The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
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sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Ribosome
|
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
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| total genus |
20
|
| structure length |
95
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| sequence length |
95
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| Q | PF01157 | Ribosomal_L21e | Ribosomal protein L21e |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VQP Q; 1YJW Q; 1VQ6 Q; 1S72 Q; 3CXC P; 1YJN Q; 2QEX Q; 1NJI R; 3CPW P; 1VQ9 Q; 1QVG P; 1VQ4 Q; 1VQ8 Q; 1K8A R; 3CC7 Q; 1VQ5 Q; 1K73 R; 1N8R R; 1Q86 R; 1KQS P; 1W2B P; 1K9M R; 3CCM Q; 1YI2 Q; 3CCQ Q; 1YIJ Q; 3G4S Q; 1VQO Q; 3CME Q; 1VQ7 Q; 1M90 R; 3G6E Q; 2OTJ Q; 3CMA Q; 1KC8 R; 1VQN Q; 1Q7Y R; 1YJ9 Q; 3CD6 Q; 1YHQ Q; 1Q82 R; 2QA4 Q; 3CC2 Q; 3OW2 P; 3CCS Q; 3CCE Q; 3CC4 Q; 3CCJ Q; 1JJ2 P; 1YIT Q; 1KD1 R; 3CCV Q; 1VQL Q; 1VQK Q; 2OTL Q; 1M1K R; 3I56 Q; 3CCU Q; 3G71 Q; 3CCR Q; 1QVF P; 3CCL Q; 1Q81 R; 1VQM Q; 3I55 Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 2X4Y A; 3P8D A; 2MWP A; 2HEQ A; 1QWF A; 4Y92 A; 3ULR B; 2Y90 A; 3RBB B; 2CDT A; 2PVD B; 3LH0 A; 2OAU A; 4M78 B; 3GPL A; 3EGD A; 1UGP B; 3GNG A; 2JTM A; 4XU0 A; 1QVG S; 1GCP A; 4Z88 A; 3GBQ A; 4X9D A; 1C0M A; 4DEY A; 3OYE A; 3CD6 A; 1B3Q A; 3OQ5 A; 2HNI A; 1BI3 A; 2W0Z A; 1PM3 A; 3RDV A; 1Z9Q A; 2BZ8 A; 2AKK A; 2CSQ A; 2MIO A; 4M7D D; 1GRI A; 2WSE E; 2HCK A; 4PJO B; 3OS1 A; 3A98 A; 5IHI A; 3GIB A; 2O01 E; 1KQ1 A; 4OMF B; 1YIT T; 4ZGJ B; 2D0N A; 1N9R A; 4CC3 A; 2CZ7 B; 2O2O A; 4EIK A; 1PKS A; 3DLM A; 2K3X A; 4CC2 A; 3OY9 A; 2DTI A; 4C8Q G; 2FZK B; 3H8Z A; 1OX9 A; 3G6E A; 3CCU T; 1T3S A; 4IIM A; 1LJO A; 4XU1 A; 2MCN A; 1Q81 R; 2JW4 A; 4A4H A; 2DA9 A; 3SD4 A; 3JCM g; 5A0L A; 3EFR A; 1AWO A; 1UUE A; 3INZ A; 3QKJ A; 3HSB A; 3MEV A; 1FMK A; 4PJM A; 4AT1 B; 1YI2 A; 2ABL A; 2JMC A; 2EGE