The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
SHMTFVALYDYVASGETDLSFKKGERLQIVNNTEGDWWLAHSLTTGRTGYIPSNYVAPSD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of a chimeric c-Src-SH3 domain with the sequence of the RT-loop from the Abl-SH3 domain at pH 6.5
rcsb |
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Gallus gallus
|
| total genus |
14
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2015-10-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3M0P A; 2ABL A; 2KYM A; 2V1Q A; 4IIM A; 1AVZ C; 1RLP C; 2EW3 A; 1WX6 A; 1PRL C; 2DL4 A; 2KT1 A; 1ZLM A; 1PRM C; 1SHG A; 4CC4 B; 2KRS A; 4ORZ A; 2DRK A; 2ENM A; 1NYG A; 2RF0 A; 1PWT A; 4D8K A; 1GCQ A; 4JPB W; 3EHQ A; 2BZX A; 3NMZ C; 2M0Y A; 2HDA A; 4F16 A; 5GJW B; 3REA B; 1W1F A; 4QT7 A; 1GRI A; 1K1Z A; 2DX1 A; 2YUO A; 1M27 C; 1SSH A; 3TSW A; 1WFW A; 5GJV B; 3LH5 A; 1G83 A; 1YCS B; 2GBQ A; 1QWE A; 1E6H A; 4EIK A; 1WIE A; 1JEG A; 1OPK A; 3I9Q A; 1NLO C; 2FPE A; 2F2X A; 2AZS A; 4RTX A; 2EYX A; 4CC7 A; 1NLP C; 2LJ0 A; 2ED0 A; 2A08 A; 2EYY A; 1BU1 A; 2EPD A; 2RN8 A; 2K2M A; 1AZE A; 1H3H A; 1B07 A; 1NEB A; 2K6D A; 2JM8 A; 3VS7 A; 4WCI A; 5IXF A; 2MIO A; 1GL5 A; 1G2B A; 2FRY A; 1UUE A; 1PHT A; 2L3Q A; 1KFZ A; 1U06 A; 3GBQ A; 2QDL A; 3QWX X; 1X2K A; 1ABO A; 2SEM A; 1SRM A; 3UAT A; 2DBM A; 2KXD A; 2L3P A; 4F17 A; 2D8J A; 1YNZ A; 3EGU A; 4IIO A; 2LCS A; 1GFD A; 2ROL A; 4LUD A; 5EC7 A; 2JXB A; 2RMO A; 2CSQ A; 4JJB A; 1QCF A; 1KJW A; 2PZ1 A; 3VRZ A; 2DE0 X; 3VS4 A; 3EG0 A; 3EG1 A; 4ZNX A; 1MUZ A; 2FPD A; 2C0T A; 1QLY A; 2OAW A; 5ECA A; 2BZY A; 3I5S A; 1WI7 A; 4LUE A; 2KBT A; 2B86 A; 2G6F X; 2JMA A; 5FW9 A; 1I0C A; 2EQI A; 2O9V A; 1K9A A; 2O88 A; 2RQU A; 4AFQ C; 3PVL A; 2L0A A; 1GBQ A; 3I35 A; 4RTT A; 1T0H A; 2A28 A; 3QWY A; 1HSQ A; 2RPN A; 1UE9 A; 1VYU A; 2J6F A; 2FPF A; 3VS3 A; 2KE9 A; 1H92 A; 2D1X A; 2W10 A; 3TVT A; 2XMF A; 2RQT A; 1VYV A; 2F2V A; 2GQI A; 4OML A; 4GBQ A; 2K79 A; 3M0Q A; 1FYN A; 1T0J A; 2AZV A; 1AWX A; 1AZG B; 1K4U S; 5I22 A; 2KRM A; 3PVQ A; 1FMK A; 