The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
LFVALYDYQADRWTDLSFHKGEKFQILDASPPGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Generation, Characterization and Structural Data of Chymase Binding Proteins Based on the Human Fyn Kinase SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CHYMASE
|
| molecule tags |
Hydrolase/de novo protein
|
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
11
|
| structure length |
61
|
| sequence length |
61
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3C0C A; 5GJV B; 3VS7 A; 2F2V A; 5IXB A; 1ZUK A; 1AWJ A; 1SHG A; 1PKT A; 1CKB A; 2C0I A; 1XOV A; 1UJ0 A; 2BZ8 A; 2DRM A; 2JM8 A; 3PVQ A; 2FRY A; 1KSW A; 3CQT A; 1VYV A; 2SRC A; 2KYB A; 1G83 A; 1PRL C; 2F2W A; 2DM1 A; 1K4U S; 3H0F A; 3H41 A; 1ABQ A; 1W70 A; 2W10 A; 1K9A A; 2FPE A; 3EG3 A; 4CC4 B; 1WDX A; 3IQL A; 1M3A A; 1BBZ A; 1GCP A; 4R0K A; 4OMQ A; 1GBQ A; 3REA B; 3O5Z A; 2J6F A; 1HJD A; 1FMK A; 4RTT A; 2K7A A; 3UF4 A; 4M4Z A; 5I11 A; 3RNJ A; 1YWO A; 2LNH B; 2O9S A; 2DBM A; 2VKN A; 3NMZ C; 1Y57 A; 2JW4 A; 4JJD A; 1UHF A; 2KXD A; 2ED1 A; 2O88 A; 1K0X A; 2V1Q A; 4RTW A; 1UUE A; 2LX7 A; 2LMJ A; 2EGA A; 2EGE A; 4D8K A; 4CC7 A; 4DEX A; 2EKH A; 4A63 B; 1OPL A; 2GNC A; 2CT3 A; 1WIE A; 4AG2 C; 1Z9Q A; 5IHK A; 1X43 A; 3VS4 A; 2PNI A; 2YDL A; 2FPD A; 2KGT A; 1SHF A; 2YUO A; 1OEB A; 2GTJ A; 2E5K A; 4E6R A; 2KRS A; 2BZY A; 1ZX6 A; 4LE9 A; 1NEB A; 3VS5 A; 1YWP A; 3KFV A; 1HSQ A; 3EHR A; 1NLP C; 2AKK A; 4GBQ A; 5IHN A; 3TSW A; 4LNP A; 4OMO A; 1K1Z A; 1U06 A; 2AKL A; 2SEM A; 1YP5 A; 4F14 A; 2DYB A; 3EG0 A; 1SRM A; 1WYX A; 1H8K A; 3M0Q A; 2KRO A; 2L2P A; 1WX6 A; 1T0H A; 1TUC A; 1AZE A; 2GGR A; 1RUW A; 2GQI A; 2GTO A; 3UA6 A; 1RLP C; 3QWY A; 2DMO A; 3VS1 A; 2BZX A; 1T3S A; 1GL5 A; 1RLQ C; 2FEI A; 2LQW A; 2L3S A; 2JTE A; 2J7I A; 