The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
NLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the Abl-SH3 domain at pH3
rcsb |
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase ABL1
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
11
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2013-03-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2V1R A; 3EGU A; 2DE0 X; 2RPN A; 2DIL A; 1NG2 A; 4RTX A; 1PHT A; 2HEQ A; 2JS2 A; 2MCN A; 2L3S A; 2RQT A; 2H8H A; 5GJV B; 3CQT A; 1YWO A; 2LMJ A; 1WXU A; 2CT4 A; 4Z88 A; 4JPB W; 4F16 A; 2W0Z A; 1G83 A; 4RTU A; 1XOV A; 2X3X D; 2HCK A; 1K0S A; 4AFS C; 2RQR A; 4JJB A; 2O31 A; 4OMP A; 1IO6 A; 2FPD A; 4WCI A; 3TVT A; 2IIM A; 3TSW A; 1M8M A; 1BK2 A; 3U23 A; 2BZ8 A; 2DL3 A; 5IXB A; 2YDL A; 3EG1 A; 2EQI A; 1UE9 A; 1X2K A; 4R0K A; 3M0T A; 2LZ6 B; 1T3L A; 1WX6 A; 3SEM A; 1CKB A; 2KRN A; 2C0O A; 2MOX A; 2O2O A; 2AZS A; 3VS5 A; 1Z9Z A; 1FMK A; 3VS1 A; 4D8K A; 1JXM A; 1X69 A; 1OEB A; 1VYU A; 1JXO A; 3H0F A; 1K0X A; 4J9H A; 4AFQ C; 1TUC A; 3VRZ A; 1WYX A; 2LCS A; 4Y92 A; 2D8H A; 4GLM A; 2QDL A; 2DL8 A; 2VWF A; 2YUQ A; 2DLP A; 2JXB A; 2DF6 A; 4J9I A; 1H92 A; 1BU1 A; 2KRS A; 2YUP A; 5L23 A; 1J3T A; 2JMC A; 1GCQ A; 1KJW A; 3EHQ A; 1QWE A; 2ED1 A; 1KFZ A; 1WFW A; 1UHF A; 2GQI A; 2K6D A; 2KT8 A; 4RTT A; 2B86 A; 3VS6 A; 2LQW A; 1ZX6 A; 1UEC A; 1VA7 A; 2AKL A; 2MIO A; 3THK A; 2ESW A; 1B3Q A; 2J6O A; 4OMQ A; 1E6G A; 2C0T A; 2W10 A; 1CSK A; 2JMA A; 4LNP A; 2SEM A; 5ECA A; 5IHK A; 1MUZ A; 1WA7 A; 1SRL A; 2DL5 A; 2EGA A; 1SPK A; 3R6N A; 2PZ1 A; 1GCQ C; 1UGV A; 2OI3 A; 1OV3 A; 4RTV A; 1WXT A; 2J6F A; 4CC4 B; 1W6X A; 1HD3 A; 1RLP C; 2VKN A; 2DL4 A; 2EVR A; 2HDA A; 2AKK A; 4IIM A; 5IXF A; 2D1X A; 1G2B A; 3PE0 A; 1UHC A; 2EYW A; 4AFU C; 2LJ3 A; 2XMF A; 2LP5 A; 3M0Q A; 2KE9 A; 2RNA A; 1K76 A; 2EW3 A; 2M0Y A; 5I11 A; 3UA7 A; 2G6F X; 1ZSG A; 3UAT A; 1YNZ A; 2RQU A; 2CSQ A; 5IH2 A; 4E6R A; 1NM7 A; 3GBQ A; 1AWW A; 2ECZ A; 2J7I A; 2EGE A; 2RMO A; 1W1F A; 2LX7 A; 2K3B A; 1OOT A; 2A36 A; 4F14 A; 4RUG A; 1ARK A; 2YT6 A; 2JT4 A; 2EPD A; 4ORZ A; 2KYB A; 1UUE A; 2KXD A; 1NYG A; 3REB B; 1N5Z A; 3NHN A; 3NPF A; 