The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
LFVALYDYQADRWTDLSFHKGEKFQILDASPPGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Generation, Characterization and Structural Data of Chymase Binding Proteins Based on the Human Fyn Kinase SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CHYMASE
|
| molecule tags |
Hydrolase/de novo protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
11
|
| structure length |
61
|
| sequence length |
61
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UFF A; 2RQW A; 1JQQ A; 2ED1 A; 1G2B A; 2DMO A; 1SRL A; 2K79 A; 2ABL A; 2CUB A; 1OV3 A; 2KXD A; 1EFN A; 1WXT A; 1ABO A; 3O5Z A; 1U3O A; 4HXJ A; 1VA7 A; 1X2Q A; 5GJW B; 3EG1 A; 1YWO A; 1T0J A; 1TUC A; 1WXB A; 2KYB A; 4CC7 A; 4AFQ C; 3REA B; 2DE0 X; 4RUG A; 2KRN A; 2LNH B; 2EYW A; 2L3S A; 1GRI A; 2JM9 A; 2FPE A; 2RQT A; 3ULR B; 1VYU A; 3A98 A; 5ECA A; 2CDT A; 4J9I A; 2KE9 A; 1NEG A; 1UJ0 A; 1X69 A; 2DL4 A; 4KRT A; 1M3A A; 3SHW A; 2VWF A; 1NG2 A; 1GFC A; 1S1N A; 2LJ1 A; 2PZ1 A; 2YSQ A; 2BZY A; 1WI7 A; 1JU5 C; 2K6D A; 1PHT A; 4J9G A; 2J05 A; 2BZ8 A; 1WXU A; 2C0O A; 2RMO A; 4HVV A; 4Y92 A; 1H3H A; 2L3Q A; 3UA6 A; 2GGR A; 2ESW A; 2L2P A; 4Z8A A; 2OAW A; 2CT3 A; 1NLO C; 2ENM A; 4M4Z A; 2C0I A; 1JXM A; 3CQT A; 3M0Q A; 2XMF A; 2EYY A; 4EIK A; 1W70 A; 2SRC A; 1T3L A; 2F2V A; 2DRK A; 2O9S A; 1CSK A; 3I5S A; 1QKW A; 1I07 A; 4Z89 A; 1GFD A; 2O9V A; 1MUZ A; 3GBQ A; 4RTX A; 1ZSG A; 1PRM C; 2NUZ A; 2J6O A; 4OMN A; 2KR3 A; 2EKH A; 1UEC A; 4AG1 C; 1QCF A; 1KJW A; 1W6X A; 3NGP A; 1FYN A; 1AWX A; 1UUE A; 2O31 A; 5FW9 A; 1KFZ A; 1M8M A; 2GBQ A; 2J06 A; 3EHR A; 1WYX A; 2DVJ A; 2ROT A; 2KEA A; 4AFU C; 2KXC A; 4DEY A; 4JZ3 A; 2LJ0 A; 4GLM A; 2ROL A; 1QLY A; 3RBB B; 1UHC A; 1AWJ A; 3NPF A; 2CUD A; 1RLQ C; 4HVU A; 1K0X A; 1E6H A; 2JM8 A; 1PWT