The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
|
sequence length |
67
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structure length |
67
|
Chain Sequence |
GPLGSGRMRVKAIFSHAAGDNSTLLSFKEGDLITLLVPEARDGWHYGESEKTKMRGWFPFSYTRVLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain from IRSp53 (BAIAP2)
rcsb |
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2
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| total genus |
15
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| structure length |
67
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| sequence length |
67
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-04-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4OML A; 4F16 A; 1AVZ C; 1CKB A; 2KNB B; 2L0A A; 1HSQ A; 2O9V A; 1SRL A; 4EIK A; 1AOJ A; 4HVV A; 1X6B A; 3I5R A; 2SRC A; 4AFU C; 3TVT A; 2A28 A; 1M3B A; 2ROL A; 2KT1 A; 2P4R A; 3EHQ A; 3EG3 A; 2DF6 A; 2GGR A; 3PVQ A; 2KRS A; 1KSW A; 2ENM A; 2YDL A; 2BZ8 A; 1WIE A; 2DX1 A; 2O88 A; 1I1J A; 3VRZ A; 2YT6 A; 4OMP A; 2HEQ A; 2JXB A; 1I07 A; 3EHR A; 2DBK A; 2DNU A; 5IHN A; 4AFZ C; 2CUB A; 2M51 A; 1PKT A; 1AWX A; 1UTI A; 2CRE A; 1HJD A; 1T0H A; 4ORZ A; 2EGE A; 2M0Y A; 1JU5 C; 2FPE A; 2A36 A; 2FG0 A; 1KIK A; 2VWF A; 2W0Z A; 1NYG A; 4HCK A; 1Y0M A; 4K11 A; 2AKK A; 2ED0 A; 4ESR A; 3H41 A; 4OMO A; 1H8K A; 2JT4 A; 1TUC A; 3H0H A; 2EBP A; 1J3T A; 1VYU A; 1K4U S; 2YUQ A; 2DYB A; 1K1Z A; 2KRO A; 1UGV A; 2DJQ A; 2C0I A; 3SHW A; 2GNC A; 1E6G A; 1G83 A; 2J7I A; 1G2B A; 2MCN A; 1JQQ A; 2SEM A; 2EYW A; 5ECA A; 5FWC A; 1Z9Q A; 2O9S A; 2LMJ A; 5FW9 A; 3ULR B; 4AFQ C; 4D8K A; 1T0J A; 4OMM A; 4JJC A; 1PRM C; 1ZX6 A; 2D0N A; 1BU1 A; 1E6H A; 2LQW A; 3EG1 A; 2LQN A; 4J9H A; 4AG2 C; 2AK5 A; 1AEY A; 5GJW B; 2J6O A; 3PVL A; 1BBZ A; 1QCF A; 4F17 A; 1XOV A; 2CSI A; 2QDL A; 2RQU A; 2JMC