The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
KELVLVLYDYQEKSPRELTVKKGDILTLLNSTNKDWWKIEVNGRQGFVPAAYLKKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
High-resolution structure of an alpha-spectrin SH3-domain mutant with a redesigned hydrophobic core.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, brain
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| molecule tags |
Structural protein
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| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
11
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-06-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2H8H A; 1K76 A; 1AWW A; 3VS6 A; 5HCK A; 1H3H A; 1SRM A; 2VWF A; 3THK A; 3UA6 A; 1RI9 A; 2AZS A; 3RBB B; 1NYG A; 1SHF A; 2AZV A; 2KBT A; 3I5R A; 2YSQ A; 4JZ4 A; 4IIO A; 1KSW A; 2DYB A; 2KNB B; 2ABL A; 1G83 A; 1WXU A; 1VYT A; 1NLO C; 2DA9 A; 2L0A A; 5FW9 A; 3EG0 A; 1ZBJ A; 5IHN A; 3EG3 A; 1CKB A; 1AEY A; 3VS5 A; 3VS2 A; 3VS3 A; 2J6O A; 1I1J A; 1U3O A; 1E6H A; 2PZ1 A; 3M0Q A; 1GBQ A; 1GBR A; 3VS4 A; 1AWJ A; 1AZG B; 2EYW A; 1AZE A; 1JQQ A; 2KYM A; 2LZ6 B; 3I35 A; 1YNZ A; 2KT1 A; 4ESR A; 2J05 A; 2LJ1 A; 1YWO A; 2DL8 A; 3VRY A; 2RMO A; 1I0C A; 3EGU A; 3NGP A; 1X43 A; 4AG2 C; 1GCQ C; 2EPD A; 2KRM A; 2CRE A; 5IH2 A; 1BU1 A; 1ZLM A; 5L23 A; 1X2K A; 2EKH A; 4M4Z A; 4J9E A; 2LMJ A; 2JS2 A; 2CUB A; 3LH5 A; 3EHR A; 2RF0 A; 3C0C A; 3NHN A; 4Z88 A; 2V1Q A; 3VS7 A; 2FPF A; 3M0R A; 3FJ5 A; 2YT6 A; 1UHF A; 2OJ2 A; 3VRZ A; 1YWP A; 2L3P A; 1AOJ A; 1UTI A; 2EYZ A; 2O9S A; 3H41 A; 2L3Q A; 3TSW A; 5IHI A; 2I0N A; 4HXJ A; 1K1Z A; 4FSS A; 2DIL A; 4IIM A; 2K79 A; 4CC2 A; 3VS0 A; 2JMC A; 1VA7 A; 2EGA A; 1WIE A; 1JEG A; 2OI3 A; 2G6F X; 1UGV A; 2ED1 A; 1K0X A; 1N5Z A; 1V1C A; 2RPN A; 2D1X A; 2CT4 A; 4AFQ C; 1OOT A; 1YCS B; 2GTO A; 1KJW A; 2HDA A; 