The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
58
|
structure length |
58
|
Chain Sequence |
PNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNQTGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the Abl-SH3 domain H59Q-N96T mutant complexed with the designed high-affinity peptide ligand P17
rcsb |
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase ABL1
|
| molecule tags |
Transferase/unknown function
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
10
|
| structure length |
58
|
| sequence length |
58
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2013-02-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SRL A; 2M0Y A; 2P4R A; 2KYB A; 4J9H A; 1WIE A; 5IHK A; 4Z89 A; 2V1Q A; 5L23 A; 3UA6 A; 5FWC A; 2RQR A; 2L3P A; 2LZ6 B; 4LUD A; 1WXB A; 4J9B A; 3PE0 A; 2KRS A; 4K11 A; 2CH4 W; 1OEB A; 1M3A A; 1A0N B; 2A37 A; 1H3H A; 1HJD A; 3QWY A; 2EW3 A; 1YP5 A; 2F2W A; 3I9Q A; 3GBQ A; 2KEA A; 2CSI A; 2D8H A; 2JTE A; 1NLP C; 2LMJ A; 2DF6 A; 4OML A; 2JT4 A; 2JXB A; 2C0O A; 3TSW A; 2DNU A; 1TUC A; 4RUG A; 5EC7 A; 1Z9Q A; 1M3C A; 2AKL A; 2LJ3 A; 4OMP A; 4HCK A; 1I1J A; 1VYT A; 2D0N A; 2ROL A; 4QT7 A; 1WDX A; 1SRM A; 1B07 A; 2L3Q A; 3H0I A; 2J05 A; 2X3W D; 2LJ0 A; 4LUE A; 2EGA A; 2I0N A; 1AWO A; 1XOV A; 4IIO A; 2DL3 A; 1K76 A; 2J6F A; 1SHF A; 1RLQ C; 3VS3 A; 2J6O A; 3M0Q A; 5IHI A; 3M0P A; 3VS7 A; 1ABO A; 2EVR A; 2SEM A; 2J06 A; 1ZSG A; 2W10 A; 2EQI A; 4LNP A; 3REA B; 2DL8 A; 1OPL A; 1PKS A; 1I0C A; 2J7I A; 2HBW A; 1QWE A; 2DYB A; 1X2K A; 2RN8 A; 2BZY A; 2FG0 A; 4Z88 A; 2JS0 A; 2DRM A; 2K9G A; 2FO0 A; 3VRZ A; 2AK5 A; 4J9D A; 1WLP B; 2GBQ A; 2NWM A; 4AFU C; 1CKA A; 1WYX A; 4AFQ C; 1IO6 A; 2A36 A; 4LE9 A; 1KSW A; 1UUE A; 1BB9 A; 2OAW A; 3H0F A; 1GRI A; 2CT3 A; 2H8H A; 1QCF A; 1MV0 B; 4JJB A; 2BTT A; 2K6D A; 1G2B A; 1YNZ A; 2PTK