The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
SAEGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRKKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural studies of the phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) SH3 domain in complex with a peptide ligand: role of the anchor residue in ligand binding.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha
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| total genus |
25
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| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-07-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CH4 A; 3PVL A; 2BZY A; 2O88 A; 2YUQ A; 4IIO A; 1UG1 A; 4HXJ A; 1AWW A; 2FO0 A; 2VVK A; 4A63 B; 1PKS A; 2EGA A; 1ZBJ A; 1H8K A; 3O5Z A; 2V1R A; 3THK A; 2CT4 A; 1I07 A; 1AZG B; 2RF0 A; 2QDL A; 4HVV A; 2HDA A; 2A36 A; 4K11 A; 2K7A A; 3GBQ A; 1MUZ A; 1WXU A; 2DRM A; 5I22 A; 4OMN A; 1ZUU A; 2KRN A; 3EG0 A; 3RNJ A; 4F17 A; 4AG2 C; 1H92 A; 2PZ1 A; 4Z89 A; 4J9F A; 5IXB A; 1KIK A; 2GGR A; 2J05 A; 2FG0 A; 4M4Z A; 1M30 A; 4J9D A; 2LJ0 A; 2A08 A; 2KT8 A; 1OPK A; 4WCI A; 1GCQ C; 3EG1 A; 2VKN A; 2CRE A; 2KYB A; 2M51 A; 2JT4 A; 2LP5 A; 4RUG A; 2HCK A; 1UHF A; 2RQV A; 4OML A; 1X27 A; 4JPB W; 1IO6 A; 1M8M A; 2O2O A; 4HVU A; 1NEG A; 1JQQ A; 1JXM A; 1JO8 A; 1UE9 A; 2GTJ A; 2O9S A; 1WXB A; 2YUN A; 1N5Z A; 1ABQ A; 1V1C A; 2D0N A; 3EHQ A; 4DEY A; 1ABO A; 1EFN A; 2EQI A; 4ESR A; 2X3X D; 2O31 A; 2KRO A; 1YN8 A; 2LMJ A; 5I11 A; 1W1F A; 1PRL C; 1FMK A; 2RQT A; 1RLQ C; 3M0Q A; 4AFU C; 2EGE A; 2MIO A; 2NWM A; 3H0F A; 1Z9Z A; 2A37 A; 2KGT A; 5FWB A; 1ZX6 A; 2JXB A; 3M0P A; 2KE9 A; 1NEB A; 2J6K A; 3TSW A; 1UUE A; 4LNP A; 2RMO A; 2AK5 A; 1PKT A; 1OV3 A; 2ED0 A; 3H0I A; 1JU5 C; 2DYB A; 3VRZ A; 4HCK A; 1WIE A; 4EIK A; 2DMO A; 4CC4 B; 1NLO C; 2KBT A; 2L2P A; 3VRY A; 2D1X A; 3ZL7 C; 3ULR B; 2C0I A; 4D8D A; 2ROT A; 1U5S A; 4CC3 A; 2PNI A; 2AKL A; 1SHF A; 1YWO A; 3REA B; 2IIM A; 2DL4 A; 1JXO A; 2DRK A; 2VWF A; 2W10 A; 2OI3 