The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
GSHMTFVALYDYESRTEEDLSFKKGERLQIVNNTEGDWWLAHSLTTGRTGYIPSNYVAPSD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Atomic resolution structures of the c-Src SH3 domain in complex with two high-affinity peptides from classes I and II.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein/peptide
|
| source organism |
Gallus gallus
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| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
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| total genus |
9
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| structure length |
61
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| sequence length |
61
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2012-11-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3EHQ A; 2LJ3 A; 2ESW A; 2K3B A; 2ROL A; 1GCQ A; 2H8H A; 3EG2 A; 1CSK A; 2SRC A; 2AZV A; 2J05 A; 2HBW A; 2L3Q A; 2KR3 A; 2DYB A; 1M30 A; 3JV3 A; 2CUD A; 3CQT A; 1HJD A; 2ECZ A; 2BZX A; 4WCI A; 1AEY A; 2DL8 A; 4OML A; 2EPD A; 1W1F A; 2A28 A; 1K1Z A; 1T0J A; 1VYT A; 1RLP C; 1V1C A; 2GTO A; 1WFW A; 3VS1 A; 1AWO A; 2RF0 A; 1NM7 A; 1AOJ A; 2FPF A; 1FYN A; 1RI9 A; 1T3L A; 1AZE A; 4RTW A; 1VYU A; 4RTT A; 3REA B; 1PRM C; 2LNH B; 1HD3 A; 1VA7 A; 2EVR A; 2ROT A; 1KSW A; 2A37 A; 4LUE A; 1ZUY A; 1ZX6 A; 4Z89 A; 4M4Z A; 2GTJ A; 1PRL C; 4D8D A; 1VYV A; 2PNI A; 2EKH A; 2ENM A; 2KBT A; 2JS2 A; 3VRZ A; 1X27 A; 1JXO A; 2FPD A; 1UG1 A; 2KRN A; 1WI7 A; 4EIK A; 2HCK A; 2M51 A; 4RTU A; 3EHR A; 1NYG A; 2MOX A; 1A0N B; 1SEM A; 2RQU A; 1QKX A; 4AFU C; 1UE9 A; 2EGE A; 2XMF A; 2G6F X; 1AWX A; 1UFF A; 4HCK A; 2HEQ A; 1M8M A; 1WXB A; 2O9V A; 2DBK A; 1G83 A; 2EW3 A; 2JW4 A; 2K9G A; 2OJ2 A; 1GCQ C; 1U06 A; 1UJY A; 2KRO A; 1UDL A; 2DX1 A; 1NEG A; 2KYM A; 2OAW A; 1T0H A; 2J6K A; 4CC2 A; 