The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
59
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structure length |
59
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Chain Sequence |
VTLFVALYDYEAITEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
SH3 domain specificity
rcsb |
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Fyn
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
11
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| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-04-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2YUP A; 2DL7 A; 2J7I A; 4F16 A; 2PTK A; 2HBW A; 1RLP C; 1XOV A; 3UA6 A; 4AFS C; 4AFU C; 2JTE A; 2PZ1 A; 4OMN A; 4E6R A; 4HVV A; 2RQU A; 2FRY A; 2RQR A; 2KBT A; 1NYG A; 1QCF A; 1AWO A; 1M3A A; 2DX1 A; 4OMO A; 2KYM A; 4OML A; 1PWT A; 3RBB B; 4OMP A; 1M3C A; 1MV3 A; 4LUD A; 4AG2 C; 2M0Y A; 3EGU A; 4Z88 A; 1WI7 A; 2CH4 W; 2DL8 A; 4JJB A; 2C0I A; 1LCK A; 2FEI A; 4RTW A; 2RN8 A; 2DRK A; 1UEC A; 1VYU A; 5ECA A; 1G83 A; 3SEM A; 2J6K A; 3CQT A; 2X3X D; 1GRI A; 4FSS A; 2VKN A; 3M0R A; 2D8J A; 3I35 A; 2V1R A; 1WXT A; 4RTZ A; 2YUQ A; 2EQI A; 5GJV B; 2DL5 A; 2YUN A; 2IIM A; 2E5K A; 1T3S A; 2A36 A; 2LJ3 A; 1HJD A; 1GCP A; 3VRY A; 2ESW A; 1M3B A; 3EHR A; 2A28 A; 2DRM A; 2HCK A; 1T0H A; 1UHC A; 2DE0 X; 4D8D A; 1B3Q A; 5IXB A; 2DLP A; 2DIL A; 3M0P A; 2KRN A; 4HXJ A; 3VS7 A; 4K11 A; 1QLY A; 2HSP A; 2LX7 A; 2CSI A; 1Z9Q A; 3VS4 A; 2W10 A; 5IXF A; 1OV3 A; 5IH2 A; 3EG3 A; 2L3P A; 2CH4 A; 1JEG A; 1U06 A; 1ABQ A; 4KRT A; 2O2O A; 2BZY A; 1UUE A; 2GTO A; 4JJC A; 1YWO A; 3QWY A; 2KXD A; 2KT8 A; 2RQW A; 5GJW B; 5FW9 A; 2CT4 A; 2EGA A; 2KRS A; 1NEB A; 2RNA A; 2ENM A; 2YSQ A; 1Y0M A; 4Z89 A; 2K9G A; 4JJD A; 2L3S A; 4F17 A; 2DM1 A; 1W6X A; 1JXM A; 3KFV A; 5EC7 A; 3QWX X; 1TUD A; 3NPF A; 2G6F X; 1E6H A; 1AEY A; 2KT1 A; 3PVL A; 1SRM A; 1ZSG A; 5I11 A; 1JO8 A; 2DMO A; 3REB B; 2AZS A; 1X2Q A; 1IO6 A; 2KXC A; 4D8K A; 3THK A; 2HEQ A; 3VS5 A; 1WDX