The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
LFVALYDYQADRWTDLSFHKGEKFQILDASPPGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Generation, Characterization and Structural Data of Chymase Binding Proteins Based on the Human Fyn Kinase SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CHYMASE
|
| molecule tags |
Hydrolase/de novo protein
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
11
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| structure length |
61
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| sequence length |
61
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2O9V A; 2CH4 W; 4RTZ A; 1LCK A; 2DBK A; 3TSW A; 2A08 A; 1QLY A; 1RLQ C; 2KXD A; 1ZSG A; 2NWM A; 2RQT A; 2KRN A; 4J9D A; 4JPB W; 4RTW A; 3QWX X; 1GFC A; 2CUB A; 1W6X A; 1B3Q A; 3M0T A; 2F2W A; 2DVJ A; 5HCK A; 2C0O A; 3VS3 A; 2I0N A; 2M51 A; 1TG0 A; 4LUD A; 4AFU C; 2BZX A; 2KR3 A; 1I07 A; 2ESW A; 2EYW A; 2LJ1 A; 1AWX A; 3JV3 A; 1BU1 A; 2AZS A; 2LJ3 A; 2RQW A; 4AG2 C; 1I1J A; 2VKN A; 1UHC A; 2BTT A; 1OEB A; 1GCP A; 2ECZ A; 4RTX A; 1YN8 A; 4HVU A; 4KRT A; 3EG3 A; 2FPF A; 2KGT A; 2NUZ A; 1RUW A; 1E7O A; 2G6F X; 1NYG A; 1V1C A; 2JS2 A; 2DRM A; 2RN8 A; 2AZV A; 2K6D A; 4Z88 A; 1J3T A; 2RPN A; 2D8J A; 4K11 A; 1M30 A; 3H41 A; 2J6K A; 4CC3 A; 1PRL C; 3REB B; 3KFV A; 3VS1 A; 1SHG A; 3NGP A; 2DA9 A; 5IHI A; 2BZY A; 1GRI A; 2DBM A; 2JT4 A; 2QDL A; 1WXU A; 2FPD A; 2FPE A; 2J05 A; 1E6G A; 4Z8A A; 1GCQ C; 2KRM A; 2W10 A; 4OMM A; 1UG1 A; 1HD3 A; 2MCN A; 3NHN A; 3UF4 A; 1X27 A; 3I9Q A; 1MUZ A; 1HJD A; 1PRM C; 2L3S A; 4OMP A; 1QCF A; 3I5R A; 3SEM A; 2KT1 A; 1ZUY A; 2A28 A; 2DRK A; 2YUP A; 1KFZ A; 2DL3 A; 1AWW A; 1ABO A; 2X3W D; 3U23 A; 1OOT A; 4D8K A; 1FMK A; 3C0C A; 4AFZ C; 1E6H A; 2LP5 A; 3O5Z A; 1AD5 A; 2DL7 A; 2FRW A; 1M3B A; 3IQL A; 1ZUK A; 1VYV