The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
VTLFVALYDYNATRWTDLSFHKGEKFQILDGDSGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPV
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Generation, Characterization and Structural Data of Chymase Binding Proteins Based on the Human Fyn Kinase SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CHYMASE
|
| molecule tags |
Hydrolase/de novo protein
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
11
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| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1JXM A; 2KGT A; 2M0Y A; 2OJ2 A; 4HCK A; 2ESW A; 3TSZ A; 4Z8A A; 1CKA A; 4M4Z A; 1JXO A; 5IHN A; 2RQT A; 2EYW A; 2DLP A; 4QT7 A; 1T3L A; 2KXD A; 2EW3 A; 2CUB A; 1G2B A; 1Z9Z A; 4IIM A; 3REB B; 1E6H A; 2ROL A; 1NLP C; 4HXJ A; 4LE9 A; 2A37 A; 4K11 A; 1EFN A; 1PHT A; 2ENM A; 1QKX A; 2DMO A; 4JZ3 A; 2FPE A; 2LNH B; 2K6D A; 2EYY A; 1BBZ A; 1AZE A; 2VWF A; 2NWM A; 2IIM A; 1NLO C; 4J9C A; 1GCQ C; 2O9V A; 1UDL A; 4AFU C; 2W10 A; 2A36 A; 1ARK A; 1WLP B; 4RTX A; 4J9H A; 4J9E A; 3EHQ A; 2EYZ A; 1Z9Q A; 2EGE A; 1ZUK A; 5I22 A; 4WCI A; 1SRL A; 4HVV A; 1VYT A; 1VA7 A; 1T0H A; 1M3B A; 1WI7 A; 2HDA A; 2LP5 A; 2ECZ A; 2FPF A; 4F17 A; 1ZUU A; 3LH5 A; 2CH4 A; 1K1Z A; 4OMO A; 1AVZ C; 1OPL A; 5GJV B; 2RF0 A; 1AEY A; 3I9Q A; 2W0Z A; 2DBM A; 1M27 C; 2HEQ A; 3TVT A; 1SHG A; 5IHK A; 1T3S A; 1X43 A; 2RQU A; 2MOX A; 2L3Q A; 1RLP C; 2DNU A; 2LCS A; 1VYV A; 2EGA A; 3IQL A; 1AWW A; 4F14 A; 4LUD A; 1HJD A; 3GBQ A; 4LN2 A; 5GJW B; 2KYB A; 1UUE A; 1IO6 A; 2C0I A; 1I0C A; 1SEM A; 3PVQ A; 3QWY A; 1NYG A; 2DRK A; 2J7I A; 3C0C A; 2DE0 X; 4J9B A; 4DEY A; 1AWJ A; 1WA7 A; 2LQN A; 2KBT A; 2EPD A; 1X2Q A; 1ZLM A; 2JW4 A; 3EG2 A; 3O5Z A; 2PNI A; 2V1Q A; 4AG2 C; 2E5K A; 4RUG A; 2RQW A; 1X6G A; 2YDL A; 2D1X A; 1PWT A; 2KRS A; 1WXU A; 2D8H A; 2JS2 A; 3VS1 A; 1GRI A; 3M0Q A; 1NM7 A; 2L3S A; 1UE9 A; 5I11 A; 2EBP A; 2K79 A; 3R6N A; 2BTT A; 1GBR A; 2X3X D; 1WIE A; 1UG1 A; 1WDX A; 2RQR A; 4JJD A; 1UGV A; 4CC7 A; 2KRN A; 1XOV A; 4OMQ A; 2JT4 A; 1OV3 A; 1HSQ A; 1BB9 A; 2RMO A; 4AG1 C; 1KFZ A; 3RBB B; 3NGP A; 1OEB A; 2KT1 A; 1M3C A; 2GTJ A; 2KYM A; 4E6R A; 1Y57 A; 