The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Ribosome
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| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
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| total genus |
18
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| structure length |
95
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| sequence length |
95
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| Q | PF01157 | Ribosomal_L21e | Ribosomal protein L21e |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VQ9 Q; 1QVF P; 1VQN Q; 2QEX Q; 1VQ4 Q; 3CCM Q; 1Q86 R; 1VQ5 Q; 1YJW Q; 2OTL Q; 3CME Q; 1YIT Q; 3CC7 Q; 3G6E Q; 1YHQ Q; 1NJI R; 3I56 Q; 3CMA Q; 3CC4 Q; 1VQ6 Q; 1VQK Q; 1YIJ Q; 3CCU Q; 3OW2 P; 1M1K R; 1N8R R; 1M90 R; 3CCS Q; 1YJN Q; 1VQM Q; 1VQP Q; 3CCE Q; 1Q82 R; 3CCV Q; 2QA4 Q; 1YJ9 Q; 1VQL Q; 3CPW P; 3CCR Q; 1S72 Q; 3CCL Q; 1Q7Y R; 3CCQ Q; 1QVG P; 1JJ2 P; 3G71 Q; 3CC2 Q; 3CCJ Q; 1K9M R; 1K8A R; 2OTJ Q; 1KC8 R; 1VQ7 Q; 1Q81 R; 1YI2 Q; 1W2B P; 1KQS P; 3CXC P; 3CD6 Q; 3I55 Q; 1VQO Q; 1VQ8 Q; 1KD1 R; 1K73 R; 3G4S Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 1FXX A; 1QVF P; 1OQK A; 1WHM A; 1JB0 E; 1PD0 A; 3A98 A; 4F17 A; 5D6X A; 2LCL A; 2JT4 A; 3JCM g; 2K5I A; 1RAG B; 3X26 B; 1PNJ A; 4DA4 A; 4BI4 A; 1FYN A; 2X3W D; 2Y90 A; 5CKD A; 5GAM e; 2EIF A; 2LX9 A; 1N9S A; 4XQ3 A; 1G8X A; 3M0S A; 2GFU A; 2BZ8 A; 2WAC A; 2J05 A; 1MV0 B; 2QEX Q; 5GMK i; 1QKX A; 1Q86 U; 1Z9Q A; 1IZ6 A; 3GLX A; 1OOT A; 2KT8 A; 4OVA A; 4PJO G; 5GAO m; 1M1G A; 4FW2 A; 1GXI E; 1QCO A; 2COW A; 5J3B A; 3OYF A; 3CEY A; 3EFS A; 2DZC A; 2BIV A; 1U3O A; 5FU6 C; 1O75 A; 1ZUY A; 8AT1 B; 3I9Q A; 3NPF A; 2V8K A; 4C0D B; 1PHT A; 1RAI B; 3MEU A; 1VQ4 A; 4JS5 A; 3H9N A; 3NTK A; 2JTF A; 3I56 Q; 2KBT A; 4WTO B; 1ZBX A; 1M2V A; 4Q5W A; 1YI2 T; 4XTU A; 1TUD A; 1U1T A; 5CK9 A; 3M53 A; 4CC7 A; 4HA8 A; 4XK8 E; 2D9T A; 2L3S A; 2FG0 A; 2KXD A; 3C94 A; 4D8D A; 5GAN j; 1IGU A; 2QYZ A; 4GLK A; 