The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
GSHMTFVALYDYESRTEEDLSFKKGERLQIVNNTEGDWWLAHSLTTGRTGYIPSNYVAPSD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Atomic resolution structures of the c-Src SH3 domain in complex with two high-affinity peptides from classes I and II.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein/peptide
|
| source organism |
Gallus gallus
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| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
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| total genus |
9
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| structure length |
61
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| sequence length |
61
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2012-11-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Z9Z A; 1PNJ A; 1RLQ C; 2EW3 A; 2KXC A; 3NHN A; 2HSP A; 4ESR A; 3VS0 A; 1ZSG A; 1UTI A; 2CT4 A; 1IO6 A; 1G2B A; 1AWX A; 2K6D A; 2BZX A; 2OJ2 A; 1YWO A; 1H8K A; 1UGV A; 2J6F A; 2KGT A; 3IQL A; 1XOV A; 3M0T A; 1PRL C; 2DJQ A; 2ESW A; 3NGP A; 3EG1 A; 2J6O A; 2LJ3 A; 1GL5 A; 1AWJ A; 2KYB A; 2J7I A; 2ROL A; 3QWY A; 1AZG B; 2KT1 A; 2EKH A; 4JZ4 A; 2DBK A; 5FWB A; 1ZBJ A; 3VS1 A; 1N5Z A; 5EC7 A; 4J9F A; 1QKX A; 1YCS B; 1WXU A; 1AOJ A; 2LMJ A; 2DL5 A; 3M0S A; 4CC2 A; 4LE9 A; 1RUW A; 2DMO A; 2M0Y A; 1PKT A; 1JXO A; 2JT4 A; 4HVV A; 4HVW A; 2ECZ A; 4CC4 B; 1MUZ A; 3EG0 A; 2C0O A; 3FJ5 A; 3PVL A; 4DEY A; 2EYY A; 2LZ6 B; 1WDX A; 3UA7 A; 1BK2 A; 1OV3 A; 3NMZ C; 2FPD A; 3UA6 A; 3JV3 A; 2K79 A; 1GCQ A; 2KRN A; 1T3L A; 1WI7 A; 1U3O A; 1G83 A; 2L2P A; 1UE9 A; 4JJC A; 2RF0 A; 1NM7 A; 1GBQ A; 2LX7 A; 4JJD A; 5IHN A; 2FRY A; 4Z89 A; 2DL3 A; 1AEY A; 1SHG A; 4F16 A; 2HEQ A; 2DRM A; 4J9B A; 4EIK A; 2DF6 A; 1VA7 A; 2DL4 A; 5IH2 A; 3EHQ A; 4FSS A; 2E5K A; 2GTO A; 2L3S A; 1ABO A; 