The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
58
|
structure length |
58
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Chain Sequence |
VTLFVALYDYNATRWTDLSFHKGEKFQILDGDSGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/de novo protein
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Generation, Characterization and Structural Data of Chymase Binding Proteins Based on the Human Fyn Kinase SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CHYMASE
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| total genus |
11
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| structure length |
58
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| sequence length |
58
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ROL A; 2F2X A; 1N5Z A; 1WXT A; 2BZ8 A; 2DMO A; 4Z89 A; 2IIM A; 1AWJ A; 1SSH A; 2CUB A; 4HXJ A; 3VS4 A; 4D8D A; 2LCS A; 3I35 A; 2J6K A; 4ZNX A; 3M0R A; 1ZX6 A; 4J9I A; 1PHT A; 3UA7 A; 1K1Z A; 1NYF A; 3NGP A; 2O9V A; 1UHC A; 1QKW A; 3UAT A; 4M4Z A; 1RLQ C; 3PE0 A; 2KR3 A; 2O9S A; 3EGU A; 1E6H A; 1U5S A; 5IH2 A; 4JJD A; 4GLM A; 4JJB A; 2DBM A; 2K9G A; 2YUQ A; 2FRW A; 2EVR A; 4DEY A; 1NEB A; 3VS2 A; 2KXD A; 1B07 A; 2D8J A; 2D8H A; 4A63 B; 2A36 A; 1AZE A; 2E5K A; 2L3S A; 2RQU A; 3H41 A; 2SRC A; 3PVL A; 1UGV A; 4Y92 A; 2BTT A; 1E6G A; 2DYB A; 3EG2 A; 2FPD A; 2YDL A; 1K0S A; 2LQN A; 4HVV A; 1NM7 A; 1JXM A; 2AZV A; 1SHF A; 1OPL A; 1G83 A; 2DL8 A; 1Y0M A; 4RTZ A; 2HSP A; 1ABO A; 2J7I A; 2BZY A; 1WDX A; 1RI9 A; 2GQI A; 3CQT A; 4D8K A; 3C0C A; 4J9H A; 1NEG A; 1X2Q A; 1X69 A; 2LNH B; 1X43 A; 2D0N A; 1IO6 A; 2AZS A; 2H8H A; 2ESW A; 1E7O A; 2XMF A; 5IHK A; 3VRZ A; 3M0U A; 1M3C A; 2GNC A; 2LX7 A; 1NLO C; 4LUE A; 5IHI A; 4IIO A; 2FRY A; 1YP5 A; 1WXU A; 2AKL A; 2K6D A; 2RMO A; 3UA6 A; 4RTV A; 2CDT A; 1CKB A; 1VYU A; 4ORZ A; 3UF4 A; 1QLY