A; 1M30 A; 2A37 A; 2OAW A; 1AOJ A; 3REA B; 4RUG A; 2EYW A; 3GBQ A; 2KRM A; 1QKX A; 1U3O A; 1UG1 A; 2CDT A; 4J9D A; 2MOX A; 1CKA A; 2BZ8 A; 4Z8A A; 1K0X A; 2EVR A; 3NGP A; 2H8H A; 3ZL7 C; 4LN2 A; 1VYT A; 1FYN A; 1NEG A; 4A63 B; 4J9B A; 1E7O A; 1H3H A; 2CT3 A; 2F2X A; 1N5Z A; 3NHN A; 1GFC A; 4RTV A; 3C0C A; 1HSQ A; 2P4R A; 2X3W D; 3M0U A; 4J9H A; 1UTI A; 1AWW A; 4J9C A; 2LCS A; 1J3T A; 2F2V A; 4DEX A; 2KEA A; 1UDL A; 2EYX A; 4AFQ C; 1K76 A; 1SPK A; 1Z9Z A; 4F14 A; 2JS0 A; 1GFD A; 2RPN A; 2C0T A; 2LZ6 B; 2RQT A; 1ZBJ A; 1NG2 A; 2C0O A; 2JS2 A; 2O31 A; 1OPK A; 2LMJ A; 2DF6 A; 5FWC A; 1YWP A; 4LUE A; 2EGC A; 1ZX6 A; 2J06 A; 2K79 A; 3I5R A; 2A08 A; 4RTU A; 3H0H A; 2NUZ A; 3VS2 A; 1WFW A; 2AK5 A; 1A0N B; 1YNZ A; 4JZ3 A; 4Y92 A; 2F2W A; 2J6F A; 1ZLM A; 4J9F A; 4ORZ A; 2GTJ A; 1ABO A; 3EG2 A; 2EGE A; 1QWE A; 3M0T A; 3H41 A; 1K4U S; 2EPD A; 2GBQ A; 4IIM A; 1M27 C; 2JT4 A; 2GGR A; 2EYY A; 1WX6 A; 3UF4 A; 2CSQ A; 1OOT A; 2CUD A; 2LP5 A; 1ARK A; 1AWX A; 2GQI A; 2ED1 A; 4HCK A; 1WLP B; 2J6O A; 4ZNX A; 5L23 A; 1T3L A; 2LQN A; 2DA9 A; 1X2K A; 1I07 A; 1GBQ A; 2VWF A; 1UJY A; 1EFN A; 1JQQ A; 4GLM A; 2B86 A; 4R0K A; 1OPL A; 1WYX A; 4J9G A; 1SEM A; 2K7A A; 2RF0 A; 1I0C A; 3IQL A; 2FG0 A; 2JW4 A; 1K0S A; 2L0A A; 2V1Q A; 3EHQ A; 1ZUU A; 3FJ5 A; 2BZX A; 3A98 A; 4WCI A; 3VS1 A; 3UA7 A; 2CUB A; 1E6G A; 4RTT A; 1UE9 A; 1U5S A; 1KSW A; 4OMQ A; 1X27 A; 1AVZ C; 1YP5 A; 3TSW A; 2DL4 A; 2AKK A; 1TUC A; 1PHT A; 3R6N A; 4OMM A; 5IHI A; 1PKT A; 1X43 A; 3ULR B; 1JXO A; 1MV0 B; 2EYZ A; 1H8K A; 2I0N A; 3SHW A; 2KGT A; 3PE0 A; 4AG1 C; 2JMC A; 2ABL A; 1X69 A; 3PVQ A; 1NLO C; 3O5Z A; 2FO0 A; 1KIK A; 5HCK A; 2GNC A; 5IHN A; 1NLP C; 1PKS A; 3TVT A; 1UGV A; 1K1Z A; 2EBP A; 2OJ2 A; 1JU5 C; 2QDL A; 2D8H A; 2KNB B; 2HDA A; 2LNH B; 2O9V A; 4LNP A; 1NM7 A; 2LJ1 A; 2DBM A; 5FWB A; 1ZUK A; 3EG1 A; 2J05 A; 4JZ4 A; 2DJQ A; 1V1C A; 1CKB A; 3VS0 A; 1UHF A; 2ED0 A; 2LJ0 A; 1BBZ A; 1PRM C; 1B07 A; 3I9Q A; 2DYB A; 2FRW A; 2W0Z A; 3U23 A; 