQ5 Q; 2CZ0 B; 3GPL A; 1PWT A; 1RAI B; 3CCM T; 4JRP A; 4PJO D; 3AT1 B; 1OX8 A; 3L2V A; 4Z02 A; 3I56 T; 1BIB A; 3OA6 A; 2RPN A; 2X35 A; 3J81 E; 3RNJ A; 5GAO p; 1YIT A; 2DD5 A; 2JTF A; 4DOV A; 4M7A C; 3R6N A; 1Q81 R; 4RTW A; 3QZ5 B; 4PL6 A; 2RB6 A; 1QKW A; 1VQN Q; 2P4T A; 4OGE A; 5KCH A; 1N8R C; 1ZQ1 A; 2R5A A; 1TU0 B; 4CC2 A; 3JCM X; 3VS4 A; 4NS5 A; 3OW2 P; 4JS5 A; 2PNI A; 1PM3 A; 2CKK A; 2GTO A; 1YP5 A; 3ZEH A; 4DEY A; 1QCN A; 3F70 A; 2DRK A; 1QQJ A; 2W10 A; 1KQS S; 3C12 A; 1W6X A; 2M51 A; 4RG2 A; 5M9O A; 4M75 G; 2J6F A; 2EYY A; 1ZUY A; 1UB4 A; 1M1G A; 2KY9 A; 3SWN B; 1WIE A; 3RKX A; 3EHQ A; 3H41 A; 3LWI A; 2P4R A; 4HCK A; 3CCV Q; 1WA7 A; 2E10 A; 1AHJ B; 2CZ7 B; 3SEM A; 1AD5 A; 3CXC A; 1NPP A; 1QMC A; 1E7O A; 1VQK Q; 1AEY A; 3AHU A; 1R8O B; 1O9S A; 1SG5 A; 4F04 B; 1LVK A; 1NEB A; 4DQ2 A; 1OU8 A; 2CZ6 B; 4PLI A; 1KHI A; 4B6M A; 4CC4 B; 1V1C A; 1VA7 A; 5GAN 5; 3X20 B; 1OV3 A; 2KT8 A; 3H0I A; 5GAN h; 2YLC A; 4OB3 B; 1AZG B; 2B8A A; 4AG1 C; 5GMK i; 2HNI A; 3I9Q A; 1M27 C; 2I2L A; 1G83 A; 4XQ3 A; 5J26 A; 4OMF B; 3PVQ A; 4C0D B; 3PE0 A; 3NFC A; 1RAD B; 2E3H A; 3PMT A; 2FZC B; 2OTL A; 2DET A; 1SRL A; 2BZY A; 1VQ7 A; 4B9W A; 3VS7 A; 2E64 A; 3LYI A; 4XTW A; 2QAZ A; 4QVD A; 1OU9 A; 5GAN j; 3P8D A; 2JNG A; 4E7K A; 1VQ6 T; 4PK4 A; 3EGU A; 1VIF A; 2M0O A; 2DPP B; 2FL7 A; 1JEG A; 1X2Q A; 1UJ0 A; 3CCU T; 4KGZ B; 2A3L A; 2BTT A; 2P0P A; 4XK8 E; 5LJ3 j; 3VS6 A; 2XK0 A; 5KYY A; 5J39 A; 5KCO A; 4C8Q E; 4FU6 A; 3HSB A; 4BI8 B; 4A4G A; 1N5Z A; 2OTJ A; 1UGR B; 3M0Q A; 3H0H A; 3OYC A; 1B07 A; 3CCS T; 1N8R R; 2CP6 A; 3OW2 A; 1ZHI A; 4ZNX A; 5D6Y A; 1M9S A; 3CCR A; 3TVT A; 5AYF A; 2GNC A; 2P0Q A; 2DM1 A; 1OEB A; 1M3C A; 3CCE Q; 2K5I A; 2LJ3 A; 1JB0 E; 5GAO l; 1J3T A; 1OOT A; 2FPE A; 1NJI C; 1WJS A; 3QBY A; 1Q7Y R; 4L5G A; 1ZSZ C; 1TG0 A; 2HAX A; 2GQI A; 2B86 A; 2JTM A; 1N9S A; 1NG2 A; 4LXC A; 5CK9 A; 1MHN A; 1K9M C; 3M59 A; 3I55 Q; 5GAN e; 4J6W A; 2BZ8 