A; 3M0S A; 2CH4 A; 4M4Z A; 2LCS A; 1X6G A; 1AVZ C; 5I22 A; 2GTO A; 1I0C A; 4OML A; 2KYM A; 3M0Q A; 2DF6 A; 1SPK A; 2F2V A; 2PNI A; 1YP5 A; 4DEX A; 1H92 A; 2RNA A; 2O9S A; 4HCK A; 3M0P A; 2JW4 A; 2HCK A; 4J9C A; 2FG0 A; 4ZNX A; 2J6O A; 1QKW A; 1K76 A; 4J9H A; 1UHF A; 1GFD A; 2AK5 A; 3VS2 A; 2K79 A; 2KRO A; 2KE9 A; 1QWF A; 1OPL A; 1WDX A; 3RBB B; 2KNB B; 1BBZ A; 1N5Z A; 1YNZ A; 4FSS A; 2V1R A; 4CC4 B; 1KIK A; 2GBQ A; 1W1F A; 2DE0 X; 2CDT A; 4AFS C; 2DIL A; 3EHQ A; 4IIO A; 3RNJ A; 2CT4 A; 3UA6 A; 1M3A A; 1IO6 A; 1RI9 A; 2E5K A; 1NEB A; 2EPD A; 2FRY A; 3ULR B; 2O88 A; 1G2B A; 1KJW A; 5IXB A; 5FWC A; 1GL5 A; 3SHW A; 1JEG A; 1PKT A; 2JMA A; 2OAW A; 2L0A A; 2DNU A; 2HSP A; 4F17 A; 3I35 A; 2KYB A; 2P4R A; 2HEQ A; 1PHT A; 4JZ4 A; 1S1N A; 1JU5 C; 2FO0 A; 1YWO A; 4D8D A; 2VVK A; 2C0I A; 1TUD A; 3UAT A; 2ROT A; 3GBQ A; 2MOX A; 4RTV A; 2YUO A; 2JM9 A; 4LN2 A; 3QWY A; 2AKL A; 2IIM A; 3TSZ A; 1NLO C; 3I5S A; 1K0X A; 4F16 A; 2KXC A; 2OI3 A; 1QKX A; 1T3S A; 1X43 A; 1UDL A; 4RTU A; 1YWP A; 2KRS A; 2D8H A; 1NEG A; 4JZ3 A; 1VA7 A; 1AOJ A; 3REA B; 1UUE A; 2LQW A; 1WI7 A; 4ESR A; 4Y92 A; 1BB9 A; 2L3Q A; 5FWB A; 4OMQ A; 2DX1 A; 4DEY A; 2RQV A; 1Z9Z A; 1SRL A; 2LQN A; 2PTK A; 1EFN A; 2LX7 A; 5EC7 A; 1T0H A; 2EYX A; 2EBP A; 2DJQ A; 5FW9 A; 2JM8 A; 4AFQ C; 3PVQ A; 2DLP A; 2K7A A; 1WX6 A; 2X3X D; 2KT8 A; 2JS0 A; 2RQU A; 1AWO A; 4R0K A; 1SRM A; 2J6F A; 1CKA A; 2H8H A; 2C0T A; 1JQQ A; 5ECA A; 2K3B A; 2K9G A; 1UE9 A; 2V1Q A; 2EGE A; 4HVW A; 1K0S A; 1Y0M A; 2D1X A; 3EHR A; 2GTJ A; 5IH2 A; 2DYB A; 1JXM A; 4RTY A; 3ZL7 C; 4CC2 A; 1WXT A; 1ZBJ A; 2EW3 A; 1FYN A; 3VS0 A; 1K9A A; 1SHF A; 5I11 A; 3EG1 A; 2J7I A; 2F2X A; 4CC7 A; 1ARK A; 5IHK A; 2LZ6 B; 1OV3 A; 4F14 A; 2RF0 A; 1K1Z A; 3PVL A; 3TVT A; 1AEY A; 1VYT A; 1AZE A; 1ABQ A; 3M0U A; 5IXF A; 1QWE A; 2OJ2 A; 2L3P A; 2YDL A; 