The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
58
|
structure length |
58
|
Chain Sequence |
ETKFVQALFDFNPQESGELAFKRGDVITLINKDDPNWWEGQLNNRRGIFPSNYVCPYN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein/inhibitor
|
| molecule keywords |
SEX MUSCLE ABNORMAL PROTEIN 5
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| publication title |
Exploiting the basis of proline recognition by SH3 and WW domains: design of N-substituted inhibitors.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Caenorhabditis elegans
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| total genus |
10
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| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1998-11-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1OOT A; 2HBW A; 4J9E A; 3NGP A; 4CC2 A; 1RI9 A; 2RQR A; 2A36 A; 2X3W D; 2LMJ A; 2KT1 A; 5GJV B; 1WIE A; 2JM9 A; 2HEQ A; 4CC3 A; 2GTO A; 2KYM A; 4RTW A; 2IIM A; 2KXD A; 2M51 A; 2G6F X; 4ORZ A; 2ED0 A; 3R6N A; 2L0A A; 4WCI A; 2PTK A; 2DMO A; 1X6G A; 1UUE A; 1WDX A; 1YWP A; 1YCS B; 3ZL7 C; 2O88 A; 4HCK A; 3C0C A; 3VS1 A; 4X1V A; 3PVL A; 4JJB A; 2JS0 A; 1TG0 A; 2DRM A; 4F16 A; 5FW9 A; 2YUN A; 5FWC A; 3VS5 A; 4OMP A; 4K11 A; 2O9S A; 1E6G A; 1H92 A; 1T3L A; 4J9I A; 2K79 A; 2K2M A; 2DRK A; 2EYZ A; 2A08 A; 1OPL A; 3VRZ A; 3M0Q A; 1QWF A; 2SEM A; 1ARK A; 1T0J A; 3THK A; 1UJ0 A; 2DYB A; 2JM8 A; 4JZ4 A; 2XMF A; 1UEC A; 2YT6 A; 1PKS A; 3H0I A; 2RF0 A; 1K1Z A; 1W6X A; 3I35 A; 2DL4 A; 2W0Z A; 4HVV A; 1M3C A; 2GNC A; 2OI3 A; 2JTE A; 2PNI A; 5ECA A; 2J05 A; 1KFZ A; 1GFC A; 1WFW A; 4AG2 C; 2V1R A; 1EFN A; 3EG0 A; 1K4U S; 1ABO A; 3H41 A; 2JS2 A; 1K0S A; 2VWF A; 1VYU A; 4RTU A; 3PVQ A; 2DIL A; 2DL3 A; 1GBR A; 2RQW A; 2LJ1 A; 4JJC A; 2DJQ A; 2MOX A; 2KYB A; 1GBQ A; 1B07 A; 2H8H A; 2NWM A; 2RQV A; 3VS4 A; 3M0P A; 3TSZ A; 2K7A