1JEG A; 4K11 A; 2DX1 A; 3I5S A; 1X2Q A; 1IO6 A; 2RQR A; 1X27 A; 4LUE A; 3VRZ A; 4HCK A; 1NG2 A; 4FSS A; 1H92 A; 2EVR A; 3R6N A; 1ZLM A; 1NYF A; 4OML A; 1GFC A; 4GLM A; 1BK2 A; 3LH5 A; 1NYG A; 2CSI A; 3EGU A; 2EBP A; 2DIL A; 1PWT A; 1GFD A; 2NUZ A; 2DL3 A; 1KFZ A; 1ARK A; 4DEY A; 1KIK A; 2KRM A; 2MOX A; 3PE0 A; 3QWX X; 2C0O A; 2YUP A; 3ZL7 C; 2J6K A; 2A08 A; 5IHI A; 4J9E A; 2DLP A; 1RI9 A; 2HSP A; 2EYY A; 2QDL A; 1UEC A; 2KT1 A; 2LJ3 A; 1A0N B; 2YUQ A; 1I07 A; 2D8J A; 2RN8 A; 2O31 A; 2DL5 A; 1PKS A; 2A37 A; 1BU1 A; 3UA7 A; 2DNU A; 2O2O A; 4AG1 C; 2MIO A; 3THK A; 1HD3 A; 2XMF A; 1CKA A; 2ROT A; 1UFF A; 4AFS C; 2ESW A; 2X3X D; 1U5S A; 1X69 A; 2H8H A; 2KR3 A; 1V1C A; 1YNZ A; 2JMA A; 2DJQ A; 2KNB B; 3NPF A; 1ABO A; 2ABL A; 1X6B A; 2RQW A; 1JXO A; 1BB9 A; 1T3L A; 4RTU A; 2JM9 A; 4AFU C; 1GCQ A; 2BTT A; 1QLY A; 2CSQ A; 2RQU A; 1X6G A; 2LJ0 A; 2PTK A; 1QWF A; 4JJB A; 2CRE A; 4RTY A; 2FG0 A; 4IIO A; 1B3Q A; 2ENM A; 1OV3 A; 1W1F A; 2K2M A; 1H3H A; 2DRK A; 4LUD A; 3VS6 A; 2L0A A; 2CH4 A; 2KE9 A; 3H0I A; 1VYU A; 1QKX A; 2CDT A; 2KXC A; 2EGC A; 2DA9 A; 2EYW A; 1EFN A; 2K9G A; 3VS0 A; 4ESR A; 4JPB W; 5HCK A; 3REB B; 2YSQ A; 2FRW A; 4OMN A; 2W0Z A; 2AK5 A; 2B86 A; 2EPD A; 2FO0 A; 2KEA A; 4JJC A; 3M0U A; 3TSZ A; 3GBQ A; 3U23 A; 4X1V A; 1GCQ C; 3NHN A; 1E6G A; 2K6D A; 4J9F A; 2YUN A; 2D0N A; 1UTI A; 1WXU A; 2OJ2 A; 2CT4 A; 2IIM A; 4RTX A; 1UJY A; 1UE9 A; 4ZNX A; 1TG0 A; 4J9B A; 1ZBJ A; 2EYX A; 4Z89 A; 2LJ1 A; 1JXM A; 2OI3 A; 1T0J A; 2VWF A; 4J9H A; 1W6X A; 2JS0 A; 1QCF A; 1K0S A; 1AWX A; 2G6F X; 1N5Z A; 2RF0 A; 2DF6 A; 4RTZ A; 2K3B A; 3TVT A; 1MUZ A; 1S1N A; 4Y92 A; 1M3B A; 1G2B A; 2RQV A; 4OMP A; 1B07 A; 3I35 A; 5GJW B; 2ECZ A; 2LP5 A; 2EYZ A; 1J3T A; 1KJW A; 2L3Q A; 1UG1 A; 1M3C A; 4J9C A; 4J9I A; 1U3O A; 2VVK A; 2RQT A; 4Z88 A; 1AVZ C; 5ECA