The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
LFVALYDYQADRWTDLSFHKGEKFQILDASPPGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPV
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Generation, Characterization and Structural Data of Chymase Binding Proteins Based on the Human Fyn Kinase SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CHYMASE
|
| molecule tags |
Hydrolase/de novo protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
10
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1WFW A; 2EYY A; 2QDL A; 2DNU A; 3EG3 A; 1RLQ C; 1QKX A; 2L2P A; 2JMA A; 2RQV A; 1BK2 A; 1X69 A; 3VS5 A; 1GCQ A; 3H0F A; 1UJ0 A; 2EYW A; 2ECZ A; 1QCF A; 2K7A A; 4ZNX A; 4CC7 A; 5L23 A; 2KXD A; 2ROT A; 1RUW A; 1TG0 A; 4LUD A; 2LCS A; 3VS6 A; 1SHF A; 4Z89 A; 2ABL A; 1VYU A; 1T0H A; 3QWY A; 2CT3 A; 2KGT A; 2C0O A; 1W6X A; 4ORZ A; 2DBK A; 4JPB W; 1AVZ C; 2KBT A; 1NM7 A; 2KYB A; 2BZX A; 2ENM A; 1V1C A; 5I11 A; 1I1J A; 1AD5 A; 4CC4 B; 2JT4 A; 1AZG B; 4AFU C; 1AWW A; 3O5Z A; 3M0Q A; 4M4Z A; 2L0A A; 1UDL A; 2GBQ A; 2DF6 A; 1UE9 A; 3I5R A; 2FG0 A; 3UAT A; 3FJ5 A; 2JW4 A; 2AZV A; 5FWC A; 2KT1 A; 2KT8 A; 2MCN A; 1E7O A; 4OMQ A; 3UA6 A; 2HDA A; 1ZX6 A; 2X3W D; 1KFZ A; 3UF4 A; 3JV3 A; 1YCS B; 1IO6 A; 2GQI A; 1ABO A; 1CKB A; 1PNJ A; 4X1V A; 1S1N A; 4HVW A; 2DL4 A; 1PKS A; 1UGV A; 4R0K A; 3TVT A; 1KJW A; 1H8K A; 1PHT A; 3NPF A; 4F14 A; 1NLP C; 2D1X A; 3NHN A; 2RQT A; 3I35 A; 3LH5 A; 1T0J A; 3ZL7 C; 2H8H A; 2MIO A; 4OMP A; 2KR3 A; 4HXJ A; 3CQT A; 1J3T A; 1E6H A; 2VVK A; 2DM1 A; 2ESW A; 2LQW A; 3GBQ A; 2L3P A; 4RUG A; 3VS1 A; 4J9H A; 2G6F X; 2BTT A; 2D8J A; 1MV3 A; 2O9S A; 3U23 A; 1RI9 A; 3I9Q A; 5IXF A; 1E6G A; 4A63 B; 1UEC A; 1WXB A; 4K11 A; 3VS0 A; 5IXB A; 1CSK A; 1I07 A; 3SHW A; 1BU1 A; 1MV0 B; 2RMO A; 3KFV A; 2KXC A; 2VKN A; 3VS7 A; 1LCK A; 4RTT A; 2VWF A; 1UUE A; 1I0C A; 4AG1 C; 1RLP C; 4CC3 A; 4RTY A; 1AWO A; 2PZ1 A; 1W70 A; 2W0Z A; 2RQR A; 5GJW B; 4J9G A; 2RPN A; 1ABQ A; 2DBM A; 2ED1 A; 4Z8A A; 2W10 A; 1U3O A; 3UA7 A; 2OAW A; 2RNA A; 2BZ8 A; 3M0R A; 1ZBJ A; 1SRL A; 2NWM A; 3VRY A; 2I0N A; 2LJ1 A; 1SEM A; 4Z88 A; 1T3L A; 2DRK A; 3VRZ A; 1AOJ A; 4LUE A; 1ZSG A; 3H0I A; 