The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
|
| molecule tags |
Ribosome
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| total genus |
17
|
| structure length |
95
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| sequence length |
95
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| Q | PF01157 | Ribosomal_L21e | Ribosomal protein L21e |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3I55 Q; 1YIT Q; 1Q7Y R; 3CME Q; 3CCV Q; 3CCE Q; 1QVF P; 1M90 R; 1VQ9 Q; 1N8R R; 1YJ9 Q; 1VQ6 Q; 1YJN Q; 1VQ4 Q; 3OW2 P; 1VQ5 Q; 1Q81 R; 1K73 R; 1NJI R; 2OTJ Q; 3CC2 Q; 3CCQ Q; 3CCS Q; 1K9M R; 3CCL Q; 1Q82 R; 1VQN Q; 1VQ8 Q; 1M1K R; 1S72 Q; 1QVG P; 1YJW Q; 3G6E Q; 1KD1 R; 1KC8 R; 3CMA Q; 2QEX Q; 1KQS P; 3CCU Q; 1Q86 R; 1W2B P; 1VQ7 Q; 3CC7 Q; 3G71 Q; 1YHQ Q; 1JJ2 P; 3CPW P; 3CCR Q; 2QA4 Q; 1YIJ Q; 1VQK Q; 3CC4 Q; 3CD6 Q; 1VQL Q; 2OTL Q; 1VQP Q; 1VQO Q; 3CCJ Q; 3CXC P; 3CCM Q; 1VQM Q; 3I56 Q; 1YI2 Q; 3G4S Q; 1K8A R; #chains in the Genus database with same CATH topology 1Q7Y C; 3JB9 D; 2LQK A; 2NYS A; 2H3E B; 6AT1 B; 1V76 A; 1ABQ A; 3CCJ A; 3QO3 A; 2COY A; 3JCM Q; 1YIT A; 2HKN A; 4J6W A; 2FZK B; 1KC8 R; 4A63 B; 2COZ A; 2P0P A; 4GY5 A; 5HCK A; 4FYY B; 2ROL A; 2KVQ G; 3QPH A; 2HEQ A; 1WX6 A; 4DBR A; 1LPL A; 3MP6 A; 4F7U G; 5LJ5 e; 1JB0 E; 1M90 C; 1T3L A; 1B34 B; 1Z9Q A; 3PMI A; 4CC2 A; 1O75 A; 2QDY B; 4M4Z A; 2YRC A; 3CC2 Q; 1ZA2 B; 2AIR B; 1Y96 B; 2F1L A; 3M9Q A; 2DET A; 3CQT A; 2EJG A; 5GAN 7; 2NUP B; 2K3B A; 1WQW A; 2BZX A; 2CP5 A; 4ZGE B; 1EX4 A; 1AHJ B; 4C0Z A; 4LE9 A; 2OJ2 A; 3OYD A; 5GAO l; 1WHL A; 2MOX A; 4PJO A; 1G3Y A; 1KIK A; 3AHU A; 4LXC A; 1VQN T; 1RLP C; 4HCC A; 5EG2 A; 3QHS A; 3GNF B; 2XHC A; 2XI9 A; 1AZE A; 3SFM A; 3L2Q A; 1PKS A; 3OBW A; 1PRL C; 4KUI A; 3E19 A; 4CRI A; 4E47 A; 2K6D A; 4OMM A; 1QCN A; 1OPL A; 5LL6 S; 2KK4 A; 1OOT A; 4R0K A; 1S72 A; 1RAG B; 4X9C A; 3CC7 A; 1FMV A; 2QGG A; 3RES A; 2RD1 A; 1G8X A; 4ESR A; 2HL3 A; 2PVO B; 2HD0 