The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
16
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sequence length |
61
|
structure length |
61
|
Chain Sequence |
GSHMTFVALYDYESRTETDLSFKKGERLQIVNNTEGDWWLAHSLTTGQTGYIPSNYVAPSD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
|
| publication title |
Crystal structure of the c-Src-SH3 domain in complex with the high affinity peptide VSL12
rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
16
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| structure length |
61
|
| sequence length |
61
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2014-11-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2C0I A; 2J05 A; 1X27 A; 2KXD A; 5L23 A; 1GBR A; 1YCS B; 4GBQ A; 1UHC A; 2RN8 A; 2GGR A; 4AFS C; 1WYX A; 2ECZ A; 2K79 A; 1GCP A; 1VA7 A; 1QWF A; 4X1V A; 2AK5 A; 2KBT A; 1Y57 A; 1A0N B; 1ZUY A; 2DL8 A; 5IXF A; 1WI7 A; 1NG2 A; 2CH4 A; 3RBB B; 1X6G A; 4HVU A; 5IHK A; 2A37 A; 5ECA A; 5I11 A; 1WXU A; 1HJD A; 2C0T A; 1KJW A; 1BBZ A; 1SPK A; 2EW3 A; 2XMF A; 2SRC A; 1Y0M A; 1M30 A; 1YN8 A; 2RNA A; 1UJ0 A; 3QWY A; 1QKX A; 3NGP A; 2HEQ A; 2GTJ A; 3REB B; 3EG3 A; 1MUZ A; 1OOT A; 1W1F A; 4OMP A; 2KXC A; 3R6N A; 2EGA A; 1X43 A; 2ED0 A; 2JMA A; 1TUD A; 4HVW A; 1PRM C; 2RF0 A; 1K0S A; 3VS5 A; 2K6D A; 1OEB A; 3EG2 A; 3EG0 A; 1M3B A; 4RTU A; 2KE9 A; 2FEI A; 2L3S A; 2CT3 A; 3QWX X; 1K76 A; 2ROT A; 4F16 A; 2O2O A; 2P4R A; 1WX6 A; 4HVV A; 2CH4 W; 3H0F A; 4Z88 A; 2LP5 A; 1VYV A; 2CRE A; 2YUP A; 2LX7 A; 1M3C A; 3PE0 A; 1X2Q A; 3ZL7 C; 1E6H A; 2L3Q A; 2JS2 A; 4J9E A; 3C0C A; 4CC4 B; 2GBQ A; 4QT7 A; 2KGT A; 2PTK A; 3SHW A; 2EBP A; 1RI9 A; 2DJQ A; 3EGU A; 2MOX A; 2FRW A; 2DM1 A; 2OAW A; 3M0P A; 3NMZ C; 1UHF A; 2CDT A; 1UEC A; 1Z9Q A; 1CKA A; 1U5S A; 4JZ3 A; 2DA9 A; 1H92 A; 2KYM A; 2EGE A; 1KSW A; 2DL7 A; 2KYB