The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
59
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structure length |
59
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Chain Sequence |
VTLFVALYDYEAITEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
SH3 domain specificity
rcsb |
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Fyn
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| total genus |
11
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| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-04-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2M51 A; 1OPK A; 5ECA A; 1RLP C; 1W6X A; 2L2P A; 1TUC A; 4GLM A; 1AD5 A; 5IXF A; 1K4U S; 2H8H A; 2OI3 A; 1I1J A; 3VS0 A; 2GTO A; 3EHR A; 4Z89 A; 3QWY A; 4LN2 A; 3NPF A; 1WX6 A; 2KRM A; 3H0H A; 3M0P A; 1VA7 A; 4CC2 A; 1ARK A; 1QLY A; 2F2V A; 2V1R A; 2DF6 A; 2HCK A; 2IIM A; 2BTT A; 1WXU A; 2A08 A; 2KYB A; 2HDA A; 2AK5 A; 4J9G A; 4J9C A; 2EYZ A; 3PVL A; 1AWO A; 1X2K A; 2K7A A; 2VWF A; 4CC7 A; 2JS2 A; 3I9Q A; 1SRL A; 2PTK A; 1UJY A; 1U5S A; 3SEM A; 1NYF A; 2K3B A; 2RMO A; 2CUD A; 1U06 A; 1ZLM A; 2NUZ A; 4JJB A; 4LUD A; 3KFV A; 4JJC A; 2LQW A; 1QWF A; 4A63 B; 3RNJ A; 1RI9 A; 2VVK A; 2EKH A; 1E6H A; 1LCK A; 2ED0 A; 1PHT A; 1X6G A; 4F17 A; 2CUB A; 2E5K A; 3UAT A; 1N5Z A; 2EGA A; 3JV3 A; 2DLP A; 1UG1 A; 2FRW A; 1GRI A; 2DBM A; 5FWB A; 1ZX6 A; 1KSW A; 3QWX X; 2XMF A; 4E6R A; 2DYB A; 1E6G A; 3TSZ A; 5L23 A; 2W0Z A; 5HCK A; 2CT3 A; 4J9I A; 1AVZ C; 4ESR A; 2LZ6 B; 2NWM A; 2V1Q A; 4Z88 A; 2LP5 A; 3EG2 A; 3M0R A; 1JU5 C; 4LNP A; 1QKW A; 2D0N A; 1XOV A; 2ED1 A; 4FSS A; 2RQW A; 1WIE A; 1AWW A; 1JEG A; 1GCQ C; 2QDL A; 1HD3 A; 2KBT A; 2K79 A; 1M3A A; 2GBQ A; 1UJ0 A; 2GTJ A; 2MIO A; 3NGP A; 4RTZ A; 4HVU A; 4OMQ A; 1OPL A; 2CT4 A; 2JTE A; 2O9V A; 2PZ1 A; 2C0I A; 1M27 C; 2KT1 A; 2KRO A; 1T3S A; 1SEM A; 2O88 A; 4OMP A; 2YDL A; 2YT6 A; 4F16 A; 3M0T A; 2FPD A; 2EYW A; 2ECZ A; 4Y92 A; 4KRT A; 1T0H A; 2KE9 A; 3I35 A; 2I0N A; 