A; 3I5S A; 2W10 A; 3ER0 A; 3MO8 A; 3MEW A; 4M7D D; 1M2V B; 2XID A; 1VQK Q; 1AWX A; 3JCM V; 4C92 F; 2JMC A; 2KRS A; 3CD6 Q; 1NG2 A; 3M59 A; 4AFQ C; 1WFW A; 4M7A D; 4OMF B; 4RG8 A; 3X24 B; 5GMK i; 1N8R R; 2X9H A; 4EMK A; 1QCO A; 5C6S A; 1Z9Z A; 2ESW A; 4M75 G; 4L6V 5; 3SHW A; 4F14 A; 3ME9 A; 2DER A; 4JZ3 A; 2LRQ A; 1X6G A; 1KQS A; 4A4F A; 2HQX A; 2V8J A; 2EYQ A; 4M7D B; 1C0M A; 2LT1 A; 4KT0 E; 1BCO A; 2M0O A; 2JT4 A; 3UA6 A; 4LUD A; 3I9Q A; 1SPK A; 4X1V A; 4M7A B; 1VQ5 T; 2ABL A; 3H0H A; 4RKU E; 3MP8 A; 2L8D A; 1SF9 A; 2KDS A; 1FXX A; 2HNI A; 1D3B A; 1VQM A; 2RNA A; 2DEU A; 2EKO A; 2QA4 T; 9ATC B; 2FO0 A; 3MP1 A; 2K3X A; 4DOW A; 1MMA A; 1OX9 A; 1QKX A; 1XJW B; 2DTI A; 5GMK e; 1PKT A; 5KYN A; 3CCL A; 4NS5 A; 3DLM A; 3CME Q; 2E41 A; 1QVF P; 1M3A A; 4F17 A; 1B34 A; 3UA7 A; 3OYK A; 2V1R A; 4Z89 A; 5FU6 B; 3FRN A; 2E70 A; 2JJ9 A; 4FU6 A; 3VS5 A; 2YRV A; 3G6E T; 5HK3 A; 1K8A U; 2NUZ A; 2PNI A; 3A5Z B; 3DKM A; 2DLP A; 2FPF A; 2WSF E; 3VUZ A; 1D1B A; 2EIF A; 4ME7 A; 2NUP A; 3RKX A; 1KD1 C; 1YIT Q; 5FRM A; 3S6W A; 4F7U F; 2CZ0 B; 3V7R A; 5FWC A; 5LJ5 j; 2EAY A; 3C0C A; 1TUG B; 5GAN d; 4XTW A; 2O9V A; 1BIB A; 1YP5 A; 5I22 A; 2CKK A; 4FL6 A; 2HAX A; 2RHZ A; 5GAM f; 1YBY A; 5GAO p; 4P5N A; 4QQ6 A; 3HFN A; 2Y90 A; 1KHC A; 2XDD A; 4LNP A; 2WSC E; 3RNJ A; 1T0H A; 2HMA A; 5LJ3 e; 4JS4 A; 2GTO A; 2LZ6 B; 1NEG A; 3VRZ A; 1M2V A; 2EQI A; 2JVV A; 1VYV A; 5KH6 A; 3GPL A; 5FU7 B; 4E6R A; 4PJO G; 3HRT A; 1YN8 A; 1RAE B; 2RJF A; 2AHJ B; 3M53 A; 2M0Y A; 3CCS T; 1BI1 A; 2M9U A; 2X4X A; 8ATC B; 5KYU B; 1Y7X A; 4LN2 A; 2JM8 A; 3OYH A; 2RQV A; 1TUD A; 1SHG A; 1S72 Q; 2H8H A; 4BY6 C; 4M7D A; 3C94 A; 3CC7 Q; 2ECZ A; 3MEV A; 1WYX A; 1V1C A; 1OV3 A; 3CXC P; 1H92 A; 1SSF A; 3C12 A; 3EG2 A; 4M7A A; 3G7Z A; 1UGV A; 4Z02 A; 1YHQ A; 1E7O A; 4M75 F; 2DKG A; 1KQ2 A; 1JEG A; 2DD5 A; 2DZC A; 2XD0 A; 2QAS A; 3FLG A; 3JCM g; 1ZBJ A; 1ZUK A; 3ZFJ A; 1M1K C; 1OX8 A; 2ZAE A; 5FWB A; 2D1X A; 4BUG A; 2E1H A; 1HYO