The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
VTLFVALYDYNATRWTDLSFHKGEKFQILDGDSGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/de novo protein
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Generation, Characterization and Structural Data of Chymase Binding Proteins Based on the Human Fyn Kinase SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CHYMASE
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| total genus |
11
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| structure length |
58
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| sequence length |
58
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2PNI A; 3LH5 A; 1W70 A; 2FRW A; 2LNH B; 2M51 A; 3M0T A; 3IQL A; 2RQU A; 1M3A A; 2KT1 A; 3M0S A; 1GCQ A; 2K7A A; 2O9V A; 1FMK A; 4LUE A; 1KFZ A; 4J9I A; 4LE9 A; 2LMJ A; 3FJ5 A; 2J6K A; 3VS5 A; 2RQR A; 2AKK A; 1X43 A; 2AKL A; 2SRC A; 1ZSG A; 2EYZ A; 1Y0M A; 1YWO A; 2DLP A; 1J3T A; 1RLP C; 1I1J A; 2J05 A; 2RQW A; 3M0U A; 2IIM A; 2NUZ A; 2KRM A; 1WFW A; 4A63 B; 1TG0 A; 1OPL A; 4AFU C; 3M0Q A; 2A08 A; 2HBW A; 3EG3 A; 2K2M A; 3UA7 A; 1CSK A; 3VS7 A; 2L3Q A; 1HSQ A; 1KJW A; 1OEB A; 2RPN A; 1K0S A; 4GBQ A; 1UHC A; 1UFF A; 4F14 A; 1ZUY A; 1LCK A; 3VS0 A; 3EHR A; 2E5K A; 3GBQ A; 2JM8 A; 1AWW A; 4E6R A; 1WXU A; 2HCK A; 1OV3 A; 1JEG A; 1NEG A; 1X69 A; 2MOX A; 3VS3 A; 3PVQ A; 4J9B A; 1UGV A; 1VYT A; 3EG2 A; 4Y92 A; 2DIL A; 2FO0 A; 1T0H A; 1YN8 A; 2K9G A; 3I9Q A; 4R0K A; 1N5Z A; 2DBM A; 1TUD A; 2CDT A; 1YNZ A; 4JJD A; 2VWF A; 2CH4 A; 3U23 A; 4HVU A; 1CKB A; 1G83 A; 1WDX A; 2C0T A; 2BZX A; 3NMZ C; 3REB B; 1HJD A; 2O31 A; 1K9A A; 1M27 C; 1M3C A; 1E7O A; 2W10 A; 2CSI A; 2VVK A; 4RTT A; 4X1V A; 3H0F A; 3EG1 A; 1PRL C; 2CUD A; 1E6G A; 2M0Y A; 2FRY A; 2YT6 A; 1QWF A; 2JS2 A; 2EBP A; 3NGP A; 2LZ6 B; 1WXB A; 3R6N A; 2RF0 A; 2LJ0 A; 3TSW A; 1UUE A; 1X6G A; 2DVJ A; 4AG1 C; 1Y57 A; 2DL4 A; 3QWX X; 2ROT A; 3M0P A; 1M8M A; 4F16 A; 2J7I A; 3VRZ A; 2O2O A; 4JJC A; 3UF4 A; 5IXB A; 2D8H A; 