The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
SEDIIVVALYDYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWKARSLATRKEGYIPSNYVARVDS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the human Hck SH3 domain and identification of its ligand binding site.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
HEMATOPOIETIC CELL KINASE
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| total genus |
9
|
| structure length |
61
|
| sequence length |
61
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1998-03-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3M0R A; 2FPF A; 2DBM A; 2FRW A; 2JTE A; 2HBW A; 4J9F A; 4CC4 B; 1Z9Q A; 1ZUY A; 3EG0 A; 2DX1 A; 2LX7 A; 1W1F A; 1K0X A; 2A36 A; 2IIM A; 1FYN A; 2C0O A; 4GLM A; 1AEY A; 2J05 A; 1WI7 A; 4ORZ A; 4RTY A; 2KT1 A; 2PZ1 A; 1M3A A; 1UDL A; 3NHN A; 4CC2 A; 2DJQ A; 1AWJ A; 2CSI A; 1BU1 A; 2HSP A; 1OV3 A; 2KBT A; 1T0J A; 2VKN A; 1M3C A; 2YUP A; 2DIL A; 2EYY A; 1E6G A; 1Z9Z A; 1U3O A; 2EGE A; 2NWM A; 1GBR A; 3VS3 A; 2J6O A; 3U23 A; 1UHC A; 2JS2 A; 2RNA A; 3M0U A; 2SEM A; 2ROT A; 1OPL A; 1HJD A; 1WX6 A; 4AG1 C; 2B86 A; 2D8J A; 2OI3 A; 2EVR A; 3VS6 A; 1YP5 A; 1V1C A; 1H92 A; 1MV3 A; 2BZX A; 1ZUK A; 3H0H A; 1VYV A; 2EW3 A; 2PNI A; 2LMJ A; 2DLP A; 1W70 A; 4HVW A; 1GFD A; 2FEI A; 2FPE A; 4WCI A; 2DE0 X; 5L23 A; 1NYF A; 2AK5 A; 2HCK A; 1ZSG A; 2BTT A; 1UUE A; 2CT3 A; 4OMQ A; 2LCS A; 1G2B A; 2GGR A; 4GBQ A; 3NMZ C; 2QDL A; 2YUQ A; 3PE0 A; 1A0N B; 4LUE A; 2HEQ A; 4AFQ C; 2C0I A; 2EKH A; 3FJ5 A; 4Y92 A; 4DEX A; 3VS4 A; 4KRT A; 4HVU A; 2L3P A; 3UA7 A; 1WXT A; 4FSS A; 1OOT A; 1PRM C; 2X3X D; 1ZUU A; 1AWO A; 1KSW A; 2FRY A; 1UGV A; 1ABO A; 1CSK A; 2AZV A; 4AG2 C; 2D8H A; 2BZ8 A; 1M3B A; 2DL3 A; 3H0I A; 2FG0 A; 3UAT A; 2OJ2 A; 1T3S A; 2FO0 A; 5IH2 A; 1UE9 A; 1NEG A; 2RQW A; 1CKA A; 