A; 3VS1 A; 1ZX6 A; 2DL3 A; 3TVT A; 2GNC A; 4D8D A; 2I0N A; 1QLY A; 3VS3 A; 1GFC A; 1RLP C; 2DVJ A; 2F2X A; 2AKK A; 1AWW A; 3I35 A; 2J7I A; 1G83 A; 5GJV B; 2VVK A; 1ABO A; 1K9A A; 1JEG A; 2K2M A; 2NUZ A; 1I07 A; 2LQN A; 1ZUK A; 4OMN A; 2DRK A; 4AFQ C; 1B07 A; 1ABQ A; 3VRY A; 1QCF A; 3U23 A; 2CUD A; 1PRL C; 4RTW A; 1VYT A; 3EG1 A; 4RTX A; 3EHR A; 1NEB A; 4Z89 A; 2H8H A; 2KT8 A; 4J9C A; 2O9V A; 1CKB A; 3UA7 A; 2CUB A; 2JW4 A; 2J6O A; 3UA6 A; 5IXB A; 1K4U S; 2J6F A; 1CSK A; 1YP5 A; 4OMQ A; 4HXJ A; 2KRM A; 2KEA A; 2VWF A; 4OML A; 1KIK A; 1M27 C; 3M0R A; 5FW9 A; 1N5Z A; 3EHQ A; 4LN2 A; 2LJ0 A; 2JXB A; 4Y92 A; 1GCQ A; 4A63 B; 2KR3 A; 4EIK A; 1W6X A; 2BTT A; 2EYY A; 2O9S A; 2A36 A; 1B3Q A; 3M0U A; 2MCN A; 2DF6 A; 2LJ1 A; 2FPF A; 4KRT A; 2SEM A; 1WXT A; 4IIM A; 2EQI A; 4ZNX A; 2D8J A; 4AFZ C; 4LUE A; 1UFF A; 1MV3 A; 1HD3 A; 1ZBJ A; 2FRY A; 5FWC A; 1WA7 A; 1K0X A; 4IIO A; 1H8K A; 1SSH A; 2DBM A; 1YNZ A; 4OMM A; 2YUO A; 1X69 A; 1KFZ A; 2J06 A; 1SRM A; 2K7A A; 2ABL A; 3VS0 A; 2M0Y A; 3REA B; 1RUW A; 2KT1 A; 2VKN A; 2EPD A; 1W70 A; 5EC7 A; 4LE9 A; 1UUE A; 1JU5 C; 2YDL A; 1UDL A; 1VYU A; 4FSS A; 1XOV A; 5IHI A; 2EVR A; 1WIE A; 4K11 A; 3TSW A; 1IO6 A; 3UF4 A; 1AZG B; 2V1R A; 1JQQ A; 1EFN A; 1K1Z A; 2LJ3 A; 2LCS A; 4RUG A; 4J9H A; 1TG0 A; 4CC3 A; 1WLP B; 2HSP A; 1WFW A; 3H41 A; 2L0A A; 1YWO A; 1UGV A; 1SEM A; 1NM7 A; 3PVQ A; 1E6G A; 4F14 A; 2DBK A; 2GTO A; 4R0K A; 1T0H A; 3H0I A; 4RTZ A; 4ORZ A; 1T3S A; 1GFD A; 1NLP C; 2YUN A; 2W0Z A; 1WDX A; 1AVZ C; 2OJ2 A; 3A98 A; 1ZSG A; 2DYB A; 2JMC A; 2ESW A; 2O31 A; 4J9F A; 2QDL A; 4RTY A; 4DEX A; 1NYG A; 1OV3 A; 2MIO A; 1AZE A; 1JO8 A; 3ULR B; 1ZUU A; 1GCQ C; 1QKW A; 4JZ4 A; 2JM8 A; 1S1N A; 1PKS A; 2L2P A; 3H0H A; 1AOJ A; 2PZ1 A; 2RPN A; 2OI3 A; 2D8H A; 1T3L A; 3FJ5 A; 3NHN A; 2ED1 A; 2X3X D; 3THK A; 2DMO A; 1TUC A; 2GQI A; 