1X6B A; 4AFQ C; 3I9Q A; 2W0Z A; 2LCS A; 1MV3 A; 1ZX6 A; 1KFZ A; 4LNP A; 1SRL A; 1SHF A; 2EYW A; 2VVK A; 2VWF A; 4GBQ A; 3SHW A; 1K0X A; 4AFS C; 2C0T A; 1JU5 C; 5IXB A; 2YT6 A; 2KRM A; 1OOT A; 2KRS A; 2EPD A; 3VS7 A; 1CKB A; 3VS6 A; 1NYG A; 4D8D A; 3SEM A; 2F2W A; 1I07 A; 2DYB A; 2AZV A; 2KRO A; 4OMP A; 1KIK A; 1NEB A; 3U23 A; 3ULR B; 1UDL A; 4AG2 C; 1WA7 A; 3TSW A; 4ORZ A; 3VRZ A; 1ZUK A; 1VYU A; 2K9G A; 1B3Q A; 4DEX A; 2XMF A; 4LUD A; 1TUD A; 2ED1 A; 4CC3 A; 2DRK A; 2JXB A; 5L23 A; 2LJ0 A; 3O5Z A; 4E6R A; 1QLY A; 4JPB W; 2LNH B; 2DA9 A; 2O2O A; 4HVU A; 1WIE A; 2FPF A; 1X43 A; 1U06 A; 2DL8 A; 1UG1 A; 4QT7 A; 3EG3 A; 1NLO C; 2DBM A; 1EFN A; 2PNI A; 4RUG A; 2H8H A; 2RN8 A; 1YP5 A; 4J9G A; 2A37 A; 1M30 A; 1FYN A; 1X2Q A; 2K2M A; 1UHC A; 2FO0 A; 4D8K A; 2CSI A; 2EVR A; 2AKL A; 1CKA A; 1A0N B; 1UJ0 A; 3EGU A; 5FW9 A; 2FEI A; 2X3X D; 2DL7 A; 2DE0 X; 2JMC A; 1YN8 A; 2YSQ A; 2HDA A; 2KR3 A; 1Z9Q A; 2I0N A; 4RTZ A; 2YUQ A; 2JM8 A; 1PHT A; 1WX6 A; 1H92 A; 1WFW A; 1GFD A; 1TG0 A; 2L3P A; 4LUE A; 4AG1 C; 2LP5 A; 2CT3 A; 4A63 B; 2DNU A; 3UF4 A; 4OML A; 2FG0 A; 2A28 A; 2EBP A; 4AFZ C; 2KE9 A; 4J9C A; 1SRM A; 1X6G A; 1I0C A; 3M0P A; 1SEM A; 1M3B A; 2BZY A; 2ENM A; 2CH4 W; 2AZS A; 1ARK A; 2AKK A; 1GCP A; 4M4Z A; 2O9V A; 2CDT A; 2YDL A; 2RQT A; 5I11 A; 2KBT A; 1QWF A; 1Y57 A; 1BBZ A; 3H41 A; 2CUB A; 2V1R A; 1NEG A; 5IHI A; 2L3Q A; 2LQN A; 1UUE A; 2DM1 A; 3I5S A; 3REB B; 3VS2 A; 3RNJ A; 4J9I A; 1BB9 A; 2JMA A; 4AFU C; 2CRE A; 2HBW A; 2HCK A; 1VYV A; 2CSQ A; 2J05 A; 2JS0 A; 1WYX A; 1WXT A; 1OPL A; 1QCF A; 3GBQ A; 2VKN A; 2PZ1 A; 2KYM A; 2W10 A; 3UAT A; 1AWO A; 2MCN A; 3REA B; 3VS5 A; 4F17 A; 2P4R A; 1E6G A; 3EG2 A; 1RI9 A; 1UJY A; 1GFC A; 4LN2 A; 2PTK A; 1UHF A; 1X69 A; 1AD5 A; 4J9E A; 4GLM A; 2LQW A; 4JJB A; 1W70 A; 2EQI A; 2ROT A; 2X3W D; 2ED0 A; 1H3H A; 3KFV A; 1M3C A; 1PKS A; 1TUC A; 2BZ8 A; 