A; 1B07 A; 1GRI A; 2KEA A; 4LUD A; 1KJW A; 2FPD A; 2JMA A; 1G2B A; 2X3W D; 5IHI A; 1T3L A; 3NMZ C; 1ZUK A; 2M0Y A; 1AWJ A; 1X6G A; 3R6N A; 3QWY A; 1PRM C; 3VS1 A; 2LNH B; 2YUP A; 2KYM A; 3EGU A; 4R0K A; 4CC7 A; 1GL5 A; 2KT1 A; 2ENM A; 1AWO A; 1G83 A; 1HSQ A; 1SEM A; 2HBW A; 1RI9 A; 2W0Z A; 1OOT A; 5FW9 A; 1UFF A; 2B86 A; 4RTV A; 1YNZ A; 2RPN A; 2JM9 A; 4OMO A; 2H8H A; 3FJ5 A; 1I1J A; 3H41 A; 4J9I A; 3I9Q A; 2EPD A; 1UTI A; 2F2X A; 3A98 A; 2A28 A; 1WYX A; 2C0T A; 1MV3 A; 1SRM A; 1AZE A; 1W6X A; 1HJD A; 3M0T A; 1K4U S; 2DM1 A; 4X1V A; 1UHC A; 4OMQ A; 5IH2 A; 2RQR A; 1QWE A; 4GBQ A; 2DIL A; 1CKA A; 4F16 A; 2AKK A; 2EYW A; 3I5R A; 3VS2 A; 5IHN A; 2DL3 A; 1AWX A; 1LCK A; 1SPK A; 4J9C A; 2CSQ A; 3EG2 A; 1GCQ A; 4F14 A; 2K2M A; 2YDL A; 2AZV A; 4HVW A; 1QKX A; 1NYF A; 3I35 A; 5GJW B; 3RBB B; 2L3S A; 1SHG A; 2DVJ A; 2DJQ A; 5ECA A; 2KRM A; 2DBM A; 3KFV A; 4OMP A; 2HEQ A; 1M3B A; 1GBR A; 1PWT A; 2F2W A; 1NM7 A; 3UF4 A; 1WDX A; 2EYX A; 3LH5 A; 2RN8 A; 4RTT A; 2D8H A; 1PNJ A; 1W70 A; 2J6O A; 1S1N A; 2V1Q A; 4QT7 A; 4ORZ A; 1PHT A; 1UEC A; 4JJC A; 1E6G A; 2JM8 A; 1ZLM A; 2ROL A; 2YSQ A; 1SSH A; 2FRW A; 4KRT A; 3M0S A; 3NHN A; 1AOJ A; 2L0A A; 5IHK A; 2C0O A; 1GFD A; 2LJ1 A; 2DA9 A; 1QLY A; 2F2V A; 1Y57 A; 1HD3 A; 3NGP A; 2DLP A; 3JV3 A; 1RLP C; 2PTK A; 2LJ3 A; 3IQL A; 3PVQ A; 1BBZ A; 1WX6 A; 1BU1 A; 4OMM A; 1UJ0 A; 2AZS A; 2K9G A; 1U06 A; 2DL8 A; 1XOV A; 2KXD A; 2LZ6 B; 1B3Q A; 3NPF A; 4LN2 A; 1GCP A; 4J9B A; 1QKW A; 2EVR A; 1J3T A; 1M27 C; 5GJV B; 3VS0 A; 3SEM A; 1TUC A; 1X2K A; 4IIM A; 2K6D A; 1ZUY A; 1QWF A; 1K1Z A; 1Z9Q A; 1AEY A; 1M3A A; 2DBK A; 2GNC A; 1FYN A; 1K76 A; 2FPE A; 2DNU A; 2E5K A; 3QWX X; 3H0H A; 3EHR A; 2CT3 A; 1T0H A; 2CUD A; 4RTZ A; 1OEB A; 2FRY A; 1CSK A; 2RQU A; 1VA7 A; 4RTX A; 1KFZ A; 2NUZ A; 4J9H A; 2I0N A; 2DL5 A; 1KSW A; 3I5S A; 4AFS C; 2YUO A; 2SEM A; 4FSS A; 4LUE A; 3VS5 A; 4Z88 A; 2BZ8 A; 2DE0 X; 1VYT A; 1JEG A; 4GLM A; 1YWP A; 1A0N B; 1X43 A; 3EG3 A; 2KNB B; 4E6R A; 1CKB A; 2LCS A; 3REB