2FO0 A; 2BZ8 A; 2V1R A; 5IXB A; 5EC7 A; 1YP5 A; 1GBR A; 2FRY A; 4DEY A; 1UHC A; 3ZL7 C; 2W0Z A; 1SHG A; 2JM8 A; 3H0I A; 3M0R A; 5IHK A; 1WXT A; 1JO8 A; 1Z9Q A; 2O9S A; 2JMA A; 5FW9 A; 4OMP A; 2K7A A; 1GRI A; 2D8J A; 1SHF A; 1ZLM A; 1FMK A; 5HCK A; 1JEG A; 1KIK A; 2I0N A; 2SEM A; 1GFC A; 1PKT A; 2CUB A; 1KJW A; 2JTE A; 1MV0 B; 3TVT A; 5IXF A; 5GJV B; 2EQI A; 2GBQ A; 1X6B A; 1U5S A; 3VS4 A; 1G2B A; 1E6H A; 3RBB B; 2B86 A; 4J9G A; 2DVJ A; 2X3W D; 4HVV A; 3UAT A; 2LQN A; 5GJW B; 2OI3 A; 1YN8 A; 2YSQ A; 2DNU A; 1PWT A; 2AK5 A; 1MUZ A; 4F16 A; 5L23 A; 1AD5 A; 2CH4 A; 1OV3 A; 1I1J A; 4HXJ A; 2DBM A; 1ABO A; 2D1X A; 2JS0 A; 2M0Y A; 3VS7 A; 1NLO C; 1WLP B; 4CC3 A; 2JMC A; 3NGP A; 3VRY A; 4J9D A; 2PZ1 A; 1H3H A; 3PVL A; 4OMQ A; 1OEB A; 2L3S A; 2DA9 A; 4CC7 A; 3VS2 A; 4IIM A; 2AKK A; 2CSQ A; 4OMO A; 1BU1 A; 1M27 C; 3M0S A; 2DMO A; 3I9Q A; 1CKA A; 2J06 A; 3I35 A; 1UGV A; 1ABQ A; 2RQT A; 1T3S A; 1JXM A; 4Y92 A; 2FRW A; 2C0I A; 1X2K A; 2CDT A; 4J9H A; 4OMM A; 4OMN A; 3R6N A; 4Z88 A; 1Y57 A; 3C0C A; 1GBQ A; 4F14 A; 2JXB A; 1WIE A; 4J9C A; 1PKS A; 2ED1 A; 2FG0 A; 1W70 A; 4AG1 C; 2YDL A; 2MCN A; 4IIO A; 1IO6 A; 1MV3 A; 4HVW A; 1QCF A; 2O31 A; 4ESR A; 4J9I A; 1YWP A; 4JJC A; 3M0U A; 1HSQ A; 3TSZ A; 3VS0 A; 1N5Z A; 2K79 A; 1UTI A; 3EG1 A; 2RMO A; 3THK A; 1ZUK A; 2DRM A; 2O88 A; 1BB9 A; 2HSP A; 4J9F A; 4E6R A; 1QLY A; 3ULR B; 2KXD A; 4F17 A; 1I0C A; 2D8H A; 2JM9 A; 2AKL A; 2D0N A; 1PNJ A; 1YNZ A; 1CKB A; 2KGT A; 3NHN A; 4LN2 A; 3EGU A; 1NLP C; 1X6G A; 2DJQ A; 2BTT A; 1NG2 A; 4JZ3 A; 1TUC A; 2ABL A; 4D8K A; 1GL5 A; 1SRL A; 2A36 A; 2KNB B; 1E6G A; 1YWO A; 2DIL A; 2V1Q A; 1YCS B; 2CRE A; 2LZ6 B; 2W10 A; 1QWE A; 3RNJ A; 3TSW A; 1X43 A; 1TUD A; 1U3O A; 2RN8 A; 2KT8 A; 3LH5 A; 2A08 A; 2EYW A; 2GQI A; 2YT6 A; 2RQV A; 5I11 A; 1BBZ A; 5FWC A; 1GCP A; 2L0A A; 1JQQ A; 4CC4 B; 2PTK A; 1X2Q A; 4LUD A; 2GNC A; 