The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
MTFVALYDYEARTETDLSFKKGERLQIVNNTEGDWWLAHSLTTGRTGYIPSNYVAPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the Src tyrosine kinase SH3 domain S94A/Q128R mutant in complex with the high affinity synthetic peptide APP12
rcsb |
| molecule tags |
Protein binding, signaling protein
|
| source organism |
Gallus gallus
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| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
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| total genus |
13
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2014-11-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1NM7 A; 1J3T A; 2EVR A; 2K6D A; 2CSQ A; 2DL7 A; 1ZUU A; 1M8M A; 1WIE A; 1CKA A; 4RTU A; 3KFV A; 1AZG B; 1MV3 A; 4HVV A; 2GBQ A; 2LP5 A; 3I5S A; 3TSZ A; 2LCS A; 4J9B A; 2EYX A; 1Z9Z A; 3VS0 A; 2DBM A; 4CC7 A; 3UA6 A; 1GBQ A; 2KEA A; 3VS1 A; 1WDX A; 4K11 A; 2A37 A; 2X3X D; 2FEI A; 1M3A A; 1BU1 A; 1TUD A; 1WI7 A; 3QWY A; 3UAT A; 2SRC A; 1AEY A; 1X27 A; 2HEQ A; 4J9E A; 1GFC A; 1AWJ A; 2O9V A; 3EG2 A; 2G6F X; 1UG1 A; 2DLP A; 2FPD A; 1T3L A; 2DF6 A; 5IHI A; 3I5R A; 3EHQ A; 3U23 A; 1YCS B; 2BTT A; 3GBQ A; 1X6B A; 5FW9 A; 5I11 A; 1GL5 A; 1ZUK A; 2J6O A; 2PZ1 A; 1WXU A; 1NEG A; 2KR3 A; 4J9D A; 4E6R A; 1QLY A; 2C0I A; 1YP5 A; 2MOX A; 3QWX X; 1YWO A; 1UGV A; 2KYM A; 1B07 A; 2LQW A; 1ZUY A; 2B86 A; 1SRL A; 4HCK A; 2KNB B; 1VYT A; 2EGC A; 2D8J A; 1WFW A; 3NPF A; 2BZ8 A; 1V1C A; 4AG2 C; 3M0P A; 4D8K A; 2CUB A; 4ESR A; 1E6G A; 1S1N A; 1KJW A; 2L3P A; 2EGE A; 5FWC A; 2DA9 A; 1PKS A; 1JEG A; 1Y57 A; 2KRS A; 1SPK A; 3TVT A; 4JJB A; 2ROT A; 2JW4 A; 1ABQ A; 1AOJ A; 1SSH A; 1WYX A; 3C0C A; 1WXB A; 2CH4 A; 4LUE A; 1VA7 A; 2VWF A; 4HXJ A; 1JQQ A; 3PVQ A; 2AKL A; 1H8K A; 2K9G A; 1G83 A; 2CH4 W; 4J9C A; 2KRN A; 5IHK A; 