A; 1UJY A; 2PVD B; 2X35 A; 4AMC A; 2OTJ A; 2QG9 B; 2GQI A; 3INZ A; 1VYU A; 4IUR A; 3QZ5 B; 1TWB A; 2L89 A; 4CI0 C; 4LD6 A; 5DLQ E; 4IUQ A; 2M16 A; 1RUW A; 2P4R A; 5CKF A; 1BKB A; 5IH2 A; 4C5G A; 4JRQ A; 3A8L B; 1YIJ T; 3HSB A; 1W1F A; 4JRP A; 3H0I A; 4DA4 A; 1SKU B; 1PCX A; 2M1H A; 3G4S T; 2GBQ A; 3QBY A; 1QKW A; 5GMK j; 1VQM Q; 1K8A R; 1R8O B; 4BI4 A; 4C0D B; 2CP3 A; 3UF4 A; 2QEX A; 3JCM J; 1RAB B; 1LVK A; 1N9R A; 2KY9 A; 1RL2 A; 4XK8 E; 5GAN 4; 3M4G A; 1RI9 A; 5D6W A; 3CCL Q; 2E4H A; 1UB4 A; 3I35 A; 1JO8 A; 2DO3 A; 1VQ6 A; 4M77 D; 5GMK m; 3H9N A; 1M9S A; 4Y92 A; 1T3S A; 3EGD B; 5CO7 A; 3VUB A; 1YJN T; 2P0Q A; 5GAN f; 2CP2 A; 1MMG A; 3OW2 P; 2VGM A; 1FX7 A; 3FB9 A; 3CCS Q; 1WLP B; 3LWI A; 4F16 A; 4FYV B; 1W2B A; 1QVG P; 3LGF A; 1X6O A; 2KRO A; 5I11 A; 4M77 B; 1WJR A; 3I55 T; 1UDL A; 4A4G A; 1ZUY A; 4E2F B; 4DOV A; 4CC3 A; 4L59 A; 5I2S A; 3M0R A; 1K9M U; 3JB9 I; 1S1N A; 2AZV A; 2KNB B; 1QCF A; 3JSC A; 1AT1 B; 1SEM A; 3TRE A; 2CT3 A; 2JZ2 A; 3V8J A; 2RJC A; 2GTJ A; 4JPB W; 3VU3 C; 5IT9 E; 1W6X A; 5IHK A; 5I21 A; 2OTL T; 4ZTJ A; 4DQ2 A; 5A2Q E; 3OS2 A; 2EYW A; 1Y07 A; 3V8K A; 4PJO F; 1E6G A; 4C8Q D; 3M58 A; 3VS3 A; 2GNC A; 3G71 A; 1NYG A; 1FWZ A; 1N5Z A; 4O6J A; 3EFS A; 3LH0 A; 1Q7Y U; 3L2W A; 4QKU A; 4XAX B; 4MDW A; 4DBH A; 4OMO A; 4R56 A; 3A8H B; 2XK0 A; 4C8Q B; 4F7U E; 3CPW S; 3SWN B; 1AZG B; 2X3X D; 1IRX A; 2COW A; 3FC3 A; 5FW9 A; 2X3W D; 5D6Y A; 2WSE E; 1UG1 A; 3CCM A; 3JCM c; 4ELZ C; 4XU2 A; 2KSS A; 2QTV A; 3CCV A; 1M90 U; 4N0A A; 1M8V A; 1YHQ Q; 2EYX A; 2RK1 A; 3FJP A; 1QP2 A; 1I1J A; 1OYX A; 2O01 E; 2RPN A; 2FRW A; 2DIL A; 4XTZ A; 5KYX B; 5GAN 3; 1PNJ A; 3TQ7 P; 1GCP A; 2ZZD A; 2B8A A; 3EG3 A; 5GAM h; 5GAO q; 1VQL A; 3ASK A; 2OTJ Q; 4BDY A; 1ZUU A; 3G71 T; 2EKH A; 3EFO A; 3BDU A; 5HY6 A; 2DNU A; 2KT8 A; 3CPW P; 3M55 A; 2JS2 A; 2OAW A; 3EGD A; 4FYX B; 1ZSZ B; 2K7A A; 1BI2 A; 2FPE A; 1ZX6 A; 3RIR A; 3ZBD A; 1TH7 A; 3HRU A; 2DIG A; 3CC2 T; 3RER A; 4FSS A; 