The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
63
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structure length |
59
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Chain Sequence |
MENDPNLFVALYDFVATLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSAYITPVNS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the Abl-SH3 domain at pH5
rcsb |
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase ABL1
|
| total genus |
12
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
63
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2013-03-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CSQ A; 1PWT A; 3H0H A; 2C0I A; 2EYY A; 1OOT A; 1GBQ A; 1HD3 A; 2LJ1 A; 2X3X D; 4Z88 A; 3EHQ A; 1OPL A; 2BTT A; 1SRL A; 1NLO C; 1GFD A; 4Y92 A; 1X6G A; 4JJB A; 5FWB A; 1K1Z A; 2ESW A; 2JS0 A; 1X2Q A; 1H3H A; 1OV3 A; 3IQL A; 1JEG A; 2FRY A; 4AFU C; 3JV3 A; 1YP5 A; 3RBB B; 1TUC A; 3UF4 A; 1SSH A; 2DL5 A; 1I0C A; 1QWE A; 3PVL A; 4QT7 A; 4J9H A; 4RTZ A; 1ZBJ A; 1JXO A; 5IHK A; 4HCK A; 1RUW A; 1UDL A; 1W70 A; 1QCF A; 5I11 A; 1GBR A; 2KXC A; 2W0Z A; 2HEQ A; 5ECA A; 2JS2 A; 4AG2 C; 1X43 A; 4RUG A; 3U23 A; 2K6D A; 2DL3 A; 1ZUY A; 2LP5 A; 4WCI A; 1NG2 A; 2DX1 A; 2L2P A; 2KRN A; 1WA7 A; 5HCK A; 2DBK A; 1E6G A; 3M0P A; 1I1J A; 3UA6 A; 3I9Q A; 2RF0 A; 4HXJ A; 2CUD A; 2MIO A; 2F2X A; 2JM9 A; 2M0Y A; 4D8K A; 2GGR A; 1UE9 A; 2E5K A; 2O9S A; 1B07 A; 2FPF A; 4J9D A; 2ENM A; 2J06 A; 2HCK A; 1OEB A; 2K9G A; 2LQN A; 3LH5 A; 1M30 A; 3PE0 A; 2HDA A; 2JTE A; 4OMQ A; 1RLQ C; 2NWM A; 2LX7 A; 1X69 A; 4J9G A; 1YCS B; 3SHW A; 3A98 A; 2YUP A; 2A36 A; 1M8M A; 1ABO A; 1WFW A; 1M3A A; 1PKT A; 2EGE A; 1TUD A; 1UTI A; 2VVK A; 2RMO A; 1Z9Z A; 2GQI A; 4OMO A; 2EPD A; 3ULR B; 2PNI A; 2EGC A; 2HSP A; 2MOX A; 1G2B A; 4E6R A; 4X1V A; 3EG1 A; 4ZNX A; 3KFV A; 2K3B A; 4LUE A; 1WYX A; 3H0I A; 1BBZ A; 2RQW A; 4JPB W; 5IXB A; 1NEG A; 1M27 C; 2FG0 A; 1AWJ A; 1N5Z A; 3EGU A; 3ZL7 C; 2KRO A; 1ARK A; 3TVT A; 4JZ4 A; 3M0T A; 3VS3 A; 2LCS A; 3RNJ A; 1NYG A; 1UUE A; 2L3S A; 3SEM A; 1SRM A; 2DM1 A; 1GCP A; 2VWF A; 1W6X A; 2DMO A; 1RLP C; 2PZ1 A; 2SEM A; 4AFQ C; 1ABQ A; 4IIO A; 1ZUU A; 2K79 A; 2KE9 A; 2CDT A; 3M0S A; 2EYZ A; 2AKL