The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
57
|
structure length |
57
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Chain Sequence |
KELVLALYDYQEKSPDEVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAYVKKLD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Understanding the polymorphic behaviour of a mutant of the alpha-spectrin SH3 domain by means of two 1.1 A structures
rcsb |
| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, brain
|
| molecule tags |
Signaling protein
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| source organism |
Gallus gallus
|
| total genus |
11
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-03-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2EBP A; 2BZX A; 3REB B; 2KEA A; 5GJV B; 2RN8 A; 1SPK A; 2W10 A; 1KIK A; 1X43 A; 1ZLM A; 2PTK A; 2D8H A; 3IQL A; 1BK2 A; 1MV3 A; 2DF6 A; 1RI9 A; 1AZG B; 1W70 A; 3H0I A; 1YN8 A; 1FYN A; 2B86 A; 2CRE A; 1FMK A; 2JM8 A; 1KFZ A; 2O9V A; 1ZUK A; 2A28 A; 4RTU A; 2KYB A; 1NYG A; 2YDL A; 2JMC A; 1G83 A; 1G2B A; 1Z9Q A; 2L2P A; 2OAW A; 2CUB A; 2O9S A; 4AFS C; 1K76 A; 4AFU C; 2RQW A; 3VS5 A; 4J9C A; 1UDL A; 3EG1 A; 1AWJ A; 2CH4 A; 2EYX A; 1N5Z A; 1VYV A; 4CC4 B; 3M0T A; 4JJB A; 4AFQ C; 2DBM A; 2CH4 W; 2RF0 A; 5ECA A; 3TVT A; 3UA6 A; 1JQQ A; 4OMO A; 2MCN A; 2FRY A; 1H92 A; 2CUD A; 2KT8 A; 2EGC A; 1WI7 A; 5FWC A; 1M27 C; 3PE0 A; 3O5Z A; 1AWO A; 1ZUU A; 3ULR B; 1WA7 A; 2O2O A; 4HCK A; 1LCK A; 2FG0 A; 4CC7 A; 1GL5 A; 1QLY A; 4CC2 A; 3UA7 A; 5IHK A; 1K0S A; 1AWX A; 4J9I A; 2D1X A; 1ZUY A; 2L3S A; 2RMO A; 4LUD A; 2JW4 A; 2V1R A; 2DA9 A; 2GNC A; 2EW3 A; 2PNI A; 3I5S A; 4E6R A; 3VS0 A; 1UUE A; 2SRC A; 2I0N A; 5FW9 A; 2ED1 A; 1M3C A; 1T3L A; 3I9Q A; 1T0J A; 1QKW A; 4R0K A; 2J7I A; 2KRS A; 4OMN A; 2V1Q A; 1H3H A; 2DBK A; 4RTT A; 2J06 A; 3EGU A; 4HVW A; 1KSW A; 2LCS