2FEI A; 1CSK A; 3UA7 A; 5L23 A; 1G83 A; 4X1V A; 2DMO A; 2LJ0 A; 2LNH B; 3LH5 A; 2AKK A; 2GQI A; 2B86 A; 1H8K A; 1MV3 A; 3THK A; 1WXB A; 1XOV A; 3M0R A; 4JJB A; 2HBW A; 3EG2 A; 1KSW A; 1ZX6 A; 2O2O A; 4LUE A; 1NLP C; 1NM7 A; 1U3O A; 2SRC A; 2VWF A; 3NPF A; 1WA7 A; 2ENM A; 2ED0 A; 2DM1 A; 4OMO A; 2L2P A; 1Z9Q A; 3FJ5 A; 4LNP A; 2DL4 A; 3VRZ A; 1JXO A; 2J06 A; 1GCQ A; 2EGC A; 1SEM A; 1WYX A; 1U5S A; 4IIM A; 4RUG A; 4OMN A; 4RTT A; 2CSI A; 2GNC A; 2KBT A; 1Y57 A; 2ED1 A; 3PE0 A; 5GJV B; 1HSQ A; 1VYU A; 2A37 A; 1M27 C; 3H0H A; 2GGR A; 4J9I A; 1PKS A; 2CT3 A; 4GLM A; 2EYZ A; 2O31 A; 1W70 A; 2ROL A; 1U06 A; 1GBR A; 2BZ8 A; 1UFF A; 1WFW A; 2KEA A; 4E6R A; 2LMJ A; 3VS5 A; 1NG2 A; 4GBQ A; 2K2M A; 1NYF A; 1ZLM A; 1X2K A; 2CSQ A; 2MIO A; 2EYY A; 1CKB A; 4J9B A; 2EGA A; 1RLP C; 1K4U S; 3NMZ C; 2YUQ A; 1SSH A; 2JXB A; 2YT6 A; 4J9G A; 2YSQ A; 3EG0 A; 1WIE A; 4J9F A; 1WLP B; 3VS6 A; 1JO8 A; 2RMO A; 4LE9 A; 2HDA A; 4EIK A; 1H3H A; 2DL8 A; 2YUN A; 1M3C A; 5IHN A; 1TUC A; 2CUD A; 3EGU A; 1UGV A; 1MV0 B; 5GJW B; 1UEC A; 4JJC A; 1AZG B; 4A63 B; 1B07 A; 2D0N A; 2RQR A; 1ZUU A; 2ABL A; 2DL5 A; 3H0I A; 1GBQ A; 2M0Y A; 2A36 A; 3A98 A; 4JJD A; 4QT7 A; 1UTI A; 2SEM A; 3VS4 A; 1UJY A; 1X2Q A; 2XMF A; 1A0N B; 1PWT A; 1OPK A; 1YCS B; 2JTE A; 2EKH A; 2EVR A; 3VRY A; 3VS7 A; 4AG1 C; 1X69 A; 4WCI A; 1UJ0 A; 2W0Z A; 4Z89 A; 1BK2 A; 3R6N A; 3H0F A; 1AWJ A; 1M8M A; 2JMC A; 2PZ1 A; 1PNJ A; 1T0J A; 1T3L A; 4J9E A; 4HVV A; 2CRE A; 4ORZ A; 4HXJ A; 3CQT A; 2EQI A; 1X6B A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4NOY A; 2O9V A; 4QQ6 A; 4BY6 C; 4OP0 A; 2P0P A; 4C92 G; 1G3T A; 4BI3 A; 4CRI A; 3JCM J; 2KXD A; 2NWM A; 3S3M A; 1MND A; 3HFN A; 5LL6 S; 3CC4 A; 2EJG A; 3L2Z A; 4XAX B; 4XTZ A; 3QWX X; 1YIJ Q; 4QW2 A; 4E7L A; 2PUK B; 2E10 A; 3ME9 A; 3JCM c; 2JN0 A; 4C8Q E; 4OMF