A; 4RTY A; 2DL7 A; 3FJ5 A; 1JU5 C; 4J9F A; 1Y0M A; 2J6K A; 1MV3 A; 2O88 A; 3M0U A; 1NYF A; 2ED0 A; 1ZX6 A; 2LJ3 A; 3NGP A; 2DL8 A; 2YT6 A; 2KXD A; 4LN2 A; 2KYB A; 1WXT A; 2CUB A; 2D1X A; 1SHF A; 2K2M A; 2SRC A; 1NLP C; 2FPD A; 1Y57 A; 2OI3 A; 1SEM A; 3R6N A; 2EKH A; 1VYT A; 1AOJ A; 2LJ0 A; 2RQT A; 2CT3 A; 1AVZ C; 3TSW A; 2EQI A; 5L23 A; 1UG1 A; 1WIE A; 1WX6 A; 1WXU A; 3EG3 A; 4A63 B; 2DRK A; 2MCN A; 2YUQ A; 1V1C A; 1OPK A; 4LNP A; 1G83 A; 2OJ2 A; 1EFN A; 1S1N A; 4F16 A; 2A28 A; 2DYB A; 1U3O A; 2KNB B; 3EHR A; 2DNU A; 2DL4 A; 1LCK A; 5IHI A; 2L3Q A; 2O9V A; 1H8K A; 2RN8 A; 2ROT A; 2PTK A; 1GRI A; 1UJ0 A; 1ZUK A; 1K4U S; 2J05 A; 2KR3 A; 2AZS A; 2LZ6 B; 2GNC A; 2NUZ A; 3VS4 A; 3TSZ A; 5GJW B; 2AZV A; 2YSQ A; 1KSW A; 1T3S A; 1T0H A; 2VKN A; 1U06 A; 1WI7 A; 4HVW A; 1CKB A; 4OML A; 1HJD A; 3H41 A; 1FMK A; 2AK5 A; 4DEY A; 2J6F A; 2CH4 A; 4EIK A; 2J6O A; 1PNJ A; 2AKK A; 4DEX A; 1AWX A; 2GTJ A; 3VS0 A; 1IO6 A; 2KGT A; 3UA7 A; 3CQT A; 1W1F A; 1BB9 A; 4AFS C; 1AEY A; 4J9C A; 1YN8 A; 4J9I A; 1AD5 A; 2GTO A; 2RQR A; 1M3B A; 2C0T A; 3UAT A; 1K0S A; 1X2K A; 1QWF A; 2L3P A; 2LMJ A; 1KIK A; 1BU1 A; 2LQW A; 1FYN A; 1AWW A; 2BZX A; 3PVQ A; 1E7O A; 1MUZ A; 1UJY A; 1WLP B; 1X6B A; 3THK A; 3M0Q A; 2CT4 A; 2EGA A; 5I22 A; 3VS7 A; 2JMC A; 1Z9Q A; 5EC7 A; 1KJW A; 5FWC A; 2CRE A; 4F17 A; 1RI9 A; 1KFZ A; 5IH2 A; 4RTU A; 2YDL A; 2F2V A; 4R0K A; 1GCQ C; 4GLM A; 1ZLM A; 1JXM A; 2DIL A; 2DE0 X; 4K11 A; 2O2O A; 3GBQ A; 1K76 A; 1U5S A; 4J9B A; 1UFF A; 2JT4 A; 1NEB A; 2F2W A; 4LE9 A; 2EYW A; 3EG0 A; 2KBT A; 1UHF A; 2FEI A; 3QWX X; 1H92 A; 2KYM A; 2M51 A; 2B86 A; 4RTW A; 2ED1 A; 1E6H A; 2KEA A; 2EVR A; 2HBW A; 2A37 A; 1YWP A; 2KRS A; 4CC3 A; 4ORZ A; 4GBQ A; 4RTX A; 4RTV A; 1HSQ A; 1QKW A; 4AG1 C; 1QLY A; 4JJD A; 1VYU A; 2CSI A; 4Z89 A; 1BK2 A; 4LUD A; 2J7I A; 1CSK A; 1NM7 A; 1PRL C; 2FO0 A; 4ESR A; 2KT8 A; 1SPK A; 3I5R A; 2A08 A; 2ABL A; 4CC4 B; 5IXF A; 4FSS A; 2JM8 A; 2KRM A; 2W10 A; 2D8J A; 2V1R A; 2OAW A; 2KT1 A; 1AZE A; 1JO8 A; 2ECZ A; 1TG0 A; 4Z8A A; 1PHT A; 2V1Q A; 2BZ8 A; 2P4R A; 3H0F A; 3O5Z A; 2EBP A; 3M0R A; 4JJC A; 1JQQ A; 2IIM A; 1X27 A; 2RPN A; 2XMF A; 1PKS A; 2FPE A; 3EG2 A; 1T3L A; 2JMA A; 2BZY A; 2JXB A; 