The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
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sequence length |
77
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structure length |
77
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Chain Sequence |
EGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural studies of the phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) SH3 domain in complex with a peptide ligand: role of the anchor residue in ligand binding.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha
|
| molecule tags |
Protein binding
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| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
20
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| structure length |
77
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| sequence length |
77
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-07-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ABO A; 1Y0M A; 1NLO C; 2JTE A; 4RTY A; 2O88 A; 4K11 A; 2LMJ A; 3TVT A; 1PRM C; 2FRW A; 2RQR A; 4JJC A; 1G83 A; 1RLP C; 2J6O A; 2K6D A; 2BTT A; 2YUQ A; 1U3O A; 1K76 A; 1SRM A; 1GFC A; 1N5Z A; 2EYW A; 2DE0 X; 2CT3 A; 2OAW A; 2DJQ A; 1TUC A; 1GBR A; 1T3L A; 5GJW B; 5FWB A; 2RQW A; 5L23 A; 1VYV A; 4J9D A; 3VS3 A; 3M0S A; 3NPF A; 3M0Q A; 2K7A A; 2ED0 A; 2F2W A; 1YWP A; 2LQW A; 1K0S A; 2EGA A; 3RBB B; 1QCF A; 4OMN A; 3REB B; 1JO8 A; 2HEQ A; 1WXB A; 4J9C A; 1X6B A; 2RQT A; 1GRI A; 3M0P A; 2L2P A; 2AKK A; 2GNC A; 2JXB A; 1WFW A; 1E6H A; 1S1N A; 3ULR B; 4RTW A; 2JMC A; 2KXC A; 4HVW A; 1M8M A; 1BK2 A; 2MCN A; 1QKW A; 4OMP A; 1I0C A; 1AZG B; 4RTV A; 2M0Y A; 3FJ5 A; 2JM8 A; 4CC7 A; 2FO0 A; 2CH4 W; 4GLM A; 4LN2 A; 5I11 A; 1M3B A; 2YT6 A; 3VS2 A; 1BB9 A; 1JEG A; 3I9Q A; 4CC4 B; 1WXU A; 1X69 A; 1OOT A; 1PKS A; 2GTO A; 2HDA A; 4M4Z A; 4ORZ A; 3H0F A; 4AFS C; 1GL5 A; 