The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
56
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structure length |
56
|
Chain Sequence |
KELVLALYDYQEKSPDEVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAYVKKL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Understanding the polymorphic behaviour of a mutant of the alpha-spectrin SH3 domain by means of two 1.1 A structures
rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Gallus gallus
|
| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, brain
|
| total genus |
11
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-03-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DA9 A; 2KYB A; 2CH4 A; 1UUE A; 1WXU A; 4Z89 A; 1WA7 A; 1WIE A; 3VS7 A; 1E6H A; 2A36 A; 4DEY A; 1LCK A; 2KYM A; 4J9B A; 1QKX A; 2KEA A; 2K2M A; 1K4U S; 2DM1 A; 3QWY A; 2CSQ A; 2LQN A; 2HCK A; 3REA B; 2F2X A; 3I35 A; 4RTU A; 2EW3 A; 2D0N A; 2EPD A; 1NG2 A; 2AKK A; 1T0J A; 2J7I A; 1OPL A; 1RI9 A; 2KR3 A; 1MUZ A; 1AD5 A; 1G83 A; 3ZL7 C; 1WYX A; 1AZE A; 3A98 A; 2EGA A; 4CC4 B; 1YNZ A; 1KIK A; 1S1N A; 2CT3 A; 1ARK A; 4J9D A; 4R0K A; 2BZY A; 2RQT A; 3UA7 A; 1PWT A; 5FWC A; 2FRY A; 1JXO A; 4RTT A; 2A28 A; 1NYF A; 4J9E A; 3NPF A; 2L3Q A; 4GLM A; 1WFW A; 1NYG A; 4J9I A; 2DX1 A; 1UG1 A; 1JU5 C; 1Y0M A; 1N5Z A; 2JS0 A; 3LH5 A; 5GJV B; 2FPE A; 4JJB A; 5ECA A; 1AWO A; 2FPF A; 2DBK A; 1V1C A; 1RLQ C; 1T0H A; 1U5S A; 4RTX A; 4HVV A; 2YUQ A; 1W6X A; 2RQV A; 4JZ4 A; 2YSQ A; 4HVU A; 1UFF A; 2EKH A; 3M0Q A; 1NEB A; 2LNH B; 1QLY A; 1SHF A; 4OMM A; 1TUD A; 2FEI A; 2B86 A; 2QDL A; 1GFC A; 2M0Y A; 2X3W D; 2DL5 A; 2GBQ A; 4AFQ C; 1ABO A; 1X43 A; 2KGT A; 2RQW A; 4JJC A; 5EC7 A; 2OI3 A; 2EQI A; 2MOX A; 4QT7 A; 2EBP A; 3H0H A; 2YUP A; 1E6G A; 1QWF A; 2ROL A; 3UAT A; 2C0T A; 1NLP C; 2ENM A; 2KRM A; 2JMA A; 3VS0 A; 1WXB A; 