B; 1Y0M A; 1SRL A; 4Z8A A; 1WI7 A; 1UDL A; 3UAT A; 1T3S A; 4JJB A; 3TSZ A; 1NLP C; 2J06 A; 4JJD A; 2K79 A; 2K3B A; 3SHW A; 1QCF A; 2MOX A; 2HSP A; 2RNA A; 1ARK A; 2ESW A; 2LX7 A; 4JZ4 A; 3PE0 A; 2EGC A; 3M0R A; 1NYG A; 1AVZ C; 1X6B A; 2CUB A; 2L3Q A; 5EC7 A; 1X69 A; 2D8J A; 2EW3 A; 1AD5 A; 1BB9 A; 3VS3 A; 2EBP A; 1YP5 A; 4D8K A; 2KRS A; 4Y92 A; 3TVT A; 1WLP B; 2DL7 A; 2GBQ A; 2JTE A; 1WA7 A; 2MCN A; 2CH4 W; 2FEI A; 4AFZ C; 2OJ2 A; 1NG2 A; 1ZSG A; 5FWC A; 1UJY A; 2GQI A; 1E7O A; 4RTU A; 1UGV A; 2JMC A; 1YCS B; 2ECZ A; 1X2Q A; 2LQW A; 4J9G A; 4DEX A; 3UA7 A; 3C0C A; 2BZX A; 5L23 A; 2EKH A; 3M0U A; 2JW4 A; 2LQN A; 2FPF A; 4J9E A; 2L3P A; 1RUW A; 4RTY A; 2YT6 A; 2EYY A; 1VYU A; 1H3H A; 1K9A A; 1K0X A; 4ZNX A; 1T0J A; 1TG0 A; 2J7I A; 1K0S A; 2P4R A; 3VS7 A; 1WFW A; 2BTT A; 4AFQ C; 4RTW A; 5HCK A; 1GFC A; 2RQW A; 3UA6 A; 2EYZ A; 1VYV A; 2CSI A; 3CQT A; 2SRC A; 3U23 A; 1OPL A; 4CC2 A; 2CDT A; 2DX1 A; 4LE9 A; 1I0C A; 2KXC A; 2KR3 A; 5IXF A; 2DF6 A; 1U3O A; 4JZ3 A; 2J6F A; 3VS6 A; 2O9V A; 2JS2 A; 1BK2 A; 1TUD A; 1M3C A; 1MV0 B; 4AG1 C; 1GBQ A; 3VS4 A; 1E6H A; 2ED1 A; 2OAW A; 1WXT A; 2JS0 A; 2GTO A; 2G6F X; 2ABL A; 2XMF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3PVL A; 3FIF A; 2RHU A; 2O88 A; 4KBM B; 2YUQ A; 4IIO A; 4C0G A; 1M90 U; 2CZ1 B; 4IUQ A; 2K5L A; 2RI5 A; 1K73 U; 1H8K A; 4Y28 E; 3M5A A; 3RR6 A; 2KMT A; 2PVO B; 1TS9 A; 4C0Z A; 2DD4 A; 2CGH A; 3V8K A; 4BE2 A; 1KHI A; 2K5I A; 3GBQ A; 1YIJ T; 2DRM A; 3WVD B; 5GAN 6; 1FMV A; 1D0Z A; 4ZGD B; 6AT1 B; 4FL6 A; 4HA8 A; 5A0D A; 4F17 A; 3G7Z A; 3UPU A; 4Z89 A; 3OYL A; 5IXB A; 3CCM A; 1ZQ1 A; 1VUB A; 2ZAE A; 4JDS A; 2J05 A; 2FG0 A; 3LW5 E; 4M4Z A; 1M30 A; 4KUI A; 3QYH B; 1BI3 A; 2A08 A; 2QA4 A; 4A4F A; 2KT8 A; 4ZTF A; 1GCQ C; 3G71 Q; 3OYD A; 1YIT T; 2M51 A; 2D0Q B; 4XTY A; 2HCK A; 2E3H A; 5C6S A; 4HVU A; 1JQQ A; 2LQ8 A; 2GTJ A; 2YUN A; 1N9S A; 4D6W A; 2D0N A; 4DEY A; 2XHC A; 3OYY A; 1AT1 B; 1YN8 A; 4XTZ A; 1S72 Q; 1RLQ C; 5CKF A; 1R0B G; 4AFU C; 2EGE A; 