The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MKPVKVKTPAGKEAELVPEKVWALAPKGRKGVKIGLFKDPETGKYFRHKLPDDYPI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Dna binding protein/dna
|
| source organism |
Sulfolobus solfataricus
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| publication title |
Crystal structure of the crenarchaeal conserved chromatin protein Cren7 and double-stranded DNA complex
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Chromatin protein Cren7
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| total genus |
5
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-12-03 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3LWI A; 3KXT A; 2JTM A; 4R55 A; 4R56 A; 3LWH A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2RI3 A; 3JCM W; 2CP2 A; 2DTH A; 1GRI A; 2YRC A; 3CC4 T; 3HL8 A; 2J7I A; 3EFS A; 1Y07 A; 5A0L A; 2CT4 A; 1VQ4 A; 3M0U A; 3QUI A; 3OW2 A; 2H8H A; 4EPC A; 5GAO l; 2COW A; 4BDY A; 1X6B A; 4KGX B; 2J6F A; 3EG1 A; 4OVA A; 2YWW A; 4DBR A; 5CIU A; 4RTW A; 5CQX A; 2EJF A; 3CCU T; 3NTK A; 2XID A; 2HZY A; 3L2Q A; 2VWF A; 1VQ5 Q; 4MZM A; 2MF2 A; 3C4S A; 2K5F A; 1FMK A; 3BE3 A; 2HMA A; 1RAB B; 1BCM A; 1S1N A; 4JZ4 A; 3VS1 A; 2YSQ A; 3FDR A; 3EFO B; 2DKG A; 1EX4 A; 2V8I A; 1D1B A; 3NPF A; 1E6G A; 1NG2 A; 2DPP B; 4N0A C; 4EMK B; 1N9S A; 4F7U B; 3ASK A; 2E3H A; 1VQM T; 2DRK A; 4ATO A; 2FPF A; 3ME9 A; 3VS2 A; 3CD6 A; 2BE9 B; 2ZPI B; 1VQP T; 2CZ1 B; 4M7D E; 1UDL A; 4M7D D; 3EGU A; 3OYL A; 5KYY B; 5LJ3 e; 2EPD A; 2EJG A; 2XD0 A; 3VS4 A; 4HCB A; 1ZUU A; 4A4G A; 1RI0 A; 4M7D F; 2DL4 A; 4J83 A; 4A4H A; 3M4G A; 4OGE A; 4AFU C; 2COZ A; 2LCS A; 1UGQ B; 4D8D A; 2GQI A; 3G4S Q; 4ZN3 A; 2JT4 A; 1M27 C; 1RLQ C; 2R57 A; 2YLC A; 1VQN A; 4QVD A; 1C6V X; 1V29 B; 4C92 G; 1KG1 A; 3JB9 G; 3RDV A; 4PJO E; 4IIM A; 1GCQ C; 3G6E Q; 4PJO D; 5GMK j; 5LJ3 f; 1M30 A; 2YLB A; 2QYZ A; 3LWI A; 2GF7 A; 5IHI A; 1T0J A; 1YIT Q; 2DL8 A; 4PJO F; 5AYF A; 1TXQ A; 2ED0 A; 1M2V B; 1SRL A; 1T3L A; 1GCP A; 2E64 