2PZ1 A; 2VWF A; 4AFS C; 1ZLM A; 2DMO A; 2EGC A; 4LE9 A; 2D8J A; 1AWX A; 2FPD A; 3IQL A; 1B07 A; 3VRZ A; 4F16 A; 4RTV A; 1ABQ A; 2KBT A; 3VS6 A; 3I5R A; 2RQU A; 2ABL A; 1I07 A; 4DEX A; 2KXD A; 4D8D A; 2L3S A; 4HXJ A; 3PE0 A; 2KRN A; 1W70 A; 2CSI A; 5I11 A; 1J3T A; 1YN8 A; 2LCS A; 1KSW A; 2O2O A; 1NEG A; 2HBW A; 3ULR B; 3VS2 A; 3TSW A; 4AG2 C; 2DL7 A; 3NGP A; 2ED0 A; 2JT4 A; 3M0T A; 4HVW A; 2J6F A; 2O9V A; 1BB9 A; 1SHG A; 2DNU A; 1MV3 A; 1U3O A; 2H8H A; 1SRM A; 2AK5 A; 1TG0 A; 2I0N A; 3U23 A; 1UJ0 A; 1AOJ A; 2J06 A; 1UEC A; 2DRM A; 1K1Z A; 5IXF A; 1GCP A; 1JXM A; 2JMC A; 3EHR A; 1X2K A; 3M0P A; 2O31 A; 4CC2 A; 1OV3 A; 3M0U A; 4IIM A; 4Y92 A; 3PVL A; 2A08 A; 1QCF A; 1CSK A; 1GBR A; 2XMF A; 4JZ3 A; 2RF0 A; 1I1J A; 2MIO A; 3THK A; 1PNJ A; 1SEM A; 1ZSG A; 2RNA A; 5IH2 A; 1Z9Q A; 4OMO A; 1HJD A; 1OOT A; 1AZG B; 3H0I A; 1FMK A; 2CH4 W; 1X69 A; 1HD3 A; 2LJ1 A; 4JPB W; 1FYN A; 1A0N B; 1ZBJ A; 2FO0 A; 1SRL A; 2HEQ A; 3GBQ A; 1G2B A; 4RTY A; 4OMQ A; 4LNP A; 2GNC A; 1GBQ A; 3JV3 A; 1MV0 B; 1B3Q A; 1RLP C; 4HCK A; 2ESW A; 1T3L A; 2MCN A; 3SHW A; 3M0S A; 4E6R A; 2K7A A; 1SPK A; 2C0I A; 1SSH A; 3O5Z A; 5I22 A; 1RUW A; 1M27 C; 2JM8 A; 4LUE A; 4J9G A; 1WLP B; 2E5K A; 4F14 A; 1T3S A; 1VYU A; 1OEB A; 1PRM C; 2GTO A; 1XOV A; 2IIM A; 1CKA A; 1WI7 A; 2EYZ A; 2F2W A; 3EHQ A; 3VS3 A; 1GCQ C; 2ROT A; 3KFV A; 1ZX6 A; 1TUC A; 2W10 A; 2DLP A; 2CUD A; 2SRC A; 1VA7 A; 2CRE A; 1GL5 A; 2L0A A; 2HSP A; 3RBB B; 1UTI A; 2LZ6 B; 2RPN A; 1BU1 A; 4D8K A; 1W1F A; 2HDA A; 1EFN A; 2CT4 A; 4WCI A; 2DL3 A; 2YT6 A; 1U06 A; 2O9S A; 2GTJ A; 2BTT A; 1Z9Z A; 2J6O A; 3RNJ A; 1YCS B; 1GCQ A; 1AWJ A; 1H8K A; 2DBM A; 2J05 A; 2V1R A; 2VVK A; 5HCK A; 1UDL A; 2SEM A; 2KT1 A; 2J6K A; 3SEM A; 1GFD A; 2K79 A; 1KJW A; 2DIL A; 2M51 A; 2DVJ A; 4RTW A; 1WDX A; 1M3A A; 4K11 A; 3EG0 A; 3TVT A; 4F17 A; 2BZ8 A; 