The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
|
sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
TLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPV
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase Fyn
|
| publication title |
The promiscuous binding of the Fyn SH3 domain to a peptide from the NS5A protein.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
13
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2011-10-21 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3KFV A; 1UJ0 A; 3M0S A; 3PE0 A; 4RTT A; 4FSS A; 1X27 A; 1RLP C; 1BU1 A; 1NG2 A; 4OMO A; 4AG1 C; 3EHR A; 2K7A A; 1EFN A; 2QDL A; 2SEM A; 1E7O A; 2FPE A; 3M0Q A; 1M3C A; 3UF4 A; 2CH4 W; 1YCS B; 4RTV A; 2ABL A; 4Y92 A; 2JM9 A; 2L2P A; 2LMJ A; 1UHF A; 3ZL7 C; 1T0H A; 1YWO A; 1TUD A; 1JXO A; 2LQW A; 1UGV A; 1JO8 A; 2KT8 A; 2VVK A; 2RF0 A; 5IXF A; 1NM7 A; 3NGP A; 2EYX A; 1PRL C; 1UJY A; 2RPN A; 4J9E A; 2AKK A; 3VS4 A; 1VA7 A; 4RTX A; 1U5S A; 4J9C A; 1SRM A; 3EG0 A; 2YUO A; 1WYX A; 4AFZ C; 2F2X A; 4CC4 B; 1T3L A; 2EGE A; 1FMK A; 5IH2 A; 3M0R A; 1SPK A; 1YNZ A; 2M51 A; 2W10 A; 1X2K A; 2O31 A; 1I0C A; 2OAW A; 1YN8 A; 2DL8 A; 2J6F A; 2RN8 A; 2L3P A; 1WIE A; 1SHG A; 2DL4 A; 1M3A A; 1NYF A; 5EC7 A; 3EHQ A; 1AOJ A; 1ABQ A; 1ZLM A; 3I5R A; 3M0U A; 2B86 A; 1UTI A; 1PKT A; 4IIM A; 2RQT A; 1UG1 A; 2KR3 A; 2AZS A; 1GRI A; 2D8J A; 4JJB A; 4Z8A A; 4J9I A; 3SEM A; 2KRM A; 2PZ1 A; 2EPD A; 2JW4 A; 2YUQ A; 1T3S A; 1SHF A; 3A98 A; 3O5Z A; 5IXB A; 3C0C A; 2FRY A; 2EGC A; 2FRW A; 2K6D A; 4HXJ A; 2YUP A; 3NPF A; 2ED1 A; 2K3B A; 4ORZ A; 1XOV A; 2EYZ A; 1FYN A; 2YSQ A; 3TSZ A; 1E6G A; 1AEY A; 3SHW A; 1QLY A; 2CT4 A; 1M30 A; 2A28 A; 4OMN A; 3UA7 A; 1PWT A; 4RTY A; 3THK A; 5IHK A; 1X6G A; 4K11 A; 3CQT A; 2DNU A; 3QWX X; 2YT6 A; 4OMP A; 1OPK A; 2GGR A; 2DX1 A; 1WXU A; 2DL7 A; 1ABO A; 2O9V A; 1X2Q A; 2LQN A; 1G83 A; 1ZUY A; 1ZSG A; 2CUB A; 1BK2 A; 4J9G A; 4J9D A; 2MOX A; 3H41 A; 2GBQ A; 2KGT A; 1W1F A; 3UA6 A; 1OV3 A; 3VS6 A; 1K0X A; 4R0K A; 1AD5 A; 3VS1 A; 1PRM C; 1N5Z A; 2PNI A; 4M4Z A; 3VS3 A; 1VYV A; 2F2W A; 1OOT A; 1U06 A; 3REB B; 2CSQ A; 2NWM A; 5L23 A; 1RUW A; 2DL3 A; 4DEY A; 1HSQ A; 1IO6 A; 