The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
NLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVNS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the Abl-SH3 domain at pH5
rcsb |
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase ABL1
|
| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
10
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| structure length |
58
|
| sequence length |
58
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2013-03-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2I0N A; 2JM9 A; 1H3H A; 4CC4 B; 2KYB A; 2RPN A; 1RI9 A; 1GCQ A; 4JJB A; 2ED1 A; 1AWO A; 3ULR B; 3R6N A; 2KRS A; 2ROL A; 3M0S A; 1UDL A; 4LUD A; 2DIL A; 1WIE A; 5IHK A; 1ZBJ A; 2K6D A; 1ZUY A; 2EQI A; 1OPK A; 2LJ1 A; 3U23 A; 1E6G A; 4DEX A; 2HBW A; 1ZUU A; 2FRW A; 2AK5 A; 3UAT A; 1I07 A; 1UEC A; 1JO8 A; 4JZ4 A; 2DL8 A; 2LJ0 A; 2ESW A; 2DX1 A; 4RTW A; 2RQV A; 2L3Q A; 4M4Z A; 1K0S A; 2DBM A; 2YUN A; 1PRM C; 1MUZ A; 1WLP B; 4X1V A; 3THK A; 2J7I A; 2F2W A; 2GNC A; 2ED0 A; 1J3T A; 1K76 A; 1M3A A; 1SEM A; 2QDL A; 3EGU A; 1Y57 A; 2BZY A; 3A98 A; 1WDX A; 2GBQ A; 1PKT A; 1GBR A; 2OI3 A; 4QT7 A; 1VYU A; 2K3B A; 1I1J A; 1K1Z A; 4CC3 A; 3REA B; 2CH4 A; 3GBQ A; 1AZG B; 4JPB W; 2MOX A; 1AZE A; 1GCP A; 1E6H A; 1KSW A; 1UJ0 A; 1E7O A; 1M27 C; 1VYT A; 2P4R A; 4J9F A; 2PTK A; 1QWE A; 3VS0 A; 2CRE A; 2DBK A; 3FJ5 A; 2DL3 A; 4KRT A; 1KIK A; 1OPL A; 1X69 A; 4Z8A A; 3EHR A; 1PRL C; 1G2B A; 2ENM A; 2EYX A; 1QKX A; 4RTT A; 3IQL A; 1Z9Q A; 4AG2 C; 1H92 A; 1JU5 C; 2EKH A; 2B86 A; 1MV3 A; 2RQU A; 2LMJ A; 4LUE A; 2EGC A; 3SHW A; 5IHN A; 1GBQ A; 3EG2 A; 3C0C A; 1YCS B; 2JTE A; 3M0R A; 2JW4 A; 2JS2 A; 5FWB A; 1PKS A; 2O88 A; 2OJ2 A; 2FRY A; 2DA9 A; 4AFU C; 1M3B A; 2PZ1 A; 4RTZ A; 2L3P A; 4OML A; 2MCN A; 1I0C A; 3I9Q A; 2DL5 A; 2RQT A; 4HVW A; 3KFV A; 2NUZ A; 2YSQ A; 2M51 A; 4EIK A; 1U06 A; 2CT3 A; 3H41 A; 1WI7 A; 2C0T A; 3NMZ C; 2NWM A; 1RUW A; 2C0I A; 3PE0 A; 1H8K A; 1B3Q A; 