2JM9 A; 2KE9 A; 2LJ0 A; 3H41 A; 2ED1 A; 1BBZ A; 1M30 A; 2PTK A; 1M3B A; 5IHN A; 1M3C A; 1X27 A; 1I0C A; 2GGR A; 4ORZ A; 5FWB A; 3NHN A; 5IHI A; 2DL4 A; 1X6B A; 1QWE A; 2L2P A; 1JEG A; 2K6D A; 2AZS A; 1YP5 A; 5GJW B; 2RQR A; 4AFZ C; 5FW9 A; 2NWM A; 3EG3 A; 3EGU A; 5IXB A; 1X2Q A; 1AEY A; 3I5S A; 4Z8A A; 2CUB A; 1UGV A; 2LJ3 A; 1WX6 A; 4RUG A; 3NMZ C; 2OJ2 A; 2GQI A; 4JJD A; 2A37 A; 2AKL A; 2JXB A; 2O88 A; 4EIK A; 1Y57 A; 2YUO A; 3EG2 A; 1PKT A; 2AZV A; 4RTZ A; 1YWO A; 2OAW A; 1ZUY A; 2EVR A; 1PHT A; 1UHF A; 4M4Z A; 3UA6 A; 1UE9 A; 4ESR A; 2K9G A; 3H0F A; 1YWP A; 2LX7 A; 3I9Q A; 2KRS A; 1H92 A; 3R6N A; 1CKB A; 4LUD A; 1PRL C; 1VYT A; 2JTE A; 2EYW A; 4OMP A; 2G6F X; 2YUN A; 1NLO C; 1KFZ A; 4LN2 A; 4CC7 A; 3TSZ A; 1UJY A; 1WXT A; 2FG0 A; 3VS1 A; 1X6G A; 2D1X A; 2L3P A; 2LP5 A; 2CDT A; 2KXC A; 2DE0 X; 2FRW A; 5L23 A; 2P4R A; 2EYY A; 4J9F A; 1AVZ C; 3REB B; 2DJQ A; 2DRK A; 2BZX A; 4AFU C; 4X1V A; 3VS4 A; 1ZUU A; 1H3H A; 1K9A A; 1E7O A; 2JW4 A; 2LMJ A; 1IO6 A; 1OPK A; 2DL8 A; 1HSQ A; 2YDL A; 2F2V A; 1JQQ A; 3UF4 A; 2W0Z A; 3EG1 A; 2C0O A; 4A63 B; 1K0S A; 3VS5 A; 2NUZ A; 4CC3 A; 4IIO A; 4J9H A; 2RMO A; 3M0R A; 1VYV A; 3VRY A; 4GBQ A; 1K76 A; 2DF6 A; 4OMN A; 2K3B A; 1M8M A; 2KRO A; 3QWX X; 2EGE A; 4OML A; 2X3X D; 4FSS A; 4Z88 A; 1ZUK A; 1JO8 A; 1GRI A; 2LQW A; 2KT8 A; 2RN8 A; 4AG1 C; 1NM7 A; 1PKS A; 3PVQ A; 2EYX A; 4KRT A; 2ECZ A; 5IHK A; 2VKN A; 1UHC A; 2DYB A; 3C0C A; 3FJ5 A; 1BK2 A; 2KNB B; 1K0X A; 4J9C A; 1QKW A; 1AWW A; 2JS2 A; 2D8H A; 3CQT A; 2V1Q A; 2PNI A; 4ZNX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1MNE A; 2DA9 A; 1VIE A; 2KYB A; 3E19 A; 1WXU A; 2GF7 A; 1WA7 A; 3H8Z A; 5AYF A; 3VS7 A; 1H64 1; 2X4W A; 3VUB A; 4FU6 A; 4PJO G; 4M7A E; 4M7D G; 5GAN h; 1K4U S; 2DM1 A; 2PVG B; 2D0Q B; 3MP8 A; 3N5B B; 4QVD A; 4DQ2 A; 2EW3 A; 1N8R R; 1Q82 C; 