3EG0 A; 3VRZ A; 2YT6 A; 1WIE A; 4AFZ C; 4CC7 A; 2DL3 A; 4RTY A; 3H0F A; 1GL5 A; 1WA7 A; 3LH5 A; 2JXB A; 1BK2 A; 1FMK A; 1BU1 A; 1RI9 A; 3M0Q A; 4J9I A; 1H92 A; 4RTX A; 1VA7 A; 4LE9 A; 1GCQ C; 1RUW A; 1CSK A; 1OEB A; 1YCS B; 1SRL A; 1RLQ C; 1S1N A; 2PNI A; 1GCQ A; 1G2B A; 4DEY A; 1X6B A; 2ROT A; 1Y57 A; 2L2P A; 2JM9 A; 1KJW A; 1NYF A; 1T0J A; 1WXB A; 4HVW A; 3I5S A; 2YDL A; 1PNJ A; 1W1F A; 2FPD A; 1W70 A; 2AZV A; 2O88 A; 1AZE A; 2LQW A; 4EIK A; 1ZUY A; 1AWJ A; 2ROL A; 3M0S A; 2FPF A; 1MUZ A; 1I1J A; 3VS3 A; 2KR3 A; 5IHK A; 4IIO A; 3UAT A; 2NWM A; 2DNU A; 1KFZ A; 2MIO A; 2CRE A; 1AD5 A; 2KYB A; 1AZG B; 1QKW A; 1PRL C; 2RQV A; 2BTT A; 3NMZ C; 4QT7 A; 1M8M A; 3VS6 A; 1K9A A; 1YN8 A; 3JV3 A; 2MCN A; 1WXU A; 2EKH A; 2RMO A; 2EW3 A; 2VVK A; 1GBR A; 2OI3 A; 2L3Q A; 4HVU A; 5I22 A; 2K2M A; 2XMF A; 2YUO A; 2SEM A; 2D0N A; 2ECZ A; 4CC4 B; 2JM8 A; 1TG0 A; 1QWF A; 2D1X A; 2KRO A; 1SSH A; 4M4Z A; 1SHG A; 2K3B A; 4ESR A; 4JPB W; 2FPE A; 2SRC A; 2M51 A; 4CC3 A; 1X6G A; 2JMA A; 4GBQ A; 2K6D A; 2O9S A; 2AKL A; 1SHF A; 1BB9 A; 2DVJ A; 4X1V A; 1VYV A; 4J9E A; 2KE9 A; 3RNJ A; 3H0I A; 1UJ0 A; 2DBK A; 3TSZ A; 4CC2 A; 1UFF A; 1HD3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4PLI A; 4MMK A; 1RAI B; 4M7A C; 1Q86 U; 2J7I A; 3KBG A; 4F16 A; 2PTK A; 3JB9 H; 5GAO m; 3LX7 A; 4AFU C; 2JTE A; 2NLU A; 2PUO B; 4C92 C; 1VQP A; 3QDR B; 5A0L A; 2FRY A; 2RQR A; 3VUB A; 1QCF A; 4PJO A; 4OMO A; 3VKI A; 3RBB B; 3ME9 A; 2M0Y A; 1WI7 A; 1M8V A; 3OYK A; 1LCK A; 4RG8 A; 2RK1 A; 4RTW A; 1ZA2 B; 1UEC A; 1VYU A; 2EQM A; 4JRQ A; 3A8M B; 4L5G A; 1RAF B; 3EFO B; 3M0R A; 3G6E Q; 3UPU A; 4RTZ A; 5GJV B; 2DL5 A; 3LYI A; 4E7H A; 3CCE A; 1JJ2 A; 3SWN B; 2LJ3 A; 1HJD A; 3MO8 A; 4C0D B; 1C1A A; 2ATC B; 4D8D A; 2E5Q A; 3VYH B; 1B3Q A; 2DLP A; 3JSC A; 2JN0 A; 3VU3 C; 2W10 A; 4UC4 A; 4NL3 A; 4WF2 A; 1OV3 A; 5CVI A; 5IH2 A; 3M57 A; 2F69 A; 1JEG A; 1KHI A; 3T9N A; 1ABQ A; 4ZGD B; 1PM3 A; 3C12 A; 2KXD A; 3MP8 A; 5GJW B; 2NUP A; 2VC8 A; 5GMK