The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
ELVLALYDYQEKSPDEVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAYVKKLD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Understanding the polymorphic behaviour of a mutant of the alpha-spectrin SH3 domain by means of two 1.1 A structures
rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Gallus gallus
|
| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, brain
|
| total genus |
10
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-03-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UJ0 A; 3U23 A; 5I22 A; 3VS0 A; 2LMJ A; 1RLQ C; 3VRZ A; 2X3W D; 2LX7 A; 2KEA A; 2EPD A; 2KYM A; 1PHT A; 2KYB A; 1AZG B; 3ZL7 C; 1M27 C; 1PRM C; 3H0I A; 4J9B A; 3SHW A; 5GJV B; 1UE9 A; 2K2M A; 2FPD A; 2GQI A; 1QWE A; 2HBW A; 1X2Q A; 4OML A; 2AZV A; 4HVV A; 4IIM A; 2W0Z A; 1X27 A; 2E5K A; 3NMZ C; 2KRM A; 2A37 A; 4LN2 A; 2F2X A; 2DMO A; 1U3O A; 4J9I A; 2HCK A; 3FJ5 A; 3VS2 A; 1U5S A; 1PKT A; 2DVJ A; 1Z9Q A; 2KRS A; 3PVL A; 4J9G A; 1VYV A; 2KRO A; 4D8D A; 1NEG A; 2D8H A; 2NUZ A; 4RTU A; 2MCN A; 1NLP C; 2DRK A; 2VWF A; 4CC2 A; 1UDL A; 3M0R A; 2EKH A; 4HCK A; 2YUO A; 2L2P A; 4LUD A; 4OMM A; 2L3P A; 2C0O A; 2KRN A; 1G2B A; 2FG0 A; 1WXU A; 2RQR A; 1KJW A; 4J9D A; 4J9E A; 1YNZ A; 2EYZ A; 3REB B; 3M0Q A; 2DM1 A; 2CUD A; 2EGC A; 2LCS A; 5HCK A; 4E6R A; 1ZX6 A; 2OI3 A; 2J6O A; 3TSZ A; 1JXO A; 1GFC A; 1B3Q A; 3PVQ A; 2DL4 A; 1YP5 A; 1OEB A; 1YCS B; 2A36 A; 1MUZ A; 1J3T A; 3QWY A; 3M0P A; 2F2W A; 1RI9 A; 1PNJ A; 1YWP A; 2AK5 A; 2MOX A; 1ABO A; 1WLP B; 2EGA A; 1WDX A; 1UJY A; 4EIK A; 4A63 B; 1X2K A; 3C0C A; 4RUG A; 4ORZ A; 1BB9 A; 1WX6 A; 1GRI A; 4CC4 B; 2KXC A; 3CQT A; 1IO6 A; 2L0A A; 4AG2 C; 2EYX A; 2CT3 A; 1MV0 B; 2CSI A; 4RTW A; 5IHK A; 1UHC A; 5IHN A; 2BZY A; 1K0X A; 5ECA A; 3VS1 A; 