The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
MTFVALYDYESRTETDLSFKKGERLQIVNSTEGDWWLAHSLTTGRTGYIPSNYVAPS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The role of Gutamine 128 of the SH3 domain of the c-Src tyrosine kinase in 3D domain swapping and amyloid formation
rcsb |
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Gallus gallus
|
| total genus |
5
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2014-01-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5FW9 A; 1I07 A; 3RBB B; 3ULR B; 1UE9 A; 2CSI A; 3VS0 A; 3VRY A; 5I22 A; 2GTO A; 2DE0 X; 2AKK A; 2BZY A; 4OMM A; 3PVQ A; 1PHT A; 3NHN A; 2AKL A; 1UJY A; 1PKS A; 4JJB A; 1AEY A; 2EPD A; 1CSK A; 2RNA A; 5ECA A; 1ARK A; 2RQW A; 2L3Q A; 1J3T A; 1ZX6 A; 1AZE A; 2VVK A; 1SRM A; 1UJ0 A; 2DL3 A; 1S1N A; 2D0N A; 2CSQ A; 1GFC A; 1JXM A; 4Z88 A; 1GBQ A; 2VKN A; 1Z9Z A; 3CQT A; 3EG0 A; 4RTZ A; 4HXJ A; 3VS3 A; 1AWJ A; 1T3S A; 1QWE A; 4RTX A; 2KBT A; 4QT7 A; 1X6G A; 2JM9 A; 5IXB A; 1U06 A; 2HSP A; 5GJW B; 2O9V A; 2KT8 A; 4DEY A; 1NLO C; 1X43 A; 1I1J A; 1U3O A; 2D8H A; 2EYZ A; 1RI9 A; 1E7O A; 3EG1 A; 5HCK A; 1NEB A; 4A63 B; 2F2V A; 2DRK A; 3VS5 A; 1JQQ A; 2KRS A; 3TVT A; 2QDL A; 2O2O A; 1I0C A; 1BK2 A; 2F2X A; 3A98 A; 2LJ1 A; 1UFF A; 3EG3 A; 2BZ8 A; 3M0T A; 4CC3 A; 2ECZ A; 1SEM A; 2JS0 A; 3I35 A; 5L23 A; 2AK5 A; 1U5S A; 2C0O A; 3VS1 A; 4FSS A; 1AD5 A; 3PVL A; 2DRM A; 2H8H A; 2YDL A; 3VS7 A; 2DBM A; 1K0S A; 1T0J A; 2EGE A; 2RPN A; 1K1Z A; 2K79 A; 1OPL A; 1GCQ C; 1KFZ A; 1H3H A; 4J9C A; 2DL5 A; 2EVR A; 1K76 A; 1GFD A; 2RMO A; 2KYM A; 1KJW A; 1SSH A; 2CT4 A; 2YUQ A; 1W6X A; 1ZUU A; 4JZ4 A; 4D8K A; 1AWW A; 3M0S A; 4LN2 A; 1KSW A; 2JXB A; 2LZ6 B; 4OMO A; 3H41 A; 2DX1 A; 3EHR A; 2KEA A; 4ZNX A; 2ROT A; 2M51 A; 4JJC A; 1BB9 A; 2HBW A; 1SHG A; 1WYX A; 4JJD A; 