4J9E A; 1AEY A; 4K11 A; 5HCK A; 4Z89 A; 4JZ4 A; 4D8D A; 3NGP A; 4RTW A; 2AZV A; 4CC2 A; 2GNC A; 2DA9 A; 2L0A A; 2F2W A; 2LQN A; 1BB9 A; 2NWM A; 3M0P A; 1ZBJ A; 1T0J A; 4J9F A; 1JEG A; 4GBQ A; 1U5S A; 2JS0 A; 2FEI A; 4ESR A; 1X2Q A; 2BZY A; 1AOJ A; 1X27 A; 1VYT A; 1VYV A; 1RLQ C; 4OML A; 3FJ5 A; 3VS0 A; 4EIK A; 2SRC A; 4OMM A; 2DBK A; 2FPF A; 1GBR A; 2O88 A; 5EC7 A; 5FW9 A; 3ULR B; 1MV0 B; 2CUB A; 4LE9 A; 3H41 A; 1PRM C; 2RF0 A; 2C0I A; 2EBP A; 1SHG A; 2LJ0 A; 1EFN A; 2OAW A; 1SEM A; 1T3S A; 2CT3 A; 5IHN A; 2DRK A; 4J9B A; 4X1V A; 4AG1 C; 1QKW A; 1T0H A; 4LN2 A; 1YWP A; 1UG1 A; 1ZUU A; 4JZ3 A; 1ZUK A; 1AD5 A; 2AK5 A; 2YUN A; 2L3P A; 3I5S A; 4CC3 A; 1NLP C; 2BZX A; 2E5K A; 4AFZ C; 1GL5 A; 4J9G A; 2HSP A; 2CUD A; 1S1N A; 3RBB B; 2J05 A; 4KRT A; 1UTI A; 2F2V A; 3I9Q A; 1ABO A; 4ZNX A; 1I1J A; 4CC7 A; 1NEG A; 2KNB B; 2ROT A; 2FPE A; 3I35 A; 2P4R A; 2JW4 A; 2ROL A; 1I0C A; 1U3O A; 3M0S A; 2EKH A; 1WI7 A; 2DL7 A; 3M0R A; 1U06 A; 1MV3 A; 1JQQ A; 1SHF A; 1V1C A; 1KIK A; 2HBW A; 1E7O A; 1SSH A; 1UJY A; 1H3H A; 2X3W D; 1PWT A; 3UA6 A; 1I07 A; 1Y57 A; 1Z9Q A; 1WDX A; 1WLP B; 4LUD A; 3KFV A; 4J9D A; 2FO0 A; 1AVZ C; 2L3Q A; 4DEY A; 2CH4 W; 3O5Z A; 2RQV A; 1X6B A; 4RTZ A; 3H0I A; 1HSQ A; 4HVV A; 4QT7 A; 2KT1 A; 2YSQ A; 1AZE A; 2PTK A; 4J9C A; 1K9A A; 2OJ2 A; 1NYF A; 2JTE A; 3ZL7 C; 2KEA A; 1AWJ A; 3TSZ A; 1M3C A; 1RUW A; 2K9G A; 1TUD A; 1OPL A; 3I5R A; 2KYM A; 2DMO A; 1X43 A; 1ZUY A; 3UF4 A; 3LH5 A; 3VS2 A; 1GFD A; 2YUO A; 1M30 A; 1ABQ A; 2K7A A; 3VS7 A; 2ED0 A; 2GTJ A; 2RQW A; 1A0N B; 1LCK A; 2LNH B; 3RNJ A; 2DBM A; 4RTY A; 1W70 A; 2KRM A; 3SHW A; 2K79 A; 1B07 A; 1QCF A; 2BTT A; 1GFC A; 2V1Q A; 1M3A A; 4A63 B; 4LUE A; 2KRO A; 3QWY A; 3VS3 A; 2K2M A; 1YCS B; 2EYY A; 4OMO A; 1AWO A; 2CRE A; 2DVJ A; 2A37 A; 2D8J A; 2J6K A; 2O9S A; 2DM1 A; 2L2P A; 2ABL A; 1K1Z A; 1GBQ A; 1OPK A; 1UJ0 A; 1FYN A; 2NUZ A; 2KBT A; 4IIO A; 1TG0 A; 1AZG B; 1CKA A; 2DNU A; 1Y0M A; 1M27 C; 1M3B A; 5FWB A; 1QWF A; 2DX1 A; 1PNJ A; 2DRM A; 3IQL A; 2VVK A; 2DJQ A; 2EYX A; 1H8K A; 2J06 A; 4OMN A; 2DYB A; 2A08 A; 2GGR A; 4DEX A; 1GRI A; 3VRY A; 3NMZ C; 3M0U A; 1QKX A; 4HXJ A; 3EHR A; 2I0N