1FMK A; 1W70 A; 1MV3 A; 2K2M A; 4LN2 A; 2P4R A; 4HVV A; 1MUZ A; 1NM7 A; 4HVU A; 4J9F A; 2YDL A; 2V1R A; 2K9G A; 4RTY A; 2GGR A; 2DE0 X; 1GL5 A; 1WXT A; 3JV3 A; 2CT3 A; 2M51 A; 2RQV A; 1HJD A; 2DL5 A; 2ESW A; 1VYU A; 3ZL7 C; 2AKL A; 2LJ3 A; 1PKS A; 2HSP A; 1OPK A; 2FPE A; 4Z89 A; 3NMZ C; 1Y57 A; 1Y0M A; 2ED0 A; 2YUP A; 2DBK A; 2GBQ A; 2GNC A; 2KEA A; 1WXB A; 2RQW A; 1ABQ A; 2A08 A; 2JM8 A; 2CUD A; 4OMM A; 2CDT A; 1S1N A; 3QWY A; 4X1V A; 4F16 A; 2PTK A; 1W6X A; 1J3T A; 2FO0 A; 2KYB A; 1W1F A; 1I07 A; 4EIK A; 1JXO A; 4GBQ A; 1PHT A; 1U5S A; 2KR3 A; 2EYX A; 4D8D A; 3TVT A; 2FRW A; 2DM1 A; 4K11 A; 5FWB A; 3UA7 A; 2O2O A; 1X69 A; 1CKA A; 2JXB A; 1M3C A; 2ENM A; 1Z9Q A; 1UJY A; 2SEM A; 2F2V A; 1T3S A; 1T3L A; 1WYX A; 2YUN A; 2LCS A; 2VKN A; 2W10 A; 2HEQ A; 2KRN A; 1GCQ A; 1ZSG A; 2EYY A; 2FPD A; 1OEB A; 2AKK A; 4AFZ C; 1GFD A; 2DVJ A; 2F2X A; 2JTE A; 4F14 A; 2DF6 A; 3I9Q A; 2IIM A; 1AWX A; 2JMA A; 2CH4 W; 4ZNX A; 5GJV B; 5GJW B; 2KE9 A; 1UE9 A; 2D8J A; 2K6D A; 3SHW A; 1X27 A; 1EFN A; 3QWX X; 5I22 A; 2JM9 A; 4AFU C; 5ECA A; 2VVK A; 4JJD A; 2ECZ A; 3IQL A; 1E7O A; 4LUD A; 4HCK A; 1HSQ A; 2E5K A; 2X3W D; 1UUE A; 4CC7 A; 1GRI A; 4OMP A; 5EC7 A; 2W0Z A; 1SSH A; 4WCI A; 2JW4 A; 4RTV A; 2FG0 A; 1PRM C; 1K9A A; 1AD5 A; 4J9I A; 2HCK A; 2K7A A; 2RN8 A; 2JT4 A; 4CC3 A; 2LNH B; 1M3A A; 1KIK A; 2RQT A; 4JJB A; 4R0K A; 2L3S A; 5FWC A; 1QCF A; 1T0H A; 2C0T A; 2O9V A; 2DL4 A; 1K0S A; 2EGC A; 2LQW A; 3PE0 A; 1HD3 A; 1PRL C; 1B07 A; 2MIO A; 1ARK A; 2SRC A; 1X2Q A; 1RUW A; 2GQI A; 3UAT A; 1OV3 A; 2DX1 A; 5IXF A; 2LX7 A; 1NLP C; 4DEX A; 1PNJ A; 2J6F A; 3O5Z A; 2YUQ A; 1M30 A; 1MV0 B; 1X6B A; 1QWF A; 1QLY A; 1JU5 C; 1XOV A; 3H0F A; 2KXD A; 2EQI A; 2MOX A; 1SEM A; 1GFC A; 1GCP A; 1B3Q A; 4J9G A; 3R6N A; 2QDL A; 2DL7 A; 2BZ8 A; 4OMO A; 4AFS C; 2RQU A; 1H8K A; 3TSZ A; 3M0S