The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
LFVALYDYQADRWTDLSFHKGEKFQILDASPPGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Generation, Characterization and Structural Data of Chymase Binding Proteins Based on the Human Fyn Kinase SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CHYMASE
|
| molecule tags |
Hydrolase/de novo protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
11
|
| structure length |
61
|
| sequence length |
61
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1U06 A; 3VRZ A; 1PRM C; 2A37 A; 1X43 A; 4Y92 A; 2CDT A; 2AKK A; 1T0H A; 2FPF A; 1NLO C; 3KFV A; 1RI9 A; 4RTZ A; 2GTJ A; 1NYF A; 1TUC A; 3M0P A; 1WXU A; 2GNC A; 2EGA A; 1BK2 A; 4OMO A; 2KR3 A; 2MCN A; 2K9G A; 4K11 A; 1PRL C; 3VS0 A; 4J9G A; 5FW9 A; 2D0N A; 1FMK A; 1UEC A; 2KT8 A; 1KJW A; 1M3A A; 3VS6 A; 1NG2 A; 1HD3 A; 1H92 A; 1NYG A; 5IHN A; 1G83 A; 2H8H A; 4E6R A; 3NGP A; 1X6B A; 1X69 A; 2A08 A; 2EYW A; 2VVK A; 1CKB A; 5ECA A; 3UA6 A; 2DMO A; 1W70 A; 2FPD A; 1NEB A; 1PNJ A; 2KGT A; 2EGC A; 2MOX A; 1AWW A; 2EPD A; 1UHC A; 2EW3 A; 2LJ0 A; 4WCI A; 3UF4 A; 2KEA A; 1ZUY A; 2L3P A; 4JJD A; 2EQI A; 1UGV A; 3VS3 A; 1B3Q A; 1MV3 A; 2ED0 A; 4IIM A; 2EYY A; 3EHR A; 1KIK A; 1T3L A; 1VYV A; 2HDA A; 3NMZ C; 3TVT A; 2YUO A; 1AWX A; 3THK A; 1JQQ A; 3UAT A; 2AKL A; 1JEG A; 3M0Q A; 1GBQ A; 2DA9 A; 1SRL A; 1X2K A; 2KXC A; 1Z9Z A; 4EIK A; 2O2O A; 4Z89 A; 2YSQ A; 2EBP A; 1E6H A; 2JMA A; 2M51 A; 2DF6 A; 4HXJ A; 5EC7 A; 2EYX A; 1LCK A; 1H3H A; 4R0K A; 1OV3 A; 2AZV A; 2ED1 A; 5I22 A; 4KRT A; 2CUB A; 2FG0 A; 2ROT A; 4J9F A; 1WFW A; 2KXD A; 2GGR A; 2YT6 A; 4LUE A; 2DX1 A; 1ABQ A; 1I07 A; 1M3C A; 2V1Q A; 1GCQ A; 2BZ8 A; 2CT4 A; 4RTU A; 2L3S A; 1XOV A; 2SEM A; 4RTY A; 2DNU A; 1SHG A; 4A63 B; 1K0S A; 1KSW A; 4LN2 A; 2A36 A; 4RTV A; 2KRO A; 2KBT