A; 3RBB B; 2DNU A; 2RNA A; 2ESW A; 1K9A A; 3VRY A; 1B07 A; 1PKT A; 1ZBJ A; 2IIM A; 4Z89 A; 1E7O A; 2AKL A; 4D8D A; 1K0X A; 2DL5 A; 3LH5 A; 1Y0M A; 2RQR A; 1X2Q A; 2DL3 A; 1UHF A; 2FEI A; 4LE9 A; 3PVL A; 2FO0 A; 3NGP A; 4M4Z A; 1X69 A; 2DRM A; 3C0C A; 2ENM A; 5FWB A; 2F2W A; 1JEG A; 2EGE A; 2KBT A; 1U06 A; 1I0C A; 2L3Q A; 3EHR A; 5I11 A; 1K1Z A; 2LX7 A; 1VA7 A; 2CT3 A; 2E5K A; 1SHG A; 4JZ4 A; 1GFD A; 3NHN A; 2ECZ A; 2EQI A; 1W6X A; 2K2M A; 3UF4 A; 4HXJ A; 2J6K A; 5IH2 A; 1WXU A; 3M0Q A; 2RQV A; 4HVU A; 4RUG A; 4RTY A; 4Z88 A; 3GBQ A; 4RTV A; 1ZSG A; 1H8K A; 1T0H A; 3QWY A; 2KGT A; 4JJC A; 3JV3 A; 1UHC A; 1AD5 A; 2JTE A; 4GBQ A; 2DVJ A; 2K9G A; 4D8K A; 4J9H A; 3UAT A; 2YUP A; 5IXB A; 2EYZ A; 5L23 A; 4EIK A; 3EG0 A; 1QKX A; 2L3P A; 1KJW A; 4RTZ A; 1EFN A; 1JU5 C; 1HSQ A; 1VYT A; 4WCI A; 3M0S A; 1SRM A; 2LMJ A; 4FSS A; 4GLM A; 1BB9 A; 2NWM A; 1NYF A; 1YWO A; 4LUE A; 1WDX A; 2RPN A; 2A36 A; 2LJ0 A; 1AOJ A; 1W1F A; 2H8H A; 2CDT A; 5HCK A; 4OML A; 4CC3 A; 3VS6 A; 4ESR A; 3EHQ A; 1YNZ A; 3EG2 A; 4ORZ A; 3SEM A; 2RQT A; 2LJ3 A; 2C0T A; 2D0N A; 1K4U S; 1GBR A; 3M0R A; 1WYX A; 2JM9 A; 2LNH B; 2DMO A; 2YSQ A; 1GBQ A; 1T3S A; 3VS2 A; 4J9E A; 3VS7 A; 1RUW A; 2KYM A; 4IIM A; 4JZ3 A; 3EG3 A; 1M30 A; 1WLP B; 2EPD A; 1GFC A; 3I35 A; 5IXF A; 1CKB A; 4RTW A; 5I22 A; 2LP5 A; 4OMP A; 2BTT A; 3U23 A; 1NLO C; 1ABQ A; 2DM1 A; 2GTJ A; 1OOT A; 2K6D A; 2DL8 A; 4X1V A; 1HD3 A; 1B3Q A; 2O31 A; 2MOX A; 3VS1 A; 2ED0 A; 2PZ1 A; 1ZX6 A; 2EGA A; 3TSW A; 1OPL A; 2C0I A; 4RTX A; 3ZL7 C; 1AWW A; 1UGV A; 1GCQ C; 1UE9 A; 2X3W D; 4AG2 C; 2HEQ A; 2GQI A; 1SRL A; 1UFF A; 1SHF A; 1U3O A; 1X27 A; 1S1N A; 1I07 A; 3H41 A; 1ABO A; 2NUZ A; 2K7A A; 2KNB B; 2P4R A; 1JXO A; 5IHI A; 2K79 A; 2ROT A; 2FPF A; 1CSK A; 2DYB A; 2OI3 A; 1YWP A; 1WX6 A; 4J9G A; 3THK A; 1X6B A; 2DL4 A; 3NMZ C; 1NLP C; 4QT7 A; 3R6N A; 