2J06 A; 3TVT A; 1B07 A; 1GFC A; 1I0C A; 1X27 A; 2EYX A; 3RBB B; 1OV3 A; 1AEY A; 2AZS A; 1UHC A; 2F2X A; 1MV0 B; 1K9A A; 2EPD A; 4ORZ A; 1HJD A; 2HSP A; 2M0Y A; 4RTX A; 3UA6 A; 2BZX A; 1YP5 A; 1WLP B; 1UUE A; 3H41 A; 2DA9 A; 3EGU A; 1G83 A; 1OEB A; 1WFW A; 4GBQ A; 1GBR A; 1KFZ A; 1GFD A; 1AOJ A; 1JXO A; 1QWE A; 4HVV A; 2RNA A; 3LH5 A; 1GBQ A; 4D8D A; 1AWX A; 1Z9Z A; 1ABQ A; 3PE0 A; 1AWJ A; 2CSI A; 2DL5 A; 2VKN A; 1NG2 A; 3VS4 A; 2DL8 A; 2LJ1 A; 2D1X A; 2DVJ A; 3VS5 A; 1SPK A; 1WYX A; 2YUQ A; 1WDX A; 2KT8 A; 2FO0 A; 2RN8 A; 4RTU A; 3H0I A; 2FPE A; 4QT7 A; 2A28 A; 1SHG A; 2CH4 A; 2EVR A; 2FG0 A; 2KYM A; 4M4Z A; 4HXJ A; 5EC7 A; 2PNI A; 2ENM A; 1M30 A; 1FMK A; 2DM1 A; 2OAW A; 5I11 A; 3NMZ C; 1MV3 A; 4DEX A; 2EQI A; 2J6F A; 2KRS A; 2DL3 A; 1ABO A; 1PKS A; 1G2B A; 2JMA A; 1ZUY A; 4J9B A; 1NYG A; 2JM8 A; 1YN8 A; 4EIK A; 4LUE A; 1SRM A; 1X2Q A; 1NEB A; 3CQT A; 2DJQ A; 3THK A; 4OMO A; 2ABL A; 3VS7 A; 1M3B A; 2B86 A; 2DE0 X; 1JO8 A; 2JW4 A; 4F14 A; 4OMN A; 1W70 A; 2GQI A; 1CSK A; 3UF4 A; 5IXB A; 2CDT A; 3IQL A; 2MOX A; 3A98 A; 3EHQ A; 2LNH B; 1U3O A; 1MUZ A; 2JS0 A; 1HSQ A; 5IHI A; 2A37 A; 1GCQ A; 2EW3 A; 1BU1 A; 1UEC A; 5FWC A; 3GBQ A; 2D8J A; 4RTW A; 2RPN A; 3EG0 A; 1M8M A; 1J3T A; 2DX1 A; 2KXC A; 3VS3 A; 2FRY A; 2F2W A; 1PNJ A; 1H92 A; 1I07 A; 1OOT A; 1WXT A; 4J9F A; 2G6F X; 4JJD A; 1T0J A; 1Y0M A; 3REA B; 2AZV A; 2CRE A; 2KEA A; 2JM9 A; 3I5R A; 4Z8A A; 4AFZ C; 2J7I A; 2O9S A; 1YCS B; 3ULR B; 4RTY A; 2J6O A; 1RUW A; 5GJV B; 1ZUK A; 2X3W D; 4OML A; 1H8K A; 2LQN A; 4R0K A; 3M0S A; 3VS2 A; 3VRZ A; 1TG0 A; 5FW9 A; 4IIO A; 1KIK A; 4ZNX A; 2CSQ A; 4AFQ C; 4JZ4 A; 1AZG B; 1K76 A; 2JXB A; 1V1C A; 4HCK A; 1BK2 A; 4AFS C; 2KNB B; 2L3P A; 2O2O A; 2L3S A; 3FJ5 A; 1WA7 A; 3ZL7 C; 2KRN A; 2LJ3 A; 1JQQ A; 2SRC A; 2JMC A; 3R6N A; 1AZE A; 2KGT A; 3PVQ A; 4K11 A; 3EG1 A; 1PRL C; 1JXM A; 2AKL A; 1K0X A; 1BBZ A; 2C0O A; 2ROL A; 4J9D A; 3U23 A; 2EYY A; 2RQV A; 1PKT A; 2BZY A; 2DRK A; 4RUG A; 1EFN A; 2LX7 A; 1VYV A; 