The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
56
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structure length |
56
|
Chain Sequence |
MTFVALYDYESRTTTDLSFKKGERLQIVNNTEGDWWLAHSLTTGRTGYIPSNYVAP
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the intertwined form of the Src tyrosine kinase SH3 domain E97T-Q128R mutant
rcsb |
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Avian sarcoma virus pr2257/16
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| molecule keywords |
Protein-tyrosine kinase
|
| total genus |
6
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-02-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3NGP A; 2DMO A; 3C0C A; 1UG1 A; 1CSK A; 1G83 A; 1V1C A; 2ABL A; 1OPK A; 3REA B; 1M30 A; 3A98 A; 1PKT A; 2CUD A; 4GLM A; 4CC4 B; 4ORZ A; 1WA7 A; 2EBP A; 3EHQ A; 1QKW A; 3M0T A; 4LE9 A; 1UJ0 A; 1K0X A; 4Z89 A; 2M51 A; 2RQW A; 1NYG A; 5GJV B; 3LH5 A; 3ZL7 C; 1MV0 B; 4RTZ A; 1AWX A; 2RMO A; 2D8H A; 3I5S A; 1ARK A; 2CSI A; 3NPF A; 1UHC A; 1GBQ A; 3EG1 A; 2DVJ A; 2MOX A; 1M3A A; 2CH4 A; 4A63 B; 4HVW A; 2J06 A; 2XMF A; 2M0Y A; 2H8H A; 4Z88 A; 2W10 A; 1X2K A; 1OOT A; 5IHN A; 4AG1 C; 2DL5 A; 2EGA A; 4J9D A; 1GBR A; 2L2P A; 2K9G A; 2HBW A; 1U06 A; 2YUN A; 2CT4 A; 2F2X A; 1NLO C; 2DBK A; 1FMK A; 2YUO A; 4OMP A; 2A28 A; 1PNJ A; 5IH2 A; 2EW3 A; 1BB9 A; 4KRT A; 1UTI A; 1QLY A; 1X6G A; 4DEX A; 4AFU C; 1WX6 A; 3O5Z A; 1RI9 A; 2KEA A; 4GBQ A; 2DNU A; 1K9A A; 1K4U S; 2EGC A; 1NEB A; 2LX7 A; 2A36 A; 1N5Z A; 1Z9Q A; 4JJD A; 2PNI A; 5FW9 A; 1JU5 C; 3EG2 A; 4J9E A; 1T3S A; 1VYV A; 1ZSG A; 1ZX6 A; 2K2M A; 3VS1 A; 1NYF A; 1WXT A; 2JMC A; 1G2B A; 3H0F A; 4Y92 A; 1TG0 A; 1W1F A; 2HDA A; 2JS2 A; 2K6D A; 3I9Q A; 2KT8 A; 1UGV A; 2ROT A; 1CKA A; 1ZUK A; 1KJW A; 2DL3 A; 2YT6 A; 5EC7 A; 2RPN A; 4RUG A; 4M4Z A; 5IHI A; 2J6F A; 1M27 