A; 4Z8A A; 1UHC A; 2KXC A; 4QT7 A; 1G2B A; 5IHK A; 4LE9 A; 1TG0 A; 3U23 A; 2ROT A; 2CSI A; 2EW3 A; 4JJC A; 1UJ0 A; 2BTT A; 2BZY A; 3H0H A; 1QKX A; 2LJ0 A; 3NPF A; 4J9C A; 1K4U S; 3M0T A; 1FYN A; 1E6G A; 2JS0 A; 1PWT A; 2J6K A; 2A28 A; 2J06 A; 4OML A; 3UF4 A; 1CSK A; 2GTJ A; 2XMF A; 1Z9Z A; 2A36 A; 2F2W A; 1WLP B; 2OAW A; 2RQR A; 1WI7 A; 4RUG A; 3REB B; 2M0Y A; 1ABO A; 1H92 A; 2A37 A; 1NG2 A; 4AG1 C; 4J9H A; 2MCN A; 1UDL A; 2YUO A; 2CH4 A; 4J9D A; 4RTU A; 1TUD A; 2EBP A; 2FRY A; 3A98 A; 4HVW A; 4KRT A; 4OMQ A; 2EGE A; 1WX6 A; 4F17 A; 1WA7 A; 2C0O A; 3M0P A; 1QWE A; 1SHG A; 1X6G A; 2ROL A; 1UEC A; 2B86 A; 2BZX A; 2AK5 A; 2DRM A; 2CSQ A; 1M8M A; 1WDX A; 1NYF A; 4J9B A; 1KFZ A; 2DBM A; 1ZUK A; 2O88 A; 3SEM A; 4D8K A; 3ULR B; 4E6R A; 2NWM A; 1NEG A; 4GLM A; 2D8H A; 2PNI A; 5IXB A; 3RNJ A; 3M0U A; 4LUE A; 5I11 A; 1SPK A; 4LNP A; 2EVR A; 1M27 C; 1BBZ A; 2KRS A; 1AWO A; 2KGT A; 3KFV A; 3H0I A; 4Y92 A; 3REA B; 2KRO A; 2DLP A; 2DJQ A; 1JO8 A; 1UFF A; 1RLQ C; 2X3X D; 2L2P A; 1WFW A; 1OPL A; 2KT8 A; 4RTT A; 1AVZ C; 1SRL A; 1ZUU A; 1PKT A; 3EG1 A; 2C0I A; 1YP5 A; 1IO6 A; 1M3B A; 4DEY A; 1RLP C; 4RTW A; 3I5S A; 1U06 A; 1VYV A; 1NEB A; 4JZ3 A; 2RNA A; 4ORZ A; 2HBW A; 4RTX A; 1YN8 A; 2DMO A; 3VS1 A; 1ZUY A; 1BB9 A; 2J7I A; 4A63 B; 2K3B A; 3PVQ A; 1BK2 A; 4RTZ A; 2DRK A; 1UG1 A; 2LP5 A; 2DL3 A; 3EG2 A; 4OMN A; 1TUC A; 2LQN A; 2FEI A; 2DNU A; 1JXM A; 3PVL A; 2D0N A; 3CQT A; 3GBQ A; 1A0N B; 4CC4 B; 1QKW A; 4JPB W; 1ZX6 A; 3EHQ A; 2O31 A; 1T0J A; 2NUZ A; 1LCK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1K73 C; 2H8H A; 3OYI A; 1AWW A; 3HHT B; 1WGS A; 3HPW A; 4EMG A; 3UA6 A; 1NYG A; 1ZA1 B; 5IN1 A; 3UT1 A; 1PSE A; 4EMK C; 3I5R A; 3RDV A; 3MHX A; 2E41 A; 4JZ4 A; 3FB9 A; 4IIO A; 4BDZ A; 2VXF A; 5LJ3 h; 3FDR A; 2QXF A; 2DTI A; 3BFM A; 1Q81 R; 1WQW A; 5CR2 A; 