A; 3SEM A; 1NM7 A; 4AFZ C; 2NWM A; 2ED0 A; 2FPF A; 1MV3 A; 5IXF A; 4WCI A; 4LN2 A; 3M0S A; 2EW3 A; 2C0T A; 4HVU A; 3VRY A; 5I22 A; 1I1J A; 1M8M A; 2KRN A; 3EHQ A; 1LCK A; 2CUB A; 2J05 A; 1WI7 A; 2A28 A; 1SEM A; 4J9D A; 2OAW A; 4IIM A; 4J9G A; 2JXB A; 1PHT A; 1JU5 C; 2CUD A; 4AFQ C; 1VYT A; 2RNA A; 2D8H A; 2LZ6 B; 4JZ3 A; 1PRM C; 2DL8 A; 2RMO A; 5L23 A; 2P4R A; 4F17 A; 1JQQ A; 2V1R A; 1WXT A; 3FJ5 A; 2AZV A; 1TUD A; 1GRI A; 3JV3 A; 1GBR A; 2DBK A; 1OOT A; 3SHW A; 1UGV A; 1YCS B; 1I0C A; 1NLO C; 4Z8A A; 2RPN A; 4OMM A; 1WFW A; 1NEG A; 3A98 A; 1AOJ A; 2JMC A; 2J6O A; 1WLP B; 2MCN A; 5FW9 A; 5FWC A; 2HEQ A; 1UDL A; 4KRT A; 1UHC A; 2O9V A; 1Y0M A; 2YT6 A; 1Z9Z A; 4RUG A; 5FWB A; 1ZUY A; 1QWE A; 2ROL A; 3M0P A; 1SPK A; 1CSK A; 1WA7 A; 1QKW A; 1ZUU A; 2F2X A; 2D1X A; 1VA7 A; 1AZG B; 4ORZ A; 2CH4 W; 1JO8 A; 2DVJ A; 1K76 A; 2J06 A; 3PVL A; 2A36 A; 1YN8 A; 2M51 A; 1AEY A; 1M30 A; 2L3P A; 3H0H A; 3UAT A; 2I0N A; 1SSH A; 4CC2 A; 1ZSG A; 1AWO A; 1X2K A; 2KBT A; 4F16 A; 2HDA A; 3EG2 A; 1OPK A; 1SRL A; 2JS2 A; 2LCS A; 1PNJ A; 4JZ4 A; 5IH2 A; 2DL7 A; 3EG1 A; 5EC7 A; 3ULR B; 2HBW A; 3VS2 A; 2PZ1 A; 1FYN A; 4QT7 A; 4RTV A; 4HVV A; 4CC3 A; 3I5R A; 1E6H A; 4HXJ A; 1AD5 A; 1E7O A; 2LQN A; 3I9Q A; 3RBB B; 4EIK A; 2DL4 A; 2M0Y A; 1WXB A; 3VS3 A; 1AWW A; 4HVW A; 4D8D A; 3NGP A; 2GBQ A; 1M27 C; 2KT8 A; 2K79 A; 2EQI A; 3M0R A; 1MV0 B; 2DE0 X; 2HCK A; 2JT4 A; 3M0T A; 2KYM A; 2AZS A; 2X3W D; #chains in the Genus database with same CATH topology 4M75 F; 2QQA A; 3C0C A; 3VS7 A; 2GF7 A; 1D3B B; 1FMW A; 3OYI A; 2LC4 A; 4HT8 A; 1PKT A; 5KYU A; 1Y07 A; 3JCM X; 5GAM g; 2JUF A; 2FRY A; 4WTO B; 2HBP A; 3CQT A; 1VYV A; 2SRC A; 4DBR A; 3CCJ T; 2DM1 A; 1N6A A; 6AT1 B; 3JCM c; 2PVD B; 3H0F A; 1M90 U; 5GAN 7; 3TU4 K; 3M4Y A; 1Q86 U; 4E7K A; 2FPE A; 1YIJ A; 1VUB A; 