2E1H A; 1QCN A; 1QVG P; 4DBH A; 2QA4 Q; 3V7R A; 1MUZ A; 4B6M A; 1FX7 A; 1G83 A; 1JJ2 A; 1MMG A; 3DB3 A; 1K73 U; 1AZE A; 8AT1 B; 3A98 A; 1VQ9 Q; 1D3B B; 1S1N A; 3I56 T; 3OYB A; 1NE8 A; 1IGQ A; 2QYZ A; 1O9S A; 2RQT A; 3UA7 A; 5FWC A; 1JXO A; 3TU4 K; 2A28 A; 3DLL A; 2MI6 A; 3CC4 A; 3OYE A; 3I55 Q; 2NLU A; 1M2V B; 5GAO q; 4HKE A; 4JJB A; 4ZN1 A; 2QK0 A; 3CCU T; 4NL2 A; 5J26 A; 3EH1 A; 4HVV A; 2HBP A; 1W6X A; 3EG9 A; 1PD0 A; 4JRK A; 1VQ7 A; 5GMK i; 3M4G A; 4LDX A; 3OYI A; 2RQV A; 5A0L A; 1NEB A; 1TH7 A; 2B86 A; 1GFC A; 1K8A U; 2X3W D; 2M1H A; 3JCM X; 2LC4 A; 3OS2 A; 3OYM A; 2K5I A; 2HMA A; 2EQI A; 2XDB A; 4QQG A; 4ME7 A; 2H3E B; 2YUP A; 1YJW Q; 3JCM e; 1E6G A; 1QWF A; 2GCX A; 5KE2 A; 2C0T A; 3VS0 A; 3LWI A; 4B9W A; 2CZ6 B; 3NFC A; 1MGQ A; 2VWF A; 3Q1J A; 2DMO A; 3MET A; 1V76 A; 2YRD A; 2A0F B; 3EGX A; 3GOX A; 3QYG B; 2IVW A; 2FPD A; 3IQL A; 3VRZ A; 5IT9 E; 4RTV A; 2RHU A; 2E6Z A; 3CCV T; 2ZCF B; 2ZPB B; 4PL6 A; 3I5R A; 5I2M A; 1I07 A; 2KXD A; 4E7S A; 3RMS A; 5LJ3 e; 3CCS A; 7AT1 B; 2YLB A; 3PE0 A; 1W70 A; 3G7Z A; 2DXB A; 3JCM P; 4MZM A; 5GAO m; 1IRE B; 3OY9 A; 2DER A; 4ZTF A; 2YHT A; 1YHQ A; 1VOM A; 4HT9 A; 2DL7 A; 2LNV A; 4HVW A; 2JT4 A; 1YIJ T; 1XQH A; 4PJO B; 2DNU A; 4UC4 A; 5KYY A; 4M7D B; 1MV3 A; 2KDS A; 3I56 Q; 2MAM A; 3X28 B; 1NJI R; 4KGV B; 1U8R A; 2O01 E; 1VQ8 T; 2L5Q A; 3ZFJ A; 2WSC E; 5GMK j; 1QCO A; 4ELZ C; 1X2K A; 4DBF A; 5CQY A; 2O31 A; 4DA4 A; 2DXU A; 4M75 D; 4CC2 A; 4A4K A; 4XTU A; 2QQB A; 3PVL A; 2VXF A; 3PGG A; 2QQR A; 3MEV A; 1NBE B; 1GBR A; 2RF0 A; 1I1J A; 1PNJ A; 2MMP A; 1AZG B; 1M1K C; 1FMK A; 2CH4 W; 3CCU Q; 2LJ1 A; 2X4X A; 4JPB W; 4PK4 A; 3JB9 D; 1ZBJ A; 2FO0 A; 2YRC A; 1V29 B; 4RTY A; 1LOJ A; 1GBQ A; 3JV3 A; 1MV0 B; 1RLP C; 1Y96 A; 4HCK A; 2OTJ A; 5GAM e; 1YJ9 T; 3RMQ A; 1T3L A; 2PUK B; 2MCN A; 3LYI A; 3FJP A; 4II1 A; 1YIT A; 4BE0 