The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
SAEGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRKKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural studies of the phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) SH3 domain in complex with a peptide ligand: role of the anchor residue in ligand binding.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha
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| total genus |
25
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| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-07-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1M30 A; 3VS5 A; 1I0C A; 3R6N A; 4RUG A; 3QWY A; 2NUZ A; 1CKA A; 1NLO C; 1CKB A; 2YDL A; 5FWC A; 2L2P A; 3REA B; 3UA6 A; 1ABO A; 3M0Q A; 5GJV B; 1LCK A; 4JPB W; 4J9H A; 2EPD A; 1VYT A; 2K9G A; 1NYG A; 1UJ0 A; 1YWP A; 5IXB A; 1X6B A; 1FYN A; 1ZUY A; 2O2O A; 1HJD A; 2DVJ A; 3M0S A; 2EYZ A; 2ROT A; 4QT7 A; 2YUN A; 2DL8 A; 1WFW A; 3VRZ A; 2VVK A; 2HDA A; 3KFV A; 2DMO A; 3NPF A; 4F16 A; 1M8M A; 2FPD A; 2RPN A; 4J9G A; 4CC4 B; 2A08 A; 1RI9 A; 1YN8 A; 4X1V A; 1WI7 A; 1QWE A; 2AKK A; 2ROL A; 4LNP A; 1AZE A; 1V1C A; 2CT3 A; 2YUO A; 1WA7 A; 3H41 A; 1QKW A; 3I5R A; 3GBQ A; 1AEY A; 2CSI A; 3VS4 A; 2KNB B; 2ECZ A; 4AFQ C; 1B07 A; 2A37 A; 2FO0 A; 4OMN A; 3CQT A; 5IHK A; 1AWO A; 3VRY A; 1ZUK A; 1AWW A; 2EKH A; 2KT8 A; 2KGT A; 4ZNX A; 4ORZ A; 2KBT A; 2CSQ A; 1AVZ C; 1KJW A; 1QLY A; 1M3C A; 2HEQ A; 3VS3 A; 2ESW A; 4J9B A; 4F17 A; 4FSS A; 4AG1 C; 2KE9 A; 3ULR B; 3PVQ A; 4OMO A; 1UTI A; 2M51 A; 2FPF A; 1QKX A; 1X2K A; 3I35 A; 2YSQ A; 4OML A; 2RMO A; 2BZ8 A; 2D8H A; 2EGE A; 2EYW A; 1OEB A; 3EG3 A; 2KRM A; 2LQN A; 2J6O A; 2D1X A; 2C0O A; 2KYM A; 1Z9Z A; 2AZS A; 4D8D A; 1GBR A; 1T0H A; 4J9E A; 4F14 A; 2VKN A; 1NLP C; 1BB9 A; 3SHW A; 1BK2 A; 2GTJ A; 2LX7 A; 1WXU A; 4K11 A; 4RTT A; 2DE0 X; 4J9D A; 3C0C A; 1BBZ A; 1E7O A; 2YT6 A; 2J05 A; 2JTE A; 2AK5 A; 2DM1 A; 1JXO A; 4HXJ A; 1AOJ A; 4GBQ A; 2DBK A; 1JO8 A; 1H8K