The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
59
|
structure length |
59
|
Chain Sequence |
VTLFVALYDYEAITEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
SH3 domain specificity
rcsb |
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Fyn
|
| total genus |
11
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-04-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DBM A; 3ZL7 C; 2FG0 A; 4ESR A; 2ECZ A; 4F14 A; 2SEM A; 2K9G A; 3KFV A; 1NLO C; 1AWW A; 4LNP A; 1AVZ C; 2HSP A; 1AEY A; 1UTI A; 4RTX A; 2CSI A; 2YT6 A; 2X3X D; 1YWP A; 2F2X A; 2A37 A; 2JS2 A; 2EYW A; 1ZX6 A; 5IHI A; 2EGA A; 4RTT A; 2GNC A; 4DEX A; 2FO0 A; 1E6G A; 2GTJ A; 1NM7 A; 1X27 A; 2A36 A; 3VS7 A; 1AWX A; 1WX6 A; 4Y92 A; 1M3A A; 1JU5 C; 3JV3 A; 2CUD A; 2VVK A; 1WA7 A; 1WIE A; 3I9Q A; 1YWO A; 2LJ0 A; 3O5Z A; 4HVU A; 4JJB A; 2I0N A; 1JQQ A; 2LX7 A; 3M0S A; 4EIK A; 1PNJ A; 1X2K A; 1AZG B; 2FPF A; 2YDL A; 4AG1 C; 4GBQ A; 3REA B; 3VRY A; 4J9G A; 1WXT A; 2K3B A; 2HBW A; 1T0J A; 2JMA A; 1T3L A; 1PWT A; 2KYB A; 1UUE A; 4OML A; 1OPK A; 1SPK A; 1SEM A; 2RQT A; 1JO8 A; 4CC7 A; 1PRL C; 2DYB A; 5IXB A; 1GFD A; 1T3S A; 3NGP A; 1M3B A; 1AWJ A; 3REB B; 3LH5 A; 5EC7 A; 2KE9 A; 1PKT A; 2V1Q A; 1UEC A; 2JTE A; 1G83 A; 1TUD A; 4K11 A; 4RTW A; 2LNH B; 2LJ3 A; 1MV0 B; 2F2W A; 2YUQ A; 1ZSG A; 2V1R A; 1B07 A; 3H41 A; 1B3Q A; 2GGR A; 3EG0 A; 4WCI A; 2J05 A; 2ABL A; 1ZUK A; 4OMM A; 4D8K A; 2O31 A; 1K0S A; 2D8H A; 1AZE A; 2EYX A; 2DVJ A; 1E7O A; 1PRM C; 1NYF A; 5FWB A; 1OEB A; 3NPF A; 1ABQ A; 1U06 A; 2RN8 A; 1G2B A; 2DM1 A; 2EYY A; 2HCK A; 3EHR A; 2RQR A; 4ZNX A; 2HEQ A; 5I22 A; 2AKL A; 3TSZ A; 4AFZ C; 5L23 A; 1JEG A; 1WXU A; 1X6G A; 2BZ8 A; 2KEA A; 3VS3 A; 1U5S A; 2JMC A; 2ED0 A; 2ED1 A; 1UG1 A; 3UA7 A; 2BZX A; 3H0H A; 3M0R A; 1WDX A; 1AWO A; 2KXC A; 5GJV B; 1WI7 A; 4HVV A; 2BTT A; 4KRT A; 2GQI A; 2DRK A; 1BK2 A; 1H92 A; 4JZ3 A; 5IXF A; 2K2M A; 1X69 A; 2W0Z A; 3EHQ A; 2L3S A; 1FMK A; 2O9V A; 2G6F X; 2CDT A; 2KBT A; 2LQN A; 1RLP C; 1K4U S; 2PNI A; 3I35 A; 4J9F A; 1NLP C; 1I0C A; 1K1Z A; 1QCF A; 2FPE A; 3PVQ A; 2RQW A; 1ARK A; 2ROT A; 2YSQ A; 2L0A A; 1HSQ A; 2EGC A; 2KT1 A; 2KR3 A; 