A; 3PVQ A; 3VS7 A; 2LMJ A; 1ZUU A; 3SEM A; 2DA9 A; 2CT3 A; 2DNU A; 4HVU A; 4K11 A; 1V1C A; 2YSQ A; 2DJQ A; 1ZBJ A; 2MOX A; 1H3H A; 1G2B A; 2OAW A; 5HCK A; 3O5Z A; 1M8M A; 1YCS B; 1WYX A; 4OMN A; 2O88 A; 3GBQ A; 1X6B A; 1ZSG A; 4EIK A; 4J9D A; 1GCP A; 2QDL A; 2VKN A; 3REA B; 1W6X A; 1VYT A; 4J9C A; 4IIM A; 2DL5 A; 1ZUY A; 1AVZ C; 1BBZ A; 3A98 A; 2JM8 A; 1GL5 A; 2LZ6 B; 4JZ3 A; 5I22 A; 2A08 A; 1WLP B; 1W1F A; 4RTU A; 1XOV A; 2FG0 A; 1VA7 A; 4LE9 A; 2EPD A; 3H0F A; 2MCN A; 1SEM A; 2PNI A; 4RTW A; 3H0H A; 1I0C A; 2VVK A; 3NHN A; 2EW3 A; 4F14 A; 4J9G A; 5FWB A; 2KRN A; 4Z88 A; 1VYV A; 1K76 A; 1U3O A; 2RPN A; 1QCF A; 3ZL7 C; 2EKH A; 2EYX A; 4J9E A; 1HSQ A; 2C0O A; 1M27 C; 1S1N A; 2MIO A; 2P4R A; 3TVT A; 2AKK A; 2CH4 A; 3RNJ A; 3THK A; 2KRO A; 1A0N B; 2FPE A; 1HD3 A; 1EFN A; 1UUE A; 2K7A A; 3I5R A; 3QWY A; 2I0N A; 2KT1 A; 2CSQ A; 4RTT A; 5GJW B; 1PNJ A; 1AD5 A; 3LH5 A; 1I07 A; 5IHN A; 1QKX A; 1GBR A; 2LJ0 A; 3SHW A; 2KRM A; 2LJ1 A; 2X3W D; 2JXB A; 2KNB B; 2NUZ A; 1TUC A; 3M0S A; 2DF6 A; 4OMO A; 5L23 A; 2KYM A; 2ROT A; 1MV3 A; 1UE9 A; 2KGT A; 3H0I A; 4F17 A; 1GCQ C; 1PKS A; 3M0P A; 4RUG A; 2FEI A; 2W0Z A; 1GFC A; 1M30 A; 2YUN A; 4LUD A; 3VS1 A; 1Z9Q A; 2D1X A; 4AFS C; 1GRI A; 2SEM A; 1UJY A; 2YUO A; 2K2M A; 1NLP C; 1MUZ A; 2RQR A; 4X1V A; 1X2K A; 2O2O A; 2EGA A; 2GTO A; 3EG3 A; 3KFV A; 4ESR A; 2RF0 A; 2LP5 A; 1ZLM A; 2L0A A; 2C0I A; 4J9F A; 4FSS A; 4WCI A; 2F2V A; 4E6R A; 2JS2 A; 2J05 A; 1SHG A; 4R0K A; 4AG1 C; 2JS0 A; 1Y57 A; 1K4U S; 3I5S A; 5ECA A; 2CH4 W; 1UEC A; 2J6O A; 1CKA A; 2EGC A; 2KRS A; 2KT8 A; 2DIL A; 1M3B A; 1FYN A; 2K79 A; 4AFU C; 1X27 A; 2DVJ A; 2V1R A; 1RUW A; 1JXO A; 4Z8A A; 1WX6 A; 1RLP C; 2JMC A; 1KIK A; 4AFZ C; 2NWM A; 5IXB A; 1JQQ A; 2ECZ A; 2J06 A; 4AFQ C; 2F2W A; 3VS0 A; 2G6F X; 3TSW A; 3IQL A; 2EQI A; 3EG0 A; 2FPF A; 1WI7 A; 2DL7 A; 2DX1 A; 2DL3 