The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Ribosome
|
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
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| total genus |
17
|
| structure length |
95
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| sequence length |
95
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| Q | PF01157 | Ribosomal_L21e | Ribosomal protein L21e |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Q86 R; 3CCE Q; 3CC7 Q; 1S72 Q; 1YJN Q; 3CCM Q; 1VQP Q; 1YIT Q; 1KD1 R; 1M1K R; 3CC4 Q; 1QVG P; 1K73 R; 1VQ8 Q; 3CCV Q; 1W2B P; 3CCU Q; 1M90 R; 1KQS P; 3CD6 Q; 1VQ5 Q; 2QA4 Q; 2OTL Q; 3G71 Q; 1Q7Y R; 1YIJ Q; 1JJ2 P; 2OTJ Q; 3CCQ Q; 1YJW Q; 3CXC P; 1VQL Q; 3CC2 Q; 3G6E Q; 1K9M R; 1N8R R; 3CCR Q; 1VQN Q; 1YJ9 Q; 1QVF P; 1KC8 R; 1VQ6 Q; 3CCJ Q; 1VQK Q; 1VQ7 Q; 3G4S Q; 3CPW P; 1YI2 Q; 3OW2 P; 1Q82 R; 2QEX Q; 1VQM Q; 1YHQ Q; 1VQ4 Q; 1Q81 R; 1VQO Q; 3I56 Q; 1K8A R; 1VQ9 Q; 3CMA Q; 1NJI R; 3CME Q; 3I55 Q; 3CCS Q; 3CCL Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 1TG0 A; 3VS6 A; 1T0H A; 1B34 A; 3CC4 Q; 1UTI A; 3CCJ T; 4M77 B; 4LDY A; 4AFZ C; 3WVD B; 1UGS B; 1AWO A; 3ULR B; 3IQL A; 4FYW B; 5L8R E; 1ZSG A; 4BE2 A; 2ROL A; 2IVW A; 3JCM J; 1Q7Y U; 5LJ5 j; 2OAW A; 4RUG A; 4E6R A; 2RI5 A; 3X20 B; 1D3B B; 1MUZ A; 1P92 A; 4X34 A; 3G71 A; 2GNC A; 1TTH B; 3CXC S; 2C0I A; 5GAN h; 2KRO A; 4A4E A; 1K8A C; 3CCQ T; 2DRK A; 2OX7 A; 4OMM A; 2RO0 A; 2E6Z A; 1TU0 B; 4ZTF A; 3CME A; 1TUD A; 4EDU A; 1JXM A; 1FXX A; 1K9M U; 3SFM A; 1N9S A; 2ZGW A; 2KXC A; 3S6W A; 1WLP B; 2COY A; 2Z0W A; 4HCB A; 3QZ9 B; 3UPU A; 4HXJ A; 2ATC B; 1NLP C; 2LP5 A; 3EFO A; 4GY5 A; 1UEB A; 3EG0 A; 4C8Q F; 3CCR T; 1YJN Q; 3QO3 A; 3L42 A; 2LNV A; 2JTF A; 2DMO A; 2K6D A; 2NUT A; 1NLO C; 3M53 A; 4M75 B; 3KXT A; 1PKT A; 3OYH A; 2EBP A; 2F5K A; 1OV3 A; 1Q86 U; 3WVE B; 4M7D G; 3OYD A; 1MMG A; 4CC7 A; 3Q1J A; 4JRK A; 3SWN B; 3TSZ A; 3GNG A; 1R77 A; 1T3L A; 2JMC A; 1W1F A; 5GAN