1KSW A; 2SEM A; 2E5K A; 2JT4 A; 4DEX A; 2ROL A; 2LX7 A; 2HDA A; 1ARK A; 2F2W A; 2KT8 A; 1PHT A; 4OMP A; 2JS0 A; 2DL3 A; 2V1Q A; 4RTY A; 2M51 A; 1M30 A; 1BBZ A; 1SHF A; 1T3S A; 2FRW A; 1UJ0 A; 2KGT A; 2DL4 A; 2YUQ A; 3UA7 A; 1UEC A; 2O88 A; 1PRM C; 2KT1 A; 2AKK A; 2RN8 A; 3JV3 A; 1X43 A; 2J6F A; 2HCK A; 2X3W D; 1HD3 A; 2DMO A; 4AFU C; 4GLM A; 4OMO A; 1M27 C; 5HCK A; 3EG3 A; 3EG0 A; 4RTZ A; 4AG1 C; 5GJV B; 1SHG A; 5IHN A; 4OMQ A; 1W1F A; 2M0Y A; 2OJ2 A; 2FRY A; 1PRL C; 4F17 A; 1QCF A; 2LJ3 A; 1MUZ A; 2ED0 A; 1KFZ A; 1NYF A; 2GGR A; 3LH5 A; 1UTI A; 3SHW A; 1GCQ C; 1K4U S; 3EG1 A; 2NWM A; 2HSP A; 2AZS A; 3I9Q A; 2EQI A; 3IQL A; 1XOV A; 3H0F A; 4X1V A; 4Z88 A; 2BZX A; 3H0H A; 1PWT A; 1AWW A; 2KXD A; 1UHF A; 2CRE A; 2FPF A; 1FYN A; 2YDL A; 1WLP B; 1UDL A; 1I07 A; 1QKW A; 4AFZ C; 2KE9 A; 2MCN A; 4DEY A; 4F14 A; 3M0S A; 2RQV A; 3VS5 A; 3VS6 A; 4Y92 A; 3REA B; 2YT6 A; 2JMC A; 2LQN A; 5EC7 A; 2DM1 A; 2DRK A; 3RNJ A; 4GBQ A; 2D1X A; 1OEB A; 4AFQ C; 2L0A A; 5I22 A; 3EHR A; 3UF4 A; 4F16 A; 1X6G A; 1VYU A; 2ECZ A; 2DX1 A; 1AZE A; 2F2V A; 2GTJ A; 4D8D A; 2DL8 A; 3NMZ C; 2FO0 A; 2LMJ A; 3M0Q A; 2K7A A; 3TSW A; 1WX6 A; 4RTX A; 1OPL A; 2C0T A; 2JTE A; 2QDL A; 2JM8 A; 2PNI A; 2A08 A; 1SRM A; 3A98 A; 1CKB A; 2VVK A; 2RNA A; 2CT3 A; 1A0N B; 3FJ5 A; 3M0R A; 1GCP A; 2LZ6 B; 4JJD A; 4RTT A; 1UE9 A; 2F2X A; 2VKN A; 4JPB W; 2DL5 A; 4RTV A; 1H3H A; 2LJ1 A; 4IIM A; 5GJW B; 2K79 A; 2KBT A; 1ZBJ A; 1WA7 A; 1YNZ A; 1YN8 A; 3EGU A; 2YUP A; 1AVZ C; 1X69 A; 2JS2 A; 1GRI A; 5FWB A; 1Z9Q A; 1W70 A; 1T0J A; 2JM9 A; 2DIL A; 1GBR A; 2AZV A; 2FPE A; 2RMO A; 1ZX6 A; 1JU5 C; 4OMN A; 3VRZ A; 2LNH B; 1NLO C; 2CUD A; 1K9A A; 2BZY A; 4WCI A; 3VS2 A; 1LCK A; 4RUG A; 2W10 A; 2DRM A; 1RLQ C; 2MIO A; 2H8H A; 2O2O A; 2I0N A; 1HSQ A; 1ZSG A; 2DNU A; 1QKX A; 1AD5 A; 3O5Z A; 2EYZ A; 2GNC A; 3M0U A; 