A; 2M51 A; 2DRK A; 1T3L A; 1AEY A; 2RQV A; 4LNP A; 1QWF A; 1YN8 A; 2AK5 A; 3JV3 A; 1NYG A; 3M0T A; 1AOJ A; 2L3P A; 3EHR A; 2LQW A; 1JU5 C; 1KJW A; 2ABL A; 2C0T A; 1Z9Z A; 1X6G A; 2FO0 A; 2ED0 A; 2HBW A; 1BB9 A; 1J3T A; 2ENM A; 2JW4 A; 4CC7 A; 1AWX A; 2B86 A; 2KBT A; 1H8K A; 1MV0 B; 2W10 A; 2YT6 A; 3TSZ A; 5GJV B; 4JPB W; 3RBB B; 1GCQ A; 1UDL A; 2CT4 A; 2GBQ A; 1OEB A; 3QWX X; 1T0J A; 2HDA A; 2HEQ A; 3VS3 A; 2RQT A; 2DLP A; 2DRM A; 3M0Q A; 2DM1 A; 2GTJ A; 2O31 A; 2BZX A; 1ARK A; 1SRL A; 4JZ4 A; 3U23 A; 1UG1 A; 1CSK A; 2VWF A; 1B3Q A; 2M0Y A; 4CC2 A; 1WA7 A; 1WFW A; 2KYB A; 1AWO A; 1OV3 A; 1PKT A; 1UTI A; 2A28 A; 1KFZ A; 3VRY A; 1PRL C; 1UFF A; 2OJ2 A; 2CRE A; 2CSI A; 1YWP A; 1W70 A; 2YUP A; 1ABQ A; 1AZG B; 4J9B A; 1KSW A; 4RTY A; 4OMP A; 2EBP A; 3I9Q A; 2EGE A; 5IXF A; 1TUD A; 2ED1 A; 3NMZ C; 2JTE A; 2KXC A; 2PZ1 A; 2CUD A; 2LJ3 A; 3EG1 A; 1GFD A; 1U06 A; 1YWO A; 4HVW A; 1UHF A; 1NG2 A; 2DL4 A; 1SRM A; 2EYY A; 2K3B A; 1UJ0 A; 1T0H A; 1YNZ A; 3REB B; 3VS5 A; 1BU1 A; 1ZUK A; 4KRT A; 2J6F A; 5FWC A; 1WIE A; 1HJD A; 1T3S A; 2GGR A; 1PWT A; 1LCK A; 2EYW A; 4AG2 C; 3EHQ A; 1K0X A; 2L3Q A; 4OML A; 1QWE A; 4HCK A; 2PTK A; 4F16 A; 3FJ5 A; 2JT4 A; 1AWW A; 5EC7 A; 4CC4 B; 2OI3 A; 1H92 A; 1I1J A; 2KE9 A; 2L2P A; 2HCK A; 2JM9 A; 4OMM A; 1WXB A; 5I11 A; 1K9A A; 3NPF A; 1JEG A; 1OPK A; 1SPK A; 1M3A A; 2JMA A; 3R6N A; 2RNA A; 1PRM C; 3ULR B; 4CC3 A; 2KEA A; 1TG0 A; 1OOT A; 2DBK A; 4QT7 A; 1FMK A; 4DEX A; 3VS6 A; 2A37 A; 2X3X D; 2RN8 A; 4OMQ A; 4RTX A; 4LN2 A; 4GBQ A; 2V1Q A; 2RQW A; 2DE0 X; 5FW9 A; 4JJC A; 1JO8 A; 1BK2 A; 2EYZ A; 1GBQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2F2X A; 2WSE E; 1WXT A; 3RIR A; 1KQ2 A; 3M58 A; 4IUQ A; 1AWJ A; 2CS7 A; 4HXJ A; 2H3J A; 2LC4 A; 5HY6 A; 3MEA A; 3CCJ A; 3I35 A; 1ZX6 A; 3UA7 A; 3EGD A; 2RHZ A; 3BDU A; 1WHG A; 2KAF A; 2CYZ B; 1QKW