A; 2DA9 A; 3FJ5 A; 1FMK A; 4QT7 A; 4RTW A; 2LX7 A; 1ZX6 A; 2RN8 A; 2M51 A; 2O2O A; 2VVK A; 1ABQ A; 1MV3 A; 3VRY A; 2EQI A; 2RQU A; 1UTI A; 1AZG B; 1SSH A; 4J9C A; 2A08 A; 1JO8 A; 1G83 A; 1UG1 A; 2CH4 A; 1WIE A; 1OEB A; 1IO6 A; 2DL7 A; 2GQI A; 1B3Q A; 2HSP A; 2LQN A; 5FWB A; 1HJD A; 2KT1 A; 2EW3 A; 4X1V A; 1CKA A; 2AKK A; 1CKB A; 4JJB A; 1WDX A; 1H8K A; 4GBQ A; 4J9H A; 2MOX A; 4OMM A; 1GL5 A; 3TSW A; 1YWP A; 2SEM A; 3RNJ A; 4FSS A; 2LJ3 A; 1UHF A; 2BZX A; 3NMZ C; 3VS5 A; 1QWE A; 1M3B A; 2X3X D; 2LZ6 B; 3REB B; 2KT8 A; 1T0H A; 2YUQ A; 3LH5 A; 1X43 A; 1I1J A; 3EG2 A; 1WA7 A; 1WX6 A; 2EBP A; 1K4U S; 4LUD A; 4ZNX A; 4F16 A; 2FRW A; 2J7I A; 2RNA A; 4RTV A; 2CT4 A; 3UAT A; 4E6R A; 3VS3 A; 1K1Z A; 1UJY A; 1Z9Z A; 2DLP A; 2W10 A; 1RLP C; 1SPK A; 4JJD A; 2RQR A; 3I35 A; 1SHF A; 2JTE A; 1AOJ A; 3THK A; 4RTU A; 2RPN A; 1U06 A; 4J9D A; 4LE9 A; 3VS1 A; 2V1Q A; 3JV3 A; 1GCQ A; 1GCQ C; 2EPD A; 4R0K A; 2K3B A; 2YT6 A; 1AWO A; 1J3T A; 2D1X A; 3M0T A; 1RI9 A; 1M27 C; 1ZUK A; 1UDL A; 4DEX A; 3VS0 A; 1ZUU A; 2MIO A; 4RTY A; 5IHI A; 2EVR A; 1M3C A; 2DBM A; 1YCS B; 1K76 A; 2G6F X; 1OPL A; 4JJC A; 2CSI A; 3M0P A; 3UF4 A; 1H92 A; 4D8K A; 1VYV A; 1NEB A; 1SRM A; 2YUN A; 2LMJ A; 4RTT A; 2RQV A; 2HEQ A; 4F17 A; 4CC3 A; 1PKS A; 1PKT A; 2K9G A; 2DJQ A; 2C0T A; 2F2X A; 2PTK A; 3QWY A; 1SHG A; 4IIO A; 4WCI A; 2HBW A; 1AZE A; 1T3S A; 3H41 A; 2KRO A; 4OMQ A; 3PE0 A; 4AG2 C; 1B07 A; 1HD3 A; 2FO0 A; 2H8H A; 2JW4 A; 2JXB A; 1OOT A; 3I9Q A; 3IQL A; 1AEY A; 2ECZ A; 3ZL7 C; 2HDA A; 5IHN A; 3SEM A; 2MCN A; 2V1R A; 3EG3 A; 1RUW A; 2F2W A; 2JS2 A; 1NLP C; 2A37 A; 5IXF A; 3QWX X; 2JMA A; 5I22 A; 1Y0M A; 1YP5 A; 1QWF A; 2HCK A; 1KSW A; 1AVZ C; 2AKL A; 1Z9Q A; 2A36 A; 3EHQ A; 2DM1 A; 1ZLM A; 1W1F A; 3NHN A; 3VS7 A; 3UA7 A; 1NYF A; 2D8J A; 2EGA A; 3VRZ A; 2AK5 A; 2QDL A; 2W0Z A; 1VYT A; 1M30 A; 2LP5 A; 2ED0 A; 4Z88 A; 3TSZ A; 2JMC A; 2D8H A; 2FPF A; 2KRM A; 5IHK A; 1V1C A; 1AWW A; 4AFS C; 3H0F A; 1XOV A; 2PNI A; 2K7A A; 4J9E A; 1NYG A; 2EGC A; 1PNJ A; 4A63 B; 3VS4 A; 2DRM A; 3M0S A; 2JT4 A; 2CRE A; 2DL5 A; 3R6N A; 1BU1 A; 2GTJ A; 2L3P A; 5IH2 A; 2AZS A; 1E7O A; 3I5R A; 2BTT A; 3H0I A; 2K2M A; 4ORZ A; 2D0N A; 4HVW A; 3M0U A; 1YN8 A; 2EYX A; 1QKX A; 4J9F A; 3PVL A; 1K0S A; 4LUE A; 2KGT A; 1NM7 A; 5GJV B; 1GBR A; 2EYZ A; 3EGU A; 1K9A A; 1UE9 A; 1JXO A; 2GTO A; 2GNC A; 2O88 A; 5L23 A; 1GCP A; 4OMP A; 2EGE A; 2YUO A; 4OML A; 2J6F A; 2FEI A; 3EG0 A; 2NWM A; 1ZBJ A; 2M0Y A; 4JZ4 A; 1WLP B; 1TG0 A; 2FG0 A; 2KRS A; 1ARK A; 1X27 A; 1X6G A; 4CC2 A; 3M0R A; 4J9B A; 2DIL A; 5EC7 A; 2DF6 A; 3TVT A; 1WFW A; 2DX1 A; 2IIM A; 2OJ2 A; 1ZUY A; 4AFZ C; 2LQW A; 4RTZ A; 3KFV A; 3VS2 A; 2X3W D; 2FRY A; 3H0H A; 1BK2 A; 2KYM A; 3PVQ A; 1BBZ A; 4ESR A; 2VKN A; 1AD5 A; 1JEG A; 5IXB A; 4F14 A; 4CC4 B; 2KNB B; 2E5K A; 2A28 A; 1OPK A; 2DNU A; 4LN2 A; 2I0N A; 1X6B A; 3U23 A; 4K11 A; 2AZV A; 2YDL A; 1YNZ A; 2CSQ A; 1X2K A; 2YUP A; 1E6G A; 1N5Z A; 4D8D A; 5HCK A; 2OI3 A; 4JPB W; 4HCK A; 3VS6 A; 2L0A A; 1Y57 A; 3C0C A; 5I11 A; 1BB9 A; 1TUD A; 2B86 A; 2DYB A; 4IIM A; 2P4R A; 2RF0 A; 2FPD A; 1A0N B; 2CH4 W; 5FWC A; 1GBQ A; 1KIK A; 1SEM A; 1LCK A; 4LNP A; 1HSQ A; 1PRL C; 2LCS A; 1MV0 B; 2J6K A; 2DL3 A; 2JS0 A; 4OMO A; 2DL8 A; 1U5S A; 2DBK A; 1I0C A; 1UGV A; 2KBT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2VAS A; 5CK9 A; 4J8O A; 2RQW A; 4HA8 A; 2X35 A; 5GAN e; 1N6A A; 1G2B A; 2DMO A; 3BFM A; 3G71 Q; 3WVD B; 3C94 A; 2ABL A; 3BDL A; 3CC7 T; 2IVW A; 1WXT A; 5J3B A; 3ZBD A; 5GAN g; 5GJW B; 2DPP B; 2L5Q A; 1K8A R; 3QYG B; 5CAI A; 1WGS A; 5CIU A; 3PIO A; 5KYY B; 1IB8 A; 3QG1 A; 4AFQ C; 2ZPE B; 1YJN T; 3CC2 Q; 4RUG A; 5LJ5 