1TUD A; 1JU5 C; 4AFS C; 2O9S A; 2C0T A; 2XMF A; 4RTZ A; 4M4Z A; 1ZBJ A; 2JMA A; 2VWF A; 3IQL A; 2EYZ A; 3VS1 A; 2KYM A; 3R6N A; 4F17 A; 2A37 A; 3I5R A; 3JV3 A; 1RI9 A; 5ECA A; 1BBZ A; 1GBQ A; 2LP5 A; 3VRZ A; 2DBK A; 1PKT A; 2GTO A; 3H41 A; 1TG0 A; 2EYW A; 4X1V A; 1PHT A; 2CRE A; 2M0Y A; 2OAW A; 2D0N A; 4CC3 A; 1VYU A; 4D8D A; 1MUZ A; 1RLQ C; 4LE9 A; 1SPK A; 1U06 A; 2JW4 A; 2F2V A; 2YUO A; 3TSZ A; 4QT7 A; 2W0Z A; 2KRO A; 1M27 C; 1QCF A; 2KNB B; 2L3S A; 4EIK A; 2SRC A; 4JPB W; 2DRM A; 1E6H A; 1WYX A; 4R0K A; 1H8K A; 1T3L A; 5FWC A; 1QKW A; 1UEC A; 2DL8 A; 5I11 A; 1FMK A; 1M8M A; 2CH4 A; 4AFZ C; 5I22 A; 2EQI A; 3QWY A; 2EGC A; 3I5S A; 2YSQ A; 4ESR A; 2DM1 A; 1K1Z A; 5IHK A; 1T0H A; 4E6R A; 2L3Q A; 2JMC A; 1X2Q A; 4RTU A; 2K2M A; 2LJ0 A; 3VRY A; 2RMO A; 1K4U S; 5FWB A; 1TUC A; 1SEM A; 2D1X A; 2CUB A; 2JXB A; 1NEB A; 1AZE A; 4RTX A; 2JM8 A; 2KRS A; 2LNH B; 1NLP C; 2K7A A; 1J3T A; 1Y57 A; 4OML A; 1SRL A; 1GCQ C; 1OPK A; 1AWW A; 2ECZ A; 1GCQ A; 2ROL A; 4AFU C; 1N5Z A; 2BZY A; 2DVJ A; 1UG1 A; 1WXU A; 3TVT A; 2LJ1 A; 1YWP A; 4HXJ A; 1YNZ A; 2L0A A; 4J9I A; 2LZ6 B; 4HVV A; 3H0F A; 2ENM A; 1YN8 A; 1GRI A; 1HSQ A; 1GFC A; 2F2W A; 1WFW A; 1X27 A; 2NUZ A; 2MOX A; 2DL4 A; 3M0T A; 1ZX6 A; 4F16 A; 2DYB A; 1WLP B; 1I07 A; 2CH4 W; 1SHF A; 3O5Z A; 4Z89 A; 1X6B A; 2L2P A; 2V1Q A; 3SEM A; 3C0C A; 1WXB A; 2RF0 A; 2KRN A; 3I35 A; 3KFV A; 3REA B; 2VVK A; 1BK2 A; 2KE9 A; 2A28 A; 5GJV B; 2YDL A; 3EG1 A; 1QWE A; 4LUD A; 4CC7 A; 4JJC A; 4LNP A; 2KXD A; 1KJW A; 2H8H A; 1I0C A; 5IHN A; 1WA7 A; 1KIK A; 1UFF A; 2P4R A; 2EGA A; 1UJY A; 3UF4 A; 3TSW A; 1XOV A; 1SHG A; 2K3B A; 4ZNX A; 3PVL A; 3M0S A; 1B3Q A; 2KR3 A; 3A98 A; 2EBP A; 1JEG A; 4JZ4 A; 1YWO A; 2PTK A; 3EHR A; 1X43 A; 4HCK A; 1ABQ A; 2O2O A; 1BB9 A; 4J9H A; 2MCN A; 2KYB A; 1H3H A; 1MV0 B; 3RBB B; 3RNJ A; 1Y0M