The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
VTLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase/protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Crystallization of and selenomethionine phasing strategy for a SETMAR-DNA complex.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase Fyn
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| total genus |
13
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| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2012-04-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3M0Q A; 2BTT A; 1X27 A; 4GLM A; 1T0H A; 4HVV A; 5IXF A; 1GFD A; 1AZG B; 3EGU A; 2DNU A; 2YUO A; 1N5Z A; 3JV3 A; 1YN8 A; 1CKA A; 2D8J A; 2LMJ A; 2KE9 A; 1B07 A; 2VVK A; 1U5S A; 2A37 A; 1GCQ C; 2EBP A; 1AOJ A; 1K0X A; 3VS1 A; 2FPD A; 4LUD A; 2LJ0 A; 1WX6 A; 2A28 A; 3I5R A; 2LCS A; 4F16 A; 1BB9 A; 4OMN A; 1S1N A; 2LZ6 B; 2F2V A; 3EG2 A; 1PRL C; 1VYU A; 5EC7 A; 2L0A A; 2AK5 A; 1UHC A; 1OV3 A; 3VS2 A; 2O31 A; 3M0R A; 1WA7 A; 2CUD A; 2F2W A; 2ED1 A; 3PE0 A; 1E6G A; 3RNJ A; 3REB B; 3VS3 A; 3SEM A; 2GTJ A; 2JS2 A; 2DBK A; 2DL7 A; 2DYB A; 1KFZ A; 1ABO A; 3VS6 A; 4F17 A; 3FJ5 A; 2K2M A; 1VYV A; 2RQU A; 4ESR A; 3I9Q A; 1X43 A; 2DL3 A; 2E5K A; 1ZBJ A; 4R0K A; 2ENM A; 4RTZ A; 1ZLM A; 4ORZ A; 2LJ1 A; 3EHQ A; 4JJB A; 2O2O A; 5FW9 A; 2JM8 A; 1YWO A; 2L3S A; 1MV0 B; 2J7I A; 2X3W D; 2MOX A; 1EFN A; 1PKS A; 2K6D A; 1AVZ C; 1K4U S; 1ZX6 A; 1NYF A; 2EVR A; 4HVW A; 1YCS B; 1RI9 A; 3H41 A; 1Y57 A; 1WYX A; 4Y92 A; 1SRL A; 2CH4 A; 3SHW A; 5FWB A; 2LQN A; 5HCK A; 3UF4 A; 1ZUK A; 1AWW A; 2CSI A; 1SSH A; 2QDL A; 1T3S A; 3ULR B; 3VS5 A; 1ZUY A; 2L2P A; 2GBQ A; 1RLP C; 3U23 A; 2EYW A; 2JMA A; 3NHN A; 1RLQ C; 5I11 A; 4IIO A; 2RQW A; 2JW4 A; 1LCK A; 2DE0 X; 2EYY A; 3O5Z A; 2I0N A; 3PVL A; 1MV3 A; 1NM7 A; 1AEY A; 2J6K A; 3M0T A; 1UJ0 A; 4QT7 A; 2M0Y A; 1QLY A; 1W1F A; 4JZ4 A; 3VS0 A; 1UG1 A; 2EPD A; 1WXB A; 3UAT A; 2PZ1 A; 2SRC A; 4CC2 A; 3KFV A; 4FSS A; 2EYZ A; 1K9A A; 2O9S A; 1GBQ A; 2OI3 A; 3LH5 A; 2CT3 A; 2FRY A; 2HCK A; 1I0C A; 1U3O A; 5IHN A; 1M8M A; 2KNB B; 1ABQ A; 2OAW A; 4DEX A; 2YUQ A; 1B3Q A; 4AFQ C; 5GJW B; 2YUN A; 2FRW A; 2DBM A; 3ZL7 C; 1XOV A; 