The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
LFVALYDYQADRWTDLSFHKGEKFQILDASPPGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPV
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Generation, Characterization and Structural Data of Chymase Binding Proteins Based on the Human Fyn Kinase SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CHYMASE
|
| molecule tags |
Hydrolase/de novo protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
10
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| chains with identical sequence |
D
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2D8J A; 2CSI A; 2CT3 A; 3CQT A; 1NYG A; 1SHG A; 3M0U A; 2RPN A; 1RLP C; 1MV3 A; 4LUE A; 3TVT A; 2J06 A; 3UA6 A; 2CH4 W; 3M0T A; 4AG2 C; 1CSK A; 1NEG A; 3FJ5 A; 2YUQ A; 3KFV A; 2ROT A; 2D0N A; 2KXC A; 2VKN A; 2KT8 A; 4AG1 C; 1M30 A; 2D1X A; 4K11 A; 1W6X A; 2O31 A; 4CC3 A; 4HXJ A; 1RUW A; 2KRM A; 2X3W D; 1PKT A; 2B86 A; 2EVR A; 2FG0 A; 2YUO A; 1ABO A; 2LJ0 A; 1GBR A; 1OOT A; 2OAW A; 2CT4 A; 4ZNX A; 1H8K A; 2JT4 A; 1RI9 A; 1J3T A; 1WXT A; 2KRS A; 1YNZ A; 3UF4 A; 1K0X A; 5IH2 A; 2FEI A; 2RQU A; 1WI7 A; 1QKX A; 3H0I A; 1WIE A; 3VS4 A; 1ZUU A; 3EG2 A; 5IHI A; 3NHN A; 1K76 A; 1PKS A; 2E5K A; 1BB9 A; 2AZS A; 1SPK A; 3NGP A; 1T0J A; 1UE9 A; 3VRZ A; 4Z8A A; 3U23 A; 1YCS B; 2YT6 A; 2PZ1 A; 3NMZ C; 2K2M A; 3SEM A; 1ABQ A; 1JXM A; 4RTZ A; 2LJ1 A; 4J9C A; 2J7I A; 2F2V A; 2MOX A; 2GTO A; 4OMQ A; 3IQL A; 2KGT A; 4OMO A; 2KYB A; 4D8K A; 4CC7 A; 2AKK A; 3H0F A; 2EYY A; 2H8H A; 1T0H A; 4HVV A; 3H0H A; 1WA7 A; 4RTY A; 3QWX X; 2ROL A; 2DIL A; 4J9H A; 4F16 A; 2JS0 A; 2DL5 A; 4RTV A; 2MCN A; 3EGU A; 2P4R A; 1NM7 A; 1ARK A; 4LN2 A; 2A28 A; 1AWJ A; 1UG1 A; 1VYV A; 2BZ8 A; 4QT7 A; 2KXD A; 4Z88 A; 2RN8 A; 3VS7 A; 5IXB A; 1RLQ C; 1GFC A; 2DVJ A; 2ENM A; 1HJD A; 2C0O