1I1J A; 4DEY A; 3VS2 A; 2HDA A; 2AKL A; 1X2K A; 2AZV A; 1AD5 A; 3VS6 A; 3M0S A; 3TSZ A; 4M4Z A; 2KRS A; 3CQT A; 3UAT A; 4HCK A; 2EYZ A; 1NYF A; 2F2V A; 4CC2 A; 1PHT A; 4J9G A; 1BB9 A; 3I9Q A; 1ZLM A; 2HBW A; 2DNU A; 1RLQ C; 2FPD A; 1QWE A; 1PWT A; 1G2B A; 2G6F X; 2NWM A; 2KNB B; 5I22 A; 1V1C A; 1Z9Z A; 1U06 A; 4AFU C; 1SHF A; 4CC7 A; 1M3A A; 2FPE A; 2FO0 A; 4JJB A; 1AWO A; 2RQT A; 2RQV A; 2RMO A; 2RQW A; 4Z8A A; 1UJY A; 1GRI A; 4AG1 C; 2AZS A; 1MV0 B; 2CSI A; 4WCI A; 2A28 A; 3M0T A; 1I0C A; 3LH5 A; 1FYN A; 2DIL A; 2K9G A; 2V1Q A; 3I5S A; 5GJW B; 5IH2 A; 2F2W A; 3NPF A; 1U3O A; 2W10 A; 2O88 A; 2HCK A; 1T0J A; 1HSQ A; 2ROL A; 4E6R A; 2YT6 A; 3PVL A; 1AWJ A; 4LUD A; 2CSQ A; 5HCK A; 2J6K A; 3M0Q A; 1NEG A; 1E7O A; 4RTT A; 2D0N A; 4F17 A; 1BK2 A; 2IIM A; 2EKH A; 2LNH B; 2DX1 A; 2PNI A; 3VS4 A; 1BU1 A; 2CT4 A; 2DE0 X; 2DL4 A; 2ENM A; 1PNJ A; 1SRL A; 1UG1 A; 1NLO C; 2K3B A; 2BZY A; 4LNP A; 2L3P A; 4J9D A; 1AEY A; 5IHN A; 2LQW A; 1UE9 A; 1FMK A; 1YWP A; 2BZ8 A; 4AG2 C; 3KFV A; 2C0O A; 2KRO A; 3IQL A; 2DL5 A; 2EGC A; 2JTE A; 1SHG A; 2FG0 A; 2A08 A; 2JT4 A; 4JPB W; 2EYX A; 1ARK A; 2YUQ A; 1PKT A; 3I5R A; 3O5Z A; 4J9B A; 2JM9 A; 1M8M A; 2RQR A; 2KRN A; 3SEM A; 2X3W D; 2BZX A; 1H3H A; 4D8K A; 3JV3 A; 3GBQ A; 1J3T A; 2YSQ A; 4JJD A; 2LMJ A; 1WXB A; 1OPK A; 1OPL A; 4OMO A; 2LZ6 B; 5FWB A; 1X6B A; 2EYW A; 1GBQ A; 1JXO A; 2DLP A; 2D1X A; 1JXM A; 2E5K A; 2RQU A; 4JJC A; 3VRZ A; 4J9I A; 4RTV A; 1UTI A; 2DRM A; 3RNJ A; 2M51 A; 3VS7 A; 4ESR A; 4GLM A; 1LCK A; 2B86 A; 1GL5 A; 1AWX A; 2JS0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2RHZ A; 3JAM E; 3CCR T; 1OQK A; 1TOV A; 3URG A; 4C8Q B; 1WHH A; 4N4G A; 5L23 A; 4FU6 A; 5LJ3 d; 4QQ6 A; 4PJO F; 3M9Q A; 2CP0 A; 5CKE A; 4X1V A; 4BE1 A; 1VQN A; 2HL5 C; 4M7A D; 1QCN A; 4RKU E; 3UWN A; 1RAF B; 1K8A U; 1SF9 A; 1WI7 A; 