The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
DATFGMGDRVRKKSGAAWQGQIVGWYCTNLTPEGYAVESEAHPGSVQIYPVAALERIN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Novel crystallization conditions for tandem variant R67 DHFR yield a wild-type crystal structure.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Dihydrofolate reductase type 2
|
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| source organism |
Escherichia coli
|
| total genus |
12
|
| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| ec nomenclature |
ec
1.5.1.3: Dihydrofolate reductase. |
| pdb deposition date | 2011-06-13 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GQV A; 2RK1 A; 1VIE A; 2OAU A; 2RK2 A; 3UDC A; 3SFM A; 3T9N A; 2RH2 A; 2VV5 A; 2P4T A; 1VIF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4A4G A; 2K2M A; 3EGX A; 1M2O A; 1IHV A; 4IUP A; 2YUQ A; 4HT9 A; 4Q5W A; 2KAF A; 1KQS P; 4E7H A; 1BIA A; 3GP8 A; 1KD1 C; 1TWB A; 1Q82 R; 1WGS A; 3M58 A; 2KYM A; 2OJ2 A; 4LXC A; 1PD0 A; 2W0Z A; 4BD3 A; 1K0S A; 3E19 A; 2D6F A; 2R58 A; 1U06 A; 2MI6 A; 1VYT A; 1I5O B; 2CZ1 B; 2JJ9 A; 2X51 A; 1WNL A; 2DXT A; 3MHX A; 3GNF B; 3CCM A; 3HRT A; 3V8L A; 2BZ8 A; 3S6W A; 4HVU A; 3CCE T; 2SEM A; 1TUC A; 1ABQ A; 1NJI C; 1JXO A; 3EG9 A; 3WVD B; 3CCS T; 1ZLM A; 4XTZ A; 2H8H A; 3GLX A; 3VYG A; 1YHQ T; 1WIE A; 2E6N A; 1M1F A; 5A0L A; 3VUZ A; 3JV3 A; 1GCQ C; 1UJ0 A; 2DE0 X; 1X6G A; 1Y07 A; 3NFC A; 2P0K A; 4NL3 A; 4PJO B; 3BDU A; 3CCQ Q; 1AZE A; 1YN8 A; 1GCQ A; 2XDP A; 2HZY A; 3VUB A; 1D0Z A; 2CP6 A; 2C06 A; 1PKS A; 3M57 A; 2PTK A; 1R8O B; 4PJO E; 2X35 A; 3GNG A; 4PJJ A; 4Z02 A; 3G4S T; 2JS0 A; 1IXD A; 3CCJ T; 1CKA A; 1AWJ A; 4MZT A; 4M7A E; 3QDF A; 1OEB A; 5D7U A; 4DEY A; 1IRE B; 3RNJ A; 2FRW A; 4LE9 A; 3RES A; 2VC8 A; 5CR2 A; 2RK2 A; 1G5V A; 2L8D A; 3J7A F; 4DOV A; 1YNZ A; 4RKU E; 2FVU A; 5FLX E; 2QEX A; 3ASK A; 4X1V A; 4XU0 A; 4QQ6 A; 3PE0 A; 4AG1 C; 4OMQ A; 4HVV A; 1S1N A; 1IGU A; 2LCS A; 1M90 R; 1AWO A; 1KG1 A; 1XOV A; 3CC7 Q; 1K0X