3EG3 A; 3JCM b; 1M8V A; 2DIG A; 1WDX A; 5C0M A; 3R6O A; 4RKU E; 4Q5W A; 4PJO E; 5CKF A; 1M3A A; 3FRN A; 4R0K A; 4OMQ A; 1GBQ A; 4JS4 A; 2B8A A; 3OMC A; 3X28 B; 3O5Z A; 3CCU Q; 1HJD A; 1VQ5 T; 1FMK A; 5A2Q E; 4RTT A; 2K7A A; 3JB9 G; 2CZ7 B; 1LJO A; 2COZ A; 1SF9 A; 1YWO A; 4PNO A; 4C8Q A; 2O9S A; 3OYD A; 2VKN A; 2OTJ Q; 2QGF B; 3VYG A; 5J26 A; 1UHF A; 3OS0 A; 2KXD A; 3FDR A; 1Y96 B; 3JCM J; 4BY6 C; 2V1Q A; 3MP1 A; 1N8R C; 4E7Z A; 4M78 B; 3URG A; 4DEX A; 1K9M C; 3CCQ Q; 2QA4 A; 2DJZ A; 1YJW A; 1OPL A; 1Q7Y U; 2RHY A; 2G3R A; 1YIJ Q; 1G3T A; 2YUO A; 1OEB A; 2E5K A; 1OI1 A; 4XQ3 A; 3KFV A; 3A8L B; 5IT9 E; 1NLP C; 3G7Z A; 2XDP A; 5CCA A; 4FU6 A; 4C8Q F; 3TSW A; 4FL6 A; 4OMO A; 1MND A; 3JAM E; 3RER A; 1VQO A; 1WYX A; 1H8K A; 5AT1 B; 3EGD B; 2Z0W A; 3DB4 A; 1RUW A; 2H3J A; 2RB6 A; 2GTO A; 5L8R E; 2BZX A; 1QQJ A; 4C92 B; 1N9R A; 4M75 C; 1IB8 A; 1G5V A; 4FW2 A; 1TS9 A; 4C5H A; 2FVU A; 4NS5 A; 1X2Q A; 2BE9 B; 1YJW Q; 1K73 C; 1WJR A; 2RQR A; 1YJ9 A; 3QYG B; 3LW5 E; 2JTF A; 1MMG A; 2CP3 A; 1H92 A; 4AMC A; 3OS5 A; 1YBY A; 3JCM e; 1GFC A; 4GLM A; 1BK2 A; 3N5B B; 1B34 B; 3A8O B; 1YFN A; 3CD6 T; 1MNE A; 5KCH A; 5FRM A; 1PWT A; 2DTI A; 4N4I A; 1JRI A; 1VQK A; 1KFZ A; 1ARK A; 1GXI E; 4FT2 A; 3PE0 A; 5KYW A; 1VQO Q; 2RI3 A; 3CME T; 3T9N A; 1KHI A; 2X9H A; 3S3N A; 2EYY A; 1KC8 C; 1KK7 A; 2K3Y A; 2KT1 A; 2LJ3 A; 3I55 T; 1NZ9 A; 2O31 A; 5A0L A; 1KG1 A; 2RH2 A; 4M7D B; 3THK A; 1C0M A; 2RJD A; 4HA8 A; 2JNG A; 3QO3 A; 1YJ9 Q; 1X69 A; 1V1C A; 4HCC A; 1YNZ A; 3HP9 A; 5HY6 A; 2KNB B; 3NPF A; 1VIF A; 1ABO A; 2OAU A; 4IUQ A; 5CAI A; 1C6V X; 2PTK A; 5FLX E; 1BKB A; 1VQK Q; 3NTK A; 1VQP A; 4J5Y A; 1VQ4 A; 2DRK A; 4LUD A; 4DA4 A; 2L0A A; 3OS2 A; 1QKX A; 5FU6 C; 5GAM h; 7AT1 B; 2NUP A; 3VS0 A; 4E7J A; 3PMT A; 4ESR A; 3OYM A; 2EJG A; 3TRE A; 4OMN A; 3SWN C; 