1FMW A; 3RMQ A; 1X6G A; 1Q86 C; 2LTO A; 4HVU A; 3V7S A; 1VQ8 A; 4ZGJ B; 2YHT A; 2RHI A; 4M7D E; 3EGD B; 2QEX Q; 5I11 A; 1WXU A; 5GAN h; 4C92 E; 1KJW A; 1U1T A; 4M77 B; 4XTZ A; 1YIT T; 2L5Q A; 1YN8 A; 4NL3 A; 2OTJ Q; 1UJ0 A; 4MML A; 5DLO A; 2HEQ A; 3REB B; 1MUZ A; 1W1F A; 3J80 E; 1VQ4 A; 5KYW B; 3OYJ A; 1BIA A; 2Y90 A; 4HVW A; 2R5A A; 4OB3 B; 3EG2 A; 2RJD A; 4M7A A; 3EGX B; 3X20 B; 2XD0 A; 2ROT A; 2P4R A; 3FRN A; 1QVG S; 3FJP A; 5CQX A; 1U1S A; 2LX7 A; 3PE0 A; 4XU3 A; 4X9C A; 3MCA B; 2L3Q A; 5GAN f; 2NUP B; 5DLQ E; 3CXC P; 2GBQ A; 2PTK A; 3TEE A; 3CMA A; 1JJ2 A; 5HK3 A; 3JCM g; 1Q86 U; 3NMZ C; 5D6X A; 3LWH A; 1UHF A; 1H92 A; 2XK0 A; 2WSC E; 3NTH A; 3CC4 A; 2KYB A; 2DXC A; 4JLG A; 1ZX6 A; 3HPW A; 3TVT A; 3I55 A; 1ZBX A; 3CPW A; 1QLY A; 5GAN 8; 5FRM A; 1VQP T; 3QHS A; 4F7U E; 1RLP C; 1QVF A; 1IHW A; 2Y4X A; 3MEA A; 2AKK A; 4ATO A; 1G83 A; 3FB9 A; 3O8V A; 1HXD A; 3OYH A; 4OMN A; 4XAX B; 3U23 A; 3P8H A; 4DBR A; 1M1K C; 3PTA A; 2DPP B; 4C8Q C; 4RTX A; 1KC8 U; 2LT1 A; 1WJR A; 1VQN Q; 2JJ9 A; 4FM4 B; 1WHJ A; 2KT8 A; 1Q81 U; 4DA4 A; 2CUB A; 1CSK A; 4HXJ A; 4A4K A; 1VQ8 Q; 2KRM A; 4J5Y A; 3M58 A; 1WJQ A; 1WZO A; 2DD5 A; 1M27 C; 3EHQ A; 4XU2 A; 4LN2 A; 4E7S A; 3CCV A; 2VB6 A; 1GCQ A; 2M02 A; 2BTT A; 2O9S A; 4A54 A; 1W2B A; 3G1J A; 2RB6 A; 3GF5 A; 2CYZ B; 1PD0 A; 3MP1 A; 3LW5 E; 5LL6 S; 2EQI A; 1D3B A; 5GAN 4; 3OQ5 A; 4BAC A; 1VQ4 Q; 1K8A R; 1H8K A; 3FEO A; 1SSH A; 4P5N A; 3F70 A; 1WHG A; 2DBM A; 1YNZ A; 4BE2 A; 3MEW A; 4M7D D; 2YUO A; 1X69 A; 1R0C B; 2X4J A; 2J06 A; 2GFA A; 1Q82 U; 3A8M B; 4PL6 A; 4PJO E; 5KYX A; 5LJ5 d; 3QJY A; 3OB9 A; 2VKN A; 1UUE A; 1VIF A; 1JU5 C; 3CD6 A; 2YDL A; 2CZ0 B; 3CMA Q; 1XOV A; 2E3I A; 1JJ2 P; 3CXC S; 1IO6 A; 1EZZ B; 2V1R A; 3CCL T; 1K1Z A; 3CC2 Q; 1P92 A; 4A4G A; 1F1B B; 4RUG A; 5D6W A; 4CC3 A; 1WLP B; 2VGN A; 3DB4 A; 2HD0 A; 4RCC