5L23 A; 4J9G A; 2EYY A; 1NLP C; 1K1Z A; 1B3Q A; 2DJQ A; 2A28 A; 1AWO A; 3H41 A; 1VYV A; 2O9S A; 2KRM A; 1BB9 A; 4LE9 A; 4LN2 A; 1FMK A; 4JJC A; 4R0K A; 2ESW A; 1JO8 A; 2EBP A; 1SEM A; 4KRT A; 3R6N A; 4QT7 A; 1RUW A; 3VS3 A; 4HVW A; 2ABL A; 4JZ3 A; 1MV0 B; 2O31 A; 2CT4 A; 2J7I A; 1H92 A; 4ZNX A; 2K3B A; 2JMA A; 1JXM A; 1BK2 A; 4EIK A; 4FSS A; 2RPN A; 1TG0 A; 4ORZ A; 1NG2 A; 2FG0 A; 2DYB A; 2RQW A; 1NYG A; 2L3S A; 2IIM A; 1I1J A; 2YUN A; 2L2P A; 4A63 B; 4HVU A; 2LJ0 A; 3ZL7 C; 3CQT A; 1M3C A; 3THK A; 2OI3 A; 2CDT A; 1K0S A; 2RF0 A; 1K0X A; 3NHN A; 4LNP A; 1OPK A; 3ULR B; 1UJY A; 2J05 A; 2ENM A; 5IXB A; 2ED1 A; 4LUD A; 2XMF A; 2EKH A; 1CSK A; 1UFF A; 3VS4 A; 2KXC A; 4Z89 A; 2P4R A; 1UUE A; 2L3Q A; 2HBW A; 4J9F A; 4OMM A; 1X2K A; 3REB B; 4AFS C; 1KIK A; 2EW3 A; 1W6X A; 4CC3 A; 2K2M A; 2NUZ A; 3RBB B; 2C0O A; 2YUO A; 1Y0M A; 4RTW A; 1QWE A; 1YWP A; 2DBK A; 1ABO A; 3PE0 A; 1RI9 A; 2KRO A; 3VRY A; 1N5Z A; 1TUC A; 2J6K A; 1GFD A; 1G2B A; 1U06 A; 1PKT A; 4J9I A; 2W0Z A; 4J9H A; 2EGA A; 2A36 A; 1U5S A; 4CC2 A; 2D8H A; 1I0C A; 1AWX A; 3PVL A; 1PNJ A; 1IO6 A; 3H0I A; 1QWF A; 1OOT A; 1GCQ A; 2YSQ A; 3NGP A; 2GTO A; 1UHC A; 1ZLM A; 2RQR A; 2PTK A; 2J06 A; 4JZ4 A; 3I35 A; 5ECA A; 3M0T A; 3SEM A; 1T0H A; 4M4Z A; 2EPD A; 2AK5 A; 5IXF A; 4OML A; 2RQU A; 2DE0 X; 2JXB A; 4CC4 B; 1RLP C; 1NEB A; 2CSI A; 2D0N A; 1K76 A; 3VS7 A; 1X2Q A; 2EYW A; 1WXT A; 1OV3 A; 2V1R A; 1HJD A; 2RQT A; 1E7O A; 2DVJ A; 1EFN A; 4Z8A A; 1E6H A; 1U3O A; 2OAW A; 2KYB A; 5IH2 A; 2GQI A; 1JXO A; 4IIO A; 1M3B A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5KCO A; 1G3T A; 1WIE A; 3S6W A; 3OYB A; 5IT9 E; 4BY6 C; 4ATO A; 2LP5 A; 2EYX A; 1FMW A; 2RD1 A; 2DBM A; 3RMS A; 5J3B A; 1N27 A; 1WDX A; 4K11 A; 2NUT B; 2YXY A; 4OB1 B; 1M3A A; 1TUD A; 5LJ3 g; 5GAO l; 2XK0 A; 3QWY A; 2BE7 D; 2SRC A; 1VQ9 Q; 