A; 1K8A C; 3QII A; 4C0F A; 4ORZ A; 4HVW A; 4ELY C; 2YRD A; 2MIO A; 1JBM A; 4M7A F; 1NPR A; 3PFS A; 4JRK A; 2RQV A; 1M1K R; 2JN0 A; 1VQ9 T; 1YJN Q; 3GIB A; 1YHQ A; 3LX7 A; 2CYZ B; 2H3J A; 4M75 C; 3CC4 Q; 1KG1 A; 4BDZ A; 2LNH B; 2OAU A; 2MI6 A; 4M7A A; 2JS2 A; 2VGN A; 1CSK A; 3RR6 A; 1XTD A; 2RJC A; 1WJR A; 1JXM A; 5GAM h; 5J3B A; 2JJ9 A; 4OP0 A; 3GP8 A; 3CCM A; 4JUV A; 3OYG A; 5KYU B; 1R0B G; 4C92 C; 5L23 A; 3CPW P; 1K73 C; 4BY6 C; 2HQE A; 4C0Z A; 2DO3 A; 2LX7 A; 4OGC A; 1VQP Q; 1NJI U; 1EIF A; 1YFN A; 3URG A; 2E65 A; 5AT1 B; 4BI4 A; 5CCA A; 5KYX B; 4M7D B; 2VVK A; 3JB9 G; 2QEX T; 5GAM j; 3M0U A; 3M0R A; 1VQM T; 4OB0 B; 1K9M U; 3OYY A; 2MAM A; 2ZCF B; 1M2O A; 1K8A U; 1WXB A; 4OF1 A; 1KK7 A; 4ZGD B; 4FYX B; 1I0C A; 2GF7 A; 1B34 A; 4QQG A; 3VS2 A; 2H3E B; 1WHH A; 3EHR A; 2EJ9 A; 4OB2 B; 2LJ0 A; 1GBR A; 3OS1 A; 4M7A D; 2JM9 A; 3CME T; 2ED1 A; 2ZZD A; 1KC8 C; 3I56 Q; 2YRC A; 5FU6 C; 2D0Q B; 1UHC A; 3UWN A; 4F7U F; 1WHM A; 2COW A; 4KUL A; 2HBP A; 1RAE B; 1YIJ Q; 3I35 A; 1TTH B; 1VQ8 Q; 2QGF B; 1T0H A; 4IIM A; 4CC3 A; 4M77 B; 4M78 B; 1FMV A; 3E2U A; 5KYW A; 4F7U A; 4RTY A; 1KFZ A; 1VQO A; 3EH2 A; 2DNU A; 1KHC A; 3G71 T; 3L2Q A; 2E6Z A; 2HMA A; 5ECA A; 1K9M R; 2DTO A; 5GAM e; 3EG1 A; 1M90 R; 4XU3 A; 3V7C A; 4C5E A; 2VUB A; 2CZ1 B; 4LDX A; 4WF2 A; 3LH0 A; 4J83 A; 4EPC A; 5FRM A; 3BFM A; 4QT7 A; 3OYH A; 4E7H A; 3QDR B; 1HK9 A; 3CXC S; 2BIV A; 2E5K A; 3L2Z A; 2DL7 A; 4RKU E; 2PVO B; 3ER0 A; 3SFM A; 4XTX A; 3CC2 A; 5CQY A; 5EG2 A; 4CC7 A; 2DE0 X; 2DF6 A; 1S72 T; 2D8J A; 3QWX X; 2DKG A; 2DIG A; 2PUO B; 4A53 A; 5D6W A; 3CD6 T; 2AKL A; 2ZPG B; 4HVU A; 2LVM A; 2AT1 B; 1RUW A; 3OYL A; 3CC7 A; 4OVA A; 3QJY A; 2SEM A; 3BY7 A; 1VQ6 A; 2CUB A; 3EGD B; 1K73 R; 5KE3 A; 4TVR A; 3JRZ A; 1X69 A; 2NYS A; 3CCU A; 1ZSZ A; 2OI3 A; 5IT9 E; 3PIO A; 1H64 1; 2DYI A; 4N4G A; 3CEY A; 2CH4 W; 4KRT A; 4MDW A; 2EJG A; 2FVU A; 1LOJ A; 2C0O A; 2V26 A; 5GJV B; 3C4S A; 