j; 3CC4 A; 4OMO A; 2LNH B; 1GFD A; 2D0Q B; 1D1C A; 4LUE A; 3OYG A; 1Q7Y C; 3CC2 Q; 3CC7 T; 1O9S A; 3PGG A; 3GIB A; 4M77 E; 3QBY A; 4HKE A; 1GBR A; 1VQ8 T; 4MMK A; 2KEA A; 4A4F A; 5HCK A; 3QJY A; 3VUZ A; 4E7S A; 2AKL A; 3SDZ A; 2DIL A; 3VS0 A; 2HNI A; 1WGS A; 1JJ2 A; 5C6S A; 2RK2 A; 2DJQ A; 2E70 A; 4M7D F; 1Y07 A; 3I9Q A; 2EJG A; 1K9M C; 2KDS A; 2CZ6 B; 3RKW A; 2E4H A; 1OI1 A; 3MEV A; 1J3T A; 2HDA A; 4J9B A; 1SHF A; 4O5V A; 2HQE A; 3L2Z A; 4OMN A; 1KG1 A; 4BDZ A; 3G4S T; 2DVE A; 3N5B B; 5FW9 A; 1G2B A; 2KSS A; 4C0G A; 5GJV B; 2QA4 Q; 3QXE B; 5HK0 A; 4J7I A; 1ZUY A; 1PRL C; 4F14 A; 2EQM A; 1JO8 A; 4F7U B; 2XK0 A; 2QEX Q; 2DXT A; 5FRN A; 3M58 A; 3OS2 A; 4J6Y A; 1CSK A; 2CSI A; 2EIF A; 3GPL A; 1Q86 C; 2QQS A; 4MML A; 3RMQ A; 2KT1 A; 1C0M A; 4XU3 A; 1ZA2 B; 3CXC A; 1KSW A; 3CCL T; 3M9Q A; 1BYM A; 2DD5 A; 2RHI A; 2D1X A; 5GAO q; 3GP8 A; 2CZ0 B; 4JRP A; 1WXB A; 5FWC A; 2CZ7 B; 4M75 E; 4EPC A; 2KVQ G; 5CKF A; 4J9G A; 1YP5 A; 4RKU E; 2MI6 A; 2MAM A; 3OYI A; 3HRT A; 4L5G A; 1OPL A; 1RI9 A; 1H3Z A; 1V29 B; 4D8K A; 3PVQ A; 2ZCF B; 4HVV A; 3CPF A; 5KYU A; 1I5L A; 2MK5 A; 1M9S A; 5KH6 A; 2K57 A; 2L2P A; 3DKM A; 4BY6 B; 2VWF A; 2AK5 A; 3EFR A; 1VQL A; 3CCV T; 3G6E A; 1D1A A; 3CD6 T; 1PHT A; 1VQK A; 5J26 A; 5CQY A; 1Q95 G; 1NE8 A; 2P0Q A; 2V8I A; 2VB6 A; 3P8D A; 3UWN A; 1HJD A; 3M5A A; 1IGQ A; 3OQ5 A; 3CCQ Q; 1RAI B; 4E7K A; 1YJW Q; 1QKX A; 2RQR A; 3JCM d; 1KQS S; 1VQP T; 1KQ1 A; 4FW1 A; 3TVT A; 1Y96 B; 2RH2 A; 4Y28 E; 1WDX A; 1YIT Q; 1HK9 A; 2ED0 A; 2SRC A; 1Y7X A; 4KBM B; 3C12 A; 4JS5 A; 1WHL A; 2ECZ A; 2MF2 A; 3EGD B; 5LJ5 d; 3LWI A; 3LGF A; 4RCC A; 3OYA A; 3CCR Q; 4DEY A; 4MZT A; 3P8B B; 4LD9 K; 2CDT A; 1WIE A; 1JQQ A; 4NOY A; 2BZ8 A; 2EW3 A; 5FU6 B; 1B07 A; 2K79 A; 3M57 A; 1NM7 A; 1YN8 A; 4RTY A; 4F7U E; 4M77 A; 3HKS A; 4M77 C; 3MP6 A; 2CSQ A; 1SKU B; 2RI3 A; 1UJ0 A; 1K73 C; 2XIC A; 2HL5 C; 3NTK A; 3OYE A; 4IIO A; 4CC2 A; 1K0X A; 2RHX A; 5D6X A; 5GAO p; 4A53 A; 1WXT A; 4RTW A; 