The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
|
sequence length |
61
|
structure length |
61
|
Chain Sequence |
VTLFVALYDYQADRWTDLSFHKGEKFQILDASPPGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Generation, Characterization and Structural Data of Chymase Binding Proteins Based on the Human Fyn Kinase SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CHYMASE
|
| molecule tags |
Hydrolase/de novo protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
12
|
| structure length |
61
|
| sequence length |
61
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YWO A; 1X2K A; 2JM8 A; 1WXB A; 4J9B A; 1JQQ A; 1PRM C; 1MUZ A; 4J9C A; 1G83 A; 3U23 A; 1JEG A; 4RTY A; 1RLQ C; 3EHQ A; 2OI3 A; 2OJ2 A; 2CUB A; 4HXJ A; 4J9G A; 1U06 A; 4A63 B; 1KSW A; 2CH4 W; 2GTO A; 2VWF A; 1SSH A; 1QWE A; 1U3O A; 1YNZ A; 4RTZ A; 1NEB A; 4J9F A; 4K11 A; 1UUE A; 1MV3 A; 3QWX X; 2YUO A; 2YT6 A; 1SEM A; 2K79 A; 3REB B; 3EG3 A; 2J06 A; 1GL5 A; 1QLY A; 1AWW A; 2CT4 A; 1G2B A; 4RTV A; 3EG2 A; 5FW9 A; 1YP5 A; 3VS2 A; 1UGV A; 3VS4 A; 3NHN A; 2KR3 A; 4AG1 C; 1VA7 A; 2EYX A; 1GCP A; 3H0H A; 1GRI A; 2AK5 A; 2ROT A; 4DEX A; 1JXO A; 1SRM A; 2FPF A; 2JXB A; 1QCF A; 1NM7 A; 2HDA A; 3I5R A; 3VS6 A; 2LNH B; 2LP5 A; 2ENM A; 2JMA A; 1UEC A; 2F2W A; 4OMQ A; 1N5Z A; 3VRY A; 2J6F A; 4RTU A; 2DRM A; 1X2Q A; 2BZ8 A; 2DX1 A; 1NYF A; 1UG1 A; 3ULR B; 4DEY A; 4KRT A; 2EGA A; 1GCQ C; 3NMZ C; 5GJW B; 3M0P A; 1TG0 A; 2X3W D; 2EKH A; 4CC2 A; 1K9A A; 2JS0 A; 2OAW A; 3M0S A; 2KRN A; 1W6X A; 2O9V A; 1M27 C; 1BBZ A; 3THK A; 1T3L A; 4OMN A; 2C0T A; 4D8K A; 4FSS A; 4LE9 A; 3M0Q A; 4GBQ A; 2DL5 A; 1PKT A; 2HBW A; 5IH2 A; 1J3T A; 2EPD A; 3JV3 A; 2L3P A; 3EHR A; 2DIL A; 2PZ1 A; 1OV3 A; 2DJQ A; 2FRW A; 2KXC A; 1GBR A; 3EG1 A; 2LJ0 A; 3M0U A; 1EFN A; 3UAT A; 4F16 A; 3UA6 A; 1ABO A; 4ESR