1M3A A; 1PHT A; 2KRN A; 2XMF A; 1NG2 A; 1AEY A; 2LZ6 B; 1X6G A; 1TUD A; 1OPK A; 1QWE A; 2JS0 A; 4F16 A; 1JXM A; 2J05 A; 1GCQ A; 3A98 A; 2J6O A; 1QCF A; 1NEB A; 2YUN A; 4DEY A; 3SHW A; 2VVK A; 4LN2 A; 4F14 A; 1UG1 A; 1SSH A; 2M51 A; 4LNP A; 2DL7 A; 1TUC A; 2DX1 A; 1BBZ A; 2LQW A; 1Y57 A; 2HDA A; 2JT4 A; 3VRZ A; 2ROL A; 1MUZ A; 2ABL A; 1RLQ C; 1E6H A; 1UEC A; 1WXT A; 2AKK A; 4JPB W; 3RNJ A; 1QWF A; 2VKN A; 2D8J A; 3FJ5 A; 2BZ8 A; 4K11 A; 2F2V A; 1WFW A; 4J9F A; 4JJD A; 2W0Z A; 2QDL A; 3VS3 A; 2C0O A; 4OMM A; 1CKA A; 1M3B A; 2KXC A; 2JMA A; 2KRO A; 2YUQ A; 3M0U A; 2YUO A; 3NPF A; 4Z8A A; 2F2X A; 1BU1 A; 2YT6 A; 1PNJ A; 2GTO A; 2CSQ A; 3M0P A; 3PVQ A; 1WIE A; 3KFV A; 4F17 A; 2AZV A; 5GJW B; 2OJ2 A; 2X3X D; 2DIL A; 1GRI A; 1UJ0 A; 2KR3 A; 2VWF A; 1YP5 A; 1ARK A; 2CSI A; 1V1C A; 4HVV A; 1AVZ C; 2O88 A; 2CT4 A; 1IO6 A; 1MV0 B; 4DEX A; 1JO8 A; 2KE9 A; 1PRM C; 1TG0 A; 1Z9Z A; 2MIO A; 2RQU A; 1NEG A; 4OMQ A; 3H0F A; 3I5R A; 2EKH A; 1X2K A; 2JXB A; 4A63 B; 5IHN A; 4AFZ C; 2HBW A; 2AZS A; 2KT1 A; 1I1J A; 3CQT A; 1UJY A; 4Y92 A; 2LJ1 A; 1U5S A; 1OV3 A; 2DJQ A; 3H0H A; 1UTI A; 2DLP A; 4J9B A; 1WXB A; 2KRM A; 2BZY A; 2A37 A; 4KRT A; 2FRW A; 2JS2 A; 2FPE A; 3TSZ A; 1HJD A; 3VS4 A; 2DE0 X; 2GBQ A; 2HSP A; 1XOV A; 3REA B; 2AK5 A; 4AG1 C; 2A08 A; 2J6F A; 2M0Y A; 2DRK A; 3QWX X; 2HCK A; 1J3T A; 1SEM A; 2GGR A; 2LQN A; 1GCP A; 1AZE A; 1OEB A; 1PRL C; 2K3B A; 2KXD A; 1E6G A; 2SEM A; 1M8M A; 1RLP C; 1YCS B; 2EYY A; 2FPD A; 1VYU A; 2EVR A; 1PKS A; 1NM7 A; 4J9D A; 1A0N B; 2G6F X; 4IIO A; 2L0A A; 2EYW A; 1PWT A; 4ZNX A; 5EC7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1V29 B; 1D3B A; 1G3S A; 5GJV B; 1KIK A; 1X43 A; 3E9F A; 4HT9 A; 4M75 D; 1BK2 A; 1MV3 A; 4A53 A; 1VQP T; 4ZTJ A; 4C0D B; 2QEX A; 1YN8 A; 2B86 A; 1FMK A; 3INZ A; 4LXC A; 2KY9 A; 2QA4 T; 4J6W A; 1NYG A; 1QMC A; 