1ZUU A; 2DL4 A; 1PKT A; 1GCQ A; 2G6F X; 1AWO A; 4OMO A; 1GBR A; 3THK A; 2L3Q A; 1K0S A; 1UTI A; 3NPF A; 2K3B A; 2KGT A; 1HD3 A; 1OPL A; 1WLP B; 2RN8 A; 4RTT A; 1UE9 A; 1M3B A; 2JTE A; 2RPN A; 4X1V A; 2KRM A; 1PRM C; 3VS4 A; 2DM1 A; 2J6O A; 1AWX A; 2HSP A; 2KXC A; 1BU1 A; 3M0P A; 2FEI A; 4AG1 C; 4F14 A; 1Y0M A; 2NUZ A; 1VA7 A; 1BK2 A; 1NLP C; 3EG0 A; 1V1C A; 3QWX X; 2RF0 A; 2CRE A; 1E7O A; 2JXB A; 4KRT A; 2L3P A; 1CSK A; 4AG2 C; 1YNZ A; 4LUE A; 1M3A A; 1QWE A; 2PNI A; 2LP5 A; 4JPB W; 4JZ3 A; 2DA9 A; 1WI7 A; 4J9C A; 1AWJ A; 1Z9Z A; 4OMM A; 2EQI A; 2AZS A; 4RTW A; 4D8K A; 1UJY A; 4JJC A; 1M27 C; 1UGV A; 2JM9 A; 2BZ8 A; 3I35 A; 1IO6 A; 1ZSG A; 1GRI A; 1X6G A; 4WCI A; 1OPK A; 4RTV A; 3R6N A; 1T3L A; 2J6F A; 2JMC A; 2DIL A; 4AFZ C; 4D8D A; 1OEB A; 1SHG A; 2CSQ A; 2AKK A; 2HDA A; 2HBW A; 4LN2 A; 1TG0 A; 2FO0 A; 4AFU C; 2EGE A; 2JS0 A; 1UHF A; 4LE9 A; 3EHR A; 1SEM A; 2DRK A; 2RQT A; 2CUB A; 4LNP A; 2RQV A; 4HXJ A; 2KXD A; 3PVQ A; 2J06 A; 4K11 A; 1NYG A; 4CC3 A; 2DX1 A; 2LNH B; 3EG3 A; 1H8K A; 2V1R A; 3REA B; 2K79 A; 3VS7 A; 1QKW A; 1X6B A; 1W70 A; 2D0N A; 1I1J A; 2D1X A; 4Z89 A; 2VWF A; 1G2B A; 1K76 A; 1GL5 A; 3QWY A; 3VRZ A; 1CKB A; 4HCK A; 2LX7 A; 1VYT A; 1JEG A; 2O88 A; 2H8H A; 1X2Q A; 4J9B A; 4ZNX A; 4OMQ A; 1WIE A; 2EW3 A; 4RUG A; 2J05 A; 3NGP A; 2X3X D; 1E6H A; 1NLO C; 2YT6 A; 1W6X A; 2W0Z A; 2DLP A; 2YDL A; 2MCN A; 3TSZ A; 2B86 A; 2EYX A; 4Z8A A; 1JO8 A; 2EGA A; 1FMK A; 5I22 A; 2IIM A; 4E6R A; 1QCF A; 2FG0 A; 1QWF A; 2EKH A; 4HVU A; 2KBT A; 1SRM A; 2DF6 A; 4AFS C; 2LQW A; 3M0U A; 1JQQ A; 2GTO A; 1SPK A; 2JT4 A; 1YWP A; 1A0N B; 2ECZ A; 2F2X A; 4RTU A; 4OMP A; 2DL5 A; 2NWM A; 1KIK A; 1X2K A; 2K9G A; 1NEB A; 2HEQ A; 2XMF A; 2ROL A; 5GJV B; 1JXO A; 1WXT A; 3A98 A; 1U06 A; 3UA7 A; 3VRY A; 2RMO A; 2O9V A; 1UEC A; 3H0F A; 4A63 B; 1AD5 A; 2KT1 A; 1MUZ A; 5IHI A; 4JJD A; 1JXM A; 2GQI A; 4M4Z A; 2BZX A; 1FYN A; 2KR3 A; 4IIM A; 4DEY A; 2FPF A; 5FWC A; 1X69 A; 3I5S A; 3IQL A; 4J9H A; 2W10 A; 1YP5 A; 1KJW A; 1QKX A; 2KYM A; 4RTX A; 1ARK A; 1UFF A; 2KRN A; 2OJ2 A; 2EGC A; 2KYB A; 3H0I A; 3H0H A; 1RUW A; 2V1Q A; 3M0S A; 1WFW A; 2ESW A; 2C0O A; 3UA6 A; 1AZE A; 2C0I A; 2RQR A; 2AZV A; 2DMO A; 