2AKK A; 2OJ2 A; 2DBK A; 1Z9Q A; 2HEQ A; 2RQR A; 5GJW B; 1KJW A; 2K2M A; 3TSW A; 5IH2 A; 2CH4 W; 1PWT A; 1WI7 A; 3SHW A; 2KXD A; 1H3H A; 2GNC A; 2HBW A; 3VS6 A; 4AFU C; 1X69 A; 3UA7 A; 2BZ8 A; 3NHN A; 2X3X D; 1RLQ C; 2FPF A; 2J05 A; 1QCF A; 1TUD A; 1YWP A; 1B3Q A; 1QKX A; 2C0T A; 1NLP C; 1K1Z A; 1X43 A; 2EBP A; 2RF0 A; 1UDL A; 3C0C A; 4D8K A; 1NM7 A; 2MCN A; 2LMJ A; 2W10 A; 1SSH A; 1T3L A; 1UFF A; 1W1F A; 1ZUU A; 2DMO A; 1E7O A; 2L3Q A; 1YNZ A; 2O31 A; 1BB9 A; 2DRM A; 2EGE A; 1A0N B; 1ZBJ A; 2YUN A; 1GL5 A; 5IHN A; 1CKB A; 4HVW A; 1S1N A; 4DEY A; 1ZSG A; 2RQU A; 3H0F A; 4IIM A; 2ROT A; 1VYU A; 1NEG A; 4CC3 A; 5I22 A; 2YUP A; 2FEI A; 2KR3 A; 1CKA A; 1X6B A; 2ESW A; 4JZ3 A; 4CC4 B; 2SEM A; 3I5S A; 1UHF A; 1YWO A; 1GCP A; 3O5Z A; 2J6K A; 2YSQ A; 4RTT A; 1WXB A; 1M3C A; 1SHF A; 2DIL A; 2RQT A; 3VRY A; 3M0Q A; 4J9H A; 4RTV A; 2DL7 A; 4JPB W; 1VYT A; 2DNU A; 4LE9 A; 1FYN A; 2D8H A; 3VS1 A; 2A36 A; 2GGR A; 3M0U A; 1NLO C; 2DL4 A; 4WCI A; 3REB B; 5IHK A; 2L0A A; 1UE9 A; 2JT4 A; 1PRM C; 2LCS A; 2K9G A; 2YUO A; 1IO6 A; 1UGV A; 2K6D A; 4OMM A; 1Y57 A; 2LJ0 A; 2EGC A; 2P4R A; 4X1V A; 1UTI A; 4AG1 C; 3EG3 A; 4AG2 C; 1K0S A; 4J9E A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2M51 A; 5ECA A; 2LT1 A; 1Q81 C; 1VOM A; 5KYY A; 1M5Q 1; 1RLP C; 3EAE A; 3OS2 A; 5KYU A; 1YHQ A; 2YLC A; 4LDX A; 2PU9 B; 1ZHI A; 2KSS A; 3PFS A; 4Z89 A; 3RKY A; 3QWY A; 3H0H A; 3BDL A; 1U1S A; 2GFA A; 4FL6 A; 3HSB A; 1VA7 A; 1VQ4 T; 2RJD A; 4JS5 A; 2D0Q B; 1TWB A; 2V1R A; 2DF6 A; 1HK9 A; 5CKF A; 3CCQ T; 1BIA A; 2JVV A; 2EYZ A; 3NTK A; 4QVD A; 1RAB B; 3L2W A; 4CC7 A; 3L1A A; 3CPW P; 4FIB A; 1QVF P; 4E7I A; 1SRL A; 3S3M A; 3V8L A; 1QVG S; 4C8Q A; 2NUZ A; 2YXY A; 4M77 D; 4A4H A; 4JJC A; 2LQW A; 5LJ3 e; 1VQM Q; 5CKB A; 5GMK j; 2OTJ Q; 1QWF A; 4A63 B; 1RI9 A; 2BKD N; 2QEX A; 1E6H A; 1PHT A; 1X6G A; 4M77 E; 4F17 A; 2CUB A; 2E4H A; 5LJ3 j; 3UAT A; 4XU0 A; 3VYG A; 1YIT Q; 1RL2 A; 5GAN 3; 1UG1 A; 2KDS A; 1ZX6 A; 4F7U G; 2V8K A; 2DYB