The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
63
|
structure length |
59
|
Chain Sequence |
MENDPNLFVALYDFVATLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSAYITPVNS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the Abl-SH3 domain at pH5
rcsb |
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase ABL1
|
| total genus |
12
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
63
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2013-03-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4JZ3 A; 4QT7 A; 4Z88 A; 2YSQ A; 2ECZ A; 1ARK A; 1WYX A; 1TUD A; 1NLO C; 3REB B; 1T0H A; 4DEX A; 5GJV B; 2PNI A; 3KFV A; 1AWW A; 1E7O A; 1JXO A; 5ECA A; 1M27 C; 2HDA A; 2I0N A; 2PZ1 A; 2E5K A; 1QKW A; 2RNA A; 4DEY A; 3VS6 A; 5IHI A; 1WA7 A; 2EGE A; 2RQV A; 1FMK A; 4AFS C; 2F2V A; 3H41 A; 1YWP A; 2KYB A; 1IO6 A; 2AZS A; 3VS0 A; 1PRM C; 2FO0 A; 3H0F A; 4AG2 C; 2K2M A; 1CSK A; 3UA7 A; 4AFQ C; 4E6R A; 1MV0 B; 4GBQ A; 1M30 A; 2SEM A; 1Y0M A; 1G2B A; 2BZ8 A; 4CC4 B; 1WFW A; 2KT1 A; 4RTX A; 2JW4 A; 4F14 A; 5L23 A; 2YT6 A; 1M3A A; 5FWC A; 3UA6 A; 3PVQ A; 1YNZ A; 1CKA A; 3NHN A; 4RTY A; 2KXC A; 4D8D A; 4X1V A; 1UE9 A; 2AKL A; 5FWB A; 1UJ0 A; 2CH4 A; 1AVZ C; 1B07 A; 2OAW A; 4IIM A; 3QWX X; 1AWO A; 1K9A A; 2DRM A; 1ZBJ A; 2LZ6 B; 2VKN A; 1V1C A; 2ROL A; 1U06 A; 2KXD A; 1OPL A; 2K7A A; 2FRY A; 3UF4 A; 2O2O A; 1PKS A; 3EG1 A; 2X3X D; 1OEB A; 3EHR A; 1UHF A; 4J9C A; 2DE0 X; 3I5S A; 1X2K A; 2AZV A; 1K76 A; 2G6F X; 2DBM A; 3VS2 A; 3SEM A; 1UGV A; 1YCS B; 4JJC A; 2DIL A; 2EVR A; 2ROT A; 2LMJ A; 1NEG A; 2BTT A; 4LNP A; 1J3T A; 2J6K A; 1B3Q A; 2ESW A; 1A0N B; 1UJY A; 1WDX A; 2JS0 A; 1X2Q A; 2EYW A; 2J06 A; 1JO8 A; 1MV3 A; 1W6X A; 4HVV A; 4ZNX A; 4HVW A; 3VS4 A; 1WX6 A; 2LX7 A; 2GTJ A; 1XOV A; 3VS5 A; 2DJQ A; 1MUZ A; 1UEC A; 2KR3 A; 3VS7 A; 1QWF A; 3IQL A; 1E6H A; 2KGT A; 4RTU A; 2CSQ A; 1PHT A; 1U3O A; 2QDL A; 1G83 A; 4Z8A A; 3NPF A; 2M51 A; 3VS1 A; 5EC7 A; 1ZSG A; 2JXB A; 2GQI A; 2L3S A; 