The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
STLFEALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSIYLAPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Theoretical and experimental demonstration of the importance of specific nonnative interactions in protein folding.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Fyn
|
| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
12
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| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2008-04-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1AEY A; 2L3S A; 2KNB B; 2RQT A; 4RTW A; 5ECA A; 1QKX A; 4RUG A; 1QWF A; 2GQI A; 2EW3 A; 4Z89 A; 1OPK A; 1RLQ C; 2W0Z A; 1WX6 A; 1MUZ A; 1OOT A; 2F2V A; 2FPD A; 1AWX A; 3JV3 A; 1ABO A; 1TG0 A; 1U06 A; 4LE9 A; 1X43 A; 2SEM A; 3QWY A; 1M3B A; 1QKW A; 1VA7 A; 2KR3 A; 4OMO A; 2LQN A; 2DL3 A; 1E7O A; 1SHG A; 1X2Q A; 1PKT A; 1TUC A; 2K6D A; 3M0U A; 2LJ0 A; 3NMZ C; 4WCI A; 4IIO A; 3PE0 A; 3SEM A; 2J6F A; 2ECZ A; 1AWW A; 1JEG A; 1UDL A; 2SRC A; 2KRS A; 3NGP A; 2YT6 A; 2J06 A; 4M4Z A; 2JMC A; 3H41 A; 3TSW A; 4HVU A; 2RQU A; 3NHN A; 2EYW A; 4ZNX A; 2M51 A; 1Y0M A; 1ABQ A; 1JXO A; 2CH4 A; 3UAT A; 2OAW A; 4OML A; 2CUD A; 1J3T A; 4DEY A; 2KRO A; 2KT8 A; 2K9G A; 1WIE A; 3VS4 A; 1AWO A; 4HXJ A; 2P4R A; 1N5Z A; 1NEG A; 1AD5 A; 2F2W A; 3VS6 A; 4RTT A; 1NEB A; 1ZSG A; 2BTT A; 1HSQ A; 1H8K A; 1MV0 B; 4RTX A; 3FJ5 A; 2FRY A; 2FPF A; 4OMN A; 2F2X A; 4AG1 C; 1IO6 A; 1VYU A; 1PRL C; 1WLP B; 2KEA A; 2JXB A; 1NLO C; 2L0A A; 5IHN A; 2M0Y A; 2L3Q A; 1E6G A; 2RQV A; 4CC7 A; 2ABL A; 2RQW A; 2B86 A; 4A63 B; 2CSQ A; 2EPD A; 4JZ3 A; 2DBM A; 3UF4 A; 3VS7 A; 2LP5 A; 3M0Q A; 2YUQ A; 4GLM A; 2EGA A; 1FYN A; 3RNJ A; 5GJW B; 2ENM A; 2MCN A; 5FWC A; 3VRZ A; 4J9D A; 2BZY A; 4LUD A; 2EYY A; 1EFN A; 3EG0 A; 4EIK A; 2JM8 A; 1M8M A; 2C0T A; 5FWB A; 3RBB B; 2GNC A; 2KXC A; 1W1F A; 2LMJ A; 3M0P A; 1NLP C; 1MV3 A; 2K2M A; 4LNP A; 1NYF A; 4J9F A; 4X1V A; 1YCS B; 2DL8 A; 4DEX A; 2DIL A; 2JM9 A; 1KSW A; 3NPF A; 4HVV A; 1U5S A; 2KRN A; 2EKH A; 5IHK A; 1WXB A; 2IIM A; 4FSS A; 1WA7 A; 1K0S A; 2DRK A; 2J6K A; 2DA9 A; 2KE9 A; 4JJD A; 2HEQ A; 3M0R A; 1QWE A; 1CSK A; 2DM1 