1AWJ A; 2O9V A; 1PCX A; 4E7J A; 1Q81 C; 2G6F X; 1UG1 A; 1QQJ A; 2DLP A; 4R55 A; 1T3L A; 3L2W A; 1YIJ T; 4M7A E; 2E6N A; 2CKK A; 4JS4 A; 1QVF A; 3EG9 B; 2PZ1 A; 1WXU A; 1NEG A; 4J9D A; 1VQM A; 3H6Z A; 4ZTJ A; 3GPL A; 3QWX X; 5FU6 B; 1H64 1; 2CP7 A; 2DYI A; 5GAN d; 5AT1 B; 3RKW A; 1I5L A; 2AHJ B; 3GIB A; 3FLG A; 4O6J A; 2VGM A; 3JCM Q; 5KCH A; 2L3P A; 4M75 E; 5C0M A; 1YHQ Q; 2DA9 A; 5HK0 A; 2KDS A; 2KRS A; 1NJI R; 1KK7 A; 2E4H A; 1K9M U; 1WJR A; 2JW4 A; 4BDZ A; 1RAC B; 4MZT A; 3G6E Q; 1WYX A; 1WXB A; 4N0A C; 3JCM d; 3CXC A; 4OB2 B; 1M1K C; 2VWF A; 1ZSZ A; 3PVQ A; 1H8K A; 1G83 A; 2V8I A; 4PJL A; 4J9C A; 2KRN A; 1VQM T; 5J39 A; 4DEX A; 2LX7 A; 3OYL A; 3HTR A; 1ARK A; 2K5I A; 2JTF A; 2X4W A; 2KT8 A; 1BIA A; 2VXE A; 3OMC A; 3M55 A; 5CCA A; 4IUQ A; 4B9X A; 4RTY A; 2CS7 A; 2V26 A; 3I55 A; 4ZGD B; 1UEC A; 3JCM c; 2O88 A; 2M0O A; 2AKK A; 1RAF B; 4A4F A; 1RAD B; 3VUZ A; 2RN8 A; 1X6O A; 3JV3 A; 4DBR A; 1HD3 A; 5DLO A; 2IPO B; 4AFU C; 5HCK A; 3NFC A; 4JRP A; 4M7A A; 3EG0 A; 3WVE B; 2RHY A; 5CIU A; 2F5K A; 5IHN A; 2DET A; 4OMQ A; 3QZ5 B; 2LDM A; 3CCE T; 2AIR B; 2NLU A; 4F17 A; 1MUZ A; 3CCJ Q; 3GP8 A; 1Q86 R; 2EYQ A; 2EQI A; 3H0F A; 3GF5 A; 4X1V A; 3CD6 T; 3H0H A; 2EKO A; 3TCJ A; 3RMQ A; 2FPF A; 3GNG A; 1PM3 A; 4RCB A; 3M9Q A; 1UDL A; 4M75 A; 1QKW A; 1BI3 A; 3LGF A; 2DTO A; 4PLI A; 3BY7 A; 4C8Q E; 1KD1 C; 5I2M A; 4Z02 A; 3M0S A; 1VIF A; 2RQV A; 4Y92 A; 4BE2 A; 3RER A; 1KQ2 A; 1N8R C; 3I56 T; 5KYU B; 5LJ5 f; 3M54 A; 4QQ6 A; 1OEB A; 3L2Q A; 1OX8 A; 1WHH A; 3EHR A; 2EQU A; 5I22 A; 2R58 A; 3VU3 C; 3ZFJ A; 2BKD N; 6AT1 B; 2DX1 A; 5KYY B; 2CZ6 B; 3OY9 A; 1DJ7 B; 3NMZ C; 2LMJ A; 2Z0W A; 2ZPI B; 1OPL A; 1OU9 A; 3M53 A; 4JRI A; 2JTE A; 2DD4 A; 3RKY A; 3X20 B; 2A08 A; 1SRM A; 5A0G A; 3A98 A; 4LDW A; 2YHT A; 4QVC A; 3EFO A; 3VV0 A; 4C0Z A; 1TU0 B; 3RUX A; 2KAF A; 1M1G A; 