A; 5IHK A; 4RTW A; 2RQR A; 4ORZ A; 1B3Q A; 3VS2 A; 5IXF A; 1GFD A; 1PHT A; 4AFU C; 1ZBJ A; 3EG3 A; 1UTI A; 1XOV A; 1FYN A; 1HSQ A; 3PE0 A; 1B07 A; 1FMK A; 2HBW A; 1CKB A; 4D8D A; 1ZX6 A; 2HEQ A; 2RNA A; 3M0R A; 1JQQ A; 4F17 A; 1UHF A; 1AEY A; 1MV0 B; 4HVW A; 2YUP A; 2ED0 A; 1GCQ A; 2L3S A; 2VWF A; 2V1Q A; 1UEC A; 2LQN A; 4J9F A; 4RTT A; 1Z9Z A; 3PVQ A; 1UFF A; 1VYU A; 1W70 A; 2XMF A; 1YWO A; 1GL5 A; 2M0Y A; 1X69 A; 5HCK A; 2DE0 X; 2LMJ A; 2ECZ A; 1ZSG A; 2DM1 A; 1PRL C; 1QLY A; 1NYF A; 1QWF A; 2EKH A; 2KRO A; 2KEA A; 2BTT A; 2DA9 A; 2YUN A; 2KYM A; 2DMO A; 2V1R A; 1GBQ A; 2DL7 A; 1X6B A; 4F14 A; 2JMC A; 2K6D A; 2RF0 A; 2ESW A; 3M0S A; 1WXU A; 1UHC A; 2JM8 A; 2L0A A; 4JZ4 A; 4RTU A; 1EFN A; 5FW9 A; 1M8M A; 2EYW A; 1SRL A; 2K3B A; 2LX7 A; 1VA7 A; 4LE9 A; 2FPD A; 1TUD A; 1ZUY A; 1U3O A; 1H3H A; 3REA B; 1W1F A; 2GNC A; 4LUD A; 1JXO A; 3PVL A; 4OMP A; 2K7A A; 1UUE A; 1OEB A; 1PWT A; 2DJQ A; 1NLO C; 2F2X A; 1GCQ C; 4JZ3 A; 1QKW A; 4FSS A; 1SEM A; 2YSQ A; 2RQT A; 2GQI A; 2NWM A; 2DL4 A; 1WFW A; 1AD5 A; 4JJC A; 4CC4 B; 2HCK A; 1SHF A; 3GBQ A; 4J9D A; 1WXB A; 2LJ3 A; 3VS0 A; 2AK5 A; 5ECA A; 2DL3 A; 2DYB A; 1N5Z A; 2CUB A; 4Y92 A; 3JV3 A; 2LQW A; 5GJW B; 4CC2 A; 2EQI A; 2J05 A; 3UAT A; 2L2P A; 1A0N B; 2HSP A; 2FRY A; 2CUD A; 1V1C A; 2O9V A; 2JS2 A; 4J9E A; 2SRC A; 4AFZ C; 2QDL A; 2X3X D; 4J9G A; 3VRY A; 2A08 A; 1Y0M A; 5I11 A; 2CDT A; 1K9A A; 3H41 A; 2PTK A; 1UDL A; 1G83 A; 1ZUK A; 1UGV A; 2J6F A; 2W0Z A; 3VS1 A; 1OV3 A; 2EGA A; 1QCF A; 2I0N A; 1YP5 A; 1VYT A; 3TSZ A; 2KE9 A; 3SHW A; 1H92 A; 4A63 B; 1PRM C; 1Y57 A; 1AVZ C; 1IO6 A; 2K9G A; 2BZX A; 2JM9 A; 1M27 C; 2NUZ A; 3EHR A; 1X2K A; 1U5S A; 4J9I A; 2A37 A; 2CRE A; 4JJD A; 2O2O A; 3EG1 A; 2KRN A; 2PNI A; 3TSW A; 2EGE A; 2DF6 A; 3I35 A; 2JW4 A; 2MIO A; 4AFS C; 2GBQ A; 3LH5 A; 3M0Q A; 2OJ2 A; 2FO0 