3ZFJ A; 4EMK B; 4MML A; 3X20 B; 2KEA A; 3A8M B; 4E7L A; 4XTY A; 3GBQ A; 4X1V A; 1QCN A; 2DTO A; 3LGF A; 2QTV A; 5D6W A; 2K3X A; 1Q81 U; 2OJ2 A; 2IIM A; 3OW2 S; 3OYJ A; 1QVG A; 1TG0 A; 3SD4 A; 3SB2 A; 4E7S A; 2WSF E; 4F7U A; 3OYY A; 4FYY B; 1M2V A; 2VWF A; 3V8K A; 2E4H A; 1UGS B; 4ZTJ A; 1D0Y A; 3JB9 F; 4J8O A; 1AWX A; 5CQX A; 4IUT A; 4RTZ A; 3TVT A; 1H3Z A; 3CCM Q; 1S1N A; 4Y92 A; 4BB7 A; 2RQV A; 4JUV A; 1D0X A; 3QXE B; 3CBO A; 2CZ6 B; 3OW2 A; 1X01 A; 2ECZ A; 2QA4 T; 2LP5 A; 3VV0 A; 3INZ A; 1KJW A; 4M7D C; 3P8D A; 1UG1 A; 3I56 T; 1BI0 A; 1R8O B; 1AVZ C; 2XHC A; 1RAG B; 5FRN A; 1S72 A; 4AFZ C; 2FPF A; 4EPC A; 1KQ1 A; 4WCI A; 2EW3 A; 3CBP A; 1M90 C; 1K8A U; 1Q86 C; 1I1J A; 3LWI A; 3FC3 A; 3OS1 A; 3OB9 A; 2EIF A; 5GAM j; 1WI7 A; 5GMK l; 3HFN A; 4J9D A; 4N0A A; 4PKC C; 4PK4 A; 4QVD A; 2L3R A; 1ZA1 B; 4OB3 B; 2CUD A; 2KMT A; 3JCM V; 3CC2 T; 1MMN A; 2QQS A; 2F69 A; 4M75 D; 5FRO A; 2DL8 A; 2XDD A; 4X34 A; 1TWB A; 4DBQ A; 1F1B B; 1ZSZ B; 1WHK A; 3CPF A; 2R57 A; 3QII A; 2QDY B; 3CCR A; 3CPW A; 2AHJ B; 1GRI A; 4A54 A; 1UGV A; 1I0C A; 2L5Q A; 3HRS A; 3J7A F; 1WFW A; 3TCJ A; 3MJX A; 3A98 A; 5LJ5 d; 2E65 A; 2JMC A; 2RHX A; 2X4W A; 3WVE B; 1VQM A; 4CI0 C; 5FWC A; 1OZ3 A; 1OUL A; 1Q7Y C; 1G3Y A; 4KRT A; 1FWZ A; 1Y0M A; 2YT6 A; 1Z9Z A; 3JCM W; 1UEB A; 1QWE A; 2D9T A; 4HCZ A; 1SPK A; 4FYX B; 1WA7 A; 1YIT A; 1QKW A; 2F2X A; 1VA7 A; 2DZC A; 3CXC S; 3E9G A; 4TVR A; 2HNI A; 1K76 A; 2M51 A; 1AEY A; 1I5O B; 4KT0 E; 2EKO A; 4BI4 A; 4E7I A; 5A0G A; 2HDA A; 2XI9 A; 3MEU A; 2IVW A; 2JS2 A; 4KH1 B; 2EJ9 A; 3CC7 T; 4JZ4 A; 4XU0 A; 3EG1 A; 3HPW A; 4HVV A; 3PFS A; 3I5R A; 2YHT A; 2VGM A; 1E7O A; 2DAQ A; 2HZY A; 2LT4 A; 3RBB B; 1MHN A; 1VQM Q; 1N8R R; 3VYH B; 3NGP A; 1M27 C; 2K79 A; 2EQI A; 2DE0 X; 2HCK A; 2JT4 A; 1K9M R; 4PJN A; 4ZGD B; 1PHT A; 3D7S B; 3A8H