1X2Q A; 4JJD A; 2EQI A; 2NWM A; 2EBP A; 2LZ6 B; 4R0K A; 1ZLM A; 4J9E A; 3VS2 A; 1YP5 A; 2AKK A; 3R6N A; 1SSH A; 1H3H A; 1PHT A; 1UDL A; 2O88 A; 2J6K A; 1YNZ A; 1WFW A; 2CUB A; 2RNA A; 2J7I A; 1KIK A; 2MOX A; 4LUE A; 1RI9 A; 2ENM A; 1EFN A; 4F17 A; 3RNJ A; 2RQU A; 2HDA A; 2P4R A; 4J9I A; 3PVL A; 2AZS A; 1OOT A; 2DA9 A; 2JS0 A; 2J6F A; 2D0N A; 2W10 A; 4X1V A; 2FEI A; 1SHG A; 2C0I A; 1Z9Z A; 2DNU A; 2L3Q A; 2RF0 A; 1KSW A; 2DL3 A; 4FSS A; 2D1X A; 2LCS A; 3U23 A; 3VS6 A; 2KRO A; 4OMQ A; 1NYG A; 1QWE A; 4LN2 A; 1RLQ C; 2DJQ A; 2OJ2 A; 4IIM A; 1UHC A; 1XOV A; 2EPD A; 2AZV A; 2DL5 A; 1UJ0 A; 2DL4 A; 4D8D A; 3I5S A; 2CRE A; 2B86 A; 2M0Y A; 5IH2 A; 2J6O A; 1ZBJ A; 1E6H A; 1BU1 A; 4DEY A; 2JM9 A; 3UAT A; 2XMF A; 2EKH A; 1SRL A; 3SEM A; 1UFF A; 1UE9 A; 1I07 A; 3M0Q A; 2A28 A; 5FWC A; 3VRZ A; 3M0T A; 2CH4 A; 1TUC A; 4RTV A; 1X6B A; 2BZY A; 1M8M A; 1ZUU A; 2OAW A; 2LMJ A; 1NEG A; 2CSQ A; 2SRC A; 3ULR B; 1GBQ A; 3I5R A; 1ABO A; 4J9D A; 3UF4 A; 5FW9 A; 1GFC A; 1MV3 A; 4OMN A; 2DBK A; 1BB9 A; 1MUZ A; 2DL7 A; 3QWX X; 2KNB B; 1V1C A; 2KRS A; 3TVT A; 3IQL A; 1K0X A; 2GTO A; 2J06 A; 4HCK A; 1YCS B; 2FPD A; 1WLP B; 2DF6 A; 1W70 A; 4J9H A; 4JPB W; 4QT7 A; 1SRM A; 2JM8 A; 3FJ5 A; 3M0P A; 1UJY A; 4Z89 A; 1W6X A; 4OMO A; 2M51 A; 2X3W D; 1W1F A; 2IIM A; 1CSK A; 1H8K A; 1N5Z A; 4RTY A; 1QWF A; 2MIO A; 1RUW A; 2DE0 X; 4JJC A; 2F2V A; 2LQW A; 4LUD A; 1Z9Q A; 3VS0 A; 2VWF A; 2EW3 A; 2JW4 A; 4CC2 A; 2K7A A; 2H8H A; 1X43 A; 5IHN A; 2EYZ A; 4CC3 A; 2JT4 A; 1T0H A; 1GL5 A; 2AK5 A; 3EG1 A; 1GRI A; 2EGE A; 2CH4 W; 2FRY A; 2MCN A; 1JXM A; 3THK A; 1M27 C; 1PKS A; 2O9S A; 1QKX A; 2YUN A; 1TG0 A; 2KT8 A; 4LE9 A; 3M0U A; 1GBR A; 3VS4 A; 2DMO A; 1VYT A; 2NUZ A; 2O2O A; 3SHW A; 1S1N A; 4HVW A; 4AFQ C; 4J9C A; 2K79 A; 2QDL A; 1OPL A; 3C0C A; 4Z88 A; 2C0T A; 2KRN A; 4CC4 B; 1HD3 A; 1FYN A; 1AD5 A; 4IIO A; 4RTZ A; 5HCK A; 2DRM A; 1KFZ A; 4HXJ A; 4M4Z A; 1NEB A; 3NMZ C; 2LJ1 A; 1AOJ A; 1A0N B; 1WXB A; 4OMP A; 4F16 A; 2DL8 A; 1LCK A; 1GCP A; 1QLY A; 2ESW A; 1WYX A; 1BBZ A; 1CKA A; 4JZ4 A; 3NHN A; 1SHF A; 1Y57 A; 2PTK A; 3EG2 A; 3EG3 A; 2A08 A; 3A98 A; 2LP5 A; 4AG2 C; 3H0I A; 1M30 A; 1UHF