5IH2 A; 1WXT A; 2K3B A; 2KXD A; 5I11 A; 2FRY A; 1TUC A; 2YUQ A; 4RTV A; 1AZE A; 2QDL A; 1B07 A; 2BZX A; 4QT7 A; 2KNB B; 1A0N B; 2OAW A; 3EG3 A; 3TSW A; 2ESW A; 2HSP A; 4JJB A; 4M4Z A; 1BU1 A; 2J05 A; 4JZ4 A; 2CH4 A; 4Z89 A; 2ROT A; 2W10 A; 3UA6 A; 2K9G A; 1E7O A; 4D8K A; 2LQN A; 1Z9Z A; 3I9Q A; 1BK2 A; 2K7A A; 3H41 A; 1SPK A; 1Y0M A; 2MIO A; 4F14 A; 1XOV A; 1AWJ A; 2DL3 A; 2O9V A; 4WCI A; 1UFF A; 2ECZ A; 3TVT A; 3VRY A; 2A28 A; 4RTT A; 1MV3 A; 1GL5 A; 2GTJ A; 2DF6 A; 2J7I A; 1FMK A; 2BZ8 A; 1JEG A; 1HD3 A; 4AFZ C; 1OPK A; 1GBR A; 3JV3 A; 1RLP C; 1YWO A; 3M0S A; 2PTK A; 1VA7 A; 2EQI A; 4AG1 C; 2EW3 A; 2RF0 A; 3THK A; 1X6G A; 2DYB A; 2ED1 A; 1ZUY A; 2L3Q A; 2FRW A; 2O31 A; 1K1Z A; 4JJD A; 2DNU A; 1VYT A; 2X3X D; 4AFS C; 1GFD A; 1OPL A; 1JXM A; 1ZUK A; 1QKX A; 3O5Z A; 2O88 A; 2JTE A; 1AWO A; 1I1J A; 2CT4 A; 2ENM A; 1H92 A; 1H3H A; 3VS4 A; 1NYG A; 2B86 A; 2CUB A; 1ZUU A; 2LP5 A; 3VS7 A; 4HVW A; 2LQW A; 3EHR A; 1K0S A; 1AD5 A; 3UF4 A; 1G83 A; 2C0T A; 2JS0 A; 4DEX A; 4OMN A; 2D1X A; 2JXB A; 1TG0 A; 5IHI A; 2LJ0 A; 2LNH B; 4GLM A; 1UUE A; 4J9H A; 1SHF A; 3VS6 A; 2EGE A; 4RTX A; 2CDT A; 1SEM A; 2YUP A; 2FEI A; 4LE9 A; 1TUD A; 1WFW A; 4DEY A; 1I07 A; 2ED0 A; 5EC7 A; 2H8H A; 2M51 A; 2L3S A; 1AWW A; 1UG1 A; 2YT6 A; 1SHG A; 4OMP A; 1SRM A; 3H0F A; 1W6X A; 2IIM A; 3UAT A; 1UEC A; 2DE0 X; 5FWC A; 2SEM A; 2CH4 W; 3EG1 A; 1S1N A; 1GCP A; 1ZBJ A; 1KIK A; 2VVK A; 1LCK A; 4AFQ C; 3R6N A; 1T3S A; 1AEY A; 2KBT A; 1QWF A; 4LNP A; 2CSQ A; 4Z8A A; 5IXB A; 1YN8 A; 1EFN A; 1N5Z A; 1WYX A; 2C0I A; 1T0H A; 3I5R A; 1E6H A; 1QKW A; 3NHN A; 2NWM A; 2YDL A; 1HSQ A; 2DA9 A; 3RNJ A; 4FSS A; 1ZLM A; 2DL7 A; 1UHF A; 2YSQ A; 2RQV A; 4J9C A; 1HJD A; 3EGU A; 1JU5 C; 2F2V A; 2RPN A; 2KGT A; 3NPF A; 1I0C A; 4CC7 A; 2RQT A; 3RBB B; 1JQQ A; 4ESR A; 4Z88 A; 2DL8 A; 1WI7 A; 