A; 2VKN A; 1X2K A; 5FRN A; 2LNV A; 4OMM A; 4PLL A; 2RNA A; 4IUU A; 2QA4 A; 1BCO A; 4O5V A; 5FLX E; 1MMG A; 3LX7 A; 2YWW A; 4KUL A; 2BIV A; 2FB7 A; 2K4Y A; 1B34 B; 3FJ5 A; 2DIL A; 1NEB A; 2CT4 A; 2AKL A; 4LN2 A; 3MJX A; 3JCM P; 2QGG A; 4V2S A; 1P92 A; 3MP1 A; 2YSQ A; 4XTV A; 3R6O A; 5DLO A; 4IUV A; 3KXT A; 1GXI E; 1YJN T; 1M27 C; 4HVW A; 3MET A; 2GGR A; 1QVG P; 1X2Q A; 1JQQ A; 3EH2 A; 4D6W A; 2KQW A; 2EJ9 A; 2VGN A; 3CCQ Q; 1YIJ Q; 1IHV A; 1WGS A; 4QKU A; 2GF7 A; 2EKH A; 3OS2 A; 2LQ8 A; 1JU5 C; 1N5Z A; 3CCJ T; 4N0A A; 3CMA A; 3OA6 A; 2DJZ A; 4C8Q F; 1YIT A; 2EIF A; 2RMO A; 2CRE A; 3ASK A; 5M9O A; 1R0B G; 3G71 A; 3CQT A; 2EYQ A; 1KHI A; 2X51 A; 4MML A; 1KD1 U; 2RJC A; 3A5Z B; 3E2U A; 1YHQ T; 3JCM W; 3VS2 A; 1TUD A; 5GAN 3; 3ZEH A; 4J6W A; 1IO6 A; 3HRS A; 2QAS A; 3JCM f; 3EG3 A; 1TG0 A; 3JB9 I; 2W10 A; 3OYC A; 4M7A G; 2HQH A; 3UA6 A; 3GLX A; 3H9N A; 1S72 Q; 1MMD A; 2H3J A; 5KCO A; 3CCU A; 4C8Q D; 1RAA B; 2DLP A; 3TSZ A; 1K9A A; 1VQO T; 2RO0 A; 4EPC A; 1RLQ C; 1AZG B; 4MDX A; 1UTI A; 3SWN B; 3U23 A; 5DY9 A; 2COY A; 1U3O A; 1KHC A; 2P0K A; 4FW2 A; 2OTJ A; 2XD0 A; 1W2B S; 2F2V A; 1QLY A; 3M5A A; 5FRO A; 2QI2 A; 2K3B A; 3EG2 A; 1ZHI A; 4ZTJ A; 3FRN A; 2OTL A; 4C8Q E; 1UJ0 A; 4CC7 A; 3OYL A; 1WYX A; 4FT2 A; 4E7S A; 1VQ6 A; 2EQK A; 2DM1 A; 2LRQ A; 2DRM A; 4XTW A; 3EG9 B; 4FYX B; 3WXM B; 4XTX A; 4LDX A; 2A7Y A; 1JXO A; 3A8G B; 3LGL A; 4GY5 A; 5GJW B; 3RIR A; 2MMP A; 2DFU A; 1VQP T; 2YHT A; 2YRD A; 2K2M A; 2F69 A; 1M1K C; 3OYH A; 5CVI A; 1YJN A; 3UF4 A; 2DAQ A; 1VQ7 T; 1VQ4 A; 5FU7 B; 2ZPF B; 2YRC A; 1ACM B; 2RQW A; 2KY9 A; 3RUX A; 4HCB A; 4XTY A; 2HKN A; 1UHF A; 5L23 A; 4RUG A; 2J6F A; 2KYB A; 5D6X A; 3V8J A; 3MEU A; 2E12 A; 2JM9 A; 2O88 A; 4BUG A; 4HVU A; 1PHT A; 2RK2 A; 4C5I A; 3PMT A; 2KXD A; 4M7A F; 1WIE A; 4LNP A; 1UGQ B; 2MPX C; 2V8K A; 4N4I A; 1FMV A; 2NYS A; 3PTA A; 2GQV A; 3BFM A; 2FPF A; 2LCL A; 1FYN A; 2ESW A; 2F1L A; 4OMN A; 2ZPI B; 1UJY A; 1WHK A; 2KI7 A; 3FJP A; 4FL6 A; 3MEW A; 4M77 G; 