2CUD A; 1WDX A; 2L3Q A; 3SEM A; 1Y57 A; 1M3A A; 4AFS C; 1YWO A; 4GBQ A; 1VA7 A; 5FWB A; 3REB B; 1X2K A; 1M30 A; 2DL7 A; 2V1Q A; 2PTK A; 4DEX A; 4JJB A; 4OML A; 1Z9Q A; 1ZUU A; 2YUN A; 4F16 A; 5IHI A; 2JXB A; 2M51 A; 2A08 A; 3TSW A; 4HVV A; 1WX6 A; 1GCQ C; 2P4R A; 2O88 A; 5HCK A; 1GFD A; 4F17 A; 2F2V A; 1NYF A; 4OMN A; 2LNH B; 2LMJ A; 2CH4 A; 1K1Z A; 2SEM A; 2K9G A; 1QWE A; 3ULR B; 2EYX A; 2DLP A; 1WA7 A; 2RQU A; 3PVL A; 4Y92 A; 1PKT A; 1SPK A; 1WXU A; 2J7I A; 4LE9 A; 1K9A A; 3H0H A; 4CC2 A; 2EKH A; 2MOX A; 4AFZ C; 1WI7 A; 2ROL A; 1OPL A; 4RTW A; 1HSQ A; 1BB9 A; 2FPD A; 4EIK A; 3TSZ A; 2DL5 A; 1ZLM A; 5IHN A; 2GTO A; 2DE0 X; 3M0T A; 3R6N A; 1OV3 A; 1UHF A; 1NYG A; 3EHQ A; 1YN8 A; 1K76 A; 2EVR A; 1W1F A; 4AG2 C; 3PVQ A; 2K2M A; 1X6B A; 2EBP A; 4D8D A; 3M0U A; 3VS4 A; 4JZ3 A; 2JTE A; 2YSQ A; 1HJD A; 1K0S A; 2K79 A; 2L3S A; 2CT4 A; 2DA9 A; 2YUO A; 2LJ3 A; 1NEB A; 2A37 A; 3THK A; 2EPD A; 1JO8 A; 1WIE A; 2F2W A; 2HEQ A; 4RTV A; 4J9B A; 1MUZ A; 1N5Z A; 2FPF A; 2YUQ A; 2DYB A; 3EHR A; 2AKK A; 2OI3 A; 1YP5 A; 4GLM A; 3RNJ A; 2JS0 A; 1ZUY A; 5I22 A; 1QWF A; 2C0I A; 2AZS A; 1NG2 A; 1AEY A; 1M3B A; 2AK5 A; 2B86 A; 2HBW A; 5ECA A; 3RBB B; 1OPK A; 1B07 A; 2KRN A; 2CH4 W; 2E5K A; 1UJY A; 4E6R A; 4QT7 A; 4LN2 A; 1Z9Z A; 4JJD A; 2O9V A; 2CSI A; 2FO0 A; 1NEG A; 2O31 A; 4IIM A; 2LJ0 A; 2EGA A; 3M0S A; 2GGR A; 2DIL A; 3PE0 A; 1SSH A; 2A28 A; 1PWT A; 1M3C A; 1X27 A; 5FW9 A; 1YNZ A; 2CRE A; 2JM8 A; 2F2X A; 1G2B A; 2J6K A; 3M0P A; 2LZ6 B; 2JS2 A; 2YUP A; 2K6D A; 2J6F A; 2KYM A; 1G83 A; 5GJV B; 1GCP A; 4WCI A; 2O2O A; 3EG1 A; 2DL3 A; 2EQI A; 2JM9 A; 3EG0 A; 3NMZ C; 4ESR A; 2HSP A; 2DL8 A; 2RQW A; 1JU5 C; 2OJ2 A; 2FPE A; 2J05 A; 5IH2 A; 2GTJ A; 4KRT A; 4RTU A; 1KSW A; 1YWP A; 2FRY A; 2GNC A; 1U06 A; 1KIK A; 1TUD A; 1GRI A; 4D8K A; 5IHK A; 2YDL A; 1UHC A; 2DX1 A; 4HCK A; 2AKL A; 4J9F A; 2D0N A; 2KRM A; 1M8M A; 2ED0 A; 2K3B A; 2DVJ A; 1BBZ A; 3A98 A; 2X3X D; 1AWJ A; 2RF0 A; 2NUZ A; 2FRW A; 2CDT A; 4J9D A; 1T3S A; 3IQL A; 1UG1 A; 1M27 C; 2HCK A; 1WYX A; 1OEB A; 1SHG A; 2SRC A; 1K4U S; 2JMC A; 4DEY A; 2BZY A; 2DMO A; 1QKW A; 1GL5 A; 1UTI A; 2C0T A; 1X6G A; 2LX7 A; 2LQN A; 4RTX A; 1B3Q A; 1WLP B; 