The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
PLGSSDLGITAIALYDYQAAGDDEISFDPDDIITNIEMIDDGWWRGVCKGRYGLFPANYVELRQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Lysozyme contamination facilitates crystallization of a heterotrimeric cortactin-Arg-lysozyme complex.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Lysozyme C
|
| molecule tags |
Hydrolase, protein binding
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| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
13
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| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-11-11 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2OJ2 A; 5IXF A; 2VWF A; 2O31 A; 2KR3 A; 4EIK A; 2LQN A; 2L2P A; 4J9D A; 4Z88 A; 1NLO C; 3ULR B; 2BZ8 A; 1X27 A; 1PHT A; 1AWJ A; 1SRL A; 2J05 A; 1MUZ A; 1BK2 A; 2CH4 W; 1T3L A; 1B3Q A; 2KT1 A; 5FWB A; 2LX7 A; 1I0C A; 2K2M A; 2OI3 A; 2FO0 A; 1PNJ A; 2KT8 A; 1GFD A; 1HD3 A; 1YN8 A; 2DJQ A; 2L3S A; 2DBK A; 4OMM A; 4JPB W; 2DVJ A; 3CQT A; 1YCS B; 1M30 A; 1UGV A; 1T0J A; 2GNC A; 4HCK A; 1K76 A; 1UJ0 A; 2DLP A; 1OOT A; 2EKH A; 1UHF A; 2EYZ A; 2O9V A; 2KNB B; 2EGC A; 2LJ0 A; 2DE0 X; 1QLY A; 2LJ3 A; 2FEI A; 4HVV A; 1OPK A; 1UE9 A; 2AK5 A; 1ZLM A; 1KIK A; 1VYV A; 3LH5 A; 3UA7 A; 1K9A A; 1YP5 A; 1RUW A; 1X2K A; 2LNH B; 2VVK A; 1FMK A; 2NWM A; 1GBR A; 2K6D A; 3PVQ A; 2KRO A; 4ESR A; 1GRI A; 1YWP A; 1T3S A; 2D8H A; 2JM9 A; 2ENM A; 3H0I A; 2MIO A; 2DL4 A; 3TSW A; 1GFC A; 2CRE A; 3M0T A; 2HSP A; 2KEA A; 1KJW A; 1ARK A; 2GBQ A; 2AZS A; 3UAT A; 3I5S A; 2H8H A; 1NEG A; 2HEQ A; 2JXB A; 1S1N A; 3TSZ A; 3VS2 A; 2IIM A; 4CC7 A; 3M0P A; 1G2B A; 5IHK A; 2CH4 A; 4OMQ A; 3VS0 A; 2GQI A; 3R6N A; 4HXJ A; 1WYX A; 4F16 A; 1NYF A; 1K1Z A; 4HVW A; 2PNI A; 3M0R A; 4IIM A; 2DM1 A; 4M4Z A; 1AOJ A; 1ZBJ A; 3KFV A; 3H41 A; 1AZG B; 