A; 2LX7 A; 4JJD A; 2A28 A; 4AFS C; 1HJD A; 1NEG A; 2IIM A; 4IIO A; 1WXU A; 1VYT A; 3A98 A; 1SRL A; 2CH4 A; 1JXM A; 2RF0 A; 1WXT A; 1OPL A; 2CUD A; 2FEI A; 4HCK A; 1VYU A; 3PVL A; 4RUG A; 2ECZ A; 3R6N A; 1SHG A; 1V1C A; 2DA9 A; 2VVK A; 1NYG A; 2KEA A; 2D8H A; 2CSQ A; 3C0C A; 5EC7 A; 1HSQ A; 1JU5 C; 2PNI A; 2EYW A; 1WX6 A; 5L23 A; 2FPD A; 3PE0 A; 3CQT A; 1E6H A; 2RN8 A; 1QWF A; 1K76 A; 1OEB A; 1IO6 A; 2ESW A; 4D8D A; 4OMM A; 2D8J A; 1ZX6 A; 2XMF A; 2KXD A; 2KT1 A; 1KJW A; 2K2M A; 1K4U S; 2DBK A; 3H0F A; 4CC7 A; 1ZSG A; 2HSP A; 1ZUK A; 2O2O A; 1UFF A; 3H0I A; 2HEQ A; 2DNU A; 4OML A; 4F14 A; 2CT3 A; 1E6G A; 2KE9 A; 1XOV A; 1KIK A; 2K9G A; 3H41 A; 3VS1 A; 2DL7 A; 5IHI A; 4ORZ A; 2FPE A; 2W10 A; 2LQN A; 2RMO A; 2GNC A; 1M3A A; 4J9I A; 2KYB A; 2GBQ A; 4HVV A; 1A0N B; 2F2X A; 1T0H A; 1PKS A; 2L2P A; 5GJV B; 1CKA A; 1WDX A; 2KT8 A; 2X3X D; 1NLO C; 3VS7 A; 1NG2 A; 2JMC A; 2CRE A; 3M0T A; 1GFD A; 3RNJ A; 1B07 A; 1K0S A; 4AFQ C; 1QKX A; 1NLP C; 2YDL A; 3I35 A; 2YUN A; 1I07 A; 4EIK A; 2DRK A; 1M3B A; 2RNA A; 2FRY A; 1AWO A; 2NUZ A; 1PRL C; 4GLM A; 2DMO A; 2YUP A; 2DL4 A; 2EBP A; 1QKW A; 2DLP A; 2E5K A; 3TVT A; 2LMJ A; 2DVJ A; 4X1V A; 1X69 A; 5HCK A; 2GQI A; 1AWJ A; 1BB9 A; 2BZX A; 2MOX A; 2PTK A; 1SPK A; 1UE9 A; 2RQU A; 2L0A A; 4JZ4 A; 2DM1 A; 2J7I A; 1JO8 A; 1H92 A; 1UHC A; 1WYX A; 2EYY A; 2K7A A; 5IXF A; 4J9H A; 4RTW A; 4Z8A A; 2NWM A; 2MCN A; 4JZ3 A; 2SRC A; 2EGC A; 4RTT A; 3GBQ A; 1LCK A; 2ED0 A; 4AFU C; 2LQW A; 2LCS A; 4JPB W; 2CSI A; 1W70 A; 3ZL7 C; 1X6B A; 2O31 A; 1YWP A; 3LH5 A; 5I22 A; 2JM9 A; 2RQW A; 1TUD A; 2GGR A; 1PNJ A; 4LNP A; 1AZG B; 2AKK A; 2DYB A; 4WCI A; 4Z89 A; 4R0K A; 2M0Y A; 1UJ0 A; 2L3Q A; 2J05 A; 1RUW A; 5ECA A; 5FWB A; 2KBT A; 1H8K A; 1GBQ A; 1FYN A; 2JS2 A; 4IIM A; 3TSW A; 1BK2 A; 5FWC A; 3RBB B; 2GTJ A; 2DL3 A; 1WIE A; 