1WYX A; 1ZSG A; 1YN8 A; 2K9G A; 5HCK A; 1JXO A; 4HXJ A; 3UAT A; 4J9F A; 1UHF A; 3H0I A; 1PKT A; 1J3T A; 1W1F A; 2YUN A; 1NG2 A; 1QWF A; 1BBZ A; 2OI3 A; 1RI9 A; 2EGC A; 1YCS B; 2JS2 A; 4J9I A; 2A37 A; 2NWM A; 3NHN A; 2X3X D; 3PVQ A; 2CUD A; 4HVU A; 3A98 A; 1AVZ C; 1ZBJ A; 1QLY A; 2RPN A; 3CQT A; 2GGR A; 1NEB A; 2I0N A; 2YSQ A; 1WDX A; 1KJW A; 1H8K A; 4DEY A; 3PVL A; 2L3S A; 4WCI A; 1MUZ A; 1X2K A; 1YWO A; 2KT1 A; 2X3W D; 1GCQ C; 2O31 A; 5IH2 A; 4D8D A; 2C0O A; 2PTK A; 1IO6 A; 4JJD A; 3TSZ A; 1ZUU A; 1X27 A; 2JMA A; 4LUD A; 3UA7 A; 1M3A A; 1AZE A; 2EKH A; 2A28 A; 1HD3 A; 1UFF A; 1K0X A; 3UF4 A; 5FWC A; 4DEX A; 1GFD A; 3C0C A; 3GBQ A; 4HCK A; 2SEM A; 3VRY A; 4CC3 A; 1UUE A; 2DL3 A; 2ED1 A; 2LP5 A; 1CKB A; 2HBW A; 2CSQ A; 1WLP B; 1XOV A; 2J7I A; 4JZ4 A; 3EHR A; 2EYY A; 2FRY A; 2GBQ A; 1NEG A; 4AFQ C; 1GCQ A; 1NYG A; 2H8H A; 4QT7 A; 3UA6 A; 1WIE A; 2F2X A; 1NYF A; 1ARK A; 2DM1 A; 2KRM A; 2VVK A; 2YUP A; 4OMM A; 1T0H A; 2W0Z A; 2KXD A; 2P4R A; 5GJV B; 3REA B; 2DVJ A; 2KBT A; 4F17 A; 2EBP A; 1CKA A; 3U23 A; 4Z8A A; 3M0U A; 4J9H A; 1X6G A; 5IHK A; 2D0N A; 2W10 A; 3SHW A; 1AWW A; 2J6F A; 1WX6 A; 2JW4 A; 1FMK A; 2PZ1 A; 2RQV A; 3NGP A; 4F14 A; 4FSS A; 1UTI A; 1UDL A; 1KFZ A; 1PNJ A; 1X2Q A; 3THK A; 2G6F X; 2KEA A; 2KRN A; 2JT4 A; 2V1Q A; 2YDL A; 2C0T A; 4CC2 A; 1E7O A; 2GTJ A; 2EYX A; 3ZL7 C; 1A0N B; 3I5R A; 3IQL A; 1H3H A; 4JZ3 A; 4LUE A; 1Z9Q A; 3VS1 A; 2K79 A; 1AWO A; 4JPB W; 2JS0 A; 2KGT A; 1OV3 A; 3M0R A; 2NUZ A; 5I22 A; 2ROT A; 2DIL A; 1RUW A; 1VA7 A; 2D1X A; 3LH5 A; 2DYB A; 1M3C A; 3JV3 A; 1OEB A; 2SRC A; 2LJ0 A; 2HSP A; 1OPL A; 2FPD A; 4KRT A; 1QWE A; 1PHT A; 1I1J A; 2V1R A; 2ABL A; 5IXB A; 1WXT A; 4GBQ A; 2J06 A; 2A36 A; 2J6K A; 3VS6 A; 2DF6 A; 2DMO A; 2LJ1 A; 2M51 A; 5EC7 A; 2KNB B; 2BZX A; 1T0J A; 1SHF A; 2FPF A; 1Y57 A; 2GQI A; 2CH4 A; 2CDT A; 4OML A; 2KR3 A; 1UGV A; 4OMO A; 1SPK A; 1I07 A; 1LCK