2HCK A; 1TUC A; 2J6O A; 2RMO A; 2CSI A; 5I11 A; 2YUP A; 4RTW A; 4OMN A; 2EPD A; 2EBP A; 2YT6 A; 1QKW A; 2CUB A; 2ABL A; 4J9G A; 2G6F X; 4DEX A; 2C0T A; 2J06 A; 2MCN A; 2FG0 A; 1RI9 A; 1H92 A; 1X2Q A; 2HBW A; 1SHG A; 1GCQ C; 3FJ5 A; 3U23 A; 1JEG A; 1GBQ A; 1CKB A; 1Y0M A; 2OAW A; 4LUD A; 5IHN A; 1GCQ A; 4LE9 A; 3M0Q A; 2FPD A; 1X43 A; 1PWT A; 4LN2 A; 4CC3 A; 2A28 A; 2LCS A; 1UDL A; 1WDX A; 2JT4 A; 2ROT A; 4JJD A; 1RLQ C; 1ZUU A; 3EG3 A; 3VS6 A; 3EG0 A; 1JO8 A; 2ROL A; 2DMO A; 2L3P A; 2D1X A; 2JM8 A; 1IO6 A; 1PRM C; 1GCP A; 4RTT A; 1VA7 A; 3EHQ A; 5GJW B; 1SHF A; 2RQW A; 3TVT A; 2X3X D; 2JTE A; 2EW3 A; 1MV0 B; 1OV3 A; 1JXO A; 1Z9Z A; 2YUO A; 5ECA A; 3JV3 A; 1ABQ A; 2BTT A; 1PRL C; 3NGP A; 3EGU A; 4A63 B; 2J6F A; 4Z8A A; 2RQV A; 1QWF A; 2A08 A; 1I07 A; 1M3C A; 2NUZ A; 3NMZ C; 2MOX A; 4AG1 C; 2EYY A; 2K3B A; 2AKK A; 4ORZ A; 4HVU A; 1AWX A; 3VS7 A; 2HDA A; 1T0H A; 2DA9 A; 2RQU A; 1W70 A; 2DL3 A; 3PVL A; 1WX6 A; 2J6K A; 1H8K A; 2EQI A; 2YDL A; 1NM7 A; 2QDL A; 2JMA A; 4J9B A; 4CC4 B; 2KGT A; 3SHW A; 4DEY A; 1X69 A; 1WXU A; 1I1J A; 1SRM A; 2V1R A; 2O88 A; 1HSQ A; 4J9I A; 2C0I A; 2F2X A; 2LP5 A; 4AFQ C; 1X6B A; 4JZ4 A; 2EVR A; 1OPL A; 2VKN A; 3C0C A; 4WCI A; 2D8J A; 2O9S A; 5IH2 A; 1MV3 A; 4RTZ A; 1HJD A; 1M8M A; 1UJY A; 3UF4 A; 2EGE A; 2LQW A; 1SEM A; 2K79 A; 2BZY A; 4KRT A; 4OMP A; 3I9Q A; 1WA7 A; 1U3O A; 2JS2 A; 1QKX A; 2DL7 A; 3PE0 A; 2B86 A; 2KXD A; 4RTU A; 1EFN A; 3QWX X; 2E5K A; 2KRS A; 2FPE A; 2FRY A; 4ZNX A; 1H3H A; 2KXC A; 2AKL A; 5GJV B; 1BBZ A; 2M0Y A; 2K7A A; 1AZE A; 1Z9Q A; 3I5R A; 3NPF A; 4IIO A; 1E6G A; 4GBQ A; 1JQQ A; 4JZ3 A; 3I35 A; 1W1F A; 4RTX A; 1SPK A; 3GBQ A; 3M0S A; 3A98 A; 1KSW A; 1AVZ C; 1A0N B; 2ED1 A; 4AG2 C; 1UTI A; 2ESW A; 2KE9 A; 3QWY A; 1NLP C; 2LZ6 B; 1YWO A; 2RPN A; 2GTJ A; 4X1V A; 4J9H A; 1M27 C; 1G83 A; 1TG0 A; 1K0X A; 