A; 4ZNX A; 4KRT A; 3IQL A; 2DMO A; 2EKH A; 2AKK A; 2IIM A; 1YWP A; 1SEM A; 1B3Q A; 5FWB A; 3O5Z A; 2O2O A; 2RQU A; 2YUP A; 3EG1 A; 4J9G A; 1ZUK A; 4Y92 A; 2CT4 A; 2DBK A; 4RTZ A; 4GLM A; 1G83 A; 1AWX A; 4RTV A; 1NEG A; 1E6H A; 4AFZ C; 2BZ8 A; 2JMC A; 4E6R A; 3EG3 A; 1UHF A; 3H0H A; 5I11 A; 1I07 A; 3RBB B; 1UJY A; 1X6G A; 2DL4 A; 2OJ2 A; 4JZ3 A; 1W1F A; 2A28 A; 1U06 A; 4HVU A; 1PRL C; 5GJW B; 1WXU A; 4RTT A; 1X43 A; 1K4U S; 3M0R A; 5FW9 A; 2F2V A; 3EHQ A; 2XMF A; 2YUO A; 1NEB A; 3VS5 A; 1PRM C; 4CC2 A; 2A08 A; 2X3X D; 1UG1 A; 2DIL A; 5ECA A; 1N5Z A; 2L2P A; 3VS4 A; 1BK2 A; 3UAT A; 2VKN A; 3I35 A; 1QKW A; 1M30 A; 4Z8A A; 2ABL A; 1JU5 C; 1X27 A; 2KXC A; 2VVK A; 4OMO A; 1AOJ A; 1UDL A; 2DL7 A; 3SEM A; 1CSK A; 3ZL7 C; 1KJW A; 1HD3 A; 2DRK A; 1AWW A; 1VA7 A; 2EBP A; 2OI3 A; 1RLP C; 2JMA A; 2NUZ A; 4D8K A; 3C0C A; 2J6K A; 3VS2 A; 3VRY A; 2LQN A; 1WFW A; 1WX6 A; 1ZLM A; 1QLY A; 3CQT A; 4AFS C; 1JXM A; 2D8J A; 2ECZ A; 3NPF A; 2RMO A; 1H92 A; 3THK A; 2O9V A; 2ESW A; 2GTO A; 1KIK A; 4JJD A; 4D8D A; 4DEY A; 4F14 A; 1AEY A; 1ZBJ A; 3NMZ C; 2MOX A; 3EGU A; 3NGP A; 1AZE A; 2RF0 A; 1AWJ A; 4RTW A; 2DE0 X; 1OV3 A; 2KXD A; 3QWX X; 3I5S A; 2CSQ A; 2FRY A; 2W0Z A; 1RUW A; 3TSZ A; 1ABQ A; 1PKT A; 2CDT A; 3RNJ A; 1KFZ A; 4HVW A; 3FJ5 A; 1UHC A; 3LH5 A; 2HCK A; 1JO8 A; 1WXT A; 1UGV A; 1MV3 A; 1ZUY A; 4ESR A; 2HSP A; 4LN2 A; 2JS2 A; 1WI7 A; 1NG2 A; 2JM9 A; 2DM1 A; 1JXO A; 2DL5 A; 2RNA A; 1NLO C; 2EYW A; 4CC7 A; 2K3B A; 2KT8 A; 2HEQ A; 3M0T A; 4GBQ A; 2YT6 A; 1ZUU A; 4ORZ A; 2FPD A; 1LCK A; 1K9A A; 2L3S A; 1ARK A; 1QKX A; 1E7O A; 2EYZ A; 3EG2 A; 1M27 C; 1GCQ C; 4J9F A; 2GQI A; 4AG2 C; 2LJ1 A; 2O88 A; 1E6G A; 2EGC A; 2V1R A; 4A63 B; 1U5S A; 4RTU A; 2EYX A; 1J3T A; 4J9E A; 2ENM A; 2DBM A; 2BZX A; 3M0S A; 3VS6 A; 1M8M A; 2VWF A; 2FEI A; 1K0X A; 1AZG B; 1SHG A; 1K0S A; 1ZX6 