A; 1X43 A; 4HVV A; 1AD5 A; 2LX7 A; 1ZUK A; 3EGU A; 2KYB A; 2K2M A; 1RLQ C; 1ZLM A; 3SEM A; 2QDL A; 1ZUY A; 2L0A A; 2DL7 A; 1W70 A; 3EHQ A; 1B3Q A; 1AWJ A; 1NLP C; 4EIK A; 2L3P A; 4AG1 C; 1VYT A; 1GCP A; 4F16 A; 4J9B A; 3TSW A; 1U5S A; 2DRM A; 1YP5 A; 2DRK A; 4IIM A; 1UEC A; 1UHC A; 1GBQ A; 2PNI A; 2A08 A; 4Y92 A; 2ENM A; 5ECA A; 2RMO A; 4OMQ A; 2D8H A; 2ESW A; 1ZX6 A; 3NMZ C; 2YUO A; 1SEM A; 2LNH B; 1MV0 B; 2LJ3 A; 1WI7 A; 2AZV A; 2KE9 A; 2J05 A; 2EPD A; 2RQU A; 3VS5 A; 4D8K A; 2L3Q A; 4AG2 C; 2AZS A; 2LZ6 B; 5IHN A; 1CSK A; 2CT4 A; 2O9V A; 1HSQ A; 2VWF A; 2CSI A; 1KIK A; 2DL4 A; 3O5Z A; 4A63 B; 1WA7 A; 1SSH A; 2DNU A; 2JM9 A; 1AOJ A; 2XMF A; 2BZ8 A; 2AKL A; 1G2B A; 1VYU A; 4AFU C; 3QWY A; 2DA9 A; 1U06 A; 3PE0 A; 4IIO A; 3KFV A; 4J9E A; 4LNP A; 4Z89 A; 5IXF A; 5IHI A; 2MIO A; 4JJB A; 2DL8 A; 3H41 A; 1V1C A; 2KRS A; 1K9A A; 3EG0 A; 2CRE A; 1FYN A; 2EVR A; 1KSW A; 4J9G A; 4E6R A; 1SHG A; 2OJ2 A; 3VS4 A; 4ESR A; 2DLP A; 1UJY A; 1YNZ A; 3VRZ A; 2FG0 A; 2EGE A; 1M27 C; 1UG1 A; 1HJD A; 4X1V A; 2FEI A; 1PWT A; 2CUB A; 3I5S A; 1ABQ A; 2DBK A; 2ROL A; 3I35 A; 1NM7 A; 3H0H A; 2B86 A; 2DL5 A; 3VS7 A; 5FW9 A; 2HCK A; 1PRL C; 1MV3 A; 3EG1 A; 2KRO A; 2O9S A; 1EFN A; 3VS0 A; 4LE9 A; 1E6G A; 1BU1 A; 2IIM A; 2VKN A; 4R0K A; 1JU5 C; 2RN8 A; 1Z9Z A; 2RNA A; 2KYM A; 1JQQ A; 1W6X A; 2RF0 A; 3RNJ A; 2EQI A; 4RTU A; 1TG0 A; 2MOX A; 1T3S A; 3QWX X; 1B07 A; 2O2O A; 1QKX A; 4RTX A; 2ECZ A; 1SRL A; 3M0T A; 2D8J A; 2LCS A; 2EW3 A; 1TUD A; 4RUG A; 2EYZ A; 2F2V A; 2K3B A; 1JXM A; 3R6N A; 4AFZ C; 1UJ0 A; 1AWX A; 2KT8 A; 1UE9 A; 2E5K A; 2C0I A; 3EG2 A; 2AK5 A; 4RTZ A; 1H92 A; 1K1Z A; 1OPK A; 1K4U S; 3EG3 A; 4Z88 A; 1M30 A; 2FPE A; 4RTT A; 2BZY A; 2DX1 A; 4ZNX A; 1AEY A; 2DBM A; 2LQN A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1M9S A; 2MMP A; 3L2W A; 4K11 A; 2QQA A; 1LPL A; 1QMC A; 5J3B A; 2NUT A; 4QQG A; 1K8A R; 1RLP