A; 1YIT T; 1VQ7 T; 5HY6 A; 2CYZ B; 2RHY A; 5LJ3 d; 3I55 Q; 2HNI A; 4XTW A; 4QT7 A; 1OX8 A; 2GF7 A; 2KE9 A; 3M0Q A; 4M77 F; 4PJO G; 3DLL A; 2LDM A; 3G6E A; 2XI9 A; 4OGC A; 4M7A G; 1LNX A; 4J9F A; 2C0I A; 3FEO A; 1Q81 C; 5DY9 A; 2HSP A; 3VS5 A; 2ED1 A; 1UTI A; 2EGE A; 5GAN 7; 2A28 A; 2RM4 A; 1SSH A; 2KBT A; 3JCM V; 1TG0 A; 2DBK A; 1OPK A; 2HKQ B; 4RUG A; 3GPL A; 1QWE A; 3HP9 A; 4M77 C; 2E12 A; 2EQM A; 1G3Y A; 2J05 A; 4M77 A; 2RQW A; 4RTY A; 2R5A A; 1Q95 G; 4RTT A; 4C92 B; 1BK2 A; 5LJ3 e; 2IG0 A; 1WJR A; 1GL5 A; 1WQW A; 4JJD A; 1PWT A; 4FSX A; 3VS7 A; 1ZUU A; 3CMA A; 4AFU C; 4CRI A; 3CC2 Q; 4JRI A; 2Y4X A; 2DZ9 A; 3PMI A; 1W2B A; 1M1K C; 4C92 E; 4ELZ C; 3OA6 A; 4PLL A; 2CS7 A; 1TTH B; 1M3A A; 1M30 A; 1WHG A; 2CP0 A; 2F5T X; 3EGU A; 3RIR A; 5AT1 B; 1VIF A; 2VGN A; 3H0H A; 1VQ9 A; 4JS5 A; 2KT1 A; 5LJ5 f; 1KK7 A; 3V7C A; 3RUX A; 3VKI A; 2K9G A; 2QYZ A; 1OPL A; 1AHJ B; 1BU1 A; 5A0G A; 1TOV A; 2KGT A; 3QXE B; 1ZUK A; 2EYZ A; 4MZP A; 2V1Q A; 1VQ5 T; 1KD1 R; 4C5I A; 3GIB A; 3CCL A; 8AT1 B; 3KBG A; 4C5H A; 2LJ1 A; 1BIB A; 5FRM A; 4CC2 A; 4C92 G; 4Y92 A; 4C0F A; 1RAD B; 4XK8 E; 3VJP A; 2LJ0 A; 4M77 D; 1NPR A; 1IGQ A; 2R57 A; 2HMA A; 2QDL A; 2OTJ T; 2KDS A; 2RNA A; 1VQ8 Q; 1NJI R; 2K3B A; 4F16 A; 4N0A C; 3OS5 A; 5GAN 2; 3LGL A; 2ECZ A; 1A0N B; 2J6O A; 4N0A A; 1WHM A; 4DOW A; 1VUB A; 2DBM A; 4EMK C; 2ZAE A; 3AT1 B; 3CD6 T; 1MGQ A; 4KT0 E; 4HVW A; 1HJD A; 3OBW A; 3M5A A; 2JZ2 A; 4KBM B; 2EYQ A; 2NUT A; 3LWH A; 1P92 A; 2COZ A; 4YTL A; 6AT1 B; 1YJ9 A; 2E64 A; 3QJY A; 2OTL A; 1FMK A; 3VS1 A; 3CCU Q; 1W6X A; 3X28 B; 5J39 A; 5CIU A; 4JRK A; 4OB1 B; 1I4K 1; 2XMF A; 4AT1 B; 1YI2 A; 1TH7 A; 3FIF A; 1SPK A; 3OYL A; 1ABO A; 1Y7X A; 3PFS A; 2RPN A; 1RLQ C; 1NLO C; 1I07 A; 1OOT A; 1UJY A; 5DM7 R; 3OMG A; 3URG A; 1W2B P; 1O9S A; 3ULR B; 1M1G A; 4XTU A; 1NE8 A; 1WZO A; 2K3X A; 2KXD A; 1JRI A; 2L3R A; 3FJ5 A; 2QQR A; 3CCQ T; 5LJ5 d; 1AZG B; 3EG2 A; 2LZ6 B; 4JLG A; 1XNI A; 1K73 C; 4ZN3 A; 1VYV A; 3G7Z A; 4RMO A; 1UG1 A; 2G6F X; 2WAC A; 3WXM