4JJN K; 4J6X A; 4A54 A; 4RTT A; 1JEG A; 1KK7 A; 3ZEH A; 5KYX B; 3CCJ A; 2D8J A; 3CC7 Q; 2K9G A; 1E7O A; 1VA7 A; 1H92 A; 1VQ8 Q; 2FZG B; 4AMC A; 2LJ1 A; 1SPK A; 3CMA T; 2QAS A; 3L2Q A; 5GAO m; 1D3B A; 1G83 A; 2DXB A; 3CCE T; 3JCM b; 1WZO A; 3ER0 A; 2H3E B; 1RAH B; 2HAX A; 2L8D A; 2CS7 A; 4C92 G; 4EMH A; 1FX7 A; 1RI0 A; 5CKH A; 4FT4 A; 4Q5W A; 1Y57 A; 3HSB A; 3V8L A; 2YDL A; 2O31 A; 4B9W A; 3OB9 A; 1LNX A; 2E10 A; 2DM1 A; 3OYN A; 4ZGJ B; 2HKN A; 3FRN A; 1XNI A; 5I22 A; 2EGE A; 2ZPG B; 5GAN d; 2HMA A; 4OGC A; 4F17 A; 2RK1 A; 2R58 A; 3CCQ A; 3HP9 A; 2LMJ A; 3G4S Q; 1LOJ A; 4LDU A; 3OW2 P; 4PNO A; 4LDV A; 2G3R A; 2HZY A; 4RTZ A; 3J80 E; 3RKX A; 4OMF B; 4LN2 A; 1UE9 A; 5GAM f; 2BKD N; 5GAN 2; 2XU8 A; 1IXD A; 3M0P A; 4M75 A; 4M75 C; 1TH7 A; 4Y92 A; 4D8D A; 1VOM A; 1OX9 A; 4BE0 A; 1JBM A; 1JXO A; 4KRT A; 1B3Q A; 2DEQ A; 1YWP A; 4CC3 A; 3CCR A; 3VV0 A; 1I0C A; 3RNJ A; 4XU0 A; 3SWN A; 3UA7 A; 3OA6 A; 3CCL Q; 3SWN C; 1WQW A; 2O9S A; 5LJ3 e; 3A98 A; 4Z89 A; 2VGM A; 2AHJ B; 4MDX A; 5KYY B; 3QYG B; 2WSF E; 4PJO B; 3JB9 F; 5IHI A; 3A8O B; 2RNA A; 1XQH A; 3OYC A; 5IT9 E; 4XTU A; 4PJN A; 4HCK A; 1VYV A; 1I4K 1; 2DL3 A; 1YBY A; 3BE3 A; 3H6Z A; 2PUO B; 2JTM A; 3EFS A; 3MO8 A; 1X6G A; 3EH2 A; 1M2O A; 3ZBD A; 2KE9 A; 3FB9 A; 2JUF A; 2RQU A; 3CC7 A; 4MZM A; 1GCQ A; 2SEM A; 2NUZ A; 1GCQ C; 2P84 A; 3ME9 A; 2ZPH B; 3JSC A; 2E65 A; 4HCZ A; 5CR2 A; 4PJL A; 2EJ9 A; 1W2B S; 2K3Y A; 3GLX A; 1YJN T; 3V8K A; 1ZLM A; 1Q82 R; 3H0F A; 3KUF A; 2QQA A; 2K4Y A; 3CEY A; 3HFO A; 5CK9 A; 4PJJ A; 2VXE A; 4MDW A; 2E12 A; 3QII A; 1VQP Q; 2DER A; 2VV5 A; 1ZSZ B; 4ZN3 A; 1QVG S; 3EHR A; 1NEB A; 3MEU A; 4J7F A; 4HCC A; 3VU3 C; 1RLQ C; 1NPR A; 5GJW B; 4BDY A; 2KNB B; 3EG9 B; 1H8K A; 2XKO C; 1WQ7 A; 3G4S A; 4HA8 A; 4Z02 A; 2H8H A; 2GTJ A; 1MMD A; 3CC2 T; 1BI1 A; 2K5F A; 2LDM A; 2QGG A; 2DTH A; 4ZNX A; 2PZ1 A; 2ZPI B; 3M0T A; 2V1Q A; 1MV0 B; 2EQI A; 3QKJ A; 4M78 B; 1FMK A; 2GCX A; 1YNZ A; 5GAM h; 2QTX A; 1QVF S; 2P4R