m; 3CEY A; 2RNA A; 1I4K 1; 5GAN 8; 1VQN T; 3OS5 A; 2L3S A; 4JJD A; 2DM1 A; 1W6X A; 1K73 C; 2Y90 A; 2LQK A; 1SRM A; 2QEX T; 3TEE A; 2AZS A; 1X2Q A; 2PQW A; 4D8K A; 3THK A; 5GAM j; 3HFO A; 4AT1 B; 3L2R A; 1VQO T; 2A3L A; 3EG9 B; 4M7D A; 1W2B P; 4J9D A; 4EDU A; 1HXD A; 2MOX A; 4KH1 B; 1OZ2 A; 1VQN Q; 2C06 A; 2IG0 A; 1K0X A; 1U1S A; 2E64 A; 5GAN f; 2H8H A; 2QEX Q; 4FL6 A; 2OTL Q; 4DOW A; 4PJO E; 1H3H A; 3R6O A; 4Z02 A; 5KH6 A; 3CPW A; 1KQS A; 2CT3 A; 1XTD A; 1N5Z A; 3NHN A; 1LNX A; 9ATC B; 3CCJ A; 2P4R A; 2VYT A; 4JLG A; 2X4J A; 4OB0 B; 1AWW A; 4M78 D; 3I55 T; 1UDL A; 4AFQ C; 2LX9 A; 1K76 A; 1VQO Q; 2KMT A; 4C0G A; 3PFS A; 1Z9Z A; 4EPC A; 4OP0 A; 4F14 A; 2RPN A; 2C0T A; 4JJN K; 2F1L A; 4PJO B; 2RQT A; 1M90 C; 2C0O A; 2K57 A; 1VQ6 A; 5D6W A; 2ZPH B; 3SDZ A; 4LDV A; 4LUE A; 4EMK C; 2K79 A; 3I5R A; 4Q5W A; 2A08 A; 4OGE A; 5GAN h; 1NJI C; 3CC2 T; 4M7D F; 3RKX A; 3VS2 A; 4XQ3 A; 3E1S A; 3L1A A; 1C6V X; 4C5H A; 3OYG A; 3CCL A; 4N0A A; 3I55 Q; 3L2V A; 1ZLM A; 4PJL A; 3X25 B; 2EKO A; 1ABO A; 4KGZ B; 3CCU Q; 3V8K A; 1FMW A; 2FZK B; 3SB2 A; 3CCM Q; 1YJW A; 3OYF A; 1TSF A; 3UF4 A; 4BDZ A; 1AWX A; 2H3J A; 3C4S A; 4HCK A; 2J6O A; 1KK7 A; 2COZ A; 3P8B B; 3CC2 Q; 1BKB A; 2RK2 A; 1UEB A; 3X20 B; 4GLM A; 3OYN A; 2P0Q A; 3CMA T; 2H3E B; 2X9H A; 1YHQ T; 4R0K A; 1U8R A; 1WYX A; 3QZ9 B; 2HNI A; 2K7A A; 1Y71 A; 2RF0 A; 5LJ3 j; 8AT1 B; 1SG5 A; 2QA4 T; 1V76 A; 2FG0 A; 2NUP B; 1Q82 C; 1X6O A; 4RCC A; 4WCI A; 1TU0 B; 3VS1 A; 1QVG A; 1E6G A; 4A4E A; 4BE1 A; 3NTK A; 1WGS A; 1MMD A; 5GMK h; 3EFS A; 1YJ9 Q; 3LWI A; 1ZSZ C; 2DL4 A; 5AYF A; 2ZPB B; 3L2Q A; 4BD3 A; 2WSE E; 5IHI A; 1X43 A; 3CMA Q; 2HQE A; 3RUX A; 1LOJ A; 3FJP A; 1YHQ Q; 1MV0 B; 1EZZ B; 4HA8 A; 2I0N A; 1OZ3 A; 3PE0 A; 2HMA A; 1X69 A; 3CCR T; 1NLO C; 3O5Z A; 2QA4 Q; 4FSX A; 4ZN3 A; 3QXE B; 5IHN A; 4BE0 A; 2F5T X; 3H8Z A; 3BDL A; 1PKS A; 4KT0 E; 1UGV A; 4M7D B; 4XU0 A; 5KCO A; 3EFR A; 1K1Z A; 4E7J A; 2OJ2 A; 2BKD N; 4M78 A; 2QDL A; 2K5L A; 4C92 D; 3JCM c; 