4D8K A; 3BFM A; 2HQE A; 2MAM A; 4RMO A; 2V8I A; 1WHJ A; 1JJ2 A; 2QEX Q; 2O9S A; 4N4G A; 5GJW B; 5CK9 A; 2X4Y A; 2Y4X A; 2E5Q A; 4II1 A; 1HJD A; 1X75 C; 1AEY A; 3OA6 A; 3JCM P; 4M75 E; 1VQ6 Q; 2J6F A; 2EVR A; 2DJZ A; 2FPD A; 4RTZ A; 1WHM A; 1IZ6 A; 1N9S A; 1PD0 A; 2IPO B; 5L8R E; 3E9F A; 1C6V X; 4D8D A; 4PJO C; 4HVV A; 5LJ3 h; 2BIV A; 4J9C A; 2G3R A; 3BW1 A; 2M51 A; 2F5T X; 1GFC A; 4X9D A; 2RH2 A; 4FW2 A; 2K5I A; 2VYT A; 1VA7 A; 1QWE A; 1Y57 A; 4JDS A; 4OMQ A; 4OP0 A; 1YJW A; 2GF7 A; 1AWJ A; 1WXT A; 2PUO B; 4QVZ A; 2DBK A; 2C0T A; 3OYE A; 2O2O A; 2CUB A; 3OS0 A; 1VQK T; 4XQ3 A; 4M78 C; 3DB4 A; 5GAO n; 3CD6 T; 3PIP A; 4JZ4 A; 4MML A; 2ZPI B; 2LMJ A; 5CKD A; 4C8Q A; 2RO0 A; 1ZSG A; 3SWN A; 1Q7Y R; 4ZGJ B; 1SG5 A; 1DJ7 B; 3VS0 A; 3L2U A; 3BE3 A; 3JB9 H; 2QQB A; 3VJP A; 2D9T A; 2CSI A; 4EMK C; 1BU1 A; 3LWH A; 4HVW A; 2LT4 A; 1AVZ C; 2VV5 A; 3G71 Q; 5FLX E; 3EG9 A; 3FJ5 A; 3QKJ A; 1BK2 A; 5KCO A; 3QWY A; 5KYX A; 3QG1 A; 1M90 R; 4RTT A; 4E7K A; 4AT1 B; 4M7D F; 1KHI A; 2A36 A; 2LCS A; 1YWO A; 2V8K A; 3JCM b; 1KD1 U; 3QDR B; 1U5S A; 5GAN h; 3HTR A; 4B9W A; 4B9X A; 4EMH A; 3R6N A; 3JCM f; 3HHT B; 3CME T; 3CCM Q; 1UFF A; 5CVI A; 2IG0 A; 3TSZ A; 3CCV Q; 5GAM d; 1MND A; 3PVQ A; 4FCY A; 2CP7 A; 3SB2 A; 4MZP A; 1BIA A; 2BZ8 A; 4ORZ A; 3QWX X; 3CCJ T; 5IHN A; 5HKC A; 1WIE A; 1NLP C; 4ANJ A; 1YIT T; 1PC0 A; 1VQL Q; 2K79 A; 2FRY A; 4JUV A; 5LJ5 f; 2RK2 A; 2LQW A; 3EH2 A; 4KH1 B; 2H3J A; 3CCU A; 1WDX A; 3CCR A; 2L3P A; 3JB9 J; 2MK5 A; 1W4S A; 2DTH A; 1LCK A; 1XTD A; 3I56 A; 1MNE A; 1PRM C; 4M78 A; 1RAF B; 2R5A A; 3BDL A; 1F1B B; 1YCY A; 1FYN A; 1JBM A; 2LJ3 A; 2EBP A; 2IVW A; 2LTO A; 5KYW B; 2YUP A; 3T9N A; 1X6B A; 4WTO B; 2HL5 C; 1SRL A; 3J80 E; 3H8Z A; 1VQO A; 5LJ3 d; 1VIE A; 1SRM A; 1U8R A; 1Q82 C; 5FRN A; 1QVF S; 4N4H A; 3KFV A; 3X20 B; 5IHI A; 4NOY A; 1QWF A; 3TVT A; 1PWT A; 4PJN A; 3H6Z A; 2YLB A; 3NHN A; 3IQL A; 1PG5 B; 1JU5 C; 1B3Q A; 1UE9 A; 2AK5 A; 1EIF A; 2DVE A; 1CSK A; 