2NWM A; 4X1V A; 2L2P A; 2EYX A; 3GBQ A; 4JJD A; 4R0K A; 2YUN A; 4A63 B; 2DRK A; 3EG3 A; 3H0F A; 2ED0 A; 3U23 A; 3H0H A; 2LQW A; 1K0S A; 1WYX A; 1SPK A; 1LCK A; 3NPF A; 4LE9 A; 1TG0 A; 4RTZ A; 1UHF A; 2YUQ A; 4AFZ C; 1SRM A; 4FSS A; 5IH2 A; 2VKN A; 1PHT A; 2KE9 A; 3I5R A; 1K76 A; 1WXU A; 2DL5 A; 1K0X A; 1M3A A; 3UA7 A; 1NEB A; 2K6D A; 1RLQ C; 2IIM A; 1NYF A; 2CT4 A; 1UEC A; 1M3C A; 3M0T A; 3FJ5 A; 1ARK A; 2GGR A; 4DEX A; 1KFZ A; 2KXC A; 1UJ0 A; 1Z9Z A; 2DL7 A; 2DF6 A; 2E5K A; 1K4U S; 2VVK A; 4GBQ A; 4AG2 C; 1B3Q A; 3I5S A; 3VS6 A; 2L3P A; 2KYB A; 1ZBJ A; 1EFN A; 2LP5 A; 4J9E A; 3KFV A; 2CH4 W; 2FEI A; 3O5Z A; 4K11 A; 1E7O A; 4QT7 A; 2LMJ A; 1Y0M A; 1OPL A; 4AFS C; 2BZY A; 3UF4 A; 1WDX A; 4J9B A; 5FWB A; 1AWW A; 1XOV A; 3M0P A; 4JZ4 A; 2DM1 A; 2EGA A; 3SEM A; 2KRM A; 3QWX X; 2F2V A; 1SSH A; 1BK2 A; 2P4R A; 2F2W A; 4ZNX A; 4RTV A; 1ZUU A; 1OOT A; 1UUE A; 3IQL A; 2DL4 A; 2KRS A; 2K2M A; 2EGC A; 1QWF A; 1AWJ A; 3H41 A; 1H92 A; 5IHI A; 2J6F A; 4JJB A; 4RUG A; 1WX6 A; 2EBP A; 1K9A A; 4AFQ C; 2C0T A; 2LCS A; 2VWF A; 4JPB W; 2RQR A; 1W6X A; 4ORZ A; 2RQW A; 2NUZ A; 4KRT A; 2YUO A; 2FPE A; 1GFD A; 3SHW A; 1I07 A; 2MIO A; 1AZG B; 2DL3 A; 3VS5 A; 1J3T A; 2YUP A; 1S1N A; 2HDA A; 2CSI A; 2DE0 X; 4HVU A; 2C0O A; 3PVQ A; 2KT1 A; 2AZS A; 2JT4 A; 1JU5 C; 2O2O A; 2LJ0 A; 3UA6 A; 2RPN A; 1M3B A; 1H8K A; 3QWY A; 4LNP A; 1QKW A; 2KEA A; 1AVZ C; 2F2X A; 5IHN A; 2X3X D; 2J7I A; 3EG0 A; 3NMZ C; 1B07 A; 1OPK A; 1RUW A; 3M0Q A; 3REB B; 2EYZ A; 4RTX A; 1X69 A; 2QDL A; 2CT3 A; 2LX7 A; 2J6O A; 5I22 A; 1WA7 A; 2LJ1 A; 2EYY A; 3VS3 A; 4GLM A; 3PE0 A; 2DLP A; 3A98 A; 5ECA A; 2RNA A; 4Z8A A; 4RTY A; 1ZSG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2OTJ A; 3EHQ A; 2E6Z A; 2ESW A; 3SB2 A; 1W2B P; 3RER A; 2QQA A; 3JCM d; 3X20 B; 2AZV A; 2J05 A; 4MZT A; 3EH1 A; 3BFM A; 1UB4 A; 2CUD A; 2YRC A; 2ECZ A; 2BZX