2LJ1 A; 5EG2 A; 1VQ5 Q; 3CCM Q; 3H0I A; 3VU3 C; 4Z8A A; 2JM9 A; 4OMO A; 5IXF A; 4JLG A; 2DFU A; 3TSZ A; 4KGZ B; 3RKX A; 5LJ5 h; 1AHJ B; 4XU1 A; 1NEG A; 3OS2 A; 4LD6 A; 3QWX X; 1RAH B; 3QZ5 B; 1OV3 A; 4OGE A; 3R6O A; 2QAZ A; 4Z88 A; 1V29 B; 4IUU A; 4BD3 A; 2BTT A; 3A8H B; 2CP2 A; 1YJW Q; 2OJ2 A; 5FU7 C; 3CC2 T; 5GAM h; 1AZE A; 4KH1 B; 4JDS A; 5HK0 A; 3GP8 A; 1ACM B; 1WA7 A; 2DJQ A; 3REB B; 1I5L A; 4NOY A; 1GL5 A; 5GMK h; 2YRC A; 2DL3 A; 2MK5 A; 4J6X A; 2JOY A; 1TG0 A; 2HQX A; 1GCQ A; 3VRY A; 2EJG A; 2HZY A; 3R6N A; 5I2S A; 4BB7 A; 1WGS A; 2D8J A; 1M4Z A; 1X6O A; 4LDY A; 4J83 A; 3JV3 A; 1BIA A; 2DRM A; 4HCC A; 3I5S A; 3MJX A; 2O4X A; 4ME7 A; 1LPL A; 2LJ0 A; 1EFN A; 2R5A A; 2O9V A; 4PKC C; 3P8B B; 4IUR A; 2DKG A; 3MKD A; 4A4E A; 4XU3 A; 1AWO A; 4LDU A; 3HHT B; 1WFW A; 4X1V A; 1SSH A; 4M4Z A; 4R55 A; 1VQM T; 2FL7 A; 5FRN A; 3HFN A; 3KUF A; 2PZ1 A; 5DLO A; 4HT8 A; 3RR6 A; 1QCF A; 1VQK Q; 1QMC A; 2FPD A; 3M5A A; 4QQD A; 1JJ2 A; 3MO8 A; 5HKC A; 1QP2 A; 4OMN A; 4II1 A; 1N8R C; 4RTT A; 4XTZ A; 4XTX A; 1E6H A; 3CC2 A; 1G83 A; 2BE9 B; 1SRL A; 3CBM A; 1X01 A; 2G6F X; 2H3J A; 4MZP A; 4RTX A; 4FCY A; 1ABO A; 3JB9 I; 1Y96 A; 4C8Q C; 2RI5 A; 1IO6 A; 2RJF A; 1RAE B; 3CCQ T; 1YIT Q; 4L59 A; 3C95 A; 4PJM A; 4BDZ A; 2JTE A; 3V8K A; 3CCE Q; 5CKB A; 1Q82 R; 1BCM A; 4YTL A; 4FYY B; 1BI1 A; 4P5N A; 2QEX T; 1KSW A; 1Q7Y R; 2R5M A; 4EMG A; 3TU4 K; 1WDX A; 4HCZ A; 4NS5 A; 2DVE A; 1T0J A; 5A2Q E; 3G1J A; 4JS4 A; 3CC7 Q; 2VGN A; 4IUT A; 4IIO A; 4C5G A; 2IVW A; 4M7D C; 2YUN A; 2LDM A; 4HVU A; 3MP6 A; 2F2V A; 4C5I A; 3HKS A; 4FU6 A; 2DE0 X; 3EHR A; 4E7H A; 1YIJ Q; 3TRE A; 2RK2 A; 5HK3 A; 1N9R A; 3CCU A; 5GAO p; 3DLL A; 1VQM A; 2FO0 A; 4OB2 B; 2RPN A; 1H3H A; 1WZO A; 3I56 T; 4RCB A; 2QTX A; 3QG1 A; 1JXO A; 1K0X A; 2QQA A; 2DAQ A; 4JZ3 A; 3SB2 A; 2E5Q A; 2ESW A; 3N5B B; 3QJY A; 4M77 F; 4M7A C; 4M77 B; 2VGM A; 2V8J A; 3CCM T; 4HVV A; 4J9G A; 4L5G A; 2DA9 A; 3HFO A; 4QQ6 A; 4EDU A; 2O4X B; 2QEX A; 2BZY A; 3CME Q; 3A8G B; 3CCJ T; 3F70 A; 5KYW A; 3ULR B; 2X4X A; 2RQT A; 5D6W A; 3QO3 A; 3VRZ A; 3CCV Q; 3CCR Q; 1VQP A; 2E65 A; 1YJW T; 4OP0 A; 2AKK A; 3OS5 A; 4CC4 B; 1QWE A; 4AG1 C; 1VQ8 Q; 4KUI A; 3M4G A; 2V1R A; 5EC7 A; 2EYY A; 1D0X A; 4JJN K; 3I56 A; 1AD5 A; 2HD0 A; 1TH7 A; 1SHG A; 1ABQ A; 3CBP A; 2K4Y A; 2L89 A; 5C6S A; 3JRZ A; 2CZ0 B; 1UFF A; 4OB1 B; 3RMQ A; 1QWF A; 3J81 E; 4FT2 A; 3C4S A; 2A08 A; 1VQ5 A; 3OBY A; 1SRM A; 8ATC B; 2E64 A; 5FWC A; 2RHX A; 1TOV A; 4C8Q E; 3V8L A; 3JB9 G; 2CH4 A; 1KK7 A; 1J3T A; 1JQQ A; 3AT1 B; 1D09 B; 2QQ9 A; 4MDX A; 3JB9 J; 3OS1 A; 1K8A C; 1VQK T; 1ARK A; 3I55 Q; 1OPL A; 1YNZ A; 1M5Q 1; 1VQO A; 2D8H A; 2RHU A; 2EKH A; 2F1L A; 3TQ7 P; 1IHV A; 5FU6 B; 1NJI R; 3CC4 Q; 2LMJ A; 1VQ7 T; 4FIB A; 2EQU A; 1XJW B; 1WIE A; 1VOM A; 2XKO C; 1D1A A; 1RI0 A; 2YLB A; 3MP8 A; 1W4S A; 1N8R U; 3ZFJ A; 2DLP A; 4C8Q A; 1YIT T; 2PU9 B; 3FB9 A; 4J9H A; 1HSQ A; 4F7U E; 2GTO A; 4LNP A; 3QDR B; 5IXB A; 3TCJ A; 3VS3 A; 4ZN1 A; 2AHJ B; 2HBP A; 4FYX B; 2DK3 A; 4JRQ A; 3CCE T; 3KXT A; 1N6A A; 2CP3 A; 2COZ A; 1TUG B; 2KR3 A; 1X69 A; 2CSQ A; 2RJD A; 2QK0 A; 3FRN A; 3JCM W; 2QQR A; 4OMF B; 1I81 A; 2DBK A; 4AG2 C; 5IHK A; 3OYE A; 4ATO A; 1WXT A; 4AT1 B; 3LH5 A; 1YBY A; 4M7A E; 1PSF A; 2DVJ A; 1KC8 C; 2M02 A; 1Q81 U; 4F7U A; 2ZPE B; 5KYW B; 2MWP A; 1YWP A; 2CH4 W; 3NFC A; 2DXB A; 2X51 A; 3MPU B; 2SRC A; 2KYM A; 4QQG A; 3OYC A; 1M90 C; 1D0Y A; 2EJ9 A; 3L2Q A; 2X9H A; 5FU7 B; 2AK5 A; 1C0M A; 1QVG P; 5GAN d; 2JNG A; 1OYX A; 1KQS P; 2DYI A; 1SSF A; 2MMP A; 3CBO A; 4A4H A; 1K73 R; 1UEB A; 1VQ6 A; 4M7A A; 5KYY B; 2DER A; 2DL7 A; 1YIT A; 1QP3 A; 2FZK B; 4HKE A; 1QW1 A; 1D0Z A; 3MCA B; 1YJ9 Q; 4HT9 A; 3CCL Q; 2HCK A; 3BDU A; 1T3L A; 4WF2 A; 5GAN 3; 3CC7 A; 2AZS A; 4XTY A; 2OTL Q; 1BI0 A; 3EG1 A; 3CCR T; 2EYW A; 1VQN A; 1HJD A; 1EX4 A; 3REA B; 1JBM A; 1YIJ A; 4EIK A; 1VQ8 T; 1MMG A; 1OEB A; 2CS7 A; 3P8H A; 2HKQ B; 3RKY A; 1NBE B; 1OPK A; 1YN8 A; 1MGQ A; 1BIB A; 1K9M C; 1UJ0 A; 2AKL A; 1TU0 B; 1MUZ A; 2DNU A; 2YLC A; 2A28 