j; 2KRN A; 4C8Q F; 4PK4 A; 2K5F A; 4J6Y A; 3QO3 A; 2FPE A; 3CD6 Q; 1WJQ A; 3ULR B; 3OYD A; 1VYU A; 3I56 A; 5ECA A; 3JAM E; 2VB6 A; 4J9I A; 1NEG A; 2BIV A; 4C8Q E; 3G71 A; 4KRT A; 2E1H A; 4IUQ A; 1K8A C; 4N4G A; 4JS5 A; 2ATC B; 1WHH A; 2BZY A; 1JU5 C; 1BIB A; 3NFC A; 2QA4 T; 5D6W A; 2FZG B; 2J05 A; 4WF2 A; 2D6F A; 1WXU A; 1YI2 A; 2C0O A; 1I81 A; 4M77 C; 4HVV A; 2RHZ A; 4X9C A; 1TSF A; 4M4Z A; 1JXM A; 3CQT A; 3ME9 A; 2EYY A; 3HPW A; 1YIJ T; 1VQO Q; 1CSK A; 1VIE A; 1QKW A; 1V29 B; 3LX7 A; 1WHM A; 3ZFJ A; 1OI1 A; 4JRP A; 4EDU A; 4RTX A; 2HZY A; 1PRM C; 1RAC B; 1UGQ B; 2RJD A; 2KR3 A; 3A8O B; 1XQH A; 1QCF A; 2BE9 B; 1W6X A; 1VQN Q; 1OZ2 A; 2OTJ A; 1FYN A; 1UUE A; 2DJZ A; 2OTL T; 3PT9 A; 2J06 A; 4KH0 B; 1WYX A; 2ROT A; 2CS7 A; 2KXC A; 4DEY A; 1VQO A; 4XAX B; 2LJ0 A; 3QJ6 A; 1QLY A; 3Q1J A; 3OBY A; 1AWJ A; 2NYS A; 1QQJ A; 4JJN K; 1K0X A; 5FU7 C; 1E6H A; 2JM8 A; 2DYI A; 4JRK A; 4NL2 A; 4C8Q B; 1JRI A; 4QT7 A; 2QQ9 A; 5FU6 B; 3M9Q A; 4LXC A; 3DKM A; 4Y28 E; 2RN8 A; 2M51 A; 4C8Q D; 4EMG A; 3I55 Q; 2E64 A; 1NPP A; 1YIT Q; 1MV3 A; 3MP6 A; 5IAY A; 2DXB A; 2BUD A; 1TWB A; 4C5E A; 2HQH A; 1Y96 B; 3OYK A; 3M57 A; 3L2Z A; 1UG1 A; 4AT1 B; 2GFU A; 2JTM A; 1OEB A; 1IO6 A; 3L2R A; 2DXU A; 1B3Q A; 2HSP A; 4PJN A; 2KT1 A; 2EW3 A; 1CKA A; 1M1K R; 3SWN C; 1K8A U; 2XK0 A; 1KC8 R; 3FJP A; 1VQ4 Q; 3AT1 B; 3S3M A; 4OMM A; 1GL5 A; 1YIT A; 4C92 G; 1YWP A; 2SEM A; 2BZX A; 1QWE A; 2X4Y A; 2X3X D; 2LZ6 B; 2YUQ A; 2QDY B; 3LH5 A; 1X43 A; 1I1J A; 1VQL A; 1D1B A; 3CC4 A; 1BI2 A; 2DTO A; 1YJW T; 1KC8 C; 4LUD A; 4XU2 A; 2NUT B; 1X6O A; 4RKU E; 2RNA A; 1VQM A; 3UAT A; 3E1S A; 5CO7 A; 4E6R A; 3GP8 A; 1N9S A; 1UJY A; 1Z9Z A; 2E10 A; 1RLP C; 2W10 A; 5I21 A; 1NBE B; 1D3B B; 3I35 A; 1SHF A; 2JTE A; 3THK A; 5FRN A; 4M7D A; 3CCM T; 1Y7X A; 3RMQ A; 4J9D A; 4LE9 A; 4PJO