A; 1JEG A; 1PNJ A; 4IIM A; 1BU1 A; 2J6K A; 2YDL A; 2C0T A; 2LNH B; 1OPL A; 1SSH A; 3ULR B; 1MUZ A; 1AWO A; 1WYX A; 2BZY A; 1U06 A; 5IHN A; 2ABL A; 2J6O A; 4LNP A; 1HD3 A; 4AFQ C; 4HVU A; 3VS3 A; 3VS5 A; 2KT1 A; 2A36 A; 2GGR A; 1CKA A; 2HDA A; 4DEX A; 2EBP A; 1S1N A; 1X27 A; 3REB B; 1G2B A; 4DEY A; 1KFZ A; 1Z9Q A; 2CH4 A; 2DNU A; 3VS6 A; 1K1Z A; 2VVK A; 4E6R A; 1KIK A; 2AKL A; 4RUG A; 1TUC A; 2EGC A; 1BBZ A; 3QWY A; 3RBB B; 1M3C A; 2DX1 A; 2FPE A; 1OPK A; 1AZG B; 2K79 A; 2RQW A; 2O88 A; 4EIK A; 4ESR A; 2EYZ A; 1YN8 A; 1KSW A; 2IIM A; 4OMM A; 3A98 A; 1WX6 A; 4IIO A; 1X6G A; 2EPD A; 2D8H A; 4X1V A; 1SRM A; 1UJY A; 2SEM A; 1BK2 A; 1YWP A; 3I5R A; 1AOJ A; 2DL8 A; 2OI3 A; 2KNB B; 2JXB A; 1NG2 A; 1GRI A; 2FPF A; 1LCK A; 1AWW A; 2L3Q A; 3R6N A; 4R0K A; 2DBK A; 2LZ6 B; 1AWX A; 4OML A; 3I5S A; 2EYX A; 4GLM A; 2JMA A; 1WDX A; 1E7O A; 2DLP A; 4GBQ A; 5FWB A; 3ZL7 C; 2CSQ A; 1JU5 C; 1I1J A; 4WCI A; 2DBM A; 1X2Q A; 1ZLM A; 3M0P A; 2LCS A; 1T3L A; 1M3A A; 2KBT A; 3EHQ A; 2O9S A; 1NLP C; 5GJV B; 5EC7 A; 1GCP A; 1WLP B; 2KR3 A; 1QWE A; 2ED1 A; 2LP5 A; 2L3P A; 2RQV A; 4RTX A; 2F2W A; 3O5Z A; 1JO8 A; 1E6G A; 1UJ0 A; 3C0C A; 1E6H A; 4M4Z A; 1M3B A; 3EG0 A; 3I9Q A; 2RMO A; 4JJB A; 4JPB W; 2AZV A; 2JTE A; 1X43 A; 3RNJ A; 2M51 A; 1KJW A; 2G6F X; 4KRT A; 1I0C A; 1K4U S; 4J9B A; 1TG0 A; 1AZE A; 2EW3 A; 3NPF A; 1I07 A; 2DRM A; 2DRK A; 2C0I A; 4Z89 A; 2GTJ A; 1K0S A; 3UA7 A; 1NEB A; 2W10 A; 1T3S A; 3THK A; 4OMN A; 2FRW A; 5FWC A; 5L23 A; 4HCK A; 5I22 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CQT A; 3M0U A; 2RB6 A; 1SHG A; 4PL6 A; 5KE3 A; 2E1H A; 3MEU A; 1D0Z A; 1MV3 A; 1VQO A; 4FYY B; 3OW2 P; 1JJ2 P; 3M0T A; 1QW1 A; 3FJ5 A; 2A3L A; 2PQW A; 2VKN A; 4C8Q C; 1EX4 A; 1M1K R; 5CVI A; 4AG1 C; 3CC2 A; 4BE2 A; 4M7A E; 1VUB A; 2PUO B; 5FRN A; 4HT8 A; 1K73 U; 4CC3 