1G83 A; 3JCM h; 4OF1 A; 3SD4 A; 4PK4 A; 2RQW A; 3VS5 A; 4J9C A; 5I2M A; 1YIT A; 1AWJ A; 3M0T A; 1NJI U; 2RHX A; 4FW2 A; 3UA6 A; 1JQQ A; 2MCN A; 4OB1 B; 4QVC A; 1RAI B; 3A8L B; 1Q95 G; 2DPP B; 2KT8 A; 4N4H A; 3R6O A; 2MPX C; 4FCY A; 1NBE B; 1I4K 1; 5GAM f; 5CAI A; 3ULR B; 5LL6 S; 5D7U A; 2XG8 D; 1YHQ T; 5GAO l; 1YIJ A; 1AWX A; 4KGX B; 4C0F A; 2LT4 A; 1VQK T; 4LUD A; 2R5M A; 2JW4 A; 2V1R A; 2DA9 A; 3P8D A; 5LJ5 g; 2EW3 A; 1NJI R; 2HBP A; 4E47 A; 4PJN A; 2F1L A; 1Q82 U; 3LWH A; 1M3C A; 1SSF A; 1NE8 A; 1IRE B; 4KH1 B; 1VQ5 T; 5CKH A; 3FIF A; 4D6W A; 4R0K A; 2J7I A; 2QK0 A; 4LDY A; 1H3H A; 1M2O A; 1M1K C; 1ZSZ B; 3OMC A; 4ATO A; 4HVW A; 3RBB B; 1VIF A; 2EQM A; 2RNA A; 2ESW A; 4ELY C; 1ZBJ A; 2LQ8 A; 2IIM A; 2MI6 A; 1G5V A; 2DL5 A; 2HKN A; 3GP8 A; 1K9M U; 4RG2 A; 1X75 C; 2KAF A; 3CC7 T; 1M4Z A; 3DKM A; 3PVL A; 2RI2 A; 3GPL A; 3NGP A; 3PMI A; 3C0C A; 1ZA1 B; 3MEA A; 4F7U F; 5FWB A; 2F2W A; 1TTH B; 2DXC A; 3CCV T; 1Q82 R; 2F5K A; 4JS5 A; 2L3Q A; 3EHR A; 4A4E A; 2P0K A; 2CT3 A; 1OI1 A; 4RMO A; 4JZ4 A; 4XTZ A; 2E3H A; 1GFD A; 3FLG A; 4B9X A; 1W6X A; 2K2M A; 1K8A R; 4M7A E; 4IUT A; 2L3R A; 1V76 A; 1WXU A; 1NJI C; 3JCM g; 1M9S A; 3HP9 A; 4LDU A; 4PLI A; 4Z88 A; 3TU4 K; 3CCE Q; 1VQN Q; 1K9M R; 1KQ1 A; 2COZ A; 2KGT A; 2WSF E; 5FU7 B; 1MMN A; 3CBM A; 1AD5 A; 2JTE A; 2ZPF B; 3HRU A; 4GBQ A; 2DVJ A; 4D8K A; 1BKB A; 4RCC A; 3UAT A; 5IXB A; 1FMW A; 2VXF A; 3BW1 A; 3ME9 A; 4A4H A; 2R58 A; 4IUQ A; 2LRQ A; 1KJW A; 2E3I A; 4XU2 A; 2CP6 A; 1JU5 C; 4WCI A; 3DLL A; 3SWN A; 2K5F A; 2VGM A; 1BB9 A; 1NYF A; 2PUO B; 1BI1 A; 2A36 A; 3CC4 A; 2P0Q A; 2QA4 A; 2H8H A; 2CDT A; 5HCK A; 2CP3 A; 1GXI E; 5GAN d; 3X28 B; 4E7S A; 4M77 G; 3EG2 A; 1Q82 C; 4B6M A; 2P84 A; 4FL6 A; 1MHN A; 2MMP A; 1KQS A; 3CC2 T; 4PFZ A; 3C94 A; 4A4G A; 1Y96 A; 4C92 G; 1JB0 E; 4F7U B; 1K4U S; 3S6W A; 1VQ6 Q; 3M0R A; 4C92 