A; 4M7A D; 1X01 A; 2X3W D; 1CSK A; 2Y90 A; 1VQL Q; 2CSQ A; 1QLY A; 1VIF A; 2YUQ A; 4XU3 A; 3VS0 A; 3NFC A; 1M3B A; 1RAD B; 4LDX A; 1N27 A; 1F1B B; 4EMK C; 2ZPF B; 3FIF A; 4KH1 B; 2MWO A; 2FZG B; 1R0B G; 3L2U A; 4LD6 A; 5CKD A; 3RMQ A; 1Q81 C; 3OYJ A; 4XAX B; 5GAN h; 1OYX A; 2C0O A; 3ER0 A; 2IPO B; 1B07 A; 2G6F X; 3SB2 A; 3OS5 A; 1KJW A; 4R0K A; 2KRM A; 1PSF A; 5KYW B; 5GAM d; 5DM7 R; 2GGR A; 2DZ9 A; 1RLP C; 1PG5 B; 2RJF A; 2JUF A; 2VGN A; 2BUD A; 3G1J A; 4QW2 A; 2RI5 A; 2E12 A; 3QWY A; 1M1K U; 1WA7 A; 4C5E A; 1JEG A; 2ZGW A; 3CCE A; 4PFZ A; 1M5Q 1; 1WHL A; 4HVV A; 1G5V A; 3ZFJ A; 2GTO A; 4RCC A; 1I5O B; 2CUB A; 1OPL A; 4FT4 A; 1O75 A; 1VA7 A; 3THK A; 3CCL Q; 1NYG A; 1BCO A; 2L8D A; 2YRD A; 1I4K 1; 5KYN A; 1EZZ B; 4AFQ C; 3OY9 A; 3CCJ Q; 3EH1 A; 4M78 A; 2JZ2 A; 3J80 E; 2VVK A; 1WHJ A; 2NUT A; 2PVG B; 4DOV A; 5FRN A; 2RPN A; 3SD4 A; 1VQL T; 4RCB A; 2AK5 A; 1VQ8 A; 1WX6 A; 3OYF A; 4M77 E; 3RER A; 4M77 D; 5DLQ E; 1QCF A; 5AT1 B; 1Z9Z A; 4MDW A; 1PRL C; 1EIF A; 2FYK A; 3OBW A; 4O6J A; 4M77 F; 2AZS A; 2EVR A; 1KFZ A; 4OML A; 5CKF A; 1H64 1; 2KEA A; 2ZPG B; 4LD9 K; 3GPL A; 1LCK A; 1KQS S; 4C8Q E; 4J9F A; 1MV3 A; 4N4I A; 4C8Q D; 3UPU A; 2EYY A; 2CDT A; 1B34 A; 2X3X D; 5FWC A; 3CBM A; 1GFC A; 4C8Q F; 1XNI A; 1ACM B; 1KD1 R; 2M16 A; 3QDR B; 2LRQ A; 5GMK l; 2P84 A; 2K2M A; 1SKU B; 4HVW A; 2V1R A; 1Q7Y U; 3CCV T; 2EQU A; 1NEG A; 1AHJ B; 1YJ9 Q; 5IHN A; 2EGC A; 5D6X A; 5CKH A; 2LQN A; 1OI1 A; 4J9D A; 2DLP A; 2LNV A; 5IHK A; 1YN8 A; 3TVT A; 4LDY A; 3M55 A; 2DAQ A; 4M78 G; 4J8O A; 2FZC B; 3TU4 K; 4Z8A A; 3I56 Q; 1BU1 A; 2KMT A; 4NL2 A; 2AT1 B; 2ZPE B; 2B86 A; 3VRY A; 3H9N A; 3CCL T; 2M0O A; 3CCM Q; 4EIK A; 1WYX A; 4OMO A; 1TWB A; 3VS3 A; 5GJW B; 2O2O A; 2JTF A; 3F70 A; 4KT0 E; 3TCJ A; 3JRZ A; 1RAA B; 2KVQ G; 3CME T; 2KBT A; 4E7I A; 1VQ9 Q; 1X6G A; 4EMH A; 1OX9 A; 3M0Q A; 3CC2 Q; 5CAI A; 1T3S A; 1W2B S; 1DJ7 B; 5LJ3 d; 2QTV A; 1TSF A; 4J9B A; 2MCN A; 1X75 C; 4HCK A; 3VUZ A; 4XU2 A; 5I2M A; 3LH0 A; 3LW5 E; 3I5R A; 2JS0 A; 4OB1 