A; 2JW4 A; 1JXM A; 1I1J A; 3EG3 A; 1UG1 A; 1ZUK A; 2C0O A; 4GBQ A; 1T0H A; 1AOJ A; 1K1Z A; 3EGU A; 2DBK A; 2ROL A; 1WYX A; 2LNH B; 1SSH A; 1JU5 C; 1YWP A; 3I35 A; 1ZBJ A; 1VYT A; 1CKB A; 1M3A A; 2CDT A; 5EC7 A; 2CH4 W; 1A0N B; 2K3B A; 1YP5 A; 1YN8 A; 2KT1 A; 4JPB W; 3GBQ A; 4RTU A; 4CC2 A; 2HCK A; 1B3Q A; 3ULR B; 3VS2 A; 1Z9Q A; 3VS5 A; 1SRM A; 2LZ6 B; 2CUB A; 1VYV A; 2AKL A; 2RMO A; 5I11 A; 2YUN A; 3QWX X; 1GBR A; 4HCK A; 4F17 A; 1SEM A; 2H8H A; 3I5S A; 1E6H A; 2EGC A; 2NUZ A; 1UEC A; 2DNU A; 3REB B; 3TVT A; 1K76 A; 2LQW A; 1T3S A; 1BBZ A; 1KJW A; 3VRY A; 1T0J A; 1OEB A; 2KYB A; 2C0I A; 4LUE A; 1GCQ A; 1NM7 A; 2CT3 A; 1X27 A; 2DX1 A; 2E5K A; 4AFU C; 2V1Q A; 1CKA A; 4J9G A; 3THK A; 2VKN A; 2O31 A; 2GGR A; 4CC3 A; 1QCF A; 2FEI A; 1ZUY A; 2EGE A; 4HVW A; 3TSZ A; 1X6B A; 1UHF A; 1UJ0 A; 2PTK A; 4OMP A; 4AFS C; 2JT4 A; 4RTZ A; 1SRL A; 1I07 A; 1SHF A; 1X6G A; 2D8J A; 2NWM A; 4Y92 A; 1X2K A; 2ED1 A; 2PZ1 A; 2DVJ A; 4JJC A; 1GBQ A; 3PVL A; 2DL4 A; 1TUD A; 1WFW A; 2MIO A; 3UA6 A; 4R0K A; 2KYM A; 2X3W D; 2X3X D; 5I22 A; 1WI7 A; 2W10 A; 1UTI A; 2EQI A; 5L23 A; 3I9Q A; 1K0X A; 2V1R A; 2YUO A; 1YWO A; 2JTE A; 1G83 A; 1GRI A; 2RPN A; 1M30 A; 2VWF A; 2AK5 A; 3UA7 A; 1JQQ A; 2BZX A; 1ZLM A; 5GJV B; 2RF0 A; 1GCQ C; 2OJ2 A; 1AZG B; 2DL7 A; 4ESR A; 1WXT A; 4F14 A; 1V1C A; 2FPE A; 5IH2 A; 1AVZ C; 2BZ8 A; 2LCS A; 1OV3 A; 2HBW A; 3M0T A; 1BK2 A; 1Y57 A; 4JZ4 A; 4AFZ C; 4J9E A; 4CC4 B; 1RUW A; 1HJD A; 3KFV A; 4D8D A; 2YUP A; 2DE0 X; 1HD3 A; 3O5Z A; 2KXD A; 2AKK A; 1NYG A; 1AWJ A; 2FO0 A; 2J6O A; 2O2O A; 2MOX A; 1GFC A; 1JO8 A; 2DF6 A; 3EHR A; 5IXF A; 1GFD A; 2ROT A; 2AZV A; 2HSP A; 2CSI A; 1WDX A; 2FG0 A; 2EVR A; 2VVK A; 2DRM A; 1W70 A; 1H3H A; 2FRW A; 2ED0 A; 1M3C A; 2A37 A; 2O9V A; 4KRT A; 2CT4 A; 4OMQ A; 3C0C A; 1I0C A; 1SPK A; 2DL5 A; 2A28 A; 1OPL A; 1UE9 A; 1M27 C; 4J9I A; 2KGT A; 1U3O A; 2L2P A; 2JS2 A; 2LJ3 A; 3EG2 A; 2XMF A; 2OI3 A; 2KBT A; 2GTO A; 2DJQ A; 1BU1 A; 4Z8A A; 2EBP A; 2YSQ A; 2AZS A; 1KFZ A; 5IHI A; 1PWT A; 2EYZ A; 2A08 A; 2RNA A; 2DMO A; 5HCK A; 3VS1 A; 3ZL7 C; 3U23 A; 5FW9 A; 4J9B A; 1WXU A; 2DLP A; 2EYX A; 3VS3 A; 1Z9Z A; 1RLP C; 4OMM A; 1H92 A; 1W6X A; 1BB9 A; 2KRM A; 3REA B; 