A; 2A36 A; 1TUD A; 2DYB A; 4LN2 A; 2JM9 A; 4JJD A; 4Z8A A; 1Y57 A; 1U06 A; 2J06 A; 1PRL C; 2EW3 A; 4RTX A; 2RQU A; 2EQI A; 1QCF A; 3QWX X; 2KYB A; 2KT1 A; 1VYV A; 1UJY A; 2CH4 W; 1YWO A; 1T3L A; 5FW9 A; 1PKS A; 1B3Q A; 3H0F A; 2K6D A; 1RLQ C; 2EGA A; 3ZL7 C; 2LJ3 A; 1ZLM A; 4JJB A; 1T0J A; 2RQW A; 4RTZ A; 1Z9Q A; 4HVU A; 3VS0 A; 1SPK A; 2V1Q A; 1YCS B; 2FPE A; 1KSW A; 3A98 A; 1NM7 A; 3NHN A; 2BZY A; 1UDL A; 1S1N A; 1ZX6 A; 1J3T A; 2L0A A; 2DBM A; 2SEM A; 1U5S A; 4AFU C; 1KFZ A; 1AWX A; 2RQV A; 2LZ6 B; 3I9Q A; 1K0X A; 2RQR A; 2CH4 A; 2GQI A; 2EGC A; 2JXB A; 2FRW A; 1XOV A; 2CT4 A; 4GLM A; 4J9I A; 1GL5 A; 1SHG A; 2FG0 A; 1RUW A; 1WIE A; 2V1R A; 2X3X D; 1NEG A; 3UA7 A; 2GGR A; 5HCK A; 2W0Z A; 1ZBJ A; 2DL3 A; 1WXT A; 2A28 A; 2RQT A; 3VS6 A; 4Z89 A; 2QDL A; 1ARK A; 2MIO A; 2O9S A; 5IHI A; 2J6F A; 1SRM A; 3PVL A; 1X2Q A; 1GCP A; 4AFZ C; 2IIM A; 4DEY A; 1GBQ A; 3RBB B; 1G2B A; 4HCK A; 2LP5 A; 1WXB A; 2LJ1 A; 2BZX A; 2C0I A; 3NMZ C; 1M3B A; 4CC2 A; 2ENM A; 1UUE A; 2HSP A; 3EG2 A; 1UGV A; 2ABL A; 2DL7 A; 2H8H A; 2KEA A; 2KRN A; 1E6G A; 2K79 A; 5IHN A; 5EC7 A; 2L3P A; 3EHQ A; 2JS2 A; 1OV3 A; 2PNI A; 4JZ4 A; 1UHC A; 1UE9 A; 3M0P A; 3TSW A; 4ESR A; 2RNA A; 5IXF A; 1K4U S; 1SSH A; 3M0T A; 1I1J A; 3IQL A; 3EHR A; 1W1F A; 4JJC A; 5I22 A; 2RF0 A; 2FRY A; 2GNC A; 2JMC A; 1SEM A; 5I11 A; 1I07 A; 1A0N B; 1WYX A; 2LCS A; 4CC3 A; 1JEG A; 2CUD A; 2X3W D; 1PHT A; 2AKL A; 2LJ0 A; 1K1Z A; 1ZUU A; 2ED0 A; 4DEX A; 2MOX A; 2CRE A; 1M3A A; 3THK A; 2L3Q A; 3TVT A; 2BTT A; 1NEB A; 1QWF A; 3JV3 A; 4R0K A; 1EFN A; 2KR3 A; 5ECA A; 2F2W A; 2K2M A; 1TUC A; 1WLP B; 1FMK A; 4RTY A; 1SRL A; 1X69 A; 1HD3 A; 2L3S A; 4Z88 A; 2D8J A; 3EG0 A; 4OMM A; 5GJW B; 1H3H A; 3RNJ A; 1NG2 A; 1HSQ A; 2K7A A; 1GFD A; 2KXD A; 1YNZ A; 4LUD A; 2DRM A; 3VS2 A; 2EVR A; 2O31 A; 1W70 A; 2DJQ A; 4LE9 A; 2VWF A; 2YUP A; 3U23 A; 1T3S A; 2LQW A; 3SEM A; 2JW4 A; 2I0N A; 1MV3 A; 1GCQ A; 2DL5 A; 2OI3 A; 2KXC A; 2F2V A; 4RTV A; 1YP5 A; 2AZV A; 4HVW A; 1K76 A; 1N5Z A; 1X6G