C; 1JJ2 S; 3JV3 A; 4R0K A; 2K3B A; 1VQK A; 2K5L A; 1J3T A; 3M0T A; 1RI9 A; 4EMK C; 4MZM A; 2LNV A; 5A0D A; 4PJJ A; 4QQ6 A; 2MIO A; 1WQ7 A; 1VQ5 T; 2EVR A; 2DBM A; 4JDS A; 2BKD N; 1K76 A; 1TOV A; 2E3I A; 4JJC A; 4FYX B; 1VYV A; 1QVF P; 5LL6 S; 3A8H B; 2P0K A; 1YHQ A; 4RTT A; 1LOJ A; 4F17 A; 2XHC A; 1PKS A; 3V7C A; 3EGD A; 2K9G A; 1YJ9 A; 2F2X A; 4IIO A; 4A4F A; 1KQS S; 2GCX A; 2QI2 A; 4ZTF A; 3H41 A; 3PE0 A; 2LDM A; 2WSE E; 3EGX A; 1HD3 A; 3J81 E; 3S3O A; 1OQK A; 1RAE B; 2JXB A; 2JTF A; 3OS1 A; 2ECZ A; 3QSU A; 2L3R A; 4ME7 A; 5KYU A; 1VQ9 Q; 4MZT A; 3DLM A; 4PJL A; 1RUW A; 1B34 B; 4C5I A; 3MP8 A; 2JMA A; 1YP5 A; 2V26 A; 1QWF A; 1S72 T; 3OW2 P; 1G3T A; 4KBM B; 4DQ2 A; 3OYN A; 2D0Q B; 1ZLM A; 1W1F A; 2O4X B; 1NYF A; 2VXE A; 2AK5 A; 1OUL A; 2W0Z A; 3G4S Q; 2JVV A; 1KC8 U; 4ZGE B; 3RKW A; 5CKH A; 3RR6 A; 3L42 A; 1RAB B; 3URG A; 3FEO A; 2X9H A; 3CCE T; 5IHK A; 1V1C A; 3L2V A; 3CMA A; 2F69 A; 4Y91 A; 1XOV A; 2RH2 A; 2M16 A; 3VUB A; 1X01 A; 1RAG B; 1NYG A; 4CI0 C; 1KG1 A; 2RJF A; 2LT1 A; 1U8R A; 2DL5 A; 3RES A; 3P8B B; 2GTJ A; 5GMK m; 2FVU A; 3CCQ Q; 2AZS A; 2JZ2 A; 3I5R A; 4FYY B; 5FLX E; 2D0N A; 4M78 E; 3OMC A; 4HVW A; 1PSF A; 3PVL A; 4KUI A; 4BY6 C; 4BAC A; 2CZ6 B; 4FCY A; 1OU8 A; 4NL3 A; 3QHS A; 1KD1 R; 2FZC B; 4HCB A; 3OYJ A; 3CBO A; 2A3L A; 3RER A; 5KCO A; 3QDR B; 4PFP A; 2DTH A; 3M53 A; 4OMF B; 4BI3 A; 2RD1 A; 4XU3 A; 5D6X A; 1WLP B; 4M77 G; 4OGC A; 1UGP B; 5FRM A; 4PLL A; 5EC7 A; 2DF6 A; 1KD1 C; 2RI2 A; 2OJ2 A; 3LWH A; 1W4S A; 3F70 A; 5KYW B; 1VQ6 T; 3R6O A; 4ELY C; 2HL3 A; 3BDU A; 4RTZ A; 3CPW A; 3QZ9 B; 2LQK A; 4LDW A; 2KYM A; 3BE3 A; 1VQP T; 4O5V A; 4ESR A; 2ZPF B; 4IUP A; 4M7A C; 5IXB A; 3LGL A; 1M5Q 1; 4CC4 B; 2KNB B; 3X25 B; 1VUB A; 4BE1 A; 2DNU A; 4LN2 A; 4QVZ A; 2I0N A; 2VUB A; 2PU9 B; 1ZQ1 A; 4MDX A; 2PVO B; 2QGG