A; 1NZ9 A; 3CCV T; 1RLQ C; 3CME Q; 4NL3 A; 2O9S A; 3EGU A; 3BFM A; 1X6O A; 1D1A A; 2NUP A; 3CCU A; 3OY9 A; 1VQ8 T; 1D0Z A; 2YUQ A; 4R56 A; 2MMP A; 2OTJ T; 2KXD A; 2G3R A; 2D8J A; 3JCM e; 4M7A B; 5GAN 5; 3PIP A; 1WJQ A; 3PVL A; 2LT4 A; 3FJP A; 5LJ5 g; 5CVI A; 2CP0 A; 3SWN C; 1NM7 A; 3EGX A; 3G4S Q; 1M1K C; 2AZV A; 1G83 A; 2DL8 A; 3VV0 A; 1KQS S; 4M7A E; 1YJW T; 2EQK A; 2J7I A; 1Y71 A; 1RI9 A; 3OYA A; 3JCM J; 3CQT A; 3C0C A; 1NEG A; 3MEW A; 5FU6 B; 4BE0 A; 1O75 A; 1E7O A; 2RB6 A; 2DK3 A; 3OS5 A; 1M3C A; 4IUR A; 4C92 F; 2LX7 A; 1NLO C; 1XQH A; 3CD6 T; 8ATC B; 3EH2 A; 4YTL A; 5IHI A; 3RMQ A; 5GAM j; 1RAD B; 2CDT A; 1ZA2 B; 3WVD B; 3PVQ A; 4C8Q F; 1QVG P; 2YRC A; 1C1A A; 2CT3 A; 2CZ6 B; 5D7U A; 3ZEH A; 2COY A; 2DTO A; 1ZBJ A; 1FWZ A; 1TUG B; 3O5Z A; 1YJ9 T; 4MDX A; 2YRV A; 3SD4 A; 1M8M A; 5LJ3 j; 2DXU A; 1WYX A; 2LQK A; 4OMN A; 1VQN Q; 4QVD A; 2E6Z A; 1K9M U; 1YIT A; 1IB8 A; 2HL5 C; 3CCQ Q; 4BUG A; 1VOM A; 4EIK A; 4J9D A; 1GCP A; 1TWB A; 2VKN A; 4J8O A; 3SFM A; 4M75 C; 4XTY A; 2DL5 A; 1Y96 A; 1ZUY A; 1AVZ C; 1BBZ A; 3M56 A; 4M77 B; 1GL5 A; 2VAS A; 2DO3 A; 4C0D B; 3MEU A; 4HA8 A; 1M4Z A; 2MCN A; 2EKO A; 1JJ2 P; 5GAO r; 2XDB A; 1I0C A; 2VVK A; 4BDZ A; 2EW3 A; 2QTX A; 4TVR A; 4F14 A; 3ASK A; 2KRN A; 1K76 A; 4M77 E; 3SWN A; 1QCF A; 4D6W A; 5CKH A; 2EYX A; 1RAC B; 5C0M A; 1M2O A; 3RKW A; 1HSQ A; 2LCC A; 1S1N A; 3JCM d; 3LW5 E; 3QKJ A; 2AKK A; 1K9M R; 3RNJ A; 1K8A R; 1M1F A; 3CC2 T; 2FPE A; 2K7A A; 1UUE A; 3QWY A; 1I81 A; 1VQ6 Q; 2KT1 A; 4BY6 C; 5EG2 A; 3V8K A; 3CC7 A; 5GJW B; 2LX9 A; 2VUB A; 4LD6 A; 1AD5 A; 3CCJ T; 2LJ0 A; 3JCM f; 4M7A G; 3RMS A; 5GAN 2; 1NBE B; 2YWW A; 3M0S A; 4OMO A; 5L23 A; 4BI3 A; 4JUV A; 3H0I A; 2FEI A; 3CCU T; 2W0Z A; 3NTH A; 2YUN A; 2CKK A; 4EMK B; 4LUD A; 1SKU B; 3VS1 A; 4M78 F; 1GRI A; 2SEM A; 2KI7 A; 2K5L A; 4J7F A; 4RKU E; 5HKC A; 3JB9 I; 2DYI