2H8H A; 4D8D A; 1XOV A; 3I5S A; 2DVJ A; 3NPF A; 1SHG A; 1UEC A; 2RQV A; 4RTT A; 1WDX A; 1J3T A; 1YNZ A; 2C0O A; 4OMN A; 1MV0 B; 2QDL A; 1VA7 A; 1I07 A; 2YUO A; 1AWO A; 3VS2 A; 1K0X A; 4IIM A; 2ROL A; 2EYX A; 3I35 A; 2K7A A; 2LNH B; 1GFC A; 4HVV A; 2CH4 W; 2I0N A; 3REA B; 3NHN A; 4CC7 A; 2DA9 A; 4CC2 A; 1K9A A; 2RNA A; 1CKA A; 1M3C A; 2FRW A; 4F14 A; 2X3W D; 2G6F X; 1UGV A; 5IHN A; 2DF6 A; 3QWY A; 3REB B; 1YWO A; 2RQU A; 5GJV B; 4OMP A; 2L0A A; 3VS6 A; 2DJQ A; 2O31 A; 5FW9 A; 3C0C A; 3VRZ A; 1WXB A; 2D0N A; 1B3Q A; 4M4Z A; 4AFZ C; 2YUN A; 2DRM A; 4JZ3 A; 1PRM C; 1GL5 A; 3VRY A; 4OMM A; 1T0J A; 2D8H A; 2EW3 A; 3VS1 A; 1ZSG A; 2DBM A; 4KRT A; 4HVU A; 4J9E A; 1A0N B; 3NMZ C; 1AZG B; 2GBQ A; 3VS5 A; 1QKX A; 2JW4 A; 1VYV A; 1GCQ A; 1UHC A; 2DLP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CBO A; 5GAO q; 2YHT A; 1W2B A; 2CSQ A; 3H0H A; 3UT1 A; 2C0I A; 4FT2 A; 5GAN e; 5GAO r; 3CMA A; 4BE1 A; 4BY6 B; 1OPL A; 1UEB A; 2VGM A; 2QXF A; 3MP1 A; 2CS7 A; 4NL3 A; 4KH0 B; 1X6G A; 3CEY A; 4JJB A; 3SWN C; 3E1S A; 2ESW A; 3L2W A; 1X2Q A; 1KC8 R; 1M1K U; 3GP8 A; 3IQL A; 4AFU C; 1YJW T; 1VQ6 Q; 5A2Q E; 3JV3 A; 3ER0 A; 2GQV A; 3G7Z A; 5CKB A; 1SSH A; 3M59 A; 3CCR A; 1QWE A; 1ZBJ A; 5IHK A; 4M7A E; 1AT1 B; 1UDL A; 1W70 A; 3G6E Q; 1D09 B; 3CCV T; 1QCF A; 5GAN 8; 5ECA A; 4DBQ A; 1YCY A; 2K6D A; 1VQP T; 1Q95 G; 1N27 A; 1ZUY A; 3UPU A; 4WCI A; 4JUV A; 2DX1 A; 3QG1 A; 1WA7 A; 1YIJ T; 3FJP A; 1OU9 A; 2RF0 A; 3MKD A; 3S3N A; 2M0Y A; 1X75 C; 2HCK A; 2QQA A; 1UGQ B; 1VQ7 T; 2M02 A; 2HDA A; 3OW2 A; 2JTE A; 2NWM A; 2CP5 A; 1YCS B; 2DAQ A; 3NTH A; 5LJ5 h; 1M8V A; 2ZPG B; 3HL8 A; 1M8M A; 3CC2 A; 2RO0 A; 1WFW A; 1M3A A; 2LCL A; 3QII A; 1YI2 T; 4JDS A; 3ULR B; 2QQB A; 4TVR A; 2MWP A; 4C92 E; 1M90 U; 1G2B A; 3EG1 A; 1VQ4 Q; 2XK0 A; 4ZNX A; 4LUE A; 1VIF A; 2YLC A; 1WYX A; 2QK0 A; 1K9M R; 5KCO A; 4JPB W; 1NE8 A; 5IXB A; 2FG0 A; 1R8O B; 5KYW B; 3ZL7 C; 2RA2 A; 1IRE B; 4ELY C; 4N4G A; 3M0T A; 4B9W A; 2COW A; 2DM1 A; 1GCP A; 3A1P A; 1W6X A; 2DD4 A; 2QTX A; 1IHV A; 3OS2 A; 2DMO A; 1RLP C; 2PZ1 A; 4AFQ C; 1ABQ A; 4IIO A; 2CP3 A; 1ZUU A; 3V8J A; 2L5Q A; 2EYZ A; 1NJI U; 2AKL A; 4M7A G; 4BI3 A; 3M4G A; 2DL7 A; 3FJ5 A; 4KGZ B; 2ATC