2EVR A; 3M0R A; 1V1C A; 1HD3 A; 1JQQ A; 2NWM A; 1G2B A; 2JMA A; 2DRK A; 2W0Z A; 4AFZ C; 1M30 A; 5I11 A; 2YUO A; 2J6F A; 4HCK A; 2EW3 A; 4Z89 A; 2LJ3 A; 5GJV B; 1K4U S; 2D0N A; 2CUB A; 2ECZ A; 2X3X D; 4JPB W; 4RTY A; 2YUQ A; 1NLP C; 4LUD A; 1W1F A; 2YDL A; 1Z9Z A; 1UEC A; 3UA6 A; 5FW9 A; 1H8K A; 2GBQ A; 4QT7 A; 2D1X A; 1XOV A; 4OMP A; 1RUW A; 3EHQ A; 2DM1 A; 2EGC A; 1GRI A; 2V1R A; 2HEQ A; 4RUG A; 4DEX A; 1SEM A; 1K1Z A; 3I5R A; 3KFV A; 1AZE A; 2KEA A; 3EG0 A; 1JU5 C; 4OML A; 2G6F X; 1MV3 A; 2DF6 A; 2GTJ A; 2KNB B; 4LNP A; 1SRM A; 1T0J A; 2CSQ A; 2FG0 A; 4M4Z A; 1ZBJ A; 2KRS A; 1PHT A; 2K6D A; 4LN2 A; 2A37 A; 3VS4 A; 2A36 A; 1KSW A; 5IH2 A; 1WYX A; 1U3O A; 1VYV A; 1AD5 A; 1GL5 A; 4K11 A; 1NM7 A; 2ESW A; 2KXC A; 3ULR B; 1IO6 A; 1H3H A; 1AWJ A; 2K79 A; 3VS6 A; 2QDL A; 2JS0 A; 2D8J A; 2LJ1 A; 2C0O A; 3CQT A; 1WA7 A; 2JW4 A; 1TUC A; 1K0X A; 2BZY A; 2MIO A; 2AZS A; 1W6X A; 2DA9 A; 1SHG A; 1H92 A; 3VRY A; 4EIK A; 1YWP A; 2FPF A; 3I35 A; 1ZUK A; 5GJW B; 2LCS A; 1SSH A; 2DL3 A; 2DBK A; 4IIM A; 4RTU A; 1WI7 A; 4J9G A; 5IXF A; 1NEB A; 4KRT A; 2DMO A; 2JXB A; 1VA7 A; 4FSS A; 2EQI A; 1GBR A; 3TVT A; 2VKN A; 1SRL A; 3THK A; 4IIO A; 1BK2 A; 4OMM A; 1RLQ C; 1GFC A; 1B3Q A; 2GQI A; 3RBB B; 2DL7 A; 5IHN A; 1GCQ C; 2JM9 A; 5IHI A; 1U5S A; 4JZ4 A; 1AVZ C; 2CT4 A; 1PWT A; 2MCN A; 1X27 A; 4JZ3 A; 1OPK A; 1E6H A; 2JMC A; 2X3W D; 3SHW A; 2L2P A; 1RI9 A; 4J9F A; 1WXT A; 4ZNX A; 2JT4 A; 2FPE A; 2YUN A; 3NHN A; 1KIK A; 1AZG B; 1JXM A; 2O88 A; 2KR3 A; 2PTK A; 5EC7 A; 4HVW A; 4HXJ A; 1BU1 A; 1CKA A; 1X2K A; 1K76 A; 4D8K A; 2RN8 A; 1QKW A; 4AFS C; 1NYF A; 2J06 A; 1BBZ A; 4OMQ A; 1JXO A; 4J9D A; 4D8D A; 3H0I A; 1FYN A; 1UE9 A; 2CH4 W; 1UJ0 A; 2RQT A; 2LQW A; 2HSP A; 2K3B A; 2J6O A; 2EYX A; 2P4R A; 2ROL A; 3REA B; 1UG1 A; 2CRE A; 3SEM A; 1ZLM A; 2BTT A; 2ENM A; 3ZL7 C; 2DE0 X; 2RMO A; 1MV0 B; 1SPK A; 2OJ2 A; 4OMO A; 2F2V A; 2L0A A; 1AWX A; 1I0C A; 2FPD A; 4ORZ A; 2B86 A; 3PVL A; 2A28 A; 2DL8 A; 2LX7 A; 2KYM A; 2DX1 A; 5ECA A; 1NG2 A; 1Z9Q A; 