A; 2G6F X; 2MIO A; 4JJB A; 2RQR A; 3THK A; 3SHW A; 2FPD A; 2J6F A; 1WIE A; 5EC7 A; 2RPN A; 4OMM A; 2DL7 A; 4RTT A; 1AOJ A; 2DRK A; 2CDT A; 1G83 A; 1IO6 A; 1W6X A; 3VS2 A; 3VS0 A; 1AZG B; 4JJD A; 2GNC A; 3VS5 A; 2LQN A; 2O31 A; 1LCK A; 4F14 A; 1NM7 A; 2DL5 A; 2F2X A; 2J06 A; 2RQU A; 2JM9 A; 1CKB A; 4RTV A; 1PKS A; 1KFZ A; 1K9A A; 1PNJ A; 4J9C A; 1PWT A; 2ABL A; 4K11 A; 1X6G A; 4IIO A; 3M0P A; 1SSH A; 1NLO C; 1JXO A; 1U5S A; 1YCS B; 4DEY A; 1E7O A; 2KGT A; 3EHQ A; 4J9G A; 3UA6 A; 1M30 A; 2ED0 A; 1JQQ A; 2J7I A; 3EGU A; 2CT4 A; 2KEA A; 2E5K A; 2X3W D; 4A63 B; 4RUG A; 2I0N A; 2ED1 A; 2O9V A; 3EG2 A; 4RTW A; 1QKX A; 1AD5 A; 3QWX X; 1PRL C; 3VS7 A; 2RQV A; 1SRM A; 5IXF A; 1GL5 A; 1JO8 A; 2AKK A; 4J9B A; 3LH5 A; 3CQT A; 1OEB A; 2DMO A; 4J9E A; 5IXB A; 1EFN A; 1K0S A; 1X2K A; 2W10 A; 2JS0 A; 3GBQ A; 3ZL7 C; 1UTI A; 1ZLM A; 2KT8 A; 4OMN A; 2RN8 A; 1ARK A; 1NYG A; 2CSQ A; 2YT6 A; 1K76 A; 1WDX A; 2ESW A; 2HDA A; 5GJW B; 2K79 A; 2YUN A; 4OMP A; 2GQI A; 1HD3 A; 4J9D A; 1JXM A; 3NPF A; 2GBQ A; 2JT4 A; 1NG2 A; 3NGP A; 1VA7 A; 2GTJ A; 4LN2 A; 3PVQ A; 5HCK A; 3EG3 A; 1B07 A; 1QLY A; 3M0Q A; 3I9Q A; 2CUD A; 4IIM A; 2V1R A; 1AWX A; 2AZS A; 2AKL A; 1RUW A; 5IHI A; 1VYT A; 2EPD A; 2DNU A; 2O88 A; 2A08 A; 4Z8A A; 2LJ3 A; 1RLP C; 2DF6 A; 2J6K A; 2K9G A; 1GCP A; 2M51 A; 4Z88 A; 2KXC A; 4D8K A; 2DA9 A; 4OMO A; 2K6D A; 1I1J A; 2RQT A; 1QWF A; 3ULR B; 1S1N A; 4JZ3 A; 1AVZ C; 5FW9 A; 1UJ0 A; 1UHF A; 2EYX A; 2KRM A; 1X69 A; 3REB B; 2LQW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2PUK B; 3M0R A; 4BI3 A; 5KH6 A; 2JTE A; 2FRW A; 3QO3 A; 1M1K C; 2GFU A; 3EG0 A; 2DX1 A; 4ZGE B; 4XTZ A; 2IIM A; 1MMD A; 3A8G B; 2FZK B; 1VQO T; 4GLM A; 3CCS A; 1QVP A; 2HZY A; 2KDS A; 4RTY A; 3LWH A; 3JCM W; 2KI7 A; 2JTM A; 3CCL T; 2XDB A; 4CC2 A; 1R8O B; 1QMC A; 3X24 B; 4Y91 A; 