B; 1EIF A; 1IRE B; 2O4X A; 5CK9 A; 5GJV B; 2QG9 B; 2F2V A; 1YIT Q; 4RG2 A; 1VQP T; 3RDV A; 1ZUK A; 1AWJ A; 2E3H A; 4ME7 A; 3EFO A; 2C0I A; 3OSS C; 5KYY B; 1NE8 A; 3G6E T; 1UJ0 A; 4C92 G; 2BZ8 A; 4V2S A; 3OYK A; 2DRM A; 3E19 A; 4OGC A; 1QW1 A; 2EQK A; 4ELY C; 4PJL A; 1PM3 A; 4BUG A; 1M1G A; 2KYB A; 1G83 A; 1RI0 A; 4XK8 E; 3QZ5 B; 4GY5 A; 2VXE A; 1ABQ A; 2W10 A; 1PSE A; 3DLM A; 3SDZ A; 3EAE A; 3IQL A; 4C5I A; 2E5Q A; 1BBZ A; 3A5Z B; 4II1 A; 3REA B; 4PJO C; 2YXY A; 2ZPI B; 4OF1 A; 4BAC A; 2LDM A; 1VQ5 Q; 2HQE A; 1PC0 A; 1V76 A; 4OB2 B; 3L2R A; 3M56 A; 1Y57 A; 1HXD A; 2JW4 A; 4JJD A; 4XTZ A; 2CP2 A; 2R5M A; 1UUE A; 2DER A; 3X25 B; 2MMP A; 2QEX A; 4M7D G; 1RAI B; 3QG1 A; 4M77 B; 4BDZ A; 3VJP A; 2EKH A; 4QW2 A; 3JSC A; 1NJI U; 1YHQ Q; 4MMK A; 2CT3 A; 1WIE A; 1WQW A; 5IHK A; 4M75 A; 1IXD A; 2M1H A; 1SHF A; 2DD4 A; 4E6R A; 2KRS A; 2BZY A; 1ZX6 A; 4LE9 A; 1KC8 R; 4BI8 B; 4A4G A; 4DQ2 A; 2RD1 A; 3EHR A; 5KH6 A; 2DEU A; 1VQ8 T; 2XID A; 3CCV A; 2MK5 A; 3CCE Q; 1VQL T; 2AKL A; 2SEM A; 4JLI A; 1YP5 A; 2DXU A; 3OYA A; 3GNF B; 3EG0 A; 1Q81 C; 3JCM P; 1N27 A; 2RO0 A; 1MGQ A; 3OYL A; 2KRO A; 2L2P A; 3M53 A; 3VUZ A; 3LGL A; 3O8V A; 2CZ1 B; 2PVO B; 2BUD A; 3ER0 A; 1M1K U; 1AT1 B; 2GQI A; 1WQ7 A; 3UA6 A; 1RLP C; 3QWY A; 2RK2 A; 2QEX Q; 1SKU B; 1T3S A; 1Y96 A; 2K5L A; 1GL5 A; 2BE7 D; 2FEI A; 2LQW A; 2JN0 A; 1BCO A; 2H3E B; 1W4S A; 4K11 A; 2NUT B; 2OTJ A; 1IO6 A; 1WJS A; 1Y7X A; 4M7A B; 3VRZ A; 4HCK A; 3CMA Q; 3WXM B; 3G4S Q; 1NG2 A; 4BI3 A; 2PUO B; 2RJC A; 3R6N A; 4JLG A; 4UC4 A; 3LH5 A; 2YWW A; 2EBP A; 1GFD A; 3CCV Q; 3CCQ A; 1KIK A; 1K8A C; 3LYI A; 3QWX X; 2C0O A; 3ZEH A; 2KVQ G; 3JCM g; 2J6K A; 4F7U E; 3CXC P; 3CME Q; 1ZBX A; 1WHG A; 2HSP A; 4KUL A; 1PD0 A; 4N4G A; 2QGG A; 2YUQ A; 4IUP A; 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