3ULR B; 2DMO A; 3U23 A; 4JJD A; 2LJ0 A; 2LZ6 B; 1H8K A; 2JMA A; 2C0O A; 2LJ3 A; 2H8H A; 1KSW A; 1ZUK A; 2ED0 A; 2EYY A; 2VKN A; 2LJ1 A; 1QCF A; 4A63 B; 4GLM A; 2DM1 A; 3IQL A; 4J9F A; 4RTZ A; 2E5K A; 2JS2 A; 2V1Q A; 2DF6 A; 4JZ4 A; 1Y57 A; 1Y0M A; 4JZ3 A; 2J06 A; 2FEI A; 1MV0 B; 4J9H A; 5I11 A; 2KYM A; 4RUG A; 5ECA A; 5GJW B; 2J6K A; 3NMZ C; 2RQV A; 1I1J A; 2CH4 A; 1X43 A; 1K1Z A; 2CT3 A; 2KXD A; 1UE9 A; 1A0N B; 1GBQ A; 4OMQ A; 1AVZ C; 2A37 A; 4KRT A; 1YWP A; 1GBR A; 2DRM A; 2ROT A; 1TG0 A; 2RMO A; 5HCK A; 3H0I A; 4F14 A; 2L0A A; 1SSH A; 2JTE A; 2EW3 A; 4QT7 A; 4AFU C; 2HSP A; 1WA7 A; 4EIK A; 1W6X A; 2JXB A; 1WDX A; 5IHI A; 1SRL A; 4E6R A; 2X3X D; 2O9S A; 2KT1 A; 1ZX6 A; 2AK5 A; 2JS0 A; 1QKW A; 4J9B A; 1QWE A; 1KFZ A; 1JQQ A; 3PVL A; 2C0I A; 4CC7 A; 1JXM A; 3RNJ A; 3LH5 A; 1JU5 C; 2D0N A; 1UHC A; 4HVU A; 2KYB A; 3EG2 A; 2W0Z A; 2LX7 A; 5FWC A; 3H0H A; 2EGA A; 2CUD A; 3I5S A; 4X1V A; 1M27 C; 2HBW A; 2VWF A; 2JT4 A; 4LUD A; 2CDT A; 2BTT A; 1NYG A; 3GBQ A; 4IIO A; 4F16 A; 1WXT A; 4Z88 A; 2X3W D; 2EBP A; 2K79 A; 3VS7 A; 2DYB A; 1AWO A; 1WI7 A; 2DIL A; 2SRC A; 1E6H A; 2DA9 A; 4Z89 A; 2EVR A; 2KRN A; 2MIO A; 1G2B A; 3I35 A; 3JV3 A; 3QWY A; 2FPD A; 2KRO A; 4LN2 A; 1CKA A; 2FO0 A; 2A36 A; 3VS5 A; 1GFD A; 1UDL A; 4AG2 C; 3VS0 A; 5IHN A; 4LE9 A; 2O88 A; 1HJD A; 2JM8 A; 3NHN A; 1V1C A; 4DEX A; 2KBT A; 3M0P A; 1GL5 A; 2HCK A; 2KRS A; 1PNJ A; 2EKH A; 2FG0 A; 3EG1 A; 1GCQ C; 1X69 A; 2BZ8 A; 3R6N A; 1VYT A; 1ARK A; 1S1N A; 2AKL A; 1MUZ A; 3FJ5 A; 1WLP B; 1Z9Z A; 2HDA A; 4WCI A; 2YUN A; 2ENM A; 2HEQ A; 1UUE A; 4RTU A; 4F17 A; 4GBQ A; 4CC2 A; 4LNP A; 1GFC A; 2RNA A; 2LP5 A; 4ESR A; 1OEB A; 1NLO C; 1BBZ A; 3I9Q A; 1T0J A; 1U3O A; 1TUC A; 1BB9 A; 4D8D A; 2XMF A; 1PHT A; 2NUZ A; 1KIK A; 2DVJ A; 2L3Q A; 1J3T A; 4JPB W; 2J6O A; 2KE9 A; 1K9A A; 4HVV A; 1AZE A; 4AFS C; 1M3B A; 2AZV A; 1M8M A; 3M0T A; 1H3H A; 2OI3 A; 1KJW A; 2RQW A; 2DRK A; 2FPF A; 1AWW A; 2I0N A; 1OPL A; 2DLP A; 3VRZ A; 1AWX A; 1LCK A; 2OJ2 A; 4CC3 A; 2KXC A; 2CRE A; 2LNH B; 2P4R A; 2ECZ A; 3PVQ A; 2RQU A; 5I22 A; 1K0S A; 2KNB B; 3TSW A; 1GCQ A; 3RBB B; 4JJC A; 2GNC A; 1GCP A; 1QKX A; 2GTO A; 1MV3 A; 2JMC A; 2A08 A; 4OML