A; 4JRK A; 4WCI A; 3CCS T; 4IUQ A; 3A5Z B; 4OML A; 4C0Z A; 5I2S A; 5GAM d; 1C1A A; 4F04 B; 2KQW A; 2A28 A; 2QDY B; 4KUL A; 5D6W A; 5FU6 C; 1RI0 A; 2F1L A; 2GTO A; 3JCM P; 3QG1 A; 2AT1 B; 1Y7X A; 2RF0 A; 1SSF A; 1VIE A; 1WHL A; 3LX7 A; 2KMT A; 1K73 U; 5FRM A; 3UPU A; 4RTT A; 1TWB A; 4IUT A; 4ZN1 A; 1YJN Q; 1ZUY A; 5KYU B; 4D8D A; 1FMV A; 1IGQ A; 8ATC B; 2ENM A; 4EMK C; 1UGS B; 3VRZ A; 5KCO A; 2E10 A; 1PD1 A; 5FRO A; 4RTU A; 5L8R E; 4OVA A; 5KCH A; 3CCM T; 3A8M B; 3CD6 T; 2JJ9 A; 2RQU A; 3V7S A; 1YJ9 Q; 3GPL A; 3OA6 A; 3EFO B; 1WJS A; 3EG9 B; 1BKB A; 1PSE A; 1WXB A; 4J5Y A; 1XQH A; 2DBK A; 2KI7 A; 2RHU A; 1GCQ C; 1TS9 A; 4ZGD B; 2KRO A; 2ZGW A; 1NEG A; 4HCC A; 4CC2 A; 1D1A A; 3HKS A; 4XQ3 A; 4C5I A; 4L5G A; 1Q82 U; 3LW5 E; 1GBR A; 3CXC S; 2RJD A; 3G71 T; 3QYG B; 4EMG A; 3VUZ A; 1UGR B; 3FRN A; 5IHK A; 4L6V 5; 1Z9Q A; 3JCM c; 1M1K U; 2O9S A; 3H9N A; 2D8J A; 4WTO B; 2E4H A; 1VOM A; 4PJO D; 1GFC A; 3RKW A; 3JB9 J; 4A4F A; 2GCX A; 2KK4 A; 4J7F A; 3PIP A; 3BDL A; 1NBE B; 1KHI A; 4QKU A; 2VGM A; 5CVI A; 4QVZ A; 4EMH A; 3PTA A; 3CCL A; 1VQO Q; 1LNX A; 2ATC B; 1VQN T; 1UGQ B; 2LQN A; 3E9F A; 5GJW B; 3C95 A; 3HHT B; 2AK5 A; 1AD5 A; 3SFM A; 3MP6 A; 2FZC B; 3M59 A; 1I5O B; 4CC3 A; 3RMQ A; 2JMC A; 2MF2 A; 5AYF A; 1W2B A; 2LCL A; 3JCM Q; 1H3H A; 3RR6 A; 2ZPG B; 4FM4 B; 1YI2 T; 4XU1 A; 3V8J A; 2DPP B; 1VQO A; 1RAE B; 2CSQ A; 2RJE A; 3FJP A; 1JXM A; 5GMK j; 2XHC A; 3M55 A; 2L8D A; 2EQM A; 3CCM Q; 2COW A; 3CMA T; 3NTH A; 2ZPF B; 5A0L A; 3C0C A; 4F14 A; 4M7A E; 3G6E T; 1WHK A; 5GAN e; 2ED1 A; 3HRT A; 2FG0 A; 3INZ A; 2QEX T; 3DLL A; 2VYT A; 1IZ6 A; 3VUB A; 2YDL A; 3GNG A; 2MCN A; 3CCR T; 4E7J A; 4C8Q B; 1VQM A; 4FYW B; 3OYH A; 2E70 A; 1Q95 G; 3M0U A; 3OBW A; 3G71 Q; 3CC2 T; 1VQ9 T; 4M7A C; 2K79 A; 3CME T; 2FVU A; 5LJ5 h; 3THK A; 1ZQ1 A; 2KAF A; 2O88 A; 1MMD A; 3MO8 A; 2CP0 A; 4J9F A; 5CKF A; 