The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
NQVYFAVYTFKARNPNELSVSANQKLKILEFKDVTGNTEWWLAEVNGKKGYVPSNYIRKTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| molecule keywords |
DYNAMIN-BINDING PROTEIN
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| publication title |
Structural Details of Human Tuba Recruitment by Inlc of Listeria Monocytogenes Elucidate Bacterial Cell-Cell Spreading.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
11
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| structure length |
61
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| sequence length |
61
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| chains with identical sequence |
C, E, G
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-10-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2AKL A; 3KFV A; 4RTX A; 2CRE A; 2LQW A; 3JV3 A; 4ESR A; 2ESW A; 2F2V A; 2MOX A; 2FPF A; 1OPK A; 2G6F X; 2M51 A; 3EHQ A; 3VS0 A; 1UDL A; 3FJ5 A; 1M3B A; 4J9I A; 4RUG A; 1WFW A; 1PRM C; 2DL8 A; 2AKK A; 1WIE A; 4HVU A; 1N5Z A; 3TSW A; 3PVQ A; 2J7I A; 2DL4 A; 1T3L A; 2OAW A; 2O2O A; 2EQI A; 2LZ6 B; 4AG2 C; 5FWB A; 2DYB A; 4HXJ A; 1H92 A; 2RNA A; 4J9C A; 3THK A; 1BK2 A; 2AK5 A; 3QWX X; 2KBT A; 2JXB A; 1M8M A; 2JS0 A; 4JZ4 A; 3VS2 A; 1X6B A; 1UJY A; 2DNU A; 3SEM A; 3VS3 A; 2C0I A; 5IXB A; 2VVK A; 4A63 B; 5IHK A; 1BB9 A; 1UTI A; 2CSI A; 2D8H A; 1PRL C; 1SRM A; 2JT4 A; 4EIK A; 2GTO A; 1YWP A; 1ZBJ A; 2CSQ A; 3M0P A; 4JJC A; 1Y57 A; 4OMN A; 2BTT A; 1S1N A; 2DJQ A; 3EG3 A; 1LCK A; 2RF0 A; 1GL5 A; 1SRL A; 2PZ1 A; 2HCK A; 3VS7 A; 4IIO A; 4IIM A; 4RTU A; 2E5K A; 2LX7 A; 1UGV A; 1SPK A; 2RQV A; 2SRC A; 2RMO A; 3PVL A; 1EFN A; 3EG0 A; 1OPL A; 1M3A A; 4M4Z A; 1RLP C; 2A08 A; 1J3T A; 2OJ2 A; 4OMQ A; 1K0X A; 1NYG A; 2B86 A; 4RTV A; 2DL5 A; 2JM8 A; 1HSQ A; 2IIM A; 1E6G A; 4AFS C; 