4LUD A; 1HJD A; 4OMP A; 3VS3 A; 2JS2 A; 1GBR A; 1NG2 A; 3CQT A; 1ABQ A; 4J9E A; 4J9B A; 3NGP A; 1K1Z A; 2DL3 A; 2EYY A; 1AZG B; 1EFN A; 2K3B A; 1HSQ A; 3TVT A; 4OMM A; 3THK A; 2V1R A; 2CT3 A; 4CC3 A; 1X6B A; 2CUD A; 2RF0 A; 1X27 A; 2LQN A; 4D8K A; 2DL8 A; 1RI9 A; 1FYN A; 1AEY A; 2K9G A; 4JJB A; 2B86 A; 1X43 A; 2LJ3 A; 4RTW A; 2F2X A; 4CC2 A; 2IIM A; 1SHG A; 5IXF A; 2DRK A; 2C0O A; 3EGU A; 1QCF A; 4AFZ C; 2EYX A; 1HD3 A; 1KIK A; 3SHW A; 1AWX A; 2C0I A; 2O88 A; 4EIK A; 3TSZ A; 1PRL C; 2K6D A; 1PNJ A; 3LH5 A; 1AZE A; 2GBQ A; 2K79 A; 3RBB B; 3EG0 A; 4GLM A; 1ZLM A; 3I5R A; 2KT8 A; 2EPD A; 4HCK A; 2JMC A; 2KRO A; 2LNH B; 2EBP A; 2JM9 A; 1UG1 A; 2A37 A; 1SRL A; 5I11 A; 1BU1 A; 2DVJ A; 2DL7 A; 1M8M A; 3M0R A; 2RPN A; 2HSP A; 3UAT A; 4OMQ A; 3M0S A; 3I35 A; 1ABO A; 2CUB A; 2HCK A; 2D8J A; 1GCQ C; 1WIE A; 1T3S A; 2KE9 A; 4F16 A; 2P4R A; 2J6O A; 2YUO A; 1VYV A; 1WXT A; 4OMN A; 1K4U S; 1I0C A; 2ENM A; 2KYM A; 4J9H A; 3PVL A; 2FG0 A; 1N5Z A; 2ABL A; 2O9V A; 1YN8 A; 1I1J A; 2CDT A; 2DMO A; 1GCQ A; 1YP5 A; 1YWO A; 1GFC A; 1KFZ A; 1Z9Z A; 2RMO A; 2FPF A; 1JU5 C; 2KRS A; 1UUE A; 1BBZ A; 4AG1 C; 2KBT A; 3VRY A; 2DL5 A; 2V1Q A; 5IXB A; 1TUC A; 4RTT A; 1W1F A; 2RQT A; 2J05 A; 1ZX6 A; 2EQI A; 2CT4 A; 3RNJ A; 4JJD A; 2LJ0 A; 5IHK A; 4KRT A; 2AKK A; 2ED1 A; 1WLP B; 1OOT A; 3GBQ A; 3M0P A; 4LN2 A; 2JTE A; 2DBK A; 2RQW A; 4JZ4 A; 4LE9 A; 2DF6 A; 1UTI A; 1JQQ A; 4HXJ A; 2RN8 A; 2D8H A; 1UDL A; 4RUG A; 1WXU A; 1GL5 A; 4WCI A; 2O31 A; 1VYU A; 2CRE A; 3I9Q A; 2A36 A; 1UHC A; 5I22 A; 1SSH A; 2DNU A; 1S1N A; 1BB9 A; 2KRN A; 1QKX A; 1M3C A; 2RQU A; 3TSW A; 1GRI A; 3REA B; 1OPK A; 4JPB W; 4AFU C; 2XMF A; 2J7I A; 1RLP C; 1RLQ C; 2BZY A; 2VVK A; 5FW9 A; 1SRM A; 2CH4 W; 2JMA A; 1Y57 A; 2YUQ A; 2A28 A; 2MIO A; 4M4Z A; 1NEB A; 1SHF A; 2W10 A; 1UFF A; 3EHQ A; 1NYG A; 2YUP A; 2DA9 A; 2JM8 A; 2D0N A; 2FPD A; 3U23 A; 1AD5 A; 1X69 A; 2RQR A; 3C0C A; 2LP5 A; 3M0U A; 1VYT A; 2EW3 A; 3FJ5 A; 1H3H A; 2JT4 A; 1CKB A; 4OML A; 