1VQL T; 2HNI A; 2YWW A; 1WHJ A; 5GAN g; 3I55 T; 1KD1 R; 5GAO l; 4IUR A; 1MMA A; 1R0C B; 1D1C A; 2D0N A; 1YNZ A; 1CKB A; 3EGU A; 4HA8 A; 2DJQ A; 1KQ1 A; 2QTV A; 1NG2 A; 2QAZ A; 1F1B B; 1O9S A; 2A36 A; 5LJ3 h; 2L5Q A; 2DIL A; 2FB7 A; 4PFP A; 3TEE A; 1QWE A; 2LTO A; 3TSW A; 2CZ0 B; 3EFS A; 1U3O A; 2KT8 A; 3CPF A; 4FT4 A; 4A4H A; 3MJX A; 2CP3 A; 2R5A A; 4B9X A; 1K73 R; 5GAN j; 1JQQ A; 2PTK A; 1X2Q A; 4KGV B; 2GNC A; 2GFU A; 3CCQ Q; 1IHV A; 1N9S A; 1RAA B; 4RG2 A; 1WYX A; 1SPK A; 1M2O A; 1VUB A; 1M5Q 1; 2OAU A; 1M1K C; 4M77 B; 2NUP A; 4FSS A; 2VKN A; 1PHT A; 5HY6 A; 2KE9 A; 5C6S A; 2X35 A; 1EX4 A; 3MKD A; 2BE7 D; 4D6W A; 2K6D A; 2IIM A; 1NYF A; 1W4S A; 3HP9 A; 1TSF A; 3JCM e; 2GF7 A; 3LLR A; 3CC2 Q; 4DEX A; 1UJ0 A; 4HKE A; 2DL7 A; 3CME Q; 3X28 B; 2Y4X A; 2P0P A; 2LX9 A; 2RK1 A; 1N8R C; 3VS6 A; 4M7D D; 2KYB A; 3OS2 A; 4C8Q G; 1VQL Q; 1EIF A; 1ZBJ A; 4DA4 A; 1EFN A; 2CH4 W; 1Q81 U; 1MND A; 2DZC A; 4NOY A; 2LMJ A; 4DBR A; 1VQ7 T; 4AFS C; 4PJO B; 1WDX A; 3FIF A; 3A8G B; 3M0P A; 4JZ4 A; 3VU3 C; 2DM1 A; 3SEM A; 3QWX X; 2D0Q B; 5GMK l; 4DOV A; 2RI2 A; 2EQJ A; 2P4R A; 4OB3 B; 4RTV A; 3JCM g; 4XU3 A; 3IQL A; 3MEU A; 1QWF A; 2QQS A; 4DBF A; 3OYE A; 3CCV T; 4JJB A; 2WSE E; 4MML A; 1YIT T; 2A3L A; 3OYI A; 1KK7 A; 3FB9 A; 1TUG B; 1N6A A; 3MPU B; 1S72 A; 2E1H A; 3MCA B; 2LRQ A; 1K9A A; 4AFQ C; 4BE0 A; 1K8A C; 2K3X A; 3MEV A; 2RQR A; 2RQW A; 2LC4 A; 3OYF A; 2NUZ A; 1GFD A; 3SHW A; 3JCM V; 3MEW A; 2MIO A; 1QVF P; 4E47 A; 3DB4 A; 3VS5 A; 4IKF A; 2YUP A; 1S1N A; 4ELY C; 2QI2 A; 2CSI A; 3G4S A; 2DE0 X; 4HT8 A; 3RUX A; 4HVU A; 3L2U A; 1IRE B; 2MI6 A; 2DET A; 2K57 A; 3VYG A; 3TU4 K; 4M78 B; 2M0O A; 4HT9 A; 3CC7 T; 2RPN A; 1B34 A; 1H8K A; 2DJZ A; 3V7C A; 5GAM j; 4M7D A; 4C8Q E; 1NJI R; 3OYL A; 1R77 A; 1RAH B; 1RUW A; 3M0Q A; 1VQ8 A; 2LX7 A; 3OBY A; 2NUP B; 2CZ7 B; 4R55 A; 5KYY B; 3I56 T; 2V8K A; 2MK5 A; 