B; 1JU5 C; 2R5M A; 1QCN A; 2AHJ B; 3RDV A; 2PVD B; 3A5Z B; 3M0U A; 2ED0 A; 1D1B A; 4N0A C; 3MP8 A; 2CP7 A; 3WVD B; 1YJN T; 2HQE A; 2CUB A; 2QI2 A; 4N0A A; 2FPD A; 3MET A; 3S3O A; 2OI3 A; 2ZZD A; 1SEM A; 3GNF B; 5CKD A; 3CCS A; 1M90 C; 3TQ7 P; 2LJ0 A; 2OX7 A; 2CT3 A; 2K5I A; 2PQW A; 2QYZ A; 5L23 A; 1VQK A; 1WX6 A; 1K8A R; 4BE2 A; 2DTH A; 3V7C A; 5CCA A; 1EFN A; 1S1N A; 3QUI A; 4BDY A; 1U3O A; 3MEU A; 5FU7 B; 1N6A A; 2LVM A; 1VQM T; 3CCL T; 2L3Q A; 2E12 A; 2K3Y A; 1K4U S; 2E5Q A; 2J05 A; 2KR3 A; 3JB9 G; 2LZ6 B; 4J6Y A; 2NUZ A; 3SFM A; 5GJW B; 3NTK A; 5CQX A; 5HY6 A; 4J6X A; 2AZV A; 4FT4 A; 1YJW Q; 4C92 G; 4VUB A; 5CKF A; 1NJI C; 4JRI A; 2A7Y A; 1U06 A; 2MAM A; 5EG2 A; 3L2Z A; 3VKI A; 1WI7 A; 3AT1 B; 5KE2 A; 3P8H A; 2H3J A; 3OYB A; 2CZ1 B; 1HJD A; 4PK4 A; 4DEY A; 3E2U A; 3CCV Q; 4XU2 A; 5GAM e; 3L1A A; 1G3S A; 4DEX A; 2P84 A; 2X4Y A; 5DLO A; 1IO6 A; 3R6O A; 4DOW A; 2I2L A; 1AEY A; 2IPO B; 1YN8 A; 4J9I A; 2V8I A; 3OYF A; 2LTO A; 5LJ5 j; 2C0T A; 5DLQ E; 3UAT A; 3QXE B; 3LWH A; 4JRQ A; 2K2V A; 2LQW A; 4ZGE B; 2PVO B; 1XNI A; 1MUZ A; 1OU8 A; 1XTD A; 3KXT A; 4ZN3 A; 3THK A; 1YJ9 T; 2X51 A; 3SB2 A; 1VQ7 Q; 2CT4 A; 2KAF A; 2JMC A; 2MI6 A; 1Z9Q A; 4C5E A; 3CME A; 3P8B B; 4EMH A; 4RTU A; 2RHI A; 4R0K A; 1Q7Y R; 1ZLM A; 3DLL A; 2DIL A; 1ZA2 B; 2QQS A; 3C94 A; 4QQ6 A; 1U5S A; 4J9B A; 1UFF A; 2LX9 A; 5AYF A; 2F2W A; 5CO7 A; 2EYW A; 5GAO n; 1UHF A; 2E3H A; 5FU6 B; 4B9X A; 2IG0 A; 2L89 A; 1SSF A; 1QVG A; 2RJF A; 3M4Y A; 2ED1 A; 5CQY A; 4KH1 B; 1Y96 A; 4Y28 E; 4CI0 C; 1RAD B; 3RMQ A; 2WSF E; 2MYS A; 4RTX A; 4RTV A; 1HSQ A; 4LDY A; 2CSI A; 4Z89 A; 1TOV A; 3OMC A; 4ATO A; 4ESR A; 1I5O B; 1SPK A; 2LNV A; 5FRN A; 2YRC A; 4CC4 B; 2JM8 A; 2W10 A; 3HRU A; 4XAX B; 1D0Y A; 3MEA A; 3L2R A; 2KT1 A; 2KVQ G; 2ZPE B; 3E19 A; 4LDV A; 4Z8A A; 2JZ2 A; 3SD4 A; 3M0R A; 1D1A A; 3QDR B; 2FPE A; 2JMA A; 4XU0 A; 3O8V A; 2BZY A; 1KC8 U; 3CC2 T; 3BY7 A; 2R57 A; 1KD1 R; 1RAF B; 2DVJ A; 1SHG A; 4RTT A; 3OBY A; 1QVF S; 2EQM A; 4OMN A; 4MZT A; 2QDL A; 2X4J A; 1AWO A; 3VS2 A; 2ROL A; 3OYY A; 3I35 A; 2K7A A; 2KI7 A; 4HVV A; 2CH4 W; 1I81 A; 4C5H A; 1VQM Q; 1JB0 E; 4F14 A; 2DET A; 1UGV A; 2RJE A; 2ZPF B; 4FYX B; 3CCQ A; 3QWY A; 3REB B; 