A; 2FZK B; 4ATO A; 2V8K A; 3SDZ A; 4OP0 A; 1EZZ B; 1RUW A; 2X3W D; 1VQK Q; 1PKT A; 2EVR A; 2FG0 A; 1Y96 B; 3MEV A; 5CKE A; 1VQO Q; 1D1A A; 5DLO A; 1ZSZ A; 1D09 B; 2DIQ A; 5KYX A; 2FVU A; 2OAW A; 3NTH A; 2HMA A; 4M75 G; 4B9W A; 3CMA A; 1WXT A; 1RAG B; 2KRS A; 3HRT A; 2CP7 A; 1K73 C; 4PJO G; 5IH2 A; 2FEI A; 2RQU A; 1WI7 A; 1QKX A; 1WIE A; 4C5G A; 1ZUU A; 4VUB A; 1YIJ Q; 2VXF A; 3H9N A; 3RMQ A; 4X9C A; 4ME7 A; 3CPW P; 1QP3 A; 2DYI A; 4HKE A; 2LCC A; 2E70 A; 4M7A C; 3Q1J A; 3U23 A; 4XK8 E; 2XDP A; 3OYL A; 2K2M A; 1ABQ A; 1YJ9 A; 4J9C A; 4DBR A; 2F2V A; 4NS5 A; 3CCQ Q; 4OMQ A; 4X9D A; 1VQP T; 5KE2 A; 1KK7 A; 2KGT A; 2VAS A; 3M56 A; 3MEW A; 5AT1 B; 2D6F A; 3X26 B; 2AKK A; 3CCR T; 3L2R A; 2K2V A; 3VYH B; 3QG1 A; 1NE8 A; 3L2U A; 4ANJ A; 2JNG A; 1NPP A; 1N6A A; 3OYB A; 4M78 E; 1YJN Q; 4JUV A; 4F16 A; 2JS0 A; 4JRQ A; 3I56 T; 3CCE T; 3OBW A; 5LJ3 g; 1AWJ A; 4FT2 A; 1VYV A; 5GAN 2; 2OTL Q; 2B8A A; 1PSE A; 4PJM A; 1WQ7 A; 2EWN A; 4BY6 B; 3VS7 A; 4L59 A; 3RR6 A; 1S72 T; 1OU9 A; 2HAX A; 5IHK A; 2QQS A; 4FT4 A; 4JRI A; 1TU0 B; 2PVO B; 1PHT A; 5IXF A; 1GFD A; 4AFU C; 3RDV A; 4GLK A; 1FMK A; 3QUI A; 3CCV A; 1VQ9 T; 1ZBX A; 5GAN 5; 2RHU A; 3GPL A; 4F17 A; 1VQN A; 4E7S A; 2DO3 A; 2K5F A; 3EGX B; 4HVW A; 1GCQ A; 1G3W A; 3CCU A; 2V1Q A; 1QCO A; 2DVE A; 4RTT A; 4M78 C; 3PVQ A; 1EIF A; 5KYU B; 1UFF A; 1VYU A; 3OSV A; 4RMO A; 2F5T X; 2HSE B; 1GL5 A; 2A7Y A; 1X69 A; 1PCX A; 3QYG B; 1PRL C; 4A4G A; 3OB9 A; 3OMG A; 2GFU A; 1VQN Q; 2DMO A; 4KBM B; 1X6B A; 1M8V A; 4F14 A; 4JZ4 A; 1MMD A; 4RTU A; 4EMG A; 2DEQ A; 1EFN A; 2K3B A; 2LX7 A; 2FPD A; 1YHQ A; 3F70 A; 1JB0 E; 2M02 A; 2X9H A; 1VQ4 Q; 2L8D A; 3CBO A; 2HD0 A; 4LUD A; 3ASK A; 2KAF A; 4XU0 A; 2K7A A; 1OEB A; 5GAN j; 4QVZ A; 3SWN C; 3JAM E; 5GAM h; 2RQT A; 1YIT A; 1KC8 U; 4ZGD B; 2E41 A; 2HCK A; 1R77 A; 4QVC A; 1R0B