4J9E A; 3FJ5 A; 1C1A A; 1UGV A; 4Z89 A; 5GAN f; 3DB3 A; 2DXC A; 1RAB B; 5FU7 C; 1M5Q 1; 1BKB A; 4F16 A; 4M75 A; 1U8R A; 3FDR A; 4LNP A; 1FXX A; 4HT9 A; 1NE8 A; 2FPF A; 3OW2 S; 1KC8 R; 1Y07 A; 1KIK A; 1ARK A; 2ZPF B; 2HD0 A; 2EGC A; 4C92 F; 2CP3 A; 2XID A; 4EMK B; 2E3I A; 3PTA A; 3KXT A; 4E7Z A; 5IAY A; 4JLG A; 4KT0 E; 2L3R A; 4A4E A; 2JM8 A; 1I1J A; 4CI0 C; 1AWW A; 2QXF A; 4E2F B; 3N5B B; 2FRY A; 2MPX C; 1VQL Q; 2E5Q A; 2NLU A; 2VXF A; 1YJW Q; 3RIR A; 3I5R A; 2E12 A; 3A8O B; 5GAN 3; 5KYN A; 4JJN K; 1PRM C; 1UTI A; 4IUT A; 2K2M A; 3CCJ T; 1BIA A; 2X51 A; 4J9D A; 3SWN C; 2CT3 A; 2H8H A; 2EWN A; 2LDM A; 1YJ9 T; 4OMO A; 1D1B A; 4PJO E; 2F1L A; 4O6J A; 1YI2 Q; 1JJ2 P; 1PSF A; 2O9V A; 4M75 D; 4X34 A; 1ABQ A; 4J7I A; 4ESR A; 4E6R A; 4L59 A; 3X26 B; 1IHW A; 1U1S A; 3UPU A; 3QXE B; 1ZLM A; 4HXJ A; 3ME9 A; 1RAG B; 4BUG A; 2RN8 A; 2CSQ A; 3UA7 A; 2JTE A; 4FYY B; 2GFA A; 2FB7 A; 2PTK A; 4M7D G; 4E7I A; 3QPH A; 2EFI A; 2GTJ A; 2F2V A; 4C92 D; 1B3Q A; 2RI2 A; 4VUB A; 2JUF A; 3J80 E; 4DBH A; 3M4G A; 2VV5 A; 2XD0 A; 4L6V 5; 2LCC A; 1VQ4 T; 3EFO B; 5FRO A; 4EDU A; 2K9G A; 4C0D C; 3JB9 H; 4Y92 A; 3CME A; 1AT1 B; 4FYW B; 4R55 A; 3GOX A; 3ULR B; 5GAM f; 4J7F A; 3HPW A; 2LCL A; 2QQR A; 3G4S Q; 1T0J A; 3JCM J; 2X3W D; 3VJP A; 2BE7 D; 2RD1 A; 4II1 A; 3OYE A; 3CCQ Q; 2LT1 A; 2DK3 A; 4AFU C; 2X4Y A; 2NUT A; 2GBQ A; 3NGP A; 4BAC A; 1ZX6 A; 2HL3 A; 1X75 C; 2RM4 A; 1H3H A; 4M77 G; 4M78 G; 1D3B B; 2DD4 A; 1VQN A; 5CKB A; 2RHU A; 1WZO A; 5FLX E; 2HBW A; 3FRN A; 3MEW A; 3G71 A; 2CH4 A; 3HKS A; 2L5Q A; 2DJQ A; 4GLM A; 6AT1 B; 1XNI A; 1IXD A; 2V8J A; 2K3Y A; 5CKE A; 3SD4 A; 3FJP A; 4LE9 A; 2ZPB B; 4OMP A; 1NEG A; 1SSF A; 3GLX A; 1MMA A; 1M2V A; 1TUC A; 2RI5 A; 3OYM A; 2O4X A; 2VB6 A; 2FYK A; 2EAY A; 1C6V X; 2MMP A; 4KGV B; 1PD0 A; 1K0X A; 1NLO C; 3O5Z A; 3HFO A; 2IVW A; 4LUE A; 3S3M A; 2MK5 A; 3C95 A; 2FZG B; 2V1Q A; 3ASK A; 2F69 A; 5GAN d; 1YBY A; 1QCF A; 2O31 