2ENM A; 2F2W A; 2JTE A; 4JPB W; 2LJ3 A; 2MCN A; 3I5R A; 2I0N A; 3VS6 A; 2ROL A; 2PNI A; 1CSK A; 5ECA A; 4LE9 A; 2VWF A; 2CT3 A; 1SEM A; 2EBP A; 2YT6 A; 1WI7 A; 2BZ8 A; 2ECZ A; 2W0Z A; 4CC3 A; 3I5S A; 2J6K A; 1GFD A; 2V1R A; 5EC7 A; 2YUN A; 1YN8 A; 1M27 C; 2ROT A; 2EPD A; 2BZY A; 2X3X D; 2DMO A; 1GFC A; 1E6H A; 2KRN A; 2DRM A; 1QWF A; 1UFF A; 2GQI A; 1NYF A; 2YSQ A; 3IQL A; 1NEG A; 1TUC A; 2J6O A; 1ZUY A; 4J9B A; 2DE0 X; 2C0O A; 3M0T A; 1ZSG A; 2JMA A; 1JU5 C; 2K7A A; 1OEB A; 3RNJ A; 3RBB B; 5L23 A; 2CUD A; 1GCQ C; 2EGA A; 4Y92 A; 2KR3 A; 1JXM A; 1VA7 A; 3CQT A; 2DA9 A; 2EYY A; 1YNZ A; 2L3P A; 4FSS A; 1UE9 A; 3H0F A; 1JQQ A; 1G83 A; 2KE9 A; 1WDX A; 1M3C A; 1NG2 A; 2O88 A; 1W6X A; 2LJ1 A; 4F17 A; 2J05 A; 4J9D A; 4AFU C; 2DBM A; 2X3W D; 1GCQ A; 1YP5 A; 1AEY A; 1TG0 A; 2KGT A; 1I0C A; 2NUZ A; 2KRS A; 4DEY A; 5I11 A; 4OMM A; 2GGR A; 3GBQ A; 4J9E A; 2SEM A; 3EGU A; 2DVJ A; 3M0Q A; 1BBZ A; 2HBW A; 1PNJ A; 4KRT A; 4E6R A; 2JS2 A; 3M0U A; 2ED1 A; 1KFZ A; 2JM9 A; 1NEB A; 1X6G A; 1ABO A; 1Y0M A; 2DL3 A; 1AD5 A; 1AZG B; 2DBK A; 2LQN A; 1GBR A; 3O5Z A; 1WYX A; 1H3H A; 3VS4 A; 1T0H A; 1W1F A; 2GNC A; 1E7O A; 1ZX6 A; 1PHT A; 1A0N B; 1GBQ A; 1NM7 A; 1OOT A; 1X27 A; 2KXC A; 3NMZ C; 4F14 A; 4Z88 A; 2EW3 A; 2EKH A; 2K3B A; 1PWT A; 1OV3 A; 4AG1 C; 1AVZ C; 3NHN A; 2OI3 A; 2D0N A; 1MUZ A; 1WA7 A; 3UA6 A; 1K1Z A; 1YWO A; 2RPN A; 4Z8A A; 4OML A; 1H8K A; 2KRO A; 1RLQ C; 2FPD A; 2CH4 W; 1ZUU A; 1BU1 A; 1KSW A; 1QCF A; 2QDL A; 1JXO A; 2F2X A; 4D8D A; 5I22 A; 4AFQ C; 2P4R A; 2ED0 A; 5IHI A; 4F16 A; 1YCS B; 4QT7 A; 2PTK A; 1QKW A; 1U3O A; 1AWO A; 2A37 A; 1PKS A; 1UHF A; 2RQU A; 2LNH B; 3U23 A; 2HDA A; 3NGP A; 1VYU A; 4CC7 A; 1WLP B; 3VS5 A; 3PE0 A; 2YUP A; 1ARK A; 2NWM A; 4HCK A; 3LH5 A; 1FYN A; 5GJV B; 3TSZ A; 4CC4 B; 1QWE A; 2C0T A; 2KRM A; 2FRW A; 5GJW B; 1QLY A; 2K2M A; 1AZE A; 1SHG A; 2RQR A; 2KYB A; 