A; 4J9B A; 4RTU A; 1U3O A; 1I1J A; 1VA7 A; 2KRM A; 3RBB B; 2KYM A; 2DLP A; 1VYU A; 1K76 A; 2YUP A; 5IHK A; 1GCQ C; 1JXO A; 5GJW B; 4Z8A A; 2PZ1 A; 3QWY A; 2EVR A; 2CT3 A; 1ZUY A; 2JXB A; 2DIL A; 1K9A A; 3TSW A; 3EGU A; 2RPN A; 2E5K A; 5I11 A; 1QKW A; 5ECA A; 2KGT A; 2VKN A; 2KXD A; 1OV3 A; 1YN8 A; 1J3T A; 2L3P A; 3H0F A; 1Y0M A; 2L2P A; 3GBQ A; 2CT4 A; 2FRW A; 3CQT A; 4ORZ A; 3VS1 A; 4E6R A; 3PE0 A; 4RUG A; 2K6D A; 4AFU C; 4A63 B; 1KJW A; 1VYV A; 4GLM A; 2RQV A; 2D8J A; 2YUO A; 1IO6 A; 1UGV A; 2RMO A; 2OI3 A; 2C0O A; 4AFS C; 1HJD A; 1M3C A; 1NG2 A; 1CKB A; 2GBQ A; 1GCQ A; 3VS5 A; 3UA6 A; 2DX1 A; 2ROL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2FG0 A; 2ECZ A; 1IRX A; 2E5Q A; 5GAM f; 3KFV A; 5LJ5 g; 4M77 A; 4HCC A; 5DLQ E; 2DEQ A; 2BUD A; 1UTI A; 1H64 1; 1YWP A; 2E41 A; 2A37 A; 4DA4 A; 4L59 A; 1ZX6 A; 3V8J A; 4M7A F; 5GAN h; 1E6G A; 4EMG A; 3CCV A; 4Q5W A; 4E7I A; 1MMA A; 3QZ9 B; 1M3A A; 5GMK l; 3JV3 A; 2A7Y A; 3OS1 A; 2VVK A; 4XTU A; 3OA6 A; 1OZ3 A; 1SG5 A; 3I9Q A; 3UT1 A; 3O5Z A; 4HVU A; 4EIK A; 2E4H A; 4M7A C; 1VQP Q; 3CCM T; 2HBW A; 4M78 E; 1YI2 T; 2OTJ Q; 1T3L A; 1ZQ1 A; 5GAN d; 1RL2 A; 4HKE A; 3OYB A; 1WNL A; 1UUE A; 3SD4 A; 3CMA T; 4N0A A; 1JO8 A; 4CC7 A; 1PRL C; 4O6J A; 1D0Z A; 4LDX A; 4E7Z A; 1IHV A; 2V26 A; 4BB7 A; 3REB B; 3TU4 K; 2KE9 A; 2JTE A; 5CQX A; 1Q7Y C; 2LNH B; 2JOY A; 4Y91 A; 1JJ2 A; 1RAA B; 2YUQ A; 4LD6 A; 1B3Q A; 2R58 A; 2ABL A; 4D8K A; 4F7U E; 5GMK j; 4M78 B; 4PFO A; 2DVJ A; 2EJ9 A; 4EPC A; 3L2U A; 5CCA A; 4QQD A; 1YJ9 T; 1OEB A; 3NPF A; 1QVF A; 3OS2 A; 2QEX T; 3OYJ A; 1WPY A; 3EHR A; 2X51 A; 1BCO A; 2HEQ A; 3PMI A; 1K8A C; 4AFZ C; 1JEG A; 1X6G A; 4EMH A; 2FYK A; 4M75 F; 3LWI A; 4MZM A; 3DLM A; 2MK5 A; 3UA7 A; 3MPU B; 4BY6 B; 2HL5 C; 2BZX A; 3H0H A; 3M0R A; 2MF2 A; 1HYO A; 2Y90 A; 3FLG A; 1YJW Q; 1N6A A; 4HA8 A; 1VQL Q; 1H92 A; 3J81 E; 2GQV A; 2K2M A; 1X69 A; 3EHQ A; 1WHM A; 3X28 B; 1FMK A; 2QQB A; 3OBW A; 4C0D B; 1RLP C; 1VQN T; 2PNI A; 2DJZ A; 4J6X A; 2R57 A; 4JJD A; 2NWM A; 2LZ6 B; 4R0K A; 1ZLM A; 2Z0W A; 3MET A; 1KC8 U; 4WTO B; 5GAO r; 2NUP A; 2K5I A; 5CO7 A; 5J26 A; 2NUT B; 4FYV B; 5KCH A; 2J7I A; 1QCO A; 