A; 1I07 A; 2BZX A; 2BZ8 A; 3EG1 A; 3U23 A; 2ECZ A; 2KT8 A; 4J9G A; 1NYF A; 4LE9 A; 2FRY A; 4Z8A A; 2EGC A; 3CQT A; 1AWW A; 1SHF A; 4A63 B; 2JMA A; 1PHT A; 2CSI A; 4HVW A; 4GBQ A; 1SRL A; 1T3S A; 2J6F A; 4HVU A; 2C0T A; 1K9A A; 2CH4 A; 3GBQ A; 3VS0 A; 4M4Z A; 2X3X D; 1NM7 A; 1E6H A; 1NLP C; 1WA7 A; 2P4R A; 2L3Q A; 1JEG A; 2DL7 A; 1HSQ A; 1ZUK A; 2CUD A; 1UG1 A; 1AZE A; 1ABQ A; 2FG0 A; 1Y0M A; 4EIK A; 3REB B; 1M3A A; 2A28 A; 3NPF A; 2CDT A; 2J06 A; 1PRM C; 3KFV A; 1K0X A; 4FSS A; 1SHG A; 2LJ0 A; 1AOJ A; 4IIO A; 5FWB A; 2V1Q A; 1WX6 A; 2ENM A; 5GJW B; 1WXT A; 2JT4 A; 1ZLM A; 4IIM A; 2B86 A; 2EKH A; 2DA9 A; 2J6O A; 3IQL A; 2ROL A; 1I0C A; 2C0I A; 2DNU A; 2LQN A; 1GCQ C; 4RTV A; 2KBT A; 3LH5 A; 5IHI A; 3NMZ C; 2E5K A; 3TSW A; 2QDL A; 2F2W A; 4F14 A; 2KRO A; 1WI7 A; 3EHR A; 5IH2 A; 1UFF A; 2LNH B; 2KEA A; 1QCF A; 1XOV A; 2EPD A; 2J7I A; 4LUD A; 2RNA A; 4CC7 A; 2GTJ A; 3REA B; 2VKN A; 2DBM A; 2RQT A; 4AFS C; 4F17 A; 1YNZ A; 1JQQ A; 1W70 A; 2RN8 A; 3VS7 A; 1MV3 A; 4E6R A; 1Z9Q A; 4ESR A; 5L23 A; 2OAW A; 2CSQ A; 2L2P A; 5IXB A; 2CRE A; 4RTZ A; 4DEY A; 2C0O A; 1W1F A; 1YP5 A; 3ULR B; 2LX7 A; 2DX1 A; 1SEM A; 4RTT A; 1JXM A; 4AG1 C; 1NEG A; 3EGU A; 2KGT A; 5IXF A; 3EG2 A; 2FRW A; 2EYY A; 1AWO A; 2D1X A; 2EQI A; 1GFD A; 2AKL A; 2DE0 X; 4Z89 A; 3QWX X; 1T0H A; 1UHF A; 1X43 A; 2KRS A; 4ZNX A; 2L3P A; 3NHN A; 1HD3 A; 3UAT A; 2I0N A; 2BTT A; 1H3H A; 1G83 A; 3JV3 A; 2AZS A; 4LUE A; 1U5S A; 1PWT A; 4D8K A; 4Y92 A; 4JZ3 A; 3M0S A; 1CKA A; 1N5Z A; 1M8M A; 1PNJ A; 4RUG A; 2EBP A; 1MUZ A; 2KXC A; 3SHW A; 2DF6 A; 3PE0 A; 4AFQ C; 3VS2 A; 2AK5 A; 3UA7 A; 4OMO A; 4OMM A; 1QKW A; 2CT4 A; 1M27 C; 2YUO A; 4GLM A; 1X2Q A; 1JXO A; 2FO0 A; 2M0Y A; 1UGV A; 2KRM A; 1X69 A; 4HXJ A; 1GCP A; 2MIO A; 2JXB A; 1BBZ A; 2J6K A; 2KNB B; 3M0U A; 4DEX A; 2DVJ A; 1I1J A; 3EHQ A; 3I5R A; 1M3B A; 2ESW A; 4JPB W; 