A; 2EYX A; 1E6H A; 4EIK A; 1PNJ A; 2O88 A; 2JS0 A; 4HVV A; 4KRT A; 4M4Z A; 4OMQ A; 4AG2 C; 4AFS C; 3H0I A; 2GTO A; 1WX6 A; 2EYY A; 1OPL A; 1UFF A; 2LMJ A; 3H0H A; 2ED1 A; 2M0Y A; 3I5S A; 2E5K A; 2W10 A; 3NGP A; 1X27 A; 3VS7 A; 2F2X A; 1K0S A; 1PWT A; 1H92 A; 1AD5 A; 2GBQ A; 1K9A A; 1RLP C; 3EGU A; 3UAT A; 4J9F A; 1CSK A; 1UEC A; 3TSZ A; 2LNH B; 2HCK A; 2MCN A; 1JQQ A; 2DF6 A; 5L23 A; 4OMP A; 1VA7 A; 2O9V A; 1OOT A; 2DRK A; 2DA9 A; 2JMA A; 2OAW A; 2FEI A; 2OJ2 A; 1WDX A; 2PTK A; 2KRO A; 2P4R A; 1PKT A; 1TG0 A; 2DLP A; 2JT4 A; 4E6R A; 1PRM C; 2YUQ A; 1KIK A; 4IIO A; 2NWM A; 2DNU A; 3M0U A; 1SHF A; 2DIL A; 2J7I A; 4JZ3 A; 3REB B; 2DL4 A; 1GRI A; 2HBW A; 1JXM A; 2CUB A; 2D0N A; 1ABQ A; 1VYU A; 1X43 A; 3LH5 A; 4RTW A; 1NYF A; 2EBP A; 3VS1 A; 4A63 B; 4WCI A; 2CDT A; 3UF4 A; 1G83 A; 3FJ5 A; 2KRS A; 1AWJ A; 1IO6 A; 1BU1 A; 2K3B A; 1JU5 C; 2B86 A; 3EG1 A; 4LUE A; 2J6K A; 1AZG B; 4Y92 A; 1MV0 B; 1GFC A; 2SRC A; 5FWB A; 4D8K A; 5IH2 A; 2JM8 A; 2C0T A; 2XMF A; 2DX1 A; 1MUZ A; 1UG1 A; 2RN8 A; 1GCQ C; 1U3O A; 1UHF A; 2PZ1 A; 3M0R A; 4IIM A; 3PE0 A; 4RTU A; 3O5Z A; 2G6F X; 4CC7 A; 1OPK A; 1Y0M A; 1M27 C; 4J9C A; 1W6X A; 1ZSG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3FDR A; 1M30 A; 3VS5 A; 2H3E B; 4C92 B; 1Q86 C; 1OU8 A; 3V8L A; 2E6Z A; 3EFR A; 4ZGE B; 2L2P A; 3REA B; 3LW5 E; 2EQU A; 1KC8 R; 4J9H A; 3TU4 K; 2K9G A; 1VQ8 T; 3OYC A; 2YLB A; 1ZQ1 A; 3QUI A; 3CCM A; 2OTL Q; 2X4X A; 2E6N A; 3RKY A; 1SG5 A; 2QEX Q; 3DLM A; 3M0S A; 2EYZ A; 2ROT A; 2YWW A; 4J8O A; 3AHU A; 1IZ6 A; 2RK1 A; 4QT7 A; 4M78 A; 3H8Z A; 3QG1 A; 1X75 C; 3VRZ A; 2XI9 A; 5CAI A; 1VQL T; 3EG9 B; 2EQK A; 5L8R E; 3A5Z B; 5GAM d; 1M8M A; 1YN8 A; 2RM4 A; 1QVG S; 2CS7 A; 5GAO m; 3CC2 A; 1UGS B; 4C5I A; 5KCH A; 4XQ3 A; 2K5I A; 4C8Q C; 1V1C A; 1K9M R; 3HRS A; 2DZ9 A; 1I5L A; 1KC8 C; 2COW A; 4LD6 A; 4E7I A; 4M75 A; 2CZ7 B; 1B07 A; 1UB4 A; 3DKM A; 3CQT A; 8AT1 B; 4R56 A; 3CCE T; 2KGT A; 2VGN A; 1RAG B; 2EAY A; 4JRK A; 3CD6 Q; 3JCM b; 1M3C A; 4M78 G; 