3SD4 A; 2XD0 A; 2O4X B; 1YIJ T; 1ZSZ A; 2ROL A; 2CP6 A; 5D7U A; 1VQ7 Q; 2V26 A; 4C8Q C; 3A8H B; 3LGF A; 2JTF A; 3X26 B; 2HBW A; 1M30 A; 1QCN A; 1QQJ A; 3GP8 A; 3QUI A; 4BD3 A; 2OTL A; 1QP3 A; 1K1Z A; 1VYT A; 4PJO G; 2OTJ T; 3EH2 A; 2XDB A; 4BY6 B; 1PM3 A; 1XJW B; 1YJW Q; 1AOJ A; 3OSS C; 2QG9 B; 5DLO A; 1T3L A; 2OX7 A; 1VQ4 A; 2QQ9 A; 1VA7 A; 2EVR A; 1BI2 A; 2DXT A; 2JZ2 A; 1WHG A; 1IRX A; 1D09 B; 1ZX6 A; 1M8V A; 3JCM X; 1ZA2 B; 2PNI A; 4FW1 A; 2VV5 A; 2JS2 A; 5CKE A; 1X27 A; 2MWO A; 2FPD A; 4C0F A; 4EIK A; 4BI4 A; 5HK0 A; 2DVE A; 3EHR A; 1NYG A; 1A0N B; 1QKX A; 2VXF A; 1VQK A; 1UFF A; 4HCK A; 1M8M A; 2O9V A; 5FLX E; 3CC4 Q; 1U06 A; 1UJY A; 3PGG A; 5J26 A; 3JB9 H; 1M90 R; 3R6O A; 5GMK h; 3V7R A; 2OAW A; 2J6K A; 2FO0 A; 3EFR A; 2BZ8 A; 3JB9 I; 4LDY A; 1QVF A; 4DEY A; 5I2M A; 1UHC A; 2CS7 A; 2PUK B; 4PFZ A; 2W0Z A; 4UC4 A; 3CPW P; 1YHQ A; 3L42 A; 3JRZ A; 3H0I A; 2RH2 A; 1JO8 A; 1UGP B; 3A1P A; 1YIJ Q; 2JMA A; 5FW9 A; 1LPL A; 5CIU A; 2LCC A; 3SDZ A; 3CC4 A; 1FMK A; 2C06 A; 4M7D B; 1JEG A; 2I0N A; 2H3E B; 2SEM A; 1PKT A; 3CBP A; 4XU2 A; 4PJO E; 3RES A; 3L1A A; 4OGE A; 2R5M A; 5IXF A; 2NYS A; 4IUV A; 2EQI A; 2GBQ A; 1X6B A; 1U5S A; 1G2B A; 2CP2 A; 3RBB B; 2B86 A; 4J9G A; 3CCU Q; 2X3W D; 2OI3 A; 1IB8 A; 2DNU A; 2YRD A; 2ZPB B; 1PWT A; 1KD1 U; 3QKJ A; 5L23 A; 1ZSZ B; 1D0Z A; 1OV3 A; 2PVO B; 3CEY A; 1Q86 R; 4HXJ A; 4KH1 B; 2DBM A; 2JS0 A; 2DTI A; 4PJO C; 3ER0 A; 1VQ5 A; 1I5L A; 3S3M A; 2VC8 A; 5AT1 B; 1QVF S; 3LWH A; 4J6X A; 4KUD K; 2L3S A; 1VQP Q; 3CCU A; 3J81 E; 3EGX B; 4N0A A; 4XTV A; 4IIM A; 2AKK A; 4OMO A; 3VS2 A; 3M56 A; 4BI3 A; 3CCL T; 1BU1 A; 2PVG B; 3M0S A; 2DMO A; 3I9Q A; 1UGV A; 1IHW A; 4J6W A; 4ZTJ A; 1T3S A; 2DFU A; 3BDU A; 5DY9 A; 5M9O A; 4QQD A; 2FRW A; 3GOX A; 3BE3 A; 4QW2 A; 3X24 B; 2DIG A; 2XID A; 4QVD A; 2CDT A; 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