2K9G A; 1PNJ A; 4GLM A; 2ESW A; 1FMK A; 1GRI A; 1WFW A; 4CC4 B; 1YWP A; 3EGU A; 4CC7 A; 1EFN A; 2CT3 A; 2LX7 A; 1SHF A; 2HCK A; 2O88 A; 2AZV A; 2ED0 A; 1T3L A; 1AWO A; 4J9D A; 2NUZ A; 2KRN A; 3C0C A; 2W0Z A; 2JW4 A; 3KFV A; 4OMP A; 3I9Q A; 4J9B A; 3VS2 A; 1B07 A; 3EG2 A; 2ABL A; 2I0N A; 4RTY A; 1QKW A; 3TSZ A; 3UA7 A; 1AVZ C; 1HD3 A; 1RLP C; 2EYY A; 3M0U A; 1NYG A; 2KGT A; 2LQW A; 2EQI A; 1LCK A; 1WXU A; 1K0X A; 1VYU A; 1G2B A; 2GQI A; 1WX6 A; 1KIK A; 4EIK A; 3THK A; 2YUP A; 2SEM A; 1H92 A; 3REA B; 2E5K A; 1M3C A; 2DA9 A; 5I11 A; 3LH5 A; 2K6D A; 1ZUK A; 2KYB A; 1VA7 A; 1PWT A; 2VWF A; 1QCF A; 1YWO A; 4AFZ C; 2KT1 A; 2SRC A; 3SHW A; 4RTT A; 2JM8 A; 1B3Q A; 1WIE A; 2K3B A; 1TG0 A; 4Y92 A; 1GCP A; 3I5R A; 1FYN A; 5FWB A; 1X27 A; 2X3W D; 2DL4 A; 4RTV A; 2CUD A; 2J6O A; 1OEB A; 3ZL7 C; 2HDA A; 1G83 A; 2CUB A; 2EGA A; 2MOX A; 1AOJ A; 1Z9Q A; 1V1C A; 2XMF A; 2KR3 A; 2FG0 A; 3NPF A; 4KRT A; 4WCI A; 2A28 A; 2YSQ A; 2LJ3 A; 2PNI A; 1NG2 A; 2AZS A; 2PTK A; 2L3P A; 1MV3 A; 1WLP B; 3R6N A; 2YUO A; 1N5Z A; 2O31 A; 1CKB A; 2IIM A; 4ORZ A; 2DYB A; 1SRL A; 3H0F A; 2P4R A; 2RQV A; 1YCS B; 2FPD A; 1UG1 A; 1M3B A; 1M3A A; 2EKH A; 3QWY A; 3PE0 A; 1WDX A; 2BZX A; 2DJQ A; 2RQU A; 4IIM A; 2FRY A; 2A08 A; 4ESR A; 2ENM A; 4AG2 C; 4E6R A; 4GBQ A; 2C0I A; 1W70 A; 1OOT A; 4OML A; 2DMO A; 2JTE A; 2W10 A; 5IHI A; 3UF4 A; 2KXC A; 2L3S A; 4F16 A; 4DEX A; 4J9I A; 3REB B; 1UTI A; 2LJ0 A; 4LUE A; 1ABQ A; 2DNU A; 2JMA A; 2DVJ A; 4F17 A; 3FJ5 A; 2GNC A; 1YN8 A; 1JU5 C; 1E6H A; 2D8J A; 3QWX X; 2DM1 A; 2V1R A; 5IXF A; 1QLY A; 1ABO A; 1HJD A; 2NWM A; 4J9H A; 2D1X A; 4AFU C; 2EGC A; 5IHN A; 4J9G A; 4X1V A; 2ROL A; 2J06 A; 2DL7 A; 2EBP A; 5EC7 A; 4HVV A; 2YUN A; 3TSW A; 4LUD A; 2LQN A; 1TUD A; 2FO0 A; 4IIO A; 2OI3 A; 2KNB B; 4JPB W; 5IHK A; 2A37 A; 4Z8A A; 2EW3 