A; 2KXC A; 2PZ1 A; 1VYT A; 2JTE A; 1QKX A; 1NM7 A; 5GJV B; 1QWE A; 1I0C A; 1S1N A; 1NLP C; 2RF0 A; 2KYB A; 4JPB W; 5IXB A; 1B07 A; 2K6D A; 1BK2 A; 2LZ6 B; 4HXJ A; 1K9A A; 2FEI A; 1UDL A; 2K7A A; 2GBQ A; 4M4Z A; 1UHC A; 1GFC A; 2EGA A; 1ARK A; 1YN8 A; 2HCK A; 1UHF A; 2AZS A; 2YSQ A; 1A0N B; 2CH4 W; 2A37 A; 4RTX A; 3I9Q A; 4X1V A; 4Z8A A; 1X69 A; 4J9G A; 4AG1 C; 1WLP B; 1PRL C; 2JMA A; 1WX6 A; 4JZ4 A; 1RUW A; 2DL7 A; 4RTY A; 1K76 A; 1YP5 A; 2VKN A; 1RI9 A; 2LJ1 A; 1SSH A; 1JO8 A; 3I35 A; 4J9B A; 1M3C A; 2KE9 A; 1Y57 A; 1GCQ C; 3TSZ A; 3EG2 A; 1K0S A; 1SEM A; 4FSS A; 1YNZ A; 1NEB A; 2EYY A; 5IHK A; 1QKW A; 1WYX A; 2C0O A; 2DM1 A; 3UF4 A; 2D8J A; 1UG1 A; 1ZUU A; 1ZLM A; 3RNJ A; 1MUZ A; 2EKH A; 3R6N A; 3M0P A; 1M8M A; 2KYM A; 2CDT A; 2CUD A; 2OJ2 A; 2FRW A; 2LP5 A; 2O2O A; 2X3X D; 1EFN A; 1W1F A; 1WXT A; 4JZ3 A; 4RTU A; 4JJD A; 1VYV A; 1RLP C; 2A08 A; 1K0X A; 2KEA A; 2MOX A; 2BTT A; 2MIO A; 3I5S A; 4CC2 A; 2L3Q A; 3THK A; 1ABQ A; 1X2Q A; 1OPL A; 5FWB A; 3VS2 A; 3VS7 A; 2NUZ A; 2LCS A; 2FPF A; 1YCS B; 2PTK A; 1BB9 A; 3LH5 A; 4HVU A; 1RLQ C; 3VS1 A; 1PNJ A; 1M27 C; 4F14 A; 4A63 B; 4E6R A; 2KXD A; 1CSK A; 1SRM A; 1WA7 A; 1JEG A; 1X27 A; 2C0T A; 1OPK A; 2JS2 A; 3VS6 A; 1SHF A; 2DL3 A; 2FPD A; 2F2X A; 2EYZ A; 4GLM A; 2V1R A; 2J6F A; 2NWM A; 2ECZ A; 4HVW A; 3REA B; 1KFZ A; 1FYN A; 2KT8 A; 4CC3 A; 3UA7 A; 1WI7 A; 1U3O A; 1GL5 A; 2JW4 A; 1W6X A; 3H0F A; 3U23 A; 1AD5 A; 3EG0 A; 3M0U A; 2RPN A; 4AFS C; 1AZE A; 4Z89 A; 2ROT A; 1TUD A; 4Z88 A; 3QWY A; 1T3S A; 2ESW A; 5I22 A; 1WXU A; 4OMN A; 4J9D A; 1X2K A; 2DRK A; 1H92 A; 1QWF A; 2DLP A; 2XMF A; 2HSP A; 1KJW A; 2AKL A; 2G6F X; 1N5Z A; 4J9E A; 4LE9 A; 4OMQ A; 1M3A A; 1UEC A; 2KRN A; 2JS0 A; 3VS0 A; 2DRM A; 2J05 A; 2YUN A; 1WXB A; 2KBT A; 2W10 A; 1NYF A; 3ZL7 C; 2LNH B; 4RTV A; 2JM8 A; 2K3B A; 2DIL A; 1SHG A; 2RNA A; 2RQV A; 