3M0Q A; 4RTU A; 4IIO A; 1LCK A; 1NLP C; 3PE0 A; 4CC7 A; 1I1J A; 2JW4 A; 2A08 A; 2F2X A; 1K1Z A; 1E7O A; 3I5R A; 1HD3 A; 4J9D A; 2CH4 A; 1OEB A; 2DVJ A; 2IIM A; 2JM9 A; 1W6X A; 1BU1 A; 3QWX X; 3VS3 A; 1OPK A; 1HJD A; 2GQI A; 2AK5 A; 2YUP A; 2G6F X; 4RTV A; 1X2K A; 2MIO A; 1ABQ A; 5FWC A; 3LH5 A; 1KJW A; 2KXD A; 2MOX A; 4X1V A; 3I35 A; 5ECA A; 1J3T A; 2GTJ A; 2RNA A; 1MV0 B; 4IIM A; 2EGA A; 2B86 A; 4K11 A; 5I22 A; 1HSQ A; 2RMO A; 2SEM A; 2RQW A; 2D8J A; 2GBQ A; 3H0I A; 3NPF A; 1ZUY A; 2K7A A; 1AVZ C; 4OMO A; 1K9A A; 1JEG A; 4OMN A; 3VRY A; 1M27 C; 5IHK A; 2C0I A; 2EGE A; 3RBB B; 1W1F A; 1GBR A; 1UFF A; 4HCK A; 1T0J A; 4RTY A; 3VS4 A; 4KRT A; 2NWM A; 4F14 A; 1M3A A; 4RTT A; 2EYZ A; 2LJ1 A; 3R6N A; 2F2V A; 1T3S A; 1NYF A; 1UEC A; 1QWE A; 2RQU A; 1K76 A; 3TSZ A; 1Y0M A; 2GNC A; 1ZUU A; 1YWP A; 1JQQ A; 2YUO A; 4R0K A; 1WXB A; 1YNZ A; 3ZL7 C; 1VYT A; 1U5S A; 1JO8 A; 1PWT A; 1JXM A; 4HXJ A; 3TVT A; 4RTW A; 4OMM A; 1KSW A; 1FMK A; 2A36 A; 1K4U S; 2KNB B; 2O88 A; 2CUD A; 2GGR A; 1ZLM A; 1PRM C; 3PVQ A; 1SSH A; 2ABL A; 2L0A A; 4Z8A A; 2D0N A; 2DIL A; 3M0R A; 1S1N A; 5IXF A; 3THK A; 2J06 A; 2D8H A; 4OMQ A; 2RQV A; 2OAW A; 4Y92 A; 3M0U A; 4JZ3 A; 4Z88 A; 5GJW B; 5HCK A; 2J6K A; 1K0S A; 1GCQ C; 1AWW A; 1GRI A; 5GJV B; 2M51 A; 2RQR A; 2OI3 A; 2BTT A; 3H0F A; 2YUN A; 1RLP C; 2EGC A; 2DX1 A; 1V1C A; 2DLP A; 2FRW A; 2O31 A; 1AZE A; 2KT8 A; 2V1Q A; 1SPK A; 3EHR A; 1WLP B; 1E6H A; 3H0H A; 1M8M A; 2K3B A; 4RTX A; 2QDL A; 4J9H A; 2D1X A; 1B07 A; 3C0C A; 4WCI A; 1CSK A; 2FPE A; 4ZNX A; 1NG2 A; 2SRC A; 2RPN A; 2JTE A; 2KEA A; 2EYX A; 3CQT A; 1T0H A; 1QKW A; 3A98 A; 2O9S A; 2JS2 A; 1X27 A; 2NUZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1HK9 A; 3MET A; 1PNJ A; 3P8H A; 1MMN A; 1VQ4 T; 1RAA B; 2COY A; 3OS2 A; 2F1L A; 4ESR A; 1M90 C; 2DK3 A; 1YIJ Q; 1VQM A; 1ZSG A; 1G2B A; 2HQX A; 5GAM j; 1AWX A; 3RUX A; 3TEE A; 4PJO C; 1BYM A; 2OJ2 A; 1LJO A; 2H3J A; 1IGQ A; 2KGT A; 1YIT A; 1XOV A; 4MZT A; 1PRL C; 3EG1 A; 2J6O A; 3WXM B; 3E9F A; 1AWJ A; 3CCM T; 2ROL A; 4HCB A; 2BUD A; 3QWY A; 4DBR A; 1MMA A; 2VYT A; 2VC8 A; 1V76 A; 2KI7 A; 3PGG A; 5EC7 A; 4YTL A; 2GCX A; 1Q81 U; 4M78 B; 3TCJ A; 4CC4 B; 3PVL A; 1SF9 A; 4M77 F; 4KGV B; 2MI6 A; 3NMZ C; 1VUB A; 2FPD A; 3UA6 A; 2OAU A; 2KY9 A; 2DXC A; 1WI7 A; 1RAD B; 1G83 A; 4JJC A; 3V7C A; 1GBQ A; 3M53 A; 5IHN A; 1YHQ T; 2ATC B; 4DA4 A; 2DL3 A; 1U1S A; 2JOY A; 5GAN 3; 3L1A A; 4MZM A; 2AT1 B; 1I5L A; 4F16 A; 2HEQ A; 5CK9 A; 3FB9 A; 4EIK A; 4EMK A; 3CC7 A; 3A8G B; 2DF6 A; 5FLX E; 3LGF A; 3GNG A; 3QYG B; 3OS5 A; 2BKD N; 3H6Z A; 1KQS S; 2W0Z A; 2HQH A; 1QCN A; 1ZX6 A; 2LCS A; 2ZPI B; 4PJN A; 2O4X A; 1BIA A; 2EYW A; 3V7R A; 1WZO A; 1K0X A; 1Q7Y U; 1VQK Q; 2X35 A; 4Q5W A; 2YT6 A; 4PLI A; 3GIB A; 2KRM A; 1OOT A; 4C0Z A; 1TTH B; 1VQ6 Q; 2KAF A; 3RDV A; 1NYG A; 2F2W A; 5KYY B; 3CCS A; 2AZV A; 3ULR B; 1UDL A; 3OYM A; 3UDC A; 3X28 B; 4FYX B; 3C95 A; 4FSX A; 1ZUK A; 1V29 B; 2DET A; 2K9G A; 3M59 A; 3MP8 A; 3GPL A; 1KHI A; 1B3Q A; 4DBQ A; 5A2Q E; 3QSU A; 2OTL T; 2ED1 A; 1PSE A; 3PMT A; 3CPW A; 2JXB A; 4BY6 C; 5L23 A; 2P0K A; 1XJW B; 4Y28 E; 4N0A C; 2P0Q A; 2GFU A; 4JPB W; 1M90 U; 5A0G A; 4IUQ A; 2FPF A; 1QVF P; 3QII A; 2DL8 A; 1VQ5 A; 5IN1 A; 3JCM b; 3ER0 A; 2H8H A; 2EKO A; 2COW A; 3MJX A; 4PNO A; 4EMH A; 4J9G A; 5HK3 A; 4M78 F; 1M30 A; 2RA2 A; 3M56 A; 3GP8 A; 4ZN1 A; 1FXX A; 2MWP A; 4ZGD B; 3G6E A; 1JJ2 A; 2CSI A; 2VB6 A; 4M78 A; 2X4Y A; 2AKL A; 3JCM J; 1QCO A; 1UJ0 A; 2K3X A; 4XTY A; 4JUV A; 1YN8 A; 2E3I A; 4PJJ A; 1D0X A; 4MZP A; 1YIT Q; 4C0D B; 2H3E B; 1TUG B; 1VQ4 A; 2YUQ A; 1UEB A; 3WVE B; 1TG0 A; 1TXQ A; 2LP5 A; 3HRS A; 2HSE B; 3QUI A; 4EMG A; 2LCC A; 4JS5 A; 2NUT B; 2EBP A; 4XTW A; 4AFZ C; 2E10 A; 4M78 G; 1LPL A; 1M3B A; 2XI9 A; 3X25 B; 