2EGE A; 1UFF A; 1GBQ A; 3VS3 A; 1WXT A; 2LP5 A; 2KRO A; 1XOV A; 3H41 A; 2CSQ A; 2YT6 A; 2DJQ A; 1QLY A; 1JQQ A; 1ARK A; 4OMO A; 1H92 A; 3NGP A; 4FSS A; 2DRM A; 2PNI A; 1H3H A; 1SRM A; 4J9C A; 1PRL C; 4LNP A; 2CUB A; 4AFQ C; 2FEI A; 2IIM A; 2M0Y A; 1Y0M A; 1ZUK A; 2KNB B; 4OMM A; 2RN8 A; 2V1R A; 1AWX A; 2J06 A; 4J9E A; 3I5S A; 4HVU A; 1EFN A; 3QWX X; 4JZ4 A; 1JXM A; 1TUC A; 1OOT A; 1X2Q A; 1X43 A; 3EG2 A; 1GBR A; 2XMF A; 1A0N B; 4IIO A; 1VYV A; 2KE9 A; 2EYZ A; 1GFC A; 2KEA A; 1U5S A; 3EGU A; 5EC7 A; 2A36 A; 1PRM C; 3C0C A; 1CKA A; 1NLO C; 4RTZ A; 2EW3 A; 1FYN A; 2KRS A; 3REA B; 2D8H A; 3VS2 A; 1JXO A; 1AZE A; 1JEG A; 1HD3 A; 1K0X A; 2EGC A; 4JJC A; 4J9I A; 2J6O A; 1FMK A; 1VYT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DNU A; 1RLQ C; 4JLI A; 1UGP B; 5HK0 A; 4LDW A; 4LDV A; 1X69 A; 2VGN A; 4C92 E; 2EYW A; 2QYZ A; 3CME Q; 4XU1 A; 2ZPF B; 1Q86 R; 4M78 C; 2KXD A; 2ROT A; 5GAO r; 3EFS A; 2DTH A; 2EQM A; 3S3O A; 2ABL A; 1VYU A; 2NUP A; 3V8J A; 4ORZ A; 4EMG A; 1WHK A; 2KBT A; 2OTJ Q; 4CRI A; 4X34 A; 2ENM A; 5I11 A; 3CD6 T; 4J6W A; 3O5Z A; 4M4Z A; 3CCM A; 2RA2 A; 5GAN 6; 1LNX A; 3CBM A; 3JCM d; 3I5R A; 1VQ7 A; 5LJ3 j; 3UA6 A; 3M54 A; 1ZQ1 A; 4OB0 B; 1KFZ A; 3FB9 A; 3JV3 A; 4E7I A; 2D9T A; 5GAM f; 1U1S A; 4J6Y A; 3RER A; 2E4H A; 4HVW A; 2ZPE B; 2DL4 A; 5FLX E; 2E64 A; 4C92 B; 1PKS A; 4MMK A; 2FHD A; 3JCM P; 2Y4Y A; 3CBP A; 5FU7 C; 1IHV A; 1YJ9 T; 5GMK e; 3MO8 A; 3S3M A; 2R5A A; 1BI3 A; 4EMH A; 1XJW B; 4ANJ A; 1QW1 A; 2QQ9 A; 1SF9 A; 2RQT A; 2E65 A; 1T0J A; 3OYD A; 2QDY B; 2ZGW A; 3L42 A; 3N5B B; 4XTU A; 1VQ8 Q; 1ZA1 B; 4ZTJ A; 4J83 A; 1BI1 A; 2ESW A; 1KC8 C; 3EGX B; 2BTT A; 2XHC A; 5KYY A; 2O4X A; 2COW A; 3FJP A; 1C1A A; 3TU4 K; 2H3E B; 1WHJ A; 4MDX A; 3I9Q A; 3I55 Q; 4M78 D; 1WXB A; 3VS0 A; 1KG1 A; 1M8V A; 2RMO A; 3ZEH A; 3KFV A; 2KXC A; 2MI6 A; 4J7F A; 1NE8 A; 4M78 A; 1M5Q 1; 3OB9 A; 2FVU A; 2Z0W A; 3PGG A; 1Q82 R; 4M77 F; 1SG5 A; 4M7A F; 4E2F B; 3M59 A; 3QSU A; 1RAC B; 3CCR A; 8AT1 B; 1VQL A; 5LJ5 j; 1QVG P; 2ED1 A; 1M90 U; 1U3O A; 2LNV A; 2K3X A; 4C5I A; 2GQV A; 5CQY A; 2RNA A; 2XU8 A; 3CEY A; 4M75 C; 2LJ1 A; 2JNG A; 2LT1 A; 4Z88 A; 4OMF B; 3P8B B; 4ELZ C; 4PJO