A; 1MMA A; 4M75 C; 3X20 B; 2C06 A; 4C8Q B; 3QXE B; 3V7R A; 1RLP C; 1ZUK A; 2HQE A; 5A0G A; 2L0A A; 4IUQ A; 3E1S A; 1I1J A; 3CME A; 1UGQ B; 4HVW A; 4BE0 A; 3HRS A; 4LE9 A; 4M7D F; 2DTH A; 1CSK A; 1M1K R; 3PMI A; 3I55 T; 4M7D B; 1YJN Q; 4ZGE B; 4FYV B; 3CCV A; 4E7J A; 3A8M B; 5C0M A; 2HAX A; 1QVP A; 4J9I A; 3CC4 T; 4F7U B; 2EJF A; 2LZ6 B; 1K8A U; 3MEA A; 5GMK m; 3S3N A; 1VQ8 A; 4M78 C; 3QZ9 B; 2GQV A; 2P0K A; 4B6M A; 3E2U A; 5GAN g; 2X4Y A; 1WXB A; 3NHN A; 5FRO A; 3OYD A; 2RN8 A; 1KQS A; 1U1S A; 4M7A B; 5LJ3 e; 1T0H A; 3OA6 A; 5D6Y A; 4LUE A; 5GAO l; 2VXE A; 2DXU A; 2K2M A; 2LVM A; 3L42 A; 4XU2 A; 1I07 A; 3OSV A; 2BKD N; 2DIG A; 3VUZ A; 4JPB W; 3CCQ Q; 2L5Q A; 3WXM B; 3I55 A; 2PNI A; 2GFA A; 1KC8 U; 3OSS C; 1Q86 R; 4QW2 A; 3MEW A; 3PMT A; 3CC4 A; 3HRT A; 3A1P A; 2HDA A; 3CXC S; 3DLM A; 1M90 U; 5GAN 6; 1LOJ A; 3ZL7 C; 3JCM e; 4N0A C; 2A3L A; 1JJ2 P; 2FVU A; 2ABL A; 4LDW A; 4BAC A; 2CSI A; 1SF9 A; 2GBQ A; 2ED1 A; 1ZA1 B; 2RH2 A; 3VS6 A; 1YJ9 T; 2MWO A; 3CCL T; 4ZTF A; 1UTI A; 1UJY A; 3OQ5 A; 2YSQ A; 3S3M A; 3RDV A; 4DOV A; 4J9F A; 1AT1 B; 2NLU A; 2A36 A; 4FSS A; 2OTL T; 2V1Q A; 2C0T A; 2DRK A; 3JCM Q; 2BUD A; 1XQH A; 2E6N A; 2I2L A; 1WQ7 A; 2EWN A; 1G2B A; 2RK1 A; 2DO3 A; 2EW3 A; 2CP7 A; 3VS1 A; 2DET A; 1M8V A; 5LJ5 j; 2PQW A; 4F7U G; 5LJ3 h; 1UE9 A; 2ZPI B; 3L1A A; 4M77 E; 4R0K A; 3JCM V; 3OYH A; 1QCN A; 2E5K A; 3OMC A; 2QQS A; 3CCJ Q; 3OYN A; 3WVE B; 1K9M U; 1MMN A; 2HSP A; 5GAM j; 2WSF E; 2RHI A; 4JZ4 A; 2LJ3 A; 3GBQ A; 4J5Y A; 3V7S A; 5GMK j; 4Z02 A; 2CZ7 B; 3QDF A; 1WHJ A; 2YXY A; 1YJ9 A; 1CKA A; 3VJP A; 1IRX A; 2XHC A; 3FLG A; 1M27 C; 4M77 A; 3M54 A; 2DL5 A; 3FJP A; 3QBY A; 3PTA A; 3UA6 A; 5AYF A; 1YI2 A; 3G7Z A; 3PFS A; 3G4S Q; 1FMW A; 2QTV A; 1YJN T; 5ECA A; 3OW2 A; 1AEY A; 3JCM h; 5HY6 A; 4C92 C; 2JJ9 A; 2FRY A; 1LCK A; 1TTH B; 2CT3 A; 5HCK A; 1WX6 A; 1ZHI A; 2PVO B; 4Y28 E; 4FW1 A; 1R77 A; 1YP5 A; 1OZ3 A; 2X4W A; 2E70 A; 1YCY A; 2XI9 A; 1ZSG A; 3SDZ A; 2HSE B; 1V1C A; 1MHN A; 4PFO A; 