A; 2HAX A; 4KT0 E; 3ZFJ A; 1Q86 R; 1ZLM A; 2HQH A; 5C6S A; 4M75 A; 3HTR A; 1BCM A; 2C0I A; 3QYG B; 4OB3 B; 5A0G A; 4E7L A; 4OB1 B; 3HFO A; 2JS2 A; 4R0K A; 2JS0 A; 4C5H A; 1X01 A; 5ECA A; 2CH4 W; 4JLG A; 4ZTJ A; 5DY9 A; 1K9M C; 3OYF A; 2KT8 A; 1G5V A; 4IUT A; 3CCQ T; 3OYK A; 3HRS A; 1TOV A; 4AFU C; 4AT1 B; 2V1R A; 1O9S A; 1NPR A; 4C8Q B; 1RLP C; 2JMC A; 2XKO C; 1KIK A; 4GY5 A; 3X20 B; 3OYL A; 4PJO F; 4AFZ C; 2NWM A; 1YHQ A; 4L5G A; 4XTU A; 4C92 E; 3FEO A; 3VS0 A; 2F69 A; 2EAY A; 2G6F X; 3S3M A; 3TSW A; 2M1H A; 5I2S A; 2K5F A; 2B8A A; 3VJP A; 4C8Q E; 3CC4 A; 4ELZ C; 2DRK A; 2RHX A; 1AEY A; 1YIJ Q; 2F5K A; 4LNP A; 1YN8 A; 3JV3 A; 1M5Q 1; 3RES A; 4M77 G; 5KYY A; 5GMK l; 4HCZ A; 2FO0 A; 1BB9 A; 3OMG A; 4C5E A; 5GAO l; 5GAM f; 1J3T A; 3QSU A; 2MF2 A; 4FSX A; 4FCY A; 2QQB A; 2KBT A; 1MV0 B; 3G71 A; 5CKF A; 5HK0 A; 1Q86 C; 1W2B A; 1VQO A; 5GJV B; 2JNG A; 1KHC A; 5KYW B; 1PCX A; 3VS3 A; 2DRM A; 4NOY A; 3GNG A; 4C0F A; 4FL6 A; 5LJ3 f; 3CCL Q; 3CXC A; 3TRE A; 3INZ A; 3U23 A; 2MAM A; 3SB2 A; 2RH2 A; 2FVU A; 3VYG A; 3CBM A; 1WFW A; 1Q81 U; 1VQ9 A; 3JCM h; 1UTI A; 2CP7 A; 2KK4 A; 3VRY A; 1PRL C; 2EQU A; 4KGV B; 1ZA1 B; 2YUP A; 4J9B A; 1KSW A; 4RTY A; 3I9Q A; 3N5B B; 2ED1 A; 3GLX A; 2O01 E; 2LJ3 A; 1W2B S; 1YWO A; 4QVC A; 2K3B A; 4M7D C; 2CZ1 B; 4J5Y A; 1RAA B; 3JB9 J; 4E47 A; 9ATC B; 1WGS A; 2JUF A; 2EYW A; 1LPL A; 2L3Q A; 2NUT A; 4OML A; 4HCK A; 1Y7X A; 3FJ5 A; 1AWW A; 2OI3 A; 2KE9 A; 1B7T A; 5I11 A; 2LVM A; 5GAM g; 1GXI E; 1Q81 R; 4MZT A; 5GAN 7; 3ULR B; 5AYF A; 4M78 E; 2OTJ A; 4F7U A; 1OOT A; 2DBK A; 1WHH A; 4QT7 A; 4DEX A; 3VS6 A; 2A37 A; 4OMQ A; 4C92 G; 3CCE Q; 4FW2 A; 3JCM c; 2E4H A; 3OW2 P; 3J7A F; 2DE0 X; 5FW9 A; 4M75 D; 3OYC A; 1JO8 A; 5LJ3 g; 5HK3 A; 4PFP A; 2ROL A; 2RM4 A; 1M90 R; 4C8Q G; 4KUL A; 2L5Q A; 1N5Z A; 2DMO A; 2RJE A; 2IIM A; 2XDD A; 1SSH A; 1BYM A; 4PJO