A; 2K7A A; 4HXJ A; 4F16 A; 1T3L A; 2K79 A; 5I22 A; 2GTJ A; 4HVV A; 2ED1 A; 2E5K A; 2KYM A; 4EIK A; 1NM7 A; 2KRO A; 1NYG A; 3VS1 A; 2AZV A; 1PNJ A; 1FYN A; 2LNH B; 1WA7 A; 2CRE A; 2GNC A; 1T3S A; 2FPE A; 1T0J A; 1BU1 A; 1QWF A; 2RQW A; 1UTI A; 1TG0 A; 1M3B A; 2JM8 A; 4CC4 B; 3I5R A; 2DX1 A; 1GFC A; 1VYU A; 2DJQ A; 1UFF A; 5IXF A; 1W70 A; 1UJ0 A; 1SSH A; 1Z9Z A; 1NYF A; 2CUD A; 4AG1 C; 2KNB B; 1UE9 A; 1BBZ A; 1S1N A; 2FPF A; 1GBQ A; 2GGR A; 4RTX A; 4RTY A; 4F17 A; 1GCP A; 1UEC A; 2KE9 A; 2DVJ A; 1YWO A; 1OOT A; 2G6F X; 3UF4 A; 2RPN A; 2YSQ A; 3PVL A; 2ED0 A; 3TVT A; 2YDL A; 3SHW A; 1PHT A; 1YN8 A; 2KT1 A; 4JPB W; 2SRC A; 1HSQ A; 3PVQ A; 1Y57 A; 3H41 A; 3KFV A; 4R0K A; 2ROT A; 2O9S A; 2B86 A; 3R6N A; 1YCS B; 3UA7 A; 4OMM A; 4OMQ A; 1GBR A; 2PZ1 A; 1PWT A; 1H8K A; 4WCI A; 2LCS A; 1AD5 A; 1EFN A; 4JZ4 A; 2K2M A; 3U23 A; 2AZS A; 1T0H A; 1GL5 A; 1Y0M A; 2LP5 A; 4X1V A; 4IIM A; 2KR3 A; 2F2X A; 1X6B A; 2L0A A; 2RQV A; 1SPK A; 1W6X A; 2KRN A; 4JJC A; 3REB B; 5IH2 A; 1CKB A; 1VYV A; 2PNI A; 3EG0 A; 1V1C A; 1JQQ A; 2KBT A; 2KGT A; 1X2Q A; 3NHN A; 5IHN A; 2DLP A; 1X69 A; 2KRM A; 2HDA A; 2CH4 A; 2D1X A; 2DA9 A; 5HCK A; 4J9I A; 1U3O A; 4FSS A; 2EYY A; 2QDL A; 4OMN A; 5IXB A; 2LQW A; 3M0U A; 1MUZ A; 1JEG A; 2YUQ A; 1RI9 A; 1TUD A; 2EPD A; 3EHR A; 2CUB A; 2C0T A; 2LX7 A; 1GCQ A; 2EGE A; 3A98 A; 4CC3 A; 5GJV B; 2YUN A; 3JV3 A; 1AVZ C; 2C0I A; 4M4Z A; 2MIO A; 1FMK A; 3ULR B; 1OPK A; 4DEX A; 1K1Z A; 2JW4 A; 2FRW A; 2RQT A; 2MCN A; 2M51 A; 2O31 A; 3VS0 A; 1GFD A; 4J9C A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5CR2 A; 1YIJ Q; 3P8H A; 4Z89 A; 2DPP B; 1WHJ A; 3QG1 A; 3UA6 A; 1YJ9 T; 4LUD A; 1KQ1 A; 1H3H A; 5EG2 A; 1HJD A; 2RI3 A; 1YP5 A; 2G3R A; 4HT8 A; 3SD4 A; 2HD0 A; 3CBP A; 3CCV Q; 2CZ6 B; 2HL5 C; 1Q86 U; 2V8K A; 1RAD B; 2FZK B; 3TSW A; 2LQ8 A; 1PC0 A; 