5FWC A; 2JW4 A; 2P4R A; 1QWE A; 3O5Z A; 1PKS A; 1U5S A; 2YUQ A; 2BZX A; 4Z89 A; 1J3T A; 1Y57 A; 2CUD A; 2K9G A; 2M51 A; 1VYU A; 1WXB A; 2DRK A; 1AD5 A; 2DBM A; 1UUE A; 1RLP C; 2A36 A; 1ZX6 A; 2GTO A; 1SSH A; 4JJB A; 4AFZ C; 4D8K A; 3H0H A; 2XMF A; 1KFZ A; 4AFS C; 1FYN A; 1AWW A; 2DL5 A; 5EC7 A; 2PZ1 A; 1JXM A; 4F17 A; 1X6G A; 3EG2 A; 1UEC A; 2CT4 A; 1W6X A; 3RBB B; 2CT3 A; 4R0K A; 3EG1 A; 3M0U A; 4RTV A; 3ZL7 C; 4J9E A; 2D0N A; 3REA B; 2CDT A; 4CC2 A; 1BU1 A; 1XOV A; 3IQL A; 3EHR A; 2CSQ A; 3UA6 A; 2AZV A; 4Y92 A; 2DYB A; 4GLM A; 1B07 A; 2KBT A; 1WIE A; 2RF0 A; 2DNU A; 1TUD A; 2YUN A; 1E7O A; 2W10 A; 4K11 A; 2JMC A; 2A37 A; 1GL5 A; 1ZUY A; 1WLP B; 1LCK A; 2L0A A; 4JJC A; 4J9F A; 1WFW A; 2KRM A; 1ZUK A; 2RQR A; 2LMJ A; 2DIL A; 2V1Q A; 1CKA A; 2KYM A; 1YNZ A; 2RQT A; 5IHI A; 4AFU C; 1ABO A; 4J9C A; 2L3Q A; 1CSK A; 2SEM A; 2J7I A; 4OMO A; 1VYT A; 2GGR A; 2W0Z A; 1U06 A; 2F2W A; 2LJ1 A; 1NYG A; 1V1C A; 4D8D A; 5IXB A; 2I0N A; 3VS3 A; 3VRY A; 4RUG A; 4FSS A; 1UHC A; 2DF6 A; 1JU5 C; 4RTY A; 1AWO A; 2DX1 A; 2ECZ A; 5I22 A; 1PKT A; 1UFF A; 2RNA A; 2FPF A; 2DRM A; 2F2V A; 2EYW A; 1BB9 A; 2ED0 A; 3REB B; 5HCK A; 2EYX A; 1M3A A; 4LNP A; 1WI7 A; 2KRN A; 2RN8 A; 1AEY A; 4E6R A; 2EGA A; 2FRW A; 3VRZ A; 1OEB A; 2DL8 A; 1K4U S; 1UG1 A; 1E6H A; 3THK A; 3SEM A; 1K0S A; 3H0F A; 2C0O A; 1N5Z A; 1NEB A; 2KYB A; 5FW9 A; 3VS1 A; 3RNJ A; 3VS4 A; 1NG2 A; 2X3W D; 2SRC A; 4F14 A; 1M3B A; 4QT7 A; 2JS0 A; 4OML A; 1ZSG A; 1QCF A; 3VS5 A; 5L23 A; 1WXT A; 2PTK A; 2YSQ A; 3NHN A; 2O2O A; 4LUE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DIQ A; 3CPF A; 1JB0 E; 4Q5W A; 4M7D G; 4FT4 A; 2XI9 A; 2VWF A; 2FB7 A; 1VQM T; 2KR3 A; 4EIK A; 3RUX A; 2LQN A; 3HRT A; 1KQ2 A; 2L2P A; 1G3S A; 3CC2 T; 4LD6 A; 3ULR B; 3L2W A; 1Q81 R; 2J05 A; 4PJO B; 2CH4 W; 4A53 A; 2OI3 A; 3M4G A; 1RAB B; 4PLI A; 4OMM A; 3SB2 A; 3EH1 A; 1VQO T; 3EFO A; 2E10 A; 1UGV A; 2QQ9 A; 2QXF A; 4FYV B; 1VQ5 A; 4PJO C; 1KQ1 A; 1BI3 A; 2M9U A; 2HL3 A; 2EKH A; 2EYZ A; 2O9V A; 4DQ2 A; 3CCR T; 3G4S Q; 2CZ1 B; 2DE0 X; 1PD0 A; 4N4G A; 5GAN j; 4DOW A; 4DBH A; 2E41 A; 2CP2 A; 4AMC A; 4HVV A; 1OPK A; 4C92 B; 2AK5 A; 4KUD K; 2G3R A; 1OZ3 A; 2ZAE A; 3PIP A; 3UA7 A; 1K9A A; 1U1S A; 2NLU A; 4HCZ A; 2VVK A; 1JBM A; 3QUI A; 4QQG A; 3KBG A; 5IAY A; 2CZ7 B; 4KH0 B; 1G8X A; 2JTM A; 4C92 C; 3L2Z A; 1B34 B; 4OMF B; 3URG A; 4O6J A; 4OB2 B; 1YWP A; 4ZGD B; 2JM9 A; 4M78 G; 5LJ3 h; 4O5V A; 5GAO l; 2MIO A; 2OTL A; 4JUV A; 4F7U G; 1OYX A; 1YI2 T; 3CCM Q; 3UAT A; 3AT1 B; 1NEG A; 1C1A A; 3A5Z B; 1VQ7 A; 1VQ9 T; 1S1N A; 3TSZ A; 3VS2 A; 3JCM J; 4LD9 K; 3CD6 A; 1WNL A; 1I81 A; 1ZA2 B; 2CH4 A; 4OMQ A; 1VIE A; 3ZFJ A; 3A8O B; 1PCX A; 1QVG A; 4DBF A; 2KI7 A; 3P8H A; 4A4E A; 1K1Z A; 5AYF A; 3M0R A; 1FXX A; 4IIM A; 3RDV A; 2COZ A; 3PIO A; 1AOJ A; 4PFO A; 4FSX A; 3ER0 A; 4M75 B; 2J6O A; 5I11 A; 4NOY A; 2X9H A; 4OMN A; 1YJ9 A; 3CCS T; 3QZ5 B; 1IHV A; 2D0Q B; 2FG0 A; 1RI9 A; 5GAN g; 1SHG A; 1GCQ C; 2D9T A; 5GAN d; 4BAC A; 4DOV A; 1IZ6 A; 4QW2 A; 2QA4 T; 3PFS A; 4LUD A; 4B9X A; 3JCM W; 3OQ5 A; 3OYJ A; 1GCQ A; 3QHS A; 5C0M A; 1BIA A; 2LCS A; 2JT4 A; 2QTX A; 2ROT A; 3CCJ T; 3G4S A; 3VS6 A; 1YJN Q; 2R5A A; 2JM8 A; 2NUT A; 1IO6 A; 1VA7 A; 1MHN A; 1SHF A; 3CMA T; 3TVT A; 5DY9 A; 2QGF B; 1TOV A; 1Y7X A; 1Z9Z A; 2YUO A; 5ECA A; 1I5O B; 1X75 C; 3GF5 A; 2BTT A; 3LGF A; 1N9S A; 3OYK A; 4XQ3 A; 3G71 A; 4Z8A A; 2RQV A; 1QWF A; 4OGC A; 1I07 A; 5LJ3 f; 2NUZ A; 2H3J A; 1H3Z A; 3LWI A; 2K2V A; 2AKK A; 4ORZ A; 4QKU A; 1Y96 A; 3ZBD A; 1Q82 C; 1W70 A; 3CC4 T; 2DEU A; 1WQ7 A; 2LRQ A; 2DL3 A; 3PVL A; 1WX6 A; 2HMA A; 5GAM h; 1D1C A; 4CC4 B; 2BIV A; 5KYU B; 1W2B A; 2JJ9 A; 3SHW A; 4A4K A; 5J26 A; 1SRM A; 4KGZ B; 2V1R A; 1VQK