3JB9 H; 2EJG A; 5D6W A; 4N0A A; 8ATC B; 1Z9Z A; 3PIP A; 3EH1 A; 2A37 A; 3EGD A; 2RJD A; 3M0P A; 2R57 A; 3CCL Q; 2LVM A; 3E19 A; 3CD6 A; 3EG9 B; 2KE9 A; 1NEB A; 1M8V A; 1QW1 A; 2ED0 A; 1JU5 C; 2LCL A; 1YJN Q; 4II1 A; 4HCK A; 4O5V A; 3ULR B; 1WPY A; 4CC3 A; 4GLK A; 2FVU A; 1M1F A; 1PCX A; 1VQ5 A; 2ZGW A; 4EDU A; 1B07 A; 2KEA A; 4LUD A; 1KJW A; 2X3W D; 1G2B A; 4C92 B; 3NMZ C; 1X6G A; 3BDL A; 2YUP A; 3EFO B; 3EGU A; 5GMK e; 1VQ9 Q; 3ASK A; 1TWB A; 4PJN A; 2KAF A; 1YI2 Q; 1SEM A; 4M75 F; 2RK2 A; 3HPW A; 2M02 A; 4ME7 A; 4RMO A; 3EH2 A; 3CEY A; 2NLU A; 2QQS A; 3P8D A; 4OMO A; 3FJ5 A; 1UGQ B; 4RKU E; 4M7A B; 3H41 A; 1WQ7 A; 1UTI A; 4E7Z A; 4M78 E; 1SRM A; 2KI7 A; 1AZE A; 4B9W A; 3CXC P; 1QQJ A; 4X1V A; 1PG5 B; 4M77 A; 4C92 D; 4E7L A; 4PJO E; 1I81 A; 2ZPF B; 2DIL A; 2QDY B; 3QZ9 B; 4F16 A; 2A7Y A; 1VQK A; 5HKC A; 3C4S A; 4MML A; 5LL6 S; 2FHD A; 1TSF A; 2CSQ A; 3EG2 A; 2IVW A; 2PVG B; 3HHT B; 2M16 A; 3G4S Q; 4E2F B; 2M0O A; 3L2Q A; 2MMP A; 2MF2 A; 1WJR A; 5GAM f; 2OTJ A; 1PM3 A; 2KRM A; 2A3L A; 1B34 A; 4OMP A; 3OYE A; 3LYI A; 1P92 A; 2OX7 A; 2RA2 A; 1NM7 A; 2O4X A; 2LC4 A; 3QG1 A; 4E7H A; 3VYG A; 1NPR A; 4RTT A; 2V1Q A; 4HKE A; 2IG0 A; 1UEC A; 4JJC A; 1VQ4 A; 4ELY C; 4FCY A; 2HKQ B; 3HKS A; 2DK3 A; 3V8L A; 4FYY B; 3QKJ A; 1WZO A; 2C0O A; 1I8F A; 1G3Y A; 2LJ1 A; 2F2V A; 1Y57 A; 1HD3 A; 4DOV A; 1Q81 R; 2BUD A; 1VQ6 T; 1RLP C; 2PTK A; 2LJ3 A; 3IQL A; 5LJ3 e; 1G3T A; 3OMG A; 3SWN C; 2DL8 A; 3G1J A; 4C8Q F; 2XDP A; 3HL8 A; 5GAN 8; 4FYV B; 5GAN e; 1BKB A; 4M7D C; 4HT8 A; 2ZPG B; 3HTR A; 1GCP A; 2EVR A; 4JS5 A; 4F7U G; 2EQK A; 1D0Y A; 1WHK A; 2DYI A; 1KQS P; 1RAE B; 2QXF A; 1RAF B; 2K6D A; 1K1Z A; 5GAN 4; 1Z9Q A; 1M3A A; 2R5A A; 2DBK A; 1M1G A; 2FB7 A; 2GNC A; 5KYN A; 2FPE A; 1V29 B; 2DNU A; 2BIV A; 5KE2 A; 4BE1 A; 5KCO A; 3QWX X; 2BE9 B; 5IT9 E; 2JOY A; 3H0H A; 2DFU A; 2DIG A; 1OEB A; 2E10 A; 2FRY A; 1CSK A; 2DJZ A; 1KFZ A; 2NUZ A; 4NL2 A; 2HKN A; 2YUO A; 1B7T A; 3CCR A; 3OYA A; 3L42 A; 1Q7Y R; 3VS5 A; 3JCM e; 3QJ6 A; 