The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
MTFVALYDYEARTETDLSFKKGERLQIVNNTEGDWWLAHSLTTGRTGYIPSNYVAPS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Gallus gallus
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| publication title |
The role of Gutamine 128 of the SH3 domain of the c-Src tyrosine kinase in 3D domain swapping and amyloid formation
rcsb |
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
|
| total genus |
5
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2014-01-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1TG0 A; 2RF0 A; 3SHW A; 1K1Z A; 2FO0 A; 2QDL A; 2KRS A; 2YUP A; 1YP5 A; 4OMM A; 2M51 A; 1QKW A; 1E6G A; 1OPK A; 2DM1 A; 2NUZ A; 1QCF A; 1UHC A; 2FPE A; 2JS0 A; 1VA7 A; 3KFV A; 2GBQ A; 2DX1 A; 1M3C A; 1Z9Q A; 2LJ0 A; 1SSH A; 2CH4 W; 2EBP A; 2KRN A; 1AEY A; 1JQQ A; 2L3P A; 2DL4 A; 3CQT A; 1OPL A; 2EKH A; 2LQN A; 2MOX A; 4AG2 C; 1G2B A; 1PNJ A; 3THK A; 1V1C A; 1X2Q A; 3R6N A; 1WX6 A; 3GBQ A; 1K4U S; 2GTO A; 4HVV A; 1AWX A; 1RLP C; 4J9F A; 2J06 A; 2KE9 A; 2CSI A; 1UE9 A; 2DIL A; 1B07 A; 2GTJ A; 1FYN A; 2F2V A; 5FW9 A; 4KRT A; 1NLP C; 1M3B A; 3VS0 A; 1UGV A; 4HCK A; 4AG1 C; 2DBM A; 1M8M A; 4FSS A; 2ROL A; 1H8K A; 2XMF A; 3VS3 A; 2DA9 A; 2KBT A; 5I11 A; 2EYY A; 3H0I A; 4AFZ C; 1QWE A; 2SRC A; 4J9G A; 4RTW A; 3VS1 A; 1OOT A; 2OI3 A; 2V1Q A; 4GBQ A; 2EGA A; 3IQL A; 3O5Z A; 2JT4 A; 1WA7 A; 2IIM A; 3I5R A; 2SEM A; 2DNU A; 1Y57 A; 1GCQ A; 3TSW A; 3NMZ C; 1IO6 A; 2JTE A; 1X27 A; 2RPN A; 1JO8 A; 4HXJ A; 4EIK A; 4J9E A; 2DBK A; 2PZ1 A; 1NG2 A; 1W1F A; 2DVJ A; 1AWJ A; 2KXD A; 2K3B A; 1M30 A; 1CKB A; 2KNB B; 1KSW A; 2FRY A; 2MCN A; 2LMJ A; 1YCS B; 2RQT A; 1MUZ A; 2KT8 A; 3EG2 A; 3NPF A; 1KJW A; 5IHI A; 3M0Q A; 2A28 A; 4WCI A; 3EG0 A; 4J9C A; 3JV3 A; 2F2W A; 4RTT A; 3UA7 A; 1LCK A; 4RTU A; 