1KSW A; 2ABL A; 2EBP A; 1V1C A; 3UA7 A; 1CKB A; 2JMA A; 1ABQ A; 2GTO A; 2AZS A; 5IXF A; 3EG2 A; 1W1F A; 2J6K A; 2JS2 A; 1PKS A; 2K6D A; 2JMC A; 1X69 A; 1WIE A; 1PRL C; 2J06 A; 1M8M A; 2XMF A; 4J9F A; 4RTZ A; 1K9A A; 3QWX X; 4JPB W; 4LUE A; 4HXJ A; 4R0K A; 1T0J A; 4AFU C; 1AVZ C; 1OV3 A; 2RMO A; 2RN8 A; 3LH5 A; 4ZNX A; 2KR3 A; 2ROL A; 4CC3 A; 1BBZ A; 2JT4 A; 1X43 A; 1M3B A; 1M3C A; 3EG0 A; 2AKK A; 1UGV A; 3ULR B; 2I0N A; 1K76 A; 2DBK A; 2YUN A; 2SRC A; 2FO0 A; 2JM8 A; 1M3A A; 2EYY A; 2D8J A; 3I35 A; 1VYU A; 3VS5 A; 2GGR A; 2KT8 A; 1GBQ A; 1ZSG A; 2EYW A; 2FPF A; 2FPE A; 2DIL A; 1Y57 A; 1WA7 A; 2BTT A; 2JM9 A; 4OMO A; 2PZ1 A; 2K79 A; 1SRL A; 1AWX A; 1GCQ A; 4F16 A; 4X1V A; 4GBQ A; 3I5S A; 3IQL A; 5GJW B; 2LJ3 A; 1NLO C; 2HEQ A; 2LJ1 A; 2GNC A; 4OMQ A; 1T3L A; 1WXB A; 1NM7 A; 1FYN A; 3KFV A; 2V1R A; 3SEM A; 1W70 A; 2M0Y A; 1X6B A; 2V1Q A; 2VKN A; 2A08 A; 3PE0 A; 4F17 A; 1H8K A; 1UTI A; 2DBM A; 2DRM A; 4HVU A; 4KRT A; 5FW9 A; 1E6G A; 3VS3 A; 1JO8 A; 1NEB A; 2P4R A; 2AKL A; 1GCQ C; 1K4U S; 3M0U A; 2EVR A; 2KT1 A; 3NGP A; 3H0H A; 4JJC A; 3REA B; 1NYF A; 2OJ2 A; 4RTY A; 1PWT A; 4IIO A; 3A98 A; 2DJQ A; 2RQW A; 2LZ6 B; 1NG2 A; 1RUW A; 2CRE A; 2DX1 A; 5FWB A; 3EHQ A; 2D0N A; 1ARK A; 1U06 A; 2O9S A; 2DL5 A; 5L23 A; 1SSH A; 4JZ3 A; 1AOJ A; 1OOT A; 1M30 A; 2RQU A; 2GBQ A; 2KE9 A; 2PNI A; 2JW4 A; 1CSK A; 2HDA A; 2J6F A; 3M0T A; 4K11 A; 1CKA A; 2O2O A; 2DLP A; 2RNA A; 3GBQ A; 2G6F X; 4Y92 A; 1KFZ A; 1QLY A; 1QCF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CCV T; 3EGX A; 4CRI A; 3U23 A; 3BW1 A; 3BE3 A; 4WTO B; 4J6W A; 1RLQ C; 2RHI A; 3M4G A; 1BI0 A; 2X3W D; 2KEA A; 2EPD A; 1C0M A; 1PRM C; 1MMG A; 2DTI A; 2R57 A; 4J9B A; 3E19 A; 4OB2 B; 1VQ9 A; 2RJD A; 1B7T A; 2K2M A; 5GAO l; 1VQ8 Q; 1JBM A; 3CCQ Q; 1BI1 A; 3MEW A; 3RR6 A; 3RES A; 3OW2 P; 3OBW A; 4A4K A; 2AZV A; 4XTW A; 3OQ5 A; 3M54 A; 4IIM A; 4D6W A; 2E10 A; 2XHC A; 4ELZ C; 2DXU A; 2BE9 B; 1X27 A; 2ZPH B; 3CCJ Q; 1KQS P; 2D6F A; 3CCS A; 3J7A F; 4BE1 A; 5GAM h; 4Y91 A; 4PJO D; 2A37 A; 2QXF A; 2YLC A; 2F2X A; 2DMO A; 4J9I A; 2RD1 A; 2QGG A; 4M7D F; 1PKT A; 3KXT A; 3CD6 T; 2DVJ A; 3MP6 A; 2QQR A; 4J9G A; 4JRK A; 5IN1 A; 4MDX A; 4N4G A; 3G4S A; 2COY A; 1BIA A; 4D8D A; 2VAS A; 1NLP C; 5GAN 7; 2DRK A; 4CC2 A; 4BDY A; 3CMA T; 3E1S A; 1TOV A; 2EKH A; 2YUO A; 2L3P A; 5HK3 A; 3GNF B; 1N9S A; 1KJW A; 2PU9 B; 4XU3 A; 1SG5 A; 5FU7 B; 2DM1 A; 2EGC A; 2RK1 A; 4QVZ A; 4M78 B; 1GFC A; 3I56 A; 2DK3 A; 3SWN A; 1MHN A; 3CCU T; 1EZZ B; 1OEB A; 4OVA A; 2EWN A; 5LJ5 e; 1VQM T; 3MEV A; 5HY6 A; 2EYQ A; 1J3T A; 5HKC A; 1S72 A; 1R77 A; 4C8Q F; 1YJ9 T; 1YWP A; 1WDX A; 4F7U G; 2QTV A; 4J7I A; 4BI8 B; 4A63 B; 1BB9 A; 1H3Z A; 5GAM f; 4Q5W A; 3BDL A; 2CZ1 B; 3VU3 C; 4AG2 C; 4EMK A; 3SWN C; 1RAD B; 2BZY A; 1FMV A; 5ECA A; 3VS1 A; 4KUD K; 1LPL A; 4OB3 B; 2KXD A; 4FM4 B; 2E4H A; 4C5H A; 2E5Q A; 3GF5 A; 3A5Z B; 2IG0 A; 4QT7 A; 4XTZ A; 5KYY A; 4RG8 A; 3JCM d; 3TSW A; 1IB8 A; 3L2V A; 4QKU A; 3AHU A; 4E7K A; 4JZ4 A; 3I55 T; 4Z89 A; 4EMK C; 3UA6 A; 1OX8 A; 1RI0 A; 1HYO A; 2RH2 A; 2IVW A; 4BY6 B; 1M2V A; 4F14 A; 1D09 B; 2K5L A; 4PJO F; 1UFF A; 2DO3 A; 1OZ3 A; 2CP7 A; 3VRY A; 4C0G A; 1BCO A; 2E3I A; 2OTL Q; 4AFZ C; 2KK4 A; 1GBR A; 1RLP C; 1VA7 A; 2DPP B; 1PCX A; 3NFC A; 2EW3 A; 3VUB A; 2L3Q A; 3CEY A; 3OYN A; 3O8V A; 3OMG A; 4M7A A; 1D3B A; 3O5Z A; 5J3B A; 1I1J A; 5GAN 2; 1H92 A; 1R8O B; 2QQA A; 1NYG A; 4M77 A; 5KYN A; 2KMT A; 1M9S A; 2OTJ Q; 2V8I A; 1KHI A; 4HVW A; 3EFR A; 3EHR A; 1VQK T; 2HQE A; 2RM4 A; 2EJ9 A; 4OMN A; 2B8A A; 2D1X A; 4ME7 A; 2ZZD A; 2LJ0 A; 2LNH B; 4J9H A; 1UUE A; 3VS6 A; 2CDT A; 2HBP A; 1QCN A; 5I2M A; 2WSC E; 1N27 A; 1KK7 A; 4M7A C; 2E64 