B; 1GRI A; 1Q81 R; 2HAX A; 2LRQ A; 1QCN A; 1QVF P; 3SWN C; 1M9S A; 4FYX B; 3CCM Q; 3BW1 A; 1MV0 B; 2GGR A; 3SWN A; 3QZ9 B; 1BI3 A; 5EG2 A; 1M4Z A; 2JTE A; 4MDX A; 4OB0 B; 4K11 A; 4HCZ A; 1QQJ A; 1VQM Q; 1M8V A; 5D6Y A; 2RI5 A; 1ZA1 B; 2YLB A; 1YHQ Q; 3GBQ A; 4PJN A; 1PHT A; 5LJ5 e; 4CI0 C; 2RO0 A; 4F7U B; 4C5G A; 2PUK B; 4M78 F; 3P8B B; 3IQL A; 4OGE A; 1VQL A; 1M1K R; 1VA7 A; 3HRU A; 4LDW A; 2K5I A; 5L8R E; 3EGD B; 5I2S A; 5KH6 A; 2RHX A; 4BE0 A; 1ZSZ A; 4F7U E; 1Z9Q A; 2EBP A; 1UFF A; 4AFZ C; 1WQ7 A; 3G4S Q; 1DJ7 B; 2D8J A; 3FDR A; 2LT1 A; 2ZCF B; 4DBQ A; 2PVO B; 3OYM A; 1YJW T; 1BB9 A; 4CC7 A; 1BI0 A; 4FYW B; 4M78 C; 4DBF A; 3RBB B; 3TSW A; 2DXB A; 2PZ1 A; 2MAM A; 1V29 B; 4M78 A; 2D1X A; 1VQO Q; 5LL6 S; 5GAO n; 2O88 A; 4ORZ A; 3M55 A; 2IIM A; 5L23 A; 2L5Q A; 4BI4 A; 1GFC A; 2QGG A; 1VQK A; 3UWN A; 1YIT Q; 2XIC A; 2LP5 A; 1VQ7 Q; 1YWO A; 4PJM A; 1OX9 A; 1M2V A; 2CGH A; 4F7U G; 2DIQ A; 1WXT A; 3SD4 A; 3Q1J A; 3G6E Q; 3LLR A; 4LDX A; 3VRZ A; 5I2M A; 4C8Q C; 4FSS A; 5M9O A; 3CXC S; 1QKX A; 5KYY B; 3LWI A; 2WSF E; 1I8F A; 3M9Q A; 1KD1 U; 2E6Z A; 4BDZ A; 2EAY A; 2QQ9 A; 4E7I A; 1YWP A; 2JTM A; 1IB8 A; 3VRY A; 4M75 B; 2K6D A; 3A98 A; 3MO8 A; 1QVG A; 1X6O A; 4FT4 A; 3OBY A; 1PCX A; 5CVI A; 3G71 T; 4LDU A; 1BCO A; 1GBQ A; 4O5V A; 4DQ2 A; 4BE1 A; 2RJD A; 4PNO A; 4M75 E; 4VUB A; 1NJI U; 3OYH A; 2K3Y A; 2O2O A; 4UC4 A; 4XQ3 A; 3TEE A; 1VQN A; 4JZ4 A; 3QJ6 A; 4M78 D; 1YIJ A; 2EIF A; 7AT1 B; 4ZNX A; 4A4K A; 1D3B A; 1VOM A; 3OYE A; 4LNP A; 3D7S B; 3UA6 A; 3THK A; 1R0C B; 1WHK A; 2PUO B; 3RMQ A; 1QW1 A; 3OS1 A; 4HT8 A; 1YFN A; 3TRE A; 3I56 A; 1I0C A; 1WHL A; 2MIO A; 2DYB A; 3X25 B; 4QVD A; 3JB9 J; 3JB9 I; 4FM4 B; 2EFI A; 2FPD A; 2FHD A; 3V7S A; 5LJ5 h; 2L3P A; 1OUL A; 2ZPG B; 1K73 R; 1VQ5 Q; 3V7R A; 4KGV B; 2GFU A; 3TQ7 P; 2DET A; 4D8K A; 5IH2 A; 1NBE B; 3QBY A; 1K9M C; 4CC4 B; 3OYJ A; 2JVV A; 1MNE A; 1UE9 A; 2GQI A; 2OTJ Q; 4WF2 A; 3HFN A; 4Y91 A; 2J6K A; 5GMK m; 2F5K A; 3CBM A; 3M4Y A; 2QTV A; 2DL3 A; 1X2K A; 3L2Q A; 2LQN