4RTZ A; 1X6B A; 2AZS A; 1SSH A; 3EGU A; 2ROT A; 4ORZ A; 1SPK A; 1OPK A; 1K0S A; 2DL4 A; 2DL3 A; 5L23 A; 4RTT A; 2DA9 A; 1SHF A; 2AKL A; 1RI9 A; 3M0T A; 1H8K A; 1E6G A; 2GNC A; 2O9S A; 2YUQ A; 1YNZ A; 2DVJ A; 2CDT A; 4JPB W; 2OAW A; 1I1J A; 2YUP A; 4HVW A; 1WXT A; 2RPN A; 2YUO A; 2SRC A; 2M51 A; 3KFV A; 2KNB B; 1GCQ A; 1NEB A; 1K4U S; 2L2P A; 3VS0 A; 1U06 A; 4D8K A; 3H41 A; 4OMM A; 5IXF A; 2AZV A; 2F2X A; 1U5S A; 2J6O A; 1W70 A; 5IH2 A; 2HCK A; 1UJ0 A; 3M0S A; 4ZNX A; 1K9A A; 1ABO A; 1ZX6 A; 2J6F A; 1KJW A; 2KXC A; 3VS4 A; 3UAT A; 3ZL7 C; 2CT4 A; 3M0U A; 1NYF A; 4FSS A; 2L3P A; 1AZG B; 2JM8 A; 5FWB A; 4DEX A; 1MV3 A; 4R0K A; 3VS6 A; 1V1C A; 1ZSG A; 3H0H A; 4KRT A; 3H0F A; 2HBW A; 2A28 A; 3PVL A; 1JQQ A; 2VKN A; 3ULR B; 2DYB A; 4JJC A; 1U3O A; 3JV3 A; 1W1F A; 4RTU A; 1K0X A; 2AKK A; 2RNA A; 2HSP A; 1YWO A; 4CC3 A; 1LCK A; 3REA B; 2DIL A; 2JS0 A; 2K3B A; 4LNP A; 4F16 A; 2DL5 A; 1CKB A; 1YP5 A; 1VYU A; 2F2W A; 3SEM A; 1GL5 A; 1UHC A; 2FO0 A; 2J6K A; 1PRM C; 5IHI A; 3CQT A; 3QWX X; 2D0N A; 4JZ4 A; 1YWP A; 3THK A; 1X2K A; 2LQW A; 2GQI A; 2CH4 W; 1Y0M A; 2B86 A; 2AK5 A; 3NPF A; 2LJ1 A; 4JJB A; 2O2O A; 1UEC A; 1T0J A; 2RN8 A; 1ZBJ A; 2SEM A; 1X27 A; 2DF6 A; 3UF4 A; 2O31 A; 3U23 A; 4OML A; 4LUE A; 2JM9 A; 1FYN A; 2K9G A; 2KT8 A; 2A08 A; 2H8H A; 5HCK A; 2LJ3 A; 3VS7 A; 3NHN A; 5FWC A; 4CC2 A; 4X1V A; 1AD5 A; 2EVR A; 3VRZ A; 1AWX A; 4HVU A; 2CUD A; 1PRL C; 1K76 A; 1WYX A; 2J06 A; 1TUD A; 2BZY A; 2LJ0 A; 2O88 A; 1S1N A; 4Z89 A; 1PNJ A; 1AOJ A; 1MV0 B; 2NUZ A; 1JEG A; 2KEA A; 2DJQ A; 3M0R A; 3EG0 A; 2G6F X; 2DBK A; 2F2V A; 1BK2 A; 1CSK A; 1I07 A; 3EG3 A; 1M8M A; 4J9G A; 4ESR A; 1GCP A; 2GGR A; 1KIK A; 1QWE A; 1QCF A; 2KR3 A; 1GBQ A; 1QLY A; 4J9I A; 1OOT A; 2VVK A; 4IIO A; 1PKS A; 1BU1 A; 2JMA A; 1QWF A; 1TUC A; 4J9D A; 1N5Z A; 2DX1 A; 3NMZ C; 3EHR A; 2DM1 A; 2YSQ A; 4AFS C; 1WFW A; 1AWO A; 2I0N A; 4AFZ C; 4RTV A; 1HD3 A; 2CSQ A; 5EC7 A; 3I5S A; 4GBQ A; 4Y92 A; 2EQI A; 2DRM A; 4OMP A; 4AFQ C; 1FMK A; 1PKT A; 3PE0 A; 2GBQ A; 2YT6 A; 1X69 A; 2KE9 A; 2BZX A; 1GFC A; 2EYX A; 2C0O A; 2K2M A; 1RLQ C; 1JU5 C; 1UTI A; 4RTY A; 2MCN A; 1G83 A; 2EGC A; 2L0A A; 2OI3 A; 2FPD A; 2ED0 A; 3I35 A; 3H0I A; 1ABQ A; 2RQV A; 3TSW A; 1MUZ A; 4GLM A; 1RUW A; 3SHW A; 1H92 A; 5ECA A; 3FJ5 A; 2JTE A; 4EIK A; 2C0T A; 2FG0 A; 2FEI A; 1M30 A; 2LZ6 B; 1NG2 A; 3VS2 A; 1UFF A; 2CT3 A; 1NEG A; 1E7O A; 2KRM A; 1UJY A; 1ZUY A; 1TG0 A; 4CC4 B; 1M3A A; 1WX6 A; 2ED1 A; 2GTO A; 1GFD A; 2BZ8 A; 3VS5 A; 2P4R A; 2LX7 A; 5IXB A; 2CRE A; 2QDL A; 2CSI A; 5FW9 A; 1H3H A; 3UA7 A; 1A0N B; 2ABL A; 1QKW A; 1UHF A; 3M0P A; 4OMN A; 3VS3 A; 2V1R A; 2FRW A; 1W6X A; 1YN8 A; 2J05 A; 1WXB A; 3UA6 A; 4A63 B; 2DL8 A; 2JMC A; 4Z88 A; 2DL7 A; 1B07 A; 2KRO A; 1SRM A; 2EKH A; 2XMF A; 2YUN A; 2K7A A; 1B3Q A; 3I5R A; 1YCS B; 1KSW A; 1J3T A; 1JO8 A; 4J9F A; 2D8J A; 4D8D A; 2LMJ A; 4RTW A; 3A98 A; 2FRY A; 3EG1 A; 2PTK A; 2X3W D; 2PZ1 A; 2JXB A; 3VRY A; 2MIO A; 3RNJ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2KGT A; 2OJ2 A; 1WNL A; 1VQL T; 2JN0 A; 2HD0 A; 3L2Q A; 4KUI A; 3I56 Q; 2RQT A; 2XID A; 1VQP Q; 1EZZ B; 2HQX A; 3OYB A; 1IB8 A; 1Z9Z A; 2LTO A; 4IIM A; 3REB B; 4JJN K; 1QVG A; 3M4Y A; 4HCZ A; 2ROL A; 4HXJ A; 4M77 C; 2QA4 A; 2A37 A; 1VQM A; 2MYS A; 1PHT A; 2QQS A; 1MND A; 3FDR A; 2LNH B; 5CKB A; 2VWF A; 2NWM A; 1PG5 B; 2IIM A; 3TU4 K; 2BKD N; 5IT9 E; 5KYY B; 1YJN T; 2CYZ B; 2BIV A; 1KC8 C; 1WLP B; 4J9H A; 4F7U A; 3EHQ A; 5LJ5 e; 2EGE A; 5I22 A; 4WCI A; 2K4Y A; 1SRL A; 3LLR A; 3HP9 A; 1VYT A; 1D09 B; 1VQN A; 3I55 Q; 2K5I A; 2HDA A; 4AT1 B; 3QDF A; 4PLI A; 4J7I A; 3MCA B; 1AVZ C; 2RHY A; 3I9Q A; 2AIR B; 2C06 A; 4PJO B; 4C92 B; 4VUB A; 3OYN A; 4C8Q C; 2D6F A; 2QI2 A; 2HL3 A; 4X9C A; 2WAC A; 1X43 A; 5GAN 2; 2MOX A; 1RLP C; 1I5L A; 2DNU A; 2XK0 A; 4M78 D; 3DLL A; 2KQW A; 1Q82 U; 3CCL Q; 5FU7 B; 1B34 B; 1VOM A; 2PU9 B; 3OBW A; 4M77 E; 4F14 A; 5LJ3 h; 4LUD A; 5AYF A; 1KQ1 A; 3X25 B; 1IO6 A; 2C0I A; 3CCV T; 2EQK A; 3PVQ A; 2J7I A; 3AT1 B; 1YJW A; 3FJP A; 1AWJ A; 3O8V A; 2XHC A; 3HRU A; 4XU2 A; 3QZ9 B; 2E5Q A; 4JUV A; 1YHQ T; 1NJI R; 2X35 A; 2D0Q B; 3O5Z A; 3SDZ A; 4D6W A; 4C0D B; 4XTW A; 4AG2 C; 2E1H A; 2E5K A; 4PKC C; 4RUG A; 2OAU A; 3M5A A; 2DPP B; 4C5H A; 2IVW A; 2CZ0 B; 2EQM A; 2YXY A; 2L3S A; 3LH0 A; 2EBP A; 1TSF A; 4RMO A; 2E3H A; 1D3B B; 1WQ7 A; 4QW2 A; 2LNV A; 3OW2 S; 1MMD A; 3A8G B; 3MEU A; 1VQ8 A; 2KRN A; 3GPL A; 3OYJ A; 2I2L A; 4A4G A; 3NGP A; 4ZGJ B; 1OEB A; 1YIJ T; 1VQK Q; 2DEU A; 2KMT A; 3DKM A; 2KYM A; 2M0O A; 4BI4 A; 4M7A F; 1YJ9 T; 2AZS A; 1K0S A; 2EJF A; 3M0T A; 4LDY A; 2O9S A; 2MPX C; 5IAY A; 5CKD A; 2O4X A; 2P0Q A; 2YUP A; 1ZSZ B; 1H3Z A; 4PJN A; 5CCA A; 4FT2 A; 3EG9 B; 2X4J A; 1K9M U; 2E3I A; 3VU3 C; 2ZPH B; 4OB1 B; 3MPU B; 1VQ6 Q; 2L2P A; 3M57 A; 4D8K A; 3H41 A; 4M78 B; 2EQU A; 4M7D B; 2P0K A; 1KD1 C; 2DXC A; 1W70 A; 2HCK A; 4XU1 A; 4N4H A; 1KQS P; 1OUL A; 1K9A A; 1ABO A; 2DVE A; 2EJG A; 3CC2 A; 1C1A A; 3CC7 Q; 3UAT A; 2CT4 A; 4B9W A; 2H3J A; 1NYF A; 1AZG B; 2Y4Y A; 3CPW A; 3V7R A; 4C8Q A; 5KE3 A; 1H64 1; 4ZN3 A; 4KRT A; 1JB0 E; 3SD4 A; 1P92 A; 4BY6 B; 1JQQ A; 2VKN A; 3JCM W; 2DYB A; 4JJC A; 2VGM A; 4RTU A; 1VQL A; 2AKK A; 1K0X A; 2HSP A; 1U8R A; 1VQO T; 2NYS A; 5GAO p; 1QVG P; 2HL5 C; 4NL3 A; 2DL5 A; 1UGS B; 1VYU A; 1M1K C; 2HQE A; 2FO0 A; 2DAQ A; 1OU9 A; 4F7U B; 1N9R A; 2DTH A; 4JLG A; 1U1T A; 3RES A; 1X2K A; 2A7Y A; 4BE1 A; 5GAN d; 2LQW A; 2HAX A; 2B86 A; 4DBQ A; 1T0J A; 3S6W A; 5KYX A; 3U23 A; 3PIO A; 6AT1 B; 3A8L B; 4OML A; 3G4S Q; 1KD1 U; 4BUG A; 1F1B B; 2YRC A; 1I4K 1; 3LWH A; 3CCU A; 2K9G A; 2RB6 A; 5GAN 3; 2H8H A; 3CCM A; 1KHI A; 2YRV A; 1YI2 Q; 1AD5 A; 2OTJ T; 3OBY A; 1IGQ A; 1WHM A; 1Y07 A; 3UT1 A; 2WSE E; 3JB9 F; 1Q81 C; 2V8K A; 4E7Z A; 2R58 A; 1AOJ A; 3J81 E; 3D7S B; 3X24 B; 3EG0 A; 5D6X A; 2F2V A; 3L1A A; 1D1C A; 4J9G A; 3G7Z A; 4M7A G; 4C8Q D; 1O75 A; 4BE2 A; 1RAD B; 4IIO A; 5LL6 S; 4DOW A; 1PKS A; 2RH2 A; 2HNI A; 3EHR A; 4JDS A; 3MET A; 2DO3 A; 1UB4 A; 3CCV A; 1WFW A; 3C95 A; 1AWO A; 4AFZ C; 5CIU A; 2Z0W A; 3LWI A; 1KC8 R; 1HD3 A; 2EWN A; 3BDL A; 4HCB A; 4Y92 A; 1VQ9 A; 3FB9 A; 1I5O B; 1YHQ A; 1PKT A; 2K5L A; 3PE0 A; 3BW1 A; 3OYD A; 3M58 A; 4ZTJ A; 3MO8 A; 2EYX A; 2C0O A; 1QP2 A; 2K2M A; 2ZPF B; 4RG8 A; 1RLQ C; 1RAH B; 2MCN A; 4GY5 A; 2Y4X A; 4FT4 A; 2VV5 A; 2EGC A; 4IUP A; 1IGU A; 2RHI A; 4PJO E; 3OYE A; 3H0I A; 4C92 E; 2RQV A; 3TSW A; 2E64 A; 3SHW A; 2P84 A; 2EQJ A; 3JSC A; 3QXE B; 2QA4 T; 2C0T A; 5LJ5 d; 1YIT Q; 2FEI A; 3GLX A; 1Q81 U; 1M1G A; 1UFF A; 4MML A; 4M77 B; 1BI0 A; 2KRM A; 1UGR B; 1TG0 A; 2L8D A; 1VQ7 Q; 3P8H A; 3WVD B; 1VIF A; 2QTV A; 5DM7 R; 2FL7 A; 