B; 2GQV A; 3LYI A; 4PJJ A; 2C0O A; 5HCK A; 4QVD A; 4FL6 A; 4KUI A; 5CCA A; 1YJW Q; 1TG0 A; 3SFM A; 2EJF A; 2ATC B; 1R0C B; 2P0K A; 4JS5 A; 3INZ A; 5I21 A; 2BE7 D; 2COZ A; 2R5A A; 3CCM Q; 1N8R C; 4EMK A; 2LJ3 A; 4QQD A; 8ATC B; 3CPW P; 3BY7 A; 2RQW A; 1YI2 T; 2BTT A; 4RCC A; 3HP9 A; 3QYH B; 1WJS A; 4C8Q G; 3EG3 A; 5C0M A; 3CXC A; 1RUW A; 3L2W A; 4JRK A; 2ZPE B; 1M1K U; 1NYG A; 2Z0W A; 2RN8 A; 3MO8 A; 2E65 A; 4M77 B; 2ZPH B; 1Q86 U; 5KYN A; 2D8J A; 1YJW A; 3KFV A; 3VUB A; 5LJ5 e; 4HCC A; 2CS7 A; 4AT1 B; 4IKF A; 4F04 B; 4VUB A; 2KRM A; 2B8A A; 3UF4 A; 1X27 A; 1QVP A; 1BKB A; 2GFA A; 3KBG A; 3OYH A; 1MUZ A; 1M2O A; 2L3S A; 1S72 T; 1QCF A; 1IXD A; 4LDW A; 3CPW A; 1KFZ A; 2JJ9 A; 3QPH A; 1AWW A; 1BCM A; 2YLB A; 1UB4 A; 3U23 A; 3RUX A; 5GAO q; 1BI3 A; 3VYG A; 1E6H A; 2LP5 A; 1AD5 A; 2DL7 A; 2FRW A; 1ZUK A; 4M4Z A; 2C06 A; 5GAM f; 3GOX A; 1I0C A; 2KYM A; 4B9X A; 3CCV A; 1OX9 A; 2LX9 A; 3L1A A; 2HCK A; 2FG0 A; 4ZNX A; 1QKW A; 3NTH A; 3QJ6 A; 3EAE A; 3M54 A; 2KE9 A; 1K73 U; 2MAM A; 3RBB B; 3CCJ Q; 4CC4 B; 1RAA B; 4C8Q B; 2KK4 A; 4Z02 A; 2RK2 A; 2DXT A; 2G3R A; 4XTY A; 5HK0 A; 4AFS C; 1VUB A; 4R56 A; 1RI9 A; 2CZ0 B; 1M2V B; 3H8Z A; 4IUP A; 2EPD A; 3DLL A; 5D6X A; 3ULR B; 2O88 A; 4KGV B; 2RI2 A; 2RHY A; 1OU9 A; 5IN1 A; 4PJL A; 2KSS A; 2X35 A; 5GAO n; 1JEG A; 2JMA A; 4F17 A; 2HSP A; 4OB3 B; 4BI4 A; 3NTK A; 1TOV A; 3OA6 A; 4PK4 A; 2BUD A; 3CCS Q; 2F5K A; 4PFO A; 1JU5 C; 3MHX A; 1D3B A; 5FU7 B; 3DB4 A; 2FZK B; 2C0I A; 3BW1 A; 3OYC A; 2MOX A; 1UGR B; 2JM9 A; 1M1K R; 2AKL A; 2BE9 B; 1QCO A; 2IIM A; 2RK1 A; 1NLO C; 2JUF A; 3I5S A; 2X4J A; 1K0X A; 2YHT A; 4KH1 B; 2CP3 A; 3CCQ A; 1Q86 R; 5CKH A; 3CCE T; 4M7D F; 1T3S A; 3CCL Q; 3JCM d; 3RIR A; 5CKD A; 5KYW B; 5GAO m; 1VA7 A; 3REA B; 2LQW A; 3S3N A; 4Y92 A; 3H6Z A; 1M1K C; 5GMK m; 2L3Q A; 4EMK C; 1OZ2 A; 2DXB A; 