A; 1NEB A; 3PVQ A; 1PRL C; 2EGC A; 4M4Z A; 3PVL A; 3REA B; 3H0H A; 1YN8 A; 1PKT A; 2GBQ A; 2FRY A; 2KR3 A; 2D0N A; 2M51 A; 2KGT A; 4AG2 C; 4HCK A; 2GTO A; 3EG3 A; 3EG0 A; 2FG0 A; 2CH4 A; 4HVW A; 2LJ1 A; 2CSI A; 2EYZ A; 1WIE A; 5I22 A; 1NLO C; 1JU5 C; 2ENM A; 1KSW A; 1SRM A; 4FSS A; 4F17 A; 2F2X A; 2FRW A; 5FWC A; 5GJW B; 1HJD A; 1YP5 A; 2CDT A; 3EG2 A; 2JM9 A; 4HVU A; 1E6H A; 1UFF A; 2JM8 A; 1BBZ A; 5IHI A; 4Z8A A; 3VS4 A; 2A28 A; 2KXC A; 4JJD A; 3JV3 A; 1X6G A; 2O9V A; 4JJC A; 1ZLM A; 1JO8 A; 1RI9 A; 3C0C A; 2PNI A; 1QLY A; 3A98 A; 1K4U S; 1WXB A; 1GCP A; 1AWX A; 3QWX X; 1UDL A; 2RN8 A; 1PKS A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2V1R A; 1BYM A; 3EGU A; 1JJ2 S; 2MCN A; 2RH2 A; 2RQT A; 1Q82 C; 5C6S A; 4FIB A; 3AHU A; 3SFM A; 2W0Z A; 4ME7 A; 3CBO A; 1VQM Q; 1SSF A; 4AFS C; 1X01 A; 2M0O A; 4OMP A; 2O31 A; 5CKD A; 2IIM A; 2CZ1 B; 2LQ8 A; 2HKN A; 1VQP A; 2M02 A; 3HPW A; 1QP2 A; 2K5L A; 1N8R R; 4RCC A; 2IPO B; 4KT0 E; 1QMC A; 1VQ8 Q; 2QEX T; 3EG1 A; 5A2Q E; 2JTF A; 1X2K A; 2CGH A; 2KRN A; 1Y96 A; 4ZN1 A; 5GAN 6; 5HK0 A; 1JJ2 A; 1VYU A; 1QW1 A; 3QUI A; 1YFN A; 3HHT B; 1JXO A; 2PVD B; 1K0X A; 2XK0 A; 1TUC A; 1EIF A; 1VQ9 T; 2V8J A; 3LGF A; 3TEE A; 3EFO B; 2EIF A; 2E4H A; 4GLM A; 5LJ5 g; 3OYB A; 4M78 D; 2BE7 D; 2HQE A; 4J9I A; 4XU2 A; 2KRS A; 3CC2 A; 3EGX A; 5FU7 B; 1KK7 A; 2PVO B; 3ZBD A; 1PCX A; 1J3T A; 1GCQ A; 1KJW A; 2ZAE A; 3EHQ A; 1XNI A; 1WHG A; 3PIP A; 2VGN A; 5GAM e; 2IVW A; 4XTZ A; 2B86 A; 3M59 A; 1YJN Q; 3UT1 A; 1VQ7 A; 2AKL A; 2EJF A; 4JLG A; 2XHC A; 2ESW A; 1B3Q A; 3GPL A; 1QCN A; 2JMA A; 3A8G B; 5FU6 C; 5IHK A; 1MUZ A; 1QCO A; 4BI4 A; 5CQY A; 2DL5 A; 1QVG S; 3JB9 J; 1K8A C; 1SPK A; 2L5Q A; 3DKM A; 1UGV A; 4ZN3 A; 2J6F A; 1KQ1 A; 1W6X A; 1VQN A; 1HD3 A; 5KYW A; 5IXF A; 4C0G A; 1G3Y A; 5KYN A; 3PE0 A; 4AFU C; 4DBF A; 2LJ3 A; 4LD9 K; 2LP5 A; 2HQX A; 5LL6 S; 9ATC B; 4IUV A; 1ZA2 B; 4N4I A; 1KC8 R; 4O5V A; 3OYA A; 4EPC A; 2K3Y A; 3C12 A; 4M77 B; 5KYU B; 3UAT A; 4M75 E; 1NM7 A; 4OP0 A; 4A4K A; 2E10 A; 4M78 E; 1R77 A; 1OOT A; 2A36 A; 4M7D D; 3E1S A; 3J7A F; 1YIJ Q; 2DIG A; 2VV5 A; 2KYB A; 1K9M U; 1ZQ1 A; 2OAU A; 4L5G A; 5I2S