3T9N A; 2X9H A; 1QCO A; 1ZBJ A; 3CPW S; 2XHC A; 4Y28 E; 2QDY B; 2F5K A; 3VS5 A; 2KK4 A; 3M5A A; 2J6O A; 1U3O A; 1E6H A; 2QQB A; 3M56 A; 2EYW A; 2DJZ A; 1YJW T; 2HBP A; 1YWO A; 2DL8 A; 2O01 E; 4FSX A; 1X43 A; 5LJ3 g; 3OYB A; 2KRM A; 2CRE A; 5L23 A; 1Y71 A; 4LD6 A; 4C0G A; 4Z88 A; 3BY7 A; 3MP6 A; 1LNX A; 2V1Q A; 3VS7 A; 1YHQ T; 3M0R A; 1VUB A; 4KGZ B; 2YT6 A; 1UHF A; 2OJ2 A; 1G3S A; 2LCL A; 3H41 A; 4BI3 A; 4Q5W A; 4ELZ C; 2I0N A; 4HXJ A; 2M16 A; 4HCB A; 4X9D A; 2DO3 A; 1FX7 A; 4CC2 A; 1D1C A; 3CCR A; 2EGA A; 3LGF A; 3P8D A; 1M1K C; 1WIE A; 4M78 F; 3JB9 H; 1Q7Y U; 1JEG A; 3I56 T; 3WXM B; 3QJY A; 4BD3 A; 2BE7 D; 4ZN3 A; 4AFQ C; 1FMW A; 5LJ3 j; 3UPU A; 2OTJ Q; 5CAI A; 1YCS B; 4JRI A; 1VQ4 T; 3P8H A; 3BW1 A; 5CQY A; 2HAX A; 2P4R A; 1MUZ A; 1B34 B; 4M78 B; 4RKU E; 4HVU A; 1RAE B; 2XU8 A; 1PD1 A; 2YDL A; 4PKC C; 2DXU A; 3CMA A; 1KG1 A; 1GL5 A; 1K9M C; 3JSC A; 3PGG A; 1RAD B; 4C0D C; 3JCM d; 1Q95 G; 3L2V A; 2QGF B; 2XKO C; 2EQM A; 4F7U B; 2AKL A; 3MCA B; 3HRU A; 3OW2 P; 3OYN A; 1PKS A; 2AHJ B; 1OPK A; 3LX7 A; 1BCM A; 4Z89 A; 3NMZ C; 3CC4 Q; 4M7D B; 3BDL A; 2CZ0 B; 2A0F B; 2QEX A; 2JM8 A; 2P4T A; 1Q82 U; 2CDT A; 2JZ2 A; 1W6X A; 2V8K A; 2EWN A; 3JCM g; 3QJ6 A; 4FYV B; 4OF1 A; 2CGH A; 2KYB A; 1WZO A; 2QG9 B; 1PHT A; 4OB3 B; 1U5S A; 2DYI A; 2GFU A; 2EYX A; 3TVT A; 2FRW A; 2DM1 A; 1YFN A; 1XNI A; 2FVU A; 1M3C A; 1Q86 U; 1WYX A; 4PJO D; 1I5L A; 1NE8 A; 1VQL Q; 2EYY A; 2FPD A; 5CKB A; 4X9C A; 4E7Z A; 5KYU A; 2QA4 T; 2AKK A; 2JOY A; 2HKN A; 3CC2 Q; 3I9Q A; 4IUR A; 2CH4 W; 5GJV B; 3PMI A; 1YJ9 A; 3CD6 A; 1U1S A; 3N5B B; 2KQW A; 3M58 A; 5ECA A; 3WVD B; 3OW2 A; 4VUB A; 3OYC A; 3E1S A; 4IUV A; 4C92 G; 4JJD A; 2ECZ A; 1E7O A; 2ATC B; 3QSU A; 3MP1 A; 1HSQ A; 1NPP A; 2EAY A; 1UUE A; 2KVQ G; 1KD1 C; 2RK2 A; 1UGP B; 1SSH A; 2PUK B; 4QKU A; 4PJO A; 2B8A A; 3MET A; 2PU9 