B; 4XTX A; 2X4Y A; 2DXT A; 3V7R A; 1G3W A; 2GFU A; 4GY5 A; 3GLX A; 2QEX A; 4A4F A; 2LCL A; 3E9G A; 1RAI B; 2E1H A; 3JB9 D; 4M7A A; 2DVJ A; 1YJ9 T; 4IIO A; 1SG5 A; 2VV5 A; 3G71 A; 3RKY A; 2K4Y A; 2FEI A; 3VU3 C; 1WFW A; 3UA7 A; 1RUW A; 3EGX A; 3CCR T; 2R58 A; 4NL3 A; 1YHQ Q; 4AG1 C; 2MK5 A; 2VXE A; 2K2V A; 2AZV A; 3I56 T; 4ORZ A; 2QGG A; 3JCM b; 4BD3 A; 1G3Y A; 2VB6 A; 3L2Z A; 3CCM T; 2CP5 A; 1YWP A; 2EQK A; 3JV3 A; 2AHJ B; 2DBM A; 2FVU A; 2DER A; 2K5L A; 1UJY A; 2L3Q A; 5GAN 7; 5GAO n; 3RNJ A; 1K8A R; 3NTH A; 2YHT A; 2ATC B; 3CCQ Q; 2CRE A; 4JJC A; 1RAF B; 4LDU A; 3EHR A; 4A54 A; 1D1C A; 3OYI A; 1IRX A; 2MWP A; 4KBM B; 3D7S B; 5J3B A; 2W0Z A; 1Q7Y R; 3C12 A; 3VS6 A; 2P0Q A; 3BDU A; 4J6W A; 1VQ9 T; 3GP8 A; 5IN1 A; 1D0Z A; 3E19 A; 2OTL A; 4K11 A; 1SF9 A; 1D09 B; 2JTM A; 4DEY A; 1YJN A; 2KR3 A; 3S3M A; 4BUG A; 4ZTF A; 4FM4 B; 2O01 E; 3FLG A; 4ANJ A; 5CQY A; 4RKU E; 2M9U A; 2OX7 A; 3QYH B; 2P4R A; 2DJZ A; 1K1Z A; 1Q82 R; 2E6N A; 2E65 A; 2O31 A; 4RTV A; 2EYZ A; 2WAC A; 5LJ3 j; 2DEQ A; 3L1A A; 4PKC C; 1YJW A; 1R8O B; 3LWH A; 3NMZ C; 1AWJ A; 3SWN A; 2EYW A; 5IAY A; 1QW1 A; 4DBH A; 1H92 A; 1UUE A; 1VQO Q; 2KI7 A; 3DB3 A; 1WPY A; 1YHQ T; 3HRU A; 2DBK A; 2DM1 A; 1OZ3 A; 3MEW A; 3EG3 A; 1YIJ Q; 2CP0 A; 2D0Q B; 4E47 A; 2K7A A; 2RHZ A; 3CC4 A; 2RQU A; 4FIB A; 4M7D B; 4A4K A; 3MKD A; 4CC2 A; 3V8L A; 3ZBD A; 5GMK h; 4HCZ A; 2DXC A; 1FMV A; 4RMO A; 3E1S A; 1U06 A; 1K9A A; 5HK3 A; 1VOM A; 5J39 A; 1PHT A; 1XJW B; 1BIB A; 3Q1J A; 3CCU A; 1I0C A; 1ZSZ A; 1SRM A; 1OQK A; 2JOY A; 3P8D A; 2Z0W A; 1WJQ A; 3EHQ A; 4PJO B; 2X4J A; 2L3R A; 1IO6 A; 3CMA Q; 2EYQ A; 4Y28 E; 3CXC S; 3M4Y A; 1WZO A; 4C0F A; 1M1K C; 2LQ8 A; 3C95 A; 2M02 A; 1ZUK A; 1VQM A; 4C5H A; 2RM4 A; 3NGP A; 3M9Q A; 2KT8 A; 3MEU A; 1PRM C; 5GAN 4; 4LUD A; 1FWZ A; 3INZ A; 1NEB A; 1M4Z A; 4A63 B; 3JCM Q; 1ABQ A; 3CPF A; 2KRN A; 1ZQ1 A; 4M78 E; 3EGX B; 1VQP A; 4M78 D; 4FT2 A; 1D0Y A; 3A98 A; 4X9D A; 3FJ5 A; 4A53 A; 4F7U G; 3HKS A; 2ZPH B; 1SHF A; 2ROT A; 1R0C B; 1M1F A; 4M78 F; 