A; 2RD1 A; 4PLL A; 2A3L A; 4C5E A; 5C0M A; 3CCR T; 1VQL T; 1YHQ A; 3NGP A; 1QVG A; 3OS0 A; 1U8R A; 4CC2 A; 1R8O B; 2L0A A; 2V26 A; 2WAC A; 1I8F A; 8AT1 B; 1WNL A; 1ZBJ A; 3A8L B; 4J9F A; 4BI3 A; 4DQ2 A; 1JEG A; 2JS0 A; 1B7T A; 4ESR A; 2MI6 A; 1X27 A; 2LCC A; 5GMK j; 1VYT A; 3JB9 I; 1VYV A; 1P92 A; 1XTD A; 3CME Q; 3EH1 A; 4OMM A; 2P0P A; 2NUT A; 2O88 A; 1OU8 A; 3ULR B; 3CCL T; 1C0M A; 4ZGD B; 4HKE A; 2CUB A; 2HNI A; 4Q5W A; 5KCO A; 1PRM C; 3OS5 A; 3OYK A; 2DTH A; 1SHG A; 1H3Z A; 1MMG A; 2DXB A; 3J80 E; 3L42 A; 2NYS A; 2JOY A; 3MP1 A; 3C94 A; 4M75 B; 4Y28 E; 4E7J A; 5CR2 A; 4J9B A; 2YLB A; 1M2V B; 1T0H A; 4M78 B; 2QQ9 A; 5D6Y A; 3MEV A; 4J83 A; 2CS7 A; 2CP0 A; 1ZUK A; 3VJP A; 3I5S A; 4XTY A; 1M1G A; 1GL5 A; 3TU4 K; 4M7D E; 1YJW A; 2DD4 A; 4PJO C; 2J05 A; 5CKB A; 4KRT A; 2DET A; 1YJN A; 3I9Q A; 1M90 R; 2P0Q A; 5D6X A; 3VYH B; 2E64 A; 3Q1J A; 5FRM A; 2MPX C; 2ROL A; 2DL7 A; 3CBM A; 5GAN 8; 1WQW A; 1SSH A; 3E9F A; 2X3W D; 1PWT A; 5IAY A; 2QGG A; 1Y57 A; 1VQ4 T; 2FO0 A; 1AVZ C; 2L3Q A; 3RMQ A; 5CKE A; 5CQX A; 2HSE B; 4RTZ A; 3H0I A; 4HVV A; 5AYF A; 2KT1 A; 2YSQ A; 2LX9 A; 1D1A A; 3MET A; 2MF2 A; 1PD0 A; 1K9A A; 2COZ A; 1V76 A; 1NYF A; 2KEA A; 1RAG B; 1M3C A; 3M56 A; 4E7H A; 3I5R A; 1YIJ A; 3V8J A; 3CCV T; 4HT8 A; 2WSE E; 3BW1 A; 1VUB A; 1X43 A; 1OQK A; 4II1 A; 3QJY A; 1PSF A; 4RG2 A; 2YUO A; 4M7D B; 1ABQ A; 5GAM d; 1R0C B; 4F04 B; 3VS7 A; 4E7I A; 2RQW A; 3O8V A; 2OTJ T; 1LCK A; 2LNH B; 2BIV A; 2P84 A; 3H8Z A; 2QYZ A; 1W70 A; 2K79 A; 2QQB A; 4FM4 B; 2C06 A; 2BTT A; 1GFC A; 1K8A U; 3CME A; 3EFO A; 2KRO A; 4ZTF A; 2K2M A; 1YJ9 Q; 1YCS B; 2EYY A; 2IG0 A; 4OMO A; 2CRE A; 2DVJ A; 2A37 A; 2J6K A; 1VQ9 A; 2BUD A; 2DM1 A; 2DEU A; 4RG8 A; 4LDU A; 1GBQ A; 2CP5 A; 4C0D C; 1S72 T; 2GCX A; 2RHI A; 4FSX A; 1D1B A; 2DRM A; 1YCY A; 4PLI A; 2VVK A; 1Q86 C; 3V8L A; 2DJQ A; 3I55 Q; 4M7A C; 3GNG A; 2GFA A; 2LT1 A; 4UC4 A; 4QVZ A; 4BUG A; 1D09 B; 3LH0 A; 1NPP A; 3NMZ C; 1QKX A; 4HXJ A; 3L2Z A; 2X4Y A; 2EGC A; 2LVM A; 4M4Z A; 3PVL A; 1AT1 B; 3H0H A; 1YN8 A; 2DPP B; 1PKT A; 2GBQ A; 2KR3 A; 2Y4X A; 3QJ6 A; 4AG2 C; 5GAN e; 3RUX A; 2FG0 A; 1JBM A; 3CMA Q; 3JCM f; 3CCM T; 