D; 2DRK A; 1Y96 B; 8ATC B; 2X4X A; 3FDR A; 1Q86 U; 3SWN B; 2CUD A; 3G6E T; 2L3Q A; 3SEM A; 1Y57 A; 2CGH A; 4PJO A; 3MEU A; 5FWB A; 4XU0 A; 2QG9 B; 4Q5W A; 2ZPH B; 4Z02 A; 3OBW A; 5HK3 A; 3CC2 T; 7AT1 B; 2RI5 A; 3E1S A; 4JS5 A; 3G71 Q; 3KBG A; 2LVM A; 3CCQ T; 2JXB A; 3A1P A; 2P4R A; 2PVG B; 4O6J A; 3C12 A; 2O88 A; 1NZ9 A; 5HCK A; 3L2W A; 4F17 A; 2R5M A; 5GAN g; 2CH4 A; 4JRI A; 3X26 B; 2VXF A; 1D0Y A; 3QDF A; 2HZY A; 1M4Z A; 1SPK A; 1WXU A; 3JB9 H; 1TSF A; 4LE9 A; 4M77 C; 2EKH A; 4AFZ C; 2RD1 A; 1WI7 A; 4LDU A; 5LJ3 h; 3UWN A; 1GXI E; 1HSQ A; 4EIK A; 3CMA Q; 3A8H B; 4RCC A; 3HRU A; 3CME A; 5KYX B; 4ME7 A; 2R57 A; 3M0T A; 1XTD A; 2DYI A; 1OV3 A; 1UHF A; 4FT2 A; 2HKQ B; 3EFR A; 1TU0 B; 1W1F A; 4FU6 A; 1MMN A; 2EFI A; 2EBP A; 5DM7 R; 3PMT A; 4KBM B; 3HP9 A; 3G7Z A; 4M78 G; 3OW2 P; 1S72 T; 2AT1 B; 3CC7 T; 2X4W A; 1HJD A; 1VQK Q; 2CT4 A; 2DA9 A; 3URG A; 2E41 A; 2ATC B; 3OSV A; 1BKB A; 4C0D B; 3G4S Q; 5KYU A; 2F2W A; 1K9M C; 2HEQ A; 4RTV A; 2RM4 A; 1ZBX A; 1K8A C; 3AT1 B; 3S3N A; 1Q95 G; 3EHR A; 1YP5 A; 1FX7 A; 1PG5 B; 4RCB A; 2QQA A; 3MEV A; 1NG2 A; 1M3B A; 3QJ6 A; 5ECA A; 1YIJ Q; 3NFC A; 1B07 A; 3VJP A; 2KRN A; 4JRQ A; 1VQO T; 2CH4 W; 3JB9 G; 4L6V 5; 1VQ9 T; 1BYM A; 1WHM A; 1D0Z A; 2DO3 A; 4PJO G; 2O9V A; 1NPP A; 2CSI A; 5L8R E; 3DLM A; 4XTZ A; 1Q82 U; 3OYC A; 1N9S A; 2GGR A; 2QQR A; 1KQS P; 4ZN1 A; 3DB4 A; 2A28 A; 1M3C A; 3V7R A; 1X27 A; 3JCM X; 3CCV T; 4FYV B; 1OX8 A; 2DEQ A; 2X51 A; 5LJ5 h; 2CZ6 B; 3L2Z A; 2RHI A; 2LCC A; 2LZ6 B; 2XID A; 4F7U F; 3I56 T; 2J6F A; 3DLL A; 5CKE A; 1VQN Q; 4HT8 A; 4M7A D; 1MMG A; 1JJ2 P; 1YBY A; 3OYM A; 5GMK l; 4BI4 A; 3NMZ C; 1G3W A; 2YRD A; 1RAB B; 4M7A A; 4MML A; 5A0L A; 5IH2 A; 3I55 A; 2GTJ A; 4OB2 B; 3CC4 Q; 1H64 1; 4RTU A; 2FRY A; 1U06 A; 2NUP B; 1ZA2 B; 4XTY A; 4D8K A; 2YDL A; 1UHC A; 2P84 A; 3ZFJ A; 3PIO A; 2AKL A; 2KRM A; 1YJN T; 3JSC A; 4M7D F; 1M8M A; 4P5N A; 2K3B A; 3LYI A; 4AT1 B; 2X3X D; 2NUZ A; 3IQL A; 5CKH A; 1MMD A; 5D6Y A; 2HCK A; 1VQ6 Q; 3HSB A; 2BE7 D; 1IXD A; 1M1K C; 4A4F A; 2DMO A; 1QKW A; 1G8X A; 1UTI A; 2EKO A; 4OGE A; 2RI2 A; 4M78 E; 1X6G A; 2LX7 A; 5A0D A; 3OYA A; 2LQN A; 3OYE A; 5FU6 C; 4LD9 K; 2FZK B; 1MNE A; 2LP5 