3JAM E; 1S72 T; 2DX1 A; 2AT1 B; 1K73 C; 1YI2 A; 1G2B A; 4Q5W A; 3CC7 T; 3CCR T; 2ED1 A; 2FL7 A; 3OYF A; 2YLC A; 1P92 A; 1UGP B; 1KFZ A; 1QP3 A; 1UEB A; 2DL8 A; 4M7D C; 4OMN A; 1KSW A; 2O31 A; 3KXT A; 1D1A A; 4M7A C; 3H41 A; 1G5V A; 5AT1 B; 2RI2 A; 2JUF A; 3X26 B; 2EJ9 A; 4XTV A; 2J06 A; 2ZPE B; 1Y96 A; 2FHD A; 1OI1 A; 2GFU A; 4EIK A; 1Q86 C; 3M0S A; 2MWP A; 2EGC A; 2AZS A; 2HSE B; 2DRM A; 5GMK l; 3CCJ Q; 3MEU A; 1KD1 R; 2DMO A; 2HQH A; 2LDM A; 1KQS S; 1J3T A; 1VQ7 A; 1K0X A; 3LYI A; 5FU6 C; 4AFS C; 2KYB A; 1IGQ A; 5C0M A; 4ZN1 A; 2NUT B; 3CCE A; 3TCJ A; 1D0X A; 3JRZ A; 1VQM T; 4KGV B; 2MWO A; 3AT1 B; 2RJD A; 4QVD A; 5DLO A; 4EPC A; 4FM4 B; 4C5H A; 2A3L A; 4BD3 A; 2RQU A; 4C92 B; 1TG0 A; 3CCL T; 2DXT A; 3CXC S; 1VQP A; 1G83 A; 4D6W A; 5A0D A; 2QAZ A; 4R55 A; 4XTX A; 4J7I A; 1KQS P; 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1V29 B; 3TSW A; 3QXE B; 2LCL A; 5CQY A; 3JCM X; 4C5I A; 4XU0 A; 3JB9 G; 1HK9 A; 4C92 E; 1QW1 A; 3OYA A; 2OI3 A; 2JXB A; 4N0A C; 2YHT A; 4O5V A; 2D6F A; 3V7S A; 4RCB A; 4N4I A; 2PUK B; 2OTJ T; 1ZLM A; 2EWN A; 1BB9 A; 4KUL A; 4C0D C; 1VUB A; 3OYN A; 1NJI C; 1GBQ A; 4IUV A; 4ZGD B; 4FT2 A; 2XDP A; 1RLQ C; 1WA7 A; 4M75 D; 1VQ7 Q; 2DTO A; 1OU9 A; 4JJD A; 2QDL A; 1KG1 A; 2MPX C; 4IIM A; 4J9E A; 5CQX A; 5HK0 A; 1NLO C; 2LX7 A; 3GLX A; 4YTL A; 2B86 A; 2E64 A; 2DXC A; 3MET A; 3CCE Q; 3GOX A; 3HPW A; 2P4T A; 2PU9 B; 5KYU A; 2V1Q A; 4GBQ A; 3OYM A; 3CBP A; 4RTX A; 2QEX T; 4PL6 A; 2LQN A; 3WVD B; 2K5F A; 4M75 B; 1IGU A; 1YJ9 A; 2RMO A; 1G3T A; 3EGX A; 1VQP Q; 3M5A A; 4M77 C; 1VQ6 T; 1TS9 A; 4QQG A; 2KRN A; 2MYS A; 3J7A F; 3QDF A; 2CP0 A; 2VC8 A; 3ZL7 C; 4XU1 A; 2CZ1 B; 2P84 A; 1NPR A; 4BE0 A; 4ELY C; 3OYC A; 4PFO A; 2QGF B; 2DJQ A; 4OVA A; 3ZEH A; 2KRM A; 4VUB A; 2DAQ A; 2ZPH B; 1W2B S; 2HBW A; 4LDV A; 2CUD A; 4M78 F; 1VQ9 Q; 2QQR A; 2E3I A; 1G3S A; 4M7D G; 2MI6 A; 1PM3 A; 1VQ8 Q; 1GFD A; 4M7A G; 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