The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
63
|
structure length |
63
|
Chain Sequence |
GGTGVTLFVALYDYEAITEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
SH3 domain specificity
rcsb |
| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Fyn
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| total genus |
10
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| structure length |
63
|
| sequence length |
63
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-04-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1AVZ C; 2LJ3 A; 4M4Z A; 2CUD A; 1QKW A; 1K0S A; 1X43 A; 2CDT A; 4RTU A; 1AWW A; 1YNZ A; 2RQU A; 1I1J A; 4JJB A; 1T3S A; 2KNB B; 5L23 A; 1WXT A; 2LQN A; 1AWO A; 1NYG A; 1UG1 A; 2L3P A; 2RMO A; 2DVJ A; 2KRN A; 2FRW A; 2L3S A; 1AZG B; 3SHW A; 2AK5 A; 2V1R A; 3VS3 A; 4JJD A; 1JXO A; 1X2K A; 2KYB A; 1X6G A; 1K76 A; 2DRK A; 2VVK A; 5ECA A; 4F16 A; 2EYW A; 2F2V A; 1M3A A; 1AWX A; 1GBQ A; 1AEY A; 3M0Q A; 2M0Y A; 1X6B A; 2D1X A; 1T0J A; 1XOV A; 1WA7 A; 1M27 C; 3I9Q A; 4J9D A; 4Z88 A; 1B07 A; 4CC3 A; 1U06 A; 2I0N A; 3H41 A; 1H3H A; 2KXC A; 2EVR A; 2HDA A; 1PNJ A; 2KT1 A; 2DBM A; 5GJW B; 1PHT A; 3VS6 A; 2K79 A; 3FJ5 A; 1KSW A; 2JW4 A; 5IXF A; 1WIE A; 1SEM A; 2DL3 A; 1PRM C; 4RTX A; 2D0N A; 1HSQ A; 1SHG A; 2BTT A; 4J9B A; 2O9S A; 3RNJ A; 4AFZ C; 4OMM A; 2LJ0 A; 2CH4 A; 3KFV A; 2PNI A; 1GRI A; 4A63 B; 1OPL A; 1SSH A; 5EC7 A; 4OMO A; 2LJ1 A; 1WXB A; 2EKH A; 2RPN A; 3M0T A; 4DEY A; 4ESR A; 2BZ8 A; 3EG3 A; 1T3L A; 1Y57 A; 1UFF A; 4RTW A; 4JPB W; 3R6N A; 1FYN A; 1CKB A; 2EW3 A; 4RTZ A; 3VRY A; 4Z8A A; 4RTT A; 4LN2 A; 3QWX X; 1K0X A; 2DA9 A; 2YDL A; 3GBQ A; 2DBK A; 1KIK A; 2ED0 A; 3SEM A; 1OEB A; 1ZSG A; 1AWJ A; 2QDL A; 1OPK A; 3EG0 A; 1PRL C; 1JU5 C; 1ARK A; 2PZ1 A; 3C0C A; 1YWO A; 4GLM A; 2LX7 A; 1BB9 A; 2KRO A; 4J9G A; 2CRE A; 4RTY A; 2DF6 A; 1OV3 A; 5IHI A; 2FO0 A; 2RNA A; 4D8K A; 1HJD A; 1NG2 A; 1B3Q A; 2DIL A; 2DL5 A; 3PVQ A; 2JMC A; 2RQT A; 1NEB A; 1QKX A; 1JEG A; 2L3Q A; 3ULR B; 3LH5 A; 1M8M A; 3UA7 A; 1VA7 A; 2DJQ A; 2LMJ A; 1FMK A; 1PWT A; 3I5S A; 3ZL7 C; 1UJ0 A; 2HSP A; 2VKN A; 1GCQ C; 4GBQ A; 2E5K A; 4WCI A; 1ZUU A; 3EHR A; 2CUB A; 4LE9 A; 