3IQL A; 2DPP B; 2VAS A; 2DL3 A; 5HK0 A; 1W6X A; 2DTO A; 5EC7 A; 5L8R E; 3AT1 B; 3RKX A; 3NTI A; 4A4G A; 1ZSZ C; 3OYD A; 1NEG A; 2J05 A; 4A63 B; 1K9M C; 2FVU A; 1D09 B; 1Y96 B; 2CP6 A; 5CK9 A; 4RTU A; 2CKK A; 4LE9 A; 1K0X A; 3PIO A; 1JEG A; 1FX7 A; 1H3H A; 4F7U A; 2XID A; 4M75 C; 2DKG A; 4PFO A; 2XHC A; 1W2B P; 1PCX A; 2LNH B; 5IHK A; 2KK4 A; 3OS0 A; 4J9F A; 2RD1 A; 2LX7 A; 4XTU A; 1K0S A; 3E9G A; 3RES A; 1R8O B; 5GAN 7; 5CR2 A; 5GAN 2; 4C0D C; 4C5H A; 1VQL Q; 3JB9 H; 2ZCF B; 1Q82 C; 3I55 T; 1ZSZ B; 1TS9 A; 3LH5 A; 2LCC A; 4HXJ A; 2DER A; 5LJ3 e; 3QPH A; 4JJB A; 1VQP A; 1TH7 A; 5GAM e; 1NJI C; 1PKT A; 1N27 A; 5CKF A; 1K4U S; 1M90 R; 3SEM A; 1ZBJ A; 1M8M A; 1X6B A; 4J9E A; 1I5O B; 1SKU B; 3GOX A; 2XDD A; 3I9Q A; 1VQ7 A; 2QDL A; 1QVF A; 4GBQ A; 2L5Q A; 2GQI A; 4YTL A; 4Z02 A; 3FEO A; 2QEX T; 4JRP A; 1AD5 A; 1WHM A; 8AT1 B; 2QGF B; 4JLI A; 1IB8 A; 1IRX A; 3QSU A; 3M9Q A; 1UB4 A; 2E4H A; 1SF9 A; 1T0H A; 5LJ5 e; 1KC8 R; 4M7A B; 3EFO B; 4M77 F; 3EGX B; 3NTK A; 1WJR A; 2LQW A; 3L2W A; 2YUO A; 4FCY A; 2ROT A; 1VQM T; 1E6H A; 1VQ9 Q; 5C6S A; 2M0Y A; 1PD1 A; 4LD6 A; 3V7C A; 2FPE A; 1Q86 R; 1QW1 A; 3JV3 A; 5CAI A; 3OBY A; 1U1T A; 3QDR B; 4M78 A; 4FYY B; 3L2U A; 1VYU A; 1Z9Z A; 4M4Z A; 4DOV A; 2KVQ G; 3GF5 A; 1WJS A; 3M4G A; 1O75 A; 3C4S A; 3H41 A; 1QWE A; 4ATO A; 4AFQ C; 4JJC A; 3KUF A; 1QP3 A; 1N8R R; 2H8H A; 1ZX6 A; 3JRZ A; 2BZY A; 1NG2 A; 2RI3 A; 4PJO A; 4C0Z A; 2RQT A; 4FYV B; 5C0M A; 2HQE A; 3CC2 T; 4KUI A; 3I35 A; 3OSS C; 1UGS B; 2KSS A; 2OX7 A; 2XDP A; 1ZSG A; 3HKS A; 1YWO A; 3M55 A; 1M5Q 1; 5GAN e; 3VS6 A; 3CCL Q; 1PRL C; 4AMC A; 4IIO A; 1I8F A; 3D7S B; 2ZAE A; 3QZ5 B; 2XIC A; 4B9X A; 3VYG A; 4KGZ B; 3I55 A; 4C5E A; 2CP5 A; 2ZPB B; 3VUZ A; 1OYX A; 5CKH A; 3G6E Q; 4M77 C; 4NL2 A; 2P0P A; 2HQX A; 1RAI B; 2VUB A; 4X9C A; 3L2R A; 2PUK B; 1JRI A; 2DVE A; 5KCH A; 2K79 A; 2MK5 A; 2QEX A; 1YI2 Q; 3JCM Q; 4M78 D; 1H92 A; 1MNE A; 2QA4 Q; 1HK9 A; 3M4Y A; 2YUQ A; 4EMK C; 3CCR T; 1TU0 B; 2WSC E; 5I2S A; 3G1J