A; 3NGP A; 2MPX C; 2RF0 A; 3JSC A; 1K76 A; 1RAH B; 3JCM f; 2PU9 B; 3VV0 A; 3MEW A; 3EGX B; 2WSE E; 4IIM A; 1OU9 A; 2B86 A; 4KH0 B; 1Q81 U; 2VGM A; 5CKH A; 3CD6 Q; 2HQH A; 4L6V 5; 4ESR A; 4OML A; 1RI0 A; 2DL4 A; 2MWO A; 2RQV A; 4MDW A; 3JCM Q; 1YJ9 Q; 2LMJ A; 1BYM A; 2M51 A; 4OP0 A; 5FWC A; 3MP8 A; 4ME7 A; 1MUZ A; 2K4Y A; 3MP1 A; 4OMF B; 4M7D G; 3OSS C; 2CKK A; 3CCM T; 2ZPB B; 3OW2 A; 2DVE A; 2VXE A; 2CUD A; 1WJS A; 1MND A; 2O4X A; 1FMV A; 3EG9 B; 1VQP A; 3HTR A; 1TUG B; 3PVL A; 4PJL A; 2X3X D; 3EFR A; 1VQM T; 1GXI E; 4PJO F; 2KNB B; 1TSF A; 2L3Q A; 2YWW A; 1UGS B; 4IUR A; 3A8O B; 3UAT A; 4M7A F; 1IO6 A; 3RKY A; 3LX7 A; 2IVW A; 3U23 A; 2X4Y A; 1WYX A; 5FRN A; 2JW4 A; 3I5S A; 5FWB A; 2CT4 A; 4FYY B; 2P0P A; 2GCX A; 2ZZD A; 3OYG A; 1M3C A; 2EVR A; 2HD0 A; 3L2U A; 1VQ4 Q; 3H0I A; 4NL2 A; 3AHU A; 3WVE B; 2BE9 B; 1NPP A; 3BY7 A; 3MET A; 1UB4 A; 4PJO C; 3EG0 A; 3HPW A; 2MYS A; 4OF1 A; 4KGZ B; 2HL5 C; 4M7A C; 5GAN 6; 1X01 A; 3SHW A; 2BUD A; 5KYX A; 2KRN A; 2HDA A; 1YCS B; 1JQQ A; 2QEX T; 4KUL A; 1N27 A; 4RTV A; 4QKU A; 3PT9 A; 3JCM W; 1VQO T; 2JS2 A; 1Y96 A; 1IRX A; 3I9Q A; 1YP5 A; 3M0T A; 3SDZ A; 4WTO B; 3CXC A; 3CCJ A; 3VU3 C; 4FYV B; 2LX9 A; 1PSF A; 1VQ6 Q; 1BKB A; 2PNI A; 1OZ3 A; 5LJ5 g; 2RQU A; 1U1T A; 4BDY A; 1KQ2 A; 2JN0 A; 2FRY A; 3G6E T; 3M0P A; 3M0S A; 3JCM d; 3RMS A; 1VQL Q; 2CH4 W; 1RAA B; 5C0M A; 2DMO A; 2QA4 Q; 4BI3 A; 1JJ2 S; 5C6S A; 2D0N A; 4EPC A; 5IT9 E; 1I5L A; 4N4I A; 1I1J A; 2V8I A; 4ELY C; 5GAO q; 2CP7 A; 3CBP A; 3DKM A; 4OMN A; 3CCR A; 4XTV A; 4C92 F; 4C5E A; 4N4G A; 1D0X A; 3EAE A; 1YJW Q; 4ZGD B; 1F1B B; 3RR6 A; 2V8K A; 3CPF A; 2EQK A; 1S72 Q; 3CC4 Q; 4M77 B; 2ZPH B; 3C94 A; 3VS3 A; 1NEG A; 3PIO A; 1ZBJ A; 3M53 A; 4M7A D; 3OW2 P; 2OAW A; 5IHN A; 2BZX A; 3I5R A; 5A2Q E; 2PVD B; 2W10 A; 2FO0 A; 4IUT A; 2X4W A; 1K9M R; 3CMA T; 3QZ5 B; 2XD0 A; 2YHT A; 4E7Z A; 4M77 E; 3JCM e; 2Z0W A; 2P0Q A; 2RJE A; 4B9X A; 1U8R A; 1U5S A; 4MMK A; 4A54 A; 4C92 C; 2DO3 A; 4J6W A; 1PNJ A; 1ZBX A; 5GAN 8; 1H92 A; 1VQ9 