4X1V A; 3VS0 A; 4F17 A; 4JJC A; 1TUC A; 2JS0 A; 2EGC A; 1CKA A; 1WFW A; 3EGU A; 2GTO A; 2KR3 A; 2FPE A; 3UAT A; 3H0I A; 4Y92 A; 3REB B; 2KXD A; 1QLY A; 2ROT A; 3VS1 A; 1GBR A; 1CSK A; 2SRC A; 1N5Z A; 2EPD A; 1UHF A; 1V1C A; 1Y0M A; 4LNP A; 2EYY A; 2JM8 A; 2D8J A; 2GNC A; 4AFQ C; 2K2M A; 4HCK A; 3M0S A; 2DX1 A; 2AZS A; 2KEA A; 1UJY A; 3U23 A; 4AFS C; 3EHQ A; 2JXB A; 1VYV A; 2K9G A; 3M0P A; 2K6D A; 1S1N A; 1G2B A; 2YT6 A; 1MV3 A; 1J3T A; 3A98 A; 2JS2 A; 1W6X A; 1X27 A; 2X3W D; 2C0I A; 1WDX A; 4OML A; 2IIM A; 2ABL A; 2KGT A; 3RBB B; 2LCS A; 1K9A A; 4R0K A; 1YCS B; 4JZ4 A; 1NLP C; 3VS5 A; 1BBZ A; 2CT4 A; 1K1Z A; 2FPF A; 2JM9 A; 2O88 A; 4CC2 A; 2VWF A; 2L2P A; 1W70 A; 1E6G A; 2DL4 A; 2J6K A; 1VYU A; 2KYM A; 2W0Z A; 2FPD A; 2GBQ A; 2JTE A; 2J6F A; 3THK A; 2EQI A; 1GL5 A; 2LNH B; 1NYF A; 3NMZ C; 1E7O A; 4AG2 C; 2OAW A; 3UF4 A; 1BU1 A; 2GGR A; 1MUZ A; 1TG0 A; 2OI3 A; 4AFU C; 2EBP A; 2YUN A; 3H0F A; 4QT7 A; 2DRM A; 2DYB A; 1PKT A; 2O31 A; 3PVL A; 1KJW A; 3VS2 A; 2LP5 A; 1ZUK A; 3REA B; 1JXM A; 2YSQ A; 4JZ3 A; 1ABQ A; 2D8H A; 3M0R A; 2ED1 A; 2XMF A; 4J9F A; 2KRS A; 1AD5 A; 2EGA A; 2GTJ A; 4HVU A; 1SRM A; 1T0H A; 2ECZ A; 2HEQ A; 3EG2 A; 4D8D A; 4RUG A; 5IXB A; 4RTV A; 1AOJ A; 5FWB A; 1NLO C; 4J9I A; 4J9C A; 1I07 A; 3VRZ A; 1UTI A; 1H92 A; 5GJV B; 3I35 A; 1UE9 A; 1OOT A; 3TSZ A; 1GCP A; 1GFC A; 1RI9 A; 4OMQ A; 2KBT A; 1QWF A; 2ESW A; 4CC4 B; 2NWM A; 4ORZ A; 1HD3 A; 1VYT A; 2EYZ A; 1ZX6 A; 4FSS A; 4HVW A; 1X2Q A; 2P4R A; 2EYX A; 1YWP A; 1YP5 A; 1PKS A; 2NUZ A; 1I0C A; 4AG1 C; 2FEI A; 1SPK A; 2J05 A; 2O2O A; 2MIO A; 1G83 A; 2YUQ A; 1SHF A; 1NM7 A; 1M3B A; 1IO6 A; 1RLQ C; 1LCK A; 1YN8 A; 3VS4 A; 2A37 A; 2DNU A; 2A28 A; 4LUE A; 1X69 A; 2B86 A; 1UHC A; 2SEM A; 3NHN A; 4ZNX A; 1Z9Q A; 2FRY A; 3QWY A; 2C0T A; 3TVT A; 1UUE A; 2FG0 A; 1RLP C; 1U3O A; 3NGP A; 5I22 A; 2W10 A; 2HBW A; 2MCN A; 2CH4 W; 4J9E A; 2K7A A; 4HVV A; 2J06 A; 4K11 A; 2JT4 A; 5HCK A; 3O5Z A; 3I5R A; 4CC7 A; 2F2W A; 1JQQ A; 3EG1 A; 2YUO A; 4KRT A; 1W1F A; 2ROL A; 2G6F X; 2BZY A; 2KRM A; 1QWE A; 2PTK A; 2RN8 A; 1WLP B; 1BK2 A; 4IIO A; 2CSQ A; 1UEC A; 2A36 A; 1ZLM A; 1GFD A; 1A0N B; 1UGV A; 2DL7 A; 2J7I A; 1U5S A; 1WI7 A; 2K3B