The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
MTFVALYDYESRGETDLSFKKGERLQIVNNTEGDWWLAHSLTTGRTGYIPSNYVAPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding, signaling protein
|
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
|
| publication title |
Crystal structure of the intertwined form of the Src tyrosine kinase SH3 domain T96G/Q128R mutant
rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
|
| total genus |
6
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2014-11-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3EGU A; 4JPB W; 3I5S A; 3PVQ A; 1NLP C; 2JM8 A; 2DX1 A; 2X3X D; 1UUE A; 1LCK A; 4OMP A; 2JT4 A; 5IHN A; 2LP5 A; 2MCN A; 2DL7 A; 1BK2 A; 3M0U A; 4LUD A; 3QWY A; 4GBQ A; 2DRK A; 1GL5 A; 3C0C A; 4HXJ A; 1QCF A; 1UEC A; 1QWF A; 2DBK A; 1GBR A; 4RTX A; 1AWW A; 1UHF A; 2JS2 A; 1WXB A; 2CSI A; 2VWF A; 3NPF A; 4IIO A; 1ABO A; 5FWC A; 3VRZ A; 2M0Y A; 2O9V A; 2J6O A; 2JS0 A; 1B07 A; 2GGR A; 3SHW A; 2FRW A; 1MV3 A; 1K0X A; 1AWJ A; 1ZBJ A; 1SSH A; 1T3L A; 2GTJ A; 2D0N A; 1E6G A; 2EVR A; 1GBQ A; 2MOX A; 1IO6 A; 1RI9 A; 2OJ2 A; 2LQN A; 3VS7 A; 1UFF A; 1H3H A; 3VS1 A; 4J9H A; 4DEY A; 3EG0 A; 1VYU A; 1A0N B; 1YN8 A; 1HSQ A; 4RTW A; 1I0C A; 3H0F A; 4RUG A; 1NLO C; 2GNC A; 4HVW A; 3VS2 A; 1OEB A; 2KRO A; 2DYB A; 1WXU A; 2JXB A; 1YCS B; 5HCK A; 5GJW B; 1VYV A; 2SRC A; 3VRY A; 2FRY A; 2DIL A; 4IIM A; 4Z88 A; 2ED1 A; 2J05 A; 2DJQ A; 1X6B A; 2DL3 A; 1UDL A; 2ESW A; 2A37 A; 2M51 A; 4JJC A; 1PRM C; 1YNZ A; 1ZLM A; 4J9C A; 1MV0 B; 1TUC A; 1M30 A; 4Z8A A; 4OMQ A; 2ABL A; 4DEX A; 2EKH A; 2FPF A; 2FPE A; 2L0A A; 1S1N A; 1M27 C; 2RQT A; 2KBT A; 2RQU A; 1JEG A; 1KSW A; 2KT1 A; 1E6H A; 5IXB A; 3I5R A; 3I9Q A; 2K7A A; 2DVJ A; 3UA7 A; 3PVL A; 2EYY A; 2LJ0 A; 2AZS A; 2VKN A; 1V1C A; 1X69 A; 1K1Z A; 1MUZ A; 2PTK A; 