4XK8 E; 2NUP B; 1OUL A; 3CCJ A; 1JEG A; 4GLM A; 1A0N B; 4GY5 A; 2KNB B; 1MGQ A; 1CKB A; 4ZGE B; 2YRV A; 2LCS A; 3CCS A; 4L6V 5; 3AHU A; 3C95 A; 3TSZ A; 2E65 A; 2K3Y A; 1VQ7 A; 4KUD K; 2E3I A; 4JJD A; 3E9F A; 3BFM A; 2E6Z A; 1QCF A; 5GAM j; 2X35 A; 1ARK A; 2RNA A; 2V8I A; 1Q82 U; 3PNW C; 2ESW A; 1ACM B; 1KK7 A; 2G3R A; 3CCU Q; 2EGC A; 1NYG A; 3KUF A; 1X6B A; 2CUB A; 3J81 E; 5IN1 A; 1HXD A; 1AD5 A; 1K73 C; 2EBP A; 2L3R A; 2CP2 A; 1WLP B; 2HL5 C; 4C0D C; 2DL7 A; 3CXC S; 5FLX E; 2QEX T; 3JB9 G; 2OJ2 A; 4A4K A; 5FWC A; 3EG9 A; 2JMC A; 1YCS B; 2MWO A; 1K9M R; 1KD1 R; 4J9G A; 2QGG A; 4BUG A; 4M78 B; 3FEO A; 4M75 C; 4WTO B; 5LJ5 f; 3M0U A; 2QAZ A; 5KYX A; 5GMK h; 4M7D G; 1H64 1; 2C06 A; 4PJO B; 1RUW A; 3A1P A; 4RTY A; 3PFS A; 1XJW B; 1VYU A; 2HSE B; 1K9A A; 3BY7 A; 5D6Y A; 1T0J A; 1YIJ Q; 4C92 A; 2X4X A; 4RTW A; 2XDB A; 2RQW A; 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5I11 A; 1W1F A; 3ME9 A; 3RER A; 2RQT A; 3I55 A; 1YJ9 T; 4HCC A; 7AT1 B; 3M0Q A; 2PVD B; 4KGV B; 3H0F A; 3JCM W; 4J5Y A; 2H3E B; 5FWB A; 1U8R A; 3CME T; 3G6E A; 1UGS B; 2J6K A; 3INZ A; 4BY6 C; 3TSW A; 5DLQ E; 1UUE A; 4A4E A; 1YJW A; 2RMO A; 2AK5 A; 3PMI A; 1OV3 A; 3JCM h; 1YHQ T; 2DER A; 2DYB A; 3VRZ A; 4B6M A; 1PSF A; 1NLO C; 2KBT A; 3VRY A; 2D1X A; 3CCQ A; 2EWN A; 4D8D A; 3CC7 T; 3BDU A; 1U5S A; 3SD4 A; 9ATC B; 3GNF B; 2AKL A; 1SHF A; 3REA B; 2KY9 A; 1JXO A; 2W10 A; 2OI3 A; 1D09 B; 2COZ A; 4KH1 B; 2LNV A; 1T3L A; 2M0Y A; 1AWJ A; 3LH0 A; 4MZT A; 3G6E T; 3JCM P; 4R0K A; 3VV0 A; 3JCM b; 4BDZ A; 4AMC A; 4CC7 A; 1GL5 A; 2KT1 A; 3T9N A; 1G83 A; 1AWO A; 5FU6 B; 2DIQ A; 2LQK A; 4FT2 A; 4DQ2 A; 3PMT A; 3JB9 F; 2W0Z A; 2XG8 D; 2B86 A; 1RAH B; 1YNZ A; 3H6Z A; 3HRU A; 1KC8 C; 3CC2 A; 1EZZ B; 1BCM A; 1I1J A; 1OX8 A; 3MEA A; 3M58 A; 4C8Q G; 4PKC C; 3H8Z A; 2F2X A; 2A28 A; 4XAX B; 4M7D F; 2QYZ A; 1VQ6 Q; 1W6X A; 1HJD A; 1I5L A; 4EMK C; 1UHC A; 1BCO A; 1QWE A; 4GBQ A; 4ZTJ A; 3ER0 A; 1CKA A; 2AKK A; 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