2HEQ A; 5A0L A; 1OYX A; 2ESW A; 3HRU A; 4J9B A; 2ATC B; 2KE9 A; 1JJ2 S; 4M7A F; 1VQ9 T; 2JN0 A; 1MNE A; 2M51 A; 3CCR T; 4GY5 A; 1YIJ A; 3G4S Q; 3OW2 A; 4PJJ A; 1N8R R; 1UGP B; 1K9M C; 2YRC A; 3CPW P; 2EGE A; 3VV0 A; 2EYW A; 4FYX B; 2K4Y A; 4C5G A; 2KRM A; 2LQN A; 2D1X A; 1PSF A; 1Z9Z A; 5KYU B; 3FEO A; 4J9E A; 2VKN A; 1BB9 A; 1JBM A; 3CCS A; 1XTD A; 1WXU A; 2P0P A; 4B6M A; 2VC8 A; 2QQ9 A; 2P0Q A; 1BBZ A; 4M7A G; 1EZZ B; 2JTE A; 2AK5 A; 2DM1 A; 2OAU A; 1S72 T; 4QW2 A; 3X25 B; 1OQK A; 2DBK A; 3CC4 A; 2A36 A; 5HKC A; 3PNW C; 2DD5 A; 2DYB A; 1QMC A; 3HL8 A; 3EFS A; 1N8R C; 4DOW A; 4Z8A A; 1OI1 A; 1WHK A; 2XID A; 3ZFJ A; 2FYK A; 1PCX A; 2RQU A; 2IVW A; 4A4G A; 4C5H A; 2KT1 A; 4F7U B; 2VB6 A; 4N4I A; 1VQK A; 3JB9 D; 1B3Q A; 1WGS A; 2HBP A; 4HKE A; 3JCM J; 2LJ3 A; 1ZLM A; 4QVC A; 4OMF B; 1MGQ A; 1Q81 R; 3CME Q; 1T0J A; 4RG2 A; 4J6Y A; 3JCM h; 1DJ7 B; 1VQN A; 2L89 A; 4M7D B; 1R0B G; 1UDL A; 3CXC P; 1VQ7 T; 1J3T A; 2KQW A; 2L0A A; 2QA4 T; 3S6W A; 2LZ6 B; 1K0X A; 1YI2 A; 2CH4 A; 3OYF A; 3TRE A; 1GL5 A; 1SHG A; 2FG0 A; 2E12 A; 2D6F A; 2X3X D; 4C0G A; 2M02 A; 2DXB A; 3A8H B; 3OYL A; 2QDL A; 1YJ9 Q; 1M2V A; 2QI2 A; 5GAN f; 3CCJ T; 4M77 C; 2DYI A; 5LJ3 j; 3PVL A; 4N0A A; 1X2Q A; 1Q81 C; 1BI0 A; 2VV5 A; 2CP6 A; 4DEY A; 3RBB B; 3J7A F; 1KD1 R; 4HCK A; 2LJ1 A; 4M77 D; 2BZX A; 1VQO T; 2E70 A; 2HSP A; 1OZ2 A; 2ABL A; 2GFA A; 3HPW A; 5I2M A; 4OB1 B; 2BE7 D; 2KEA A; 3JB9 I; 1E6G A; 1M9S A; 1TTH B; 2PQW A; 2L3P A; 3OS0 A; 1YJW T; 1OV3 A; 3SWN B; 2RHU A; 1UE9 A; 2XDP A; 4C8Q F; 5IXF A; 3OMG A; 1Q86 U; 5GAO n; 1I1J A; 1D1B A; 1W1F A; 4JJC A; 4KH0 B; 5I22 A; 2QQB A; 2RF0 A; 4C5E A; 4BDY A; 2VAS A; 4C0F A; 1SEM A; 3RMQ A; 1VQP Q; 5CKB A; 2DK3 A; 4O6J A; 4CC3 A; 1JEG A; 5FU6 B; 1KD1 C; 3I55 Q; 1YFN A; 5LJ3 g; 5GAN 3; 4DEX A; 4TVR A; 1M3A A; 3HFN A; 2BTT A; 1EX4 A; 1NEB A; 1EFN A; 3HSB A; 5ECA A; 2VXE A; 1WJR A; 1TUC A; 1WLP B; 3JCM d; 4C8Q G; 1SRL A; 3RKX A; 2D8J A; 4OMM A; 1VOM A; 3RNJ A; 1QVG A; 3E1S A; 2KXD A; 3URG A; 4XAX B; 