2MIO A; 2DL4 A; 4J9B A; 3ULR B; 1PNJ A; 2DLP A; 1SEM A; 2H8H A; 1VA7 A; 2J7I A; 2RQW A; 2AKK A; 2JMC A; 5IH2 A; 4HCK A; 3UA6 A; 3GBQ A; 2DBM A; 1I07 A; 2HEQ A; 2I0N A; 1WIE A; 4J9D A; 2K2M A; 3IQL A; 1YP5 A; 3LH5 A; 3M0P A; 1GFC A; 2KR3 A; 4D8D A; 1M3A A; 2OAW A; 2DNU A; 3TVT A; 2RNA A; 1GCQ A; 1UJ0 A; 2GBQ A; 4RTZ A; 4JJB A; 2A08 A; 1AZE A; 5L23 A; 1BBZ A; 1YWP A; 2XMF A; 2FG0 A; 2HSP A; 2GTO A; 2DRM A; 2EGE A; 3VS3 A; 2X3W D; 1FMK A; 2VVK A; 1AZG B; 2KRN A; 1SRM A; 2SEM A; 3NHN A; 2KXC A; 2CUD A; 1RLQ C; 4FSS A; 1GFD A; 1AWO A; 1QKW A; 2RN8 A; 2AKL A; 3RBB B; 1AEY A; 2YSQ A; 4OMO A; 4EIK A; 1BB9 A; 2HDA A; 1K4U S; 1AVZ C; 1PKS A; 1PRL C; 1PKT A; 1SPK A; 2YUP A; 1X43 A; 2RQR A; 2A28 A; 2KYB A; 1SRL A; 1WX6 A; 1OPL A; 1HJD A; 2AZV A; 4J9I A; 1X2K A; 3NGP A; 2F2X A; 2JM9 A; 1ABQ A; 4ORZ A; 2LMJ A; 1ARK A; 2IIM A; 1XOV A; 4D8K A; 1NM7 A; 2EQI A; 5IHK A; 1KFZ A; 1NYG A; 1UTI A; 1AOJ A; 1CKB A; 2DL5 A; 2YUN A; 2DMO A; 3UF4 A; 4F14 A; 2A36 A; 3EHQ A; 2OI3 A; 1ZSG A; 3KFV A; 1GCP A; 2EW3 A; 2EYX A; 3VS6 A; 1KJW A; 1BU1 A; 4OML A; 4HVV A; 2O9S A; 1H92 A; 2L2P A; 3EG1 A; 1G2B A; 2NUZ A; 2L3P A; 2CSQ A; 4RTU A; 2PNI A; 1JU5 C; 1NEB A; 1WXT A; 2EGA A; 1QKX A; 2JMA A; 1TG0 A; 2E5K A; 2KEA A; 2F2V A; 4E6R A; 1B3Q A; 2GQI A; 1T3S A; 1ZUK A; 3REB B; 1RUW A; 2K6D A; 2EYW A; 1G83 A; 3NMZ C; 1RLP C; 2ED0 A; 2J6K A; 1AD5 A; 2YDL A; 2AK5 A; 4K11 A; 2P4R A; 2LJ1 A; 1EFN A; 1K0S A; 2KT8 A; 1H8K A; 1JXM A; 3UAT A; 2JTE A; 5EC7 A; 2CH4 W; 2C0T A; 1K76 A; 1M8M A; 1U3O A; 2BTT A; 2V1R A; 4OMN A; 1WDX A; 2ECZ A; 1PWT A; 4QT7 A; 4AG2 C; 2QDL A; 2B86 A; 4Z89 A; 3M0T A; 4LNP A; 1NG2 A; 2W10 A; 4AG1 C; 1CSK A; 1JQQ A; 1W70 A; 2RQV A; 2K9G A; 2CH4 A; 4AFU C; 2HCK A; 2ROT A; 2KXD A; 5IHI A; 1W6X A; 2KNB B; 5I11 A; 1U5S A; 4LUE A; 5FW9 A; 4J9F A; 3M0Q A; 4J9G A; 