4RUG A; 2HMA A; 5LJ5 f; 4LD6 A; 1M90 U; 1VYT A; 2ROL A; 5GAO m; 3M58 A; 2EJ9 A; 2OAU A; 2FZG B; 3CCJ A; 1XOV A; 2HZY A; 5FLX E; 3Q1J A; 2DL3 A; 2J6O A; 4KUD K; 3JRZ A; 4KUI A; 1D1A A; 1ACM B; 4BB7 A; 3J7A F; 2J06 A; 5GMK l; 3OYM A; 2W10 A; 1EX4 A; 2EQI A; 1RAG B; 3EGX B; 2WSC E; 3DKM A; 2QGF B; 2E12 A; 2DTI A; 4J6X A; 3D7S B; 1MMN A; 4P5N A; 2RJD A; 4KGV B; 4LXC A; 1RAE B; 2MPX C; 4C0Z A; 3HFN A; 2A3L A; 3JCM e; 2F5T X; 2K9G A; 3WVE B; 2EAY A; 1D1C A; 3I55 T; 3OW2 A; 4LDX A; 5GAN j; 4OGC A; 1Q7Y U; 2AK5 A; 1BCM A; 1WLP B; 1OQK A; 2QXF A; 1BI0 A; 1WYX A; 3V7R A; 3OYH A; 2LT1 A; 2A36 A; 4BUG A; 4WF2 A; 1UUE A; 1BB9 A; 2DXC A; 3MEW A; 1YIT Q; 3JCM g; 1GRI A; 3E9G A; 4N4H A; 2H8H A; 1QCF A; 1O75 A; 1TH7 A; 1MV0 B; 3CCL T; 2YRC A; 2Z0W A; 1M4Z A; 4ZNX A; 3LW5 E; 3IQL A; 3RDV A; 5GAN 8; 3FC3 A; 2LC4 A; 3P8D A; 3S3M A; 1SEM A; 1Q95 G; 5CKE A; 4N0A A; 1I81 A; 3I56 A; 4PJO B; 3EG1 A; 3JCM Q; 4BDY A; 7AT1 B; 3HSB A; 1Y96 A; 2P84 A; 2DER A; 4F7U E; 3G7Z A; 4M78 E; 2M16 A; 2X9H A; 4GLM A; 2AT1 B; 1QVG S; 1HK9 A; 2RM4 A; 3OS2 A; 1VQ4 T; 1VQK Q; 5KYN A; 3QZ5 B; 3DB4 A; 3H0H A; 2OTJ Q; 1I07 A; 4J8O A; 3CC7 A; 3CD6 A; 1X6G A; 3X20 B; 4C92 B; 4ZGE B; 4JZ3 A; 2MI6 A; 1W1F A; 5J39 A; 4FL6 A; 5GAN g; 1FWZ A; 4CRI A; 1QVP A; 2HSE B; 1OX9 A; 3VS5 A; 4CC2 A; 1UG1 A; 1WHM A; 1BK2 A; 1IHW A; 4V2S A; 3CEY A; 4M7D C; 1RAB B; 2IPO B; 2A7Y A; 1M30 A; 1X75 C; 1VQ7 Q; 2KXC A; 3JCM W; 3QKJ A; 1UDL A; 3VKI A; 3ZL7 C; 1JJ2 S; 4NL3 A; 1HD3 A; 2DRK A; 1KHC A; 2MYS A; 5DLQ E; 2CZ1 B; 4JRQ A; 3NTK A; 4D8K A; 4M75 B; 3C0C A; 1VQ5 A; 3A8G B; 2Y4X A; 4FW1 A; 3EFS A; 1JXM A; 1VQ9 T; 3BDL A; 2X4X A; 2L8D A; 3TCJ A; 4F7U F; 4JJD A; 4D8D A; 4DEY A; 4Y91 A; 2MOX A; 5D7U A; 3DB3 A; 5GAM j; 2KAF A; 3N5B B; 1PCX A; 4RTW A; 2XDB A; 4C5I A; 3QWX X; 1VQ8 A; 2DD5 A; 4C0D B; 2W0Z A; 4C8Q C; 1RUW A; 