1TUD A; 1KSW A; 1WXU A; 4GBQ A; 2DVJ A; 1HJD A; 1PNJ A; 1JU5 C; 2ROT A; 2PTK A; 2A36 A; 1SHF A; 1H3H A; 1M3C A; 2KRS A; 2SEM A; 4EIK A; 2BZY A; 2DJQ A; 5L23 A; 2DL8 A; 2FPE A; 1GCP A; 4CC7 A; 4J9E A; 2AKL A; 1UDL A; 5IH2 A; 4RTY A; 2ED0 A; 2VKN A; 5IXB A; 1T0J A; 4Z88 A; 1I07 A; 2RNA A; 2MIO A; 1PWT A; 1H92 A; 2LJ3 A; 1TUC A; 2C0T A; 2ABL A; 2GGR A; 2GNC A; 1BBZ A; 4CC4 B; 2A08 A; 2CT4 A; 1UUE A; 1G83 A; 1K1Z A; 2CDT A; 1PHT A; 5ECA A; 1J3T A; 2KRO A; 1WDX A; 1HSQ A; 1M30 A; 3EG1 A; 2K7A A; 2M51 A; 2YSQ A; 2YUP A; 3GBQ A; 1NG2 A; 2KEA A; 3NMZ C; 2CH4 W; 4J9D A; 1OOT A; 2P4R A; 4J9F A; 2DRM A; 1GFC A; 2KT8 A; 3C0C A; 3CQT A; 4OML A; 5IHK A; 2D8H A; 3TVT A; 4J9I A; 3RBB B; 1NEG A; 3TSW A; 1Z9Q A; 4J9G A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5J3B A; 1PD1 A; 1X27 A; 4OVA A; 1KD1 C; 4M7D F; 1GFD A; 3EGU A; 2RK2 A; 5GAM d; 2KE9 A; 2MK5 A; 4JJN K; 1VQ8 Q; 4HCB A; 2PQW A; 4LDX A; 3OS1 A; 8AT1 B; 2HNI A; 1W2B P; 1U5S A; 3X24 B; 4DQ2 A; 1YIT Q; 3CCV Q; 3VS1 A; 4LUD A; 2CP5 A; 2E4H A; 2A28 A; 1TTH B; 4ANJ A; 4PJN A; 1S1N A; 4L6V 5; 3DKM A; 3EG2 A; 5EC7 A; 3CME Q; 1WQW A; 2AK5 A; 1D3B B; 4PK4 A; 2LQK A; 2M02 A; 3VS2 A; 1VQO T; 3MP8 A; 2CUD A; 5I21 A; 4EMK A; 1Q82 C; 2QQS A; 1Q7Y U; 5KYW B; 4BI3 A; 1K9M R; 3CD6 T; 4C5I A; 2OAU A; 4M75 E; 3REB B; 4QVC A; 1W2B A; 2DL7 A; 3V7S A; 1YI2 A; 2VGN A; 5GMK l; 2E1H A; 1QVF S; 2QQR A; 1X43 A; 3J80 E; 3D7S B; 4WTO B; 2LCC A; 4R0K A; 2LX9 A; 4ORZ A; 3OYG A; 3EHQ A; 2RJF A; 3CCE Q; 2A3L A; 2X51 A; 2JM8 A; 1YWO A; 3PT9 A; 3RDV A; 1MV0 B; 1ZA2 B; 4M77 F; 4BDY A; 5FU7 C; 1D1B A; 1EFN A; 3OYJ A; 1PKS A; 4A4G A; 2R57 A; 3CCJ T; 1NYF A; 1W4S A; 4HVW A; 3CCM T; 1O9S A; 4LD6 A; 1H64 1; 2K5L A; 4Y92 A; 1VQ5 Q; 1YHQ Q; 1SRL A; 1YJN Q; 2LQN A; 2D6F A; 4DBH A; 4NL3 A; 4N4H A; 1SSH A; 2QDL A; 1ZUY A; 4ZTJ A; 4PJO B; 2L2P A; 2GBQ A; 2GQV A; 5GMK i; 2EYW A; 3MJX A; 2E3I A; 3NHN A; 1RLQ C; 5I11 A; 2RQW A; 1LCK A; 2EYY A; 3PVL A; 2WSE E; 1MV3 A; 1TU0 B; 3VS0 A; 2VAS A; 3M58 A; 4D6W A; 4RG2 A; 3VV0 A; 2JN0 A; 3UT1 A; 5LJ3 g; 2SRC A; 1VQ6 Q; 4DA4 A; 3KFV A; 3CC4 Q; 3HPW A; 4DBF A; 3BW1 A; 2FRY A; 2JTM A; 3AT1 B; 5IHN A; 2KNB B; 1ABQ A; 4DEX A; 3L2R A; 2CP3 