A; 2GQI A; 5IHK A; 1WYX A; 2OJ2 A; 2RQV A; 3PE0 A; 4E6R A; 2LQW A; 5FW9 A; 3NPF A; 2L0A A; 4DEX A; 5I11 A; 3VS7 A; 2V1Q A; 1ABO A; 2LZ6 B; 2RF0 A; 2AZV A; 2HCK A; 3IQL A; 2EGE A; 3M0U A; 3TSW A; 1Z9Z A; 1K4U S; 1ZUY A; 2BZX A; 3JV3 A; 4EIK A; 1RUW A; 2KE9 A; 4HXJ A; 2C0O A; 1M3C A; 3CQT A; 1E6H A; 1NEG A; 2J6O A; 2YUP A; 2M51 A; 2AKL A; 4OMN A; 2MOX A; 1JO8 A; 2ENM A; 5FWC A; 1EFN A; 2AKK A; 5IHN A; 1WX6 A; 2X3X D; 3UA6 A; 2DE0 X; 1MV0 B; 1KFZ A; 2DMO A; 2H8H A; 2CSI A; 4IIM A; 2A08 A; 1WXU A; 1UDL A; 2KT8 A; 1QCF A; 4LUD A; 4OMP A; 2DL8 A; 1H8K A; 4Z89 A; 2DM1 A; 2DLP A; 1TUD A; 3H0H A; 4F14 A; 1M30 A; 2F2X A; 1AZE A; 2O9V A; 2JMA A; 2RQR A; 2CT3 A; 1SRL A; 2RQW A; 1ZBJ A; 5IH2 A; 4J9H A; 1GCQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4M4Z A; 1K8A R; 1YJ9 T; 4OB3 B; 2JTF A; 3X24 B; 1X43 A; 2CDT A; 1AWW A; 1YJW A; 3LLR A; 3M56 A; 4FYW B; 1T3S A; 2E65 A; 2KNB B; 2MPX C; 5I21 A; 5GAN g; 4GLK A; 2KRN A; 1IRE B; 5C0M A; 1VQK T; 2V1R A; 2Z0W A; 2KYB A; 4F7U A; 3FLG A; 4GY5 A; 2L89 A; 3P8H A; 3I56 A; 3S3M A; 1MMN A; 2EYW A; 4C8Q B; 2VYT A; 3L2V A; 1M3A A; 5KYX A; 3LYI A; 1GBQ A; 3MEV A; 1SKU B; 1JB0 E; 2M0Y A; 3M0Q A; 1X6B A; 3OYN A; 1XOV A; 2DTI A; 3OYG A; 1N9R A; 2QAS A; 2I0N A; 4HA8 A; 1BI3 A; 4NL2 A; 2KT1 A; 1PNJ A; 3CCE Q; 2DBM A; 5GJW B; 1PHT A; 3VS6 A; 4A4G A; 1WIE A; 1SEM A; 3JB9 F; 4RTX A; 2BTT A; 1NJI R; 1PD1 A; 4M75 B; 4HCB A; 2LRQ A; 2COZ A; 3L42 A; 2HSE B; 4AFZ C; 1NZ9 A; 2E64 A; 1B34 A; 4E47 A; 1O9S A; 1GRI A; 1SSH A; 4FIB A; 5EC7 A; 2QEX A; 2HKN A; 5KE2 A; 4FYV B; 3L2U A; 5GMK j; 3M0T A; 1N8R R; 4KGV B; 1YI2 A; 2BZ8 A; 1WPY A; 2XD0 A; 1OX8 A; 3NTK A; 3CPF A; 2EW3 A; 3MP6 A; 3VRY A; 1IZ6 A; 1FXX A; 2YRD A; 4LN2 A; 3QWX X; 1RAB B; 1KD1 C; 2CP2 A; 2YDL A; 4JRP A; 4Q5W A; 2RHX A; 2RM4 A; 4OB1 B; 1OEB A; 3CCU T; 6AT1 B; 2DIQ A; 3X26 B; 1K8A C; 1OZ2 A; 2IPO B; 1M5Q 1; 2LX7 A; 4GLM A; 5L8R E; 4XTW A; 3CD6 Q; 4RTY A; 4ANJ A; 5EG2 A; 2FO0 A; 4C8Q D; 5A0L A; 4M75 C; 1M9S A; 4N4I A; 5CIU A; 2RQT A; 3QYH B; 1UEB A; 1QKX A; 4LD9 K; 2EQK A; 3UA7 A; 2MYS A; 4HCZ A; 4ZGJ B; 1UJ0 A; 1VQP A; 3CC2 T; 3PT9 A; 4NS5 A; 1ZUU A; 2CUB A; 2HAX A; 2M9U A; 5CQX A; 1VQO A; 3SDZ A; 1ZBX