2FEI A; 1CKB A; 2W10 A; 4J9C A; 4Z88 A; 1AWJ A; 2VVK A; 1QKX A; 1X27 A; 5IHN A; 2O9V A; 2FPD A; 1PKT A; 1WLP B; 2DBK A; 2SRC A; 3SEM A; 2ABL A; 4CC4 B; 5EC7 A; 2LJ3 A; 2DL8 A; 4J9D A; 4J9F A; 1GRI A; 1KJW A; 1UE9 A; 3I5S A; 4D8D A; 1AVZ C; 1SSH A; 4LN2 A; 1GCQ A; 1S1N A; 4RTY A; 1SRM A; 1KIK A; 2HSP A; 3QWY A; 2EW3 A; 1OPK A; 2EVR A; 2LQW A; 1E7O A; 2L3S A; 3RNJ A; 1NG2 A; 2AKK A; 1Z9Z A; 2K3B A; 3H0H A; 5IHK A; 1QWE A; 3RBB B; 3I9Q A; 1H8K A; 3VS3 A; 2RMO A; 2CUB A; 3EG3 A; 2F2V A; 2BZY A; 1JO8 A; 2PZ1 A; 1AWX A; 1ZUY A; 3TVT A; 2NUZ A; 1VYV A; 1MV0 B; 2K9G A; 2LP5 A; 1K76 A; 1JU5 C; 1OEB A; 2GBQ A; 2D8J A; 1G2B A; 2D8H A; 2EYW A; 1ZX6 A; 4J9H A; 2ED1 A; 1WXB A; 1NYG A; 1UJY A; 2KR3 A; 3VS6 A; 1J3T A; 3M0R A; 2CT3 A; 1BU1 A; 1ZSG A; 3H0F A; 1FMK A; 1WYX A; 2DLP A; 2GQI A; 2RPN A; 5HCK A; 2EGE A; 1UDL A; 2K6D A; 2CH4 W; 2EGA A; 4KRT A; 2FPE A; 2O2O A; 2DL5 A; 3UA6 A; 1U06 A; 2KE9 A; 2LZ6 B; 2D0N A; 2YUP A; 1B3Q A; 2AZV A; 1NEB A; 1BK2 A; 1SPK A; 4OMN A; 1UHC A; 2JW4 A; 5I11 A; 1LCK A; 4R0K A; 1TUD A; 1X6B A; 1AEY A; 1TUC A; 2OJ2 A; 1VYT A; 3A98 A; 4OML A; 1WXU A; 1RLP C; 4J9B A; 3UF4 A; 1CSK A; 3M0T A; 4JJD A; 1M30 A; 2A37 A; 2EYX A; 1YN8 A; 1OV3 A; 1ZUU A; 2YSQ A; 2ROT A; 3FJ5 A; 1Y57 A; 1UTI A; 1X2K A; 1HJD A; 2DM1 A; 4LNP A; 2MCN A; 2GGR A; 1KSW A; 1PRL C; 1V1C A; 4OMQ A; 2KRN A; 2O31 A; 1ZBJ A; 1U3O A; 2YUQ A; 1AZG B; 1RLQ C; 4AFU C; 3O5Z A; 1GL5 A; 2HDA A; 1QLY A; 1RUW A; 2F2X A; 4RTX A; 2JMC A; 2HCK A; 1IO6 A; 2YDL A; 1FYN A; 3VRY A; 2FPF A; 1VA7 A; 4AFZ C; 1AD5 A; 1BB9 A; 2RQU A; 2LCS A; 4QT7 A; 1A0N B; 1YWO A; 1NLO C; 5I22 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2BE7 D; 1OOT A; 2EJ9 A; 2DK3 A; 3M58 A; 4OF1 A; 3OBW A; 3PGG A; 1SF9 A; 3MP1 A; 3L1A A; 2FZG B; 2RQR A; 2A36 A; 5GAN h; 3F70 A; 4CC3 A; 2GTO A; 1BCO A; 3EG9 A; 2IIM A; 3JB9 F; 3MEA A; 