1YI2 Q; 2DX1 A; 2RQV A; 1Z9Z A; 2NUT A; 1Q86 C; 4BD3 A; 4C5H A; 2X4X A; 2PTK A; 4M75 F; 3EGX A; 5HY6 A; 1T0H A; 2E4H A; 2EBP A; 3F70 A; 2DJQ A; 3V8L A; 2QK0 A; 1KG1 A; 2FHD A; 3CCL A; 1MGQ A; 1AHJ B; 1PG5 B; 2MWP A; 1KK7 A; 5FRO A; 1M1F A; 5D6Y A; 1N9R A; 5KE3 A; 2A3L A; 5IH2 A; 2DYB A; 3ZL7 C; 1U1T A; 1WXT A; 1ZBJ A; 1KD1 U; 1YI2 A; 1K9M U; 1K9A A; 5I11 A; 2PU9 B; 2J7I A; 1VQN T; 4M77 D; 1VQ8 T; 1S72 Q; 2E12 A; 3JCM W; 1I4K 1; 1JRI A; 3MEA A; 3TVT A; 1AEY A; 3TCJ A; 1O9S A; 1AZE A; 2EIF A; 5IXF A; 5FLX E; 1C1A A; 1WZO A; 1CSK A; 4LD6 A; 3MEU A; 4N4G A; 3NFC A; 3I55 T; 1OQK A; 2EKO A; 3GNF B; 4X1V A; 1VQK T; 2DMO A; 2DK3 A; 5FU6 B; 2AKK A; 2GQI A; 2X4W A; 1MV3 A; 2LRQ A; 2QXF A; 4E7J A; 2DFU A; 5GAN e; 2P84 A; 1RAE B; 1ZX6 A; 2O2O A; 4LUE A; 1P92 A; 5LJ5 f; 5CKF A; 3HKS A; 3M58 A; 1U3O A; 2VWF A; 5GMK l; 1TUG B; 2LNV A; 3G4S T; 2EAY A; 1S72 A; 2L2P A; 1Z9Q A; 3QG1 A; 5KYY B; 2DL4 A; 2DTH A; 3OYG A; 5CVI A; 1JXO A; 1GCQ A; 2AIR B; 2YRD A; 1SEM A; 1WYX A; 3E19 A; 3J80 E; 4DOW A; 3BFM A; 1YIT A; 2CSI A; 1WQW A; 2H3J A; 1IGU A; 2XDB A; 3PE0 A; 1TU0 B; 2A7Y A; 3CBM A; 5GJV B; 1HSQ A; 1PD0 A; 2DZ9 A; 5KYX B; 4KUL A; 1M27 C; 4M7D E; 1KC8 U; 1PKS A; 4PKC C; 2EYZ A; 4NS5 A; 8AT1 B; 2QAZ A; 4LD9 K; 4PFP A; 2V8I A; 3FEO A; 4QVC A; 2EFI A; 2LMJ A; 3X26 B; 3VS5 A; 1NG2 A; 4WF2 A; 2VXF A; 4C8Q D; 2CSQ A; 3LH0 A; 1CKB A; 4B9W A; 3JCM g; 5GAN j; 1BIA A; 1SSH A; 1Q81 U; 4J9G A; 3G1J A; 4M78 F; 1VQ6 T; 2PVO B; 4LE9 A; 3I56 T; 4HT8 A; 1H3H A; 2DL8 A; 4HT9 A; 2CUD A; 3VUZ A; 3EGD A; 1NE8 A; 4JJC A; 3CCE Q; 2D0N A; 2RQR A; 4BE2 A; 5CO7 A; 2DL5 A; 1GBQ A; 1OUL A; 2XK0 A; 4FW2 A; 2SEM A; 4ZGD B; 1Q82 U; 1A0N B; 2HKQ B; 1YBY A; 2QQA A; 1KD1 R; 1UJ0 A; 4Z89 A; 1K9M R; 1VQ9 T; 3QYG B; 2LQK A; 3R6N A; 3FDR A; 4WTO B; 1AWJ A; 1ZHI A; 2PZ1 A; 1PNJ A; 3SDZ A; 2YWW A; 2CRE