A; 1YIJ T; 2JOY A; 1RAA B; 5GJW B; 4JRP A; 4L59 A; 5J26 A; 3L2V A; 3LGL A; 2G6F X; 2DO3 A; 3CC2 A; 3THK A; 1MHN A; 1UTI A; 2CP6 A; 1OPL A; 1YJW Q; 1WLP B; 1M3B A; 3CBM A; 1QCO A; 5M9O A; 5LJ5 g; 1C6V X; 3QPH A; 5EG2 A; 2DM1 A; 2J6O A; 3OYH A; 2HSP A; 3SFM A; 2DET A; 5HK0 A; 4KH1 B; 4M75 F; 2DEQ A; 3G6E Q; 1VA7 A; 1BK2 A; 1NLP C; 3CCL Q; 4N0A C; 1PSF A; 2RF0 A; 3E2U A; 1XJW B; 2CRE A; 1E7O A; 2KQW A; 3OYB A; 2LRQ A; 4NOY A; 5FU7 B; 1CSK A; 2X4J A; 5GAM h; 2E64 A; 1Q95 G; 2LP5 A; 3PTA A; 4J9C A; 5HK3 A; 1AWJ A; 1Z9Z A; 3OYE A; 1IRX A; 4E7S A; 1OZ3 A; 1VQ9 A; 3SD4 A; 4RTW A; 4LD9 K; 4D8K A; 5CQX A; 1M27 C; 3OYL A; 2YLB A; 3QO3 A; 3A8G B; 2BZ8 A; 3LLR A; 2DXC A; 5DM7 R; 1X6G A; 4ZGE B; 4RTV A; 3R6N A; 2J6F A; 2DIL A; 4AFZ C; 2P0Q A; 3CC7 T; 5IT9 E; 1HK9 A; 3G4S Q; 4M7A G; 1D0Y A; 2CYZ B; 3VJP A; 2G3R A; 4C92 E; 1M1G A; 1SEM A; 4LNP A; 1N6A A; 4XTZ A; 2KXD A; 2LC4 A; 5GAO m; 4K11 A; 1UB4 A; 1VQ4 T; 2LDM A; 1M4Z A; 1OX9 A; 3REA B; 5GAO l; 3DB3 A; 3VS7 A; 1OI1 A; 1W70 A; 2D0N A; 1I1J A; 1UGR B; 2D1X A; 2YXY A; 4Z89 A; 1OQK A; 2VWF A; 3EFO A; 1GL5 A; 3CCS Q; 3CXC A; 2QDY B; 4FYW B; 4HCK A; 1GXI E; 2LX7 A; 2HAX A; 2O88 A; 2H8H A; 2RD1 A; 1WZO A; 4OMQ A; 1I81 A; 2J05 A; 1KQS P; 3OMG A; 5D7U A; 2X3X D; 1NLO C; 4Q5W A; 4FW1 A; 2L8D A; 3CCR A; 2H3E B; 7AT1 B; 3CMA A; 1JJ2 P; 2RHI A; 1S72 T; 3GOX A; 1QWF A; 1N27 A; 1EIF A; 2EKH A; 4HVU A; 2MF2 A; 2KBT A; 2KVQ G; 4E7H A; 3SWN C; 1BCO A; 1ACM B; 3M0U A; 1JQQ A; 1F1B B; 2K3Y A; 2XHC A; 3OSS C; 1BI3 A; 1OX8 A; 4JS5 A; 1KQS A; 4X9C A; 4C5H A; 2DIG A; 3OW2 P; 2NWM A; 1KIK A; 2XMF A; 2HEQ A; 3RMS A; 1WXT A; 1IGQ A; 3NTH A; 3MEV A; 3CPW P; 3DB4 A; 2QA4 Q; 2RMO A; 4E2F B; 4MML A; 2OTJ T; 1JJ2 A; 1IB8 A; 1UEC A; 1H3Z A; 3JB9 F; 1VQP T; 1BI1 A; 1VQM T; 2BKD N; 4Z02 A; 5GAO q; 3UWN A; 2BZX A; 2FZK B; 2KR3 A; 4DEY A; 4JDS A; 1IRE B; 3M54 A; 2W10 A; 1KJW A; 4Y91 A; 1KHI A; 2QK0 A; 1RAG B; 2K5I A; 2OJ2 A; 2KYB A; 3QYH B; 3SDZ A; 1TUG B; 1KC8 U; 1RUW A; 2V1Q A; 4ZN1 A; 3M0S A; 3EH1 A; 2XU8 A; 5GAO p; 2DTO A; 4XTW A; 4C92 F; 1SSF A; 2C0I A; 4JRI A; 2RQR A; 3QUI A; 1TUD A; 4IUV A; 5FU6 C; 3PIP A; 3G71 T; 2LVM A; 1K9M C; 5KYY A; 4M7A D; 1VQN Q; 9ATC B; 3OYM