C; 2G6F X; 4ZNX A; 1ZBJ A; 2J7I A; 1PRM C; 1YNZ A; 4HVV A; 2JTE A; 2CSQ A; 1AWO A; 2X3X D; 1VA7 A; 2KRN A; 3UF4 A; 1OPL A; 1M3B A; 1OV3 A; 4FSS A; 1AZG B; 1QKX A; 2PTK A; 2DF6 A; 3UA6 A; 4IIO A; 2DL4 A; 1PHT A; 1ZLM A; 5IXB A; 5GJW B; 3VS5 A; 2KT1 A; 2HCK A; 1AD5 A; 2DL7 A; 2KXC A; 2KRM A; 1PWT A; 1YCS B; 1VYT A; 1KFZ A; 1MV3 A; 4LN2 A; 2KRS A; 5IXF A; 2JW4 A; 2YUQ A; 1BU1 A; 2DBM A; 1WIE A; 3PVL A; 2SEM A; 4F14 A; 3PE0 A; 1UDL A; 3EGU A; 2K7A A; 4CC2 A; 3CQT A; 1W6X A; 4D8K A; 2L3S A; 1NG2 A; 2KRO A; 2FPF A; 4CC7 A; 1ABO A; 3M0U A; 2FG0 A; 3UA7 A; 1CKB A; 1U3O A; 3VS6 A; 2SRC A; 4JPB W; 4AG2 C; 4RTV A; 1AZE A; 3SHW A; 1HSQ A; 2EYY A; 1IO6 A; 2DRK A; 1KSW A; 4JZ3 A; 2BZY A; 2KE9 A; 4OML A; 4DEY A; 2RN8 A; 2FO0 A; 2O9S A; 2AZV A; 2ECZ A; 2GQI A; 4F17 A; 1EFN A; 1QWF A; 2RQU A; 2KYM A; 2E5K A; 2DM1 A; 2DIL A; 1JEG A; 2JXB A; 2DLP A; 4JZ4 A; 1SHF A; 2NWM A; 4LUE A; 1GCP A; 3VS7 A; 1X43 A; 2D8J A; 2DRM A; 2MCN A; 3EHR A; 4AFZ C; 2A37 A; 4OMM A; 2DA9 A; 1S1N A; 2QDL A; 1K0S A; 2B86 A; 3M0R A; 3RBB B; 2V1R A; 1WLP B; 2HEQ A; 5I11 A; 4CC3 A; 2FRY A; 1QCF A; 1WXB A; 2CH4 W; 3TSZ A; 2L0A A; 1NEG A; 4IIM A; 4K11 A; 1WYX A; 1X27 A; 3R6N A; 1JXM A; 1AWJ A; 3KFV A; 1T3L A; 1RLQ C; 1WXU A; 3M0S A; 1FYN A; 2ED1 A; 4R0K A; 1UEC A; 2EVR A; 3IQL A; 2EYZ A; 2LQN A; 2RF0 A; 3REB B; 4RTX A; 1A0N B; 1M8M A; 1KIK A; 2GBQ A; 3EG0 A; 1UE9 A; 2I0N A; 4OMO A; 3ULR B; 3VS0 A; 2BZX A; 4QT7 A; 4J9I A; 1SSH A; 1UFF A; 2X3W D; 2CRE A; 4WCI A; 1LCK A; 2LMJ A; 1AVZ C; 2AK5 A; 2GTO A; 3M0Q A; 1X2Q A; 2OJ2 A; 1NLP C; 1JQQ A; 2VKN A; 1GL5 A; 2DL8 A; 2DE0 X; 2D0N A; 1RUW A; 2BTT A; 1I1J A; 2HSP A; 5IHK A; 2EKH A; 2A08 A; 2DJQ A; 2DYB A; 1XOV A; 2L3P A; 2YUP A; 4HXJ A; 1MUZ A; 2FPE A; 1YWO A; 3JV3 A; 5FWC A; 1JO8 A; 2OAW A; 2FRW A; 2MIO A; 2GTJ A; 2D1X A; 4J9G A; 1YP5 A; 2EYX A; 3QWY