1WHL A; 4Z02 A; 5HY6 A; 5I22 A; 1FMW A; 2YRV A; 3A8O B; 3X28 B; 4B9W A; 3OBW A; 4F17 A; 4MMK A; 4PJJ A; 1Y71 A; 2DTO A; 1N9S A; 2JM9 A; 1E6H A; 1RAB B; 3EH2 A; 2MAM A; 5GAO q; 3OYI A; 1ACM B; 1VQ4 Q; 2RJD A; 5KYU A; 1QVF S; 1EX4 A; 4JJD A; 4PFO A; 1M2O A; 2O9V A; 4JJC A; 5D6W A; 1RI9 A; 2KQW A; 3CPW P; 3C0C A; 4IUP A; 3JB9 H; 4OB2 B; 3MKD A; 1WXB A; 2HL5 C; 2DER A; 1WHH A; 4Z88 A; 3CCV Q; 2DE0 X; 3BE3 A; 2DIL A; 1G3S A; 1KQS P; 1NG2 A; 2K3X A; 4RTX A; 2L3S A; 4NOY A; 3CQT A; 3CCR A; 1VQL A; 1OUL A; 1WXU A; 3CEY A; 1G83 A; 1LVK A; 4IKF A; 1YI2 T; 5FRN A; 1XOV A; 1K0S A; 4JDS A; 4JJB A; 4FCY A; 3QII A; 1IO6 A; 4F7U E; 4QQ6 A; 4PNO A; 3TVT A; 1WQ7 A; 3TSW A; 3VYG A; 1VQP Q; 1YIT T; 3C4S A; 4C5G A; 3CCL A; 2XID A; 4EMK A; 4BDY A; 1SKU B; 2YDL A; 4JS5 A; 1TXQ A; 3SB2 A; 5GAM h; 4A54 A; 1T3L A; 3JRZ A; 4M78 G; 4HCC A; 2C0O A; 2MOX A; 1G3T A; 2AZS A; 1Z9Z A; 4GLK A; 1RAE B; 1RAC B; 4KGV B; 1X69 A; 1M2V A; 2VB6 A; 4M78 A; 3PMI A; 3WVD B; 4J9H A; 4AFQ C; 4DOW A; 3VRZ A; 1WYX A; 3A8H B; 2K4Y A; 2LT4 A; 4XU1 A; 4KH1 B; 5DLO A; 1WGS A; 3P8H A; 2DLP A; 4C8Q D; 2JXB A; 3S3O A; 2DF6 A; 3FC3 A; 5LJ5 j; 2HMA A; 5A0D A; 2QQA A; 2VXE A; 4BY6 C; 5KYX B; 3CC2 Q; 5D7U A; 2E65 A; 3CCE T; 3CMA A; 2JMC A; 4B6M A; 2YWW A; 1FWZ A; 1ZA1 B; 4FW2 A; 1HXD A; 5GAN 7; 1D0X A; 4F7U B; 4N0A A; 1WFW A; 2MMP A; 2PUO B; 3CC4 T; 3PNW C; 4RTT A; 4HT9 A; 4FU6 A; 5LJ3 j; 2LQW A; 2VAS A; 4JRK A; 3CD6 T; 1UEC A; 3THK A; 4J5Y A; 2J6O A; 1VQ4 A; 2C0T A; 2QK0 A; 2W10 A; 4N4G A; 1CSK A; 5GAO l; 2SEM A; 4M78 F; 1Q86 U; 3R6N A; 1QQJ A; 4MDW A; 4RTV A; 4M7D G; 1WXT A; 2KDS A; 4M77 D; 1VQN Q; 1N6A A; 4PFZ A; 2HDA A; 3OY9 A; 1Q7Y U; 2D1X A; 1G2B A; 4IUQ A; 2V8K A; 2RB6 A; 4M7D A; 3CCV A; 1UGP B; 5IN1 A; 3FJP A; 1RAF B; 1MNE A; 1UGQ B; 4KUD K; 2M0Y A; 4A53 A; 3UA7 A; 2G6F X; 4E6R A; 5IT9 E; 2ECZ A; 1G5V A; 2EGE A; 4PK4 A; 2LX7 A; 3MP8 A; 4C8Q E; 2K3B A; 5LJ5 f; 4F14 A; 1Q95 G; 2CKK A; 2VC8 A; 3M9Q A; 3SWN C; 5GAN d; 1BIB A; 1UUE A; 2KXD A; 1NYG A; 2Y90 A; 1BI2 A; 3OYG A; 1LOJ A; 3OSV A; 4ANJ A; 3GP8 A; 2HQH A; 1AEY A; 3D7S B; 4MZP A; 4Z89 A; 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