2X4J A; 3TSZ A; 2AIR B; 4A4G A; 3RIR A; 3G71 T; 3A8L B; 3CBM A; 1MMG A; 3M57 A; 3T9N A; 2L5Q A; 3FJ5 A; 2DEU A; 2VYT A; 3LH5 A; 5GAO l; 1WPY A; 1UGV A; 3QPH A; 1MV3 A; 2K5I A; 1BYM A; 4FIB A; 3CXC P; 1VQN T; 1TS9 A; 2DD4 A; 1WI7 A; 3CCQ A; 3DLM A; 3MO8 A; 2QEX Q; 2EYW A; 4CC7 A; 2K3B A; 1TXQ A; 2R5A A; 3L1A A; 5KYW B; 3VJP A; 2DVE A; 4GBQ A; 2CP3 A; 2HKN A; 2YT6 A; 4ORZ A; 2VUB A; 2MWP A; 1NJI C; 4M77 E; 2GFU A; 3EGX A; 4ZGJ B; 1WHK A; 4PNO A; 2EYZ A; 4JLI A; 1GCQ C; 5LJ3 h; 2QI2 A; 1E6G A; 1OU9 A; 2EYX A; 4XAX B; 4J9E A; 5GAM g; 3VS6 A; 2VWF A; 2FEI A; 3CC4 A; 4A53 A; 1SHG A; 1ZX6 A; 3OYI A; 2XU8 A; 1BIB A; 4F16 A; 4HXJ A; 1VQ7 T; 1N8R C; 2ED1 A; 4KH1 B; 2KRO A; 2RHI A; 2QA4 A; 1QW1 A; 3VS1 A; 3KUF A; 3OYJ A; 3M4G A; 1WA7 A; 4BE2 A; 3JCM d; 2V8J A; 2E6N A; 3OBY A; 1BU1 A; 1QWF A; 5DM7 R; 4HA8 A; 1X01 A; 1I8F A; 3HRU A; 3TU4 K; 2H3J A; 2OX7 A; 2DJQ A; 4ELY C; 5IXF A; 5FRO A; 1BCO A; 3FLG A; 3QSU A; 1V29 B; 3HFO A; 2PVO B; 3HP9 A; 3GIB A; 4RTY A; 5FU7 C; 4F17 A; 1GXI E; 1NJI R; 1GCP A; 3SWN B; 2DVJ A; 1IRX A; 4DOV A; 3UF4 A; 2RPN A; 2YSQ A; 3OSV A; 2OTL T; 2SRC A; 1W2B A; 1IGQ A; 2YHT A; 1YCY A; 1OI1 A; 5KYX B; 3JB9 H; 3KFV A; 4M7A C; 1RAH B; 4AT1 B; 2O9S A; 2I2L A; 3CPW P; 3R6N A; 4XTV A; 3LGL A; 4FW2 A; 1QP3 A; 1N8R R; 1MHN A; 2HKQ B; 2M02 A; 4TVR A; 1VQL A; 1JRI A; 1YJW Q; 2AZS A; 1U1S A; 2COZ A; 3RR6 A; 2CP5 A; 3CCE Q; 4A4E A; 4X1V A; 4IIM A; 4WTO B; 1X6B A; 2YRD A; 3LLR A; 1CKB A; 3HPW A; 1VYV A; 4M78 C; 4CI0 C; 2HL3 A; 4E7H A; 2YLB A; 5CCA A; 4EDU A; 2D1X A; 2E3H A; 2CZ0 B; 2DA9 A; 1VQ6 Q; 2A0F B; 4M75 A; 2EYY A; 2LDM A; 1YBY A; 2YUQ A; 1RI9 A; 1TUD A; 4UC4 A; 3EHR A; 2C0T A; 2LX7 A; 1GCQ A; 2EGE A; 2EQU A; 3CCM Q; 1AVZ C; 2C0I A; 1VQM A; 5IAY A; 2O01 E; 4HCZ A; 4DEX A; 2RD1 A; 2JW4 A; 2ZPH B; 5LJ3 j; 2LNV A; 1VQP T; 1GFD A; 3VYH B; 1OX8 