A; 1PKS A; 4HVU A; 3H0I A; 2C0T A; 1WI7 A; 4RTY A; 3U23 A; 1K1Z A; 2O2O A; 3NHN A; 1K76 A; 1HJD A; 2J6O A; 4E6R A; 3GBQ A; 3THK A; 1X6B A; 4AFQ C; 4F16 A; 4J9B A; 2J6K A; 2P4R A; 2VVK A; 3RNJ A; 1SEM A; 1X69 A; 1BK2 A; 2JM9 A; 1M3C A; 1ZUU A; 2FPD A; 2LJ3 A; 2ROL A; 4ESR A; 1W70 A; 1I0C A; 2RQT A; 3QWX X; 1AEY A; 1RLP C; 4LUD A; 4EIK A; 2GGR A; 2L3Q A; 1UUE A; 3TVT A; 1H8K A; 1YN8 A; 2AZS A; 4RTU A; 2CT3 A; 3VS2 A; 2KR3 A; 2EQI A; 1TUC A; 1GCQ C; 3VS3 A; 1B07 A; 1Z9Z A; 4X1V A; 2F2V A; 3M0P A; 1QWE A; 2JM8 A; 3VRZ A; 2KXD A; 1H3H A; 1AOJ A; 1WDX A; 1VYU A; 4J9C A; 2F2W A; 1E6H A; 1PRL C; 3I35 A; 1SRM A; 2C0I A; 1T0H A; 4OMN A; 2DX1 A; 4LNP A; 3I5R A; 2RQV A; 4RTT A; 4AFS C; 1GFC A; 2EYW A; 1I07 A; 4HCK A; 2YSQ A; 2PZ1 A; 1UJY A; 1NM7 A; 2KGT A; 1AWW A; 2V1Q A; 5FWB A; 2OI3 A; 1B3Q A; 2EGE A; 2KYB A; 5L23 A; 1SRL A; 1ZUY A; 3H0H A; 5HCK A; 1J3T A; 2GNC A; 2IIM A; 3H41 A; 1UHF A; 5ECA A; 2ED0 A; 1GFD A; 2AKL A; 1ABQ A; 2KNB B; 5I22 A; 3SEM A; 2ENM A; 4JJB A; 2LCS A; 4D8D A; 2W0Z A; 1TUD A; 2VWF A; 1SHG A; 2JT4 A; 3FJ5 A; 1U5S A; 2O88 A; 4J9H A; 1OEB A; 2CUB A; 2YDL A; 1HD3 A; 2O31 A; 4Z8A A; 1GCQ A; 2CDT A; 2FEI A; 2NUZ A; 2LZ6 B; 2JS0 A; 1E6G A; 2LP5 A; 1T0J A; 2K79 A; 3TSW A; 2RQR A; 1Y57 A; 3PVQ A; 2J05 A; 3VRY A; 4RTW A; 2O9V A; 4J9F A; 2C0O A; 3NMZ C; 1JXO A; 3EG3 A; 1YWP A; 2EPD A; 2LQW A; 4JJC A; 2BZ8 A; 3UAT A; 2AKK A; 2K3B A; 2LNH B; 4OMQ A; 1SPK A; 1BBZ A; 2ESW A; 2KBT A; 1GRI A; 2LJ1 A; 1WFW A; 2RNA A; 1H92 A; 1E7O A; 1Y0M A; 2LJ0 A; 2JMA A; 3VS4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DAQ A; 3S3M A; 5KYY A; 2RH2 A; 3NGP A; 4F7U E; 1G3S A; 2DMO A; 3C0C A; 3QG1 A; 1CSK A; 1G83 A; 1M30 A; 3A98 A; 2P4T A; 3NFC A; 5CAI A; 2CUD A; 2K5I A; 1KK7 A; 2P0K A; 4PJO G; 1QKW A; 3QDF A; 1BYM A; 4TVR A; 2QG9 B; 2QEX T; 1UJ0 A; 3C4S A; 2PUK