T; 1PG5 B; 4HKE A; 3HSB A; 2ABL A; 2F2W A; 1IZ6 A; 1EZZ B; 1WJQ A; 2DD5 A; 1K73 U; 2RQT A; 2QGF B; 2NYS A; 3CCV A; 1GFD A; 1RAI B; 3INZ A; 2KEA A; 3V8K A; 1B34 A; 2DAQ A; 2KRO A; 5HCK A; 1WPY A; 4PLI A; 1E6H A; 2PQW A; 1K4U S; 3CQT A; 2JXB A; 1D1B A; 2HKN A; 3JCM c; 1KQ1 A; 4EMH A; 2QDY B; 2DF6 A; 2QXF A; 3A8L B; 1K8A C; 3G71 Q; 2DL5 A; 3ME9 A; 1KIK A; 1OYX A; 4Z89 A; 2RD1 A; 3T9N A; 1M27 C; 2NWM A; 3PIP A; 2M0Y A; 2DTO A; 5CAI A; 2EGC A; 2PVG B; 3ZBD A; 1SHF A; 1QMC A; 3UT1 A; 3CXC P; 2RA2 A; 3DLM A; 2EQU A; 4IIO A; 2DLP A; 5GAN 4; 2V8J A; 3SEM A; 3BDL A; 1QVG S; 5GAN 5; 2MOX A; 3X24 B; 4QQD A; 2FEI A; 2A0F B; 2CDT A; 4E6R A; 1XJW B; 3EFO A; 5DLQ E; 3I56 Q; 2MK5 A; 2A36 A; 4ATO A; 2CP5 A; 1Q82 U; 4EMK A; 4AFQ C; 3OS2 A; 4XU1 A; 2VV5 A; 2NUT B; 3O8V A; 2DK3 A; 1YJ9 T; 5I11 A; 2EGA A; 4J8O A; 2K2V A; 1HK9 A; 4QVZ A; 3S3M A; 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3OY9 A; 2LJ3 A; 3LGF A; 1WFW A; 4OB2 B; 1S72 T; 1H3H A; 2QEX Q; 3CC4 T; 2DXC A; 3QSU A; 4M78 B; 2KI7 A; 1T3L A; 1Y0M A; 4C8Q F; 1K8A R; 2RHU A; 2V26 A; 3X20 B; 2R5M A; 2C0O A; 4C0D B; 5IXF A; 1VQK T; 1AT1 B; 1ZA2 B; 1MMA A; 5HK3 A; 2M9U A; 4M78 E; 1M2V B; 1QLY A; 1UGR B; 2E5K A; 1U3O A; 3TVT A; 2NUP A; 2CSQ A; 1Q7Y C; 1ZSG A; 2FYK A; 1QP2 A; 1CSK A; 1G8X A; 1SEM A; 2DIL A; 3M4G A; 2ENM A; 2DTI A; 4RCC A; 3JRZ A; 1WDX A; 3CME A; 2EKO A; 4C8Q A; 4FIB A; 3CC2 A; 1OV3 A; 1V76 A; 2GNC A; 1VIE A; 2KVQ G; 5KCH A; 3ZEH A; 1NZ9 A; 1KHI A; 3DB4 A; 3REB B; 3C12 A; 1KQS A; 4X34 A; 2YSQ A; 2KT8 A; 4FU6 A; 2VUB A; 4NOY A; 1WHH A; 1C1A A; 1VQN T; 5GJV B; 4E7K A; 3FJP A; 4A4E A; 1YIJ T; 1JJ2 P; 3CMA Q; 2I0N A; 1N6A A; 3QYG B; 3JCM g; 1D3B B; 3ZFJ A; 5KYW A; 3H6Z A; 1Q86 R; 3TSZ A; 3A8M B; 1B3Q A; 2E10 A; 3L2Z A; 3LH5 A; 3M56 A; 2Y4Y A; 3I56 T; 1X6B A; 3HHT B; 1VQ9 Q; 1QWF A; 4HCK A; 3RKW A; 1NEB A; 1LCK A; 1B07 A; 2VXF A; 1WXU A; 5FU6 B; 1TU0 B; 1EFN A; 2K57 A; 2AZS A; 5GAN j; 1E7O A; 4KGX B; 1VQ8 A; 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