1NYF A; 2C0I A; 3PVL A; 1QLY A; 1WI7 A; 1X2K A; 1ARK A; 5IHN A; 3RNJ A; 1GL5 A; 2EGC A; 2EYX A; 4IIM A; 5ECA A; 3I5S A; 4JZ4 A; 2ECZ A; 2X3W D; 2LQW A; 4ORZ A; 3VRZ A; 1UFF A; 4JPB W; 1G83 A; 1HSQ A; 4F17 A; 2AZS A; 2KR3 A; 3REA B; 1ZSG A; 4ESR A; 1AWO A; 1UDL A; 2C0T A; 1AZG B; 2JS2 A; 4OML A; 3EG3 A; 2DL8 A; 4D8D A; 3U23 A; 2D0N A; 1WXB A; 1T0H A; 2E5K A; 2NWM A; 1GFC A; 2YUO A; 1YWP A; 4J9H A; 2K2M A; 3UF4 A; 1VYU A; 1GCQ C; 4OMO A; 2DF6 A; 1SRL A; 3H0H A; 2GGR A; 2ESW A; 1K0X A; 2RN8 A; 1SRM A; 2EPD A; 2VWF A; 2L3Q A; 4GLM A; 2CUD A; 2AKL A; 1ZLM A; 2ED0 A; 2RNA A; 2O9V A; 4F14 A; 2EVR A; 2O31 A; 1GCP A; 2KEA A; 2FPF A; 3TVT A; 4E6R A; 4JJB A; 1ZX6 A; 2W10 A; 4AFQ C; 1FMK A; 2RQW A; 4LNP A; 2CSQ A; 2LJ1 A; 3EHR A; 1KFZ A; 4HVU A; 3SEM A; 1QKX A; 5L23 A; 1BBZ A; 1WIE A; 2FG0 A; 4JJD A; 2BZX A; 3VRY A; 2ROT A; 1PRM C; 2KRO A; 2GNC A; 2DLP A; 1AOJ A; 1CSK A; 2JMC A; 1GFD A; 2D8H A; 1UUE A; 1VYT A; 1I07 A; 4X1V A; 1BK2 A; 4RTY A; 2KXC A; 4M4Z A; 2LX7 A; 2CRE A; 1E7O A; 2JXB A; 5IHK A; 3TSZ A; 4CC4 B; 2J6O A; 4LUE A; 2CH4 A; 1WDX A; 5IH2 A; 1UHF A; 3I9Q A; 2ED1 A; 4JZ3 A; 3NHN A; 2G6F X; 1JXM A; 2RMO A; 3A98 A; 2EGE A; 1X6G A; 1VYV A; 1WFW A; 3I35 A; 2A37 A; 1AD5 A; 4DEX A; 1H92 A; 2BZ8 A; 1JXO A; 2YDL A; 1UTI A; 2D1X A; 1JU5 C; 3REB B; 3M0S A; 1SEM A; 4JJC A; 5GJV B; 2O2O A; 2YUN A; 3QWX X; 2LNH B; 2HBW A; 4ZNX A; 1ZBJ A; 1S1N A; 2CUB A; 3EGU A; 4HVW A; 1UJY A; 1W6X A; 1PWT A; 2DMO A; 1XOV A; 2BZY A; 1ABQ A; 3PE0 A; 1CKA A; 3UAT A; 3FJ5 A; 3M0T A; 2ENM A; 2J6K A; 5I22 A; 2M0Y A; 1OV3 A; 1M3A A; 1E6H A; 1I0C A; 5FWC A; 2DYB A; 2J7I A; 1GBQ A; 4Z88 A; 1X69 A; 1MV3 A; 1PKS A; 2JW4 A; 3VS6 A; 4A63 B; 1WYX A; 2CT3 A; 2JMA A; 2KYM A; 4J9D A; 2GQI A; 4D8K A; 1PRL C; 4Z8A A; 3H41 A; 1T3S A; 1K9A A; 3VS4 A; 4LE9 A; 4IIO A; 1KIK A; 1OEB A; 2I0N