The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
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sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Ribosome
|
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
|
| total genus |
20
|
| structure length |
95
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| sequence length |
95
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| Q | PF01157 | Ribosomal_L21e | Ribosomal protein L21e |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3CCE Q; 3CPW P; 1NJI R; 3CXC P; 1VQ8 Q; 1VQN Q; 1YIT Q; 1KQS P; 1K8A R; 3CCL Q; 1YI2 Q; 1YHQ Q; 3CCS Q; 1N8R R; 3CD6 Q; 3I56 Q; 3G4S Q; 1VQM Q; 1YJ9 Q; 1VQO Q; 1KC8 R; 1S72 Q; 1VQ7 Q; 3CCU Q; 2OTL Q; 1VQP Q; 1Q7Y R; 3OW2 P; 3CCR Q; 3CCV Q; 1M90 R; 1M1K R; 3CCQ Q; 1VQ4 Q; 3CCJ Q; 3CMA Q; 1YJN Q; 1VQ6 Q; 3CME Q; 3CC2 Q; 1YJW Q; 2QA4 Q; 1JJ2 P; 3I55 Q; 1Q81 R; 1QVF P; 1QVG P; 1VQ9 Q; 1W2B P; 1VQK Q; 3CC7 Q; 2OTJ Q; 1K9M R; 1KD1 R; 3G6E Q; 1VQ5 Q; 1Q86 R; 1YIJ Q; 3CCM Q; 3CC4 Q; 1Q82 R; 3G71 Q; 1K73 R; 1VQL Q; 2QEX Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 4HCZ A; 5LJ5 h; 3CC7 A; 2QDL A; 2DPP B; 5GMK j; 3RUX A; 3C12 A; 3RER A; 4AFU C; 4A4H A; 1VIE A; 3CCS T; 3EFO A; 2V1R A; 4TVR A; 3M0U A; 4NS5 A; 1N6A A; 4C8Q D; 2O9S A; 2LDM A; 3QYG B; 2XMF A; 1G3S A; 4Y91 A; 2V8I A; 3VS6 A; 1WGS A; 1MND A; 4C92 E; 3DLM A; 4OVA A; 1M5Q 1; 3E9F A; 1Q7Y R; 2DD4 A; 1ZX6 A; 1SSH A; 1V1C A; 4Z89 A; 3CD6 A; 3U23 A; 2LJ3 A; 4GLM A; 2HQH A; 2ZPH B; 1XJW B; 2LCL A; 2ZPF B; 5KYU B; 1GFC A; 3CCU T; 4B9W A; 2OTJ Q; 3GNF B; 4J8O A; 5IAY A; 1M4Z A; 3C95 A; 3HRU A; 2LRQ A; 4HT8 A; 3M54 A; 4A4F A; 1T3L A; 2DXB A; 1WHH A; 2DXT A; 5C0M A; 2RJD A; 3TRE A; 1Y57 A; 2DD5 A; 4HVV A; 4M77 F; 4N0A C; 3MEU A; 5KYX A; 3I5S A; 4PJO C; 1D0Z A; 4FL6 A; 5AYF A; 2GCX A; 3VJP A; 4J83 A; 4XTZ A; 3OA6 A; 3UPU A; 3DB4 A; 1Y96 B; 1X2Q A; 2RA2 A; 1YCY A; 4LDU A; 5HKC A; 3CCM Q; 2HCK A; 4C0D B; 1VQK A; 1N8R C; 3OYN A; 2H3J