2HDA A; 1OOT A; 2KYB A; 1PKS A; 1YCS B; 5HCK A; 4AG2 C; 1GBQ A; 5I22 A; 1X6B A; 3QWY A; 3A98 A; 2EYY A; 4GLM A; 1YP5 A; 2DYB A; 3O5Z A; 2KE9 A; 4Z8A A; 2L3P A; 1QKX A; 4Z88 A; 2FEI A; 4J9C A; 1MUZ A; 4RTZ A; 1UHF A; 2PZ1 A; 3PE0 A; 1T3S A; 2YSQ A; 1S1N A; 2H8H A; 5IHK A; 4J9E A; 1B07 A; 1M3B A; 2C0I A; 1GFD A; 2ABL A; 3VS2 A; 2EGA A; 2KGT A; 3UAT A; 4CC7 A; 1ZX6 A; 4CC2 A; 2EYW A; 2RNA A; 3EGU A; 1AEY A; 2DRM A; 5L23 A; 2JTE A; 1NLO C; 1WLP B; 4F17 A; 2KT8 A; 5FWB A; 3RNJ A; 1T3L A; 2CT3 A; 3H0H A; 1PRM C; 1A0N B; 2GGR A; 2OAW A; 1WX6 A; 2F2W A; 3H41 A; 4J9H A; 3TSZ A; 1SHF A; 4RTW A; 4HVV A; 2EGE A; 2SEM A; 1JO8 A; 4DEY A; 1I07 A; 1QWE A; 2DL5 A; 2KBT A; 1ZUU A; 1ABO A; 1UTI A; 2GTO A; 3JV3 A; 4CC3 A; 1AWO A; 2EPD A; 1UJY A; 3VS1 A; 1PNJ A; 1ARK A; 1BB9 A; 1U06 A; 2ED0 A; 1GCP A; 4OMN A; 1PKT A; 4RTV A; 1VYU A; 4WCI A; 2GNC A; 1X2Q A; 2AK5 A; 4JJB A; 4RTX A; 2KRN A; 2L3S A; 4CC4 B; 2O9S A; 1WIE A; 2LP5 A; 1QLY A; 1AOJ A; 2BZ8 A; 1UDL A; 2V1Q A; 1QCF A; 2YUP A; 2F2X A; 2OI3 A; 2I0N A; 2KXD A; 1ABQ A; 1EFN A; 2EKH A; 2AZV A; 3I5S A; 2DJQ A; 2DNU A; 2ED1 A; 2KRO A; 2LQN A; 1NYG A; 5FWC A; 2RQV A; 3C0C A; 2XMF A; 4AFQ C; 4ESR A; 3NPF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5M9O A; 3OW2 A; 2PNI A; 3JCM d; 4ELY C; 1W70 A; 2EQK A; 1KHC A; 3VYH B; 4M7A D; 3OSV A; 1I81 A; 3IQL A; 3GLX A; 4PFO A; 3CC2 Q; 3CCM Q; 2O9V A; 4Y91 A; 5DLO A; 3QXE B; 1Q82 R; 3VS5 A; 3CCQ T; 3M58 A; 1FXX A; 2XDB A; 2SRC A; 2COW A; 1VQ4 A; 2EYZ A; 4AMC A; 4OGC A; 1FMW A; 2MK5 A; 4C8Q E; 2DLP A; 1J3T A; 4IKF A; 1R8O B; 2RQW A; 3M0U A; 2NUZ A; 1C6V X; 4FCY A; 1KQS A; 1KC8 C; 3A8G B; 4FU6 A; 2A08 A; 2HBW A; 2RO0 A; 4NOY A; 3UA7 A; 1VQ7 Q; 2KAF A; 3SB2 A; 2L3Q A; 3V7R A; 1OEB A; 3RIR A; 3V8L A; 1UHC A; 2E5Q A; 4C8Q A; 1LOJ A; 5FU7 C; 1W4S A; 3WVD B; 2MWP A; 4C92 E; 4PJN A; 1ZUY A; 2DIQ A; 3CCR Q; 1VQ5 T; 4RCC A; 2EQJ A; 2XDP A; 2DKG A; 1X69 A; 2E6N A; 2QDY B; 3M5A A; 1NJI C; 4GY5 A; 1VYT A; 2P0P A; 4PJO G; 4BI8 B; 3OYC A; 2DZC A; 2QK0 