3JCM b; 1X43 A; 2YHT A; 3A8L B; 3MEV A; 2AZV A; 3M55 A; 1BI2 A; 3G71 Q; 2OTJ Q; 4OML A; 1VQ7 Q; 1BU1 A; 5M9O A; 1MNE A; 3UF4 A; 3HP9 A; 4RTW A; 4DBF A; 4D8K A; 1D1C A; 2JVV A; 1R8O B; 1W6X A; 1MMD A; 1FMK A; 4PJO C; 4BDY A; 3O5Z A; 1YJN A; 2CP5 A; 4C0Z A; 2DYB A; 4VUB A; 1ZUU A; 1LJO A; 2DIL A; 4K11 A; 2QDY B; 4FYW B; 1MND A; 2O9S A; 2E41 A; 4A53 A; 5CQX A; 1Y71 A; 2KYB A; 1Q81 C; 1GBR A; 2DF6 A; 1H8K A; 3FDR A; 1NLP C; 1WLP B; 3RER A; 1PRL C; 3GNF B; 4RKU E; 5GAN 8; 1SPK A; 5IHI A; 2B86 A; 2DX1 A; 4O5V A; 3JSC A; 2KT1 A; 2Y4X A; 2KRN A; 4J6Y A; 4B9W A; 2DM1 A; 2YUO A; 1B3Q A; 2LQN A; 2RQV A; 1OU8 A; 5LL6 S; 3GIB A; 4LXC A; 4EMK C; 4M75 F; 3JB9 F; 2CDT A; 1Q7Y U; 4M75 B; 2ZPB B; 2K3Y A; 1KHI A; 4HCB A; 4KBM B; 2XDP A; 1SEM A; 3UWN A; 1XNI A; 2MF2 A; 2M51 A; 1W2B S; 2J6K A; 2P4R A; 4MMK A; 2DXC A; 3H0H A; 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3VYH B; 4N4I A; 4E7S A; 4NL2 A; 2K6D A; 2HL3 A; 2PVD B; 4IIM A; 3PVQ A; 4CI0 C; 4M77 G; 1I0C A; 1JJ2 S; 2DTI A; 1KQ1 A; 5KE3 A; 2SEM A; 3NMZ C; 3QWY A; 3OYK A; 1RI9 A; 1S72 Q; 5L8R E; 2HQH A; 4M7D A; 4DEX A; 2VV5 A; 1NG2 A; 2DPP B; 3VS5 A; 2AIR B; 4RTY A; 2EKO A; 3M0Q A; 2E6Z A; 3LLR A; 2K3X A; 1VQ4 Q; 5CCA A; 2CP6 A; 2DD4 A; 4E6R A; 3IQL A; 2XG8 D; 1OI1 A; 4AFU C; 1VQK A; 1LNX A; 2MCN A; 3GF5 A; 2MIO A; 3CXC A; 4DBR A; 4LD9 K; 3EG3 A; 1K9A A; 4XU0 A; 5CR2 A; 1UGP B; 1BK2 A; 1PKS A; 3G71 A; 2F69 A; 4OGC A; 4IUV A; 2XU8 A; 1VQ7 A; 2YT6 A; 4A4G A; 1IGQ A; 1OU9 A; 4BE1 A; 2A7Y A; 5LJ5 d; 4DBH A; 4E7K A; 4C0F A; 2D0Q B; 2EAY A; 2DJZ A; 5I11 A; 2PUK B; 1M8M A; 5LJ5 f; 1PC0 A; 3CCE A; 3M0T A; 1G3Y A; 2LTO A; 2RI3 A; 2Z0W A; 5D7U A; 4C92 F; 3G6E T; 2KRO A; 1Y0M A; 3QSU A; 4C92 B; 5GAM d; 2KQW A; 5GAN 2; 1AOJ A; 3M4Y A; 2LQK A; 1G3W A; 3E9F A; 5CKF A; 4FM4 B; 2A0F B; 1KD1 U; 2ZPG B; 2MPX C; 2VWF A; 2XID A; 4ESR A; 2YWW A; 5GAM f; 3NGP A; 2LNH B; 3OYI A; 2A37 A; 1X27 A; 5GAN 4; 2L3P A; 3SHW A; 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