A; 5A0G A; 1QVP A; 3DLL A; 4QQG A; 2KRS A; 3OYB A; 1J3T A; 2QQ9 A; 4M77 B; 3SHW A; 3FLG A; 1VQM A; 2PQW A; 3QYG B; 4C92 C; 2DF6 A; 4M78 E; 1ABO A; 1HYO A; 3HRT A; 1OU8 A; 3QHS A; 4OGE A; 1B34 A; 4PJO D; 1QP2 A; 1Q7Y R; 4XAX B; 2L3Q A; 2QQA A; 3CCE T; 2DL4 A; 4A54 A; 2R5M A; 1KQ2 A; 2J6K A; 2DMO A; 2DTH A; 2F2X A; 1H3Z A; 1SRM A; 1VQK Q; 4IUQ A; 1U8R A; 2CYZ B; 2X4X A; 5LJ3 j; 3E9F A; 2E64 A; 1T3L A; 3VS5 A; 3CPW A; 3I5R A; 2R57 A; 4FYW B; 5GAM j; 4EMH A; 3OYM A; 4HT9 A; 3PGG A; 4BY6 C; 1NBE B; 1U1S A; 2QTX A; 2L3P A; 3A1P A; 1F1B B; 2C0I A; 1Q95 G; 5GMK i; 3CMA Q; 2DXB A; 3HTR A; 3CCS Q; 3QBY A; 4FT4 A; 4LXC A; 1BIB A; 4J9I A; 1YIT Q; 3G71 Q; 1GCQ C; 3CC2 A; 2O31 A; 2MYS A; 2EYW A; 2DL5 A; 2P4T A; 2PU9 B; 3VV0 A; 4JLG A; 1OZ2 A; 2KRM A; 2O9V A; 3EH1 A; 2LCS A; 1I1J A; 1UE9 A; 4J6X A; 1PRM C; 5LJ5 j; 3JB9 J; 1W1F A; 2COW A; 3CBP A; 4ZN1 A; 3OW2 A; 5DLQ E; 4WTO B; 4KT0 E; 2XK0 A; 3RNJ A; 3BE3 A; 5LJ3 d; 4BY6 B; 2J06 A; 7AT1 B; 2K7A A; 4PJL A; 4KH1 B; 1LCK A; 1OEB A; 2GFA A; 4NOY A; 1BI0 A; 4BI8 B; 2V26 A; 5CCA A; 2VVK A; 2OTJ Q; 2KRN A; 1D0Z A; 3SWN A; 2HDA A; 2LJ3 A; 1SSF A; 5GJV B; 2NUT A; 1X01 A; 3WVE B; 3VUB A; 2OTL Q; 1VQ6 Q; 3HRU A; 4JJN K; 1OUL A; 2FL7 A; 1VQ5 T; 3CCR A; 3S3O A; 2V1Q A; 5AYF A; 5LJ5 d; 2RH2 A; 2YRV A; 3QJ6 A; 3EHR A; 4DA4 A; 4ANJ A; 2RB6 A; 1V1C A; 1C1A A; 2RHZ A; 1K8A U; 2LQN A; 1M4Z A; 2KEA A; 5GAN j; 3THK A; 1VA7 A; 2HBP A; 4CC4 B; 1U06 A; 3CCE A; 1NLP C; 1SHF A; 1M1F A; 1YJN Q; 1VQ4 Q; 5FWC A; 3T9N A; 4J9H A; 3CBO A; 5GAO l; 2RN8 A; 5CQX A; 2DEU A; 1C6V X; 2RPN A; 2HBW A; 5J3B A; 1KQS S; 1M2V B; 4FU6 A; 3HFO A; 3HL8 A; 4M7D C; 3QDF A; 4X34 A; 5GAO n; 2PTK A; 2DK3 A; 1KD1 C; 2VGM A; 2FO0 A; 4OMO A; 4KGX B; 2P84 A; 2LT1 A; 1AWJ A; 3MP8 A; 5IT9 E; 4C8Q A; 1Y71 A; 3CME T; 2MI6 A; 2V8J A; 1O9S A; 4N4H A; 2GNC A; 2HKQ B; 5GAO m; 5GAN d; 4DBF A; 1RI9 A; 4B9W A; 2EQM A; 3O8V A; 2D8J A; 2K57 A; 1OOT A; 4J9D A; 1LNX A; 3N5B B; 1ZBX A; 1MHN A; 1K73 R; 3M59 A; 3CCM T; 1D3B