C; 1YJN Q; 4PJO C; 2BTT A; 2MF2 A; 2YUQ A; 1K76 A; 4BY6 B; 4MDW A; 2K5I A; 2K5F A; 3QG1 A; 4XTV A; 3GOX A; 2X4Y A; 3PIO A; 2VGN A; 3RER A; 5GJW B; 5FWB A; 5GAN 2; 4PLI A; 1K8A U; 1NE8 A; 2V8K A; 1ACM B; 2L3R A; 2X9H A; 5CKD A; 1QCF A; 4NOY A; 4E7J A; 2R5M A; 2OTL Q; 2YRC A; 2PUO B; 5GAN 4; 4M75 E; 4N4G A; 2RI5 A; 2FZG B; 3OYN A; 2JXB A; 1WFW A; 3UWN A; 1XNI A; 2RHX A; 4FYV B; 2CP0 A; 4IUQ A; 1VQL T; 1MHN A; 2O01 E; 2KXC A; 4PJO A; 5FU7 B; 4ATO A; 3FLG A; 1M1K R; 2X35 A; 1VQN A; 1M3B A; 3X20 B; 3ASK A; 1BB9 A; 2YWW A; 1JEG A; 1LJO A; 5GAM h; 2DER A; 3FEO A; 3HRS A; 1VQ9 T; 3FC3 A; 1WXU A; 1OOT A; 2YLB A; 3CCS Q; 1FWZ A; 4M4Z A; 1EZZ B; 3H0F A; 4PNO A; 2QQR A; 4Z02 A; 4AFS C; 1GL5 A; 1WYX A; 4EMH A; 1RAG B; 2QGF B; 1MGQ A; 4J9F A; 1UHF A; 3CME Q; 3CC7 Q; 5LJ5 j; 1H64 1; 1W1F A; 4M7D C; 2MK5 A; 1QWF A; 2DKG A; 1O75 A; 1YJW A; 3PTA A; 4J9I A; 2NWM A; 5GMK m; 3NHN A; 9ATC B; 4JS4 A; 3CCL T; 1C1A A; 2DEQ A; 1WHK A; 3LLR A; 1ZBJ A; 4XU0 A; 3CQT A; 3QBY A; 1GXI E; 1NPP A; 2QG9 B; 3HRU A; 3CCE A; 1KJW A; 5FU6 C; 4M7A G; 5KYU B; 1RL2 A; 3QJ6 A; 4M75 G; 2KT1 A; 2LQK A; 4DBR A; 4C92 B; 2O31 A; 5IH2 A; 2P0Q A; 2C0O A; 3RR6 A; 3A8G B; 4BI3 A; 4E47 A; 1B7T A; 5KYY B; 4XU3 A; 1AZE A; 3HFN A; 5L8R E; 1UFF A; 5CQX A; 4M7A F; 1K0X A; 5J39 A; 1OI1 A; 5FWC A; 1U1S A; 4M75 F; 4DEX A; 2RHZ A; 3OYF A; 3OYK A; 1KK7 A; 1VQ8 Q; 5IT9 E; 3VRY A; 4CC3 A; 2FB7 A; 3EH1 A; 2EWN A; 4GY5 A; 2COZ A; 1XOV A; 5GMK e; 3CC2 T; 4XK8 E; 3H8Z A; 2QAS A; 3EHR A; 4BI8 B; 4JS5 A; 3E2U A; 2V8J A; 2EQU A; 1VQO A; 2QQ9 A; 4M77 C; 4EMK B; 2H8H A; 2F2X A; 1ARK A; 3VU3 C; 2OAU A; 2L8D A; 3G6E T; 3JCM V; 2KXD A; 3MET A; 5CIU A; 2GFA A; 3REA B; 2DVJ A; 2MWP A; 1VQM T; 3TQ7 P; 3U23 A; 3ME9 A; 1KHI A; 4J9H A; 2LT1 A; 4KGZ B; 3CEY A; 1BIA A; 3DLM A; 1Q86 R; 1VQK Q; 1ZBX A; 1FMK A; 4DBH A; 1I5O B; 1WQ7 A; 4IUT A; 3GF5 A; 4F14 A; 1KC8 U; 1UDL A; 4QW2 A; 