A; 2DYB A; 2DL5 A; 1WI7 A; 2DRM A; 4OMP A; 2F2W A; 2HBW A; 2DLP A; 1WX6 A; 2LQN A; 2JS2 A; 3I9Q A; 1BB9 A; 1PWT A; 3EG0 A; 4IIO A; 1A0N B; 1ZLM A; 1WIE A; 2J6O A; 1B07 A; 2ROL A; 1SEM A; 4JJC A; 2EGE A; 2KE9 A; 3QWX X; 3M0R A; 2JS0 A; 2AZS A; 2CT3 A; 2LNH B; 3M0U A; 1ABO A; 1X6G A; 2DVJ A; 2PZ1 A; 1HSQ A; 2RPN A; 4OMM A; 3VS2 A; 2EYZ A; 1WA7 A; 2J05 A; 2RMO A; 1M8M A; 3VS5 A; 2M0Y A; 3VRY A; 2J7I A; 2I0N A; 1OPL A; 2JM9 A; 1K76 A; 5IHI A; 4RTW A; 4CC7 A; 3U23 A; 2KRS A; 1YCS B; 2C0I A; 2K2M A; 2KYM A; 2VWF A; 3ULR B; 2LJ3 A; 1K4U S; 1M27 C; 2KYB A; 5GJV B; 4D8D A; 3NHN A; 4HCK A; 4LNP A; 1M30 A; 2O9S A; 2FO0 A; 2FEI A; 4AFS C; 1S1N A; 2LZ6 B; 2J6K A; 4J9C A; 2W0Z A; 2L0A A; 2DJQ A; 2DRK A; 2QDL A; 1AD5 A; 1CKA A; 1UFF A; 2J06 A; 2OI3 A; 1SSH A; 2E5K A; 2A28 A; 3JV3 A; 2JM8 A; 1U3O A; 4GLM A; 2K6D A; 1E6G A; 3TSW A; 1JU5 C; 1NEG A; 1RLQ C; 2O9V A; 3H0I A; 4CC3 A; 2CUD A; 1X2Q A; 3REA B; 4HVW A; 3H41 A; 3TSZ A; 2YUP A; 3LH5 A; 1G2B A; 2LX7 A; 1ZUU A; 1ARK A; 2RF0 A; 2K7A A; 4RUG A; 2O31 A; 1W6X A; 4AFU C; 2DIL A; 4F17 A; 2CRE A; 2G6F X; 2F2V A; 3FJ5 A; 1OOT A; 4J9D A; 2LMJ A; 1YWO A; 2BZX A; 3I5S A; 4J9I A; 1GFC A; 3SEM A; 2YDL A; 1UHF A; 5I11 A; 1AZE A; 3EHQ A; 1SRM A; 2RQU A; 2LQW A; 2B86 A; 3H0H A; 4OMQ A; 2BZY A; 1KFZ A; 1UJY A; 3VS7 A; 2K79 A; 3CQT A; 1UG1 A; 1GBR A; 2JT4 A; 5HCK A; 2LJ1 A; 1M3B A; 2D8J A; 2JMC A; 4ZNX A; 3H0F A; 2XMF A; 2EKH A; 2PTK A; 2IIM A; 3RBB B; 1CSK A; 2YUN A; 2D8H A; 1GCQ C; 1QCF A; 4HVU A; 3M0T A; 5L23 A; 2KT1 A; 1SPK A; 4LE9 A; 4JPB W; 2DBK A; 1UDL A; 2KRM A; 1AWJ A; 4X1V A; 1AOJ A; 5GJW B; 1ZSG A; 4D8K A; 3RNJ A; 2RQW A; 4QT7 A; 1UUE A; 2JW4 A; 1V1C A; 1X27 A; 1T0J A; 1YN8 A; 4J9H A; 2ECZ A; 3I35 A; 1YNZ A; 1ZUK A; 1YWP A; 2HCK A; 2K3B A; 2CSI A; 4CC2 A; 2GBQ A; 2W10 A; 1T3S A; 1MV0 B; 1FYN