2QGG A; 2G6F X; 2ED0 A; 3BE3 A; 3JCM W; 4KH1 B; 3CC2 Q; 1KQS P; 1UUE A; 4FT2 A; 2I2L A; 1YJW T; 1YWP A; 5KCH A; 1I8F A; 3EG9 B; 3QG1 A; 2O88 A; 2DFU A; 5HY6 A; 3DLM A; 4UC4 A; 4E7I A; 2ZPB B; 3PVL A; 4JJB A; 5CKB A; 1I4K 1; 2JS0 A; 3QPH A; 5FW9 A; 2COY A; 5FWC A; 4OMP A; 5GAN 3; 1T3L A; 4J9I A; 3MEW A; 1KC8 R; 3MHX A; 2DRK A; 4DBH A; 3VRZ A; 3M0Q A; 1WHK A; 3CCS A; 1ARK A; 2JM8 A; 3G6E A; 2K5L A; 3LH0 A; 4OVA A; 2OTJ T; 5KYX A; 1OX9 A; 1UEC A; 2YT6 A; 5DM7 R; 3H0I A; 2OTL A; 2KMT A; 1RAH B; 3CMA T; 4N0A A; 1G3W A; 5D6W A; 3OS5 A; 1MMD A; 5KYX B; 2GNC A; 4XU1 A; 4OB2 B; 4M7D D; 4C8Q G; 2DVE A; 4KUL A; 3PIO A; 1GFC A; 4JRP A; 1H3Z A; 4FIB A; 4AG2 C; 1I5O B; 5J26 A; 4C5G A; 3H41 A; 1NZ9 A; 2VWF A; 5KYU A; 1VYU A; 3L2Z A; 2CP7 A; 2JOY A; 4A4G A; 1IHW A; 3CXC P; 4JJC A; 2MOX A; 2KYB A; 2H8H A; 1ZSZ A; 5KYU B; 3VS4 A; 2DZ9 A; 2F1L A; 3TSZ A; 4C92 C; 1YJN A; 3EFO A; 1M1K R; 3CD6 A; 1NYF A; 1G3Y A; 4EMK C; 5GAN e; 3OYA A; 3ZEH A; 3I56 A; 2JUF A; 1PHT A; 4C5E A; 2XHC A; 3EFO B; 4GBQ A; 3JAM E; 5LJ3 e; 2J6F A; 3V8L A; 4WTO B; 3V7S A; 4R56 A; 2X3X D; 1NM7 A; 2P4R A; 4PJO D; 1K9M R; 2V8I A; 1VQN A; 1ZUK A; 1UG1 A; 1ABQ A; 2FG0 A; 4DBQ A; 1Y0M A; 4C8Q C; 3REB B; 2VB6 A; 3I55 T; 3CCE T; 4BI4 A; 1VQL A; 2LX9 A; 3MPU B; 3KFV A; 3N5B B; 4IIO A; 1D0X A; 4FSS A; 4DA4 A; 2LRQ A; 3VYH B; 3QZ9 B; 1WX6 A; 2ENM A; 5GJW B; 4IUU A; 2NUP B; 2JZ2 A; 1PG5 B; 1YBY A; 3G4S T; 1BIA A; 1BIB A; 2DEQ A; 2L8D A; 2XKO C; 2M1H A; 4QQ6 A; 3TSW A; 1JBM A; 1H64 1; 4JUV A; 2E1H A; 4PFP A; 2M02 A; 4FT4 A; 2F5T X; 3ER0 A; 3CC4 A; 2KEA A; 3V7C A; 3CCL A; 1U1S A; 1XOV A; 4LUD A; 5CQY A; 1N6A A; 2C06 A; 1YJ9 A; 3R6O A; 4AFS C; 4E7Z A; 1FX7 A; 1YJW Q; 2CGH A; 1W70 A; 3C95 A; 3S3N A; 4OMF B; 1LJO A; 4E6R A; 3LX7 A; 4HT9 A; 3RKW A; 3CCR A; 3QZ5 B; 2DJZ A; 5LJ5 d; 2CSQ A; 3OSS C; 4DEY A; 1W1F A; 3ULR B; 1PD1 A; 2QI2 