A; 2DZ9 A; 3PIP A; 3MHX A; 1SRM A; 3MP1 A; 2HQX A; 4N4G A; 3CCL A; 2CP2 A; 3LX7 A; 3EG1 A; 3QDF A; 1HSQ A; 3VS3 A; 4ZTJ A; 5KE3 A; 2RHZ A; 4B6M A; 1TXQ A; 3DB3 A; 4X9C A; 2QK0 A; 2CP5 A; 4BY6 C; 1VQ7 Q; 1AWW A; 4NS5 A; 4PJO E; 2LCC A; 2QA4 T; 3FEO A; 2KY9 A; 5M9O A; 2X4Y A; 2FHD A; 3CCE Q; 3JCM X; 4MZP A; 2XI9 A; 2QEX T; 1XOV A; 4FYX B; 3CCS T; 1JJ2 P; 1QQJ A; 2KQW A; 3CCV A; 2M1H A; 3CCM T; 1G8X A; 5GAN 7; 3CD6 A; 2DO3 A; 1M3A A; 2V8K A; 1YHQ Q; 4RG2 A; 3THK A; 4M7A D; 4OGE A; 2YRV A; 2LVM A; 3PVL A; 4F16 A; 5CCA A; 2F2V A; 4OML A; 2FYK A; 4BE1 A; 2NYS A; 3EGD A; 5GAM j; 1VQP A; 3PMI A; 5KCO A; 3QPH A; 4M77 G; 4PJO D; 1N8R R; 1UG1 A; 5LJ3 g; 3LW5 E; 3EGU A; 5FU6 C; 3QWY A; 5FU7 B; 1BCM A; 4FYY B; 1VQ6 T; 1K0S A; 2KYB A; 2FRW A; 3M0Q A; 1QCO A; 2DAQ A; 4E7Z A; 1GCP A; 2BTT A; 2KAF A; 4IUU A; 3JCM P; 4A4H A; 2EKH A; 1AD5 A; 5KYX A; 3JCM W; 4M78 E; 4C8Q B; 1YJW T; 1I81 A; 1FMW A; 2X51 A; 2D6F A; 3R6O A; 5A0D A; 2DL8 A; 3GNF B; 4M77 F; 1O75 A; 4C92 A; 2P0K A; 2EQK A; 4C92 C; 2OI3 A; 1YIT T; 1H3H A; 3M59 A; 2VAS A; 2KRS A; 1Q81 U; 2O88 A; 2EWN A; 4KGV B; 2GQI A; 3QHS A; 3GOX A; 3L2W A; 1YJ9 T; 2JXB A; 1K9A A; 4RTU A; 3CMA A; 3J81 E; 1OPK A; 3VRY A; 1QCN A; 3CCE A; 2I2L A; 1XTD A; 1V1C A; 4KT0 E; 1QVF A; 4GBQ A; 4M78 D; 1ZUU A; 4M75 G; 2FO0 A; 1NEG A; 2XHC A; 1K8A R; 2HD0 A; 2VUB A; 2RQT A; 2HSE B; 1M8V A; 4J9D A; 1UDL A; 1PC0 A; 2XDD A; 3MEW A; 1UUE A; 2YLB A; 2DPP B; 2A3L A; 2B8A A; 4RTX A; 1QMC A; 1QP2 A; 2B86 A; 4QQ6 A; 2MWO A; 4LDX A; 2JNG A; 4GLK A; 1V76 A; 1N9R A; 1AWJ A; 3HRS A; 2FPF A; 1YI2 Q; 4LXC A; 1WJQ A; 1RAC B; 4FU6 A; 4ESR A; 1SG5 A; 4OB0 B; 3RMS A; 2RHY A; 2AZV A; 2DF6 A; 5CKE A; 3ZFJ A; 5CO7 A; 1M5Q 1; 3EH1 A; 5KYY A; 4PJO A; 1HYO A; 2PVO B; 2KK4 A; 4X1V A; 2XD0 A; 1VQ4 T; 4PJO C; 5GAN 6; 1G3Y A; 4M75 F; 3RBB B; 3VUB A; 1OQK A; 2KRM A; 2V8J A; 3C0C A; 3RUX A; 1IRE B; 2DXC A; 3TEE A; 1Q81 C; 1PD0 A; 2O4X B; 5AT1 B; 2FB7 A; 3LWH A; 2QTV A; 4C8Q E; 1Q7Y R; 2HL3 