4OB3 B; 4HT9 A; 2HQH A; 4OMP A; 3RMS A; 2CP2 A; 4QQG A; 5I2M A; 2HAX A; 4ME7 A; 4A4G A; 2O31 A; 5HK3 A; 4WTO B; 4ZGJ B; 3C0C A; 2D0N A; 4MZM A; 4PJN A; 1RAC B; 3EFR A; 4OMM A; 3VS1 A; 4A4K A; 2DBM A; 4XTY A; 5DM7 R; 5GAN 2; 1Q86 U; 1W4S A; 1A0N B; 3I56 A; 4DOV A; 2M1H A; 2HQX A; 4N4H A; 2HL5 C; 1QKX A; 2LT4 A; 2HD0 A; 1D3B A; 4XK8 E; 3M54 A; 3RR6 A; 1O75 A; 1PSE A; 1KC8 C; 4PJL A; 2ZCF B; 4YTL A; 4R55 A; 4C5I A; 3S3M A; 2COZ A; 2VXE A; 3CCS T; 1HD3 A; 2LJ1 A; 4OF1 A; 3EHQ A; 2BTT A; 2BIV A; 1WHM A; 1BI3 A; 4Q5W A; 4AMC A; 1VQK T; 4Y92 A; 1MGQ A; 3DKM A; 3VV0 A; 5CR2 A; 2JS0 A; 5CVI A; 1H3H A; 1OV3 A; 3CCU Q; 4PFP A; 3JCM b; 3X24 B; 1K9M U; 3BDL A; 1D3B B; 1YP5 A; 3RBB B; 2QEX T; 2D9T A; 3UF4 A; 3OYA A; 4MMK A; 2DIQ A; 4FW2 A; 5KE3 A; 2DL5 A; 1I0C A; 4M78 A; 3PVL A; 4QT7 A; 1M2V B; 1JXO A; 2RH2 A; 1M1G A; 5I11 A; 2W0Z A; 3OYC A; 2Y4X A; 2PU9 B; 3C12 A; 4JJN K; 3RUX A; 3J7A F; 1TU0 B; 2DBK A; 4EPC A; 3I55 T; 1VQ5 Q; 4M78 B; 2F2X A; 2JM9 A; 3CD6 Q; 1UGP B; 1UE9 A; 1QCO A; 2FPF A; 2JTF A; 2L8D A; 2RI3 A; 2J06 A; 5KCH A; 3LWI A; 3OS0 A; 5IAY A; 2FZK B; 8ATC B; 2DO3 A; 3PE0 A; 1YFN A; 1JJ2 A; 5KYU A; 3A98 A; 2YUP A; 4PJO C; 1K9M C; 4KUD K; 2HL3 A; 3CPW A; 1UTI A; 2RMO A; 1Z9Z A; 4PJO A; 2V26 A; 2EPD A; 3G1J A; 2EGC A; 2HSP A; 2MOX A; 4XTX A; 3CME T; 4LDW A; 1WQW A; 1ZHI A; 3CC2 Q; 1EX4 A; 3QHS A; 3H0I A; 4R56 A; 2RQW A; 5IT9 E; 3ZBD A; 1M27 C; 1AWJ A; 2RK2 A; 4FL6 A; 3EGU A; 1WHJ A; 4QVZ A; 5D7U A; 2HMA A; 2JUF A; 1QP2 A; 3QPH A; 1WQ7 A; 1SRM A; 1VOM A; 4PJO B; 3A8O B; 2VWF A; 4OB1 B; 4IUV A; 3CCU A; 4F7U A; 2QGG A; 3OW2 P; 1UB4 A; 2K79 A; 1WHH A; 2CZ6 B; 3M0S A; 2H3E B; 3AHU A; 1BYM A; 5HKC A; 2O4X B; 3M5A A; 1KHI A; 3OYN A; 2ZPI B; 1JBM A; 2LDM A; 1MV3 A; 2O88 A; 2VV5 A; 1UGR B; 1K8A C; 2LJ3 A; 3OYM A; 1M5Q 1; 3LLR A; 3SWN A; 2F69 A; 1BIA A; 3PT9 A; 1XJW B; 4E47 A; 2SRC A; 2VUB A; 4PJO D; 1VYT A; 1AVZ C; 3TSW A; 3G71 A; 1VQ5 A; 4PNO A; 4L5G A; 4D6W A; 3BE3 A; 3EG3 A; 1WIE A; 5HK0 A; 3CBM A; 4A63 B; 3CD6 A; 3EFS A; 4LNP A; 1Q7Y U; 2OJ2 A; 3Q1J A; 2QG9 B; 2LC4 A; 2DYB A; 5LJ5 f; 3QJY A; 3CBP A; 1B7T A; 2E1H A; 3OYI A; 1U1T A; 3CCS Q; 3SWN B; 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