2DRK A; 2FRY A; 3UAT A; 4JZ3 A; 3EG2 A; 4GBQ A; 2EYX A; 1T3S A; 1JO8 A; 1WXU A; 4LN2 A; 1AOJ A; 4J9G A; 1M30 A; 2O9V A; 2EVR A; 1VYV A; 1K9A A; 1NLP C; 1UJ0 A; 4ZNX A; 2K6D A; 2EYZ A; 2KYM A; 1B3Q A; 2MIO A; 1K0S A; 1I1J A; 2XMF A; 2ABL A; 4K11 A; 4J9F A; 1TUD A; 2BZX A; 3H0I A; 1UHC A; 2O31 A; 2EYW A; 2KXD A; 2L3Q A; 1V1C A; 2CT4 A; 1K4U S; 4JJB A; 1KIK A; 3SHW A; 1ZLM A; 2AZS A; 2GBQ A; 2RN8 A; 1AWW A; 4RTW A; 2LP5 A; 3ZL7 C; 2K79 A; 2L0A A; 2A28 A; 3QWY A; 4LUE A; 3I35 A; 1WXT A; 2DL7 A; 4RTT A; 1U5S A; 1SHF A; 1MV0 B; 2DM1 A; 2K9G A; 3UF4 A; 2FPE A; 2DIL A; 2FEI A; 2L2P A; 1SSH A; 3I9Q A; 3H0H A; 1UG1 A; 1WX6 A; 2KT1 A; 2LCS A; 3VRZ A; 3EG1 A; 5IH2 A; 5IXF A; 1ZUK A; 2FG0 A; 4JJD A; 5FWC A; 4RTZ A; 1FMK A; 1T0J A; 2LMJ A; 1AWX A; 1UUE A; 2YUQ A; 3EHR A; 3VRY A; 1X2K A; 4GLM A; 1RI9 A; 2VKN A; 2JMC A; 3M0R A; 4RTY A; 2CH4 A; 1NLO C; 1GRI A; 1Z9Z A; 4WCI A; 4LUD A; 1AWJ A; 1B07 A; 3TVT A; 1G2B A; 2JW4 A; 4X1V A; 2GTJ A; 1X43 A; 1WXB A; 2H8H A; 2CUB A; 3A98 A; 2L3S A; 1U06 A; 5IHN A; 2V1Q A; 3R6N A; 2J06 A; 2AZV A; 4R0K A; 2RQT A; 2KNB B; 4HVV A; 1IO6 A; 4AFZ C; 4D8K A; 4DEX A; 1CKB A; 2YUO A; 1MV3 A; 4OMO A; 2W10 A; 2D1X A; 2HEQ A; 3NPF A; 1K76 A; 1W70 A; 3REB B; 3VS1 A; 1UEC A; 2O9S A; 2DX1 A; 1QKX A; 1XOV A; 3H41 A; 1X2Q A; 4J9H A; 2EGE A; 3UA7 A; 2EGC A; 1KJW A; 3ULR B; 1X69 A; 3REA B; 1CKA A; 1I07 A; 1VYT A; 2HSP A; 1Z9Q A; 2D8J A; 2M0Y A; 3M0S A; 4CC2 A; 2DF6 A; 1HJD A; 4LNP A; 4OMP A; 2J6F A; 5FW9 A; 2A36 A; 2KEA A; 2DLP A; 2KT8 A; 1HD3 A; 2CDT A; 1PKT A; 2RQW A; 1GCP A; 4Z89 A; 2YDL A; 1ABQ A; 2LJ0 A; 5HCK A; 4HVW A; 4ORZ A; 2FO0 A; 1JEG A; 1RUW A; 3C0C A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1TS9 A; 2DEQ A; 4BI4 A; 1MMA A; 1VQ5 T; 3JCM P; 4PJO D; 3QG1 A; 2G6F X; 3EHQ A; 2M51 A; 3FIF A; 2ZCF B; 4C5E A; 3ASK A; 4J9I A; 3QHS A; 4RUG A; 4C8Q G; 5GAM j; 