G; 4XAX B; 4B6M A; 2YRD A; 1YJW A; 1D3B A; 1N5Z A; 4Y92 A; 3JV3 A; 1QVF S; 5GJW B; 2J05 A; 3HFN A; 3TU4 K; 1A0N B; 4XTX A; 1AHJ B; 2O9V A; 1KC8 C; 2V8I A; 1D1C A; 1YIT Q; 2QDL A; 2X3X D; 1Q7Y U; 3LH0 A; 3A8H B; 4RKU E; 2PTK A; 4KGX B; 3M57 A; 1M5Q 1; 2EAY A; 4TVR A; 2J6F A; 1QVF A; 2W0Z A; 2HKQ B; 4DA4 A; 1YJW Q; 2QQ9 A; 2R5M A; 2I0N A; 1PM3 A; 3TSZ A; 2KE9 A; 3SHW A; 4A63 B; 4M77 G; 5FLX E; 4JJN K; 1KQS P; 1FMV A; 2KDS A; 1AVZ C; 3PMT A; 3URG A; 1R8O B; 4PNO A; 2XDB A; 1M27 C; 3EHR A; 1Q7Y C; 4FYV B; 4J9I A; 1YI2 T; 1UB4 A; 3BDL A; 2DF6 A; 1RAI B; 2JW4 A; 2Y4Y A; 3HRU A; 3OYD A; 4AFS C; 1NJI U; 5KCO A; 3M0Q A; 2R5A A; 1JEG A; 1I81 A; 4FSX A; 5FU7 C; 2HNI A; 5LJ5 j; 2J6K A; 5GAN f; 2C0T A; 1IZ6 A; 3ER0 A; 2J6O A; 4PJJ A; 4LNP A; 2MK5 A; 3P8B B; 4CRI A; 2KT1 A; 3CCR Q; 3CPF A; 4XU2 A; 2FHD A; 2L89 A; 4M7A G; 1G2B A; 3M54 A; 3CCL A; 4DEY A; 1NJI C; 2DNU A; 4ZTJ A; 3VS6 A; 2CGH A; 3RKX A; 2DXU A; 1KIK A; 4A54 A; 3I56 Q; 3CCE Q; 3QWY A; 2M16 A; 3RBB B; 2F69 A; 3EGX A; 1AZG B; 1JRI A; 1DJ7 B; 4M75 E; 5GAN h; 3PTA A; 2V8J A; 1W2B S; 4DOW A; 2EYZ A; 4ESR A; 1BIB A; 1YN8 A; 2IIM A; 1WX6 A; 1X6G A; 5KYU A; 1S72 Q; 1D0Y A; 4FU6 A; 3CC4 T; 2V26 A; 3I5R A; 1NG2 A; 1IB8 A; 1TOV A; 1VQM T; 1K73 R; 1VQ9 Q; 3R6N A; 1W2B A; 3BY7 A; 3A8G B; 4R0K A; 5CQY A; 2K5L A; 4Y28 E; 2LZ6 B; 1LNX A; 2CYZ B; 2E3I A; 4A4F A; 4OB3 B; 5CKD A; 2JMA A; 1E7O A; 2RA2 A; 4ZGJ B; 2CSQ A; 2FL7 A; 1BYM A; 2XIC A; 4N4I A; 1BI3 A; 2BE7 D; 2RD1 A; 2DBM A; 1ZLM A; 2LCS A; 4J8O A; 1WHJ A; 2QAS A; 4M75 C; 1WHK A; 4OB0 B; 5GAN e; 4WF2 A; 2KVQ G; 2O9S A; 1NLP C; 3QZ5 B; 5GJV B; 1GCP A; 4XTY A; 5LJ3 d; 4PJO C; 5LJ5 f; 1M4Z A; 3QYH B; 2QA4 A; 1JO8 A; 1TSF A; 3PIP A; 1M2V B; 1VQO T; 2LX9 A; 3S3O A; 2EQM A; 4C0D B; 4JPB W; 2AZV A; 3OQ5 A; 3OW2 S; 2COW A; 4C92 F; 1JJ2 S; 2LVM A; 2YRV A; 3CC2 