B; 2M51 A; 4M7A D; 3S3N A; 2QQA A; 3OYH A; 1WGS A; 1OX8 A; 3H6Z A; 1AWX A; 1G5V A; 2D8H A; 1Y96 B; 2CSI A; 3PTA A; 5FRM A; 3CD6 T; 4CI0 C; 1UHC A; 2MYS A; 2LQ8 A; 1M3A A; 4HVW A; 2QYZ A; 3SWN C; 2H8H A; 4EMG A; 5GAM d; 3HFO A; 2W10 A; 4OGC A; 3JB9 D; 2EWN A; 2L2P A; 4EPC A; 1QVF S; 1U06 A; 2FVU A; 4M7A G; 1Q7Y C; 2F2X A; 2CS7 A; 1VUB A; 2YUO A; 4OMP A; 2EW3 A; 1F1B B; 4FYX B; 5EG2 A; 1QLY A; 1YIT A; 3G6E T; 3AHU A; 3S3O A; 4AFU C; 3O5Z A; 3OYD A; 1K9A A; 1MNE A; 1K4U S; 1M8V A; 4M7A A; 2ZAE A; 2PNI A; 1TS9 A; 4BE2 A; 2K4Y A; 3VS1 A; 1D0X A; 1RAC B; 1UGS B; 4OF1 A; 2XDD A; 1NYF A; 3G4S A; 2JZ2 A; 1G2B A; 2NUT A; 3CCU A; 3OYM A; 1YHQ A; 1VQP T; 3QSU A; 3M5A A; 4Y92 A; 1VQO Q; 2JS2 A; 5LJ3 j; 4Y28 E; 4HKE A; 5IN1 A; 3KUF A; 3OYE A; 2NLU A; 2ROT A; 3FLG A; 2YT6 A; 4C0G A; 2WSF E; 4N0A C; 1M2O A; 1D1A A; 2XDP A; 1QP2 A; 5HK3 A; 2RPN A; 4O5V A; 2JTM A; 1VQ6 A; 5IHI A; 4E7I A; 1TSF A; 3RKX A; 3SB2 A; 4YTL A; 1M27 C; 1PRM C; 5KCH A; 5KYN A; 1NJI R; 3UF4 A; 1VA7 A; 4J8O A; 1G3W A; 5CQY A; 2X4J A; 4LD9 K; 3P8H A; 1ZSZ C; 3UA6 A; 2HSE B; 1VQN A; 2HCK A; 3E9G A; 2LCL A; 1YJ9 Q; 3JB9 H; 4E47 A; 3PT9 A; 3RKW A; 2E6Z A; 5IXF A; 4J7F A; 3CCE T; 2QQ9 A; 2YUQ A; 3JCM b; 1BU1 A; 1WIE A; 3RMQ A; 3X25 B; 3CCQ T; 1UDL A; 3OS0 A; 2K7A A; 3HRU A; 5FU7 C; 2DXB A; 1VQM Q; 1NG2 A; 2KRO A; 4QVZ A; 2RI3 A; 3OW2 A; 4PL6 A; 2HQX A; 1U3O A; 3VS6 A; 4AG2 C; 3CCM Q; 3SHW A; 1O9S A; 2EYY A; 1IO6 A; 2M1H A; 1KSW A; 3EH1 A; 2QA4 A; 3MO8 A; 2FO0 A; 2GQI A; 2JOY A; 2RQU A; 1Q82 R; 5GAO n; 2DM1 A; 3CME Q; 1Y07 A; 3CC2 A; 4JLI A; 4MZP A; 1UGQ B; 1WJQ A; 1GCP A; 3PMT A; 3VS7 A; 8ATC B; 1X43 A; 5HK0 A; 2AT1 B; 5I2S A; 2MCN A; 1Y7X A; 3EHR A; 1O75 A; 4AFZ C; 4XU1 A; 2QAS A; 4BE0 A; 1XQH A; 2Y90 A; 4ELZ C; 4OB0 B; 2B86 A; 3M0R A; 4L5G A; 2V1R A; 4M77 B; 3CXC A; 4XTY A; 1WXB A; 3JB9 I; 2E64 