A; 1WFW A; 1YFN A; 3H41 A; 3PMT A; 2XG8 D; 2PVO B; 5FU7 B; 5GAO m; 4M7A F; 1NM7 A; 1ZSZ B; 1MMD A; 2ZPG B; 2JVV A; 2GTO A; 2R58 A; 1JB0 E; 1YJW A; 4M7D A; 4R0K A; 1T0H A; 4C92 A; 1LOJ A; 2NYS A; 1GFD A; 2LVM A; 4ELZ C; 3PMI A; 2DYB A; 2O31 A; 2ESW A; 3OYG A; 5GAM h; 1NYG A; 2MIO A; 4QW2 A; 2JM8 A; 1Q86 R; 1PKS A; 2LQK A; 2WAC A; 1D1C A; 2OI3 A; 4F04 B; 2X3X D; 4BUG A; 3OS5 A; 1B34 A; 2OTL A; 3CME T; 1I1J A; 3VS2 A; 1X2K A; 3OMC A; 4RCB A; 3VS6 A; 2LDM A; 2YWW A; 2KRS A; 2HAX A; 2YRV A; 1FMV A; 4HCK A; 2F2V A; 1QQJ A; 3CCV Q; 4J9G A; 1C0M A; 1BB9 A; 3CCR A; 5IAY A; 2HBW A; 5GAM f; 5LJ3 g; 4FT2 A; 4N4I A; 1W2B P; 3TQ7 P; 1PWT A; 5CKH A; 2RH2 A; 1VUB A; 5KCO A; 4FYV B; 1Z9Z A; 1M9S A; 3A8H B; 1M3A A; 4IUT A; 1AWO A; 2XI9 A; 4JJB A; 2RQT A; 4FIB A; 2GCX A; 3CCJ A; 2EWN A; 2HQE A; 2RMO A; 2ZCF B; 2RQW A; 4F7U A; 4FYW B; 2AZS A; 2CSI A; 1MGQ A; 2NLU A; 1QCO A; 2DEQ A; 3M0T A; 4EDU A; 1I0C A; 2CP3 A; 4OF1 A; 2K9G A; 3MET A; 2V1Q A; 3OYN A; 2VYT A; 5IH2 A; 4NL2 A; 3G4S T; 1EIF A; 2BE7 D; 4BI4 A; 4E7J A; 4M78 C; 2WSE E; 2DYI A; 2YT6 A; 4C0D C; 4EMH A; 2MI6 A; 5HCK A; 3M0Q A; 1NE8 A; 5LJ3 j; 4C0Z A; 3G71 T; 3EFS A; 2D0N A; 3RR6 A; 1VQ7 T; 4F17 A; 3DLL A; 1M2V B; 1BK2 A; 5GMK e; 1KHC A; 2IIM A; 3LH0 A; 2RHU A; 3VS4 A; 2DX1 A; 4M7D G; 4PJO D; 4ZGD B; 3SWN A; 3CCS T; 2EFI A; 2ENM A; 4C92 G; 1VQ9 T; 1SRL A; 3M4Y A; 1UG1 A; 3HTR A; 2X4X A; 2L3P A; 2KY9 A; 4J9D A; 4E7L A; 1M1K R; 2KSS A; 3JCM d; 1MMG A; 1YJW Q; 5CIU A; 2XDD A; 5GAM e; 1YWP A; 2P0P A; 3DLM A; 4BB7 A; 3OYK A; 3M54 A; 1NPR A; 1SHG A; 1TTH B; 2GF7 A; 2RI3 A; 4AT1 B; 1S72 T; 4DBQ A; 4KGZ B; 3OS0 A; 1PKT A; 4J9B A; 1PSE A; 2JM9 A; 2O01 E; 2RQR A; 5GMK m; 1H3H A; 2AT1 B; 1J3T A; 2OTL Q; 5GAO r; 4OMO A; 3OYD A; 2LZ6 B; 2EYW A; 4FT4 A; 3LGL A; 4JUV A; 2P4T A; 3TU4 K; 4PJO A; 4D6W A; 4L59 A; 1M1F A; 3RNJ A; 