A; 2DYI A; 2X35 A; 2L89 A; 2AIR B; 2JM9 A; 2DMO A; 3CXC A; 1VQM A; 4M7A C; 2JTM A; 2KSS A; 5FLX E; 4PJO G; 1MNE A; 2DK3 A; 3D7S B; 4J9E A; 2X4J A; 3CCR Q; 1RUW A; 1YJW A; 4BAC A; 1OYX A; 1K9M C; 4M7D G; 1UGR B; 3CCQ A; 3I35 A; 5IXF A; 3WVE B; 3VV0 A; 3CMA T; 2LP5 A; 2EFI A; 4OMP A; 4J5Y A; 1NLO C; 2X4X A; 2YXY A; 2GTJ A; 1OOT A; 2VYT A; 2DL8 A; 1B3Q A; 2O31 A; 3OY9 A; 3J80 E; 2ED0 A; 2PZ1 A; 3JCM d; 3TSW A; 5KE3 A; 2B8A A; 4N0A A; 1W2B P; 3G4S A; 2C0I A; 2QGF B; 3CPW A; 4RTX A; 3ZL7 C; 2M1H A; 1AWW A; 2XKO C; 1K73 U; 1UGV A; 3FJP A; 1VQ8 A; 2LNV A; 1UE9 A; 1Q86 U; 4ZTF A; 1R8O B; 3EG9 B; 4AG2 C; 1X01 A; 4HCC A; 1N6A A; 5GAN e; 3BY7 A; 2NUZ A; 2K7A A; 4V2S A; 2K79 A; 4LDV A; 3OYK A; 3OYY A; 2FPF A; 4OB3 B; 1CSK A; 3PNW C; 3CCJ Q; 3EAE A; 2EQK A; 4J83 A; 2KRN A; 2Y90 A; 3H8Z A; 3JB9 I; 4IUV A; 5GAN f; 1WGS A; 5KCH A; 2JS0 A; 2NUP A; 1U1T A; 3JB9 G; 2PVD B; 2JNG A; 1GCQ A; 3A98 A; 1VQ7 A; 3SHW A; 1M2V B; 1QVF A; 1K73 R; 4E7K A; 2M51 A; 3CCV A; 4OGC A; 1Q86 R; 5HKC A; 1BBZ A; 2FVU A; 2HDA A; 3VRZ A; 2JT4 A; 4M77 C; 3UDC A; 1MUZ A; 4C92 C; 5CO7 A; 1RLQ C; 1VOM A; 5GAM h; 1RAD B; 1E6H A; 1UEC A; 3TRE A; 3OYH A; 4X9D A; 5M9O A; 1MGQ A; 3JCM e; 5A2Q E; 4PJO C; 4E7J A; 1XQH A; 2F2V A; 1WFW A; 2E4H A; 2W0Z A; 2QDL A; 3GNF B; 1B7T A; 1KC8 U; 2C0O A; 5KYY B; 3AHU A; 2KXC A; 2KRO A; 4M7D C; 2YUO A; 2F2X A; 4IUP A; 2GTO A; 5GAM j; 4MZT A; 2CSQ A; 4QQ6 A; 1D1A A; 2YHT A; 2OJ2 A; 2X3X D; 1GRI A; 1UJ0 A; 2VWF A; 1YP5 A; 2E41 A; 1VQ4 T; 4KUI A; 4EMH A; 1VQO Q; 4DEX A; 5IN1 A; 1TG0 A; 3M58 A; 1Z9Z A; 2RQU A; 5D6Y A; 4II1 A; 4PKC C; 3J7A F; 4EMG A; 4OMQ A; 1LVK A; 4JRQ A; 1OQK A; 2M0O A; 2EKH A; 4LD9 K; 2JXB A; 1JJ2 P; 5A0D A; 1OZ2 A; 1UEB A; 2AZS A; 1YBY A; 1KC8 R; 1I1J A; 1KHI A; 3CQT A; 1RAC B; 4Y92 A; 1OV3 A; 3H0H A; 4OMF B; 3QXE B; 4EMK A; 4HCZ A; 2RA2 A; 3CBP A; 3JRZ A; 