A; 1ABO A; 1CKB A; 2L3S A; 5GAM d; 2KAF A; 1K0S A; 3LLR A; 1KG1 A; 1C0M A; 5A0G A; 2BZ8 A; 4IUU A; 3LWI A; 1JJ2 P; 5FLX E; 5IHI A; 2DX1 A; 4JLG A; 1ZSZ A; 2XKO C; 5GAO l; 3MEA A; 2HBW A; 3JB9 G; 3ME9 A; 3ASK A; 4LUD A; 4OML A; 1M3A A; 3THK A; 4ELZ C; 1RAI B; 1RUW A; 3X20 B; 2DJZ A; 1Q81 C; 2J6F A; 4FW1 A; 1Y71 A; 2VVK A; 3LGL A; 1SRM A; 2V1Q A; 3H8Z A; 2E41 A; 2NLU A; 1O75 A; 4OGC A; 2JNG A; 3NGP A; 1NLO C; 2Y4Y A; 1R8O B; 3AT1 B; 2XK0 A; 4CI0 C; 4JS5 A; 1BCM A; 5GAN g; 2ATC B; 3RDV A; 4FT2 A; 4LDV A; 2W10 A; 4OMQ A; 1S72 A; 1Q82 U; 4M7D E; 1EX4 A; 2FZC B; 4OB0 B; 4PJO F; 3L1A A; 4BB7 A; 1EFN A; 4HXJ A; 1EIF A; 3CCJ T; 4YTL A; 4KH1 B; 3CPW P; 5LJ3 h; 1VQ8 Q; 4PFZ A; 1TU0 B; 3VS2 A; 4IUP A; 3RMQ A; 4C92 C; 2EYZ A; 1PC0 A; 4ORZ A; 4FYY B; 5I2M A; 4HKE A; 1A0N B; 3H9N A; 3QZ9 B; 4BDY A; 4QVZ A; 1KQS A; 3RNJ A; 2CP5 A; 2XI9 A; 2DVJ A; 1XNI A; 2K2M A; 2FVU A; 1BCO A; 3OYI A; 1VQO T; 4XAX B; 2H3E B; 5CK9 A; 1IZ6 A; 2FRW A; 1B34 B; 1ZSG A; 2QEX Q; 3HPW A; 2RN8 A; 3M0P A; 1UGP B; 4RCC A; 3CXC P; 2RHI A; 1UJY A; 3OYH A; 5J26 A; 2PZ1 A; 5KYN A; 3CC4 T; 3LW5 E; 2GTJ A; 2EYX A; 4EDU A; 3E1S A; 2D6F A; 4F7U A; 1X43 A; 1QMC A; 1AEY A; 4NL3 A; 4AFQ C; 5GAO q; 2QTX A; 1QVF S; 2XDD A; 4JRI A; 2J7I A; 4JLI A; 4PJN A; 2ZPE B; 4A4K A; 1W1F A; 4V2S A; 1EZZ B; 2E1H A; 5FRO A; 1YJN A; 3CMA T; 3CC2 A; 4FW2 A; 2FPD A; 4E7K A; 2YSQ A; 4M77 G; 5L23 A; 2HQX A; 2YLB A; 3JCM V; 3RKY A; 1ZA1 B; 1ZBJ A; 5FW9 A; 1WJR A; 2E4H A; 2DMO A; 1KK7 A; 2QA4 Q; 2DRM A; 3LH5 A; 4CC2 A; 3EGD A; 2X4Y A; 2ENM A; 2LT1 A; 4EMK B; 2DF6 A; 4F14 A; 2DTI A; 4QVD A; 4M77 B; 3CCE Q; 3INZ A; 1M2O A; 4CC4 B; 2O2O A; 1M90 U; 1B7T A; 2AKL A; 3OYA A; 2DXC A; 2EKH A; 5GAN j; 4KGX B; 2DEU A; 2MI6 A; 4C92 F; 3CCS A; 3CCL T; 2DER A; 4F17 A; 1XTD A; 2QGF B; 4XU2 A; 3I56 T; 3G4S T; 2E5Q A; 1VQP T; 2VGM A; 2PQW A; 6AT1 B; 1X27 A; 1D1C A; 1E6H A; 2JM9 A; 3CEY A; 3CME A; 1PNJ A; 3CPF A; 2CH4 W; 3JCM h; 3SWN C; 2RM4 A; 1JEG A; 3I35 A; 4C0Z A; 2K5I