4A53 A; 5CKB A; 2PU9 B; 3OS0 A; 3I55 T; 4NS5 A; 3I55 Q; 1TUG B; 2R58 A; 3LWH A; 3P8B B; 2DL4 A; 2YWW A; 2O2O A; 2RJC A; 2EQI A; 2RH2 A; 2XK0 A; 5LJ5 g; 2LC4 A; 2X9H A; 5FWB A; 4HXJ A; 2I2L A; 3RKW A; 3QWX X; 3TCJ A; 1NE8 A; 1PSE A; 1UJY A; 3CCE A; 3S3M A; 2H3J A; 5CKD A; 2RI5 A; 4A63 B; 2O01 E; 2D8H A; 2HAX A; 1PRL C; 1SRM A; 3AHU A; 1C1A A; 2LTO A; 1WHM A; 1KK7 A; 2PUK B; 5GAN 3; 4P5N A; 1Y57 A; 2HKN A; 4OMN A; 2AHJ B; 2BTT A; 2FZC B; 2DJQ A; 1LCK A; 2RF0 A; 2EQK A; 1SRL A; 4M77 D; 3QYG B; 1WHL A; 4M7D D; 4KGZ B; 1YJW T; 5I2M A; 4IIM A; 3QDR B; 4C8Q B; 1ZQ1 A; 5KE2 A; 2LX7 A; 4C0D B; 1G3S A; 5CKF A; 2RQV A; 1N8R C; 5KYN A; 3G1J A; 3PVL A; 4Y28 E; 3SWN C; 2LCC A; 2QI2 A; 4M4Z A; 1VQ4 T; 1N6A A; 3MCA B; 1VQ4 Q; 4OP0 A; 2MI6 A; 3CCM T; 3J80 E; 3CCM Q; 4RTV A; 4DA4 A; 3GOX A; 1I5L A; 1E6G A; 2F2W A; 4ZN1 A; 4PKC C; 1VOM A; 2QAS A; 1WI7 A; 4C92 F; 2RHU A; 4AT1 B; 2P84 A; 4GLK A; 2J6K A; 4N4H A; 2KK4 A; 4ZN3 A; 1M27 C; 2ROT A; 2QQS A; 2NUT B; 4KUI A; 2DMO A; 3G4S Q; 1UFF A; 2EJG A; 1Q86 R; 2PQW A; 1D1A A; 4BY6 C; 1TUC A; 4M75 C; 4RKU E; 5CKE A; 1ZUY A; 4ZGJ B; 4ZTF A; 5GMK i; 3M0T A; 1C0M A; 1UGQ B; 3JB9 H; 4NOY A; 4QVZ A; 2DZ9 A; 5LJ3 d; 1GCQ C; 1DJ7 B; 1JXM A; 3CQT A; 5LJ5 e; 4M7A E; 3V8K A; 5AYF A; 1BIB A; 1UE9 A; 5CCA A; 3CC4 A; 4C0G A; 2FL7 A; 1RAB B; 1NG2 A; 3CXC A; 1W6X A; 4XTY A; 3JAM E; 5GAN 6; 4E47 A; 4J7I A; 1AEY A; 2KGT A; 2KDS A; 2KRS A; 4DEY A; 3FRN A; 2GGR A; 5L8R E; 2CKK A; 3M0Q A; 2HBW A; 2EQM A; 1QVG A; 5DM7 R; 3KXT A; 5D6X A; 3RKY A; 1YI2 A; 1Q86 U; 3OMC A; 1VQM A; 1X6G A; 2DL3 A; 3OW2 A; 4M7A A; 1B7T A; 5KYU A; 1Y96 A; 3VS4 A; 1VQ6 T; 2GNC A; 1VQ6 Q; 1A0N B; 1PHT A; 3DB3 A; 1PD1 A; 4LD6 A; 2RB6 A; 4F14 A; 1VQN T; 2IVW A; 3P8D A; 4XTW A; 2EKH A; 2K3B A; 2R57 A; 4PFO A; 4C92 D; 4AG1 C; 1JJ2 P; 2EQJ A; 2RK1 A; 1SKU B; 2M9U A; 3CCQ Q; 5LJ3 e; 1R0C B; 4L5G A; 3MEU