A; 3C94 A; 2E1H A; 4BI3 A; 4R0K A; 1QW1 A; 2I0N A; 2A08 A; 5KYN A; 2MPX C; 4ME7 A; 1AVZ C; 2JTE A; 1VQM Q; 1T0J A; 4YTL A; 3M4G A; 4WCI A; 3CCS Q; 1UGP B; 4F7U G; 4JJB A; 1S72 Q; 1X6B A; 5GMK h; 3JCM e; 3CCM Q; 2LQK A; 2X35 A; 1ZSZ A; 1RAB B; 1ZSZ C; 2COW A; 4PKC C; 2ZPE B; 1YJN A; 1JB0 E; 1X2K A; 3OBY A; 1K9M R; 5I2M A; 4R56 A; 5I21 A; 1SHG A; 4EMG A; 1T3S A; 3EG9 A; 4P5N A; 5DLQ E; 2HCK A; 2K3X A; 5LJ5 e; 3A1P A; 2J05 A; 3OSV A; 1U1S A; 2L3Q A; 4C8Q D; 1K73 U; 2LTO A; 4E47 A; 1PM3 A; 2V26 A; 3VS1 A; 4M78 A; 2GF7 A; 1M90 C; 4M78 C; 3OS5 A; 2G6F X; 2FL7 A; 5A0L A; 4QVC A; 2X4W A; 1VQ6 Q; 2PTK A; 4PFO A; 5DM7 R; 2PUK B; 3CC2 A; 4Z8A A; 2RJD A; 2J7I A; 2IPO B; 3OYL A; 2H3J A; 3VS5 A; 2OTJ T; 2MYS A; 1Q86 R; 4L59 A; 4XU1 A; 3PIO A; 2XID A; 3L2V A; 4NL3 A; 2EFI A; 4KGZ B; 3BY7 A; 2IG0 A; 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3I5S A; 4C8Q C; 1VQ6 A; 4A4G A; 2K5L A; 2CUB A; 3OBW A; 1VQ4 Q; 1OYX A; 2VYT A; 1NJI C; 1RAD B; 2VC8 A; 4A4K A; 3CPW S; 4ELZ C; 2A0F B; 3MEA A; 1OZ3 A; 4XQ3 A; 1K73 R; 1KD1 C; 4BAC A; 1YHQ T; 1IO6 A; 2PQW A; 2EVR A; 1BIA A; 1QWE A; 3QWX X; 4ANJ A; 4J9E A; 1YJW A; 3M54 A; 2BE9 B; 1M1G A; 2JW4 A; 2GTO A; 2JM9 A; 3JCM g; 2FPD A; 4XTZ A; 1WYX A; 3OS1 A; 2RD1 A; 2QYZ A; 2EQU A; 4N4H A; 2EJF A; 1IHV A; 4DA4 A; 1YIT A; 1R0B G; 4KUL A; 2QAZ A; 3V7C A; 5IXF A; 1K76 A; 4BI8 B; 3HRU A; 2BUD A; 4C92 F; 1G5V A; 3MPU B; 4AT1 B; 5LJ5 g; 1KC8 U; 2L5Q A; 3I56 Q; 4M7A B; 3FJ5 A; 1M8M A; 2HEQ A; 1M1K U; 1BU1 A; 3OW2 S; 2QXF A; 4OVA A; 1KQS A; 1LJO A; 2QDL A; 1A0N B; 1EZZ B; 3PMT A; 1UGR B; 2LJ3 A; 3LGL A; 4PJO G; 1Q82 C; 4TVR A; 4BD3 A; 1VQO Q; 2VVK A; 4AFQ C; 3AHU A; 2W10 A; 4CI0 C; 4RMO A; 2ZPF B; 2M02 A; 4FW2 A; 1MV3 A; 2JZ2 A; 3VS4 A; 4PFZ A; 3E19 A; 2OTJ Q; 1VQ8 A; 2LCL A; 2JS2 A; 1SF9 A; 2RM4 A; 9ATC B; 2O4X A; 2YHT A; 2MMP A; 2JS0 A; 4C0Z A; 3PFS A; 2DZC A; 1VQ4 A; 3M4Y A; 5GMK l; 3AT1 B; 3BW1 A; 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