A; 2DIQ A; 2O88 A; 2RD1 A; 4R56 A; 2YUO A; 3X26 B; 4OB2 B; 4M7A C; 1MMN A; 2RI2 A; 5IHN A; 1BI0 A; 1U1S A; 3SFM A; 2L89 A; 3MEW A; 2D0Q B; 2QQA A; 1G3Y A; 2JTE A; 1ZHI A; 2FPE A; 3CCR Q; 4ZGD B; 2RHU A; 5FWC A; 2QDY B; 3EGX B; 5LJ3 f; 3WXM B; 1WNL A; 2AIR B; 3EG0 A; 1K9M C; 4PJO G; 1E6G A; 2HL3 A; 1VQ6 A; 4J9B A; 4PL6 A; 4IKF A; 1K9A A; 1YBY A; 4JPB W; 5GAN 5; 1M1K U; 3C0C A; 2EQJ A; 1Y96 A; 2MMP A; 3SEM A; 4PJO B; 3X28 B; 2ESW A; 2D1X A; 2FHD A; 3JCM P; 1FWZ A; 4MZT A; 4RTU A; 2LQ8 A; 2LQW A; 8AT1 B; 1I81 A; 4M7A D; 4MZP A; 1YIJ Q; 1WJQ A; 2GGR A; 1QP2 A; 3E19 A; 3SDZ A; 1TS9 A; 5D6Y A; 3H0I A; 5EG2 A; 3OYD A; 3GOX A; 4BDZ A; 4IUT A; 3QO3 A; 1K4U S; 3N5B B; 5GAN f; 1YI2 T; 1YFN A; 1YJ9 A; 1VYV A; 1FMW A; 1JXM A; 3CD6 T; 2Y90 A; 4BI4 A; 1PRM C; 1I5L A; 1YN8 A; 1KD1 R; 1AZE A; 3V7C A; 4M7A F; 1NZ9 A; 3M0S A; 1JXO A; 3UA7 A; 2LX7 A; 1W2B A; 5GAN 6; 1VQN Q; 1UUE A; 1VQ9 T; 2AHJ B; 3L42 A; 1G5V A; 2L5Q A; 2FYK A; 3A8M B; 2E12 A; 1TUG B; 2GFU A; 3KUF A; 5IXF A; 1TUD A; 2JJ9 A; 5IXB A; 4AFS C; 2P0P A; 1VQ5 Q; 1RI0 A; 4BE2 A; 3RKW A; 3OYJ A; 4XU3 A; 1BU1 A; 1D09 B; 2EBP A; 5A0D A; 5LL6 S; 3KFV A; 2NUT B; 2K4Y A; 1VQK T; 2JS2 A; 2XDP A; 4FYW B; 4BE1 A; 2YRV A; 2A0F B; 4C92 G; 1OQK A; 2B8A A; 2EYW A; 1VOM A; 3TSZ A; 4OMP A; 5CQX A; 3URG A; 2KSS A; 3JAM E; 2B86 A; 2KYB A; 3X25 B; 4JZ3 A; 3JB9 I; 4C92 B; 2KVQ G; 2FPF A; 1VQL A; 2DM1 A; 1MGQ A; 2LNH B; 2LVM A; 3CCU Q; 2F5T X; 3FB9 A; 1M8V A; 1BI2 A; 2F69 A; 4M4Z A; 1Y7X A; 3PIP A; 2E65 A; 4J6Y A; 3O8V A; 4O6J A; 2LC4 A; 4KH0 B; 1D1B A; 3CMA A; 1NYF A; 1X6O A; 1H8K A; 2RB6 A; 1AWJ A; 3OB9 A; 1NBE B; 4QW2 A; 5IN1 A; 1Q7Y C; 2X35 A; 5I11 A; 2MK5 A; 3PMT A; 5KYW B; 4XTY A; 3EG9 B; 1NEG A; 1TUC A; 1S72 T; 4GLK A; 2M9U A; 2K7A A; 4PK4 A; 2R58 A; 5CKE A; 2HDA A; 3G6E A; 2DYB A; 2E3I A; 4BE0 A; 4EMK A; 2HD0 A; 3OW2 P; 2O4X A; 4LE9 A; 2RHX A; 3CCL A; 1SRL A; 5FU7 C; 4M77 A; 5LJ5 g; 1FX7 A; 2ZZD A; 3I56 A; 3G4S A; 1VQM A; 1VQP A; 3EHR A; 1UEB A; 3GBQ A; 