A; 1NLP C; 1WA7 A; 3NGP A; 1PRL C; 1BU1 A; 1WXB A; 3I5S A; 2JT4 A; 2DIL A; 1UDL A; 1QKX A; 1ZUY A; 1YNZ A; 2OAW A; 2J05 A; 1X69 A; 1NM7 A; 1TUC A; 3M0R A; 2YT6 A; 2RN8 A; 2EYW A; 3UA6 A; 4AFS C; 1SPK A; 3VS4 A; 3H0I A; 1AWX A; 4D8D A; 1NEG A; 5IH2 A; 1Y0M A; 2GGR A; 4AG1 C; 1VYT A; 4CC2 A; 1RLQ C; 2CRE A; 1YP5 A; 4M4Z A; 2BTT A; 4HVU A; 4R0K A; 1NYF A; 4LE9 A; 1GL5 A; 1MUZ A; 2KE9 A; 1IO6 A; 4LNP A; 2DBK A; 2KRM A; 2M0Y A; 1UUE A; 1H8K A; 1X6B A; 1JO8 A; 3GBQ A; 1HSQ A; 4K11 A; 1OPK A; 1UHF A; 2J6F A; 2EYX A; 4RUG A; 4J9E A; 3VRZ A; 3VS6 A; 2KXD A; 1UEC A; 4RTU A; 1UGV A; 1Y57 A; 1VYV A; 4OMQ A; 1UHC A; 5FWC A; 1ZBJ A; 2HEQ A; 1X2K A; 2CH4 W; 2GTJ A; 3UAT A; 1BBZ A; 1PKT A; 3RNJ A; 3NMZ C; 2A36 A; 2LP5 A; 4RTW A; 2L0A A; 2F2W A; 4HVW A; 2RQR A; 1GBR A; 1WXT A; 2DF6 A; 3JV3 A; 2RQT A; 1AZG B; 2FRW A; 3H0H A; 1T0H A; 2JS2 A; 5GJV B; 3SEM A; 4F14 A; 3EHQ A; 1WI7 A; 2J7I A; 2LMJ A; 1XOV A; 3IQL A; 3O5Z A; 2DLP A; 2O9S A; 1ZLM A; 4AFQ C; 2CH4 A; 2FEI A; 1QWF A; 1K4U S; 4JZ3 A; 1ZSG A; 2FPF A; 1MV0 B; 1E6G A; 2JMC A; 1X2Q A; 2X3X D; 4OMN A; 1OV3 A; 1PRM C; 2C0T A; 1M27 C; 2V1Q A; 2L2P A; 2K2M A; 2OJ2 A; 4Z89 A; 1RUW A; 2K7A A; 1GCQ A; 2KRO A; 3M0Q A; 4J9F A; 2G6F X; 2MIO A; 1CKA A; 1A0N B; 2DL8 A; 2CDT A; 2RF0 A; 1K9A A; 2GBQ A; 3M0P A; 1JEG A; 2LCS A; 2MCN A; 2ED1 A; 2FPE A; 1M30 A; 4HCK A; 2B86 A; 3U23 A; 1W1F A; 2LNH B; 1JXO A; 2J6K A; 2PZ1 A; 1M8M A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3EFO A; 1UE9 A; 5GAM g; 1VQK A; 2AKK A; 1X6O A; 2BZY A; 3L2V A; 2QQS A; 3PVQ A; 1PC0 A; 1NJI R; 3VUB A; 3OS2 A; 4PJO A; 2AKL A; 1UGS B; 1PKS A; 1XNI A; 4QQ6 A; 5LJ5 j; 4QW2 A; 3G4S Q; 1ARK A; 4E7Z A; 3OYK A; 1Q81 R; 1ZX6 A; 1AZE A; 2VVK A; 2H3J A; 2DL3 A; 1S1N A; 2K4Y A; 2OTL T; 2DIG A; 3G71 A; 3A8L B; 1LJO A; 3RMQ A; 1JXM A; 