3NTI A; 3VKI A; 3EFS A; 1KQS S; 1RI9 A; 4M77 G; 4JDS A; 3EFO B; 3CXC A; 2I2L A; 1N8R U; 2DTH A; 4J9I A; 1N27 A; 2AZS A; 1OI1 A; 3G6E A; 2JS0 A; 2DIQ A; 2D0N A; 3GLX A; 4X1V A; 5FLX E; 1U1T A; 2FEI A; 4XTZ A; 5LJ3 e; 2DNU A; 4C8Q F; 2RF0 A; 1KSW A; 1LOJ A; 2KRO A; 1SSF A; 1NYG A; 5GAN 5; 1JJ2 S; 5FRM A; 4IIM A; 4JS4 A; 1UHC A; 2EPD A; 3DB3 A; 2DL4 A; 3I5S A; 3G1J A; 4XQ3 A; 1M2O A; 1QVF S; 3HFO A; 1BU1 A; 4DEY A; 1LNX A; 3JCM P; 4NL3 A; 4C8Q C; 4ELZ C; 1UFF A; 1I07 A; 1O9S A; 1VQ5 Q; 2V8J A; 9ATC B; 2VYT A; 3CCS T; 4E7H A; 2LMJ A; 4ME7 A; 1QCN A; 2CSQ A; 2KMT A; 1GBQ A; 3SDZ A; 1KHI A; 2JUF A; 2E6N A; 5DLO A; 1QP3 A; 1VOM A; 3OW2 S; 4N4G A; 2HQE A; 4B6M A; 1D09 B; 1WLP B; 1M90 R; 1SRM A; 1WHJ A; 4E7J A; 2AT1 B; 3ME9 A; 3LH0 A; 2QGF B; 4M78 A; 1MGQ A; 2M51 A; 4C92 E; 4M78 D; 3LGF A; 4MDW A; 1MMN A; 3M58 A; 3L2V A; 2JNG A; 3PGG A; 2IPO B; 1I5O B; 4J6W A; 3OB9 A; 1WJQ A; 2EWN A; 3CCR Q; 3OYN A; 3D7S B; 4XTW A; 2GFA A; 5GAN g; 1KD1 C; 3LYI A; 3VS0 A; 2VWF A; 4BDY A; 2MAM A; 1SF9 A; 2F5K A; 2X4J A; 4CC3 A; 2LTO A; 1ZHI A; 3V7R A; 2FRY A; 1M2V B; 1QW1 A; 3THK A; 2OTJ A; 4EMK B; 2ZPI B; 1K73 U; 4LE9 A; 4PK4 A; 1JRI A; 3M57 A; 1S72 A; 3CXC S; 1GBR A; 2DMO A; 1VYT A; 3MEV A; 4DBH A; 3JCM e; 4JUV A; 5GAO m; 4BD3 A; 3EFR A; 3G7Z A; 4N0A C; 3WVE B; 2E10 A; 2KRN A; 1FYN A; 2JZ2 A; 4II1 A; 1VQO Q; 4DOV A; 4HXJ A; 4BE0 A; 1W2B S; 2QQ9 A; 3NMZ C; 2LJ1 A; 2CGH A; 4B9W A; 1WXB A; 5GAN 4; 4F16 A; 2E6Z A; 2X4X A; 1QLY A; 2VXE A; 3QDF A; 4YTL A; 2PUK B; 2NUT A; 1Q7Y U; 2MYS A; 4PJN A; 3I55 Q; 5C0M A; 1VQ7 Q; 2LP5 A; 4RCB A; 1N8R R; 4AG2 C; 4M77 E; 4X9D A; 1M30 A; 1UHF A; 4FYX B; 4J9B A; 2O01 E; 3EFO A; 1U3O A; 2YRD A; 2ZPE B; 1VA7 A; 5LJ3 f; 2EYQ A; 3RBB B; 2C06 A; 3BFM A; 2KYM A; 2DLP A; 3WXM B; 5M9O A; 1K8A U; 1GCQ C; 3V8L A; 2PZ1 A; 3QWY A; 5KYN A; 1ZUY A; 5L8R E; 1K9A A; 3BY7 A; 1QP2 A; 1QVG S; 2VKN A; 3EGD B; 5CKD A; 2EFI A; 1OV3 A; 4X9C A; 5GAO q; 3M9Q A; 4LXC A; 2QA4 Q; 1TXQ A; 4KGV B; 4E47 A; 4E6R A; 3PE0 A; 2XU8 A; 4Y28 E; 3RES A; 4RUG A; 2L89 A; 4AFU C; 1KJW A; 3CC7 Q; 1VQ4 T; 1IO6 A; 1B34 B; 3INZ A; 3CD6 Q; 4JS5 A; 4R55 A; 3EAE A; 1NG2 A; 2RJD A; 1RAG B; 