3H0I A; 3M0R A; 2EQI A; 1YWO A; 4J9F A; 2DL4 A; 4LUE A; 2GTJ A; 4CC7 A; 2OI3 A; 2KRM A; 3TSW A; 3FJ5 A; 3NHN A; 1CKA A; 1UJY A; 4JJB A; 3SEM A; 1Z9Z A; 1JXM A; 2L3S A; 2L2P A; 2HDA A; 2K79 A; 4DEX A; 2AZV A; 1AWJ A; 4RTW A; 3REB B; 4KRT A; 2LJ3 A; 4QT7 A; 5L23 A; 2RN8 A; 1GBQ A; 2I0N A; 2OAW A; 2B86 A; 1SPK A; 4IIO A; 2CH4 A; 1T3L A; 2EW3 A; 1W70 A; 5IXF A; 1ZBJ A; 3VS5 A; 2CSQ A; 3A98 A; 3GBQ A; 2J06 A; 2D8H A; 2CT4 A; 2EVR A; 2RMO A; 1AZG B; 2BZX A; 2EYX A; 2L3P A; 3NMZ C; 2LX7 A; 3M0T A; 4D8D A; 2RQR A; 1ZUK A; 4ZNX A; 4J9C A; 2RQT A; 2JM9 A; 5I11 A; 4LUD A; 2CT3 A; 2FO0 A; 3PE0 A; 2DA9 A; 4CC4 B; 1IO6 A; 1MV3 A; 2V1Q A; 2DBM A; 1PHT A; 1YWP A; 2F2V A; 1GBR A; 1UUE A; 3C0C A; 2J6K A; 2YUP A; 3JV3 A; 2O31 A; 4RTT A; 3VS4 A; 5IHI A; 2ABL A; 4DEY A; 2DL8 A; 2IIM A; 5IH2 A; 3KFV A; 3EGU A; 1QLY A; 1WFW A; 2DE0 X; 3M0Q A; 2DVJ A; 1UE9 A; 3M0S A; 1ABO A; 2X3W D; 1GCP A; 3O5Z A; 1AWW A; 1OOT A; 2HBW A; 1FMK A; 1ZUY A; 2D1X A; 2F2W A; 2K2M A; 2YUO A; 1NEG A; 4LN2 A; 1X6G A; 5HCK A; 3RBB B; 3NPF A; 4WCI A; 3UA6 A; 1NLO C; 2DL5 A; 2GQI A; 2GTO A; 2PNI A; 1B3Q A; 1UJ0 A; 1LCK A; 3VRY A; 3CQT A; 4J9I A; 2KGT A; 1UFF A; 2RQW A; 1AWO A; 2EPD A; 1OEB A; 1U5S A; 1VA7 A; 3NGP A; 3IQL A; 4LNP A; 1GFD A; 2FRY A; 2ED1 A; 1HD3 A; 4RTZ A; 1X43 A; 1TG0 A; 2KR3 A; 1H3H A; 2K9G A; 1GRI A; 1NG2 A; 4R0K A; 1PKS A; 2E5K A; 1ZSG A; 1V1C A; 2DMO A; 2LJ0 A; 4IIM A; 1JXO A; 2VVK A; 1WDX A; 3VS3 A; 2H8H A; 1OV3 A; 5EC7 A; 3UAT A; 1PWT A; 4RUG A; 4Y92 A; 1U06 A; 3QWX X; 1E7O A; 4GBQ A; 1M30 A; 2EGC A; 1MV0 B; 2BZY A; 1GCQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4QKU A; 2KNB B; 3RR6 A; 1RL2 A; 4M7A E; 4JS4 A; 4M7D E; 1VQ4 T; 3HRS A; 2XK0 A; 2ROL A; 2KT1 A; 2RI2 A; 3PVQ A; 4P5N A; 2KRS A; 2ENM A; 5GAN 2; 2BZ8 A; 2MWP A; 3OYF A; 3TCJ A; 3VRZ A; 3G71 A; 2YT6 A; 2HEQ A; 2JXB A; 