5GAO n; 4HXJ A; 3VS3 A; 1RAD B; 2RJD A; 2WSE E; 4C8Q G; 1SG5 A; 1RAH B; 4F7U E; 1Q86 U; 4XTZ A; 2RO0 A; 1VQ5 A; 2FHD A; 2KBT A; 1X6G A; 2JM9 A; 5IXB A; 1U06 A; 1LVK A; 4A4G A; 4EMK C; 1NLO C; 8AT1 B; 4KUI A; 1U3O A; 5GMK l; 2QA4 T; 4FW2 A; 5HCK A; 4C8Q D; 2XKO C; 1W2B A; 2PVO B; 4B9X A; 2HMA A; 1YI2 A; 1AHJ B; 4IUP A; 1JQQ A; 2QDL A; 5GAN 5; 1BK2 A; 3CEY A; 1WHK A; 1UFF A; 3OA6 A; 4R56 A; 2X4J A; 2ECZ A; 4PL6 A; 1D0X A; 2JS0 A; 3I35 A; 5AYF A; 2AK5 A; 3EFR A; 2C0O A; 4MZM A; 4FSS A; 1K9M R; 1I81 A; 3BFM A; 1Y96 B; 2DBM A; 1K0S A; 4FM4 B; 1OPL A; 1KFZ A; 4J9C A; 3EFS A; 5LL6 S; 1N8R C; 1K76 A; 3FB9 A; 1GFD A; 2YLB A; 2CT4 A; 2YUQ A; 2QEX Q; 2LZ6 B; 1FMV A; 4OMO A; 5GAM f; 3KXT A; 2DX1 A; 4ZNX A; 3CME T; 2M51 A; 1BB9 A; 2C06 A; 2EQJ A; 1SHG A; 2XK0 A; 4JJD A; 4KGV B; 1X75 C; 1PNJ A; 1U8R A; 1G8X A; 2MK5 A; 1YWP A; 2DXT A; 1PD1 A; 2CT3 A; 1XTD A; 2AIR B; 5KYU A; 5HK3 A; 1PM3 A; 1W4S A; 1YJ9 T; 1XQH A; 4PJO C; 4QVC A; 1D0Y A; 2EJG A; 3MEU A; 4B9W A; 1AWO A; 5D6W A; 1PD0 A; 3A8H B; 1Q81 U; 3CCM A; 3VS2 A; 2R58 A; 1X01 A; 1EIF A; 3FEO A; 3EG2 A; 1D3B A; 2OTL Q; 3HTR A; 2H3E B; 5CKH A; 1LCK A; 1K0X A; 2EYQ A; 1VQ8 A; 2GQI A; 3OYN A; 1OYX A; 1UGR B; 1TSF A; 1BKB A; 1M8V A; 2E5K A; 3EG9 B; 2RB6 A; 3CCJ A; 3RUX A; 1IGQ A; 4BI3 A; 4NL2 A; 4IUR A; 2K6D A; 2KYB A; 1VA7 A; 2JUF A; 2VWF A; 5LJ3 g; 1K73 C; 1TG0 A; 3MEW A; 4Y92 A; 5GAM e; 3I5R A; 4X34 A; 2DXU A; 5FWB A; 5FU6 C; 3KBG A; 2QA4 Q; 4M7D G; 4RTV A; 5GAN 2; 3MP6 A; 3OBW A; 5CQX A; 1G83 A; 1TXQ A; 3OYH A; 1Z9Q A; 2BE7 D; 2XMF A; 1BI1 A; 2CP0 A; 2E3H A; 1B34 B; 4JS5 A; 2NLU A; 2LJ3 A; 4M7D D; 1UEB A; 5CIU A; 2DZC A; 1MV3 A; 1WLP B; 2YUO A; 5CAI A; 4IUU A; 1IGU A; 1Q86 C; 3H6Z A; 3FC3 A; 1G3T A; 2DYB A; 4A4F A; 1YHQ T; 4AT1 B; 2RQV A; 1YCS B; 4C5E A; 3GNG A; 1M3A A; 1MMA A; 3QWY