1X6G A; 1WA7 A; 3QWX X; 3A98 A; 1AWX A; 4LE9 A; 4RTT A; 1WLP B; 1U06 A; 5ECA A; 1QLY A; 1T0J A; 1M3B A; 2EBP A; 4F17 A; 4J9E A; 1J3T A; 4OMM A; 4R0K A; 2C0O A; 4CC4 B; 5IXF A; 2D8H A; 2FO0 A; 1ZUY A; 3EG3 A; 3JV3 A; 2K3B A; 4Y92 A; 2LQW A; 1Y57 A; 3TSZ A; 2O88 A; 2HBW A; 2J06 A; 3H0H A; 1SHF A; 2LCS A; 2ENM A; 2DA9 A; 2DF6 A; 1GCQ C; 1OPK A; 2C0I A; 3ZL7 C; 2CUB A; 1PHT A; 1Y0M A; 4X1V A; 4GLM A; 2KE9 A; 2J6F A; 2RF0 A; 4CC7 A; 4M4Z A; 3FJ5 A; 1HD3 A; 1VYT A; 2DM1 A; 4KRT A; 2CRE A; 2D1X A; 1NYF A; 1UHC A; 3H41 A; 2V1Q A; 2ROL A; 1N5Z A; 4AFZ C; 5I22 A; 2KRM A; 2YT6 A; 5FWB A; 1UGV A; 3VS5 A; 1M3C A; 1YWO A; 2K79 A; 1W1F A; 3U23 A; 4WCI A; 4AFS C; 3H0I A; 2L3Q A; 2EPD A; 3REA B; 3R6N A; 1NEG A; 2EGC A; 4F16 A; 1UE9 A; 1UG1 A; 2RMO A; 3SEM A; 1GRI A; 2NWM A; 1WFW A; 1ZUU A; 5GJV B; 1SHG A; 1T0H A; 2O2O A; 3M0R A; 2G6F X; 4ESR A; 2D8J A; 2W0Z A; 1K9A A; 2KYM A; 1OV3 A; 1WI7 A; 3I35 A; 4JJD A; 1JO8 A; 1X27 A; 2KRS A; 2CT4 A; 3M0S A; 4RTV A; 4A63 B; 2KGT A; 2BZX A; 1Z9Z A; 3THK A; 1OOT A; 4JZ3 A; 4CC3 A; 1FYN A; 1UJY A; 2LJ3 A; 2CT3 A; 2JW4 A; 1JXO A; 2BZY A; 2CDT A; 2YUO A; 3EHR A; 2LX7 A; 3CQT A; 4JZ4 A; 1E7O A; 3VS4 A; 2EYZ A; 2LZ6 B; 1I1J A; 2YUQ A; 4CC2 A; 3PE0 A; 2DE0 X; 2O31 A; 3O5Z A; 3TSW A; 1TUD A; 1KIK A; 2PZ1 A; 2F2W A; 2FPD A; 2BZ8 A; 1WYX A; 4RTY A; 2FEI A; 4HVU A; 2DL8 A; 4ZNX A; 1CKA A; 3RNJ A; 1QWE A; 2RPN A; 3VS0 A; 1X2Q A; 2LNH B; 1ZX6 A; 4AFQ C; 2L3S A; 3EG2 A; 1Z9Q A; 4LN2 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1KD1 C; 1VQ5 Q; 3EGU A; 4JPB W; 5GAN e; 3P8H A; 3PVQ A; 3P8B B; 2BUD A; 2JM8 A; 3CCM Q; 3HFN A; 2L5Q A; 3HPW A; 3A8H B; 1LCK A; 4OMP A; 4EMG A; 4BE2 A; 2QAZ A; 1QVF A; 2LP5 A; 4MZM A; 2QEX T; 4BI8 B; 2MCN A; 2DL7 A; 2KMT A; 4LUD A; 2O4X A; 2R58 A; 3C0C A; 5GAO r; 4HXJ A; 2R5A A; 2X51 A; 1VQ6 A; 