4QQ6 A; 1AWJ A; 2QAZ A; 3OYY A; 1BU1 A; 2HSP A; 2KBT A; 3OYF A; 4PJO A; 1M3C A; 2YUP A; 2YHT A; 2DIL A; 5GAN h; 4KGX B; 1E6G A; 2CZ0 B; 2VGM A; 3SD4 A; 2QAS A; 4OB0 B; 4PJN A; 3PMI A; 2RNA A; 1M1K U; 3CCU T; 4LDX A; 2ROT A; 2B86 A; 1Y96 B; 2EVR A; 4F7U E; 2X4Y A; 4IUQ A; 1ACM B; 2MAM A; 2CP2 A; 3GOX A; 3DKM A; 2BZX A; 3FJP A; 2RJC A; 3EGD B; 4FYY B; 3OS2 A; 1TWB A; 2DLP A; 5GAN 6; 4QW2 A; 1GFD A; 2FEI A; 2FPE A; 5GMK h; 5KE2 A; 4WCI A; 1NYF A; 4M78 B; 1TTH B; 5CKB A; 3M55 A; 4M77 G; 2BTT A; 1UUE A; 3N5B B; 3OQ5 A; 1KHI A; 2LCS A; 3Q1J A; 3NMZ C; 2CS7 A; 1I5O B; 2HEQ A; 4AFQ C; 3OYJ A; 1VQ7 A; 1GXI E; 4A4F A; 4XTX A; 2QQA A; 3QJ6 A; 2X4W A; 2X51 A; 4PKC C; 1OOT A; 1AWO A; 3TQ7 P; 2JZ2 A; 3M4Y A; 3M53 A; 2BZ8 A; 3EAE A; 4LDV A; 3H0I A; 2E6N A; 1T3S A; 2MPX C; 2E1H A; 1VUB A; 4M78 F; 1UE9 A; 1RAD B; 2OTL A; 1KQ1 A; 3EH2 A; 2K5L A; 1NEG A; 1M1F A; 3LGF A; 5LJ5 j; 1F1B B; 2C0T A; 2XMF A; 1RAC B; 2FB7 A; 1NZ9 A; 2DKG A; 1VQL Q; 2VWF A; 1DJ7 B; 4WTO B; 3EH1 A; 3VYH B; 2VXE A; 2HAX A; 2ZPG B; 3R6N A; 3JCM e; 3I5R A; 3JCM d; 5ECA A; 1BBZ A; 1GBQ A; 1G5V A; 3VRZ A; 5CQX A; 5KYU B; 2YRC A; 4FL6 A; 3L42 A; 4JS5 A; 3I55 A; 1RAB B; 4C8Q B; 3MKD A; 4LE9 A; 1RLQ C; 1YJN T; 1N9S A; 4M7D F; 2QQS A; 1N8R R; 3CCL Q; 1TXQ A; 3G4S A; 3CXC S; 4QT7 A; 1Q7Y R; 4A4E A; 3CC2 T; 1QCF A; 2MF2 A; 5LJ5 e; 4OP0 A; 4DBF A; 2OAU A; 1XQH A; 4IUT A; 2DRM A; 1E6H A; 2F5T X; 3JCM f; 5FWC A; 1QKW A; 1UEC A; 2F1L A; 1ZBX A; 2COW A; 5LJ3 j; 3MHX A; 2RK1 A; 4FM4 B; 1FMK A; 2M0O A; 4ZGD B; 1WQ7 A; 4M78 G; 3QSU A; 2DM1 A; 3SFM A; 1WHK A; 1K1Z A; 1T0H A; 2L3Q A; 1D0Z A; 2JMC A; 1X2Q A; 2K2M A; 1W2B S; 2X9H A; 1K4U S; 4J6Y A; 2K2V A; 2D1X A; 2CUB A; 4C5I A; 1R0C B; 4IUP A; 5LJ5 f; 4L59 A; 1AZE A; 2JM8 A; 2KRS A; 1M90 R; 1NLP C; 4A4K A; 2VAS A; 2OTJ T; 1OQK A; 1YIJ A; 1YJW T; 2BUD