A; 2K9G A; 3CCV Q; 4R0K A; 1TUD A; 2CDT A; 2QQ9 A; 3D7S B; 1OYX A; 5KYU A; 3PIP A; 3G4S A; 1VQN Q; 1G3S A; 1KD1 U; 1RAG B; 3E2U A; 3JAM E; 3G71 T; 2P84 A; 5J39 A; 5HK3 A; 2W10 A; 4RTT A; 4QKU A; 2P0Q A; 3I56 A; 1IGQ A; 3A8M B; 1BI1 A; 1W2B S; 5KYW A; 3CCU T; 2E3I A; 3NGP A; 2RI3 A; 1LPL A; 2LZ6 B; 5LJ3 e; 3MP6 A; 2H3E B; 3URG A; 4OF1 A; 2XHC A; 1Y57 A; 3HFO A; 2OTJ T; 2DD5 A; 3MP1 A; 3JCM h; 4NS5 A; 2QGF B; 1Q81 C; 1G3Y A; 2O2O A; 1K73 U; 2D8H A; 3OYE A; 3G6E T; 3UDC A; 3H6Z A; 1HD3 A; 1G2B A; 1VQP T; 1D3B A; 1YJ9 T; 3GNF B; 4RCB A; 1PCX A; 4FW2 A; 2YRC A; 1M30 A; 4XTW A; 5I11 A; 1QVP A; 3QO3 A; 4ZGE B; 2RHU A; 2DTH A; 4HCK A; 2EW3 A; 1K4U S; 4J5Y A; 2ECZ A; 4RTY A; 2DXU A; 2E1H A; 5CK9 A; 1WHM A; 2YUQ A; 2PVO B; 1UEC A; 2DD4 A; 5IT9 E; 1RUW A; 4LDV A; 3EHQ A; 2L5Q A; 2V1R A; 5GAM d; 2QTX A; 2HEQ A; 4RUG A; 1SEM A; 1YIT T; 2I2L A; 2EKO A; 3I5R A; 2HBP A; 2KEA A; 2OTL A; 3EG0 A; 2G6F X; 1OUL A; 2KNB B; 4FYY B; 4M4Z A; 2LCC A; 1M90 R; 4XK8 E; 3OYH A; 1KC8 R; 1I5O B; 5IH2 A; 1WYX A; 1YFN A; 3TCJ A; 3RKX A; 3N5B B; 4A4E A; 2JN0 A; 1N8R R; 1PG5 B; 2K79 A; 3VS6 A; 2K5I A; 9ATC B; 3C12 A; 2LJ1 A; 5GAN d; 3I55 T; 1MHN A; 1UGQ B; 2BZY A; 2MIO A; 2QAZ A; 2QG9 B; 1RI0 A; 3PMI A; 2DA9 A; 1RAE B; 1SHG A; 1YWP A; 3CCE T; 3I35 A; 2DXB A; 2LCS A; 1SSH A; 3DB4 A; 1MND A; 2AT1 B; 2H3J A; 1WI7 A; 2CP7 A; 1MMD A; 2XG8 D; 3SWN A; 1NEB A; 3ME9 A; 4WTO B; 5KCH A; 3M4G A; 2EQI A; 3OBY A; 3CME A; 4M7A C; 3J81 E; 4RG8 A; 2F5T X; 1SRL A; 3THK A; 3NFC A; 3QSU A; 2P4T A; 1QVG S; 1X75 C; 1JB0 E; 4BE0 A; 3TQ7 P; 2K5F A; 2DL7 A; 4UC4 A; 3OQ5 A; 1GCQ C; 3EH1 A; 3EFO B; 3JCM b; 3F70 A; 1YIJ A; 3RKW A; 4JZ4 A; 1D1B A; 3S3O A; 2DET A; 1W2B P; 3A8H B; 2FZG B; 4QW2 A; 2RB6 A; 1OPK A; 2M9U A; 3OYI A; 2BE7 D; 2RI2 A; 3SHW A; 3MEW A; 3CCJ Q; 1RI9 A; 1FX7 A; 5A0D A; 4J9F A; 3OYG A; 2NLU A; 2JTM A; 4J6W A; 1KD1 C; 3V7S A; 2A0F B; 4MDX A; 4PJO E; 2FVU A; 3NHN A; 4PKC C; 2RD1 A; 1KIK A; 4V2S A; 4B9W A; 1EZZ B; 2KR3 A; 2V26 A; 3G4S Q; 3CC4 A; 1UB4 A; 3CXC