2G6F X; 2COY A; 4M7A D; 2JT4 A; 3E9G A; 2K5L A; 3EAE A; 1Q95 G; 4HKE A; 4M77 A; 3ZL7 C; 3I5R A; 4JZ3 A; 2HD0 A; 4M78 A; 1YI2 A; 2RB6 A; 2LX9 A; 1M2O A; 2KGT A; 4V2S A; 1RUW A; 1VA7 A; 1K8A C; 4Q5W A; 1N9S A; 1TTH B; 3JV3 A; 4PJO B; 4J5Y A; 2SRC A; 3L2U A; 3V8K A; 2GCX A; 3JCM W; 3QKJ A; 1RAI B; 1YJN A; 1NJI R; 5KCH A; 3VYH B; 2HSP A; 1Q7Y R; 2FPD A; 1I1J A; 3QII A; 2V1R A; 2ABL A; 4UC4 A; 4C92 D; 3F70 A; 2J06 A; 3OS5 A; 4C8Q C; 3VS6 A; 2DF6 A; 2DMO A; 2ZCF B; 2M51 A; 5EC7 A; 1SKU B; 1T0J A; 3EGD B; 2VV5 A; 1W4S A; 3HTR A; 2CDT A; 2DTH A; 2E64 A; 1MMA A; 3EFO A; 3SD4 A; 3S3M A; 4CRI A; 1KG1 A; 1ZSZ B; 3HPW A; 3WVD B; 4E7S A; 4XTW A; 2LTO A; 4FM4 B; 2G3R A; 3KBG A; 1VQ4 T; 3HSB A; 2DL7 A; 1TOV A; 2XIC A; 1B3Q A; 4P5N A; 5GMK h; 4XAX B; 3MPU B; 4IKF A; 4M7D E; 4AG1 C; 4KT0 E; 4PLL A; 1G5V A; 4DBQ A; 1YP5 A; 1Q82 R; 1KD1 U; 4C8Q A; 5GAM f; 2D9T A; 3BDU A; 4Y92 A; 2ENM A; 3CCS A; 4F7U E; 2D8H A; 3P8H A; 2QXF A; 2YUO A; 4E7H A; 3MEU A; 2LJ3 A; 2KE9 A; 2J05 A; 5CVI A; 2P84 A; 3VS5 A; 2AZS A; 5AT1 B; 1WJR A; 5A0G A; 3OYD A; 3M4G A; 1CSK A; 1PSE A; 2XK0 A; 4ZTF A; 1HSQ A; 2QI2 A; 2DEU A; 2DL4 A; 2F5T X; 3CCV T; 2CP5 A; 5LJ5 g; 1XJW B; 2XMF A; 4KGV B; 2AKL A; 1VYU A; 2DA9 A; 1U06 A; 3KFV A; 1WNL A; 5FU6 B; 5IHI A; 5GAN 6; 5GAN g; 4BE2 A; 3L2Q A; 8ATC B; 2F1L A; 1YIJ Q; 4FCY A; 3JB9 G; 2ZPB B; 4M77 E; 4JLI A; 4MML A; 1KSW A; 1KQS P; 2X4W A; 4J9G A; 1S72 T; 4M7D G; 3VS4 A; 1YHQ T; 4PJO D; 1IXD A; 1MND A; 2FG0 A; 3RES A; 2YHT A; 4BUG A; 2RI2 A; 3SWN B; 4A4K A; 2A3L A; 1M27 C; 1BYM A; 3QUI A; 2QEX Q; 1VQ8 A; 3JB9 F; 3P8B B; 4RCB A; 1BI3 A; 2ROL A; 3I35 A; 1NM7 A; 3M9Q A; 2ZPH B; 2PVG B; 4BY6 C; 4M7D F; 4ZN1 A; 4F7U G; 1FMW A; 2HQE A; 5FW9 A; 4OB3 B; 2HAX A; 3OSV A; 1Q81 U; 4LE9 A; 8AT1 B; 3OYC A; 2DYI A; 2M16 A; 1M1G A; 2KYM A; 4M78 B; 1DJ7 B; 1MMG A; 1RAE B; 4HCZ A; 1W6X A; 2ATC B; 3A1P A; 4F7U F; 1QQJ A; 