1ZUU A; 4K11 A; 1UJY A; 4RTV A; 3M0S A; 1KIK A; 2GBQ A; 1PHT A; 3VS0 A; 3EG1 A; 2J05 A; 4J9H A; 3H0F A; 1UGV A; 3R6N A; 4QT7 A; 1AZE A; 2I0N A; 2J7I A; 1QLY A; 1G2B A; 4D8K A; 2GTJ A; 1GCP A; 2D0N A; 4AFQ C; 4ORZ A; 2G6F X; 2YDL A; 3CQT A; 4LN2 A; 1YNZ A; 2D1X A; 2RN8 A; 3H0I A; 1ARK A; 1K4U S; 2A36 A; 4F16 A; 2ESW A; 2PNI A; 2O9S A; 1B07 A; 2CRE A; 4AG2 C; 1T3L A; 2RQR A; 1RI9 A; 5IXB A; 2JMA A; 4Z88 A; 1LCK A; 1UHC A; 2LX7 A; 1UFF A; 1PNJ A; 1S1N A; 4JJB A; 1PKS A; 3SHW A; 2DYB A; 2LJ1 A; 2O88 A; 1UUE A; 3PVQ A; 2K79 A; 2D8H A; 3A98 A; 1FMK A; 3I5R A; 1NG2 A; 2K7A A; 1GL5 A; 2JS0 A; 4RTY A; 1ZX6 A; 1XOV A; 3LH5 A; 3EHQ A; 4E6R A; 2HDA A; 1X69 A; 1K9A A; 3H0H A; 3IQL A; 4J9C A; 2L3P A; 4IIM A; 2QDL A; 1PRM C; #chains in the Genus database with same CATH topology 1M8V A; 2DO3 A; 1QKX A; 1I81 A; 3JCM W; 4M77 C; 1OPK A; 2CKK A; 1O75 A; 1WX6 A; 1MUZ A; 2FPD A; 3JV3 A; 4AMC A; 1U06 A; 2KI7 A; 1X43 A; 4LE9 A; 3SB2 A; 3A8L B; 5CQX A; 1VQ7 A; 2DTO A; 5FU6 B; 3M4G A; 5GAN 3; 5GAN j; 3INZ A; 2KR3 A; 2OTJ A; 2MWO A; 4J83 A; 1YHQ Q; 1YI2 Q; 2GCX A; 4FSX A; 1PKT A; 2DTI A; 3I55 T; 3M0U A; 4IIO A; 1XJW B; 2PUO B; 3PE0 A; 3SEM A; 2ECZ A; 4CRI A; 4PK4 A; 1JEG A; 2SRC A; 2EJG A; 2L89 A; 4M4Z A; 3CCR Q; 1OX9 A; 2V8I A; 5GAO q; 2HMA A; 1VQ9 T; 1VQN T; 3NHN A; 4B9X A; 2YLB A; 4BB7 A; 2CH4 A; 3GIB A; 5GAN 8; 1RAH B; 4OML A; 2EFI A; 2CUD A; 2KRO A; 2V26 A; 1M2V B; 4LD6 A; 1SKU B; 2LC4 A; 3VS4 A; 4J6X A; 1AWO A; 4HXJ A; 2XD0 A; 3CMA T; 2LCC A; 4C0D C; 4ZN1 A; 3JRZ A; 1BI0 A; 4LDY A; 3OYG A; 3R6O A; 3VS6 A; 1NEB A; 1ZSG A; 1FWZ A; 2RHU A; 3OYN A; 5CKH A; 3RR6 A; 1H8K A; 5GMK j; 4RTX A; 2DER A; 1VQ7 Q; 3QZ9 B; 4LDU A; 5HKC A; 3FJ5 A; 1YJW A; 1K73 U; 1OU8 A; 2RI5 A; 2FPF A; 3PT9 A; 4AG1 C; 2OTJ Q; 5LJ3 h; 3HL8 A; 1MMG A; 1PRL C; 2KEA A; 3PFS A; 1YIJ Q; 2RA2 A; 1NLO C; 5CCA A; 2E5Q A; 2E70 A; 2M0Y A; 4RMO A; 1V29 B; 4CC7 A; 2ABL A; 1Q81 C; 2RQW A; 2QI2 A; 1Q7Y R; 4M7D F; 2EIF A; 4PJO F; 4E7L A; 3MO8 A; 3V7R A; 5KYU A; 1Q81 U; 3UWN A; 3VYG A; 3CCJ A; 3JCM J; 3G6E T; 2FZC B; 3EFO B; 1RAA B; 5GJW B; 4XTY A; 1QVG S; 2QTX A; 3CPW A; 3EG0 A; 2BUD A; 4GLK A; 5HK0 A; 4XTZ A; 4XU2 A; 5FWB A; 1MND A; 1KQS A; 4BY6 