A; 5I22 A; 3CC2 T; 1TOV A; 2XHC A; 1WLP B; 1VQ5 T; 1T3S A; 2F5K A; 1PRM C; 4PJO C; 4OP0 A; 2GTO A; 1XOV A; 2X4J A; 4M7D C; 5GAN 4; 1I5L A; 4M7A A; 2ZZD A; 3DKM A; 3KFV A; 3MO8 A; 1TUC A; 5HK0 A; 1BYM A; 5DY9 A; 2CUD A; 4IUV A; 3EFR A; 1K9M R; 3M56 A; 3HPW A; 4PJJ A; 4JRI A; 1BU1 A; 2COZ A; 4KUI A; 3T9N A; 2QA4 A; 3CCV Q; 5GMK l; 2IG0 A; 2FZG B; 1KK7 A; 2CT4 A; 3M57 A; 2K5L A; 3H6Z A; 2CGH A; 3ME9 A; 3LGF A; 1U06 A; 1OYX A; 4E7J A; 4NS5 A; 2BTT A; 4JLG A; 4XAX B; 1GCQ A; 1AWJ A; 2QAZ A; 1UDL A; 4FYW B; 3QBY A; 2DTI A; 3EG9 B; 1GFD A; 2K79 A; 4MDX A; 3UDC A; 2DIL A; 3I55 A; 3A8L B; 1I8F A; 2LCC A; 2JM9 A; 2DIG A; 2RH2 A; 2VV5 A; 4QW2 A; 1M1G A; 1YIJ Q; 4M7A G; 4RMO A; 2F69 A; 2HL5 C; 5IHN A; 1M3C A; 3OSS C; 5GAN d; 5KYN A; 6AT1 B; 1VQ8 Q; 2GGR A; 3NHN A; 4ZTJ A; 1VQ7 T; 2FB7 A; 2D9T A; 2AZS A; 4X34 A; 4AFZ C; 2NWM A; 3G71 T; 3LH0 A; 5KH6 A; 3L2R A; 2CUB A; 1KC8 R; 1YI2 T; 4FYV B; 1UGV A; 2LJ3 A; 1WX6 A; 5EG2 A; 2GQI A; 4JJD A; 3EGX B; 2E6N A; 2RHY A; 1X6O A; 2RI3 A; 1M90 R; 2PQW A; 1Y57 A; 2YUO A; 2MYS A; 4KBM B; 1WHH A; 3SWN A; 3J80 E; 2OAW A; 1KQS P; 3CD6 T; 1ZUY A; 1YJ9 Q; 3PMI A; 1VQO T; 1WHJ A; 3H0F A; 5GMK h; 2LX7 A; 3JCM W; 3HTR A; 4BAC A; 2L89 A; 4E7H A; 3S3N A; 4LUD A; 1PRL C; 2HKN A; 3CC2 Q; 1NLO C; 1PC0 A; 4F7U F; 1H3Z A; 2FL7 A; 1VQ5 Q; 2XDD A; 4X9C A; 2D1X A; 2L3P A; 3FEO A; 1OU8 A; 2KXC A; 2DE0 X; 5A2Q E; 5KYY B; 2FRW A; 2EIF A; 2HAX A; 2XIC A; 1N9R A; 2DJQ A; 2VUB A; 4FL6 A; 5FRM A; 2E10 A; 1IO6 A; 4BI4 A; 3OS5 A; 2EQU A; 3OYF A; 1JQQ A; 3GPL A; 4ATO A; 3EG1 A; 3QUI A; 2NUZ A; 3I56 A; 4A4F A; 2RMO A; 1I5O B; 1QP2 A; 3VRY A; 3CCR T; 4FYX B; 4L5G A; 1RAA B; 4OB2 B; 4C0D C; 1PG5 B; 1MMD A; 1K76 A; 3D7S B; 1KD1 C; 4AMC A; 4C92 C; 4J8O A; 2KRO A; 3OMG A; 3QWX X; 3SB2 A; 2EGE A; 2E41 A; 2X3X D; 4Z88 A; 3ER0 A; 4DOV A; 3LW5 E; 2E70 A; 4M75 