1BIA A; 2DEU A; 1VIE A; 3LX7 A; 2HAX A; 4PFO A; 3U23 A; 3FJP A; 1KC8 U; 3EFO B; 3G6E T; 2PVG B; 5GAN 4; 2KXC A; 5KH6 A; 2F2V A; 2H3J A; 3JCM Q; 2K5F A; 7AT1 B; 1YP5 A; 3NTH A; 1K76 A; 1N5Z A; 2EYX A; 1P92 A; 3LWH A; 3CCL A; 1PD1 A; 2E3I A; 1VQ8 Q; 4OMQ A; 4AG2 C; 4QVZ A; 3TQ7 P; 3FRN A; 3VUZ A; 2EYY A; 3HHT B; 1OPL A; 1UFF A; 2ED1 A; 2E5K A; 2EJ9 A; 1G3W A; 3NGP A; 3VJP A; 2EJF A; 4A4K A; 1PM3 A; 3VS7 A; 2F2X A; 1JJ2 A; 2FZC B; 1H92 A; 1UGR B; 2F5T X; 2LT1 A; 1V76 A; 1KG1 A; 1VQL Q; 1RLP C; 2NYS A; 1K9M U; 1WHG A; 4E7S A; 1UEC A; 2JTM A; 3TSZ A; 4KUD K; 2KMT A; 4BE2 A; 3M55 A; 2QQS A; 3JB9 F; 2MCN A; 1ZSZ B; 5LL6 S; 2O9V A; 5LJ5 g; 1O75 A; 4L5G A; 1MND A; 5I2S A; 3OS2 A; 2FEI A; 5D6X A; 3V7R A; 2XHC A; 1WDX A; 3PT9 A; 1B34 B; 5HK3 A; 4F7U E; 1U1T A; 3JB9 J; 1OX8 A; 3L2Q A; 2E64 A; 1OU9 A; 1PRM C; 4OVA A; 2NWM A; 2DNU A; 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5GAN j; 4CRI A; 2HDA A; 3KFV A; 1NBE B; 1Q81 U; 2XIC A; 4J9G A; 4CC4 B; 1RI9 A; 3QO3 A; 3LLR A; 5CVI A; 2HNI A; 2AKK A; 4FU6 A; 4M75 D; 4LNP A; 1V29 B; 1QP3 A; 5KYX A; 1WA7 A; 4M7A B; 4L6V 5; 5FU7 C; 1QKW A; 3I5R A; 3GBQ A; 1ZHI A; 1AEY A; 2KNB B; 3CC7 T; 4OB0 B; 4PJO A; 2A37 A; 1VQ7 Q; 3R6O A; 2XDB A; 5IHK A; 2QA4 Q; 3M57 A; 1ZUK A; 4XU2 A; 4FYW B; 2KT8 A; 2WSE E; 4PLI A; 1RAE B; 3CCQ A; 4X9D A; 4ORZ A; 2KBT A; 3DLL A; 2HKN A; 1KJW A; 3QXE B; 1NJI C; 4OB2 B; 5CK9 A; 3EH1 A; 3PVQ A; 1UTI A; 1KD1 U; 3CCJ Q; 3FIF A; 1X2K A; 1XJW B; 2ZCF B; 4E2F B; 1TS9 A; 8ATC B; 2YSQ A; 3OB9 A; 2PUK B; 1OEB A; 1D1C A; 4ZN1 A; 1VQO Q; 3X26 B; 4DBF A; 5A0D A; 4PJN A; 4ZTJ A; 2C0O A; 1H3Z A; 3PMI A; 4F14 A; 4PJO G; 4A4H A; 1NLP C; 3SHW A; 3CPW S; 1BK2 A; 2GTJ A; 3RIR A; 2LX7 A; 4R55 A; 3CCU A; 2QQA A; 1YJW Q; 2MMP A; 1E7O A; 4JUV A; 2J05 A; 3OYG A; 3VYG A; 5KYY A; 4HXJ A; 4C92 C; 3JCM c; 1WNL A; 2JUF A; 4KGV B; 4BDZ A; 4C92 D; 2L8D A; 3WXM B; 1KQ1 A; 1Y57 A; 2R5A A; 4UC4 A; 2OTJ A; 2JVV A; 5GAN h; 1PRL C; 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