3G6E Q; 4RTX A; 1YJ9 T; 1WXB A; 2VWF A; 1ZSZ B; 3VRZ A; 2A3L A; 3H9N A; 1FX7 A; 1N9S A; 1N8R R; 3ZBD A; 4FIB A; 2JS0 A; 2RHI A; 4PFP A; 1MV3 A; 1QVG S; 1Q82 C; 2CP3 A; 2D0N A; 2A7Y A; 2JJ9 A; 2EVR A; 2OJ2 A; 3VS7 A; 1RAD B; 2LQN A; 4B6M A; 2AT1 B; 4DQ2 A; 3EG0 A; 1ZQ1 A; 3HRT A; 5KCH A; 4IUR A; 1Q86 U; 1MNE A; 4RTW A; 2BE9 B; 4NL3 A; 4Q5W A; 2JTM A; 3RMS A; 1WXU A; 3OB9 A; 3CCS A; 3OYJ A; 3TU4 K; 5GJW B; 1VYV A; 2CZ6 B; 5FU6 C; 5GMK i; 2SRC A; 4IIM A; 2XU8 A; 1N8R C; 1X6B A; 3EFS A; 3RMQ A; 5J39 A; 3CD6 A; 2CP5 A; 1LNX A; 4JJC A; 4KUD K; 1MV0 B; 3OMC A; 4FU6 A; 3MJX A; 2C06 A; 1TS9 A; 3VU3 C; 2FPE A; 1M27 C; 1WZO A; 2RHY A; 3UDC A; 2KBT A; 2RQU A; 4LXC A; 5FRO A; 2OTL T; 1RAG B; 2K5L A; 4JRI A; 2QQB A; 3PVL A; 5LJ3 h; 1QP3 A; 3LX7 A; 1K9M R; 1VQL Q; 2AZS A; 5D6Y A; 1K1Z A; 4Y91 A; 2DKG A; 3DLM A; 2XIC A; 3BY7 A; 2J7I A; 3INZ A; 2FB7 A; 3OYA A; 3F70 A; 1I07 A; 2HEQ A; 4J9D A; 1VQM Q; 3PFS A; 4FW2 A; 4A4K A; 4XTU A; 3KXT A; 1GFC A; 2EQJ A; 2KR3 A; 1MND A; 4B9W A; 1ZBX A; 4KUL A; 5J26 A; 1PM3 A; 4RG2 A; 5C6S A; 2EJ9 A; 4XQ3 A; 2HQX A; 1N27 A; 1UJ0 A; 3LH0 A; 4JJB A; 2YLB A; 9ATC B; 3CME T; 5D7U A; 2ZAE A; 2FG0 A; 3M4G A; 3CBP A; 2DRM A; 3HKS A; 2QAS A; 3I56 T; 3OYG A; 1YIJ T; 1SRM A; 4IUU A; 1Y96 B; 3JB9 I; 1QKW A; 1D3B A; 2RN8 A; 2YSQ A; 2EFI A; 4EIK A; 1K4U S; 1AVZ C; 2RM4 A; 2OTJ T; 2ZZD A; 4OVA A; 3WXM B; 2HAX A; 5CQY A; 3CCV Q; 1I5L A; 4ZTJ A; 4EDU A; 3PMI A; 5GAM e; 2AZV A; 4ORZ A; 2CGH A; 4C92 A; 5GAO q; 4M77 C; 2XKO C; 4D8K A; 1KFZ A; 4RG8 A; 1NYG A; 4BDZ A; 1Q86 R; 2NLU A; 1CKB A; 2DL5 A; 2YUN A; 2E12 A; 2DMO A; 3M57 A; 1DJ7 B; 4F14 A; 2MMP A; 8ATC B; 2VXF A; 2JUF A; 1EX4 A; 1HXD A; 3KFV A; 2FHD A; 2EW3 A; 4M7A C; 3OYB A; 1NPP A; 1RAA B; 1BU1 A; 3FB9 A; 3OYY A; 4F7U E; 4OML A; 3CPW P; 4HVV A; 1YJN A; 1W4S A; 1XQH A; 2DER