A; 4FSS A; 1EFN A; 3UA7 A; 1VYU A; 2V1R A; 2DL4 A; 1OEB A; 2FPE A; 4F14 A; 3REB B; 5IHK A; 1K9A A; 1UTI A; 2CH4 W; 5IXF A; 1QKX A; 1AVZ C; 1Y57 A; 1ZX6 A; 4RTT A; 1QKW A; 2D1X A; 3PVQ A; 2ABL A; 3EG1 A; 2LCS A; 4DEX A; 2C0O A; 2X3X D; 1I1J A; 1PKT A; 2JXB A; 2P4R A; 1JO8 A; 3NPF A; 2LP5 A; 3QWY A; 1RUW A; 2AK5 A; 2NWM A; 3R6N A; 2DM1 A; 3A98 A; 4OMN A; 5IXB A; 4RTX A; 4ORZ A; 4Z8A A; 2VKN A; 1GFD A; 1JXM A; 1GRI A; 2DL7 A; 4JZ3 A; 4DEY A; 4LUD A; 2SRC A; 2DL8 A; 4JJB A; 1HJD A; 2L3Q A; 1E7O A; 2OJ2 A; 4F16 A; 2KRN A; 2C0T A; 2PNI A; 2RN8 A; 3GBQ A; 3IQL A; 1TG0 A; 4JZ4 A; 1WYX A; 3VS1 A; 1K0X A; 1U5S A; 2MIO A; 2BTT A; 4AFZ C; 2GQI A; 4GBQ A; 1JXO A; 1WXT A; 1QLY A; 1WXB A; 1Y0M A; 1TUD A; 4OML A; 1W1F A; 1VA7 A; 1QWF A; 3M0S A; 2YUQ A; 2NUZ A; 3PVL A; 4J9E A; 2RNA A; 4CC4 B; 1K1Z A; 5IH2 A; 1RLP C; 2L2P A; 3EG3 A; 2OAW A; 1BBZ A; 2X3W D; 2RQR A; 1WLP B; 2RQT A; 1AEY A; 1MUZ A; 1PKS A; 5FWB A; 1NLP C; 1VYT A; 1J3T A; 1UJ0 A; 2O88 A; 4ESR A; 3I5R A; 1GCP A; 1ZBJ A; 4Z88 A; 1UE9 A; 4M4Z A; 2CSQ A; 2HEQ A; 4HVV A; 3EGU A; 5FWC A; 3EG2 A; 4AG1 C; 1GL5 A; 1WDX A; 2HSP A; 1QWE A; 2EVR A; 2J6F A; 1YP5 A; 4AG2 C; 1Z9Q A; 1BU1 A; 3SHW A; 2ENM A; 1I0C A; 2F2X A; 2FRY A; 2DL3 A; 2DE0 X; 2ESW A; 2CH4 A; 2KNB B; 2FRW A; 1AZG B; 1PHT A; 2RQV A; 3ZL7 C; 4AFQ C; 1NM7 A; 1SHF A; 3PE0 A; 1H8K A; 4J9B A; 3VS4 A; 1AWO A; 1OPK A; 1IO6 A; 1N5Z A; 3C0C A; 3O5Z A; 2DBM A; 2GTO A; 2JTE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3NTK A; 1PRM C; 5CO7 A; 1X43 A; 2CGH A; 4M78 B; 1T0H A; 4BDY A; 2FL7 A; 5GAN 4; 5LJ5 j; 3ASK A; 4OMO A; 2KR3 A; 4FW2 A; 4M78 F; 4EMK A; 2WSF E; 4EMG A; 2ZAE A; 3NTH A; 5D7U A; 1VQK Q; 3CCE T; 3QSU A; 1QP2 A; 3OW2 S; 4JS5 A; 3NTI A; 2D0N A; 2EIF A; 4DOV A; 4XU2 A; 3LH0 A; 1KQS S; 2E5Q A; 1KJW A; 1HD3 A; 4FYW B; 3M56 