2CH4 W; 1ARK A; 2AKK A; 1GCP A; 4F7U B; 5GAN g; 3QZ9 B; 1MGQ A; 3A8M B; 1JBM A; 2E6N A; 5DM7 R; 2YDL A; 2ZPH B; 2LNV A; 3FRN A; 4XTV A; 3EGD B; 1WQW A; 1RAG B; 3VS2 A; 4J9I A; 1BB9 A; 2JMA A; 3CC7 Q; 2A7Y A; 2HCK A; 1QVF S; 2RHX A; 3PT9 A; 1U8R A; 1WYX A; 1WXT A; 2VKN A; 2WSF E; 3I56 T; 1S72 T; 3JCM P; 1ZSZ C; 1ACM B; 4M78 D; 4RG2 A; 3OS1 A; 5GAO m; 3RMS A; 1RI9 A; 1GFC A; 2LT4 A; 4B9X A; 2YXY A; 3OW2 A; 1NPP A; 2K5F A; 3A5Z B; 3CCU T; 1LNX A; 4XU1 A; 3FJP A; 4JRK A; 2LT1 A; 2Y90 A; 4JLI A; 2EQI A; 3JB9 J; 2ZGW A; 3E19 A; 3M57 A; 1YJN T; 3CCS Q; 3S3O A; 1TUC A; 1D0Y A; 4E7I A; 4IUU A; 4XU0 A; 3PNW C; 4QVC A; 1G3Y A; 2XU8 A; 2QGG A; 1HD3 A; 3VJP A; 2DVJ A; 2IIM A; 4FM4 B; 1JRI A; 3CC2 A; 4RTV A; 5CKD A; 1ABQ A; 3G7Z A; 5FWC A; 1VQ5 Q; 1YBY A; 5CR2 A; 3CPF A; 1NPR A; 5ECA A; 3JCM X; 1QVP A; 4R56 A; 1MV0 B; 4IIM A; 1B34 B; 4K11 A; 2OTL A; 1M1F A; 2FHD A; 2SEM A; 3CPW S; 4LD9 K; 2GBQ A; 2WAC A; 3NPF A; 1ZUY A; 1BI1 A; 1VQL Q; 1O9S A; 3RES A; 4F7U F; 2HD0 A; 3RBB B; 4F7U A; 4HCK A; 1IHW A; 2NLU A; 2NWM A; 4HCZ A; 1RAH B; 3VKI A; 4QVZ A; 2VGM A; 1T3S A; 1VQ4 Q; 4FL6 A; 2BE7 D; 3EGD A; 2DZ9 A; 1YJW T; 1M4Z A; 1QWE A; 3SWN B; 1K76 A; 1ZUU A; 4HT8 A; 4C5E A; 3AT1 B; 1Q86 R; 2VV5 A; 4R0K A; 3ZL7 C; 2QA4 A; 3G71 A; 1JXM A; 1W4S A; 1N9S A; 4RCB A; 3WVD B; 4RTW A; 1KSW A; 3EG9 A; 3OS0 A; 4JRI A; 2R57 A; 2KNB B; 2JUF A; 4M7A B; 1MMD A; 4F7U G; 3J7A F; 2PVO B; 2O88 A; 2CUD A; 5GAN 8; 4VUB A; 2L0A A; 2D0N A; 5LJ3 j; 2LQK A; 2DIL A; 2RI2 A; 5CQY A; 4Y92 A; 2OAW A; 5LJ5 j; 3BDU A; 1FX7 A; 3M0U A; 4BI3 A; 1RI0 A; 2QEX T; 2ZAE A; 5GAO r; 2RHI A; 1K0S A; 1GCQ C; 3CCR T; 2M51 A; 2OI3 A; 3OYL A; 1M9S A; 2YRD A; 3DB4 A; 4XK8 E; 4C92 F; 2L3R A; 3JCM V; 2EGC A; 4C92 A; 1QMC A; 2FRW A; 2O31 A; 4GY5 A; 4C8Q E; 2KT8 A; 1TOV A; 3DLL A; 1SPK A; 1WLP B; 3H0H A; 3CXC P; 2NUP A; 4J9H A; 2D1X A; 1BCO A; 5LL6 S; 