2DF6 A; 2JW4 A; 2L3S A; 2J6K A; 1UJY A; 5IHN A; 1RI9 A; 2ED1 A; 2J6O A; 2DBM A; 4CC3 A; 4HVW A; 2KYM A; 4HVU A; 2SEM A; 1E7O A; 1UDL A; 4J9E A; 1I1J A; 3QWY A; 4AFZ C; 3EGU A; 4LUD A; 1ZUY A; 2I0N A; 2RQV A; 2A08 A; 4QT7 A; 1PHT A; 2HCK A; 1ZUU A; 1Y0M A; 2RQT A; 2QDL A; 1AVZ C; 3I5S A; 2AKL A; 3NGP A; 2B86 A; 2O9S A; 1AWX A; 3KFV A; 3VS3 A; 2FO0 A; 2RPN A; 1CKB A; 2V1Q A; 2H8H A; 1WA7 A; 1WLP B; 3PVQ A; 1WFW A; 3IQL A; 1S1N A; 2BTT A; 1U5S A; 2A37 A; 1H3H A; 4ZNX A; 2O88 A; 2ROL A; 1ARK A; 2LJ3 A; 1T0J A; 4Y92 A; 1ZBJ A; 3UA7 A; 1M30 A; 1UTI A; 2LJ1 A; 2EQI A; 4RTX A; 1M8M A; 2W0Z A; 2KRS A; 1K1Z A; 2LZ6 B; 2RQR A; 1YN8 A; 4JJB A; 2MIO A; 3UF4 A; 1Z9Z A; 4OMO A; 2EVR A; 3O5Z A; 2KGT A; 1I0C A; 1X27 A; 2ABL A; 4JJC A; 1ABQ A; 1T3S A; 1PWT A; 1CSK A; 2KNB B; 4LN2 A; 2YSQ A; 4J9D A; 2EW3 A; 2YUQ A; 2M51 A; 2EGE A; 4M4Z A; 2D1X A; 1Y57 A; 1HD3 A; 2K3B A; 1AD5 A; 4OMP A; 2EYZ A; 2F2V A; 1B3Q A; 4AG2 C; 3SHW A; 1WI7 A; 1VYV A; 1MV0 B; 2C0O A; 3VRZ A; 1OPK A; 1X43 A; 1FMK A; 3TSZ A; 3VS0 A; 2CDT A; 1AZE A; 5I11 A; 3M0R A; 2K6D A; 1AEY A; 3I9Q A; 2JTE A; 1K0X A; 2A36 A; 2AZS A; 1Z9Q A; 2BZY A; 1OOT A; 2JT4 A; 4Z88 A; 3EG0 A; 4CC4 B; 2DL8 A; 4LUE A; 3NPF A; 4E6R A; 1KFZ A; 1GCQ A; 3SEM A; 5IHK A; 3REA B; 2KRO A; 1GFC A; 2DE0 X; 1W1F A; 1AOJ A; 2KRM A; 4F17 A; 1RLP C; 2C0I A; 2D0N A; 1ZLM A; 1X6G A; 2G6F X; 2V1R A; 1TUC A; 2VKN A; 3VS5 A; 2P4R A; 5IXB A; 2FG0 A; 3FJ5 A; 1BU1 A; 1SHF A; 1YCS B; 1M3C A; 1UHF A; 2AZV A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5CKB A; 1AT1 B; 4M7A E; 1X2K A; 5DY9 A; 2QG9 B; 1JEG A; 4KGV B; 1G83 A; 3OYD A; 3CPW S; 2OJ2 A; 3CBO A; 3I55 T; 2RHI A; 1K9M R; 3HRT A; 2YLC A; 4J9G A; 3DB4 A; 1NJI C; 2GTO A; 1YIJ Q; 3OMG A; 3TCJ A; 4QKU A; 3GIB A; 4RTZ A; 1WJQ A; 4K11 A; 3P8H A; 3G71 A; 1UUE A; 4II1 A; 5GAN h; 