A; 2B86 A; 2P4R A; 2YSQ A; 1UG1 A; 1T3L A; 1PKT A; 4CC2 A; 1Y0M A; 4OMQ A; 4J9B A; 5HCK A; 1EFN A; 1RUW A; 1B3Q A; 2ABL A; 1I1J A; 1GRI A; 3NGP A; 1SPK A; 2C0O A; 1TUD A; 1ZUK A; 1RI9 A; 2O9S A; 4RUG A; 3UA6 A; 1W70 A; 3RBB B; 2DL5 A; 1HD3 A; 2J05 A; 1NM7 A; 1N5Z A; 4QT7 A; 1K0S A; 1NLO C; 1H3H A; 1AWW A; 4K11 A; 5GJW B; 2H8H A; 2DJQ A; 1TUC A; 2X3X D; 3EG1 A; 5EC7 A; 3ULR B; 4Z89 A; 1J3T A; 2YUQ A; 2HDA A; 4RTZ A; 2K9G A; 2HCK A; 1SHF A; 2RQV A; 1HJD A; 1WXU A; 2MIO A; 2AK5 A; 4Y92 A; 1WLP B; 2DE0 X; 2DL7 A; 2KT1 A; 2BTT A; 2D8J A; 2O88 A; 4LN2 A; 1GBR A; 2J6F A; 2VVK A; 1AVZ C; 2RQR A; 1QWF A; 4F16 A; 2YT6 A; 1PHT A; 4LUD A; 2LCS A; 1RLQ C; 4R0K A; 2DRM A; 2EYW A; 2RQU A; 1MV0 B; 1K76 A; 3VS2 A; 1UJ0 A; 2W0Z A; 1ZUY A; 3C0C A; 2L0A A; 4DEY A; 3VS5 A; 1BB9 A; 1U3O A; 2L2P A; 2L3S A; 3QWY A; 2DRK A; 3M0U A; 1X43 A; 1YWO A; 2AKK A; 1U5S A; 2VKN A; 4RTX A; 2CT4 A; 4OMP A; 2JM9 A; 3EHQ A; 2CDT A; 4CC7 A; 2A36 A; 2FPD A; 3LH5 A; 1YN8 A; 2KYB A; 1ABO A; 2FRW A; 1A0N B; 1NEB A; 2EYZ A; 3M0P A; 2PTK A; 4AFU C; 1JEG A; 2KGT A; 1Z9Z A; 1M27 C; 1NEG A; 2DL3 A; 4J9I A; 4CC3 A; 1AZE A; 2K79 A; 1YNZ A; 1T0J A; 4RTV A; 2A08 A; 5FWB A; 1SHG A; 2K7A A; 5IXB A; 1UEC A; 2HSP A; 2PNI A; 4OMN A; 2LJ3 A; 2K6D A; 1BU1 A; 1U06 A; 2JM8 A; 1ZUU A; 2HEQ A; 3M0R A; 3VS7 A; 2LZ6 B; 5IXF A; 2EQI A; 1NYG A; 2OJ2 A; 2AZV A; 3PVQ A; 2EW3 A; 2FEI A; 3ZL7 C; 3H0F A; 4AFS C; 2F2X A; 1X6B A; 2OAW A; 2LP5 A; 1WXT A; 2V1R A; 2KRM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1TG0 A; 3R6O A; 4F7U B; 3SHW A; 2L5Q A; 4JRI A; 2FO0 A; 1NJI C; 1B7T A; 4PJO E; 2YHT A; 1MMD A; 2YUP A; 1YP5 A; 4J6W A; 4OMM A; 3CPW S; 1TS9 A; 2GFU A; 3ME9 A; 2FPE A; 2XI9 A; 4M78 G; 1YJ9 T; 3P8B B; 2K57 A; 4FYW B; 1M3C A; 1Z9Q A; 2CH4 W; 2EBP A; 2L89 A; 2CZ7 B; 1M2O A; 2JJ9 A; 2L3P A; 