A; 1W4S A; 1EIF A; 4QQ6 A; 1KHC A; 3OYM A; 2C0I A; 4AFQ C; 3QJ6 A; 2O4X B; 3HHT B; 3JCM X; 4C0G A; 1RAI B; 2P0K A; 4M7A D; 1RAF B; 5IH2 A; 4RTZ A; 4XU3 A; 1DJ7 B; 3CCQ Q; 4M7A F; 2EGE A; 2LQW A; 1SEM A; 3SWN A; 4OMP A; 2O01 E; 2DL7 A; 3MEU A; 3RKY A; 3MPU B; 4BI8 B; 3S3O A; 2KXC A; 4A54 A; 4R55 A; 1BBZ A; 2X4J A; 2K7A A; 4II1 A; 4HCB A; 2I2L A; 4JLI A; 3JB9 H; 4GBQ A; 3CC7 T; 1JQQ A; 1XNI A; 2BUD A; 3E9F A; 1UGQ B; 4RTX A; 3M0S A; 1Q82 R; 1XQH A; 5GAO m; 2ED1 A; 1U8R A; 4E7J A; 1UTI A; 4IUU A; 1WJR A; 3OYG A; 3FLG A; 2RPN A; 2OTJ T; 3OSV A; 4C8Q D; 2A3L A; 2DD4 A; 3I55 A; 3J80 E; 2CZ0 B; 4J9H A; 1G83 A; 5LJ5 e; 2JW4 A; 4C8Q F; 1TWB A; 3O5Z A; 1U5S A; 3CCE T; 2GFU A; 5LJ3 e; 1M4Z A; 2EQM A; 4Z89 A; 3JCM h; 1Y57 A; 3CCL A; 2BE7 D; 2K9G A; 1QVP A; 1VYU A; 4BI3 A; 4LDX A; 3V8L A; 3CCU A; 2QEX A; 3CCV T; 4F04 B; 1N6A A; 5GAM f; 2CGH A; 1VQ6 A; 1KHI A; 2ZCF B; 1UGR B; 2HAX A; 3H0H A; 5GAN 4; 3G6E T; 2DL5 A; 2PZ1 A; 4PFP A; 5GMK j; 3RER A; 1Q7Y C; 1IRX A; 3FIF A; 2LX9 A; 1M8V A; 2XHC A; 3EG1 A; 4FYY B; 3M0U A; 2VGN A; 4FT2 A; 3ZL7 C; 2K5L A; 4E7K A; 1OUL A; 3C95 A; 2IPO B; 2DFU A; 2RJD A; 4M77 B; 1QVF P; 4PNO A; 4GLM A; 1YIJ Q; 1W2B P; 3JCM P; 1JJ2 A; 3X24 B; 3VUB A; 2DNU A; 3G1J A; 3J81 E; 5GAO q; 3JB9 D; 2E65 A; 5HY6 A; 2LT4 A; 2YRD A; 4M77 C; 3JB9 F; 4L5G A; 2LMJ A; 2VYT A; 4BE1 A; 2XD0 A; 1VQ4 T; 3A8M B; 3GP8 A; 5IHI A; 2ZPI B; 1H64 1; 4KUL A; 3V7S A; 2P84 A; 1ABO A; 3E1S A; 1N8R U; 5A0L A; 3BY7 A; 2SEM A; 5J3B A; 5AT1 B; 4J7F A; 5A0D A; 1Q95 G; 1Y71 A; 2W0Z A; 5KE3 A; 2WSE E; 4D8D A; 4V2S A; 2I0N A; 3VS3 A; 1D1B A; 3OYL A; 4FSS A; 2DF6 A; 1AWO A; 2ECZ A; 5I22 A; 1PKT A; 5KYX A; 1BI2 A; 2F2V A; 2EYW A; 1BB9 A; 2ED0 A; 1YIT T; 1YJW T; 2EYX A; 2RJE A; 1R0C B; 3CME T; 2HL5 C; 3PMT A; 3LGL A; 2EGA A; 4PJM A; 1YHQ T; 1OEB A; 1E6H A; 3JCM f; 5A0G A; 3SEM