E; 1Y96 B; 4M77 F; 2KK4 A; 1GRI A; 3OYH A; 3CCU A; 1I81 A; 4KRT A; 3S6W A; 2HL3 A; 2VKN A; 1KD1 U; 5I2S A; 3QPH A; 2P0Q A; 1VQ7 Q; 2EJG A; 4Y28 E; 1QKW A; 2V1Q A; 3G71 Q; 4O6J A; 2OX7 A; 4M7A B; 4BI8 B; 2DD4 A; 4Z89 A; 1YI2 Q; 1WIE A; 1B34 A; 4JJN K; 4XU0 A; 1YIT T; 4LDU A; 2K2M A; 2OTL T; 2CSQ A; 2GFU A; 4DBR A; 2EPD A; 1NG2 A; 2Y4Y A; 2AKK A; 2J7I A; 3CD6 Q; 1WHK A; 1VQO Q; 4QQD A; 3OYA A; 1AD5 A; 1KHC A; 4C8Q F; 3OYY A; 4C5G A; 5GAN 3; 2L3R A; 1ACM B; 4CC4 B; 1KIK A; 3CCV A; 2CT3 A; 5AT1 B; 1Q95 G; 1EX4 A; 2X9H A; 3OMC A; 3CBM A; 5LJ5 g; 1PWT A; 4ZGE B; 1NYF A; 2JVV A; 4J9E A; 2L3Q A; 4PFO A; 4KUL A; 1K73 R; 1D1A A; 5GAN 2; 1JU5 C; 1Y0M A; 2GFA A; 5ECA A; 1AWO A; 3C95 A; 5J3B A; 2COW A; 1MND A; 4M7A C; 3GNF B; 1YIJ A; 2HKQ B; 2YUQ A; 2QG9 B; 4E7Z A; 3CCR Q; 1NZ9 A; 2DKG A; 3M0Q A; 4Y91 A; 4C0G A; 1WJR A; 1VQ8 A; 3HFN A; 4FIB A; 4N0A A; 1ZBX A; 3VYG A; 3OB9 A; 1QVF P; 2BE7 D; 2GBQ A; 1QVP A; 3PT9 A; 1X43 A; 3G4S T; 3WVE B; 5EC7 A; 2CP6 A; 2QEX A; 2MOX A; 1TS9 A; 3SWN B; 2EBP A; 3MJX A; 3FDR A; 2EKO A; 4C92 F; 1SKU B; 2RJF A; 4MDW A; 1K8A R; 1ZSZ A; 1VQ4 A; 3V7S A; 2KRM A; 2JMA A; 3CCJ T; 4N4H A; 4PJL A; 4E47 A; 4AFS C; 1YJ9 A; 4ANJ A; 3QZ5 B; 1B7T A; 2OTJ Q; 5M9O A; 1ABQ A; 3A5Z B; 4KT0 E; 3QSU A; 1WJQ A; 3SFM A; 4OB1 B; 1KHI A; 2ABL A; 4DEX A; 3CC2 A; 1YIT Q; 5GAO p; 2EQJ A; 1VQ5 A; 2WSE E; 2KRN A; 3GLX A; 2OTL Q; 3NTI A; 1BI2 A; 2JZ2 A; 1J3T A; 1YN8 A; 2LCS A; 1S72 T; 1TTH B; 1WHL A; 2O2O A; 2XKO C; 1NEG A; 3PFS A; 2JUF A; 2WSF E; 3ULR B; 4AG2 C; 4M78 E; 3M0T A; 4XTX A; 2LCL A; 5L8R E; 2H8H A; 3SWN C; 1TG0 A; 3U23 A; 4EMH A; 1UJ0 A; 3A8O B; 5FRN A; 1QVF S; 4C5H A; 3EHR A; 3M0P A; 9ATC B; 4BDZ A; 1WHG A; 1Q82 U; 2NUT A; 1M5Q 1; 1QCF A; 2XMF A; 3THK A; 3HP9 A; 3RKW A; 3MHX A; 1X75 C; 2HZY A; 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