A; 1N9R A; 3JCM h; 2H8H A; 4C8Q F; 3DLL A; 1BYM A; 4XAX B; 1CKB A; 3UA6 A; 3CC2 Q; 3M59 A; 4OB2 B; 3VJP A; 1AWW A; 1TS9 A; 2AHJ B; 4QQG A; 2EW3 A; 4WCI A; 2QQS A; 3JCM d; 3OYF A; 2RHX A; 4N4I A; 1K8A R; 3PGG A; 1MNE A; 1IGQ A; 5DY9 A; 3L42 A; 3EFO A; 1KC8 C; 2HL3 A; 1B3Q A; 1OQK A; 5CQX A; 1KIK A; 1T3L A; 2YUO A; 1OU9 A; 1VQO A; 3OYE A; 4M77 A; 3EFS A; 3M0Q A; 1GBQ A; 2HBP A; 2RJF A; 4PK4 A; 1SRL A; 4M7A F; 1E6H A; 2JMA A; 2K5F A; 4X9D A; 1NE8 A; 3CXC S; 2EYX A; 4KGX B; 1LCK A; 1XQH A; 2NUP B; 5KYW B; 2QDY B; 2LCL A; 4M77 E; 2LT1 A; 2ROT A; 1VQK T; 1VQ6 Q; 1SF9 A; 1YHQ A; 3ZBD A; 2HKN A; 1HYO A; 2DX1 A; 2F1L A; 1MMG A; 2V1Q A; 1OU8 A; 3GIB A; 2O4X A; 2QQA A; 2SEM A; 3FJP A; 4RTY A; 2RHI A; 3PMT A; 4ZN1 A; 4PFZ A; 3PT9 A; 2DL5 A; 5L8R E; 2HBW A; 4M78 D; 1G5V A; 2H3J A; 3CC4 Q; 4F7U B; 3EG0 A; 2XID A; 2P0Q A; 1S72 Q; 3QWX X; 4E7S A; 3M0R A; 2BKD N; 1NJI R; 2V8K A; 3J81 E; 3M0U A; 1VQ4 Q; 1O75 A; 1X6G A; 4C8Q D; 5GAN f; 4PJO C; 1N8R C; 2EYZ A; 3EGX B; 2OTL A; 3OYA A; 4MMK A; 4B9W A; 4BD3 A; 2JOY A; 2J7I A; 2KY9 A; 1K76 A; 3Q1J A; 2WSE E; 1QVP A; 3U23 A; 2E3H A; 4J6Y A; 1JJ2 A; 2R5M A; 2RO0 A; 2X35 A; 1SSF A; 4FT4 A; 4OGC A; 2QAZ A; 1OYX A; 4ZGJ B; 3CCU Q; 2RB6 A; 3MET A; 3URG A; 1D09 B; 2EQK A; 2DJZ A; 2O9S A; 2FO0 A; 1W2B A; 2FEI A; 1S1N A; 2DJQ A; 2WAC A; 1FX7 A; 3ZFJ A; 3JCM b; 5DM7 R; 2EYQ A; 4M7A D; 2OI3 A; 1SSH A; 2E5K A; 2A28 A; 4HKE A; 2QEX Q; 2JM8 A; 4EMK B; 1KQ1 A; 1U3O A; 1VQO T; 2P4T A; 1Q81 R; 4M7D B; 1NEG A; 4CC3 A; 1KD1 C; 2AT1 B; 5GAM j; 1M5Q 1; 5GAO n; 2Y90 A; 1YJW Q; 3HRU A; 3TEE A; 2L89 A; 3CCJ Q; 2EJF A; 3JB9 F; 3QYG B; 4M7D F; 1G2B A; 4LDX A; 1QVG P; 1TOV A; 4RUG A; 1W6X A; 1YFN A; 4R56 A; 2G6F X; 3V8J A; 4ANJ A; 1Q86 R; 2BZX A; 5LJ3 f; 2MWO A; 4XTY A; 2EWN A; 1YHQ T; 1QVF P; 1C6V X; 1WHK A; 3EFO B; 3EHQ A; 2RQU A; 4M75 C; 2LQW A; 2KK4 A; 3SB2 A; 4F7U G; 2K79 A; 1UG1 A; 3LWI A; 2JT4 A; 2XK0 A; 3MP8 A; 3X20 B; 4M77 B; 5GAN g; 1M3B A; 3CME A; 2D8J A; 4ZNX A; 4OB1 B; 2EKH A; 2E65 A; 2D8H A; 1GCQ C; 2HSE B; 3OYH A; 4BE2 A; 5L23 A; 3CPW A; 3OQ5 A; 2EFI A; 1SPK A; 3JRZ A; 1UDL A; 3MPU B; 1AOJ A; 3TRE A; 4J6X A; 1OZ3 A; 4QT7 A; 1UUE A; 2JW4 A; 2X4J A; 3OYY A; 1RAC B; 5CKB A; 3L2V A; 4ZGE B; 2VC8 A; 1V1C A; 1X27 A; 4J9H A; 1YJN Q; 2EQJ A; 3HTR A; 2OTL T; 1YWP A; 2HCK A; 1VQ5 A; 1MV0 B; 1X75 C; 3FC3 A; 2EAY A; 1I5O B; 2O01 E; 3JB9 J; 3KXT A; 5LL6 S; 3MEV A; 5IHK A; 2P0K A; 1K9A A; 1Y96 A; 4PNO A; 1Y57 A; 5HK0 A; 1ZX6 A; 3OSS C; 4RG8 A; 4RTT A; 1LVK A; 4FYV B; 4QQ6 A; 2FZC B; 5FRN A; 2EQM A; 1M90 C; 4L59 A; 4BB7 A; 5LJ5 f; 3QKJ A; 4DBR A; 4V2S A; 1X01 A; 2CKK A; 3NPF A; 4M7D D; 2NWM A; 2D9T A; 4Z8A A; 2GQV A; 2LX9 A; 3N5B B; 1GFD A; 1K9M R; 2JZ2 A; 4XQ3 A; 4DEY A; 5LJ3 g; 4HCZ A; 5GAN e; 1TTH B; 2YXY A; 1SG5 A; 2PVD B; 1AT1 B; 2PNI A; 1TG0 A; 1I5L A; 2GCX A; 5C6S A; 2COY A; 3EGD A; 4FT2 A; 1WYX A; 1Q82 R; 2QI2 A; 4JRP A; 1R8O B; 2BTT A; 4AFZ C; 1WXT A; 1RAE B; 1QLY A; 1Y0M A; 4XU1 A; 2KSS A; 4OML A; 1RAH B; 1VA7 A; 3OW2 P; 2YUQ A; 5KYY A; 3QO3 A; 4FL6 A; 4M77 G; 4XTU A; 4B9X A; 2XG8 D; 1PC0 A; 1ZSZ A; 4PL6 A; 1KQS P; 1SKU B; 2OTJ Q; 2X3W D; 3DLM A; 4F04 B; 2ZPI B; 4NL2 A; 3VKI A; 5FWB A; 2HD0 A; 4M78 A; 1YI2 A; 1I4K 1; 3AT1 B; 1ZA1 B; 3QZ5 B; 4M4Z A; 2CSQ A; 2HEQ A; 4HVV A; 1RAD B; 3O8V A; 3EGU A; 3CME T; 4KUI A; 1V29 B; 2J6F A; 4AG2 C; 3OMG A; 4C8Q A; 3SHW A; 1VQP Q; 2H3E B; 2V8J A; 3I55 A; 2F2X A; 3KUF A; 4KH1 B; 2ESW A; 4M78 E; 2KNB B; 1KQ2 A; 3ZL7 C; 1PSE A; 1H8K A; 3G7Z A; 4Q5W A; 3UDC A; 4FCY A; 1AWO A; 2HZY A; 1IO6 A; 1LOJ A; 1VQL A; 3MEU A; 3QPH A; 3GF5 A; 5LJ3 e; 5LJ5 g; 1VQ5 T; 4C8Q E; 1U06 A; 3VRZ A; 1IZ6 A; 5KYN A; 2A37 