A; 3TSZ A; 2L0A A; 1WYX A; 5M9O A; 1N27 A; 3NTI A; 4M75 B; 4M75 F; 3JCM J; 3R6N A; 2ZPE B; 1JXM A; 1AWJ A; 2CP0 A; 3J80 E; 1OUL A; 3KFV A; 1T3L A; 1RLQ C; 1WXU A; 3M0S A; 2ED1 A; 2DJZ A; 1G3Y A; 2RJE A; 4QQD A; 4XTU A; 3VS0 A; 2MWO A; 4M78 F; 5LJ3 e; 1SSH A; 4M77 D; 2X3W D; 2CRE A; 3OBY A; 4WCI A; 2D9T A; 3L2Q A; 1QVG A; 4C92 E; 3FC3 A; 2VKN A; 1RUW A; 4XTZ A; 1I1J A; 4M7A F; 2HSP A; 2V8K A; 5IHK A; 3ZEH A; 5GAN 2; 2ZPB B; 2DJQ A; 3M4G A; 7AT1 B; 2QI2 A; 1XOV A; 3A1P A; 2K57 A; 3FEO A; 3GLX A; 2FPE A; 5GAN h; 5D6X A; 1YI2 A; 3OY9 A; 2H3J A; 2MIO A; 1K9M R; 1VQO A; 2JTF A; 2D1X A; 3V8J A; 3BY7 A; 2EYX A; 1PG5 B; 4HVU A; 1M90 R; 1ZA2 B; 2C0T A; 4M75 G; 1IRX A; 3OYF A; 4ATO A; 2RM4 A; 3JCM V; 2RHY A; 1I8F A; 2VAS A; 3LGF A; 4J9B A; 5A0D A; 4M78 G; 1SEM A; 3M55 A; 1VQ4 T; 2KMT A; 1BK2 A; 4FT4 A; 1M3C A; 1ZUU A; 2LJ3 A; 4RG2 A; 4QVC A; 2RHU A; 1YIJ T; 4M75 A; 1AEY A; 5LJ5 h; 1UUE A; 1K8A U; 4E7J A; 3VS2 A; 4VUB A; 4EDU A; 3CCL T; 1GCQ C; 3JB9 J; 4M78 A; 3RR6 A; 2A0F B; 2JUF A; 1Z9Z A; 2HL5 C; 1YJ9 A; 2JM8 A; 1N6A A; 5GAN 8; 1SF9 A; 3AT1 B; 3JRZ A; 5GMK h; 3OS2 A; 3MEU A; 4FCY A; 2HNI A; 1VQ7 Q; 2M9U A; 5DM7 R; 3QZ5 B; 1VQM A; 2F69 A; 3HRS A; 4OMN A; 2DX1 A; 4F7U B; 4F7U F; 4LNP A; 4AT1 B; 4LD6 A; 3LH0 A; 4RTT A; 1ZBX A; 4AFS C; 2XID A; 1W2B A; 4XU3 A; 2EYW A; 2KVQ G; 2YSQ A; 2PZ1 A; 5GAN 4; 1Q7Y R; 3CCM A; 2KYB A; 2DKG A; 5HCK A; 2IIM A; 1B34 B; 2ED0 A; 1GFD A; 1ABQ A; 3SEM A; 2ENM A; 4HCZ A; 2LT1 A; 5LJ3 d; 3JCM c; 1LJO A; 1RAI B; 3CME A; 2DFU A; 2RHI A; 3DKM A; 2O88 A; 3BE3 A; 1PSF A; 1BIA A; 2CKK A; 4C5G A; 2CUB A; 3A8O B; 1QMC A; 2YXY A; 1HD3 A; 2O31 A; 4Z8A A; 3JCM Q; 2NUZ A; 4QVD A; 3LW5 E; 4RG8 A; 1N8R U; 3C95 A; 2XHC A; 3RMS A; 1T0J A; 5IAY A; 3VRY A; 4RTW A; 3OW2 P; 2O9V A; 4F7U G; 3TQ7 P; 3CCV T; 1VQ8 Q; 3EG3 A; 2MPX C; 2MF2 A; 1UGR B; 2LQW