B; 1N9S A; 4WF2 A; 2RN8 A; 2OTJ A; 5I21 A; 4BY6 B; 4ME7 A; 1M3A A; 2EQU A; 2JVV A; 4QVZ A; 1BI3 A; 1QCF A; 1BYM A; 3A8L B; 1T0H A; 2YRC A; 4DBQ A; 4FYX B; 2DD4 A; 2LQW A; 3JCM P; 3LH0 A; 1M90 C; 2SRC A; 3A8H B; 5L8R E; 1YJN A; 2QQA A; 5GAO r; 3UAT A; 1M2V A; 1OV3 A; 2DX1 A; 2E5Q A; 4N0A A; 5IXF A; 5KE2 A; 3CCS T; 2LX7 A; 4DEX A; 1PNJ A; 1BKB A; 2COY A; 4JRP A; 1X75 C; 1X6B A; 5I2M A; 5GAM d; 4KGX B; 4J9G A; 3CCJ T; 1V76 A; 4A4G A; 2E65 A; 2BZ8 A; 3TSZ A; 4JJN K; 3CCL Q; 2KXC A; 2P84 A; 2F69 A; 5IHK A; 1YI2 A; 2QAZ A; 2HL3 A; 3CCV Q; 2CSI A; 1QVG S; 4JJC A; 1UJ0 A; 4M7A F; 3F70 A; 3L2Z A; 3H0H A; 1K8A R; 3NPF A; 1WHJ A; 2AT1 B; 8AT1 B; 2A28 A; 5KH6 A; 1O75 A; 4YTL A; 3UF4 A; 2V8J A; 1PC0 A; 2GTJ A; 2XMF A; 1VQL A; 2X4J A; 4LDU A; 2RQR A; 4RUG A; 3REB B; 2EJ9 A; 4L59 A; 1ABO A; 1KC8 C; 4M7A B; 3HKS A; 1UDL A; 4QQG A; 2DIG A; 4ZGJ B; 3ME9 A; 3G71 T; 2YLB A; 3CCQ A; 4F7U E; 3EFO B; 5AT1 B; 3A98 A; 2LCC A; 3OMG A; 3CBO A; 1KQ2 A; 3OS5 A; 1SSF A; 3M0P A; 1X6G A; 1RAI B; 3BDU A; 3S3O A; 2ZCF B; 2AK5 A; 2HQE A; 4C92 C; 2VV5 A; 2CSQ A; 1SF9 A; 1NYF A; 1G3T A; 1M9S A; 2MYS A; 4XTW A; 3PNW C; 4C8Q F; 2L8D A; 1NEG A; 4GLM A; 4DA4 A; 5J26 A; 2F1L A; 5I11 A; 1M27 C; 3QO3 A; 3JB9 G; 2KRS A; 3CME Q; 1TS9 A; 1AWO A; 3H0I A; 4FM4 B; 4Y92 A; 2DJQ A; 5GAN d; 2L2P A; 1VQP Q; 1M1G A; 2KT8 A; 1VQ8 Q; 4C8Q B; 2RD1 A; 1AVZ C; 1Y96 B; 5IT9 E; 3E9G A; 4C0Z A; 1JJ2 S; 1VQO T; 2EQK A; 1F1B B; 4FT2 A; 2R5M A; 2M0O A; 3VKI A; 2C0I A; 2CP7 A; 4M75 F; 4PL6 A; 3CCE Q; 1M3B A; 4RTW A; 4RG2 A; 1NEB A; 2RO0 A; 4ORZ A; 1JRI A; 2O4X A; 1BB9 A; 1XQH A; 2EIF A; 3CCM A; 2HQX A; 1BK2 A; 2DTH A; 2A3L A; 2LT4 A; 4ZN1 A; 5GAN g; 1EIF A; 1N8R R; 3DKM A; 3GOX A; 2LQN A; 1YIJ T; 2FEI A; 3KBG A; 2DNU A; 1VQ7 Q; 3CQT A; 4M75 B; 4ZTJ A; 5GAO p; 4XTY A; 4CC4 B; 4AMC A; 1KQS S; 2CP2 A; 2GF7 A; 