5LJ5 d; 2YUO A; 2K79 A; 2ZPB B; 4OGE A; 5CKF A; 4M78 E; 1Q95 G; 2EJG A; 4BB7 A; 3CCU A; 2CT4 A; 2XU8 A; 3CCM T; 3QUI A; 2A3L A; 3VS2 A; 1UGV A; 3HPW A; 4L59 A; 1D0X A; 4AG1 C; 4RCB A; 4XTU A; 3L2Z A; 1TWB A; 2EYX A; 5CK9 A; 3OS1 A; 3MP8 A; 4BI4 A; 1N8R C; 4IUQ A; 1VQP A; 3CCS A; 2ROT A; 2XK0 A; 1SRM A; 2FPF A; 2JXB A; 1VIE A; 1QCF A; 2K57 A; 2XDD A; 1NM7 A; 1TSF A; 4KUD K; 2ENM A; 2F2W A; 1YJN T; 2M9U A; 1W2B P; 1O75 A; 4OMQ A; 1N5Z A; 2DRM A; 1Q86 U; 3JRZ A; 2LVM A; 2ZPH B; 5A0L A; 4X34 A; 1HYO A; 5CQY A; 1X2Q A; 4N4G A; 4C92 C; 1KHC A; 4N4I A; 1BI1 A; 1S72 A; 4KRT A; 1R77 A; 2CP2 A; 3A8L B; 2VB6 A; 2EKH A; 2EYQ A; 2VAS A; 4PJN A; 3M0S A; 3JCM h; 4KGZ B; 1W6X A; 2KK4 A; 1M27 C; 2O9V A; 3FEO A; 3JCM V; 4J83 A; 1G3Y A; 1I5O B; 3V7S A; 4LE9 A; 2RHX A; 4DBH A; 2FZG B; 3HRU A; 5IH2 A; 3M55 A; 2HL5 C; 2L3P A; 4C92 E; 2F1L A; 1VQ7 Q; 1UB4 A; 2PZ1 A; 4BD3 A; 2DJQ A; 4GY5 A; 2E41 A; 2KXC A; 1GBR A; 3EG1 A; 5C6S A; 3G71 T; 3BY7 A; 4FYV B; 2M16 A; 3BDU A; 2HMA A; 2LX7 A; 4F7U E; 3FRN A; 2FHD A; 2KY9 A; 1HJD A; 3ASK A; 4IIO A; 3CCU T; 2XHC A; 5GAN 4; 3A98 A; 3RKY A; 1WXT A; 1OPL A; 2X4J A; 1KQS A; 4MMK A; 2OTJ A; 4RUG A; 1IGU A; 4Z02 A; 2JOY A; 5CIU A; 2NUT B; 5GMK j; 1HSQ A; 3CCL A; 1EIF A; 1VQP T; 4OB0 B; 3CEY A; 3CCS T; 3DKM A; 4R56 A; 8ATC B; 4XQ3 A; 5GAM f; 2FPD A; 1KD1 C; 4M75 E; 4A53 A; 1OEB A; 4DBR A; 4TVR A; 3QKJ A; 5KYY A; 4QVZ A; 2FVU A; 2XMF A; 2KXD A; 4BAC A; 3E2U A; 2DBK A; 3H0F A; 5GAM e; 1ZSG A; 3CME Q; 2HSP A; 2O2O A; 1S72 T; 4EMK A; 4JRQ A; 1VQN A; 8AT1 B; 1H3Z A; 2RH2 A; 1MMN A; 2VC8 A; 3O8V A; 2KE9 A; 1KIK A; 1NPR A; 4ZGE B; 2K9G A; 1VQM Q; 3H41 A; 5FRM A; 3VS1 A; 3CBP A; 2RJD A; 2ZCF B; 2LQN A; 5FLX E; 4C0D C; 1V76 A; 2E6Z A; 3CC7 A; 4XTW A; 4HCB A; 4HKE A; 1ACM B; 1T0H A; 2RK2 A; 2QTX A; 1NG2 A; 4JRP A; 1UGR B; 3M0T A; 2DJZ A; 1B07 A; 3WXM B; 5LL6 S; 1QKX A; 5GAN 7; 2VGN A; 3L2Q A; 2D6F A; 2DET A; 1DJ7 B; 3I55 Q; 2XD0 A; 4IUR A; 4GLM A; 1FX7 A; 2DL4 A; 2E5K A; 4OB2 B; 1EX4 A; 2GQI A; 2OTJ T; 2BUD A; 1BB9 A; 3A5Z B; 3MET A; 3OYH A; 3CCL T; 4JZ4 A; 1QVF A; 2J7I A; 1Y71 A; 4B9X A; 1X75 C; 5IXF A; 1IHW A; 3M59 A; 4BE0 A; 2YLB A; 4Z8A A; 4ANJ A; 4M7A G; 3GBQ A; 4JPB W; 5AYF A; 3SD4 A; 1K73 C; 4QQ6 A; 1QW1 A; 3X20 B; 1X6B A; 2O31 A; 3HTR A; 2JM9 A; 2RQW A; 3PMT A; 3CPW A; 1TUD A; 3SDZ A; 2AKK A; 2DYB A; 1VQN T; 2F5K A; 3QYG B; 1JJ2 S; 4WCI A; 4PNO A; 1M1F A; 2V8J A; 4J7I A; 3QO3 A; 5FWB A; 1RUW A; 1BIA A; 2E1H A; 3OMC A; 2LQ8 A; 5DM7 R; 4FYW B; 3RBB B; 5CKH A; 1PC0 A; 1QVG P; 2J6O A; 4VUB A; 4FW2 A; 2DBM A; 1UEB A; 3JAM E; 3CC7 T; 1UDL A; 4J9E A; 2NLU A; 2M1H A; 2I0N A; 2RQV A; 5C0M A; 1ZA2 B; 1ZUU A; 3M56 A; 1K8A U; 2RQT A; 1KC8 R; 3OYB A; 4J6Y A; 3RKW A; 3NGP A; 2LNV A; 3HL8 A; 4J6X A; 3M53 A; 2FO0 A; 2RPN A; 2V1Q A; 2H8H A; 3JCM X; 2K4Y A; 1YFN A; 1SKU B; 3IQL A; 4C92 B; 1S1N A; 2KI7 A; 2JVV A; 5GMK i; 2BTT A; 2A37 A; 2EKO A; 5A2Q E; 1ARK A; 4KGX B; 1M30 A; 2WSF E; 2EQI A; 4JUV A; 2YXY A; 2KRS A; 1VQ5 Q; 2PQW A; 3CCU Q; 4JJB A; 2MIO A; 3RR6 A; 3LGF A; 5D7U A; 1QP2 A; 4M77 F; 3S3N A; 4Q5W A; 1D3B A; 1CSK A; 1WHG A; 4LN2 A; 5GAN j; 3OYJ A; 3V7C A; 4J9D A; 2DVE A; 5KYU A; 1OU8 A; 2EGE A; 4M4Z A; 5HY6 A; 2D1X A; 2QXF A; 2DXT A; 1HD3 A; 2EYZ A; 3M54 A; 3HSB A; 1WPY A; 2DYI A; 4C92 G; 3PT9 A; 1VQ7 A; 3SHW A; 4FSX A; 1KG1 A; 1XTD A; 5GMK h; 2PUK B; 5IT9 E; 3M0R A; 2JJ9 A; 2K6D A; 2JTE A; 3Q1J A; 1K0X A; 2H3E B; 1Z9Q A; 5GMK m; 1PD0 A; 1KD1 U; 1KQ1 A; 4C92 D; 4LUE A; 2XKO C; 1Q86 C; 1KFZ A; 1GCQ A; 1M9S A; 3SEM A; 3X25 B; 4PKC C; 1GFC A; 2DE0 X; 3QBY A; 1AOJ A; 1RLP C; 4M77 B; 3VS5 A; 2D0Q B; 3FJ5 A; 1IXD A; 2QI2 A; 1YCS B; 3L2V A; 1VQL Q; 3L42 A; 1WXB A; 2MPX C; 