A; 1IZ6 A; 1SRM A; 4M77 C; 5AYF A; 3M58 A; 3UAT A; 2R58 A; 3EG1 A; 2VGM A; 1WGS A; 1LNX A; 1LCK A; 4VUB A; 1I81 A; 4PFO A; 3S3M A; 3PMT A; 4QQD A; 3UPU A; 2E6N A; 3JCM W; 1QWF A; 4C92 D; 2CSQ A; 2DKG A; 2CZ0 B; 5C0M A; 2K4Y A; 4PL6 A; 4IKF A; 1N5Z A; 2C06 A; 1WYX A; 2DER A; 1AT1 B; 3CCM Q; 3CME Q; 1T0H A; 3NHN A; 3QHS A; 5CO7 A; 2DVE A; 3LYI A; 2Y90 A; 2YDL A; 1HSQ A; 4NS5 A; 1MND A; 2OTL T; 1UHF A; 2RQV A; 4F7U F; 3NPF A; 1WHM A; 4ESR A; 1PSF A; 4PFP A; 1YIJ A; 3BFM A; 1WI7 A; 5GAO n; 4M7D A; 2ABL A; 3GNG A; 1ABQ A; 3G7Z A; 2GTO A; 2DEU A; 3M9Q A; 3EG2 A; 1W1F A; 3CCE T; 2XID A; 2K6D A; 1PRL C; 1VQ9 T; 1MMD A; 1IRX A; 4RTZ A; 2FB7 A; 1K9A A; 2BIV A; 4KUI A; 2JN0 A; 4C5G A; 2OTJ T; 3JB9 I; 4AFU C; 2MPX C; 3TRE A; 3QZ9 B; 1OV3 A; 2QA4 A; 2RN8 A; 3QDR B; 1D0X A; 3V7R A; 3LH5 A; 1YI2 Q; 3CC4 A; 2CKK A; 3JCM P; 1X43 A; 3FJP A; 1M3B A; 2Y4Y A; 2ZPG B; 4M7D C; 4A4F A; 2DTO A; 4OGE A; 4C0D C; 2EYY A; 2CP2 A; 4L5G A; 4B6M A; 1GBQ A; 2GF7 A; 4R55 A; 1TH7 A; 1EX4 A; 3RER A; 1VIF A; 3OS5 A; 3X24 B; 5A0L A; 2PVO B; 1YHQ Q; 2K79 A; 2NUP B; 4AMC A; 2YLB A; 4BB7 A; 3INZ A; 4M75 F; 5LJ3 f; 1KC8 R; 4IUV A; 3L1A A; 3GLX A; 1Q7Y R; 2XU8 A; 4GBQ A; 2GFU A; 3I56 T; 3X28 B; 2ZPE B; 2E1H A; 2GNC A; 4OMQ A; 3OY9 A; 4C92 F; 4C8Q C; 1NM7 A; 3GIB A; 1FYN A; 3KFV A; 2QEX Q; 2A0F B; 1S72 T; 2M0Y A; 4LDX A; 3S6W A; 2MWP A; 4XU2 A; 1WHJ A; 2QYZ A; 2HMA A; 3JCM h; 3UT1 A; 5FW9 A; 4XTU A; 2DFU A; 2LQ8 A; 1C1A A; 4C0F A; 1Q86 C; 2KT1 A; 4JJC A; 1BKB A; 4OMF B; 3ZBD A; 4M78 G; 4ELY C; 4PJO A; 1NG2 A; 3FRN A; 4M7A E; 1VQ6 Q; 4DBH A; 3EH2 A; 5GAN e; 1JJ2 S; 3EHQ A; 2DD5 A; 1Q86 U; 1SSH A; 3G6E Q; 4M77 E; 2NLU A; 4FL6 A; 2FL7 A; 2A7Y A; 2GBQ A; 2KE9 A; 2PNI A; 5CCA A; 3OYA A; 4BE2 A; 2HDA A; 2J6F A; 3JRZ A; 3LGL A; 2FZK B; 3DKM A; 3MET A; 5D6W A; 2DLP A; 5L8R E; 4IUR