A; 3CQT A; 3OYY A; 1X6B A; 4J83 A; 5A2Q E; 2CH4 W; 2DBK A; 3E9G A; 1TS9 A; 2CP2 A; 3TSW A; 2JZ2 A; 1KD1 C; 3CCR T; 1QP2 A; 1EX4 A; 1K9M C; 1OZ3 A; 1IHW A; 2KRN A; 3C95 A; 2QA4 T; 3JCM h; 4RTW A; 1GFC A; 2QYZ A; 2MK5 A; 2JOY A; 1B3Q A; 1C6V X; 5J39 A; 4ELZ C; 2DVJ A; 2HMA A; 3G71 T; 1PC0 A; 4EDU A; 2RJD A; 4EMH A; 4AFU C; 4DBH A; 3CCV T; 4DQ2 A; 1BI2 A; 1VQN Q; 1I07 A; 3M59 A; 2ESW A; 2EYW A; 1VQ8 Q; 2LJ1 A; 5FRN A; 4KGZ B; 3JV3 A; 3M57 A; 2V8K A; 3A5Z B; 3JB9 I; 4MML A; 4M7D B; 1XQH A; 3RKW A; 1OEB A; 1GCP A; 2ECZ A; 3LLR A; 4RTX A; 3I55 Q; 3Q1J A; 4HVU A; 4ZN1 A; 4JJN K; 1E7O A; 1RAI B; 3OYJ A; 1X75 C; 2G6F X; 1VQK Q; 3UDC A; 3MEV A; 2QQR A; 1UGP B; 2AZV A; 2WSF E; 5FU6 C; 2IPO B; 1KC8 R; 1VQO A; 2XIC A; 1HK9 A; 2NLU A; 1FXX A; 5KCH A; 5DM7 R; 3TEE A; 4BUG A; 2J6K A; 2KDS A; 5I2S A; 4M7A F; 3NGP A; 1VQN A; 4FM4 B; 3T9N A; 1VQ8 A; 3GLX A; 3G4S Q; 1PSF A; 2QDL A; 3OB9 A; 4M75 A; 2FPD A; 2J05 A; 1SSF A; 1D0Z A; 1GCQ C; 2LVM A; 2W10 A; 3I55 A; 1KC8 C; 1HD3 A; 3ZBD A; 3I9Q A; 3EG9 B; 3LX7 A; 3OYF A; 2H3E B; 2HBP A; 2R58 A; 3X25 B; 1YJ9 A; 3PIO A; 3OS0 A; 2YRC A; 3I5R A; 3SEM A; 4BE0 A; 2DRK A; 2YUP A; 3HFO A; 4HCB A; 4UC4 A; 3KUF A; 5GMK h; 3HHT B; 1M1G A; 2PVG B; 5AT1 B; 1ABO A; 2FB7 A; 2X3W D; 1OOT A; 1D09 B; 3O5Z A; 2KI7 A; 3CCQ T; 4ANJ A; 2LCS A; 1VYV A; 5DLQ E; 1B7T A; 1X6G A; 1Q81 C; 2CP7 A; 1Q82 R; 3P8D A; 4MMK A; 3MPU B; 3G4S A; 2QTV A; 1JB0 E; 5GAN f; 2DF6 A; 4V2S A; 1SPK A; 2PNI A; 3OYM A; 1QQJ A; 3HRS A; 2LCL A; 2J6O A; 2QEX T; 5KH6 A; 1UHF A; 2DZC A; 4MZM A; 2AK5 A; 4XK8 E; 1VQ6 Q; 2K79 A; 3I56 Q; 4FYY B; 1Q82 C; 4FSX A; 2ZPI B; 1BBZ A; 2DEQ A; 5C6S A; 3V7R A; 2GBQ A; 2FVU A; 2QGF B; 2E3H A; 3EHQ A; 2K3X A; 4IIO A; 3CME A; 3CCL T; 1IO6 A; 1M3A A; 2QGG A; 3G7Z A; 1G5V A; 5KYU A; 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