A; 5LJ3 f; 3JCM J; 1ZSZ A; 2O4X A; 4EIK A; 2DJQ A; 2DL8 A; 4CC7 A; 4QQ6 A; 2AKL A; 1UDL A; 3SB2 A; 2X9H A; 5IXB A; 4B6M A; 1N9R A; 3CCU T; 1I07 A; 1XQH A; 2PUO B; 3JCM P; 5CO7 A; 3VUZ A; 1QVF P; 1N8R C; 4F7U A; 5A0G A; 1TUC A; 3SWN B; 5LJ3 e; 1VQL A; 1VQK A; 4CC4 B; 2CT4 A; 1G83 A; 3OMC A; 3QBY A; 4PJO E; 3BFM A; 4BE0 A; 1AT1 B; 1J3T A; 2HD0 A; 4HCZ A; 2KRO A; 3I56 T; 2YUP A; 5DY9 A; 1B34 B; 4J6X A; 2KEA A; 4FCY A; 3MPU B; 4DBR A; 1KQ2 A; 2DRM A; 1GFC A; 4M77 G; 4OML A; 1X01 A; 5IHK A; 3QHS A; 2RO0 A; 1Z9Q A; 2CZ0 B; 1NZ9 A; 2BTT A; 1T0H A; 4HVV A; 4KUL A; 2FYK A; 2DIQ A; 4QVZ A; 3JV3 A; 2LMJ A; 5LJ5 e; 3I55 T; 2XIC A; 4AMC A; 1M1K U; 2VVK A; 1RL2 A; 2L5Q A; 3RIR A; 2EBP A; 3BY7 A; 1K0X A; 1BIA A; 1WX6 A; 1QVP A; 4F16 A; 5CK9 A; 3ASK A; 1WHK A; 2YRD A; 1R0B G; 2L0A A; 2P84 A; 1UHC A; 1OV3 A; 3M0R A; 4CRI A; 4EMK C; 2F2W A; 2ED1 A; 1IZ6 A; 5FU6 B; 2XDP A; 1LOJ A; 2NUT A; 6AT1 B; 3VS3 A; 3SEM A; 2DAQ A; 2GTJ A; 1YI2 Q; 3P8H A; 2DYB A; 5GAN g; 4F17 A; 3FJ5 A; 3FJP A; 2MMP A; 2V8I A; 5KYU B; 1D1C A; 3N5B B; 3I9Q A; 3EAE A; 4M7A C; 2E5K A; 4NS5 A; 2HMA A; 4RTZ A; 4II1 A; 5LJ3 j; 2MWP A; 2LJ1 A; 2QAZ A; 1WHJ A; 3PFS A; 8ATC B; 1KC8 R; 5FW9 A; 3MEA A; 2CZ6 B; 2L3S A; 4IUP A; 1Q86 U; 3TCJ A; 4ELZ C; 3WVE B; 2E12 A; 1LVK A; 3A8L B; 4KUD K; 1ZX6 A; 4FL6 A; 4M75 G; 5GAN 6; 1RI9 A; 1Q7Y C; 3H41 A; 2CP7 A; 1FMV A; 5GMK h; 1U8R A; 2VXF A; 1ZUK A; 2CSI A; 4GY5 A; 5LJ5 j; 4PJO F; 1QVG S; 3LWI A; 1RLP C; 1VQ8 T; 4IIO A; 4L5G A; 2DE0 X; 1YIT T; 2I0N A; 3CCV T; 1VQ7 A; 3M0T A; 1G3T A; 4QT7 A; 4F7U G; 3C12 A; 3UAT A; 4PJJ A; 4FYY B; 3CME T; 4CC2 A; 2O9S A; 2NUP A; 4ATO A; 1GBQ A; 2BE7 D; 2P0P A; 3LH5 A; 2DKG A; 3QDR B; 2RHY A; 1I0C A; 4EMK B; 3UPU A; 1M8M A; 2VC8 A; 2OAW A; 3INZ A; 3H9N A; 2YUQ A; 2YUN A; 3CCQ A; 2FRW A; 3CC2 Q; 2OTL A; 2DBM A; 1ZUU A; 1MMG A; 2LNV A; 1QMC A; 5KE3 A; 5CKE A; 2K3B A; 3OYI A; 3OQ5 A; 1NJI U; 4RKU E; 1M90 C; 4X1V A; 4M78 A; 1MMN A; 1M1K R; 3HFO A; 2CGH A; 2KXC A; 3M0P A; 3CCE T; 2FEI A; 3M5A A; 4F14 A; 3TRE A; 2X4X A; 4FT4 A; 3V8J A; 4RMO A; 2M1H A; 4MDW A; 2E65 A; 2I2L A; 2JXB A; 5GMK m; 5KYX A; 3DLM A; 1MGQ A; 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