C; 1W1F A; 5I2M A; 3QYG B; 4DOV A; 1NYF A; 2VXF A; 4DEX A; 2JM9 A; 4MDW A; 1YJW Q; 4HVV A; 2KRN A; 4QW2 A; 4KUD K; 5IHK A; 1VOM A; 1AHJ B; 2IIM A; 1WA7 A; 1VQN A; 5KCO A; 5KYX A; 3X26 B; 4Y28 E; 2WSF E; 3E19 A; 2JOY A; 1D1C A; 1JXM A; 3VV0 A; 2M9U A; 3EGU A; 3G7Z A; 1N9R A; 3CC4 T; 1QW1 A; 1SSH A; 5FU6 C; 1B7T A; 1ZBJ A; 1M3A A; 5EC7 A; 1A0N B; 4JS5 A; 3MEW A; 4KGZ B; 3GBQ A; 3M54 A; 4EMK B; 4CC2 A; 5DLQ E; 2O01 E; 5IAY A; 3I55 Q; 1Z9Q A; 4C92 F; 5A0G A; 3P8D A; 1VYV A; 3QWX X; 4DBF A; 4M75 F; 4HCK A; 4F17 A; 2R5M A; 2H8H A; 3I5S A; 5LJ3 g; 1E6H A; 2FZK B; 2EGC A; 2NUZ A; 4ELZ C; 1LJO A; 3CCE T; 3RUX A; 1VQ9 Q; 1VQN Q; 4E7H A; 3MEA A; 1KD1 C; 1KJW A; 2D9T A; 2KVQ G; 4KGV B; 1OEB A; 2C0I A; 5LJ3 d; 2CT3 A; 3OYD A; 1KD1 U; 3THK A; 2JVV A; 1QCF A; 4BE0 A; 3HRS A; 4M7A B; 3CMA Q; 3PIO A; 4M7D D; 1UHF A; 4AFS C; 2PTK A; 4LXC A; 4JRP A; 1WHH A; 2JT4 A; 2QGG A; 3JCM d; 3JCM X; 1SHF A; 2CS7 A; 2CP3 A; 2ED1 A; 2DVJ A; 3DB4 A; 2FVU A; 2DL4 A; 3MCA B; 1DJ7 B; 4ZTF A; 1H3Z A; 2K3Y A; 2X3X D; 1OZ2 A; 5IT9 E; 3MP6 A; 3CCU T; 5L23 A; 4PJO G; 2V1R A; 1Q82 R; 2HL3 A; 5A2Q E; 4N0A C; 3VJP A; 3RIR A; 3CME T; 1YWO A; 3FRN A; 2RPN A; 2VV5 A; 3D7S B; 3NTK A; 1IZ6 A; 3PNW C; 1VQM A; 1OYX A; 3H9N A; 2BZX A; 1ZSZ B; 2CP2 A; 3FIF A; 1SG5 A; 3GNG A; 2VB6 A; 1WHG A; 5GJV B; 1G8X A; 3G6E Q; 4RG2 A; 3E9G A; 3Q1J A; 2DFU A; 3MJX A; 4F14 A; 4KT0 E; 2FPE A; 5IH2 A; 1AVZ C; 4MMK A; 5J39 A; 2BZ8 A; 4ZTJ A; 2EYQ A; 1WHJ A; 3QUI A; 4JRI A; 4M7D A; 4IKF A; 3OYL A; 2IG0 A; 4O6J A; 3RER A; 4PJO A; 2K5F A; 2YUP A; 4QVC A; 1TXQ A; 1AWJ A; 2VXE A; 4WF2 A; 4BI3 A; 1VQP T; 2ROT A; 2YXY A; 3M9Q A; 2HSP A; 1BI3 A; 2FG0 A; 2DVE A; 3JB9 I; 2HKN A; 4C92 D; 2RK2 A; 4M7A E; 5A0D A; 3ZFJ A; 5FRN A; 2ZPF B; 4M75 D; 3SWN B; 2RJD A; 1SPK A; 5LJ3 e; 3P8B B; 1UE9 A; 4QKU A; 2NUT B; 4C5H A; 4J9I A; 2HQE A; 2QQ9 A; 3DLL A; 4OGE A; 1ZA1 B; 2OTL A; 1HXD A; 3KUF A; 3DB3 A; 4MML A; 3EH2 A; 1M90 C; 2GTO A; 3H6Z A; 1MGQ A; 3JCM e; 4EMK C; 2EBP A; 1PCX A; 2YSQ A; 5IHI A; 2M16 A; 5HCK A; 2DMO A; 1M90 U; 3EFR A; 3CCU A; 2R57 A; 4J9B A; 2BE7 D; 3CXC P; 3CCQ T; 4DBR A; 3REA B; 3X28 B; 3CME A; 1ZUU A; 4KBM B; 4X34 A; 3URG A; 5A0L A; 1PHT A; 1OI1 A; 