A; 4JJC A; 1KC8 C; 2AKK A; 2K3B A; 3LYI A; 1QVF A; 3EGX A; 4XTW A; 4XU0 A; 3DLL A; 2ESW A; 1JBM A; 2CP5 A; 1H92 A; 3EFO B; 4M7D F; 3QXE B; 5GAO l; 3CPW S; 1HYO A; 2HBP A; 4MMK A; 3QYG B; 5HY6 A; 5GAN f; 1OPK A; 3REA B; 3L42 A; 4NL3 A; 2E3H A; 3H9N A; 1AT1 B; 3CMA Q; 3G7Z A; 2E5Q A; 4X9C A; 2L8D A; 2EBP A; 4XK8 E; 3EHQ A; 1KD1 U; 4MDX A; 3M59 A; 4ZGJ B; 1K0X A; 4Z89 A; 1IGQ A; 4V2S A; 3LH5 A; 1MV0 B; 3P8D A; 4RTZ A; 1BCM A; 2I2L A; 1K8A C; 1TU0 B; 1I81 A; 4A54 A; 3HSB A; 1RL2 A; 2MOX A; 3ME9 A; 2YHT A; 1Q81 U; 2CH4 A; 5LJ5 f; 2M0Y A; 3CPW P; 3BDL A; 4AG1 C; 5AT1 B; 2EGA A; 2WSE E; 4C5I A; 3I56 Q; 2K9G A; 1YJN Q; 4M7D G; 2HBW A; 3CC4 T; 3CC7 T; 1OZ2 A; 4ZN1 A; 1NLO C; 2DBK A; 1FMK A; 1PNJ A; 1IXD A; 2DTO A; 1VQL T; 3TCJ A; 1D0Z A; 2IVW A; 5C6S A; 5D7U A; 1D3B B; 2DNU A; 2OX7 A; 4M7D A; 2A36 A; 1D0Y A; 3EG2 A; 4J9E A; 1T3S A; 1ZSG A; 1ZX6 A; 4R55 A; 4OMF B; 3EGD B; 1WXT A; 3FB9 A; 4WTO B; 1K73 U; 4PJL A; 2VV5 A; 4DBR A; 4BDY A; 3L2Z A; 3QPH A; 2DVE A; 1TG0 A; 5GAM g; 1VQ7 A; 3I9Q A; 4LXC A; 5D6Y A; 1ZUK A; 2DL3 A; 3VKI A; 3X26 B; 2PVO B; 1VQ5 A; 1PCX A; 4RUG A; 2MK5 A; 4HT9 A; 1M1K R; 1N8R C; 3FDR A; 2JTE A; 2RA2 A; 2CSQ A; 1AWO A; 1WJR A; 1BKB A; 3JSC A; 1OV3 A; 1W2B S; 3CCS A; 4FSS A; 1S72 T; 2LTO A; 1AZG B; 2PTK A; 2ZPF B; 1KHC A; 5KYU B; 4F04 B; 2G3R A; 1TWB A; 1YJW T; 9ATC B; 2DPP B; 2DL4 A; 1PHT A; 1ZLM A; 1BI2 A; 2DL7 A; 2KXC A; 1SG5 A; 3G71 T; 2KRM A; 4O6J A; 5CVI A; 1PWT A; 1VYT A; 4KUI A; 4RCB A; 1D3B A; 4EMK A; 2RD1 A; 3WVD B; 1X01 A; 4C0F A; 2JW4 A; 3PVL A; 3JB9 F; 1G3T A; 2OTJ Q; 4E7K A; 4N4G A; 4CC2 A; 4D8K A; 2OTL T; 1W2B P; 1QCN A; 4X9D A; 4CC7 A; 1KD1 C; 1KG1 A; 5L8R E; 2CP2 A; 1C0M A; 4PLL A; 5GAN d; 4C92 F; 4C92 B; 4PJO A; 1HSQ A; 5LJ3 h; 2KE9 A; 3JCM g; 2EQU A; 4OML A; 4DEY A; 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