4FSS A; 1AWJ A; 2LJ1 A; 3M0T A; 1H8K A; 1M3B A; 4J9F A; 1JXM A; 1H92 A; 1WI7 A; 1ZUU A; 1PWT A; 1OV3 A; 3VRZ A; 3EG2 A; 2FRW A; 4K11 A; 4RTV A; 3ULR B; 1BK2 A; 3NMZ C; 2OJ2 A; 2LCS A; 2M0Y A; 4CC7 A; 1VA7 A; 4R0K A; 1GCP A; 5IH2 A; 2L3P A; 2GNC A; 3PE0 A; 1U5S A; 2MCN A; 1PKT A; 1QLY A; 2L0A A; 2EGC A; 2KRM A; 1KSW A; 1NYF A; 1LCK A; 2DLP A; 2HEQ A; 3M0Q A; 5GJW B; 1QWE A; 1W70 A; 4LUE A; 1K0X A; 2KNB B; 4J9I A; 2J6F A; 1SPK A; 5HCK A; 2DL4 A; 3O5Z A; 2H8H A; 2OI3 A; 3QWY A; 2NUZ A; 4ESR A; 1GBQ A; 4Z89 A; 3ZL7 C; 1E6G A; 2DM1 A; 1WXB A; 1X6G A; 1ZUK A; 5IHN A; 2FPE A; 1K0S A; 1T0J A; 2VWF A; 4ORZ A; 2EYZ A; 2KEA A; 2FEI A; 1RUW A; 2GTO A; 2PTK A; 4Y92 A; 2D1X A; 1GFD A; 2NWM A; 2GGR A; 3EG3 A; 2DYB A; 1AOJ A; 2C0T A; 4RTZ A; 2X3W D; 1Z9Q A; 4F17 A; 3A98 A; 2W0Z A; 1NM7 A; 1KJW A; 3R6N A; 2EKH A; 3H0I A; 1T3L A; 1NLP C; 2L3Q A; 3H0H A; 1JEG A; 2HBW A; 1SEM A; 1ZUY A; 4OMO A; 4A63 B; 2DX1 A; 2CSI A; 2LQW A; 2YDL A; 1I07 A; 2A08 A; 2F2W A; 2EGA A; 4IIO A; 2ED0 A; 4J9D A; 2SRC A; 2MOX A; 3JV3 A; 1TG0 A; 2BZX A; 4HVU A; 2YUN A; 2O9S A; 4J9G A; 2L2P A; 2AK5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DEU A; 4XU3 A; 3HPW A; 1NZ9 A; 2OX7 A; 2YSQ A; 5GAM e; 1ARK A; 1TUD A; 1NLO C; 2A7Y A; 2GFU A; 4WF2 A; 3KFV A; 3CD6 T; 2MI6 A; 4FL6 A; 2HDA A; 2PZ1 A; 1EZZ B; 1YJ9 A; 1RL2 A; 4C8Q C; 3OYG A; 2G3R A; 2K5F A; 1D0X A; 2RNA A; 2KSS A; 3HTR A; 5IHI A; 4J6X A; 5GAO m; 3H6Z A; 5GAO q; 1KC8 U; 1VQN Q; 2E6N A; 1YJN A; 4AG2 C; 1I5L A; 4C0D C; 4E6R A; 1MV0 B; 2EJG A; 1M30 A; 1ZQ1 A; 1Y0M A; 2RA2 A; 5D6W A; 2BZ8 A; 4CC4 B; 3CCV T; 4KUI A; 4EMK C; 2I2L A; 3QPH A; 1D1C A; 5LJ3 e; 4M7A A; 1M3A A; 4XTU A; 4C5H A; 4IUV A; 1JB0 E; 3MO8 A; 3V7R A; 2M16 A; 2XIC A; 2AKL A; 1AVZ C; 1OZ3 A; 2ZPG B; 1ZBJ A; 2XDB A; 4P5N A; 2ZPI B; 2RJE A; 4GLK A; 1U06 A; 4MML A; 2KAF A; 2FRY A; 2X51 A; 2O2O A; 4QQD A; 2KVQ G; 4BE1 A; 4FYV B; 1M8V A; 3I5S A; 1FXX A; 2AZV A; 3A5Z B; 2X4X A; 3KBG A; 1MMA A; 1TXQ A; 2EVR A; 3UPU