3TRE A; 4J9B A; 5LJ5 g; 5DLO A; 1I8F A; 3CME A; 2CUB A; 4E7J A; 5HKC A; 4C0D B; 4A4H A; 2OTJ Q; 5EG2 A; 1M2O A; 4DQ2 A; 1YBY A; 1SSH A; 1QWE A; 1YNZ A; 1VQM A; 3TU4 K; 4J9F A; 3CCL Q; 2DTH A; 3H6Z A; 3AT1 B; 4PFO A; 2YT6 A; 4FU6 A; 2YWW A; 4M77 G; 4FT2 A; 1QLY A; 1M5Q 1; 1VQ7 T; 1OYX A; 3EH2 A; 4X9C A; 1G2B A; 3EG2 A; 1MNE A; 1YP5 A; 4C0F A; 1VA7 A; 3MEV A; 3V8L A; 1GCP A; 4A4K A; 3BDL A; 1GRI A; 4O5V A; 3CXC A; 4JRK A; 2ZPG B; 1OZ3 A; 4M77 D; 2VGM A; 2JMA A; 4DA4 A; 4WF2 A; 1RAD B; 1K73 U; 4ZN3 A; 2J6F A; 1IRX A; 4PJO F; 4ME7 A; 5CKD A; 4MZM A; 3CC7 Q; 2CP7 A; 1OUL A; 3C95 A; 2L5Q A; 4V2S A; 1WJR A; 2MMP A; 5L8R E; 4RG8 A; 2FYK A; 5I2M A; 3NMZ C; 5LJ3 j; 2X3W D; 3DLL A; 3GPL A; 4C0Z A; 1K9A A; 3P8D A; 3EGD B; 4M7D F; 1WQ7 A; 4JDS A; 1VOM A; 3CME T; 2CS7 A; 3SWN B; 3OYC A; 1T3L A; 4A54 A; 4OMN A; 5FU6 C; 2X51 A; 4FSS A; 3QZ5 B; 3C12 A; 1OX8 A; 2L8D A; 2HBW A; 1AHJ B; 2DIL A; 4FT4 A; 1OV3 A; 2FRW A; 2P4T A; 1VQM T; 5A0G A; 1QVF S; 1Q81 R; 1I81 A; 1EFN A; 5GAO l; 1B34 A; 2ZGW A; 1Q7Y C; 4QW2 A; 3UA6 A; 3JSC A; 2F5T X; 4JJD A; 2A28 A; 1OI1 A; 1NEG A; 3EG9 B; 2VXE A; 2EQK A; 5GAN d; 2JN0 A; 2QK0 A; 2CUD A; 4PJO B; 1VYU A; 2ECZ A; 2E3H A; 3R6N A; 4BY6 B; 3ZEH A; 3CCV Q; 4IUP A; 5CKE A; 2ZAE A; 3QSU A; 2EYW A; 2ZPF B; 4EMK C; 4A4E A; 4D6W A; 3G4S Q; 2R57 A; 3MP1 A; 4M7D B; 1VIF A; 1D09 B; 1OU9 A; 1K76 A; 4JLI A; 1IO6 A; 3L2U A; 2DAQ A; 2KVQ G; 2DK3 A; 2EJ9 A; 4OMM A; 4E47 A; 2KT1 A; 4NL2 A; 1KJW A; 2K2M A; 3V8J A; 3LWH A; 1VQ5 A; 1FWZ A; 1ZUK A; 2QEX Q; 4XU3 A; 4EDU A; 1ZSZ B; 2CT3 A; 2PVO B; 3JB9 F; 4ZGD B; 2C06 A; 2DL7 A; 1MND A; 5GAN 3; 5KYX A; 1M3A A; 2IG0 A; 2KYB A; 3JCM d; 3GNF B; 1K8A C; 6AT1 B; 1PKS A; 1CKA A; 2KT8 A; 2X3X D; 3A8G B; 2JMC A; 1GFD A; 4PJO D; 1OZ2 A; 5KCO A; 3A8M B; 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