3CQT A; 2VV5 A; 4AT1 B; 1FWZ A; 1K9M C; 4RKU E; 3G4S Q; 1QVG S; 1G2B A; 1PNJ A; 3THK A; 2OTJ T; 3CCV Q; 5CR2 A; 3G4S A; 5C6S A; 3EGX B; 2R58 A; 3CCV A; 2J06 A; 2BE9 B; 2CSI A; 2GTJ A; 3UT1 A; 3HFO A; 1FYN A; 4RMO A; 3FJP A; 1Q81 C; 5GAO m; 4NL3 A; 3OSS C; 1BI3 A; 3A8M B; 4AG1 C; 3PTA A; 1M8M A; 3HHT B; 1H8K A; 4ZTF A; 4ELY C; 1ZSZ A; 2RI5 A; 4R55 A; 3VS3 A; 1RAA B; 2DA9 A; 5GAM j; 3CCE Q; 2H3J A; 2EYY A; 1QWE A; 4WTO B; 4RTW A; 5GAM d; 2V1Q A; 3CCE A; 4E7S A; 1G3W A; 3O5Z A; 2JT4 A; 3OA6 A; 2RHZ A; 2ZCF B; 2IIM A; 1Q7Y U; 1QVF P; 2PVO B; 3TSW A; 1D3B B; 5J39 A; 1U1S A; 1WHL A; 2JTE A; 2MF2 A; 3RDV A; 4HXJ A; 2BE7 D; 4JDS A; 4QVD A; 1LJO A; 2PZ1 A; 3QZ9 B; 2JNG A; 1M2V A; 3LW5 E; 1KSW A; 1YCS B; 3TU4 K; 4M77 B; 3NTI A; 3EG2 A; 3NPF A; 2M9U A; 3M59 A; 2F2W A; 2XDP A; 4RTU A; 1QLY A; 3UDC A; 1W4S A; 2QQS A; 1WI7 A; 5GAN 4; 2R5A A; 2P0P A; 3I5S A; 3NTK A; 2LQW A; 2X35 A; 4JPB W; 2YRV A; 3OYD A; 1QQJ A; 3REA B; 2EQU A; 1ZSG A; 2QGF B; 1WHM A; 1AZG B; 1QW1 A; 2K3Y A; 2E5K A; 1YIT Q; 2NWM A; 2DTI A; 3VJP A; 3UWN A; 3UF4 A; 1VYU A; 4OMO A; 3CCM Q; 1YIT A; 1QMC A; 1SRM A; 2EPD A; 4GLM A; 4XTY A; 1PD0 A; 2RHX A; 3CCM A; 2EJG A; 1Y07 A; 3F70 A; 2RI2 A; 4IUQ A; 2ED0 A; 2RNA A; 4A4F A; 2KEA A; 1FMW A; 1YHQ Q; 2IG0 A; 4XU2 A; 3GIB A; 1QVP A; 1QKX A; 4ZGJ B; 3EH2 A; 4R56 A; 1QP3 A; 2BZX A; 2ROT A; 4KH1 B; 1I8F A; 1PRM C; 2KRO A; 4M75 F; 1BCO A; 5L8R E; 5KYY B; 4EMK B; 2JMC A; 5LJ3 g; 2AIR B; 2FZC B; 1I07 A; 1BK2 A; 3A8O B; 3CCL T; 3QBY A; 4C5I A; 2CRE A; 5LJ3 f; 2JXB A; 5IHK A; 1IGQ A; 3TQ7 P; 4LUE A; 3TCJ A; 1V29 B; 2V26 A; 2COZ A; 1YJW Q; 3EAE A; 5IH2 A; 4B6M A; 1VQP Q; 3RIR A; 1YJW A; 2MWO A; 5GMK i; 4NS5 A; 2RMO A; 1VQP A; 3OSV A; 1PM3 A; 1S72 T; 5GAO n; 1H92 A; 4JLI A; 1TOV A; 1KG1 A; 1RAD B; 1JU5 C; 4C0D B; 4OB2 B; 2O2O A; 4JRK A; 1ZBJ A; 2CUB