2HDA A; 2E1H A; 2LNH B; 2O9V A; 4J7F A; 4A53 A; 2J05 A; 1CKB A; 1WPY A; 3JB9 D; 4BDY A; 2QG9 B; 2DIG A; 2ED0 A; 1JJ2 P; 1QVF S; 3RKY A; 3CCR Q; 2W0Z A; 3U23 A; 1Q81 R; 1D0X A; 4XAX B; 1WIE A; 2FL7 A; 1YIT T; 4CRI A; 4FYX B; 3JRZ A; 3HL8 A; 4MML A; 1BK2 A; 2RHY A; 1RI9 A; 3M0Q A; 4RG2 A; 4HCZ A; 1GCQ C; 1OEB A; 4PKC C; 2RA2 A; 2JJ9 A; 2X51 A; 5LJ5 e; 2M16 A; 3OW2 S; 2HQH A; 1WXB A; 3QII A; 5GAM e; 4M77 C; 4M78 F; 2IVW A; 2FPD A; 1AZE A; 4M7D G; 2D9T A; 2LQW A; 3P8H A; 1ZUY A; 1JB0 E; 3KUF A; 4NL2 A; 3M0S A; 3OYA A; 2OX7 A; 1M9S A; 2PU9 B; 1YIT Q; 3TCJ A; 2E6N A; 2KR3 A; 5FU6 B; 4ELZ C; 4ZGE B; 2ZCF B; 3QPH A; 1M1K C; 3JV3 A; 2EKH A; 4XTV A; 4F7U E; 4BUG A; 2X4W A; 2Y4Y A; 2DZC A; 5CK9 A; 4PFZ A; 2CZ0 B; 3CC7 T; 4RMO A; 2XMF A; 1VQN A; 1K9M U; 2D0N A; 4CC4 B; 5CAI A; 3L2U A; 1TG0 A; 2EAY A; 2D1X A; 5FU7 B; 2M1H A; 4ESR A; 4II1 A; 2FPE A; 5C6S A; 2M51 A; 1X6G A; 2V8J A; 3PMI A; 3BW1 A; 2AKL A; 4F7U B; 2KE9 A; 3CME T; 2EFI A; 2E4H A; 2XI9 A; 2K4Y A; 1F1B B; 1YI2 T; 5KYY A; 5KCH A; 2DL7 A; 1KQS P; 2VGN A; 3CPW P; 1K8A R; 2EJF A; 2DXU A; 1XOV A; 3UA6 A; 3QZ5 B; 1VQO A; 1N8R R; 1Y7X A; 4M7A A; 2VUB A; 3CC7 Q; 4ZTF A; 3TQ7 P; 6AT1 B; 3DLM A; 2LCC A; 2RH2 A; 4BE2 A; 4JRP A; 2DIQ A; 1D0Y A; 1IGU A; 2YRC A; 3OBY A; 3QJY A; 1TS9 A; 3CXC A; 4FT2 A; 1M3C A; 1BI2 A; 2BE9 B; 4Z88 A; 1KC8 R; 2EQK A; 2JOY A; 1PCX A; 2DL8 A; 2ZPG B; 4JJB A; 4M75 E; 1WHM A; 3CME Q; 2KAF A; 1KD1 C; 4KUD K; 1G83 A; 1M2V A; 2L89 A; 3SEM A; 2X3X D; 4FSS A; 2VKN A; 4OB1 B; 2D8J A; 3I55 A; 2CP6 A; 3QHS A; 2XHC A; 5D6Y A; 2EQI A; 4EMH A; 4JS4 A; 1Q86 R; 2DTO A; 2KK4 A; 3M56 A; 4M75 B; 2RI3 A; 3HP9 A; 5LJ3 e; 5A2Q E; 5DLO A; 3LGL A; 3GNG A; 2A28 A; 3BE3 A; 1NPP A; 1T0H A; 5IXB A; 3BFM A; 2DK3 A; 3G4S T; 5CCA A; 1QLY A; 1BCO A; 1SF9 A; 2CSI A; 1I81 A; 1Z9Q A; 3ASK A; 4C92 F; 4HCC A; 2L3P A; 5LL6 S; 5FRN A; 2CP7 A; 2CH4 A; 2QTX A; 4IUQ A; 2O2O A; 2BZY A; 2GTO A; 3BDU A; 3QWY A; 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