A; 3EG1 A; 1G2B A; 4D6W A; 5GAN d; 4ZN1 A; 2XID A; 3D7S B; 4E7I A; 1N6A A; 3V7R A; 5GAM j; 5GAN 2; 1Q86 C; 2ZPE B; 1QKX A; 3G71 A; 3Q1J A; 3CCR A; 1VIF A; 2DFU A; 2GQI A; 4RCB A; 4DA4 A; 1M1K U; 4BD3 A; 2EYW A; 2JVV A; 4JLI A; 5GAO n; 3JCM d; 4KGX B; 4PJO C; 2J6K A; 3MP6 A; 4K11 A; 1RAC B; 1C0M A; 5IT9 E; 1BI2 A; 4C92 C; 4PJL A; 3CPW A; 4J5Y A; 1M90 R; 1K0S A; 3PT9 A; 5CQX A; 3FRN A; 2JTE A; 4JS4 A; 1BI1 A; 5EC7 A; 3JRZ A; 2C0T A; 3CCE A; 3OYK A; 1U8R A; 1X01 A; 5EG2 A; 1MMG A; 4ZTF A; 4AMC A; 1LVK A; 2DZ9 A; 4M75 B; 3S6W A; 1KHC A; 2HKQ B; 3CCU A; 4AG2 C; 4DOV A; 1D0Z A; 1BKB A; 3A1P A; 2E41 A; 2IG0 A; 3EH2 A; 2QQ9 A; 3GPL A; 3MEW A; 4AG1 C; 1SG5 A; 2IPO B; 4ELY C; 5C0M A; 1O75 A; 2CH4 A; 1VQO Q; 5IHI A; 5HY6 A; 3LGL A; 3MEU A; 3S3N A; 2CP6 A; 1OQK A; 1U5S A; 2E70 A; 2VB6 A; 2ZPB B; 2HMA A; 5CCA A; 2X4X A; 5GAN 7; 4R55 A; 3M0Q A; 1YHQ T; 1IHW A; 3A98 A; 4F04 B; 2RI2 A; 2JN0 A; 3HRS A; 1YJW T; 3VUZ A; 1VQ5 A; 5J3B A; 3AHU A; 1TTH B; 3CCL T; 3EH1 A; 3CCM A; 3VJP A; 4XTW A; 4M78 B; 2C0O A; 1OU8 A; 4XU1 A; 2FO0 A; 3ER0 A; 4F7U G; 4M7D C; 1YBY A; 3EG3 A; 2L3R A; 3FEO A; 1RI0 A; 1Y57 A; 3JCM P; 2HBW A; 1UGR B; 1G3T A; 2ZPG B; 1IZ6 A; 3OYE A; 3ZL7 C; 1Y0M A; 2ZCF B; 4X1V A; 3G6E A; 4M77 B; 1HD3 A; 2DM1 A; 3H8Z A; 1W2B P; 3L2W A; 4A4H A; 1NYF A; 4F7U A; 2DIQ A; 1M4Z A; 2QA4 Q; 2QDY B; 4OB0 B; 2YT6 A; 3WVD B; 3CC4 Q; 1UGV A; 1VQ8 Q; 4KT0 E; 3I55 T; 1WHL A; 3V7S A; 4ME7 A; 4AFS C; 5GAN 4; 2KAF A; 2L3Q A; 4YTL A; 2EPD A; 2KY9 A; 4XTX A; 3REA B; 4EMH A; 4OP0 A; 4XU2 A; 2OX7 A; 4F16 A; 3MP8 A; 2RMO A; 3SEM A; 2YRC A; 3BE3 A; 1HK9 A; 3DB3 A; 2G6F X; 4NOY A; 2W0Z A; 1XNI A; 3CC2 Q; 4XU0 A; 1X27 A; 4RTV A; 4DBQ A; 5LJ5 d; 1W2B A; 2BZX A; 1M1K R; 4MZT A; 4JZ3 A; 3THK A; 1NPR A; 3GLX A; 1FYN A; 3RIR A; 2LJ3 A; 2CT3 A; 2JW4 A; 1JXO A; 2BZY A; 4C8Q