A; 2AZV A; 4FT2 A; 2CSQ A; 2FHD A; 1OU9 A; 1X2K A; 2KMT A; 1E6G A; 4C92 F; 4LDY A; 4R55 A; 3FDR A; 3JB9 H; 3OYG A; 3KXT A; 2OI3 A; 3CCU T; 2QEX Q; 4OB2 B; 1Y57 A; 4M78 B; 3CCR Q; 2DEU A; 1TUD A; 4M78 D; 3KBG A; 4C92 E; 2P4R A; 2HKQ B; 1WJS A; 2FPD A; 2RF0 A; 1EX4 A; 1PC0 A; 1LCK A; 5J39 A; 4C0D C; 2Y4X A; 3HTR A; 1ZSZ C; 2DL8 A; 3D7S B; 2KBT A; 1OYX A; 1UFF A; 1JQQ A; 3CME T; 3JB9 J; 3A8M B; 1SRL A; 3E19 A; 5GAN 6; 2CUB A; 1EFN A; 3O5Z A; 1ABO A; 4E7K A; 1VA7 A; 1X2Q A; 1M1F A; 3M56 A; 4PKC C; 1T0J A; 4QQG A; 4DOV A; 1KHC A; 2DXT A; 3G6E Q; 3EFR A; 2HNI A; 4CC7 A; 3REA B; 3RKX A; 2YLB A; 2DFU A; 1WPY A; 2AT1 B; 2LNH B; 5GAO m; 4J5Y A; 2JM9 A; 3A98 A; 4M75 C; 4M75 A; 4JUV A; 2O01 E; 1KD1 U; 2DL4 A; 3SHW A; 3QDF A; 2NUP B; 2I2L A; 1GFC A; 4A4G A; 2LJ1 A; 2V8I A; 2PZ1 A; 2K6D A; 3VV0 A; 1PHT A; 1XTD A; 5AYF A; 1BCM A; 1D0X A; 4Y92 A; 1H3H A; 2GFA A; 3OYA A; 2ESW A; 3MKD A; 2L2P A; 4Z8A A; 2CT3 A; 2R5A A; 4PJO G; 1UEB A; 1DJ7 B; 3OQ5 A; 3M0Q A; 4FT4 A; 2YRC A; 2X4J A; 4JS4 A; 1M8V A; 2P0P A; 5A0L A; 4XQ3 A; 3CCV T; 4Z89 A; 4RG8 A; 2QTV A; 2O9V A; 3GBQ A; 2ZCF B; 2NUZ A; 4FL6 A; 2RJC A; 5CKF A; 2M1H A; 1JB0 E; 3CC7 Q; 3GPL A; 3NGP A; 3NTH A; 5IT9 E; 2O31 A; 5KE2 A; 4FM4 B; 1MND A; 3LW5 E; 2GBQ A; 1WNL A; 4BUG A; 3CPF A; 2DVJ A; 2DTI A; 1EZZ B; 2KEA A; 4AFU C; 1YJN Q; 3LGF A; 1OX9 A; 3X28 B; 4GLM A; 5KH6 A; 3HFN A; 4QKU A; 5KYY A; 1PG5 B; 2ZPH B; 2CUD A; 1RLQ C; 5GAO n; 2DA9 A; 4RTW A; 4MZP A; 5CQX A; 1MMG A; 2M9U A; 2O2O A; 2VVK A; 1ABQ A; 3ASK A; 3CC7 A; 3CXC A; 1QVG P; 4GLK A; 4XTX A; 1UTI A; 1SSH A; 4J9C A; 4F7U B; 2QA4 Q; 1Q81 R; 1G83 A; 2EFI A; 3JSC A; 1YJN A; 2DL7 A; 4XU0 A; 2FYK A; 3X24 B; 1HJD A; 2ZAE A; 4E7L A; 1WQW A; 2AKK A; 2MYS A; 3OS0 A; 1BI1 A; 4JJB A; 1YIJ Q; 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