2WSC E; 1N8R C; 2J05 A; 2FYK A; 3CPW P; 4C8Q G; 3R6N A; 1N8R U; 1H64 1; 1G2B A; 1LPL A; 2QEX A; 4KGX B; 4D8K A; 5KYW A; 2GTJ A; 4M7A C; 1IRX A; 4ORZ A; 1Y7X A; 2DXB A; 1D0Y A; 4LN2 A; 1FMW A; 5KCH A; 5CAI A; 1D0Z A; 2ESW A; 3CBM A; 2PNI A; 2O9S A; 4J7I A; 3ER0 A; 3T9N A; 4HCB A; 3UDC A; 2I2L A; 3CC7 T; 2JMA A; 4B6M A; 2DAQ A; 1WJQ A; 1PNJ A; 1S1N A; 4JJB A; 1RAF B; 2O88 A; 2VYT A; 1VQP A; 3CCU Q; 4OP0 A; 3QZ5 B; 2H3J A; 2WAC A; 1NG2 A; 2RD1 A; 1GL5 A; 4RTY A; 1Q86 R; 4LDV A; 3LH5 A; 4C8Q A; 2KDS A; 5KYN A; 3CBP A; 3CME Q; 1R0B G; 3OBW A; 3E2U A; 3H0H A; 4WTO B; 2L3R A; 1ZSZ C; 1D0X A; 5GAN 4; 2L3S A; 1IXD A; 4RTW A; 3VKI A; 4RUG A; 3LWI A; 1QWF A; 2GQI A; 1YHQ T; 4QVZ A; 1BCM A; 2HBP A; 3CD6 T; 1TOV A; 1M2O A; 4C92 C; 2H3E B; 3CCS T; 3G71 T; 2MI6 A; 4M75 C; 3CCQ A; 3QWY A; 1VA7 A; 4XTW A; 4OMO A; 2DL3 A; 1OU9 A; 5C6S A; 3NMZ C; 2LJ0 A; 2NUP A; 4WCI A; 4M77 G; 4C5E A; 1XQH A; 3M4Y A; 1VQP Q; 1M1K R; 1JJ2 S; 4PLL A; 3NGP A; 3SWN C; 2X51 A; 5CKB A; 2J06 A; 5CKF A; 4KUI A; 4HVU A; 2EYW A; 4ZNX A; 1ABQ A; 2KAF A; 3UAT A; 9ATC B; 3OSV A; 1J3T A; 4DEY A; 2F5K A; 3JAM E; 2E41 A; 4P5N A; 3CC7 A; 5KYY A; 4V2S A; 4N4G A; 2RJF A; 2RHZ A; 3RKY A; 2GFA A; 4HT8 A; 3PGG A; 1UGP B; 4IUQ A; 2ZPE B; 4Y91 A; 2EQM A; 1MV0 B; 1BYM A; 4F7U G; 3MP8 A; 3CCQ Q; 1X75 C; 2FRY A; 4NS5 A; 2B8A A; 2EAY A; 1E6G A; 3OYB A; 2RQV A; 1B34 A; 4CI0 C; 2B86 A; 2FHD A; 1F1B B; 5HK3 A; 2CSQ A; 1NBE B; 2QA4 T; 2DBM A; 2LP5 A; 3M0Q A; 3CD6 A; 3GLX A; 3CCS A; 1FYN A; 4OB3 B; 2HD0 A; 2MCN A; 3OYK A; 3CXC S; 4J9D A; 4LUD A; 1QP3 A; 4C5G A; 3CC7 Q; 1G3T A; 2JM8 A; 1M8M A; 2C0T A; 3M53 A; 4PJM A; 3C4S A; 2KXC A; 2LMJ A; 3MEU A; 3CBO A; 3I56 T; 5L8R E; 1PG5 B; 2C06 A; 3LLR A; 1KSW A; 2X4Y A; 2CZ6 B; 1W2B A; 4FSS A; 3CCJ T; 1K0S A; 2DRK A; 2IPO B; 2KE9 A; 5GAM d; 3C94 A; 3TEE A; 2Z0W A; 3RKX A; 1D3B B; 4PJN A; 2CZ7 B; 3OW2 A; 3AT1 B; 4J8O A; 4BI8 B; 2P84 A; 4GBQ A; 5FRM A; 1AOJ A; 2FZG B; 3CEY A; 2ROL A; 1WYX A; 3CD6 Q; 1JU5 C; 3GP8 A; 3I35 A; 2AHJ B; 1CKB A; 4RCC A; 3CCS Q; 2HSE B; 3G71 Q; 2CDT A; 2CH4 W; 4DBQ A; 2K3B A; 5LJ3 f; 3JCM V; 2M1H A; 1K8A U; 3CCM T; 2L5Q A; 2CUB A; 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