4JJD A; 4Y91 A; 2PUK B; 1KC8 C; 4EMG A; 2VKN A; 2QK0 A; 1UEB A; 2DL5 A; 2HSE B; 4FT4 A; 4IIM A; 2XKO C; 5GJW B; 3CCL A; 2Y90 A; 2ZGW A; 1LJO A; 2WAC A; 3CC2 Q; 1UGQ B; 2MWP A; 4RMO A; 1YN8 A; 5FRN A; 2PVO B; 2YUP A; 1AVZ C; 1NBE B; 5DLQ E; 4QQG A; 5GAN e; 2AZV A; 5LJ3 j; 2QEX Q; 1IRX A; 2FB7 A; 2RMO A; 4XTU A; 5CO7 A; 3LGL A; 5GAN 8; 2A0F B; 2MWO A; 4N4G A; 4M7D F; 1NLO C; 1TSF A; 2ZPE B; 2CYZ B; 4M77 C; 4LDV A; 5KYW B; 2HNI A; 4JLI A; 4RUG A; 2R5A A; 4M78 F; 1RLQ C; 1VQ5 T; 2DER A; 5DY9 A; 1QVG A; 2O2O A; 3CCR A; 4XAX B; 1JJ2 A; 3O5Z A; 5CKB A; 1Y96 A; 3G4S Q; 4C8Q A; 3L2V A; 1NLP C; 5GMK m; 2LC4 A; 5GAN 6; 3QKJ A; 1NJI U; 3CCV A; 1B3Q A; 2DJQ A; 1NPR A; 1U8R A; 3OSS C; 3QYH B; 4PK4 A; 2QYZ A; 3CXC P; 1KQS A; 4XTW A; 2R57 A; 1P92 A; 4ELZ C; 5CKF A; 2EIF A; 2CP0 A; 2EBP A; 3PTA A; 3R6N A; 4ME7 A; 3MCA B; 3PIP A; 3UT1 A; 2K57 A; 4JZ3 A; 2O31 A; 1PD1 A; 2J7I A; 1H92 A; 1QCN A; 2ZPB B; 2COW A; 3CME T; 2E65 A; 1B34 B; 2YLB A; 3QJ6 A; 1VQ6 Q; 2FG0 A; 2LNV A; 2F69 A; 3INZ A; 2IIM A; 2E5Q A; 2LJ0 A; 5GAN 4; 4AMC A; 2GFA A; 4F04 B; 3CQT A; 3OYM A; 2OI3 A; 1D0X A; 2OTJ A; 4RG2 A; 1K0S A; 2RF0 A; 3NHN A; 3CCU T; 1VQ7 T; 3ULR B; 2DO3 A; 2OX7 A; 2CP3 A; 4ELY C; 4A4H A; 3FRN A; 5IXB A; 1WHJ A; 1CSK A; 2NUT A; 1UFF A; 2MPX C; 2RI3 A; 2QA4 T; 3D7S B; 1Q86 U; 4DA4 A; 1M90 U; 2L3Q A; 2HBW A; 5CKH A; 3REB B; 1OU8 A; 5GAO n; 2EW3 A; 5GAN 7; 1W6X A; 2K2M A; 3CCS T; 3EG9 A; 4MDW A; 5LJ3 h; 4BI8 B; 3RBB B; 2LT4 A; 3C4S A; 1O75 A; 4RTW A; 2HD0 A; 2OTJ T; 1QWE A; 1YWP A; 3QO3 A; 4PJO F; 2OTL Q; 5LJ3 e; 1YJ9 Q; 3CCM A; 1TUC A; 4BAC A; 4J9H A; 2P0Q A; 1ZBX A; 3OS0 A; 1VQL Q; 1AWX A; 3V7R A; 1MMA A; 4F7U F; 1GCQ A; 4ANJ A; 3SD4 A; 3UPU A; 3RR6 A; 3JCM f; 5HKC A; 3FIF A; 4XU3 A; 2E3H A; 1G3W A; 1MMD A; 1R0B G; 4KGZ B; 1TWB A; 5CR2 A; 2EPD A; 3H9N A; 3QDF A; 4HA8 A; 2VXF A; 4FM4 