3CCE T; 1VQN T; 3TSZ A; 2GBQ A; 1XOV A; 2AK5 A; 4AG1 C; 1NPP A; 3QDF A; 2CZ1 B; 5GMK m; 3G6E Q; 1YJN A; 1FWZ A; 2LQN A; 1KD1 R; 1EIF A; 3ASK A; 2NUT B; 1S72 Q; 1OEB A; 4GY5 A; 1PRL C; 2K3B A; 3CMA A; 2E5Q A; 5GAO n; 1E6G A; 1M8M A; 3QZ5 B; 3V8L A; 1P92 A; 2EYY A; 2FPD A; 4C8Q A; 1NM7 A; 2A7Y A; 2CYZ B; 1A0N B; 4BUG A; 4BI4 A; 5CK9 A; 2EBP A; 2BZX A; 5GAN 7; 3REB B; 4C0Z A; 2RN8 A; 1SPK A; 2W10 A; 1ZLM A; 2E10 A; 2PTK A; 4HA8 A; 3RIR A; 2AHJ B; 3M4Y A; 1VQ6 T; 2HNI A; 1G3T A; 1W70 A; 1KC8 C; 1FYN A; 3M5A A; 4JRI A; 1D1C A; 2O9V A; 2CP7 A; 2XHC A; 1Q81 C; 3CCR T; 3KUF A; 4XTX A; 4M78 G; 1LPL A; 2YDL A; 4DBQ A; 1N8R U; 1QW1 A; 4BE2 A; 1Z9Q A; 4QVD A; 2OAW A; 1Y71 A; 3CD6 Q; 1XJW B; 2COW A; 3UT1 A; 2O9S A; 1K76 A; 4AFU C; 3I55 Q; 2XDD A; 3CCS Q; 4MZM A; 3I56 Q; 3CCM Q; 2EYX A; 4ZGD B; 2LT1 A; 5KYN A; 2ZPI B; 3S3O A; 3QKJ A; 1WQW A; 3TCJ A; 1OU8 A; 4DOV A; 3GOX A; 3TVT A; 4OMO A; 1MMG A; 2FRY A; 1H92 A; 2C06 A; 3SB2 A; 4JJN K; 1KK7 A; 1RAH B; 2CUD A; 2EGC A; 3EGD A; 5FWC A; 3HRT A; 4PL6 A; 3CXC S; 2LX9 A; 1M27 C; 3PE0 A; 1AWO A; 1WA7 A; 2O2O A; 1N8R R; 2WSE E; 3CCU Q; 2BUD A; 5A0G A; 2QDY B; 3UA7 A; 1PCX A; 3CCJ T; 2Z0W A; 4AT1 B; 3QHS A; 4J9I A; 2D1X A; 3ZEH A; 1JRI A; 2YWW A; 2DXB A; 1IGQ A; 2RH2 A; 4E6R A; 3CME Q; 1VQ4 A; 5CKB A; 1OZ3 A; 2I0N A; 4WTO B; 2CS7 A; 1T0J A; 5GAO q; 4OMN A; 2OAU A; 2V1Q A; 3CPW S; 2F69 A; 2DBK A; 3CBO A; 5GAM d; 1KSW A; 5GAN 2; 3VRY A; 3LX7 A; 1PKT A; 2RM4 A; 2DEQ A; 3X25 B; 1SG5 A; 2K2V A; 4D8D A; 4Z89 A; 1DJ7 B; 3LH5 A; 2RQR A; 2MYS A; 3LW5 E; 2DL3 A; 3VUZ A; 4CI0 C; 3OYE A; 2FEI A; 4IUR A; 4MMK A; 1X69 A; 4M78 C; 2Y4Y A; 1JEG A; 2EGE A; 1U06 A; 4OGE A; 5GAN j; 1K1Z A; 3QSU A; 3X26 B; 2DO3 A; 1BI3 A; 2E5K A; 4BE0 A; 5FU6 B; 2RD1 A; 3URG A; 4PJM A; 1HK9 A; 1TUG B; 1QVF S; 4HXJ A; 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