1TUC A; 2CDT A; 2D8H A; 2K7A A; 2DL7 A; 1WYX A; 2KGT A; 2KRM A; 3QWY A; 2LNH B; 4IIM A; 1W70 A; 3M0T A; 2EYY A; 2KYM A; 4GBQ A; 1VA7 A; 1UTI A; 4OMN A; 1NYF A; 1UJY A; 2A08 A; 4J9D A; 4JJD A; 1FYN A; 3VS1 A; 2BZ8 A; 2JXB A; 2CSQ A; 1T3L A; 2KNB B; 1CSK A; 3M0Q A; 2DRK A; 2JMA A; 2D0N A; 5L23 A; 2KR3 A; 2K79 A; 1Z9Z A; 2V1Q A; 2EYW A; 3PVL A; 2JT4 A; 1X6B A; 2RN8 A; 2RQW A; 4F16 A; 4WCI A; 1QWF A; 2EBP A; 1AWX A; 3M0U A; 4LN2 A; 3VS4 A; 1SRL A; 2W10 A; 1LCK A; 1XOV A; 1ZSG A; 1WA7 A; 3VS2 A; 1AVZ C; 2LCS A; 3TSZ A; 2FEI A; 5IXB A; 2A36 A; 1ZLM A; 5IHI A; 3QWX X; 4F14 A; 2D8J A; 1X6G A; 1S1N A; 4LNP A; 5I11 A; 2VWF A; 1K0X A; 2PNI A; 2J6K A; 2EPD A; 2DRM A; 2KT1 A; 4E6R A; 4J9B A; 1AEY A; 3SEM A; 4OMO A; 2E5K A; 2W0Z A; 1GCQ C; 3H0H A; 1AWJ A; 2DYB A; 4J9H A; 1UG1 A; 4GLM A; 2FPD A; 2DE0 X; 3ZL7 C; 2LJ3 A; 2J6O A; 2LP5 A; 5HCK A; 4HCK A; 4D8K A; 1ABO A; 2KXD A; 1WFW A; 1N5Z A; 5ECA A; 2DLP A; 4FSS A; 3TSW A; 2CT4 A; 1T0J A; 1YNZ A; 2M0Y A; 4J9C A; 4HXJ A; 1YP5 A; 2FPF A; 1QKW A; 1V1C A; 2FO0 A; 2RMO A; 2DVJ A; 1X2Q A; 2DJQ A; 2RF0 A; 2AZS A; 2L0A A; 2X3W D; 1SPK A; 3VS7 A; 1OV3 A; 2L2P A; 1TG0 A; 3NPF A; 3VRY A; 1BBZ A; 4F17 A; 2J6F A; 1WXT A; 2LZ6 B; 1K4U S; 1IO6 A; 1G83 A; 3EG3 A; 2CUD A; 2C0O A; 2O9V A; 3RNJ A; 2EGE A; 2F2X A; 2CUB A; 2K9G A; 4RUG A; 1EFN A; 3JV3 A; 1UGV A; 2FG0 A; 1PNJ A; 1CKA A; 1X2K A; 3EG1 A; 4OMP A; 2GTJ A; 2GQI A; 2LQW A; 1BB9 A; 2KRN A; 4ZNX A; 3VS5 A; 3EHQ A; 3NGP A; 2EGA A; 1M30 A; 4ESR A; 1UFF A; 4HVV A; 3NHN A; 1W1F A; 1JXO A; 4AFS C; 4JJC A; 1HJD A; 1SSH A; 2BTT A; 5IH2 A; 2SRC A; 5GJW B; 4ORZ A; 4AG1 C; 2YUQ A; 5FW9 A; 2EVR A; 1SHG A; 2XMF A; 2HEQ A; 2LQN A; 1PHT A; 1ARK A; 2YT6 A; 1QCF A; 1U5S A; 4Z89 A; 2H8H A; 4JZ3 A; 1FMK A; 2EYZ A; 2YUO A; 2ROT A; 1OEB A; 4DEY A; 2SEM A; 1W6X A; 2CSI A; 2LX7 A; 3H0I A; 1B07 A; 4LE9 A; 2ECZ A; 3PVQ A; 1UE9 A; 1AWW A; 1WXB A; 2D1X A; 1KJW A; 1PWT A; 2HDA A; 1KFZ A; 2L3S A; 3VS6 A; 5FWC A; 1WXU A; 4RTU A; 1UHC