A; 2K5L A; 3EGX A; 2KY9 A; 5GAM f; 5L23 A; 2RJC A; 5HCK A; 1BIB A; 3CC4 Q; 1G5V A; 4ESR A; 2P4T A; 5I2S A; 5GMK h; 2QA4 T; 3M0R A; 4BAC A; 2D0N A; 2ED1 A; 5LJ3 h; 5LJ5 e; 2DJZ A; 1D0X A; 3NTH A; 3V7C A; 2QDL A; 3RMQ A; 2DXT A; 1YJW Q; 2FB7 A; 3R6O A; 1I81 A; 1M1K R; 3L2Q A; 3M59 A; 4C5E A; 4OMQ A; 1OPL A; 5GAN g; 2KRO A; 2IG0 A; 4OGC A; 1VQN Q; 1SEM A; 3G1J A; 4OMP A; 1NJI R; 4FU6 A; 4DOV A; 2DPP B; 2Y4X A; 3EG9 A; 3HPW A; 3TVT A; 1W2B S; 1I0C A; 5CAI A; 5LJ5 h; 1OV3 A; 1JJ2 S; 2X4X A; 2E10 A; 1KC8 C; 3M57 A; 1YJ9 T; 2HD0 A; 4ORZ A; 4Q5W A; 4A4G A; 2F69 A; 1WLP B; 1WJS A; 2EWN A; 5FRO A; 2DTO A; 3H41 A; 1NPR A; 5GAN 6; 4NOY A; 2DA9 A; 3H6Z A; 4GBQ A; 1K8A U; 1IHV A; 1C1A A; 2JNG A; 2RNA A; 3LH5 A; 3UWN A; 4BY6 B; 2XD0 A; 4D8D A; 3VUB A; 3G7Z A; 1IHW A; 3PE0 A; 4M78 G; 3I55 Q; 1M90 U; 2CSI A; 3JAM E; 4M77 G; 3EH1 A; 1Y96 B; 2NLU A; 2DVJ A; 2OX7 A; 3MPU B; 5A0L A; 2F5T X; 1YJ9 A; 4RCB A; 2KT8 A; 2FO0 A; 2RN8 A; 5KYX B; 5CQY A; 1Y07 A; 1YIJ Q; 4RTU A; 3OYF A; 2FPE A; 4LD6 A; 3CBO A; 1SHG A; 2CH4 A; 4C0Z A; 4KBM B; 2QQS A; 3BFM A; 1VQK Q; 2RHY A; 3FLG A; 4DBH A; 4XTW A; 1BKB A; 3CCJ Q; 1YI2 Q; 3HP9 A; 4JRK A; 3OYC A; 2KK4 A; 1PC0 A; 2KQW A; 3SFM A; 4R56 A; 1MV3 A; 4WF2 A; 4PJO F; 2J6F A; 1VQL A; 3JCM W; 1N8R U; 5KYN A; 3L2U A; 1OQK A; 1M8V A; 1RAG B; 1S72 Q; 3CC2 T; 2DAQ A; 2MMP A; 3SD4 A; 3PIO A; 1NYG A; 4EIK A; 2A7Y A; 2QI2 A; 1NEB A; 4M78 C; 3CQT A; 3LW5 E; 2DJQ A; 2DTI A; 2RB6 A; 4OMO A; 2ABL A; 3VS7 A; 2MWO A; 3MET A; 4M77 C; 4NL3 A; 4OMN A; 1QVF A; 2X4Y A; 1H3Z A; 4ZN1 A; 1Y96 A; 5GAO p; 2LNH B; 4C0D B; 1JRI A; 1OZ3 A; 4OMF B; 3UT1 A; 5KYX A; 1R77 A; 4ZTF A; 1FXX A; 1KD1 R; 1GCQ A; 1PCX A; 4M7A F; 2CP6 A; 3M54 A; 3EG0 A; 1J3T A; 2DX1 A; 2KXC A; 3VS3 A; 2F2W A; 1PNJ A; 3CBM A; 4IUU A; 3KBG A; 1I5O B; 3TU4 K; 2YLB A; 1KQS S; 3CCM A; 4JJD A; 5GAM e; 5C6S A; 2AZV A; 4BDY A; 3OYD A; 5GAM j; 5KYW B; 2EJ9 A; 4RTY A; 1XJW B; 2R5A A; 1YIT T; 2GFU A; 5CO7 A; 3M9Q A; 3DLL A; 1SSF A; 4J6W A; 5L8R