A; 2CP3 A; 3CCU T; 1VQM T; 5LJ3 g; 1JQQ A; 1ARK A; 1H92 A; 5GAN 3; 2XD0 A; 1WJQ A; 2B8A A; 1LVK A; 4QQG A; 3H8Z A; 2K2V A; 1SRM A; 4N4H A; 1PRL C; 2L3R A; 1BI0 A; 2YLB A; 3EH1 A; 2IIM A; 2FZG B; 1TTH B; 4PJJ A; 5HKC A; 2MYS A; 2KNB B; 4N0A C; 2CP0 A; 4O5V A; 4HVU A; 1EFN A; 3QWX X; 1JXM A; 2EJF A; 4E7Z A; 1TUC A; 3UT1 A; 1D3B A; 4PFO A; 3CCM Q; 4PJO E; 4KGX B; 5GMK i; 2XMF A; 1N8R R; 5GAN d; 3BY7 A; 1A0N B; 1VYV A; 2KE9 A; 5KYY B; 2EYZ A; 2O4X B; 2A36 A; 5I2S A; 4RTZ A; 1CKA A; 2EW3 A; 2KRS A; 2R58 A; 3J81 E; 3OYN A; 1X6O A; 1JXO A; 1ZSZ A; 2E6Z A; 2K4Y A; 3JCM W; 3MHX A; 1B34 A; 2EYY A; 3LLR A; 2QDL A; 4M77 G; 4FCY A; 4M7A G; 1QKX A; 2DET A; 2L2P A; 2JMA A; 2RQV A; 5KE2 A; 3EG9 A; 5D6W A; 3RIR A; 1QCF A; 3GNG A; 1TUG B; 2DXT A; 2VGM A; 5L23 A; 2V8K A; 1RUW A; 1PSE A; 3P8D A; 3R6O A; 2QA4 T; 3VS6 A; 4HT9 A; 1VQK A; 2NYS A; 2C06 A; 1T0H A; 5LJ5 g; 2C0O A; 4BD3 A; 1RAD B; 2KVQ G; 5AYF A; 2MK5 A; 3OYF A; 5LL6 S; 3JCM f; 2BZX A; 2RHX A; 1V1C A; 4PJO B; 1IRE B; 1I1J A; 1RAG B; 4CC4 B; 1V29 B; 2LCL A; 1IGU A; 2KMT A; 4AFU C; 1AWW A; 3M0Q A; 3C95 A; 2OTJ T; 1PSF A; 2DD4 A; 2EJG A; 4XU3 A; 3UAT A; 2JW4 A; 3OMC A; 2MCN A; 1E7O A; 2BKD N; 3LGL A; 4F7U A; 1QP3 A; 2X3W D; 2HQX A; 3UF4 A; 4AMC A; 1IO6 A; 2GQI A; 1SKU B; 3QO3 A; 1ABO A; 2JVV A; 3CCR Q; 1VQL Q; 2XDB A; 4MDW A; 1S1N A; 5GAO n; 1UB4 A; 2E6N A; 3O8V A; 1NJI C; 4V2S A; 1UGV A; 4FSX A; 1MND A; 2QAZ A; 4ELY C; 2IPO B; 2I2L A; 1LJO A; 2JTM A; 1DJ7 B; 4M7D D; 1VQN A; 4KH0 B; 1YJW A; 5CK9 A; 1PCX A; 3QPH A; 2E12 A; 3I35 A; 1YIT A; 4M7D A; 4DBF A; 4L59 A; 4OMP A; 4R56 A; 3ASK A; 4RUG A; 2G6F X; 4XQ3 A; 3CC4 A; 1R8O B; 4PJM A; 1RI9 A; 2M16 A; 5IXF A; 5J26 A; 1VQ8 T; 4A63 B; 2RJD A; 2FZC B; 2VV5 A; 3JRZ A; 4EMK A; 2QGF B; 1I07 A; 5KYU B; 3SHW A; 2KI7 A; 1KD1 C; 1BU1 A; 1MV0 B; 1KQS A; 2DXB A; 3LH0 A; 4M77 E; 2K5I A; 1EIF A; 1M2O A; 4M7A E; 4X9C A; 3OYG A; 5KCH A; 1I0C A; 2DZC A; 1RLP C; 4CC3 A; 2QQS A; 2PZ1 A; 1VQ6 A; 1M90 R; 2W0Z A; 2L89 A; 3QZ5 B; 2RK1 A; 2RPN A; 4KGZ B; 2OTL Q; 2W10 A; 1X75 C; 2COY A; 2XK0 A; 1WJS A; 4BE1 A; 1JJ2 A; 3M0R A; 3CBO A; 1BIB A; 2I0N A; 2Y90 A; 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