A; 1AZG B; 2J05 A; 1K76 A; 3VS2 A; 1B07 A; 2K2M A; 2PTK A; 3TVT A; 2F2V A; 2DBM A; 2DJQ A; 1RLQ C; 1QWF A; 1WXB A; 3H0F A; 1Z9Q A; 2DL5 A; 1WX6 A; 1JEG A; 2EYW A; 1RI9 A; 1WFW A; 1AWJ A; 2YDL A; 1ZBJ A; 1CSK A; 3VRY A; 1NEG A; 2L3S A; 4LUE A; 2GQI A; 1UEC A; 2LCS A; 1NEB A; 2MCN A; 1X6B A; 2M0Y A; 3REA B; 2K9G A; 3EGU A; 1ZUU A; 2DBK A; 4OMM A; 1VYU A; 2ROL A; 2D8H A; 4AFQ C; 2D1X A; 2RQR A; 2J7I A; 1SEM A; 2V1R A; 4D8K A; 2GTJ A; 1I07 A; 4HCK A; 1CKB A; 2KEA A; 1UFF A; 2BZY A; 2O2O A; 5GJV B; 1NLP C; 2ESW A; 2C0T A; 2EQI A; 1K4U S; 1PKS A; 1H92 A; 5FWB A; 1W70 A; 1B3Q A; 2CSI A; 2IIM A; 4RTW A; 2BZX A; 3EG3 A; 1HD3 A; 4HVW A; 1YP5 A; 5FW9 A; 4ZNX A; 2DE0 X; 3UAT A; 2G6F X; #chains in the Genus database with same CATH topology 5CCA A; 5GAM f; 1KC8 U; 1WHG A; 3M0S A; 3VYG A; 3PE0 A; 1RLP C; 1M90 U; 1NG2 A; 4OMO A; 3CC4 A; 1YIT A; 2BE9 B; 1VQ5 T; 2FPE A; 4DOV A; 1QVF P; 2ABL A; 4Y92 A; 1SG5 A; 4M78 B; 1FMW A; 2DAQ A; 2DXU A; 1I8F A; 1N8R R; 2LQW A; 2DJZ A; 1UGV A; 1UGR B; 2VVK A; 4XU0 A; 3OYG A; 1AT1 B; 2RO0 A; 1UJY A; 1U5S A; 3EG0 A; 4AFZ C; 2VXE A; 1IGU A; 4DA4 A; 4JRK A; 5IH2 A; 2L8D A; 4FW2 A; 1C0M A; 3V8J A; 8AT1 B; 2EIF A; 1SPK A; 2X51 A; 1YNZ A; 2M51 A; 4F7U A; 1G3T A; 2W10 A; 1X2K A; 1I0C A; 5J3B A; 2ZPF B; 4OB1 B; 2L3P A; 3QYH B; 2RJC A; 2DL4 A; 1KD1 U; 1LNX A; 1YJ9 T; 1W2B S; 1IGQ A; 3LWI A; 1UTI A; 2FVU A; 1PKT A; 2DFU A; 5GAO m; 4C8Q D; 4C0D C; 3H9N A; 4Z8A A; 3OSS C; 4J9I A; 1O75 A; 2EPD A; 1T3S A; 4IUR A; 3A98 A; 2P4T A; 1ZHI A; 2IG0 A; 2OTL A; 1M1K R; 4LD6 A; 2CP5 A; 3RKX A; 4ANJ A; 4NOY A; 1IB8 A; 2OX7 A; 1TU0 B; 2YUP A; 1XNI A; 2Y4X A; 2EJG A; 1VQP A; 4ORZ A; 1XOV A; 1FYN A; 3A8O B; 2ZPI B; 2NUP B; 1E6G A; 3LGL A; 2M1H A; 9ATC B; 3JCM J; 5GAM e; 2CT4 A; 1G3Y A; 5LJ3 d; 4M75 E; 3H8Z A; 3M54 A; 4OMN A; 3DLM A; 4V2S A; 4RTY A; 1BI3 A; 3CCL A; 3OS0 A; 4LDW A; 1X75 C; 3QKJ A; 1X6G A; 3TQ7 P; 4KGZ B; 2DNU A; 5KE3 A; 3QWX X; 4OMP A; 4B9X A; 2GGR A; 4C0Z A; 2YLC A; 2DL7 A; 2M02 A; 2O9V A; 5GAM h; 1BIA A; 1OX9 A; 3CCE T; 1VQ8 Q; 2PVG B; 1G83 A; 1S72 A; 2CUB A; 4LDX A; 4AMC A; 2OTJ A; 3GIB A; 5KYY B; 4Q5W A; 4XK8 E; 3ME9 A; 4PNO A; 2RJD A; 1QVP A; 2F2W A; 1U06 A; 