A; 3M9Q A; 1AWW A; 5J26 A; 5LJ3 e; 2E4H A; 2NUT A; 1VQP T; 1WXU A; 3M58 A; 4M7D G; 4B9X A; 1YWP A; 4A4H A; 2BE9 B; 1HSQ A; 1BI1 A; 4NS5 A; 1GFC A; 1U8R A; 2VV5 A; 2RI2 A; 4CRI A; 4XTV A; 2E41 A; 4F16 A; 3VJP A; 3RMQ A; 2LCL A; 4EMK C; 4M7A C; 3J7A F; 4EMK A; 4D6W A; 4M7A A; 1KK7 A; 4XQ3 A; 4FYX B; 4C8Q G; 4HT8 A; 1KD1 R; 4FYW B; 5GJV B; 2ZCF B; 1D1A A; 1QWE A; 4LUD A; 2G3R A; 5IAY A; 4M75 B; 5LJ3 f; 3LH0 A; 5CAI A; 1I0C A; 4LXC A; 4PJO E; 1KIK A; 1Q82 R; 1UFF A; 2P4R A; 3UF4 A; 3TSW A; 3ASK A; 1YJN Q; 1SHG A; 2K3B A; 3OSV A; 3PVL A; 5D6Y A; 5KYX B; 2DXC A; 4M78 E; 3A98 A; 5HK3 A; 4JZ4 A; 3EHR A; 4HCK A; 1ABQ A; 1VQ6 Q; 3CC2 Q; 3VV0 A; 1OYX A; 3ZFJ A; 1NJI C; 1VQO A; 2G6F X; 4KGV B; 4JJB A; 2RQR A; 3MP1 A; 3L2Z A; 1JJ2 A; 3THK A; 1MHN A; 4ZN3 A; 3GLX A; 1H3Z A; 4ATO A; 1WIE A; 4OMM A; 3I56 T; 1TU0 B; 2FL7 A; 1IO6 A; 2EQU A; 4JJD A; 2GNC A; 4M7D E; 2LT4 A; 5KE3 A; 4F14 A; 2DL5 A; 2F2X A; 2J06 A; 2JM9 A; 3CCJ T; 5GAO m; 4ZTF A; 4RTV A; 3CCU A; 3EGX A; 4JJN K; 5GAN 3; 4K11 A; 4IIO A; 1RI0 A; 3M0P A; 1NJI U; 1JXO A; 2LTO A; 2HSE B; 4DEY A; 3EHQ A; 3H9N A; 3OW2 A; 5LJ5 h; 2GQV A; 4ANJ A; 3PIP A; 2RHY A; 2OTJ Q; 2QA4 T; 1YJW Q; 3CC7 T; 3OYC A; 2CT4 A; 3T9N A; 3JAM E; 4E7L A; 1VQP Q; 2I0N A; 2K5F A; 4PJO D; 1VQ9 T; 5FU6 C; 5CQY A; 4RTW A; 3VU3 C; 1P92 A; 3QWX X; 5GAO p; 1B7T A; 2RQV A; 4FW2 A; 4M78 D; 1VQK T; 1B34 B; 4MML A; 4IUR A; 3LH5 A; 1OEB A; 1BCM A; 2B8A A; 4J9E A; 2E3H A; 4KBM B; 2LQ8 A; 5GAO n; 2YLC A; 1X2K A; 4M75 G; 1UTI A; 1ZSZ C; 1ZLM A; 2RN8 A; 2DD4 A; 2R58 A; 4QVZ A; 1ZSZ A; 2DAQ A; 3SWN C; 2PQW A; 1C0M A; 2AT1 B; 1K76 A; 2HDA A; 2ESW A; 3SWN A; 3JCM Q; 2H3E B; 2QYZ A; 2GQI A; 2P0Q A; 1UGS B; 3CCV T; 2JT4 A; 1S72 Q; 4EDU A; 4QVC A; 2GTJ A; 4M7D D; 1WJS A; 2VGN A; 3R6O A; 4JRQ A; 3DLM A; 2RHI A; 4NL3 A; 4E7J A; 5DY9 A; 2M02 A; 