A; 1C0M A; 2JS0 A; 3TU4 K; 3EG3 A; 2OAW A; 1S72 A; 5IHI A; 1YIT Q; 2X3X D; 1UGP B; 4ME7 A; 3E9G A; 1JJ2 A; 3QYG B; 1W2B P; 5LJ3 d; 3CD6 A; 3JSC A; 3JB9 F; 3OS5 A; 2PVG B; 1X6B A; 2LC4 A; 2A08 A; 4OMM A; 3L2W A; 1VQO T; 1G2B A; 2JVV A; 2W0Z A; 5A0L A; 1LNX A; 2C0T A; 2IG0 A; 2JXB A; 2QA4 T; 2YSQ A; 1KD1 U; 2G3R A; 2LX9 A; 3HRT A; 1QVF P; 5CVI A; 3CPW S; 1HXD A; 2J7I A; 2ED0 A; 2ZAE A; 3SHW A; 1UFF A; 3MKD A; 3OBY A; 3M55 A; 2QQS A; 3MPU B; 2E6N A; 3H6Z A; 3E1S A; 3OYI A; 1MMD A; 2O01 E; 2EQU A; 1K0S A; 3HRU A; 3PNW C; 4HT8 A; 4RTZ A; 4Z8A A; 4JS4 A; 3QHS A; 1TH7 A; 4IUV A; 4PNO A; 5D7U A; 3VKI A; 1R0C B; 3CC2 T; 1QVP A; 2WSC E; 4IUR A; 3OYN A; 1FWZ A; 2EGE A; 4C8Q B; 3C94 A; 4J9B A; 5LJ3 h; 1ZBJ A; 2K5F A; 4M7D C; 1N9R A; 1MNE A; 3OBW A; 5DM7 R; 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3RER A; 1OZ2 A; 1GBQ A; 4A63 B; 5D6X A; 4CRI A; 4HCC A; 2PQW A; 3LH5 A; 4N4H A; 4BD3 A; 9ATC B; 2F5T X; 3PT9 A; 1W70 A; 3G1J A; 2GCX A; 1M1F A; 2L0A A; 1BI3 A; 1VQP A; 1JRI A; 2HZY A; 2XDD A; 1BYM A; 3OS0 A; 1FYN A; 3EAE A; 1YHQ Q; 5CIU A; 4YTL A; 3WXM B; 5LL6 S; 1LPL A; 1WJQ A; 1OPL A; 2YWW A; 5GAN 2; 1U1T A; 1SSH A; 1M8V A; 2RF0 A; 5LJ5 e; 2HKN A; 3M53 A; 4JRQ A; 3A5Z B; 1YNZ A; 3GF5 A; 3ZL7 C; 2BUD A; 1OQK A; 1KSW A; 1IRE B; 4IKF A; 4MZP A; 2EYX A; 2YUN A; 1SHG A; 3CCM Q; 2KXC A; 2YRV A; 5HCK A; 3QUI A; 3JB9 I; 1VQ5 T; 3HTR A; 4FW2 A; 3JCM e; 4Q5W A; 3M9Q A; 4PJN A; 2DYB A; 1RAF B; 3LGF A; 2EQM A; 1U06 A; 2M1H A; 1Q82 C; 2AZS A; 4EMG A; 5KYU A; 2DVE A; 1LJO A; 1WGS A; 1QWE A; 2MF2 A; 4M7D F; 2DL5 A; 5I21 A; 3OY9 A; 4F7U E; 2EQI A; 1NJI R; 5GMK l; 2CP2 A; 4HCB A; 3V8K A; 2KQW A; 1VQN T; 2A36 A; 1JJ2 S; 2HQX A; 5KYX A; 2L89 A; 2CSI A; 3CBO A; 2QA4 A; 4M7D A; 2QDY B; 4AMC A; 2L8D A; 2KGT A; 3O8V A; 1K8A R; 3V7S A; 1BU1 A; 7AT1 B; 4OMQ A; 3HRS A; 3VS0 A; 2G6F X; 5A0D A; 2ZGW A; 4ZGE B; 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