3REB B; 1LVK A; 2CSQ A; 1RUW A; 4DEY A; 2KY9 A; 1IO6 A; 2MWO A; 4JJD A; 5I2M A; 5CKB A; 3VYH B; 1KSW A; 2C06 A; 2DVE A; 1SSF A; 1VQM A; 2XDD A; 3CCJ T; 1KG1 A; 4QQD A; 3MO8 A; 3OYD A; 2VKN A; 1RI0 A; 3SFM A; 4QKU A; 3ASK A; 2HAX A; 5KYN A; 2DM1 A; 3ZFJ A; 3EGX A; 2E5K A; 4JDS A; 1YJ9 Q; 4PFP A; 5I11 A; 2FEI A; 1MV0 B; 4J9H A; 3J80 E; 4RUG A; 1OU9 A; 2L89 A; 4M77 F; 1A0N B; 5FU7 B; 2WSC E; 3HL8 A; 2DRM A; 3OW2 P; 5GAM g; 2E41 A; 4XU3 A; 4QVD A; 3H0I A; 5FRN A; 2O4X A; 4F14 A; 2L0A A; 3QSU A; 1SSH A; 5FLX E; 4FSX A; 4AFU C; 2HSP A; 1WA7 A; 3HPW A; 1VQK A; 1QVG S; 3LW5 E; 1SRL A; 2MI6 A; 1JJ2 S; 1G3S A; 3JCM b; 2KT1 A; 1OI1 A; 1ZX6 A; 1V29 B; 4E7Z A; 2DTH A; 1QKW A; 4J9B A; 3M4G A; 1JQQ A; 3MJX A; 2C0I A; 4F7U B; 1UGS B; 1U8R A; 4HVU A; 2KYB A; 2K5L A; 4ATO A; 2XDP A; 1WZO A; 3JCM V; 2X9H A; 3EG2 A; 4MZP A; 1YHQ T; 4DBH A; 2LX7 A; 5FWC A; 3H0H A; 2EGA A; 1WJQ A; 1MND A; 2KAF A; 3P8H A; 1K73 U; 1Q7Y R; 4PLI A; 2MPX C; 3OBW A; 2CDT A; 1KQS P; 3T9N A; 2BTT A; 2QQR A; 3FJP A; 1Y07 A; 1WXT A; 1EZZ B; 2ZPG B; 4Z88 A; 2X3W D; 1D3B B; 1VQ6 T; 2K79 A; 1NJI C; 2DYB A; 1WI7 A; 2DIL A; 2SRC A; 4BDZ A; 3M5A A; 4BY6 B; 2EVR A; 3I35 A; 4KH1 B; 4OB0 B; 4L6V 5; 3JB9 H; 3JCM d; 4QVC A; 2FO0 A; 1UDL A; 4AG2 C; 3CC4 T; 5GAO q; 4LE9 A; 1YIT T; 1HJD A; 2JM8 A; 3FRN A; 4FM4 B; 1VQL Q; 3M9Q A; 3HRS A; 3CCJ Q; 1GL5 A; 5HK0 A; 1PNJ A; 3RR6 A; 2E70 A; 1GCQ C; 3R6N A; 2EYQ A; 1VYT A; 2E3H A; 4X9C A; 1FX7 A; 2AKL A; 3EFS A; 2KVQ G; 3L2Q A; 4FYX B; 2BIV A; 2VUB A; 2XID A; 3C4S A; 4WCI A; 4OGC A; 3RMQ A; 2ENM A; 1VQ8 A; 1OU8 A; 3EG9 A; 4F17 A; 3V7R A; 1GFC A; 1M2O A; 1LPL A; 4XTX A; 2QTV A; 5CQY A; 4ESR A; 1OEB A; 3PTA A; 3OMG A; 1TUC A; 1BB9 A; 1YJW A; 4D8D A; 2NUZ A; 5C6S A; 3I55 A; 1N9R A; 1SKU B; 2F5K A; 3M4Y A; 2LT4 A; 4M77 D; 3VJP A; 2J6O A; 1K9A A; 4X34 A; 1WHK A; 1M3B A; 2AZV A; 4FW1 A; 2PVD B; 1KJW A; 4M77 E; 3EH1 A; 4Y28 E; 4M7D C; 1YFN A; 3CCS Q; 3FLG A; 2I0N A; 1OPL A; 2DLP A; 2VXF A; 2OTL T; 2KXC A; 2GFU A; 3PVQ A; 2QQ9 A; 2RQU A; 4XU2 A; 1PD0 A; 4JJC A; 5LJ5 f; 1YHQ Q; 2RM4 A; 2FHD A; 1AZG B; 5DM7 R; 3A8G B; 3CCR A; 1B07 A; 3I56 Q; 3OYM A; 2BKD N; 3FC3 A; 1VQ9 Q; 4D6W A; 1WXB A; 5HKC