A; 5M9O A; 1VQP Q; 5CK9 A; 1FWZ A; 2BTT A; 5KH6 A; 1YIJ A; 3MP8 A; 3CCJ T; 1B3Q A; 1WDX A; 3JCM Q; 1O9S A; 1X2Q A; 2J06 A; 1W6X A; 1JJ2 A; 4HVW A; 3HP9 A; 1WX6 A; 1FX7 A; 4IUP A; 2LX7 A; 3L2V A; 3QDR B; 3F70 A; 1D3B B; 2KR3 A; 3HFN A; 2P0P A; 2QEX Q; 4PJO A; 4BI3 A; 1E6H A; 1VQL Q; 4A4E A; 3D7S B; 2H3J A; 4N4H A; 4B6M A; 1PHT A; 5GAN 6; 3MP1 A; 4Z8A A; 2KI7 A; 1D1B A; 3VS1 A; 3JAM E; 4PL6 A; 1ZSG A; 2JXB A; 5EC7 A; 1R0C B; 5KYX A; 4XTY A; 2GQI A; 1U8R A; 2JS2 A; 4A53 A; 3EFS A; 4QVZ A; 4A4G A; 4J9E A; 2NLU A; 4IKF A; 3QHS A; 3PMT A; 1QCO A; 1K1Z A; 2EYY A; 1YI2 T; 1AZG B; 5CVI A; 3PIP A; 2K3B A; 3CCM T; 3A8H B; 4CC3 A; 1X6B A; 1H64 1; 2RF0 A; 2MWP A; 5CKB A; 1X27 A; 3PGG A; 1JBM A; 3OYL A; 2EQK A; 3OYM A; 1AEY A; 5GAO n; 1X43 A; 2LJ3 A; 2V8I A; 4DBH A; 3GF5 A; 2DD4 A; 2QK0 A; 1SHG A; 3HL8 A; 3SWN B; 2C0O A; 1KIK A; 3L1A A; 4M7D C; 4JLG A; 1KD1 U; 5KYY A; 4EIK A; 3TSZ A; 2QGF B; 2VB6 A; 3I56 Q; 1VQ5 Q; 2K79 A; 1RAD B; 3EG0 A; 2X35 A; 2EPD A; 2KT8 A; 3INZ A; 2JMC A; 3LH0 A; 2EBP A; 2D9T A; 1UG1 A; 2A37 A; 2XI9 A; 3L2W A; 3S3M A; 4PFO A; 2QA4 T; 1R77 A; 3MHX A; 2CP0 A; 1Q82 U; 4MZM A; 4OGE A; 3RDV A; 3PFS A; 1OZ2 A; 2XID A; 3SWN A; 5IT9 E; 4EMG A; 5J39 A; 4BDZ A; 3MJX A; 2ENM A; 3L2Q A; 2R57 A; 3PVL A; 2FG0 A; 2O9V A; 1YN8 A; 4LD6 A; 4AT1 B; 1GXI E; 4R56 A; 2QA4 A; 2EQJ A; 3MEV A; 3KXT A; 1GCQ A; 4OB0 B; 1YWO A; 2EWN A; 2WSE E; 4A4H A; 1WZO A; 2FPF A; 5LJ5 d; 1UUE A; 7AT1 B; 4OP0 A; 4XU0 A; 4PJN A; 2B8A A; 1D1A A; 1VIE A; 4FT2 A; 1TUC A; 4RTT A; 5GAN h; 3DLL A; 2RQT A; 1ZX6 A; 1VQN A; 1IRX A; 2HQE A; 3RNJ A; 1EIF A; 2VV5 A; 3VKI A; 5GAM g; 3OYB A; 1OX9 A; 1VQM Q; 2ED1 A; 1YIT Q; 1WLP B; 1OOT A; 3M0P A; 2JTE A; 2RQW A; 3M4G A; 2ZGW A; 4JZ4 A; 3X25 B; 5GAN j; 3CCL Q; 5CAI A; 2DF6 A; 4HXJ A; 1UTI A; 1I4K 1; 2DEQ A; 4KUL A; 4DBF A; 2WSF E; 4RG2 A; 1D09 B; 4BB7 A; 3CCU T; 1AHJ B; 2Y4Y A; 4B9W A; 2BE9 B; 1G5V A; 5LJ5 h; 1MGQ A; 1UGP B; 3BDL A; 2BIV A; 2FZK B; 4C92 C; 2L8D A; 2CZ6 B; 1UHC A; 