3HSB A; 2KYB A; 1VQO T; 1WHK A; 3P8B B; 1N9R A; 1Y7X A; 1Z9Q A; 2X51 A; 2DD4 A; 5GAN e; 4FSS A; 1YIJ T; 2SEM A; 1VYV A; 5C0M A; 1M90 R; 5GAN 2; 4M7D C; 4E7Z A; 4XK8 E; 1VQ7 Q; 1YP5 A; 4HT9 A; 1BK2 A; 2RHU A; 2HQX A; 2ABL A; 2DMO A; 4D8K A; 1JQQ A; 3CCS Q; 1JJ2 S; 1C0M A; 4OB2 B; 1I5L A; 3RES A; 5GAN f; 1I07 A; 4QKU A; 2EBP A; 1XTD A; 2DL3 A; 4AT1 B; 2LNH B; 3QKJ A; 4RTY A; 2HL3 A; 2RMO A; 4C92 A; 3PMI A; 5CVI A; 1KHC A; 1NJI R; 2M0Y A; 4PJO C; 4OGC A; 2LJ3 A; 1O9S A; 1UHC A; 2A7Y A; 1K8A C; 2EQJ A; 2QXF A; 2RA2 A; 4BAC A; 2A36 A; 2EKH A; 3MEA A; 4GLM A; 2QGF B; 3X24 B; 4JLI A; 3CQT A; 3V8K A; 1Q7Y C; 1UB4 A; 2CUD A; 2LX7 A; 3TSW A; 1EFN A; 3A1P A; 4FYV B; 1N8R U; 2AKK A; 1T0H A; 2E5K A; 5LJ5 g; 2LT1 A; 1UGR B; 1BKB A; 4M77 B; 1XQH A; 2KQW A; 1OV3 A; 1BBZ A; 1JB0 E; 3EFR A; 2HEQ A; 2QI2 A; 4RG2 A; 2EWN A; 1SSH A; 2E4H A; 1W4S A; 3M54 A; 4MZP A; 1WDX A; 2MPX C; 3EH2 A; 3UWN A; 2L3S A; 1IGU A; 1X69 A; 2D6F A; 4C8Q B; 4LDW A; 3G7Z A; 3JCM g; 3MP6 A; 5GAM h; 3RKW A; 1K9M R; 2JVV A; 1LOJ A; 3HRS A; 2DTO A; 1VQ7 T; 3OS1 A; 4RG8 A; 2PVD B; 2PVO B; 2RK2 A; 4IUT A; 5GMK i; 1CKB A; 3UF4 A; 2YUO A; 1MMA A; 3OMG A; 3KUF A; 1SSF A; 3A8H B; 2RQT A; 2AKL A; 1KD1 U; 3GNG A; 2BZX A; 4LN2 A; 4M7A E; 2V1Q A; 1VQL A; 6AT1 B; 1G8X A; 4OB0 B; 1VQ5 T; 4FW2 A; 3HFN A; 2FPD A; 1PNJ A; 4F17 A; 1MUZ A; 3PIP A; 2RJE A; 1YFN A; 4M7A F; 2MIO A; 1W1F A; 1TTH B; 3LGL A; 3N5B B; 5CK9 A; 1N6A A; 4KRT A; 4WF2 A; 3VRZ A; 1IZ6 A; 3C94 A; 3HP9 A; 4PK4 A; 1AOJ A; 2K3B A; 4M77 C; 2D8H A; 1NLO C; 4QT7 A; 4FSX A; 2CYZ B; 1KK7 A; 1SHG A; 3EGD B; 3CCV A; 3C0C A; 4DBQ A; 5CR2 A; 1AVZ C; 5L8R E; 2RQW A; 4E2F B; 3LLR A; 4C8Q C; 4L6V 5; 3M0P A; 3OYB A; 3OYG A; 3A5Z B; 5A0D A; 2RHI A; 4M75 A; 2CZ7 B; 2EGE A; 2M51 A; 4JUV A; 2DFU A; 1UJ0 A; 2DIL A; 2QAZ A; 1D3B A; 4CC3 A; 1M1G A; 3G4S T; 1B3Q A; 2W10 A; 1ZBJ A; 5KE2 A; 4BE1 A; 3CCL A; 2C0T A; 1YCY A; 2DL7 A; 3O8V A; 1PKS A; 5CKB A; 3G6E T; 1N8R R; 1QVG P; 5FW9 A; 2KRS A; 3VKI A; 4JRP A; 1YIT T; 5LL6 S; 1K76 A; 