A; 2LTO A; 1VQ6 Q; 4TVR A; 4E7K A; 2EFI A; 3URG A; 3CCL T; 2QGF B; 5D7U A; 2NLU A; 3ZBD A; 1AWJ A; 1TSF A; 3QDF A; 2YDL A; 2O4X B; 1CSK A; 3OBY A; 1VQO T; 3VRY A; 2GQI A; 2LCS A; 3REA B; 3KXT A; 3RDV A; 3CPW S; 1KD1 R; 3EGU A; 1PM3 A; 2DBK A; 4M75 B; 3CC4 Q; 1D0Z A; 2D8H A; 4FT2 A; 1YIT Q; 3CCV A; 1Y96 A; 1S72 T; 4LD9 K; 1W2B P; 1I07 A; 2KEA A; 1M9S A; 1NLP C; 3MCA B; 1D0Y A; 2X35 A; 4A53 A; 1W70 A; 1VQ7 A; 2IIM A; 1IRX A; 3EG3 A; 1HD3 A; 3RUX A; 2E64 A; 2L5Q A; 4EMK A; 3UAT A; 2XD0 A; 5LJ5 j; 1R77 A; 1QQJ A; 3CCQ Q; 1RAA B; 1NPR A; 2KMT A; 2QDL A; 2K4Y A; 2SEM A; 3M0Q A; 1M3C A; 2CH4 W; 1D1C A; 4RTV A; 2LCC A; 2L2P A; 1M4Z A; 2LMJ A; 5KCO A; 1T0H A; 1YWO A; 1FMV A; 1BCO A; 1TUD A; 1VQ4 A; 5J26 A; 1JXO A; 1HK9 A; 1JO8 A; 2KT8 A; 3SB2 A; 4B9W A; 1K9M C; 2ZAE A; 1YCY A; 1PRL C; 2RPN A; 5LJ5 e; 1OQK A; 3VS4 A; 2YUO A; 1WYX A; 1QW1 A; 2VB6 A; 1T3L A; 3CC2 A; 2K3X A; 3QJY A; 2OTL Q; 1FMK A; 3KUF A; 2D9T A; 1GXI E; 3BW1 A; 3GF5 A; 1VQP Q; 3QII A; 1D09 B; 1VQK T; 2DER A; 2J6F A; 3RMS A; 3EG9 B; 1WIE A; 1RAC B; 4EPC A; 1ZA1 B; 2MMP A; 3S3N A; 1M3A A; 1NYF A; 5LJ5 h; 2HQH A; 4XQ3 A; 1Q86 U; 1ZLM A; 2A7Y A; 4C8Q F; 2RQT A; 2KR3 A; 3CME A; 3BFM A; 4JJB A; 4OB2 B; 5KE2 A; 3SEM A; 2PZ1 A; 2NUT B; 3CCL Q; 4ZN3 A; 3PIO A; 4O6J A; 3X28 B; 4E7I A; 2M9U A; 3O5Z A; 1G5V A; 1MGQ A; 3PIP A; 1WJS A; 1RAB B; 1KC8 C; 2ED1 A; 4C92 F; 2YSQ A; 2QG9 B; 3TSZ A; 1M90 C; 3JCM c; 3J81 E; 2XKO C; 4C8Q G; 2OTJ Q; 2YRD A; 3X26 B; 3EFO B; 1VUB A; 2V8J A; 2IPO B; 3CXC P; 2A28 A; 2CZ7 B; 4BI4 A; 4JS5 A; 2CZ1 B; 3WVE B; 3A1P A; 1RAE B; 1WHL A; 2HD0 A; 4WF2 A; 3THK A; 3LX7 A; 4C92 G; 3G4S A; 4LDV A; 4M7D A; 2YT6 A; 4BI3 A; 4PJM A; 2JOY A; 1VQM Q; 1WXU A; 3M53 A; 1ABO A; 2EQJ A; 2FZK B; 1OYX A; 1WNL A; 2GCX A; 1QVG P; 2LQN A; 4XTU A; 3EGD A; 4FT4 A; 2YHT A; 1JJ2 P; 1ZSG A; 3OYK A; 3UPU A; 3H41 A; 4B6M A; 2GBQ A; 2DIQ A; 1JB0 E; 4QVZ A; 1OV3 A; 4R0K A; 2DTI A; 1AD5 A; 5GAN 3; 3VS1 A; 1VQ8 T; 4M75 C; 3VS3 A; 3CBP A; 1OOT A; 1KQ1 A; 4IUU A; 2NWM A; 5L23 A; 5FU6 B; 4EDU A; 3OS5 A; 1KD1 C; 3U23 A; 1Y96 B; 2H8H A; 2JJ9 A; 3QUI A; 1ZUK A; 5AYF A; 3OMC A; 4A4H A; 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