4HCC A; 3JCM d; 4XU3 A; 2O4X B; 2CRE A; 2CSI A; 1N9S A; 2R5A A; 5FW9 A; 4M78 F; 3UA7 A; 2LVM A; 4M7D F; 3L2R A; 1BCM A; 4RKU E; 1UHF A; 3VS3 A; 2V1R A; 1RAC B; 1VQN T; 4M75 F; 2JMC A; 2MWP A; 1B07 A; 3INZ A; 1KHC A; 3PNW C; 5GMK h; 2KRO A; 2EKH A; 2JUF A; 2VXE A; 2XMF A; 2YUN A; 3I5R A; 3OY9 A; 2D8J A; 3VYG A; 4FL6 A; 4BD3 A; 3A98 A; 4V2S A; 2QGG A; 2PZ1 A; 4C8Q B; 4PFP A; 3M4G A; 3CCS A; 3HRT A; 3PVL A; 2QAZ A; 1BIB A; 2ESW A; 1XQH A; 3CPW P; 5J3B A; 3G1J A; 1TWB A; 1TUG B; 2RK1 A; 2DLP A; 3FRN A; 4QT7 A; 3BE3 A; 4KT0 E; 4F7U F; 2KY9 A; 2CUB A; 4ZGD B; 5KE2 A; 3JB9 G; 7AT1 B; 3OYY A; 2ZGW A; 3CCR A; 3QSU A; 2R57 A; 1VUB A; 1EFN A; 1M2V A; 2ENM A; 2HBP A; 3OMC A; 2DMO A; 4JZ3 A; 3CPF A; 2VUB A; 2GQV A; 2EYY A; 2E4H A; 3CMA T; 1BBZ A; 1AZE A; 4C0Z A; 4DA4 A; 1UEB A; 5D6W A; 4PLL A; 2XG8 D; 2FZC B; 1KD1 R; 4BE0 A; 1VQ8 T; 4A54 A; 1ZUK A; 1Q95 G; 1VQ4 Q; 3G6E T; 4ELY C; 4C0G A; 2E12 A; 2QXF A; 3G71 Q; 1WI7 A; 3C94 A; 4OB3 B; 1ZUU A; 1G3W A; 2LCC A; 4PL6 A; 4MZM A; 3S3N A; 5GJV B; 2O01 E; 4PJM A; 2ATC B; 2DXT A; 5FU6 C; 3RER A; 3TVT A; 1SHG A; 3CCJ A; 4XAX B; 2OTJ A; 3URG A; 1R8O B; 5GMK m; 1TXQ A; 1VYV A; 3RMS A; 1WJQ A; 3JB9 I; 2RHU A; 3GBQ A; 3VV0 A; 5GJW B; 2QGF B; 2COZ A; 2GFU A; 1M1K R; 3CXC S; 2E65 A; 2LDM A; 1VQP A; 2LC4 A; 2RI2 A; 3H6Z A; 4LXC A; 2K5F A; 4PK4 A; 4RG2 A; 4M7D G; 2NUT A; 3CC2 T; 1ZBX A; 3X20 B; 4KBM B; 1X6G A; 2YDL A; 3JRZ A; 4WF2 A; 1PWT A; 3LGL A; 1WXU A; 2X4Y A; 2JJ9 A; 1UGQ B; 3Q1J A; 4M75 G; 5CQY A; 1UE9 A; 4M77 F; 2K79 A; 3R6N A; 4MDW A; 1IZ6 A; 1WIE A; 5GAN g; 3HSB A; 2RQR A; 1UGV A; 3OS1 A; 4OMQ A; 2DYI A; 4J83 A; 1OV3 A; 1Q81 R; 1BB9 A; 4Z02 A; 2L89 A; 2IPO B; 2CP7 A; 2XI9 A; 3I55 A; 1WHK A; 4RTZ A; 3OA6 A; 1JRI A; 1SSH A; 5D6Y A; 4ORZ A; 4E7S A; 1SPK A; 2DL4 A; 3SWN A; 4RTT A; 2OTL Q; 3EFR A; 2DA9 A; 2AKL A; 1RI9 A; 2XDP A; 2AHJ B; 2PVG B; 1Q86 C; 2YUQ A; 1YNZ A; 2CDT A; 1YCY A; 4OB2 B; 2DET A; 3CCL A; 3JAM E; 4F04 B; 4QVZ A; 3CCU T; 1XJW B; 1C0M A; 2KNB B; 2M51 A; 3CCM T; 1NEB A; 2KVQ G; 1M90 R; 4MMK A; 3HFO A; 2FB7 A; 2HKN A; 2AZV A; 2VGN A; 1S72 Q; 1PD1 A; 5IH2 A; 1UJ0 A; 2COW A; 4EMH A; 5LJ3 f; 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