A; 1VQP Q; 1VQ8 A; 2JNG A; 3QYG B; 2CS7 A; 4PJO C; 2DZC A; 1K8A R; 5I22 A; 2VC8 A; 2LMJ A; 5LJ5 j; 4IUT A; 3EFO A; 2LX7 A; 4PLL A; 4J7F A; 2KYB A; 3CCJ A; 5LJ5 d; 1M27 C; 3H0I A; 3SHW A; 3OS2 A; 1YIT T; 1UE9 A; 3BDU A; 1QP3 A; 3C94 A; 5FRO A; 3MHX A; 2RJF A; 4LD6 A; 2I2L A; 5CQX A; 3JCM f; 1NZ9 A; 1N9R A; 2D9T A; 3E2U A; 3PMI A; 3CCV Q; 4UC4 A; 4JDS A; 2W0Z A; 4M78 D; 4DOW A; 2E5K A; 2KRM A; 2EQM A; 3LGF A; 2M02 A; 2CP0 A; 1U3O A; 3FJ5 A; 2DXB A; 3VS2 A; 3HL8 A; 3SWN B; 2KRS A; 3PVL A; 2KRO A; 1Q81 C; 2EQJ A; 2EQK A; 2RHX A; 2LT1 A; 2KRN A; 1WXU A; 2RQR A; 4J9E A; 2LCS A; 1Q7Y C; 1ZX6 A; 2J6O A; 3TSZ A; 1Q81 U; 5GAO p; 1B3Q A; 4RCB A; 3PVQ A; 3CXC S; 4M7D E; 4EMK B; 3HTR A; 2A3L A; 2A36 A; 2QAZ A; 1VQ6 T; 4BI3 A; 3MJX A; 2F69 A; 3CMA Q; 1X01 A; 1OX9 A; 1P92 A; 3OYH A; 1VQ4 A; 1Q7Y U; 2F2W A; 2GFA A; 1OYX A; 2MOX A; 4F7U A; 3A8G B; 2EGA A; 3MP1 A; 1UJY A; 8AT1 B; 5KYY B; 2EAY A; 4A4E A; 1WX6 A; 4QQG A; 5DLQ E; 3CC2 A; 3MKD A; 2MYS A; 3C12 A; 2L0A A; 1X75 C; 3CCU Q; 1IXD A; 1G3S A; 1VQM Q; 2CSI A; 2ZPI B; 4RTW A; 1KD1 C; 3PGG A; 5IHN A; 3EAE A; 1Q82 R; 3QII A; 4KGZ B; 1M1G A; 4J5Y A; 2VGN A; 1I5L A; 4C8Q E; 5I11 A; 1M2V B; 3QO3 A; 1K9M R; 3J80 E; 4OB1 B; 2BZX A; 1A0N B; 1KD1 U; 3EG3 A; 4A53 A; 4M4Z A; 4FYY B; 2ROT A; 4JUV A; 1Z9Z A; 1K8A C; 1VQL T; 1O9S A; 1SPK A; 1Y0M A; 2X4Y A; 1UGP B; 1YIJ T; 1M8V A; 1AWJ A; 2DL3 A; 4E7S A; 2ECZ A; 3TVT A; 2LVM A; 3CCR A; 2XD0 A; 4E47 A; 1MV3 A; 3VYH B; 4M7A B; 2DF6 A; 3HPW A; 1FMK A; 4MZM A; 1D3B B; 2WSF E; 1K8A U; 1JEG A; 2DZ9 A; 3I55 Q; 2FVU A; 4ZGJ B; 1YWO A; 2NUT A; 3CPW S; 4HT8 A; 2QA4 T; 3M0S A; 2EQI A; 1UGQ B; 4M75 A; 1ZHI A; 2RF0 A; 3OSV A; 4ZTJ A; 2DEQ A; 2FZC B; 2ED1 A; 3CC4 T; 1ZUY A; 3URG A; 1XNI A; 4PJO E; 1VQO A; 5CKB A; 4OGC A; 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