4C92 A; 1K8A U; 1Y07 A; 5LJ3 j; 5GMK l; 1RAF B; 1FXX A; 9ATC B; 2M51 A; 1Q95 G; 4M7A D; 1UTI A; 1PSF A; 4WTO B; 2CRE A; 3E9F A; 1HJD A; 3OYL A; 1N27 A; 4QQ6 A; 1KHI A; 3SWN C; 2OTJ A; 1QMC A; 2CZ0 B; 1JU5 C; 1YJN A; 3I55 A; 1Q86 C; 1KIK A; 2E3I A; 5M9O A; 4IUV A; 2KI7 A; 3FRN A; 3WVE B; 2F69 A; 1M1K U; 1VQ7 T; 1NPP A; 3SB2 A; 2BKD N; 2AKK A; 1RAD B; 4OMO A; 1H8K A; 3HKS A; 2CP0 A; 3KBG A; 4PJM A; 3M4Y A; 5LJ5 h; 3H0H A; 4XU0 A; 2EJF A; 3CBP A; 2YUQ A; 2DYB A; 2QK0 A; 1BKB A; 2C0I A; 2A7Y A; 2DIQ A; 3SHW A; 1KQS S; 4NL2 A; 2J7I A; 5KH6 A; 3URG A; 4LDY A; 2JOY A; 5CAI A; 3OSS C; 2CP5 A; 4XU2 A; 2VXE A; 1K9M U; 4N0A C; 2QEX Q; 4KUI A; 3CMA T; 1XNI A; 4C92 B; 1RAG B; 4OMM A; 4JJC A; 3VUZ A; 4DBQ A; 3MJX A; 1E6H A; 2LQW A; 3EG1 A; 4AG2 C; 2KSS A; 2X4Y A; 4JLG A; 1RAB B; 4PFZ A; 1X6O A; 3GOX A; 2J6O A; 4E2F B; 5GAO m; 2HKN A; 3JCM d; 5CIU A; 1YHQ Q; 5GAN d; 2CSI A; 5L8R E; 3OMG A; 2KXC A; 2YLB A; 1QKX A; 1LPL A; 2DZC A; 3A8H B; 5IXB A; 1B07 A; 4NL3 A; 2LZ6 B; 4HXJ A; 3CC2 A; 4BY6 B; 5GAN 7; 1UDL A; 2QGG A; 1KC8 C; 4N4H A; 1G3W A; 2GBQ A; 4M4Z A; 1GFC A; 5AYF A; 4C0D B; 3VJP A; 3J81 E; 3CCR A; 1ARK A; 4EPC A; 2WSE E; 2Y4X A; 2A37 A; 3I9Q A; 4F7U E; 5DLO A; 4EMK A; 2JMA A; 1YI2 T; 4JZ4 A; 7AT1 B; 3CPW A; 2VKN A; 1SSH A; 3MP1 A; 4MDW A; 2COW A; 3OS0 A; 2V26 A; 3RKY A; 3F70 A; 3OS1 A; 3JRZ A; 4DQ2 A; 1K0S A; 3PT9 A; 4M77 D; 4C5G A; 3UF4 A; 2DVE A; 2D8J A; 4CI0 C; 3RNJ A; 3CCS A; 1RI0 A; 1TH7 A; 3M4G A; 3CCJ A; 4C0F A; 4RCC A; 1QCO A; 3M0P A; 2CDT A; 2QAS A; 2LP5 A; 4M77 F; 2EJG A; 3OQ5 A; 4C8Q E; 2X3X D; 1EFN A; 1WXT A; 3ASK A; 4JZ3 A; 5FRN A; 4X9C A; 4JJD A; 1H64 1; 1YJW A; 2A08 A; 2E64 A; 2MIO A; 4JRQ A; 3THK A; 1ABQ A; 2LQK A; 5FWB A; 2A3L A; 4BI4 A; 2L5Q A; 3VS7 A; 4EMK B; 3G6E A; 3HP9 A; 4JRK A; 3DB4 A; 3PTA A; 1B7T A; 1VQK A; 3LH5 A; 2K5I A; 1QVG S; 4FYV B; 