1M90 C; 3CME A; 3CCE Q; 2CSI A; 2FB7 A; 1HD3 A; 2FG0 A; 4AFZ C; 4X1V A; 1J3T A; 2H3E B; 1QVG A; 1K73 R; 2DYI A; 1NZ9 A; 1ZSG A; 1OOT A; 5LJ5 e; 4OF1 A; 1QP2 A; 4C0G A; 3M57 A; 2BZ8 A; 2GFA A; 4P5N A; 4E7L A; 2CH4 A; 1WNL A; 2XKO C; 1FYN A; 2XI9 A; 4C5G A; 1QWF A; 1QVF P; 5KYU A; 2J6K A; 2VGM A; 4XTU A; 2KNB B; 1U8R A; 1K4U S; 1NJI C; 1QVP A; 1TUD A; 2F2V A; 3V8J A; 5GJV B; 4JLG A; 3VUB A; 5LJ5 f; 1Y96 A; 4ZNX A; 4M75 G; 1QVF A; 3I5S A; 1AWO A; 4DEX A; 3JCM e; 4FU6 A; 2EQI A; 5LJ3 h; 4IUP A; 1K8A U; 2QA4 Q; 2YUP A; 3RIR A; 2HDA A; 5HKC A; 3OSS C; 4IUV A; 1YJ9 A; 4CI0 C; 2BZY A; 2FZK B; 1ZBX A; 1XOV A; 5D6W A; 1RAG B; 2YUN A; 2G3R A; 3VV0 A; 3CPW S; 1X27 A; 3ULR B; 3CCR A; 2K5I A; 1PD0 A; 3I56 A; 3JCM f; 1MMN A; 1KSW A; 5FU7 B; 4FYY B; 2JW4 A; 2KK4 A; 4LXC A; 3QO3 A; 3CCM A; 2DVE A; 1U5S A; 1KIK A; 1KC8 R; 5EG2 A; 2LT4 A; 1Q95 G; 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1VQ6 T; 2ZCF B; 1WHM A; 5A2Q E; 5D6Y A; 2VYT A; 4M4Z A; 4A4E A; 4QQG A; 2DF6 A; 3CC2 T; 4HCC A; 1OZ2 A; 1NBE B; 1RAC B; 2XDP A; 3KFV A; 1B34 B; 1Q86 R; 3JB9 I; 3OYY A; 4MMK A; 4ELY C; 2DYB A; 2F5K A; 3VYH B; 1WXU A; 3OYM A; 1M90 U; 2RB6 A; 3UT1 A; 2LQW A; 2A08 A; 3DB4 A; 3TQ7 P; 2LDM A; 1GCQ A; 3OYD A; 4PJJ A; 4KUD K; 1JU5 C; 4ME7 A; 4RTU A; 4II1 A; 1BIA A; 1S72 T; 1GBR A; 2NUP A; 2PNI A; 5CKE A; 4E7H A; 2E5Q A; 3M58 A; 2FRW A; 4BY6 C; 1W70 A; 3JB9 J; 2I2L A; 2P4T A; 1YJN Q; 1VQO A; 1IB8 A; 2OTJ T; 2FHD A; 4O5V A; 4X34 A; 1HJD A; 3RKX A; 2ED1 A; 1NJI U; 1G3S A; 1FXX A; 2CP3 A; 2KGT A; 3JB9 H; 1WHG A; 1KD1 C; 3JCM V; 1AT1 B; 1YIJ A; 4CC7 A; 3EFO A; 4M78 C; 2RHX A; 2CP7 A; 4QVC A; 4EMK A; 4F7U A; 4XTW A; 1VQK Q; 1OEB A; 2GCX A; 3QZ9 B; 1FMW A; 2DRM A; 2KY9 A; 2KYM A; 2QQA A; 3FRN A; 2A0F B; 1VUB A; 3CCQ T; 4PFP A; 1LNX A; 3OS0 A; 4BI4 A; 3OB9 A; 1CKA A; 3RR6 A; 2CZ0 B; 2DK3 A; 3DLM A; 3JCM d; 4J9G A; 5KYY A; 2QQR A; 1M3C A; 2BIV A; 5IXF A; 5GAM e; 4M75 E; 3CC4 Q; 2WSE E; 4M75 D; 3MPU B; 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