5AT1 B; 1S72 A; 3I55 A; 1B34 A; 3HHT B; 2JTE A; 4BE1 A; 2XHC A; 3H8Z A; 1T0H A; 4ELZ C; 2F69 A; 3OYB A; 2DTO A; 2FVU A; 2KMT A; 1Q7Y R; 3HRT A; 1PG5 B; 4LDY A; 4C92 G; 2EW3 A; 3UPU A; 1VIE A; 5CO7 A; 3CC2 Q; 2CT4 A; 1IO6 A; 1Q86 C; 9ATC B; 3FLG A; 1KC8 R; 2JNG A; 4FT2 A; 4PJO G; 3CMA A; 5GAN f; 3RIR A; 2OTL Q; 2E41 A; 4E7K A; 1AZG B; 2EKH A; 2DER A; 2P4T A; 2DBK A; 5FWB A; 4N4G A; 3CBP A; 4M7A F; 4J9F A; 3M9Q A; 4X34 A; 2X51 A; 4M7A A; 4CC2 A; 4FW1 A; 3L2R A; 1PKT A; 1JXO A; 2RJC A; 2ECZ A; 3EG0 A; 2C0O A; 2EYY A; 2ZPE B; 4DOW A; 1N9R A; 2CP2 A; 2LZ6 B; 4C92 D; 2PVG B; 2MWO A; 4HT9 A; 4FYV B; 3JV3 A; 2K5I A; 1M8V A; 2L2P A; 3CCL A; 2RF0 A; 5GAM d; 3OYA A; 4L5G A; 2I2L A; 4PJO D; 2FRY A; 4Z89 A; 2Y4Y A; 4IUR A; 3GLX A; 2PU9 B; 2DRM A; 4DOV A; 1VA7 A; 2DL4 A; 4N4H A; 2E5K A; 2L3S A; 1XTD A; 2KSS A; 4M7A G; 2DIG A; 3JCM W; 1D09 B; 2DFU A; 1D1C A; 4QW2 A; 1SRL A; 2JN0 A; 1HXD A; 1SHF A; 1W2B P; 2HL5 C; 2C0T A; 4EMK B; 4C8Q C; 2QQS A; 3FDR A; 4ZGE B; 3CME T; 2LRQ A; 5GAN 6; 2QAS A; 1Q7Y C; 3LW5 E; 3GNF B; 3OSS C; 3LX7 A; 5CKB A; 2KRS A; 4LD6 A; 2EPD A; 3SEM A; 4NOY A; 5I2M A; 2O4X B; 4JDS A; 4M7D E; 1KIK A; 1NEB A; 4BUG A; 1WA7 A; 4ORZ A; 2X4J A; 2WSE E; 1KC8 C; 1VYU A; 2R5M A; 1VQO T; 2KDS A; 4DEX A; 2XMF A; 2M16 A; 2LC4 A; 3CCE T; 4PLL A; 4ANJ A; 2DRK A; 2LJ0 A; 3I56 Q; 1S72 Q; 4J8O A; 3I55 Q; 1WHK A; 2DA9 A; 1WIE A; 2JJ9 A; 2QI2 A; 1KG1 A; 1WJQ A; 1Q86 U; 1K9M R; 1NLO C; 1EFN A; 1PD0 A; 2PNI A; 1YP5 A; 2DPP B; 1FYN A; 2K2M A; 4A53 A; 1UHC A; 4JS4 A; 2YLB A; 3OYG A; 2QG9 B; 4KUI A; 1B7T A; 3HFO A; 2CZ7 B; 1DJ7 B; 3CCJ A; 2KR3 A; 3CMA Q; 3QBY A; 1RAF B; 1FMV A; 1QW1 A; 1WGS A; 2JM8 A; 1W2B S; 1PHT A; 3CC4 T; 1GFD A; 2L3P A; 4AG1 C; 4M75 E; 1ZQ1 A; 1D0Z A; 2NYS A; 2HBP A; 2MYS A; 2FG0 A; 2A28 A; 3NTK A; 1QVF A; 2QK0 A; 1PC0 A; 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