A; 2O01 E; 4B9X A; 2X4Y A; 3EGU A; 3OYB A; 4C5H A; 5CIU A; 4C0F A; 5GAO r; 4Z89 A; 3QWX X; 2OTJ Q; 4ZNX A; 2L3P A; 3NHN A; 1VQ7 T; 3JV3 A; 2AZS A; 3CMA Q; 4LUE A; 4M7D G; 1U5S A; 1M1G A; 2FVU A; 1PNJ A; 1YIT T; 2EBP A; 4AFQ C; 1VIE A; 1M90 C; 1HYO A; 1LVK A; 3JCM X; 2LVM A; 1GXI E; 3RR6 A; 1M27 C; 2YUO A; 2M0Y A; 1ZA2 B; 3G1J A; 1UGV A; 2L3R A; 4HXJ A; 4C8Q F; 4RCC A; 1D3B B; 4ATO A; 4ZN3 A; 2KNB B; 1QVF A; 2Y4Y A; 3QII A; 4JRK A; 4MDW A; 4M75 E; 2LTO A; 3HRS A; 3KBG A; 2QQB A; 3DB3 A; 4OGC A; 3MO8 A; 1RL2 A; 4M7D E; 4M75 A; 1CKB A; 5LJ5 g; 1TXQ A; 1Q82 U; 1QKX A; 2HQH A; 1X27 A; 4L5G A; 4M7D A; 3A8G B; 2DBK A; 4PJM A; 2SRC A; 2CP2 A; 3M55 A; 3SEM A; 3INZ A; 4M75 B; 2LJ3 A; 4PJO G; 3NFC A; 2DL8 A; 3MKD A; 1X6O A; 3G71 T; 1MNE A; 3VU3 C; 2HSP A; 2VAS A; 1VQ4 A; 5FU7 C; 2D9T A; 3SD4 A; 5M9O A; 1QVF S; 1TTH B; 2QK0 A; 3H6Z A; 3CCE Q; 2K3X A; 4O5V A; 4PFO A; 2CUB A; 4LDY A; 2QQA A; 4NOY A; 1AWX A; 1MV0 B; 3SWN C; 4TVR A; 2K5F A; 5KYY A; 4J9H A; 2ED1 A; 1WXB A; 1IHV A; 3V8J A; 4DBF A; 4XTV A; 1N9R A; 5GAM h; 1J3T A; 3G4S Q; 2X4X A; 2CT3 A; 2EYQ A; 1BU1 A; 4PJO E; 4A53 A; 2PVO B; 1WYX A; 2GQI A; 1Q86 C; 5KYY B; 4PJO A; 2HAX A; 3QJY A; 1Q95 G; 3CBM A; 3UA6 A; 4FYW B; 2WAC A; 1B3Q A; 3OY9 A; 3L2V A; 4DBR A; 2RI5 A; 1BK2 A; 2CZ1 B; 4OMN A; 1D0Z A; 2G3R A; 1AEY A; 2YWW A; 3A98 A; 1VQ9 Q; 4J9B A; 8ATC B; 3RKY A; 3UF4 A; 1Q7Y C; 1NPP A; 4E7H A; 2BUD A; 5GAN d; 2E10 A; 2E3H A; 2HQX A; 1N8R R; 3FJ5 A; 2YRD A; 2MK5 A; 2ZPG B; 4IKF A; 1VIF A; 1HJD A; 3PFS A; 1UEB A; 2CP6 A; 1V1C A; 2O31 A; 2YUQ A; 1M4Z A; 4AFU C; 1C6V X; 3O5Z A; 2QTV A; 2JTF A; 3MEU A; 4BI8 B; 4IUV A; 4KGZ B; 1N8R U; 2JMC A; 2HCK A; 4XAX B; 2ZAE A; 1IRE B; 1V29 B; 1G8X A; 3VRY A; 5FU6 C; 1WHH A; 2LCS A; 1YIT Q; 2VGN A; 5GAN 8; 5KH6 A; 5GAN 6; 3RDV A; 2CYZ B; 3BDU A; 2QEX Q; 4J9E A; 1K8A C; 3A8L B; 3GNG A; 4CC2 A; 