A; 1B34 B; 1TUC A; 3L1A A; 2EGC A; 3VV0 A; 2EJF A; 1PSF A; 2FPE A; 3G6E Q; 4M78 E; 2YXY A; 3M5A A; 4M75 D; 3REB B; 1VQN A; 1K9M U; 3E2U A; 1VIE A; 1WJR A; 5GMK h; 2K3Y A; 3OYK A; 5DM7 R; 1K73 R; 1V1C A; 1Y0M A; 4LNP A; 5CQY A; 3RUX A; 3MHX A; 2EYY A; 2CP3 A; 3O8V A; 4OP0 A; 3LGL A; 5GAM j; 2E6Z A; 1NJI C; 2XKO C; 5FU7 C; 5GAN 5; 2ZPB B; 2COW A; 3X28 B; 1F1B B; 2DX1 A; 3OYC A; 1MMD A; 1PCX A; 1XNI A; 1M90 R; 4OF1 A; 3EHQ A; 2K6D A; 2YT6 A; 3A98 A; 1N8R C; 3F70 A; 1TUG B; 4II1 A; 3FJP A; 1RAD B; 1VQ4 A; 4KT0 E; 2E70 A; 4MDW A; 1D0Z A; 2CT4 A; 2DEU A; 2JM9 A; 4X9D A; 4A4E A; 3J81 E; 1W70 A; 2DK3 A; 1XTD A; 2CZ7 B; 2VV5 A; 2W0Z A; 3C12 A; 1D0Y A; 3MKD A; 3VU3 C; 3V8K A; 3A8H B; 1NPR A; 2DPP B; 3EGD B; 4OGE A; 2X4W A; 2F69 A; 3JCM X; 2DIG A; 3RKW A; 3H6Z A; 2OAW A; 2DD5 A; 2GGR A; 2YUN A; 3H0F A; 1VQK Q; 1OU9 A; 3G7Z A; 2M16 A; 2P0K A; 2O31 A; 3MO8 A; 1KG1 A; 5FRO A; 4DQ2 A; 1JXM A; 2JTM A; 4EMG A; 3CCR A; 1YIJ T; 3CBM A; 3NTI A; 2JZ2 A; 2VC8 A; 3MEW A; 1M1K R; 1VQ7 T; 3V7R A; 3JCM d; 3M0R A; 3CCE A; 1SG5 A; 2RJD A; 2KRS A; 3JRZ A; 2OTJ T; 4UC4 A; 1KC8 U; 1SRM A; 2GF7 A; 2ECZ A; 3HKS A; 4XU3 A; 2PUO B; 2AT1 B; 5FWB A; 1C1A A; 1BKB A; 3VRZ A; 3BW1 A; 3P8D A; 1X01 A; 4N4H A; 1H92 A; 4DOV A; 5D6W A; 2JUF A; 2KAF A; 1OOT A; 5GAN 6; 1GFC A; 4OMQ A; 2EJG A; 4WF2 A; 1QWF A; 2V8I A; 4CC4 B; 3CCS A; 1K73 C; 2EYZ A; 2BUD A; 2LCL A; 1O75 A; 3CBP A; 2XG8 D; 3QHS A; 1PKS A; 2Y90 A; 3OW2 S; 2J05 A; 4A4H A; 2MAM A; 3VS4 A; 1M90 C; 2A28 A; 3LWI A; 2B86 A; 4PJO E; 2RI3 A; 2V8K A; 1Z9Q A; 4E7Z A; 4P5N A; 4FYY B; 4QQD A; 4ZN1 A; 4BY6 C; 2K7A A; 2F5T X; 1XQH A; 1Y71 A; 3QUI A; 3EG1 A; 3GNF B; 2DXU A; 2BZY A; 3CCM T; 3NFC A; 5GAM f; 1WLP B; 4IIO A; 1MHN A; 2WSE E; 1IGQ A; 3RMQ A; 1QVF A; 4XTX A; 2JVV A; 1PD0 A; 3T9N A; 3M4Y A; 1W4S A; 1U5S A; 2RHZ A; 5IHK A; 2RQV A; 4BDY A; 3EGX A; 5GAN 8; 2L0A A; 3VS7 A; 2LZ6 B; 4LDW A; 2HCK A; 1PM3 A; 3IQL A; 3M0U A; 1OUL A; 1U1S A; 2HD0 A; 3CC2 Q; 3JCM e; 4EIK A; 3OYI A; 1M1K C; 1RUW A; 2KE9 A; 4EMK A; 3I56 Q; 1E6H A; 3EG9 A; 3OS5 A; 2NYS A; 3CME A; 2E12 A; 2J6O A; 2EQJ A; 2HL3 A; 4A53 A; 1C0M A; 4M7D E; 2X9H A; 2M51 A; 3QKJ A; 2LTO A; 2A0F B; 4RG2 A; 1EFN A; 