A; 4DOW A; 2KRO A; 2QG9 B; 4Y91 A; 4PL6 A; 1ZUU A; 4C8Q C; 1GXI E; 4MML A; 8AT1 B; 2QDL A; 1Y07 A; 3DKM A; 3EGX B; 2RA2 A; 2P4T A; 1WJS A; 5KE3 A; 2K5F A; 1M2O A; 1OX9 A; 4PLL A; 1YCS B; 2KSS A; 3CBM A; 4QT7 A; 1U3O A; 1QMC A; 4QVC A; 2JN0 A; 2RQU A; 5DLO A; 3LX7 A; 2M0O A; 3WVD B; 5GAO m; 1TXQ A; 1VYU A; 2X4Y A; 1WLP B; 3CD6 A; 4M78 G; 3OYM A; 2YUP A; 1FYN A; 2KRM A; 3OYH A; 1IGU A; 1SHG A; 2RQR A; 2KYB A; 5CAI A; 3C94 A; 2FRY A; 1D0X A; 4JZ3 A; 3H6Z A; 3OYA A; 4O6J A; 3A1P A; 1JO8 A; 3RUX A; 1AOJ A; 1KC8 U; 2YHT A; 1K9A A; 3FJP A; 3HTR A; 1NLP C; 3CCV T; 2K6D A; 1JB0 E; 3CCV Q; 2MIO A; 3QJY A; 1Q95 G; 3CCR A; 4KBM B; 4BE0 A; 3JB9 I; 3M4G A; 5FU7 B; 2RO0 A; 1TTH B; 3VYG A; 1K4U S; 1G3W A; 3VYH B; 4BUG A; 2AZS A; 2RN8 A; 3UT1 A; 2BE7 D; 2K79 A; 4WF2 A; 3G71 Q; 3CMA T; 2DL7 A; 1QQJ A; 2K9G A; 2QDY B; 3OYG A; 3X26 B; 3C95 A; 4JDS A; 2HSE B; 2CZ0 B; 1NJI C; 3E9G A; 1U1T A; 5GMK j; 1ZSZ B; 1LOJ A; 3JCM c; 2LCS A; 2BUD A; 3VRZ A; 3EG1 A; 5IXF A; 1ZUK A; 2FG0 A; 4JJD A; 3EGD B; 1WZO A; 4ELY C; 1B34 B; 3QBY A; 4LD9 K; 1YIJ A; 2EKO A; 1KQS A; 2VKN A; 2IG0 A; 3M0R A; 2PVD B; 1WHJ A; 2ZAE A; 4WCI A; 1QW1 A; 3CCL T; 4FU6 A; 3VUB A; 3SFM A; 3UWN A; 1G2B A; 5CQY A; 2HZY A; 2E12 A; 4DQ2 A; 2CUB A; 2DIG A; 3D7S B; 3CC2 Q; 2DER A; 2DEU A; 2ZPH B; 3MEW A; 2E64 A; 1FXX A; 5GAO q; 2J06 A; 2KI7 A; 1VQK Q; 2DIQ A; 3JCM V; 5D6Y A; 1IO6 A; 4AFZ C; 4D8K A; 4C0F A; 4RMO A; 2QAZ A; 2QEX A; 1MV3 A; 4E7L A; 2XG8 D; 2W10 A; 2HL3 A; 2D1X A; 1K76 A; 3X20 B; 2YRC A; 2F5T X; 3VS1 A; 3OYY A; 3GNF B; 3EAE A; 1QKX A; 4LDY A; 3RMQ A; 2L8D A; 2QQA A; 3CCS Q; 4PJO G; 2EGE A; 2MAM A; 9ATC B; 1I07 A; 4BI8 B; 4CC2 A; 2K5I A; 1RAH B; 2E65 A; 1JRI A; 2EJF A; 3A8G B; 4LNP A; 4JS4 A; 4OMP A; 3I56 A; 2J6F A; 3ZFJ A; 1V76 A; 1VQ8 Q; 4XQ3 A; 1D0Z A; 1EIF A; 5D6W A; 5CR2 A; 3JCM g; 1R8O B; 4KUL A; 1YBY A; 5FLX E; 2CP2 A; 