A; 3HRU A; 1KHI A; 1BI3 A; 2OTJ A; 2XDP A; 2RJF A; 4ESR A; 3OYD A; 4A4K A; 1OOT A; 5IHI A; 4VUB A; 3CME Q; 3CBP A; 2E70 A; 2X4Y A; 2AHJ B; 3OMG A; 4DEX A; 3NFC A; 2XG8 D; 1N6A A; 4JS4 A; 3OYC A; 4ZN3 A; 3OYF A; 4OGE A; 3FJ5 A; 1ZA1 B; 2VYT A; 1JU5 C; 2MAM A; 4TVR A; 5KCO A; 3TU4 K; 2DTH A; 2WAC A; 1KG1 A; 5IXF A; 1QLY A; 2V8K A; 1YJ9 Q; 3PTA A; 1M1K R; 3OSV A; 2KAF A; 4J9G A; 4M77 B; 2DL7 A; 4JRK A; 1VQP A; 4EMG A; 3EAE A; 1QVG S; 3FJP A; 2HZY A; 1TUD A; 2XD0 A; 4ZGD B; 3MO8 A; 2ZCF B; 4Z8A A; 4FIB A; 4QKU A; 2ZPH B; 1YJW A; 1BCO A; 3RES A; 1YCY A; 3E1S A; 1WXB A; 3I5S A; 3QKJ A; 3JCM c; 4BI4 A; 2JT4 A; 3BY7 A; 1Y7X A; 1UGP B; 1YNZ A; 2OAW A; 2J05 A; 1X69 A; 1NM7 A; 1TUC A; 3M0R A; 4Q5W A; 2RHX A; 2RHU A; 4C5G A; 1AT1 B; 4AFS C; 3VS4 A; 3H0I A; 1AWX A; 3CXC S; 5IH2 A; 1Y0M A; 2CP7 A; 5M9O A; 2EAY A; 4AG1 C; 2ZPB B; 3CCL T; 1PSF A; 1M1F A; 2DER A; 3PFS A; 1RLQ C; 1YP5 A; 2BTT A; 2IVW A; 1NJI C; 4M75 E; 1QVF A; 1ZA2 B; 1HXD A; 2LNV A; 1MUZ A; 2JZ2 A; 2KRM A; 5FLX E; 3R6O A; 5LJ3 d; 1D1B A; 3L42 A; 2HD0 A; 2L89 A; 3GBQ A; 3QZ5 B; 2RI5 A; 4XU0 A; 3S3M A; 1OPK A; 2M0O A; 1Q81 C; 5GAN 6; 2JN0 A; 3CC2 Q; 5A0G A; 4J9E A; 1OZ2 A; 1UHC A; 5KE2 A; 3EG9 A; 2A36 A; 4BDY A; 3UPU A; 5EG2 A; 1GBR A; 2DF6 A; 4M78 E; 1AZG B; 2FRW A; 5GAM j; 1T0H A; 1YFN A; 5LJ5 d; 4XQ3 A; 3QUI A; 1N9R A; 2Y4X A; 3OW2 A; 1VQO T; 1Q95 G; 2O9S A; 1RAB B; 1YHQ Q; 2BKD N; 4AFQ C; 3CXC P; 2CH4 A; 4XTU A; 1QP3 A; 1ZSG A; 2IPO B; 1MV0 B; 4C8Q B; 5GAO m; 5LJ3 e; 1OU9 A; 1X2Q A; 4C92 B; 3UDC A; 3LYI A; 1PRM C; 4M7A E; 5FRO A; 1M27 C; 2M02 A; 2K2M A; 4Z89 A; 3TCJ A; 2ZGW A; 2R57 A; 3M0Q A; 2MMP A; 5KH6 A; 2P0K A; 1G3S A; 3MJX A; 4LXC A; 3TEE A; 2XI9 A; 3L2Z A; 2O4X B; 2OX7 A; 3JRZ A; 1A0N B; 2DL8 A; 1K9A A; 2MCN A; 5LJ5 e; 2FZC B; 1K9M C; 2ED1 A; 4JRP A; 1JB0 E; 