3PNW C; 2YWW A; 1UHC A; 2LQK A; 2HZY A; 2D8J A; 3T9N A; 3OYC A; 3JB9 F; 2JOY A; 2K3Y A; 3D7S B; 3RR6 A; 1OOT A; 2DLP A; 1M3B A; 1Q95 G; 5GMK e; 1F1B B; 3NMZ C; 3JCM Q; 4LD9 K; 2RI3 A; 2YXY A; 1JJ2 S; 2HSP A; 3Q1J A; 4RUG A; 4XTW A; 4M7D G; 1YJW A; 1YJN T; 1NJI R; 3CC2 T; 4DBF A; 5GAM h; 1RAC B; 3G71 A; 4DOW A; 3PMI A; 4A63 B; 4BAC A; 1AWO A; 3UAT A; 2X3X D; 4AG2 C; 3QHS A; 2DYI A; 2M51 A; 3I9Q A; 4M7D B; 2COY A; 3M57 A; 1QVG P; 1SHF A; 4BY6 B; 1QCF A; 4IUQ A; 2LTO A; 2E3H A; 1OX8 A; 3L2V A; 3BDL A; 3JRZ A; 4LUE A; 4LNP A; 4AFZ C; 5GMK l; 4J5Y A; 2HAX A; 4M78 E; 1VQO Q; 1IGQ A; 2OX7 A; 1K1Z A; 4Z88 A; 3UWN A; 4DBQ A; 4ZGE B; 1M2V B; 4II1 A; 4PFP A; 3HP9 A; 3FLG A; 4Y92 A; 2QQB A; 2KBT A; 4N0A A; 3IQL A; 1X2K A; 3M0T A; 2OJ2 A; 2MWO A; 1N8R U; 1K73 R; 4PJO A; 2V8K A; 3CME T; 3MKD A; 2QQ9 A; 2F2V A; 2X51 A; 2YT6 A; 4M77 D; 1VQ8 A; 5I2S A; 5LJ5 j; 1YI2 A; 4DOV A; 4LXC A; 1PHT A; 3A8G B; 2RI5 A; 4J9E A; 2MWP A; 2FEI A; 3CBO A; 2MF2 A; 1TSF A; 3NTI A; 1ARK A; 1VQ9 A; 5GAN 8; 2PUK B; 3PIO A; 3OSS C; 2QEX A; 1QQJ A; 5GAN 4; 2JM8 A; 1BBZ A; 3ZFJ A; 1UG1 A; 1Q81 U; 2DBK A; 2FZK B; 2P4T A; 1VYU A; 1XQH A; 2EFI A; 2A36 A; 2CUB A; 1N9S A; 2HSE B; 2DA9 A; 3NHN A; 2JS0 A; 2RHY A; 1VQ6 T; 1G83 A; 2A7Y A; 3FJ5 A; 1K8A R; 2R5A A; 2XDB A; 3VRZ A; 4XTV A; 1U06 A; 4JS4 A; 4OP0 A; 1IGU A; 4A4E A; 4XU1 A; 5LJ3 g; 1W70 A; 2K9G A; 1VQ7 T; 1D0Y A; 1VYT A; 2NUT A; 5DLO A; 2EQM A; 2KNB B; 2DK3 A; 1S1N A; 4R0K A; 4E7L A; 2JZ2 A; 4PKC C; 5CR2 A; 3PTA A; 5GJV B; 3HRS A; 1YHQ Q; 2CP3 A; 4L6V 5; 4RTZ A; 1G2B A; 1HYO A; 3CCE A; 2K2V A; 3PFS A; 5GAM f; 1YJ9 T; 4PJO D; 4C92 A; 2KXD A; 1BIB A; 3GNG A; 4B9X A; 3CCV A; 1WYX A; 4RG2 A; 1BB9 A; 4F7U E; 3VUB A; 4Q5W A; 4N4G A; 4ZTJ A; 4J9G A; 3OYF A; 3I55 A; 3FDR A; 2FL7 A; 4RTX A; 2KRN A; 2P84 A; 1KQS P; 4XTX A; 3UA6 A; 5KYY A; 1H64 1; 1RLP C; 2ZPG B; 2V8J A; 5LJ3 e; 5IT9 E; 2DAQ A; 4RTY A; 3JCM W; 1DJ7 B; 1HJD A; 5LJ5 f; 5FRN A; 1LNX A; 4QVC A; 1FMV A; 1WHL A; 3CC7 Q; 1N9R A; 4OMO A; 3R6N A; 2E64 A; 4J9F A; 2CDT A; 3V8K A; 1ZQ1 A; 1JJ2 A; 5KYW A; 2DNU A; 3EG9 A; 1D3B B; 1U3O A; 3HFO A; 4KRT A; 2AT1 B; 3RES A; 4KGV B; 3MP6 A; 2FRY A; 1YNZ A; 3OQ5 A; 4FT4 A; 4LDX A; 1W2B S; 1M30 A; 2Z0W A; 4JZ4 A; 5GAO m; 4MDW A; 1ZUK A; 2EJG A; 1NE8 A; 2KRM A; 3CD6 Q; 3QDR B; 1KC8 R; 2FB7 A; 1VQL T; 3C4S A; 3J7A F; 5GAN e; 5LJ3 j; 3M59 A; 2A37 A; 2KI7 A; 3BW1 A; 1NPR A; 1IHW A; 5FU7 B; 2XIC A; 3JCM g; 2EAY A; 2EGC A; 2CKK A; 1JQQ A; 5KCH A; 3DLL A; 2WSC E; 2WAC A; 3KBG A; 3JB9 H; 1XOV A; 5CVI A; 1Q86 R; 4Z8A A; 3LWH A; 3FJP A; 4CC3 A; 1B07 A; 2F5K A; 2M16 A; 3CPW A; 4QQG A; 2RJE A; 4C92 D; 2ED1 A; 4HVU A; 2VAS A; 3RIR A; 1G3T A; 3SWN A; 3TEE A; 1T0H A; 3P8D A; 1KD1 C; 1NLP C; 1VQK Q; 4NOY A; 1PG5 B; 5I21 A; 2DZC A; 1RAD B; 1BI3 A; 4M7A A; 2OTJ T; 2QTV A; 1ZUY A; 3G6E T; 3CXC A; 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4ME7 A; 3A5Z B; 3HHT B; 1I0C A; 1VQ8 T; 4E7Z A; 4ZN1 A; 4ELY C; 3REB B; 5KCO A; 2M02 A; 1WPY A; 3M53 A; 2DL3 A; 1YJN Q; 2OTL A; 3CC2 Q; 1OV3 A; 4ZGJ B; 5GAO p; 2D0N A; 2COZ A; 1QVF P; 1GCP A; 2W0Z A; 2OAU A; 1MV3 A; 3CCQ A; 4JRQ A; 1VQ4 A; 1Q82 R; 5FU6 B; 4PJJ A; 2KY9 A; 4M7D F; 2E10 A; 5KE2 A; 3MJX A; 1ABQ A; 2PNI A; 1RLQ C; 3OS2 A; 4QT7 A; 2GQV A; 2QEX T; 4J9H A; 1UHF A; 4JJB A; 4M78 G; 1MMD A; 2KGT A; 4JJD A; 4F16 A; 5KYX B; 1GL5 A; 2KXC A; 2RQR A; 1OZ2 A; 3G7Z A; 1M3C A; 4PLL A; 1NJI C; 2M0Y A; 4XQ3 A; 1AD5 A; 3R6O A; 3BE3 A; 3JCM X; 1Q7Y U; 1UFF A; 2XHC A; 4M78 B; 3CCS Q; 2K3X A; 1BYM A; 2PTK A; 4ATO A; 2DE0 X; 2MPX C; 4WCI A; 1SEM A; 4X9D A; 3OMG A; 4C8Q E; 3ZBD A; 4KT0 E; 3CME Q; 3JCM f; 1QWE A; 4FSS A; 3QSU A; 2L3P A; 1C1A A; 1WHG A; 1MMA A; 2M1H A; 1RI9 A; 1ZSZ B; 2DTH A; 1WZO A; 5J3B A; 2C0T A; 2K5F A; 3CCE T; 1PD0 A; 1PD1 A; 1B34 A; 3VKI A; 5CKD A; 2K57 A; 5KH6 A; 1IRE B; 1GBR A; 2HQE A; 1RAB B; 3QG1 A; 2RJC A; 1K73 C; 3WVE B; 3VS4 A; 3CCV T; 5CIU A; 2VGN A; 3P8H A; 4E7I A; 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