A; 3OMC A; 4IUQ A; 1N5Z A; 3EG9 A; 3QDR B; 4XTV A; 3VS1 A; 2DZ9 A; 2SRC A; 3HPW A; 2JS0 A; 1KD1 C; 2DAQ A; 4M7A A; 3AHU A; 3JB9 J; 1WXT A; 3D7S B; 1VUB A; 4M7A E; 3NHN A; 2O2O A; 5GAM e; 4HKE A; 1NJI U; 2MYS A; 5IXF A; 1BKB A; 1Q86 C; 4MZM A; 1MMD A; 1D0Z A; 2FYK A; 1VQP A; 1KC8 C; 4N4I A; 3LW5 E; 1SRL A; 1XTD A; 2COY A; 1MUZ A; 2MWO A; 1T3L A; 5FRO A; 1B3Q A; 1YIJ A; 1MMG A; 5D6Y A; 2YRC A; 2KT8 A; 4XTY A; 1HD3 A; 2F69 A; 1YN8 A; 2M16 A; 2DBK A; 4JPB W; 2DVJ A; 3CQT A; 1YCS B; 1QQJ A; 2DVE A; 4M7D B; 2JOY A; 1K76 A; 1RAH B; 3LX7 A; 1MND A; 2E6Z A; 1OOT A; 3OA6 A; 1UHF A; 5IN1 A; 3OS2 A; 1QCN A; 1QLY A; 3L1A A; 1WHM A; 4M7D C; 3QBY A; 1UE9 A; 2X4Y A; 4C8Q A; 3GOX A; 1G3W A; 1D0X A; 4C8Q E; 1X2K A; 4B9W A; 1JJ2 P; 2JNG A; 2RHI A; 4M7D A; 2K6D A; 1KD1 R; 1VQ5 Q; 2EQK A; 2MAM A; 1TSF A; 2DER A; 1M2V B; 2ENM A; 4M7A G; 3QYH B; 1Q86 R; 3M0T A; 1KJW A; 2KEA A; 1Q81 C; 2GBQ A; 1KC8 R; 3RR6 A; 3CC2 A; 2IIM A; 4CC7 A; 3M0P A; 5DLO A; 3MEW A; 2DET A; 1G2B A; 3PTA A; 2Y4X A; 2GQI A; 3R6N A; 4HXJ A; 4M75 D; 4F16 A; 4M78 B; 4HVW A; 3OYF A; 2YRV A; 4M4Z A; 2KSS A; 1OZ2 A; 1VQO A; 3PGG A; 4F7U B; 2PUK B; 4OGE A; 3S3M A; 3KFV A; 2OTL Q; 3H41 A; 1AZG B; 2RMO A; 2CP3 A; 2CSI A; 4A4F A; 2YUP A; 4RTW A; 2EBP A; 4OB3 B; 1VQ7 Q; 4ZN1 A; 4DEX A; 3CD6 Q; 1KK7 A; 4JS5 A; 1X2Q A; 1LNX A; 2HBW A; 3CPW A; 2E12 A; 3HRS A; 3U23 A; 4ELY C; 2ATC B; 2KMT A; 4N4H A; 1GBQ A; 5GMK i; 2R58 A; 4C8Q G; 3V7C A; 1I4K 1; 3HKS A; 4LE9 A; 3M0Q A; 1UB4 A; 2RO0 A; 3EFO B; 2QDY B; 1UDL A; 1WDX A; 1RLQ C; 3EG3 A; 1M2O A; 3OYY A; 3EFR A; 5GAN 3; 1YJ9 Q; 2KAF A; 3CBP A; 1VQN Q; 2DMO A; 1YI2 A; 1PRM C; 4FU6 A; 4L6V 5; 2DXB A; 4PJL A; 2VC8 A; 3O8V A; 1VQ9 A; 3MCA B; 5CO7 A; 4J8O A; 1PRL C; 3M57 A; 4E47 A; 3M54 A; 4J6W A; 5DLQ E; 2A08 A; 4QVD A; 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