3VS5 A; 4KUL A; 4KT0 E; 3LLR A; 2ROL A; 3L2W A; 1NBE B; 4LDV A; 1VQK Q; 1I8F A; 5GAM h; 2KVQ G; 4F14 A; 3QJ6 A; 2K9G A; 3H9N A; 4IUV A; 1AVZ C; 1BYM A; 2HSP A; 2EQJ A; 2RD1 A; 1RAC B; 4PLL A; 4QVC A; 3JCM c; 2YT6 A; 1D1A A; 2F2X A; 4M78 G; 5IHI A; 1K9M R; 1RAI B; 3CC4 Q; 1RI0 A; 2GTJ A; 4JLG A; 3VS7 A; 1KC8 C; 4Y92 A; 3DLL A; 2RO0 A; 3A8O B; 1JU5 C; 1IGQ A; 3BDU A; 2DIG A; 5GAM d; 4C5H A; 2LJ0 A; 3AT1 B; 2YRC A; 5HKC A; 1JQQ A; 4FM4 B; 2BE9 B; 1PNJ A; 1X2K A; 1AZG B; 1VQ5 A; 4N4H A; 5CQY A; 1M2V A; 1TUG B; 3E2U A; 4GBQ A; 3PFS A; 3REA B; 3VYG A; 3JCM f; 4F7U G; 4J9G A; 4EMK A; 4XTV A; 2RHI A; 3KBG A; 2VB6 A; 2K3B A; 1MNE A; 4C92 D; 2DXU A; 1VIE A; 2JMA A; 2XID A; 3FB9 A; 3F70 A; 1Q86 C; 3FIF A; 4M78 F; 1PSE A; 1TOV A; 4OML A; 1SEM A; 1ZA2 B; 8ATC B; 2OTL Q; 1IXD A; 5GAN 7; 1UGR B; 2DYB A; 2V8I A; 3RR6 A; 1GFD A; 3NGP A; 1M3B A; 1AWJ A; 4PFP A; 2CP3 A; 3M55 A; 1UEC A; 3EH1 A; 1TUD A; 5GMK h; 1VQP T; 2LJ3 A; 1RAH B; 1ZSG A; 3MHX A; 3QDR B; 2MPX C; 1B07 A; 3H41 A; 2OTJ T; 1ZUK A; 4M78 C; 2H3E B; 1S72 T; 2KQW A; 3CC2 Q; 1M8V A; 1AZE A; 4F7U F; 1E7O A; 5FU7 B; 1VQ9 Q; 1SKU B; 2ZPB B; 3CCR A; 2KAF A; 3E9F A; 1BIA A; 5I2M A; 1G2B A; 3TEE A; 2EYY A; 3QJY A; 3PMT A; 2AKL A; 1M9S A; 4FW1 A; 3VYH B; 2YRV A; 2XD0 A; 2ATC B; 3C12 A; 2YWW A; 3L2R A; 1YFN A; 4RMO A; 2DXC A; 2EKO A; 4OB0 B; 2COW A; 2DER A; 2XDP A; 4A4F A; 1KD1 U; 1WDX A; 1AWO A; 1ZSZ C; 2ZZD A; 4HVV A; 2BTT A; 2GQI A; 4JZ3 A; 5IXF A; 2D6F A; 2L3S A; 3O8V A; 2O9V A; 4XU2 A; 2G6F X; 3V8K A; 4HT9 A; 3CPF A; 3EGD A; 3BDL A; 1YJN A; 1K4U S; 4J9F A; 2DO3 A; 3PNW C; 1I0C A; 2FPE A; 4M77 D; 5GAM j; 1GXI E; 2ROT A; 2MWP A; 2L0A A; 1WHK A; 1M1G A; 2KR3 A; 1X2Q A; 3CXC P; 2EQI A; 2EBP A; 5J39 A; 2K5L A; 4J9E A; 3CCS A; 1B34 A; 1YP5 A; 3QKJ A; 3URG A; 1YIT Q; 3M56 A; 4MZT A; 1UEB A; 1VIF A; 2J6K A; 2VC8 A; 4BI4 A; 2HD0 A; 2FZC B; 3OYK A; 1YNZ A; 1WFW A; 3M5A A; 2VV5 A; 3SWN B; 3X20 B; 2X35 A; 3JCM J; 1KIK A; 1K73 C; 3CME Q; 2IG0 A; 4DQ2 A; 2ENM A; 2COZ A; 4F17 A; 4OGE A; 2P4R A; 2M16 A; 2YXY A; 1IGU A; 3SB2 A; 2VXF A; 5AT1 B; 2DA9 A; 2J6F A; 2W10 A; 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