4C5G A; 5FLX E; 3FIF A; 1WX6 A; 4J6W A; 1GXI E; 2KI7 A; 1IGU A; 2X3X D; 3OYE A; 2L3R A; 3INZ A; 3JB9 D; 3S6W A; 1MV0 B; 4A54 A; 4AMC A; 2D6F A; 2DYI A; 3MJX A; 1BCO A; 2QQR A; 3QDF A; 2RI2 A; 1M4Z A; 3R6O A; 2YLC A; 2LT4 A; 2LVM A; 3CC7 T; 2OTL T; 2ZPE B; 3V8L A; 2F2X A; 4ATO A; 4J6Y A; 1I4K 1; 3M54 A; 1ZQ1 A; 5DY9 A; 4Y28 E; 3RER A; 1ZBJ A; 4IUR A; 2QEX Q; 2DTO A; 1UGS B; 3CCL T; 1AVZ C; 2LJ3 A; 1QKW A; 3DLM A; 3CCJ T; 3OS0 A; 1QVF S; 4L5G A; 2E4H A; 2JNG A; 1WXT A; 4XTV A; 1AWO A; 5GMK m; 1NYG A; 9ATC B; 3VJP A; 1YJ9 A; 4OB0 B; 3EGX B; 3SHW A; 2AK5 A; 2VGN A; 3VS3 A; 4JJD A; 3FC3 A; 1X2K A; 4M7A E; 1OZ3 A; 2QGF B; 5GMK i; 4C92 E; 4PLI A; 3CC4 T; 1K76 A; 5GAN 7; 2Y4Y A; 2VVK A; 5LJ3 j; 2K57 A; 3LX7 A; 3QDR B; 4O5V A; 2F2V A; 4KUL A; 3OYL A; 3UDC A; 1X75 C; 4M77 E; 3SWN A; 3FEO A; 3GP8 A; 2KXC A; 2HDA A; 2VAS A; 2ZZD A; 1YIJ Q; 3EFO A; 2NLU A; 3CPW P; 5IXF A; 7AT1 B; 2DL3 A; 1VQ7 Q; 4TVR A; 2D0N A; 5CKB A; 4J9B A; 1VQP Q; 2DXC A; 2EYQ A; 3M55 A; 1OU8 A; 3ZFJ A; 2MK5 A; 1VQO Q; 5J39 A; 1OPL A; 2MWO A; 2FL7 A; 3OSS C; 5GAM d; 1WXB A; 2EKH A; 4OGC A; 1EZZ B; 1VQN Q; 1N9S A; 2PQW A; 5GMK l; 1YFN A; 3EG3 A; 1NBE B; 2GFU A; 4RTW A; 1TWB A; 3JCM c; 4EMK C; 4XTZ A; 1CKB A; 4Z8A A; 4HCC A; 5GAN j; 3QPH A; 4RTT A; 1Q86 R; 4EPC A; 5KYW A; 2DA9 A; 3VKI A; 5DLO A; 3OYH A; 4BE1 A; 4O6J A; 3DB3 A; 4QVZ A; 1VOM A; 3CXC A; 1AWJ A; 4YTL A; 1M2V A; 2HZY A; 2EQU A; 2PZ1 A; 4BE2 A; 2CP0 A; 4BDZ A; 1BB9 A; 2KRO A; 2CZ6 B; 5LJ5 d; 3QZ9 B; 3CCU A; 4XU2 A; 3C94 A; 4B6M A; 4D8K A; 1I5L A; 3RIR A; 2RHI A; 1B3Q A; 1VQ4 Q; 2JMC A; 3E19 A; 1NEB A; 1VQ9 T; 4MML A; 2QGG A; 1D3B A; 1VA7 A; 2DJQ A; 3ZL7 C; 2HSP A; 2D0Q B; 2PU9 B; 4GBQ A; 4J7I A; 2GCX A; 3EHR A; 4LE9 A; 4X1V A; 3VS0 A; 4MMK A; 2JS0 A; 4PJO F; 4Y91 A; 4DA4 A; 3JCM h; 3CC2 A; 4RKU E; 5CKD A; 2QTX A; 2DXB A; 4JS5 A; 2KXD A; 3TRE A; 4HKE A; 4M78 A; 3VS1 A; 4C92 G; 4XTU A; 1GBR A; 3AT1 B; 1R8O B; 1N5Z A; 3RR6 A; 3G4S T; 3CCR Q; 2H3E B; 2GNC A; 4FT4 A; 3QII A; 5KYW B; 3HFN A; 3M0S A; 3SWN C; 5LJ3 f; 3V7C A; 2KEA A; 2ZPH B; 3HSB A; 5GAM e; 1Q7Y U; 2KSS A; 2MWP A; 3CXC S; 1VIF A; 1JJ2 S; 1S1N A; 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