A; 3EGU A; 2GFA A; 4KBM B; 1TWB A; 3INZ A; 1YJN Q; 3V7C A; 4PJO B; 3MCA B; 3QUI A; 3CCJ T; 3M0T A; 3OMC A; 5GAN 6; 2ENM A; 2J6K A; 5I22 A; 1YJN A; 3TRE A; 3CD6 A; 1ACM B; 2MI6 A; 4E7J A; 2F5K A; 2J7I A; 1K73 R; 2JW4 A; 2CGH A; 4Z02 A; 3E19 A; 1PG5 B; 3V7S A; 4J9D A; 3CCU A; 4MDW A; 3G6E A; 4C92 G; 3NFC A; 2OX7 A; 2RJC A; 1KQ1 A; 1U1T A; 4P5N A; 2QQR A; 1UGR B; 4LE9 A; 2NUP B; 1IRX A; 2Y4Y A; 7AT1 B; 4XQ3 A; 4A54 A; 1UG1 A; 4M7A G; 3SD4 A; 4Y28 E; 1OYX A; 1YI2 Q; 2QK0 A; 4OMQ A; 1PSF A; 3QPH A; 3I56 A; 4PNO A; 2MYS A; 5KYY A; 4EMK A; 2M02 A; 4IUT A; 4M75 D; 2HSE B; 1GRI A; 3NGP A; 1SPK A; 4XU3 A; 2C0O A; 2NUT A; 1TUD A; 1ZUK A; 1VQ6 Q; 2O9S A; 2R5M A; 2DZ9 A; 1Y7X A; 1W70 A; 3RBB B; 3HRT A; 1VQ6 A; 1HD3 A; 4EPC A; 5GAO q; 4QT7 A; 1K0S A; 4BAC A; 4M75 C; 5GMK e; 2DEQ A; 1WHH A; 4Y91 A; 1H64 1; 2DPP B; 1VOM A; 1I5O B; 1I81 A; 4FT4 A; 2DJQ A; 3JCM W; 2ATC B; 4KH0 B; 4Z89 A; 2ZGW A; 2YUQ A; 3PGG A; 4RTZ A; 2K9G A; 2QYZ A; 1WXU A; 2DAQ A; 4JRQ A; 1WLP B; 3CCU T; 5LJ5 e; 5LJ5 g; 2KT1 A; 2CP6 A; 3CXC A; 1NJI U; 2E6Z A; 2VVK A; 3KBG A; 4J6X A; 3E2U A; 4LDU A; 2YT6 A; 4FSX A; 1TUG B; 5LJ5 f; 1EIF A; 4IKF A; 4R0K A; 2DRM A; 1TTH B; 3WXM B; 1K76 A; 2W0Z A; 3FDR A; 2L8D A; 4DEY A; 3M54 A; 1JJ2 P; 3QWY A; 2DRK A; 4LD6 A; 4HT8 A; 5HY6 A; 2CT4 A; 3EHQ A; 1VQ7 Q; 2RM4 A; 1K9M U; 2BIV A; 2FPD A; 5KCH A; 1ABO A; 3CBO A; 3VUZ A; 3G71 T; 1A0N B; 4KUL A; 1VQ7 A; 3JB9 G; 2EYZ A; 2MPX C; 3M0P A; 1TSF A; 4AFU C; 3BE3 A; 5KYN A; 1Y96 A; 4CI0 C; 2K5L A; 4ZN1 A; 1Z9Z A; 3CMA T; 2K5F A; 3JB9 I; 4QW2 A; 2VUB A; 3AHU A; 2XHC A; 5A2Q E; 3S3N A; 5GAO p; 4J9I A; 2K79 A; 4UC4 A; 4ANJ A; 4BDY A; 3JCM e; 3JCM g; 2FZK B; 1UEC A; 2HSP A; 3BY7 A; 2LJ3 A; 1U06 A; 3OW2 P; 2HEQ A; 3VS7 A; 5LJ3 h; 3JCM f; 2EQI A; 4C0F A; 4F7U G; 2EW3 A; 3BDU A; 2RF0 A; 1W2B S; 5KYU A; 1R77 