3EHQ A; 3EGD A; 2NUZ A; 3CCV A; 3G4S T; 1N27 A; 1RAC B; 3THK A; 1YIJ A; 3CC7 T; 1RI9 A; 2FHD A; 1SHF A; 3INZ A; 1QMC A; 2KAF A; 2ZAE A; 4C92 D; 5LJ5 e; 1VYT A; 1NLO C; 3G4S A; 5D6W A; 2DVE A; 5FW9 A; 1MNE A; 3QBY A; 3EG9 B; 3CC7 A; 5IHN A; 3EG3 A; 4IUT A; 1CKB A; 5CKD A; 1WJS A; 3VS3 A; 3GLX A; 4X34 A; 1I1J A; 2QQ9 A; 3LGL A; 4PFZ A; 3V8K A; 2NUP A; 2G3R A; 1VQ5 T; 3O8V A; 2KYM A; 4OB0 B; 4C5H A; 1YNZ A; 3G1J A; 2KT1 A; 1WHH A; 2J05 A; 4LDW A; 3NGP A; 2DAQ A; 1Y07 A; 2Y90 A; 1GCQ C; 4D6W A; 2EPD A; 2RJD A; 2E1H A; 3LWH A; 4C92 A; 1VQ5 A; 1H3Z A; 3CBP A; 2EKH A; 3S6W A; 2LMJ A; 3G6E T; 1MMN A; 3LH5 A; 3QHS A; 2RF0 A; 3C0C A; 3VUZ A; 3M54 A; 4PJM A; 1VQM T; 4FYY B; 2FPF A; 3OYK A; 2CP5 A; 1AOJ A; 2KI7 A; 2O9S A; 4TVR A; 3ER0 A; 1VQP A; 1VQ8 A; 1ZSZ B; 2L3Q A; 3OSS C; 4PLL A; 5IHI A; 4J83 A; 3RMS A; 2HL5 C; 3H9N A; 1D0Z A; 2Z0W A; 2OTL T; 2RK1 A; 2DER A; 5LJ5 f; 2DZ9 A; 5GAN 2; 2R57 A; 2XK0 A; 4LXC A; 2X4W A; 1VQM A; 2JMC A; 2DXB A; 2P0Q A; 5KCH A; 3OYL A; 1OQK A; 2FZC B; 1YIT T; 2F5T X; 2E6N A; 3TEE A; 4FW1 A; 4KBM B; 1Q7Y R; 4RCC A; 4C92 F; 3UDC A; 3FC3 A; 2ED1 A; 3JCM X; 1K0X A; 6AT1 B; 3OYE A; 2OTL A; 4XTZ A; 2RPN A; 1VQ6 T; 1VQ7 A; 4BE1 A; 1KJW A; 2BUD A; 1D1B A; 5HK0 A; 2X51 A; 8ATC B; 4JS4 A; 4N4I A; 4J9F A; 2QGG A; 2V1R A; 3I55 A; 5FRN A; 1WQ7 A; 4PK4 A; 4PLI A; 4BDY A; 1WXT A; 4XU0 A; 1JJ2 P; 3CMA Q; 1VQN A; 1ZBX A; 5LJ3 e; 2JJ9 A; 1KQ1 A; 1BIA A; 2RJE A; 2LJ3 A; 1VQ4 Q; 2LVM A; 1QQJ A; 1NJI C; 3PTA A; 3RUX A; 2DKG A; 2HD0 A; 2GNC A; 3MKD A; 3RR6 A; 2KEA A; 2ZPI B; 1TUG B; 1ABQ A; 2CUD A; 1U1T A; 4F16 A; 1Q82 R; 3S3N A; 1UGQ B; 1K73 U; 2QEX Q; 3JB9 D; 1WPY A; 1W1F A; 1I07 A; 1JXO A; 1R8O B; 1QCN A; 4V2S A; 1TOV A; 1WHG A; 1MGQ A; 4K11 A; 4UC4 A; 1CKA A; 2ENM A; 5GAO n; 1Q86 R; 2KDS A; 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