4FYY B; 5GAN 5; 2RK2 A; 1I81 A; 4GLM A; 2LCL A; 2B86 A; 1AWX A; 3V8L A; 3CCR Q; 3QZ9 B; 2OX7 A; 3M4G A; 1X27 A; 4F7U G; 4PJL A; 4BY6 B; 4E7I A; 2L89 A; 2RN8 A; 1YJ9 T; 1BCO A; 3OA6 A; 3CCJ Q; 1GCP A; 1VA7 A; 1OZ2 A; 1X6O A; 1QWF A; 2AK5 A; 2DTH A; 4BDZ A; 3GP8 A; 3JCM V; 2QK0 A; 2LCC A; 2RJC A; 2RK1 A; 1NG2 A; 2RI5 A; 2CH4 A; 3RBB B; 4M7A B; 2DFU A; 2ZPB B; 3ZBD A; 5A0D A; 2B8A A; 3HSB A; 3ZEH A; 3DKM A; 2EKO A; 4PJJ A; 3L2V A; 2C0T A; 4MZM A; 5GAN d; 1YIT Q; 1SPK A; 1V29 B; 2XMF A; 2E4H A; 1Y0M A; 3H9N A; 2RNA A; 2KI7 A; 2MPX C; 1UGQ B; 2KDS A; 3RKY A; 1OOT A; 2RJE A; 2KXC A; 2OTJ A; 2K5I A; 1Y96 A; 5LJ5 g; 1PRM C; 2RF0 A; 3VS5 A; 3X25 B; 3LGF A; 3QWX X; 4F16 A; 1WX6 A; 3CCM A; 3OSV A; 3RES A; 3OW2 P; 1VQ5 T; 3KBG A; 2LP5 A; 2CRE A; 1PD1 A; 2YUP A; 1M3C A; 1D0Z A; 3HRT A; 2QXF A; 4QT7 A; 2D6F A; 2JTM A; 2E1H A; 3CCL A; 1VQK T; 4PJO G; 2OAW A; 1D1B A; 1UEC A; 4FCY A; 3OS1 A; 1CKA A; 2DA9 A; 3QKJ A; 4HT9 A; 2EGE A; 1KSW A; 3PIP A; 4IUQ A; 4E7Z A; 5GAO q; 4R56 A; 1VQP Q; 2GNC A; 2E3H A; 4ANJ A; 3JB9 D; 2MMP A; 2VC8 A; 3VS3 A; 2F2X A; 1BI0 A; 1N9R A; 5LJ5 j; 2J7I A; 2VVK A; 2NUZ A; 3D7S B; 2LQN A; 1ZUK A; 4X34 A; 2DRK A; 2DET A; 4C8Q E; 2RD1 A; 2HKN A; 3KUF A; 1LPL A; 2WSF E; 1PRL C; 5GMK i; 1VYT A; 2BKD N; 4L5G A; 3E19 A; 3EHR A; 1D3B B; 3WVD B; 4BY6 C; 3PFS A; 2V8K A; 4Z89 A; 3CME A; 3UA7 A; 4O5V A; 3UA6 A; 5IXB A; 1K4U S; 2M9U A; 1BI1 A; 1I5L A; 1XQH A; 2KEA A; 5KYX B; 4KGX B; 5L8R E; 3M0R A; 5FW9 A; 3T9N A; 2JN0 A; 3L2Q A; 2LJ0 A; 2JXB A; 2DIQ A; 2QTX A; 3EFR A; 1B3Q A; 2DF6 A; 4NS5 A; 3QXE B; 3EAE A; 3JCM W; 2SEM A; 4WTO B; 3MKD A; 3CEY A; 4ZNX A; 2PQW A; 2FRY A; 1OUL A; 5FWC A; 4A4F A; 2OAU A; 1YI2 T; 2COZ A; 3BE3 A; 2X35 A; 3QBY A; 5GAO l; 3QG1 A; 3CBP A; 4KUI A; 1SRM A; 4M7D B; 3CCM Q; 1VIE A; 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