4M7D F; 1M2V B; 2E5Q A; 3JCM h; 2QEX A; 2X3W D; 1KD1 U; 2KT1 A; 5GJV B; 3HHT B; 2HZY A; 4BUG A; 4A4H A; 2XIC A; 4ORZ A; 5GAM e; 2OTL T; 2PTK A; 1Q81 U; 2FYK A; 1WZO A; 1YCS B; 2EFI A; 3ZL7 C; 3CCU A; 2Y4X A; 2EJG A; 5GAN g; 5GMK j; 2K3Y A; 3P8D A; 3VYG A; 4C0Z A; 2D0Q B; 2XG8 D; 1YHQ A; 1VQP A; 1JJ2 A; 2P0Q A; 2DRM A; 4F16 A; 5IAY A; 2YUN A; 4LD9 K; 2CP3 A; 4K11 A; 4F7U E; 2O9S A; 4PJL A; 1E6G A; 1RAB B; 1NJI R; 2EAY A; 2K79 A; 4F7U A; 4PKC C; 2A08 A; 2HNI A; 4KUI A; 2AIR B; 3G71 Q; 3QDF A; 1QWF A; 2SEM A; 4F04 B; 5LJ5 f; 3HRT A; 4JLI A; 4JZ4 A; 3WVE B; 1YJN T; 1PKS A; 4PJO F; 1K1Z A; 3CD6 T; 3I35 A; 3OW2 A; 1Y7X A; 1O9S A; 2QDY B; 3CCJ A; 2DO3 A; 5A0G A; 3I56 T; 1BYM A; 2OI3 A; 4XU0 A; 2PNI A; 5ECA A; 5KE3 A; 1KFZ A; 1SKU B; 4FW1 A; 2YRV A; 1EFN A; 1M8V A; 1JJ2 S; 2NYS A; 3J81 E; 2JS2 A; 2DAQ A; 3RIR A; 4OB1 B; 4ZGE B; 2HKN A; 2DIL A; 2LJ1 A; 1FMV A; 1D1B A; 2DJQ A; 1W2B A; 4V2S A; 2KI7 A; 1OI1 A; 5CO7 A; 5KYN A; 3M0P A; 1PCX A; 1ACM B; 3BFM A; 3A1P A; 3JB9 I; 1VQL T; 4E7K A; 1I07 A; 2BZ8 A; 3M53 A; 3OYI A; 3EG1 A; 3U23 A; 3JCM e; 4Y91 A; 5KYW A; 1MGQ A; 2BKD N; 4LE9 A; 2K57 A; 3OW2 S; 3LWI A; 3LLR A; 1MMN A; 4QQD A; 3TQ7 P; 1QVF P; 4ZTF A; 1OU9 A; 2LNV A; 2C0T A; 3OSV A; 2CH4 A; 5HKC A; 3FEO A; 1K73 R; 1NLP C; 1D1C A; 2OAU A; 1JEG A; 3EH1 A; 2DL7 A; 1HSQ A; 2CUD A; 3SFM A; 1AZE A; 2MI6 A; 1M1F A; 3FRN A; 4RCB A; 3CCL T; 1W2B S; 3VUZ A; 3CME A; 2A28 A; 4LDX A; 4JRI A; 1YJ9 T; 5GAO l; 2CDT A; 3RKX A; 3OYD A; 3GIB A; 4OB3 B; 1PRM C; 5LJ3 h; 1K0X A; 1SHG A; 1BI2 A; 5FWB A; 3M59 A; 1K73 U; 3A8H B; 2DZC A; 4HKE A; 5IN1 A; 5GAN 4; 1ZLM A; 2CZ7 B; 3CCR T; 2ROL A; 2DNU A; 2PUO B; 1GCQ C; 4RTV A; 5GMK m; 5IHI A; 2FZC B; 3CEY A; 1IZ6 A; 2JNG A; 3UWN A; 1WI7 A; 3EHR A; 2R5A A; 1UFF A; 5IH2 A; 2XU8 A; 2LNH B; 3QO3 A; 2VV5 A; 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