A; 1SKU B; 2P4R A; 2KYB A; 2HNI A; 2R5M A; 1PD1 A; 2KY9 A; 5FWC A; 4BI4 A; 4A4F A; 4FYX B; 5KE3 A; 2LZ6 B; 1TOV A; 5FU6 C; 1WXB A; 3PE0 A; 1M3A A; 2KSS A; 2QQA A; 2QQR A; 3JCM h; 2EQK A; 1KQS S; 3CCR A; 2PUK B; 4E7I A; 2VAS A; 4R55 A; 2B8A A; 3ASK A; 4ANJ A; 2LMJ A; 2DF6 A; 4OML A; 3RKY A; 4XTY A; 1M1K C; 2C0O A; 2Y90 A; 1TUC A; 1UGS B; 3JCM b; 3SDZ A; 3PTA A; 2LJ3 A; 3QHS A; 4OMP A; 1I1J A; 2D0N A; 3CCJ Q; 4QT7 A; 1SRM A; 4FYW B; 5LJ3 e; 3QDF A; 4XU1 A; 2LTO A; 1BIA A; 4L6V 5; 2COW A; 3QDR B; 3VS3 A; 1IZ6 A; 2EYQ A; 1YJN T; 2QQ9 A; 1K8A C; 3M0P A; 3VS7 A; 2GFA A; 2RHZ A; 3URG A; 2SEM A; 2DL8 A; 4XTZ A; 3CME A; 3ME9 A; 1YHQ T; 1PKS A; 3JCM X; 5GAN h; 1KG1 A; 1QVG A; 2DRM A; 3CCS T; 2XDP A; 3VRZ A; 2GBQ A; 1H64 1; 4OP0 A; 4EPC A; 1VQO A; 4Q5W A; 3BE3 A; 4AFQ C; 1IO6 A; 1JJ2 P; 2OAW A; 4RKU E; 1M1K R; 2FYK A; 3G6E A; 4PJO E; 1QVF A; 4E47 A; 5CQY A; 3SWN A; 2CP2 A; 2JN0 A; 2DMO A; 2EKH A; 5D6Y A; 1S72 T; 1OU8 A; 2IIM A; 1YWP A; 2E3I A; 4O5V A; 3G4S A; 1K8A R; 5FWB A; 3I56 Q; 2O2O A; 1M1G A; 5KYX A; 3OSS C; 3OMG A; 4C92 E; 2JUF A; 1ZUK A; 4Y92 A; 4MDW A; 2DBK A; 3EG9 B; 3PIO A; 5CIU A; 3OYC A; 1G83 A; 1Q81 C; 1AWX A; 4J83 A; 4RTV A; 1E6H A; 2M9U A; 2PQW A; 2CGH A; 4AFZ C; 2JMC A; 3CCU A; 4MMK A; 2L89 A; 3CC7 Q; 3CD6 Q; 2QTX A; 5I11 A; 1YI2 A; 4FT4 A; 3EFO B; 1UJY A; 4QQ6 A; 2OJ2 A; 3H8Z A; 4MML A; 2ZCF B; 3CPW S; 1PRL C; 4Y28 E; 1AHJ B; 1G3S A; 3M0R A; 5FW9 A; 1DJ7 B; 2MK5 A; 2YUO A; 2A08 A; 3CC2 T; 2X3X D; 4M75 E; 3A8H B; 4QVZ A; 1ZSZ C; 2DTH A; 4IUQ A; 3CMA A; 1N5Z A; 2L2P A; 2VKN A; 4PJO F; 1RAC B; 3V8K A; 3I35 A; 2P0P A; 1LJO A; 1QKW A; 1JB0 E; 3PMI A; 2ABL A; 5CAI A; 1X27 A; 5GAO p; 4OMO A; 5GAN 6; 3OYY A; 2DL7 A; 3PIP A; 4NS5 A; 1VQ5 Q; 1KJW A; 2JZ2 A; 2OI3 A; 1MMA A; 3M9Q A; 1YJ9 A; 3VRY A; 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