3KUF A; 2DNU A; 1S1N A; 1BB9 A; 2AIR B; 2RQU A; 3TSW A; 3O8V A; 3REA B; 4PFP A; 1OPK A; 8ATC B; 2CP6 A; 1TUG B; 3PT9 A; 2R5A A; 2J7I A; 2BZY A; 2VVK A; 3CBM A; 2E65 A; 2MIO A; 5CQX A; 1UFF A; 1V29 B; 2YUP A; 1LVK A; 2JM8 A; 2QTX A; 2FPD A; 2MMP A; 4L59 A; 1VQP A; 3A8O B; 2LP5 A; 2EW3 A; 1JJ2 P; 5GAN e; 4X9C A; 3DLM A; 4R55 A; 1AWJ A; 2K2V A; 4FT4 A; 1M3B A; 5J26 A; 1WI7 A; 3CBP A; 2YRC A; 2QEX A; 3MKD A; 2FRW A; 4BE2 A; 4PLL A; 1VQL A; 3TU4 K; 2NUP B; 5KYW B; 2E5Q A; 3OY9 A; 1BK2 A; 3NMZ C; 1NJI R; 2AHJ B; 2DER A; 1VA7 A; 4BI4 A; 1GCP A; 1MNE A; 4ELY C; 3E19 A; 1U5S A; 1R8O B; 2L0A A; 2EGC A; 4C8Q G; 5HK0 A; 4ZN3 A; 4LDY A; 1VQK T; 1LCK A; 3LYI A; 4JRK A; 1W2B A; 1QWE A; 2COW A; 4LUE A; 4M75 C; 1PD0 A; 2HD0 A; 3LX7 A; 1EX4 A; 5CIU A; 2XD0 A; 2XU8 A; 2V8J A; 3I55 T; 1LOJ A; 2LQK A; 3QWY A; 4ESR A; 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4AFQ C; 3CCL A; 4GBQ A; 1SSF A; 3CCJ Q; 3QJ6 A; 2HQX A; 4Y28 E; 4M7D E; 1K9M U; 2KT1 A; 3JCM h; 4F14 A; 4KUD K; 5L23 A; 1OUL A; 5FWC A; 3PVQ A; 1CKA A; 3NHN A; 4RTY A; 2RI3 A; 4X1V A; 4M7A F; 5FWB A; 1UJ0 A; 4M77 D; 4XTX A; 3A1P A; 2OAW A; 4IIM A; 3EGX B; 2F69 A; 2VKN A; 3SDZ A; 1OPL A; 4EMK A; 3OSS C; 1OEB A; 2YHT A; 3GIB A; 4M7D G; 2K5I A; 4C0F A; 1KC8 C; 5DLQ E; 4ZTF A; 1UGV A; 3M9Q A; 1YI2 Q; 4M77 B; 2ROT A; 3JCM P; 4ZTJ A; 3CCM Q; 4LNP A; 1C1A A; 2NYS A; 3PTA A; 5LJ5 f; 1N9S A; 2EYW A; 1MV3 A; 1M9S A; 2HL5 C; 4HVV A; 4ZNX A; 3VS4 A; 4CRI A; 2R58 A; 3EGX A; 1M1F A; 3VS5 A; 2DJQ A; 2OAU A; 1MUZ A; 5KYU A; 1UEC A; 5LJ3 h; 2QAZ A; 1QWF A; 3JCM W; 4LDX A; 4M7A D; 4RTU A; 4FYX B; 2MF2 A; 4PJO F; 2E1H A; 3P8B B; 1Q82 R; 2M51 A; 2O4X A; 1ZHI A; 2PVG B; 4PK4 A; 1QVG P; 4M77 A; 3MP6 A; 5GAN g; 1U1S A; 1UB4 A; 3JB9 H; 3V8K A; 4LUD A; 4OMP A; 1W2B P; 4QKU A; 1ABQ A; 2QA4 Q; 4C92 E; 1WQ7 A; 4M7A B; 3J81 E; 1HSQ A; 4OMM A; 2QQS A; 3WVD B; 2JJ9 A; 2CUD A; 1FMV A; 1V76 A; 3G4S T; 2F5K A; 2LQN A; 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