A; 2X3X D; 1ZX6 A; 2AKK A; 2CH4 W; 1BK2 A; 2KT8 A; 2JMC A; 4OMM A; 3EG0 A; 1RLP C; 4RTY A; 4Z88 A; 1CKB A; 2KE9 A; 2MIO A; 2K2M A; 3REB B; 1A0N B; 1SHF A; 1X43 A; 1NEG A; 1WX6 A; 1YN8 A; 5EC7 A; 1UHF A; 2KXC A; 1X27 A; 1OOT A; 3RBB B; 3M0P A; 1BU1 A; 2JS0 A; 1NYG A; 2HCK A; 2KBT A; 4R0K A; 2GTO A; 4RTV A; 2JM8 A; 1TUD A; 2A37 A; 2YUP A; 3VRZ A; 2F2V A; 4OMQ A; 2GGR A; 3I5S A; 1YWO A; 1Y0M A; 2BZX A; 3VS3 A; 4A63 B; 1AD5 A; 2IIM A; 2AKL A; 2FPE A; 2AZV A; 1YWP A; 3CQT A; 1NLP C; 1NEB A; 1QLY A; 1ZUK A; 4AFZ C; 2EW3 A; 2A28 A; 1UUE A; 1HD3 A; 4K11 A; 3H0F A; 2DF6 A; 4AFQ C; 4HVU A; 2ABL A; 4J9E A; 2DM1 A; 1NLO C; 1GL5 A; 1RLQ C; 1NG2 A; 1M8M A; 1AOJ A; 1ABQ A; 5I22 A; 1JXM A; 1VYV A; 4J9G A; 3O5Z A; 2HSP A; 4IIO A; 3UA6 A; 1GRI A; 2VKN A; 2O9S A; 3I5R A; 2DNU A; 1JEG A; 1K9A A; 1M3C A; 4CC2 A; 1HSQ A; 3UA7 A; 2O31 A; 3UF4 A; 2KEA A; 4RTX A; 3I35 A; 2DL4 A; 5IXF A; 1JQQ A; 3TVT A; 2RNA A; 4J9I A; 2V1R A; 2DMO A; 1U3O A; 1GFD A; 2RQR A; 1T3S A; 2J05 A; 2VVK A; 2O2O A; 4D8D A; 3LH5 A; 4Y92 A; 1MV0 B; 1SRM A; 5GJV B; 1T0H A; 2YDL A; 1NM7 A; 4CC7 A; 2KRO A; 2G6F X; 2OAW A; 2J06 A; 1GFC A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2D9T A; 2JM9 A; 4IUV A; 2DAQ A; 1BIB A; 4JJB A; 3RMS A; 2ED1 A; 1IGU A; 3ULR B; 4LD9 K; 5GAN j; 1ZSZ B; 2DIL A; 1WIE A; 5IHK A; 4PJJ A; 3SWN B; 2MF2 A; 3CBM A; 3HP9 A; 3X28 B; 4C8Q E; 4YTL A; 2CZ1 B; 2DZC A; 1NZ9 A; 2B8A A; 2FRW A; 4C92 F; 3EGX B; 2JZ2 A; 2E65 A; 4M7D A; 1UB4 A; 1I07 A; 2OX7 A; 4ANJ A; 2DX1 A; 1NPP A; 4RTW A; 4J6X A; 2RQV A; 3CCU A; 3LGL A; 2DBM A; 1WLP B; 4X1V A; 2GCX A; 3L2U A; 3G7Z A; 4LDX A; 3QDF A; 5FU7 C; 1M3A A; 3M4G A; 1M1F A; 2QDL A; 4M77 B; 3OYL A; 3TEE A; 1VQP Q; 3VV0 A; 2CH4 A; 3SFM A; 1AZG B; 2P4T A; 2MOX A; 2K5L A; 1E7O A; 2JTM A; 4X34 A; 2PTK A; 2CP3 A; 2DBK A; 1YJN A; 1C6V X; 4M7A A; 1KIK A; 3V8K A; 4Z8A A; 3PGG A; 5M9O A; 3EHR A; 2H3E B; 2HNI A; 1PRL C; 2ENM A; 5CKF A; 4M78 F; 3JCM J; 4AG2 C; 2RM4 A; 3UDC A; 2R5M