3OW2 S; 4RTU A; 4KH1 B; 2KI7 A; 3QWX X; 4BD3 A; 1IRE B; 2E6Z A; 1SG5 A; 2ECZ A; 3OYY A; 2AIR B; 4CI0 C; 1Q86 C; 2XDD A; 1YJ9 T; 3CBP A; 4QVD A; 3DB3 A; 1KHC A; 1VQK A; 4OVA A; 1UGR B; 1FMV A; 1VQ5 T; 5FU7 C; 3OSS C; 3JCM g; 3EG2 A; 4M77 G; 4PFZ A; 3FDR A; 5CAI A; 1D1B A; 3RDV A; 2KY9 A; 3EG3 A; 4Z88 A; 2ZPF B; 4FU6 A; 3RKX A; 3RIR A; 3V7R A; 5GAN 7; 1AEY A; 4ELY C; 4JLG A; 1Y0M A; 1NLO C; 2LMJ A; 2ZZD A; 2HKQ B; 4M77 F; 2XI9 A; 2DD5 A; 1PRM C; 2FRW A; 2QA4 Q; 3L42 A; 2RQR A; 2HL3 A; 1FX7 A; 1NJI C; 2DZ9 A; 2ZPI B; 1Q7Y C; 1BI2 A; 2BE9 B; 2YRD A; 1N5Z A; 1VQ6 T; 4RG2 A; 2KSS A; 1JJ2 S; 1F1B B; 2HQX A; 2JTF A; 3DLL A; 1TUC A; 1M90 R; 1PCX A; 3VYG A; 5L23 A; 3VS3 A; 4C8Q B; 3M0S A; 2K7A A; 2DPP B; 2ED0 A; 2LQW A; 4RCC A; 3GNG A; 3REB B; 3JCM X; 1WXB A; 2HL5 C; 2FZC B; 1LOJ A; 3M0P A; 1YIT T; 4Y28 E; 2FVU A; 3LYI A; 3OQ5 A; 1E6H A; 1S1N A; 1NBE B; 1RAD B; 2V8I A; 2JMC A; 1QKW A; 3RMQ A; 3AHU A; 2RJF A; 1I0C A; 1AZG B; 4CC7 A; 2CH4 W; 2XG8 D; 1Q82 C; 3VS2 A; 2RO0 A; 3JSC A; 1KQ1 A; 1VQL Q; 4CC4 B; 4M78 D; 1B34 B; 1VQ7 T; 1PKS A; 2GTO A; 2HDA A; 4OMF B; 4ORZ A; 2BUD A; 3MEV A; 4QKU A; 3C94 A; 2BIV A; 4JDS A; 5KE3 A; 4EMK C; 2KK4 A; 5HCK A; 5GAM e; 1JXO A; 2LC4 A; 3UAT A; 4JRP A; 1VQ9 Q; 5KYY A; 3CCR T; 3QZ9 B; 1XQH A; 2WSE E; 4C5E A; 1BBZ A; 2FHD A; 2OTJ T; 3G4S Q; 2EIF A; 1RI9 A; 2DIG A; 1K9M R; 5FRO A; 2X3X D; 2CUD A; 1AVZ C; 5GAM d; 1HXD A; 1OYX A; 4RG8 A; 3MEW A; 1BIB A; 1H8K A; 5KYW B; 3PVL A; 2L3S A; 1YWO A; 2X3W D; 1GCQ C; 3M57 A; 1D0Y A; 2MYS A; 4MMK A; 3CCL Q; 2DVE A; 1YIJ A; 4JJD A; 1VQN T; 1TXQ A; 1X27 A; 2DK3 A; 2O4X A; 2X4X A; 4EMK A; 1HD3 A; 3J81 E; 4HCC A; 3CC4 T; 1GFD A; 4LXC A; 4HCK A; 4PKC C; 2SEM A; 5GAO q; 1UUE A; 3S3O A; 2CKK A; 1BKB A; 3I56 T; 2RD1 A; 2QEX A; 4FIB A; 4N4H A; 4B6M A; 4C8Q D; 3GNF B; 3J80 E; 5GAN 5; 2GBQ A; 1GCQ A; 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