4JUV A; 1OZ3 A; 1PNJ A; 3MP6 A; 2LT4 A; 4A63 B; 2YXY A; 1VQ4 Q; 1CSK A; 2GF7 A; 3QBY A; 3EFS A; 1WA7 A; 3GNG A; 2ZPG B; 4FU6 A; 3OYD A; 4FYW B; 4GLM A; 4RMO A; 2J6F A; 2ECZ A; 1KFZ A; 2LCL A; 2KT8 A; 3A8O B; 1IB8 A; 3HFN A; 3M53 A; 4J6X A; 3CPF A; 2JW4 A; 3GF5 A; 5CKH A; 4M7A A; 1VQ6 T; 2K3X A; 1AD5 A; 3EG0 A; 1NJI C; 4M7D A; 2QYZ A; 3M0U A; 1Q82 R; 4BUG A; 1VQ7 Q; 4YTL A; 3CCE T; 2ROT A; 1UGP B; 1WNL A; 4Z88 A; 1OX9 A; 5I22 A; 1KD1 R; 3S6W A; 2CP7 A; 1R8O B; 4OMN A; 4J9D A; 3HFO A; 1QWF A; 2HSP A; 2P0K A; 4BE2 A; 2AKL A; 2G6F X; 2Y4Y A; 4QQG A; 2E3H A; 5GAN 6; 1C1A A; 2M0O A; 3FIF A; 2W10 A; 2OTL Q; 3X20 B; 3CMA Q; 1SF9 A; 2NUP B; 1U1S A; 2K3B A; 4RCB A; 1ZQ1 A; 4D6W A; 1SHG A; 3PMI A; 3H0I A; 5LJ5 f; 4IUR A; 4BB7 A; 1VQN T; 2IPO B; 2LX9 A; 4M7A B; 3QZ5 B; 2RK1 A; 4M7D B; 1W2B A; 1S72 T; 3SEM A; 1VQ9 T; 3UT1 A; 3OW2 S; 2KQW A; 1N8R R; 4DBR A; 3VU3 C; 1JB0 E; 5J3B A; 1PM3 A; 1GBQ A; 2RHZ A; 3OYY A; 1SPK A; 1TUG B; 2MPX C; 2CH4 A; 3V8K A; 1D1C A; 1T3L A; 2RJF A; 5IXF A; 4C5E A; 2J06 A; 2CT4 A; 5AT1 B; 3V7C A; 2LT1 A; 3CC7 A; 1PC0 A; 1U8R A; 4D8D A; 3WVD B; 4J9C A; 4IUT A; 2DXT A; 1I5L A; 1BI1 A; 2OAU A; 1YI2 Q; 2X35 A; 1YCY A; 2AT1 B; 5KE3 A; 1M5Q 1; 4ZN3 A; 3JB9 D; 2MYS A; 5CVI A; 3HHT B; 4CC4 B; 4JRP A; 2DBM A; 3P8H A; 5GAO r; 1PHT A; 2F2V A; 1UUE A; 3A5Z B; 3L2Q A; 3EH2 A; 4B6M A; 5IHI A; 2RHI A; 2FZC B; 3RKW A; 2DL8 A; 3JB9 F; 2COZ A; 1VQO A; 4M77 A; 1WFW A; 3M0Q A; 1WHG A; 2DVJ A; 3M55 A; 3VYH B; 4DBF A; 1ABO A; 4XAX B; 1GCP A; 1AWW A; 2RH2 A; 2D1X A; 1FMK A; 2F2W A; 2NUT A; 2I2L A; 4XU3 A; 2KAF A; 4JS5 A; 5HCK A; 3A8G B; 2QQS A; 3NPF A; 1M1F A; 4WCI A; 2LTO A; 5LJ3 d; 2RJD A; 4RG2 A; 2GTO A; 2LNV A; 2RI3 A; 1YIJ T; 2RHU A; 4FSX A; 4C5H A; 2RQW A; 2FYK A; 3ME9 A; 2XD0 A; 3RMQ A; 4C92 D; 1NZ9 A; 2VB6 A; 2QQ9 A; 4LNP A; 3L1A A; 4XTW A; 3CCL T; 2FRY A; 1Q86 