A; 2B86 A; 4PJO B; 1NE8 A; 1M2V A; 1TUG B; 3OYA A; 1YCS B; 2JTE A; 2L3R A; 3C12 A; 3HRS A; 3M0R A; 2JW4 A; 3VUZ A; 5GAM g; 5FWB A; 1PKS A; 2DO3 A; 3I55 Q; 4F04 B; 4RTZ A; 3WVE B; 4AT1 B; 2CYZ B; 4MZT A; 3G4S Q; 3CC7 Q; 3KFV A; 2DIQ A; 2F1L A; 2MK5 A; 2A3L A; 2NUT A; 2C0T A; 2NWM A; 1RUW A; 2C0I A; 4ZGJ B; 2M9U A; 3RMQ A; 2D8H A; 2K7A A; 1S72 T; 4A53 A; 1WYX A; 2KRM A; 2O01 E; 2A0F B; 4FYY B; 4KGV B; 4OB0 B; 3OSS C; 2EYY A; 2G3R A; 2KYM A; 1PSF A; 4J6W A; 5CO7 A; 1UTI A; 1QQJ A; 3GOX A; 5LL6 S; 4A4G A; 4VUB A; 4J9D A; 3JCM V; 2MAM A; 3EFO B; 4B9W A; 1FYN A; 1PG5 B; 3VS1 A; 2JXB A; 2QAS A; 2KNB B; 1CSK A; 3M9Q A; 4ATO A; 2V8K A; 5HK3 A; 2DRK A; 1VQ9 T; 4M77 E; 5L23 A; 3DB3 A; 6AT1 B; 1QCO A; 4C8Q G; 4M75 A; 2YWW A; 4DA4 A; 4F16 A; 3VKI A; 3M0U A; 4LN2 A; 4M7D D; 1OX9 A; 5LJ5 j; 3OYK A; 2JN0 A; 2ZPI B; 1I4K 1; 1AVZ C; 2LCS A; 5GMK h; 2CZ0 B; 3TSZ A; 2FEI A; 5IXB A; 2XDD A; 1M5Q 1; 5IHI A; 3QWX X; 5DY9 A; 3RIR A; 4LNP A; 5I11 A; 1K0X A; 1MGQ A; 1AEY A; 2DRM A; 2FHD A; 3OS0 A; 3EFS A; 2KI7 A; 2P84 A; 5GAO n; 4AMC A; 3V7R A; 4PJO E; 1WJS A; 2DYB A; 4FU6 A; 1VQ7 A; 3E2U A; 3ZL7 C; 1LOJ A; 5GMK l; 1Q86 C; 1Q95 G; 4C92 G; 2KXD A; 1WFW A; 3JCM d; 2L5Q A; 5ECA A; 2DKG A; 3KXT A; 4M7A D; 2JTF A; 1S72 A; 1M1K C; 1YNZ A; 4M7D C; 4HXJ A; 2FPF A; 4L59 A; 4RCB A; 1U8R A; 2DVJ A; 1C1A A; 1VQN A; 4JUV A; 3PMT A; 1TG0 A; 2RJE A; 2X4X A; 4ME7 A; 5A0D A; 2LZ6 B; 3JSC A; 4M78 D; 2VV5 A; 3JAM E; 2DJZ A; 2CUD A; 2O9V A; 2X51 A; 3M4Y A; 2F2X A; 1G3W A; 4RUG A; 1IXD A; 1BI1 A; 2ZPF B; 1X2K A; 3EG1 A; 3CXC A; 1Q7Y R; 1Y96 B; 4DOW A; 1VQK A; 5A2Q E; 2GQI A; 4ZNX A; 2YLC A; 1D0X A; 5HKC A; 1S72 Q; 3NGP A; 4HVV A; 2BE7 D; 4F7U A; 2EJF A; 4PFO A; 1W4S A; 1HJD A; 2BE9 B; 2BTT A; 4M7A C; 5IH2 A; 2P0K A; 1R77 A; 2QK0 A; 4QQG A; 3QDR B; 5LJ3 e; 3JCM f; 4II1 A; 1IHW A; 3G6E A; 3WVD B; 2ZPE B; 1BKB A; 1PHT A; 2XID A; 1ARK A; 1G3Y A; 3RES A; 3OYC A; 2QQA A; 4FCY A; 2EYZ A; 1PC0 A; 2ROT A; 2ZPB B; 2KVQ G; 4M78 C; 