1W1F A; 2EFI A; 2RHY A; 3G71 T; 2RHI A; 1M1K U; 2E41 A; 1QCN A; 5GAN 7; 2YRV A; 3QJY A; 2HL3 A; 3VS0 A; 4DQ2 A; 4IKF A; 3LWH A; 3HSB A; 2JNG A; 3VYG A; 2CGH A; 4OP0 A; 1VQ5 T; 1UGQ B; 3S3N A; 4PLL A; 4M77 E; 3QJ6 A; 3VKI A; 1M2V B; 1UJY A; 4UC4 A; 4HA8 A; 4MDX A; 1RL2 A; 2RM4 A; 4ANJ A; 4JJB A; 1AEY A; 2DXB A; 1MMN A; 2L5Q A; 5FRN A; 2RNA A; 3G6E A; 4OGC A; 2DET A; 2DJZ A; 1MMD A; 1RAI B; 5I2S A; 4F7U B; 2D0N A; 5CVI A; 1YI2 T; 3EH1 A; 1VQN A; 2VKN A; 1W2B S; 5GMK i; 3CCL Q; 1V76 A; 3OS5 A; 4BB7 A; 1AWJ A; 5FRM A; 3QO3 A; 2K57 A; 2KMT A; 1N8R U; 3CCU Q; 5GJW B; 2K3X A; 4HCC A; 4WF2 A; 2EYZ A; 4FU6 A; 4FYW B; 2ZPG B; 1MNE A; 5KYY B; 4ME7 A; 1C6V X; 2P84 A; 2F2V A; 2DRK A; 3VS5 A; 5CCA A; 2FYK A; 4DOW A; 4FL6 A; 3EGX B; 5HKC A; 2O2O A; 3A98 A; 2BZ8 A; 1ACM B; 4BD3 A; 3M0T A; 5KYX B; 1VQO Q; 5L23 A; 3KUF A; 4BI8 B; 1W2B P; 1SF9 A; 1NZ9 A; 3CC7 A; 1U5S A; 1AD5 A; 3PVL A; 2H8H A; 2WSC E; 5HY6 A; 4BDZ A; 3VS7 A; 4E7J A; 1T0J A; 2EGE A; 1HK9 A; 4ZN1 A; 2HQE A; 1H3H A; 3OBY A; 1WHM A; 2E64 A; 2DL5 A; 2EVR A; 1QW1 A; 4C8Q E; 4E47 A; 1SSH A; 1VQK Q; 1VQ9 A; 2YRC A; 1ZUU A; 3M0S A; 3GLX A; 3QBY A; 4LN2 A; 4M7D B; 4QVD A; 3L2U A; 3Q1J A; 2QI2 A; 5CQY A; 3EHR A; 5IAY A; 3CCM T; 4PJJ A; 3GNF B; 8ATC B; 2HBW A; 4EDU A; 1WYX A; 4JLI A; 1IXD A; 2K9G A; 1WJR A; 4C92 A; 3X28 B; 1M4Z A; 2ESW A; 3G71 Q; 1EFN A; 1VQ8 T; 1WQ7 A; 1JJ2 A; 1K73 U; 1VQ5 Q; 2HCK A; 2O4X A; 1IHW A; 3JCM h; 3MEV A; 2ED0 A; 1T3L A; 2RH2 A; 4J9D A; 1ZBX A; 4OMP A; 2GF7 A; 3M59 A; 2QAZ A; 4E7S A; 3I9Q A; 1PSE A; 3WVE B; 1S72 A; 3V7R A; 4EMH A; 4M77 C; 2I2L A; 5FU7 B; 2JOY A; 3OYY A; 1YI2 Q; 1TWB A; 3QII A; 2HL5 C; 2EYY A; 5DM7 R; 3QZ9 B; 2EQI A; 1I5L A; 1WXU A; 1M1K C; 2YUP A; 3REA B; 2QQR A; 1Q7Y R; 4JUV A; 3LLR A; 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