B; 1MMA A; 2EYZ A; 2MAM A; 4A4K A; 1W4S A; 1VQN T; 2X35 A; 3M54 A; 3MEA A; 4PL6 A; 3PT9 A; 1EX4 A; 2KDS A; 4MZT A; 5I22 A; 2D8H A; 1Y96 A; 3CC4 Q; 1RAH B; 4OB3 B; 3CXC A; 5FRM A; 2EYY A; 4M75 G; 1G2B A; 3JCM e; 2JM8 A; 2QTV A; 4HA8 A; 3TQ7 P; 1VQ5 A; 1Q81 U; 4PNO A; 3SB2 A; 4C5G A; 4JDS A; 1CKA A; 2FEI A; 2NUP B; 3VU3 C; 1YFN A; 2Y4X A; 1JJ2 A; 4OMP A; 1D1B A; 2FG0 A; 3LGF A; 1WX6 A; 2ROL A; 1NZ9 A; 4MMK A; 4HCZ A; 2O9S A; 2EPD A; 1Y0M A; 1VQP Q; 2DBM A; 2X4W A; 3S3N A; 3LW5 E; 2GFU A; 1WHJ A; 3PE0 A; 1KQS A; 4FM4 B; 3X25 B; 4L59 A; 4BE1 A; 3M0U A; 1VQ7 Q; 1PSE A; 3EGD B; 4J7I A; 4ZGE B; 3QJY A; 2CS7 A; 4PFP A; 2DZ9 A; 1RUW A; 1PWT A; 3I56 Q; 1AOJ A; 1SHG A; 4F16 A; 3BY7 A; 3VYH B; 2ENM A; 4JZ3 A; 1VYT A; 5KYX B; 5LJ3 h; 5KYY B; 1YIJ T; 1KQS P; 3G4S T; 4N4G A; 5IN1 A; 5GAO p; 3J81 E; 4LD9 K; 2F2W A; 1TOV A; 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1YP5 A; 1M9S A; 4CI0 C; 4M77 A; 2IPO B; 2LDM A; 4L5G A; 5GAO q; 3LWH A; 3OYF A; 1NJI R; 5HY6 A; 2G3R A; 4C92 G; 4AG2 C; 2K5F A; 1TUC A; 1QQJ A; 1VQ8 A; 3QZ9 B; 3DKM A; 4C0F A; 1LPL A; 1YJ9 Q; 2HL5 C; 4E7J A; 4M75 B; 1RAD B; 1ABQ A; 1X43 A; 1IHW A; 1K76 A; 1YNZ A; 3OYN A; 3ZL7 C; 1AEY A; 4XTZ A; 3JB9 G; 1M3B A; 1XTD A; 2IG0 A; 3PMI A; 4C0D B; 1QCO A; 2XMF A; 3NGP A; 3L2Z A; 4ORZ A; 2DIQ A; 3QG1 A; 5HCK A; 2DET A; 2FHD A; 3CC2 Q; 1HD3 A; 2COZ A; 5LL6 S; 1MND A; 5GAN g; 4PKC C; 1QVF P; 1AWW A; 1G3T A; 1S1N A; 2LQK A; 2K5I A; 1UEC A; 2CP7 A; 3QII A; 4QW2 A; 2VXF A; 5GAN 8; 4NL3 A; 3P8H A; 2SRC A; 1M3A A; 3CD6 Q; 2KYM A; 2OAW A; 1VQL T; 3H0I A; 4AG1 C; 4F14 A; 1WA7 A; 3M0P A; 3C0C A; 2YXY A; 2F5K A; 4M77 D; 1SEM A; 3TCJ A; 1RAF B; 1YJW T; 1QCF A; 3VS7 A; 4QQ6 A; 9ATC B; 4PJJ A; 4BI3 A; 2KNB B; 5D7U A; 2CP0 A; 3TRE A; 4KRT A; 4C92 F; 3FIF A; 3CPW S; 4A4E A; 5I2M A; 2XI9 A; 1A0N B; 3MKD A; 2E3H A; 4WCI A; 4M77 E; 3TEE A; 4FW1 A; 1M90 U; 1LOJ A; 2O4X B; 2LP5 A; 2C0T A; 3Q1J A; 3UT1 A; 3OYK A; 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