T; 2G6F X; 4KRT A; 4A4E A; 4J9B A; 1TG0 A; 1AZE A; 3GNF B; 5GAO n; 2EW3 A; 3NPF A; 2DRM A; 2FZG B; 3M55 A; 1LVK A; 4Q5W A; 1YIJ T; 1ACM B; 1NEB A; 1T3S A; 2LCL A; 3LWH A; 2EJG A; 3OW2 A; 1JJ2 A; 3VUZ A; 1IRX A; 4V2S A; 1ZSZ B; 2D8J A; 3JB9 G; 2CT3 A; 4C92 A; 1G5V A; 1OI1 A; 2RPN A; 1RLP C; 3G1J A; 4XTV A; 4EMK B; 2MF2 A; 4XTZ A; 2M9U A; 4JS5 A; 4OGC A; 1PSF A; 2IPO B; 1XJW B; 1BI2 A; 2KXC A; 2DXT A; 2E10 A; 4EPC A; 1ZA2 B; 1AT1 B; 2JN0 A; 2K3Y A; 2DKG A; 1W6X A; 1O9S A; 3CPW S; 2XD0 A; 2ZPE B; 3MP1 A; 1B34 A; 1KHI A; 3I55 A; 4LDU A; 4P5N A; 3INZ A; 2DET A; 4PFO A; 3MPU B; 4E7Z A; 2CP5 A; 3EH2 A; 1TXQ A; 1RAA B; 4HT9 A; 1RAE B; 2IVW A; 2GF7 A; 4ZNX A; 3CPW A; 3JCM g; 1J3T A; 1TWB A; 2RO0 A; 4ZN1 A; 5D7U A; 1VQ8 A; 4R55 A; 1MNE A; 2DEU A; 3EG2 A; 5IHI A; 4C0D C; 1XQH A; 1RI0 A; 5FRO A; 2OTJ A; 4OB2 B; 2E5K A; 3V8J A; 5KYW B; 3BFM A; 2QQR A; 2E12 A; 3A1P A; 3MHX A; 3QZ9 B; 1YCS B; 3OYM A; 2YT6 A; 2NYS A; 3RKW A; 2PZ1 A; 4CI0 C; 3SEM A; 2LJ1 A; 2G3R A; 1FXX A; 2MOX A; 4MML A; 2QDY B; 3CCV T; 3OBY A; 2OTJ Q; 4OMO A; 3A8M B; 3RUX A; 4CC7 A; 3V7S A; 4ZN3 A; 2EJ9 A; 1N9R A; 4II1 A; 1KC8 R; 4C0G A; 1T0H A; 4HVV A; 3H0H A; 1VQN T; 4DOV A; 1NZ9 A; 5GMK l; 4HCB A; 1BI1 A; 5GAN 7; 2FB7 A; 5DY9 A; 2RH2 A; 4KGV B; 3CCU T; 4RTV A; 5J3B A; 2P4R A; 1ARK A; 3L1A A; 1I5O B; 2A28 A; 2R58 A; 3OS2 A; 2KXD A; 2JTF A; 1YBY A; 2JUF A; 4C92 D; 2HQH A; 3PT9 A; 4PLL A; 1QP2 A; 2YRC A; 4NL3 A; 2RJE A; 4RTW A; 5GAO m; 1VQM Q; 3EAE A; 1B3Q A; 1ZBJ A; 1ZA1 B; 1Q7Y R; 1ZHI A; 1FYN A; 1B07 A; 3PFS A; 2HBW A; 4D8D A; 5A2Q E; 1LJO A; 1ZX6 A; 1YHQ T; 1M2V A; 1V76 A; 2JVV A; 3JRZ A; 5CAI A; 3M5A A; 4IUV A; 4OGE A; 2YUP A; 3R6O A; 1Z9Z A; 3OYK A; 4M77 C; 3LGF A; 2XMF A; 3QSU A; 3JCM V; 3EGD B; 3QDF A; 2M0Y A; 2DE0 X; 2ECZ A; 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