A; 3VV0 A; 3CBP A; 4Y92 A; 2CDT A; 3CXC P; 1M8V A; 2DIQ A; 1NLO C; 3KFV A; 2GTJ A; 3OMC A; 3OYI A; 1NYF A; 1W2B P; 1TUC A; 1G3Y A; 3M0P A; 4M75 F; 4RG2 A; 2MCN A; 2R58 A; 1W4S A; 1PRL C; 3VS0 A; 5FW9 A; 4M7A A; 1U8R A; 2KT8 A; 2ZPB B; 1RAA B; 5FU7 C; 1NG2 A; 1H92 A; 2KMT A; 5IHN A; 1PG5 B; 3AHU A; 3OBY A; 2A08 A; 2DZ9 A; 5ECA A; 2EJG A; 2DTI A; 5CR2 A; 1W70 A; 2KGT A; 2NUP A; 2EPD A; 5KYW A; 4FW1 A; 2DK3 A; 3MP6 A; 5I2M A; 4M7A E; 3MJX A; 2XD0 A; 3OYK A; 4J8O A; 2KEA A; 2QQ9 A; 3HRS A; 1OX8 A; 2QA4 A; 4DA4 A; 3PIO A; 1UGV A; 1ACM B; 3V8L A; 3EHR A; 4HCC A; 2KQW A; 2HDA A; 3NMZ C; 4FIB A; 1M1G A; 1D1C A; 1AWX A; 1BI2 A; 5FU6 B; 3A8O B; 2CYZ B; 3UAT A; 1JEG A; 3J80 E; 1X2K A; 2LTO A; 1Z9Z A; 4EIK A; 3A8H B; 4F7U A; 5A0L A; 5LJ5 e; 3RKW A; 5GAM f; 3GLX A; 4R0K A; 5J26 A; 1OV3 A; 3S3N A; 1YI2 T; 5GAO r; 1K73 U; 5HKC A; 2FG0 A; 1VQN A; 3SWN C; 1B7T A; 2KXD A; 2V8I A; 2GGR A; 1B34 A; 2FVU A; 1QVG A; 1I07 A; 2VGN A; 3RUX A; 2JN0 A; 3L2W A; 2BZ8 A; 2L3S A; 1I8F A; 4MDW A; 3OS1 A; 3QBY A; 2DNU A; 3I55 T; 3E2U A; 1FMV A; 3CC2 A; 4RTV A; 2V26 A; 2KRO A; 4MML A; 4TVR A; 4N0A A; 5KYY B; 1QVF A; 2FZG B; 2MPX C; 2DLP A; 2VXF A; 3HRT A; 3OB9 A; 1VQM Q; 2K4Y A; 2YRD A; 1D0X A; 2EJ9 A; 1PWT A; 2RH2 A; 1IHW A; 4IIO A; 1A0N B; 4BY6 C; 3G6E A; 1WIE A; 1VQL T; 4RKU E; 1EZZ B; 3GP8 A; 2NLU A; 1PD0 A; 2VAS A; 2D6F A; 2EKO A; 2RI3 A; 1ABO A; 1M4Z A; 3MEA A; 2PZ1 A; 4RMO A; 1NBE B; 3VS2 A; 2RPN A; 2RMO A; 1KHC A; 4BI4 A; 4M7D A; 3VRY A; 2DXC A; 3CBO A; 3CBM A; 3JAM E; 4C8Q B; 5HK3 A; 4C0D B; 2LC4 A; 4QW2 A; 2ZPF B; 5IHI A; 1KG1 A; 3L2Q A; 2F5T X; 2KRS A; 4O6J A; 4EMK C; 2MMP A; 2K2M A; 1IB8 A; 3JB9 H; 1WNL A; 2KYM A; 2VWF A; 4IUQ A; 1M27 C; 3MEW A; 3HKS A; 1VQ6 A; 4M7D E; 4ZTF A; 2JJ9 A; 3FLG A; 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