3CCV A; 1VQ9 Q; 3HL8 A; 1H64 1; 2KK4 A; 3QYH B; 1Q82 R; 1Q86 U; 2VB6 A; 3H0I A; 2COW A; 4LE9 A; 4PFP A; 3X25 B; 4M75 D; 2DTO A; 1U1S A; 4C0F A; 4C0G A; 2ZPG B; 4D6W A; 4OF1 A; 5KYW A; 3AHU A; 2L3S A; 1WXU A; 4RTU A; 5KYX B; 4FIB A; 1QCN A; 2KT8 A; 3REB B; 1A0N B; 2LC4 A; 2KE9 A; 2MIO A; 4QVC A; 2K2V A; 3MEA A; 5EC7 A; 4E47 A; 3M59 A; 1WJQ A; 3OY9 A; 1OZ2 A; 3DB4 A; 1D0Y A; 2KBT A; 4FL6 A; 2GTO A; 3T9N A; 4HCC A; 1TUD A; 2DXC A; 2F5T X; 2I2L A; 3VRZ A; 4OB2 B; 2F2V A; 4KT0 E; 3BW1 A; 2GGR A; 4MDX A; 2HAX A; 2IPO B; 2BZX A; 4JS4 A; 4JRQ A; 2Y4Y A; 1PSE A; 2MI6 A; 1QVF A; 2FZK B; 3L2Q A; 2MMP A; 1YWP A; 4M75 C; 3CQT A; 5FLX E; 3CPW A; 3OB9 A; 1ZUK A; 2A28 A; 1SG5 A; 3A5Z B; 5KYU B; 4AFQ C; 1N8R R; 2ABL A; 4J9E A; 2QAZ A; 3PTA A; 4PL6 A; 4XTY A; 2DM1 A; 1NLO C; 1RLQ C; 1NG2 A; 1Y7X A; 2RHZ A; 3HRU A; 3ZBD A; 5I22 A; 1JXM A; 1OX8 A; 3OS5 A; 3OYJ A; 2M02 A; 3PMI A; 3S6W A; 1IZ6 A; 2RO0 A; 1Q7Y U; 2HMA A; 1YHQ A; 1N9S A; 5I21 A; 3VYH B; 4KBM B; 5CQX A; 2QQ9 A; 2DXB A; 2COZ A; 3JB9 J; 1D3B B; 1KQS A; 3I35 A; 5FU6 C; 2YRV A; 2HKQ B; 1YCY A; 3QG1 A; 3S3N A; 8AT1 B; 2RQR A; 3QO3 A; 1TH7 A; 5GMK j; 1GFD A; 2V26 A; 4LD6 A; 1N27 A; 5DLO A; 3EFR A; 2M0O A; 5GJV B; 2QGF B; 2VC8 A; 3EG9 A; 2YDL A; 3HTR A; 2KRO A; 4Z02 A; 1B7T A; 2PVG B; 3OYD A; 1WQW A; 5GAN 8; 3CCQ T; 5LJ3 g; 1D1A A; 1Q82 U; 1AWO A; 5D7U A; 3L2R A; 2KRS A; 3M0S A; 2QQB A; 1OU8 A; 2QQS A; 3VU3 C; 2LX9 A; 1ZUY A; 2EQI A; 1MHN A; 1PD1 A; 2EQJ A; 1OPK A; 2LJ1 A; 3CCE T; 2QQR A; 4XU0 A; 4J83 A; 3CC2 A; 1ZUU A; 3JCM h; 2LQ8 A; 3GP8 A; 2F69 A; 2AK5 A; 2A7Y A; 5GAN 7; 3A8L B; 4HKE A; 2EWN A; 2EAY A; 2HZY A; 3CXC S; 2NUP A; 1RAH B; 2F2W A; 3LW5 E; 3OSV A; 4WTO B; 1J3T A; 5J3B A; 4C0Z A; 1G5V A; 3QUI A; 1LNX A; 1SEM A; 3M58 A; 1K73 C; 3A98 A; 1WDX A; 3S3O A; 3LYI A; 4BY6 B; 1I1J A; 3CCR A; 3GBQ A; 5GAN e; 3NFC A; 4JPB W; 3FEO A; 1N8R U; 4J9F A; 1EZZ B; 4A54 A; 1M90 C; 1QWE A; 3VS0 A; 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