3M55 A; 2EFI A; 3ZEH A; 1OZ2 A; 1JEG A; 2CP6 A; 4J6Y A; 1SF9 A; 4L6V 5; 3LGL A; 3CME A; 2AKL A; 2YRV A; 4KT0 E; 2CRE A; 2DET A; 2D6F A; 4M7A D; 3JV3 A; 2DXC A; 2F2V A; 3JB9 F; 1UDL A; 1BKB A; 3M59 A; 1M3B A; 4QVD A; 2K4Y A; 1WFW A; 2OX7 A; 1YHQ A; 2DL8 A; 2AKK A; 1OU9 A; 1R77 A; 3X28 B; 4HVU A; 1SG5 A; 2H3E B; 1BIA A; 1QVF A; 2PVG B; 3ER0 A; 5LJ5 f; 2OTL Q; 3JCM d; 1VQ5 A; 2K3X A; 2XKO C; 3INZ A; 4PJO B; 4EDU A; 1LPL A; 1T3L A; 2OAW A; 4M77 G; 3UPU A; 4M7D G; 4FYY B; 5EG2 A; 2QA4 Q; 4PLI A; 5C6S A; 4M78 C; 3NFC A; 2EYQ A; 1K9M C; 1IHV A; 2AK5 A; 4PJO F; 1W4S A; 2VB6 A; 1BYM A; 1M8M A; 2YXY A; 3VS2 A; 3M54 A; 2DNU A; 3RES A; 1Q7Y C; 3VS3 A; 2C0I A; 2K3Y A; 3OBW A; 1EZZ B; 5IHK A; 1UTI A; 2CSI A; 4J7F A; 2P0K A; 3OA6 A; 3JB9 J; 4FL6 A; 1YWP A; 2CSQ A; 3V7S A; 3CCJ Q; 5LJ5 h; 3M0P A; 2DO3 A; 3BDU A; 2DXB A; 3LW5 E; 3PMT A; 1QVP A; 4TVR A; 1S1N A; 2X4W A; 2PZ1 A; 1WJQ A; 2HCK A; 4IIO A; 1FX7 A; 1S72 Q; 4RTU A; 3CPW A; 1UGV A; 2JUF A; 3DLL A; 1G8X A; 1EFN A; 2E41 A; 2FZK B; 4N4I A; 1OPL A; 3HL8 A; 1RLP C; 3V7R A; 1J3T A; 2M1H A; 5LJ3 f; 5CK9 A; 1KD1 R; 2B86 A; 4M77 B; 2CZ7 B; 4M7D B; 1G3T A; 3JCM e; 1YJW A; 4AFS C; 3FDR A; 4JPB W; 4XTZ A; 2XDD A; 3VS6 A; 3JB9 D; 3OYD A; 3OSV A; 4DBH A; 1MMN A; 4LE9 A; 2CT3 A; 2YT6 A; 4M7D F; 1VQ4 A; 1WHG A; 3VJP A; 4CC3 A; 3I5S A; 2FVU A; 5CO7 A; 1LNX A; 2YUN A; 4Q5W A; 1RAA B; 1YN8 A; 2P0P A; 3CEY A; 2HQE A; 2KMT A; 2OTJ T; 2BZY A; 1D3B A; 3EH2 A; 4FW2 A; 4IUR A; 2JTF A; 3M4Y A; 2GFU A; 4LDX A; 2DRM A; 1QWF A; 2MYS A; 3FLG A; 5LJ3 h; 2YSQ A; 3IQL A; 1K8A R; 2HL5 C; 2J6O A; 1X75 C; 3OYC A; 3BFM A; 4J9B A; 3PIP A; 2C0O A; 1ZSG A; 4HCB A; 1TWB A; 2JMA A; 1JU5 C; 3PGG A; 3P8H A; 4J5Y A; 3LWI A; 2CUD A; 4ELZ C; 3NTH A; 1PC0 A; 2KR3 A; 2DD5 A; 2DA9 A; 5GAO l; 2QYZ A; 5I2S A; 1JQQ A; 1HXD A; 2KE9 A; 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