A; 4HVW A; 3EG9 B; 5DLQ E; 3S3N A; 4Y28 E; 1I8F A; 2NUT B; 2HQE A; 1NYF A; 2J06 A; 4PJO A; 4M7D E; 1BBZ A; 5GAM h; 4IUT A; 4J9D A; 2RHY A; 4EMH A; 2LX9 A; 1B34 A; 4OB3 B; 4JS5 A; 1IXD A; 4X9D A; 2EYX A; 2P4R A; 3I56 Q; 5J26 A; 3REA B; 1YJN Q; 2CRE A; 2RJF A; 2DEQ A; 1WJS A; 2ENM A; 1ZA2 B; 2DE0 X; 3PTA A; 4M7D A; 3OS1 A; 1M1K C; 1TTH B; 1OZ3 A; 2ZPH B; 1SPK A; 3PFS A; 2L0A A; 4EMK A; 1I0C A; 1BI2 A; 3JCM P; 2EFI A; 3PVL A; 4QQG A; 2KYM A; 1V76 A; 2DZ9 A; 5ECA A; 4E7L A; 5A0L A; 2HDA A; 5GAN h; 5HY6 A; 5LJ5 d; 1HYO A; 1WNL A; 2DER A; 2D9T A; 3OYJ A; 3E9F A; 1BI0 A; 5KYY B; 4JS4 A; 1TH7 A; 4PFP A; 3OY9 A; 1FMV A; 5CVI A; 1T3S A; 4IUV A; 2ZPG B; 2C0I A; 3OS5 A; 2ABL A; 4E7H A; 2EGA A; 3UAT A; 4IUP A; 1N27 A; 4CC2 A; 3JB9 G; 5CO7 A; 1Q7Y U; 3EGU A; 3OA6 A; 2DRM A; 2K2V A; 3JCM X; 3TU4 K; 5C6S A; 1IGU A; 2CT3 A; 3HPW A; 2OAW A; 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4M7A G; 1UGV A; 2XKO C; 4Y92 A; 1Y96 B; 2DIL A; 1VQ7 T; 4E2F B; 1YN8 A; 3JCM J; 1VQ8 T; 3L2R A; 1YNZ A; 1LJO A; 3MEV A; 4JJD A; 3C95 A; 2VWF A; 3BDL A; 3QPH A; 4LDY A; 3PNW C; 3OMC A; 2HSE B; 2CZ6 B; 2MWO A; 1CKB A; 2ZZD A; 3ASK A; 3OYA A; 3NMZ C; 3CBP A; 1M27 C; 1OZ2 A; 4ZN3 A; 1WQW A; 3EG1 A; 3MEU A; 1BYM A; 1PRL C; 2QGG A; 5IN1 A; 3CCV T; 3HTR A; 3VYG A; 1VQN T; 2WSF E; 4AT1 B; 3PIO A; 3MP8 A; 1Q7Y C; 3R6N A; 3OMG A; 4JDS A; 2RF0 A; 2LJ0 A; 2O4X A; 3HRU A; 1UUE A; 1X6G A; 2DVJ A; 1MGQ A; 1YI2 Q; 2ROT A; 1M8M A; 4B6M A; 4F16 A; 2J7I A; 4JJC A; 3CC7 T; 1P92 A; 4A4G A; 4LXC A; 4LD6 A; 1W2B A; 3QZ9 B; 2NWM A; 4JLG A; 4M78 A; 3VKI A; 1GXI E; 1WGS A; 1G3T A; 2DPP B; 4Z89 A; 5GJV B; 2D0N A; 1VQ6 T; 2X3X D; 4JPB W; 3A5Z B; 3QYH B; 2ZPE B; 2BUD A; 1O9S A; 3ZBD A; 2LQ8 A; 4M7A B; 1FWZ A; 1H8K A; 2D1X A; 3GNG A; 2VUB A; 2EGC A; 1GRI A; 2KK4 A; 4DOV A; 2X4X A; 5A0G A; 1MNE A; 1ZSZ B; 4DEX A; 3OYK A; 2WSE E; 1K1Z A; 1AZE A; 3JCM V; 1MV3 A; 4LNP A; 3VU3 C; 3KXT A; 1WHK A; 3LW5 E; 3VS4 A; 4F7U F; 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