2EPD A; 2RB6 A; 2OTL T; 2ZGW A; 4Z8A A; 2QQB A; 5CO7 A; 3A8L B; 1YJ9 T; 2Y90 A; 4PFO A; 1N27 A; 4ZN1 A; 4D8K A; 1YJN A; 2VXF A; 2DTH A; 1I1J A; 2RQT A; 1VQ4 T; 3ULR B; 1S1N A; 4F7U B; 1AVZ C; 5GAM h; 3OYD A; 3CC2 A; 2NLU A; 2QEX T; 3CCS Q; 1WHJ A; 2DTO A; 1U1S A; 2DBM A; 2E12 A; 2E3I A; 2FPF A; 3BY7 A; 4C5E A; 4CC4 B; 1Z9Q A; 1ZUY A; 1QP2 A; 1QVG P; 1W1F A; 3CCJ Q; 2A36 A; 1M4Z A; 5GAO r; 2C0O A; 2J05 A; 1WI7 A; 2EQM A; 4J8O A; 3CPW P; 3CCR T; 3VUB A; 3NHN A; 2PUO B; 4ZTJ A; 1WQW A; 2QA4 Q; 2MK5 A; 1OV3 A; 3E9F A; 2VKN A; 5GAM g; 3DLL A; 3JB9 D; 2EYY A; 2LNV A; 2NWM A; 3FDR A; 1GBR A; 3VS3 A; 1VQ9 Q; 3JB9 I; 2JS2 A; 4OF1 A; 3QZ9 B; 2RH2 A; 4EMH A; 2LVM A; 3F70 A; 2EJF A; 2DZ9 A; 1OU8 A; 2L8D A; 2MI6 A; 4AG1 C; 3QXE B; 4QVD A; 3PNW C; 3VS6 A; 4BAC A; 2OTJ A; 1KC8 C; 2O01 E; 1OI1 A; 1YJW A; 1QVF P; 2HNI A; 1ZUK A; 2IG0 A; 3OYG A; 4C92 F; 1VQP A; 1PM3 A; 2L89 A; 5CVI A; 1UGQ B; 2DXT A; 1M2V B; 1VQ7 Q; 4HVW A; 2DPP B; 1Q81 R; 1WNL A; 3DB3 A; 3UWN A; 4OB3 B; 3CCV Q; 2CT3 A; 1G2B A; 2GGR A; 2MMP A; 3EG9 B; 4Y92 A; 1YFN A; 4KRT A; 3NFC A; 3UA7 A; 1X01 A; 4M77 C; 4FSS A; 1KC8 U; 2X3X D; 5D6X A; 9ATC B; 4M77 A; 3G1J A; 2OTL Q; 3X26 B; 5EG2 A; 4F7U G; 2AZV A; 3OYN A; 1YJ9 Q; 1M3B A; 2DL3 A; 2K3X A; 5KYW B; 1K8A R; 1M8V A; 2KY9 A; 1O9S A; 2KAF A; 2CP3 A; 2E70 A; 4FT4 A; 3KXT A; 1TUD A; 1JU5 C; 3PFS A; 2O9S A; 4M4Z A; 3NTI A; 3AHU A; 4N4I A; 2QG9 B; 3JV3 A; 1UGP B; 3OYI A; 2LP5 A; 3PTA A; 1PKT A; 1KHC A; 4UC4 A; 1TG0 A; 2FVU A; 4A54 A; 3G4S Q; 1PG5 B; 3OMG A; 2DET A; 2M0Y A; 4MDX A; 3CCE T; 2CZ1 B; 5KYY A; 2D0N A; 1JJ2 S; 2MWO A; 3I56 A; 4D8D A; 3CCR Q; 4FT2 A; 4E7K A; 1U06 A; 2JW4 A; 4DBR A; 1WGS A; 4E47 A; 1N6A A; 3E9G A; 2W0Z A; 2VUB A; 1WJQ A; 2KRO A; 3CC4 T; 3S3O A; 1KG1 A; 3CCJ A; 3E1S A; 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