R; 3OYE A; 3CME T; 2QDY B; 3QZ9 B; 2WSC E; 4EMH A; 3JCM h; 5GAN h; 4HT8 A; 1UGQ B; 4C8Q A; 4R0K A; 4OGE A; 3JB9 J; 1ZSG A; 4C92 F; 2LJ0 A; 3OY9 A; 1JXO A; 1VQM T; 1YIT T; 2VVK A; 3G4S T; 2DTO A; 1G8X A; 3E2U A; 1M1G A; 1OV3 A; 4M77 B; 4LD9 K; 4Y92 A; 1OZ2 A; 1XJW B; 3L2U A; 4PJO E; 3DKM A; 1VQ6 Q; 2DER A; 4OML A; 1CKB A; 4M78 E; 2O9V A; 1SRL A; 2NLU A; 3OYJ A; 3RER A; 3ZBD A; 1K8A C; 3CCE Q; 5EG2 A; 2SRC A; 4J6Y A; 3M58 A; 1TU0 B; 3MEA A; 1EIF A; 2E6N A; 2GFA A; 3P8B B; 1KSW A; 4PJN A; 1EX4 A; 2DX1 A; 3CXC S; 2O88 A; 3GNF B; 3T9N A; 4OMP A; 2K3Y A; 4C8Q B; 3EHR A; 3UDC A; 2DNU A; 1IZ6 A; 5IHN A; 8AT1 B; 1M1K C; 3UPU A; 3X24 B; 3M57 A; 5J39 A; 1KC8 R; 1H3Z A; 4ORZ A; 3PIP A; 3QJ6 A; 2EGE A; 1DJ7 B; 3LLR A; 2FG0 A; 5J26 A; 2VWF A; 3VUB A; 1VQN Q; 4HCK A; 1KHC A; 4K11 A; 1G5V A; 2RHX A; 1Q7Y U; 2JT4 A; 1K9M C; 3RUX A; 1S72 Q; 1J3T A; 1VQ9 Q; 1VYU A; 4PKC C; 1K4U S; 3OBW A; 1UGV A; 2GNC A; 2MCN A; 1JQQ A; 1I8F A; 1U1T A; 3HL8 A; 2YRC A; 2M9U A; 5FWC A; 4OMF B; 4E7H A; 2O9S A; 5FW9 A; 4KBM B; 1G3S A; 3OB9 A; 3QG1 A; 5GMK j; 1T0J A; 1PRM C; 4II1 A; 2D0N A; 3J80 E; 4OGC A; 4R55 A; 1BU1 A; 3RES A; 5A0L A; 3CD6 Q; 4E7S A; 1I4K 1; 3OYM A; 1YJ9 Q; 4PJL A; 2K4Y A; 1QCF A; 2H3E B; 3D7S B; 3EG9 A; 4NS5 A; 4LXC A; 1ZA1 B; 2JNG A; 2PZ1 A; 3OYI A; 1VIF A; 2KK4 A; 1OQK A; 1NM7 A; 3M9Q A; 2VGM A; 1QWE A; 1I0C A; 4KT0 E; 2E41 A; 2RF0 A; 2ZPI B; 4A4F A; 2K6D A; 1BK2 A; 4MZT A; 2XID A; 1YJN T; 2FEI A; 4M75 E; 3I55 T; 1UHC A; 3GP8 A; 4E7L A; 1C6V X; 1YN8 A; 2HCK A; 2AZS A; 2YSQ A; 2HL3 A; 1MMD A; 4RTX A; 2VGN A; 1X69 A; 4J9G A; 5LJ5 j; 4AG1 C; 4VUB A; 5GAO n; 3L2Z A; 3V7S A; 4QVC A; 1YIJ Q; 1RUW A; 1YP5 A; 1RI9 A; 4PJJ A; 3DB3 A; 3I35 A; 2HQX A; 3CCL Q; 2KE9 A; 3EG9 B; 1NJI R; 1SEM A; 3CME Q; 1RAI B; 3GLX A; 4HKE A; 1WYX A; 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