A; 4A53 A; 5LL6 S; 2MMP A; 4N0A C; 1WQW A; 3E9G A; 3PMI A; 2YLB A; 5FU7 C; 2DO3 A; 1QCF A; 2VYT A; 3M58 A; 2OTL T; 1UHC A; 4BE0 A; 1IB8 A; 1VA7 A; 3LH0 A; 2LJ0 A; 1SSH A; 3QG1 A; 4D6W A; 2YXY A; 1OU9 A; 2KRN A; 1AEY A; 4X34 A; 5GAN e; 1B34 B; 3H8Z A; 1OPL A; 3H6Z A; 1ZA2 B; 2MOX A; 4PL6 A; 2RK2 A; 4BB7 A; 1HK9 A; 1M5Q 1; 3OMG A; 3MEV A; 1V1C A; 1X2Q A; 1WX6 A; 3GBQ A; 1FX7 A; 4XAX B; 3FC3 A; 3GOX A; 4DA4 A; 2CZ6 B; 1VQ5 Q; 1K4U S; 2GTO A; 3CME T; 1RLP C; 4B9X A; 4J9F A; 2V8I A; 4M7D G; 1UE9 A; 5KCO A; 3V7R A; 2D0Q B; 2ZAE A; 4QQ6 A; 5FW9 A; 4E7K A; 1VQK Q; 2XDB A; 4A4H A; 4OF1 A; 1M3B A; 8AT1 B; 4HCK A; 3HP9 A; 1VQK A; 4KGV B; 1QVG P; 2ROL A; 2EWN A; 2FVU A; 1XQH A; 2QTV A; 1F1B B; 1YIJ T; 2ZPG B; 3H0I A; 4AFZ C; 2HKQ B; 2SRC A; 2XID A; 4GBQ A; 2LT1 A; 1LOJ A; 4KGX B; 1YJ9 Q; 4JRP A; 3ZBD A; 1VQM T; 4GLK A; 3I5R A; 5GMK l; 2DNU A; 1Y57 A; 1YJ9 A; 1IO6 A; 3ZEH A; 2RPN A; 5GAN 5; 1W1F A; 4M77 G; 4RCC A; 1CKB A; 5GMK h; 2OTJ Q; 2MCN A; 2LMJ A; 3QJY A; 2RQT A; 2VGM A; 1ZSZ B; 4JS4 A; 2OTJ A; 2D9T A; 5IHI A; 2DXU A; 2KY9 A; 3EGD A; 3RR6 A; 1X6O A; 4WCI A; 5DM7 R; 1NYF A; 2C0I A; 4BD3 A; 5CK9 A; 4JJN K; 1WPY A; 1GL5 A; 2M1H A; 5LJ5 h; 1C1A A; 2EGC A; 2DXB A; 1B34 A; 2EYX A; 3AT1 B; 3OS5 A; 4IIM A; 4QQD A; 4N4I A; 2ECZ A; 2XDD A; 3VRZ A; 1BIB A; 3JSC A; 2XG8 D; 1WJS A; 2EYQ A; 3QYG B; 1AWO A; 1H3Z A; 1M2V B; 2M16 A; 3EG3 A; 2D0N A; 1T0H A; 1JRI A; 2YUO A; 1YWP A; 4C8Q F; 2B8A A; 1GCQ C; 1M1G A; 3DLL A; 1SRL A; 3H0H A; 2VC8 A; 3HPW A; 4OGE A; 4MDX A; 1QVF A; 2KAF A; 3VKI A; 4M75 B; 1UGQ B; 1JB0 E; 4BUG A; 2LC4 A; 2CUD A; 5FU6 C; 2EVR A; 4KGZ B; 3A8H B; 2E6N A; 3BW1 A; 1ZA1 B; 4E6R A; 3CC4 T; 2W10 A; 4LNP A; 2CSQ A; 2RA2 A; 3X20 B; 3EHR A; 1VQL T; 1FMV A; 5HK3 A; 1KFZ A; 1WJQ A; 2WAC A; 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