B; 2J6K A; 4ZNX A; 3C4S A; 2E70 A; 3CCR Q; 4EMG A; 3NGP A; 2VC8 A; 4J83 A; 2ZZD A; 3UAT A; 4J6W A; 5KE2 A; 2QDY B; 4RMO A; 4N0A C; 4B9X A; 3PE0 A; 2ATC B; 2PQW A; 1BIB A; 4DBR A; 4PJO E; 2ZGW A; 2EJF A; 1YHQ T; 4JJB A; 4GLM A; 2GFU A; 2K9G A; 1QCO A; 4DEY A; 3TEE A; 3EG9 A; 3CD6 A; 5KYU B; 1R0B G; 2X4W A; 3L1A A; 4KUD K; 3M54 A; 2D8H A; 1XTD A; 3HL8 A; 2A36 A; 2E5K A; 3CC4 T; 1UGV A; 4EMH A; 2BTT A; 2RI5 A; 5LL6 S; 4PJM A; 4B9W A; 1Q81 C; 4M7D A; 2DIG A; 1W4S A; 2XID A; 3EAE A; 4E7I A; 2MWO A; 1MMD A; 2DXC A; 1YJ9 A; 8AT1 B; 1D3B B; 1ABO A; 1WDX A; 5IN1 A; 2GQI A; 5LJ5 d; 3QDR B; 4ELY C; 4J9H A; 4DQ2 A; 5GAO n; 2D0N A; 1M90 C; 1VQO T; 1SG5 A; 2X4X A; 1KQ1 A; 3BY7 A; 2BE7 D; 5IHK A; 2EIF A; 5GMK e; 2GNC A; 3G1J A; 5D6W A; 1UEB A; 2QA4 Q; 4DOV A; 1YCY A; 4IIO A; 3OA6 A; 1YP5 A; 2QEX Q; 1VQ4 Q; 1QVF S; 4BE1 A; 1WQ7 A; 1N9S A; 3UF4 A; 3X26 B; 3C12 A; 2LMJ A; 4FT4 A; 4N4I A; 2RK2 A; 3CPW P; 3F70 A; 5GAN 3; 3RER A; 3CME A; 2MOX A; 3X24 B; 1YCS B; 1N6A A; 3QXE B; 4VUB A; 3GNF B; 2EWN A; 2QG9 B; 3H8Z A; 1VQL T; 3E9G A; 3G7Z A; 1X6B A; 1ZSG A; 5CQX A; 2ZPB B; 4JS4 A; 5J39 A; 1QVG S; 3LGF A; 2JN0 A; 4N0A A; 4PLI A; 1FXX A; 1TU0 B; 1W6X A; 1VYT A; 2HMA A; 3BE3 A; 3DKM A; 4IIM A; 4J9C A; 2M9U A; 2EFI A; 3TU4 K; 3G4S A; 5GAN 8; 2LZ6 B; 2YLB A; 4JZ3 A; 5I22 A; 2A08 A; 1FMV A; 4A4E A; 4LE9 A; 1KQS A; 1VQ5 Q; 2M02 A; 2PVD B; 2QXF A; 3OB9 A; 3S3N A; 5I2M A; 3QJ6 A; 2DAQ A; 1JRI A; 3HPW A; 2RJC A; 5GAN j; 2RPN A; 1MMA A; 2XK0 A; 3ZL7 C; 4PJO G; 1G3Y A; 1OU8 A; 2V8I A; 2DXB A; 2C0O A; 1M27 C; 4PKC C; 3O8V A; 2MIO A; 3TVT A; 2QK0 A; 2VV5 A; 2CH4 A; 2ZPG B; 5KYX A; 2BE9 B; 1A0N B; 3QJY A; 2M0O A; 4LDV A; 1EFN A; 1M2V B; 4ZGD B; 1I5O B; 1OQK A; 2CSQ A; 2QTV A; 2K2V A; 1PNJ A; 3M53 A; 5IHN A; 1QKX A; 1H64 1; 1HK9 A; 2KRM A; 1VQN A; 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