E; 3EFS A; 4D6W A; 1TG0 A; 1WHJ A; 5FW9 A; 4IIO A; 1FMW A; 3PMI A; 5CVI A; 3CC4 T; 2DET A; 1QCN A; 3ER0 A; 1N6A A; 1K76 A; 1V1C A; 4HCK A; 4Z02 A; 1D1C A; 4C5I A; 2RI3 A; 1WHK A; 5GAM h; 2O2O A; 3ZL7 C; 1Q86 R; 2SRC A; 1K73 R; 2AHJ B; 2EQM A; 1I5L A; 5DY9 A; 3MP6 A; 2QGG A; 3E1S A; 2PUK B; 3R6N A; 4N4H A; 2HSE B; 1JBM A; 3I56 Q; 2JJ9 A; 1PRL C; 3EG1 A; 1BBZ A; 2ROL A; 2WAC A; 3U23 A; 1PSE A; 3MHX A; 2DRK A; 3HL8 A; 1EFN A; 1VYV A; 2OJ2 A; 1IGQ A; 2HEQ A; 1VQN T; 3PT9 A; 1KJW A; 3FB9 A; 2C06 A; 3CME A; 3TSW A; 2KVQ G; 2CH4 W; 4EMK C; 3OYM A; 4HCB A; 1Q7Y R; 2GNC A; 1N27 A; 3MEA A; 2QQB A; 3UA7 A; 1XTD A; 3NHN A; 3S3O A; 2X3X D; 2BUD A; 2J05 A; 3OW2 A; 1QKX A; 2C0T A; 1X43 A; 1UDL A; 5D6X A; 4X9C A; 1SSH A; 4J6Y A; 2RH2 A; 2P84 A; 2L3Q A; 2O31 A; 1A0N B; 5GMK l; 5IHN A; 2XDP A; 2YWW A; 2RHZ A; 4CRI A; 2CS7 A; 2Y90 A; 2DEQ A; 2K3Y A; 1WHH A; 5IN1 A; 5GAN 8; 2YUP A; 4E7J A; 2EIF A; 2KR3 A; 2QEX Q; 1G3T A; 1VQ8 A; 3O5Z A; 2YSQ A; 4LD9 K; 4C92 B; 4BE0 A; 4Y91 A; 4XU3 A; 4BB7 A; 3MJX A; 2E5Q A; 3BW1 A; 1QP3 A; 4RTV A; 1YIJ T; 3QUI A; 1FYN A; 2GGR A; 2CP7 A; 1NLO C; 4QVC A; 2L0A A; 2YUO A; 2FHD A; 4DA4 A; 2K6D A; 2MYS A; 3VKI A; 3JCM P; 4X1V A; 1BCO A; 4F7U A; 3OB9 A; 2RA2 A; 3QJY A; 4FM4 B; 3P8H A; 4J7F A; 1W6X A; 4VUB A; 5IXF A; 2E6N A; 1S72 T; 1I1J A; 3EHR A; 4EPC A; 2KRM A; 3Q1J A; 2DZ9 A; 1RAF B; 3CMA Q; 3OA6 A; 2HCK A; 2IIM A; 4M77 B; 1KG1 A; 5AT1 B; 1WXU A; 4J9C A; 3PVL A; 4C92 A; 2K7A A; 5LJ5 f; 4KT0 E; 3FC3 A; 2LDM A; 1UJY A; 5KCO A; 4QW2 A; 4LDU A; 4MZP A; 4QKU A; 2CUD A; 1O9S A; 2LT4 A; 2VAS A; 3O8V A; 1Q95 G; 1K9M U; 2KAF A; 5LJ3 d; 2MI6 A; 4XQ3 A; 2HKN A; 1X6O A; 5KCH A; 3VUZ A; 3FDR A; 1N5Z A; 1QVP A; 1WHL A; 1K8A C; 2DLP A; 4AMC A; 2FRW A; 2D9T A; 1IGU A; 2DER A; 4PJO D; 4O5V A; 3G4S Q; 1MMA A; 1KSW A; 4XTY A; 3G71 Q; 2XMF A; 4BY6 C; 1M90 C; 3N5B B; 2DD5 A; 1NZ9 A; 4FYY B; 3D7S B; 2W0Z A; 4PJO E; 4J9I A; 1AVZ C; 2CYZ B; 2NWM A; 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