C; 3LW5 E; 3EHR A; 2LX7 A; 5CKD A; 3M4Y A; 4JZ4 A; 3VS4 A; 4KGZ B; 5FU7 C; 1I1J A; 4QQD A; 4CC2 A; 2JTF A; 4PJO B; 5CVI A; 2H3J A; 3TSW A; 2M1H A; 1RAE B; 1S72 T; 1B34 B; 1WGS A; 3L2R A; 4KBM B; 2CYZ B; 3TEE A; 1YIT Q; 4HVU A; 4OGC A; 2M9U A; 1VQ4 T; 5GAM d; 3EG2 A; 3PNW C; 4VUB A; 1Q82 U; 1VQP T; 2LCC A; 2DEQ A; 1VQL A; 3G1J A; 3M56 A; 4J8O A; 3OA6 A; 2JT4 A; 1BK2 A; 4NL2 A; 3QWY A; 2DRK A; 1VQM A; 4PKC C; 1QVG P; 1VQ9 A; 2OAU A; 2M16 A; 2DTI A; 4J7F A; 4A4F A; 1GBR A; 4KH1 B; 1AWW A; 2JS2 A; 2CSI A; 3NPF A; 4IKF A; 1BIB A; 4PLL A; 1ABO A; 2YRD A; 2M0Y A; 2PVG B; 3SHW A; 5KE3 A; 1AWJ A; 2LCL A; 1TOV A; 4E2F B; 5GMK l; 3SD4 A; 1E6G A; 2IVW A; 3JCM W; 4BE0 A; 2RO0 A; 1MMD A; 1M8V A; 2WSF E; 3OYN A; 2R5M A; 1UFF A; 1H3H A; 3HTR A; 4JJN K; 5I21 A; 1VQ7 Q; 1VQN T; 1QVG A; 3JAM E; 5CKE A; 1I0C A; 2GNC A; 4HVW A; 3VS2 A; 3OYD A; 2KRO A; 1YCS B; 3VRY A; 5A0L A; 4OMF B; 4DBF A; 3CCV A; 1SKU B; 4WTO B; 2DL3 A; 2DYI A; 1UDL A; 2K3X A; 1MMN A; 1PRM C; 2DTO A; 2BKD N; 2GFA A; 4J9C A; 1TUC A; 2DEU A; 3GIB A; 4OMQ A; 2ABL A; 4M75 E; 4DEX A; 3NTI A; 2L0A A; 3SFM A; 2RQT A; 1KD1 R; 2LC4 A; 2KT1 A; 1ZA1 B; 5GAN 3; 2RJD A; 3I9Q A; 2DVJ A; 3NTK A; 2NUP B; 4J6X A; 1VQ6 T; 3LYI A; 2LJ0 A; 4CRI A; 3X24 B; 2VKN A; 3RUX A; 4QKU A; 2L89 A; 4JRK A; 2DL4 A; 2NUT A; 1PNJ A; 2H8H A; 4Y28 E; 4E47 A; 5KE2 A; 1VA7 A; 4N0A A; 2DTH A; 2RQW A; 2AKK A; 2XDP A; 2DXU A; 1KQ2 A; 5FU7 B; 6AT1 B; 1XTD A; 3E2U A; 1TXQ A; 2DXT A; 4J7I A; 4C0G A; 2K2M A; 3IQL A; 4QW2 A; 3LH5 A; 4D8D A; 1M3A A; 4M78 E; 2MAM A; 3TVT A; 5GAN g; 3TRE A; 4BE1 A; 1Q82 R; 4RTZ A; 3V8K A; 1QP2 A; 2YRV A; 2XMF A; 1G3Y A; 1KQS S; 3RDV A; 2FYK A; 3VS3 A; 3CCS T; 2VVK A; 1AZG B; 3JCM V; 3JCM e; 2SEM A; 3NHN A; 4M77 E; 3JCM g; 2HL3 A; 2CUD A; 5LJ3 f; 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