B; 2NUP B; 5IAY A; 1NEB A; 1FX7 A; 2D0N A; 1JBM A; 3VS7 A; 4FYW B; 1WXT A; 2MAM A; 2LQK A; 1HJD A; 2HKN A; 4EMH A; 2CP2 A; 2G3R A; 1Y07 A; 2QGF B; 2JZ2 A; 3O8V A; 1FXX A; 1S72 A; 2GQI A; 1N6A A; 4E47 A; 1NM7 A; 2EVR A; 1Q7Y C; 2QQA A; 2FZG B; 3OYI A; 1ZUU A; 1CKA A; 4RTU A; 5GAN 3; 1MV3 A; 4JLG A; 1VQK Q; 1VQ8 A; 2LCS A; 2MYS A; 4KT0 E; 3E9F A; 4CC7 A; 2E41 A; 4KUD K; 2FEI A; 2RM4 A; 1WI7 A; 1JJ2 P; 1K73 U; 1AEY A; 1LNX A; 4Y28 E; 4J9E A; 2MMP A; 2H3J A; 3DKM A; 2FPD A; 3I5R A; 2KQW A; 4QVD A; 2BTT A; 2H3E B; 5I11 A; 1ZUK A; 2J6O A; 4BB7 A; 4E6R A; 2KR3 A; 2JJ9 A; 5CK9 A; 3A5Z B; 1M4Z A; 2KYM A; 3KUF A; 1VQ8 T; 1QW1 A; 3ZBD A; 1SSF A; 1VYT A; 1YJW A; 2QDY B; 2D8J A; 2XID A; 1OZ3 A; 3CEY A; 3NPF A; 1V1C A; 4AG2 C; 3M0P A; 4D8K A; 5KYY A; 5LJ5 j; 4ESR A; 1E6G A; 1M1K R; 4BD3 A; 1WHK A; 2ZPH B; 5M9O A; 3L2Z A; 1JEG A; 3BW1 A; 1M2V B; 1SPK A; 3TVT A; 2ZPG B; 4GLK A; 4JRK A; 3PGG A; 1B7T A; 1QVF S; 1D09 B; 3DB4 A; 5GAO m; 1AOJ A; 3C0C A; 1QP2 A; 4LUE A; 1VQ4 A; 3CMA T; 4HXJ A; 4E7S A; 1Y96 B; 2AKL A; 2K9G A; 4ZGJ B; 4M7D G; 4BI3 A; 1BIB A; 1PSF A; 4A54 A; 1KSW A; 2LX9 A; 3OA6 A; 3L42 A; 2SEM A; 3FJP A; 1VQO Q; 2HDA A; 4M78 G; 4C92 C; 2K4Y A; 3M59 A; 2WSC E; 3CC7 Q; 3HRT A; 4HCC A; 4MMK A; 2V1Q A; 1ACM B; 4XU2 A; 1M30 A; 1SHF A; 2FRW A; 2DAQ A; 1UJ0 A; 2YUQ A; 1XTD A; 3UA7 A; 3CXC S; 2EAY A; 4XTZ A; 7AT1 B; 1YIJ A; 2DXU A; 2J6F A; 2HCK A; 4C0D B; 2LVM A; 1C1A A; 2XDD A; 1VQ4 T; 3X25 B; 1U1T A; 1YIT T; 4RG8 A; 2LCL A; 5GJV B; 1SHG A; 4AG1 C; 3A8H B; 1VQP A; 3QDR B; 2OJ2 A; 2M1H A; 2ED0 A; 2LJ3 A; 3LH5 A; 2ZZD A; 1BI2 A; 5GAO r; 3UWN A; 3SHW A; 1YI2 Q; 4FIB A; 3FEO A; 2NWM A; 1KD1 R; 4M7D D; 1RAI B; 1XOV A; 3DLM A; 2E10 A; 3J81 E; 1UGR B; 1N8R R; 4M7D B; 1PWT A; 3EH2 A; 3G7Z A; 2KXD A; 2CRE A; 3EH1 A; 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