2DRM A; 4J9I A; 4LNP A; 5L23 A; 2RQW A; 4D8D A; 2GGR A; 1E6G A; 1B3Q A; 1BK2 A; 4FSS A; 1WLP B; 5IXB A; 1HD3 A; 2GTJ A; 1GCP A; 1SPK A; 2HEQ A; 2JM9 A; 4J9C A; 1M8M A; 1ZSG A; 4RTZ A; 2FG0 A; 3NPF A; 4CC3 A; 2A37 A; 2W0Z A; 3VRY A; 2K7A A; 2C0O A; 3VS5 A; 1T3S A; 3EG2 A; 1I07 A; 3SHW A; 4J9H A; 2K9G A; 1GFC A; 2GNC A; 2PNI A; 3CQT A; 3M0S A; 3SEM A; 1X2Q A; 3M0U A; 4JJD A; 4OMN A; 1RLQ C; 2VWF A; 1AEY A; 2DM1 A; 1WXU A; 3H0I A; 4RTY A; 1U5S A; 1XOV A; 2EVR A; 4HVU A; 2CUB A; 1M3B A; 2O2O A; 1OOT A; 2NWM A; 1TG0 A; 2JMC A; 1UHC A; 4OMQ A; 3EG3 A; 1VYT A; 2EGC A; 1RI9 A; 4HCK A; 1UJY A; 1WA7 A; 5FWC A; 2J7I A; 2OI3 A; 3ZL7 C; 2IIM A; 4J9F A; 2CT4 A; 3KFV A; 4J9G A; 1AOJ A; 5IHK A; 2LQW A; 1HJD A; 3VS0 A; 1JQQ A; 1PKS A; 1NG2 A; 1MV3 A; 1SHF A; 1U3O A; 3RNJ A; 2H8H A; 2L2P A; 3UF4 A; 1X69 A; 2RQV A; 2LNH B; 3R6N A; 2MOX A; 2VVK A; 2D0N A; 2DL7 A; 1X27 A; 2EYW A; 3EHR A; 2CT3 A; 1T3L A; 1WYX A; 1BB9 A; 1V1C A; 4HVW A; 1UJ0 A; 2FEI A; 4OMM A; 4RTV A; 2BZ8 A; 3C0C A; 2VKN A; 2M51 A; 1SRL A; 3REB B; 1X6G A; 2EKH A; 4ESR A; 2JS0 A; 4LN2 A; 1K0X A; 2LJ1 A; 1N5Z A; 4AG1 C; 2F2W A; 2KGT A; 2FO0 A; 2DJQ A; 1OPL A; 2EGA A; 4AFU C; 1M3C A; 1QWF A; 1YP5 A; 4F14 A; 2KR3 A; 1OV3 A; 2X3W D; 1JXO A; 2LZ6 B; 4RTW A; 3TSZ A; 4E6R A; 4LE9 A; 2A36 A; 2YUN A; 4Y92 A; 1AWW A; 2RQR A; 1A0N B; 3FJ5 A; 1ZUU A; 1LCK A; 4AFS C; 1PKT A; 1QKX A; 2EYZ A; 5IHI A; 1UG1 A; 4J9E A; 1BBZ A; 2EGE A; 1M30 A; 3UA7 A; 4J9D A; 2AK5 A; 2X3X D; 4AFZ C; 2KRN A; 2NUZ A; 2HCK A; 4Z89 A; 1NYF A; 4J9B A; 2ECZ A; 2DMO A; 2YT6 A; 2P4R A; 1ABQ A; 2J06 A; 1AWJ A; 3I5R A; 2YUP A; 3H0H A; 1UTI A; 2CH4 A; 1KIK A; 1JXM A; 2YSQ A; 2EBP A; 3JV3 A; 4K11 A; 4OMO A; 2LX7 A; 2C0I A; 2DBK A; 4A63 B; 4X1V A; 3U23 A; 2KYB A; 3THK A; 1X6B A; 3PE0 A; 2CSI A; 2MCN A; 1YWO A; 4Z88 A; 2LQN A; 1E7O A; 5HCK A; 1TUD A; 2DF6 A; 4RTU A; 1UGV A; 2FRW A; 4HXJ A; 5IH2 A; 1CKB A; 4DEY A; 1AWO A; 2DL3 A; 2E5K A; 2HBW A; 3ULR B; 1GCQ C; 1JO8 A; 4CC2 A; 4HVV A; 3M0R A; 2DL8 A; 1KSW A; 1RUW A; 1UDL A; 1TUC A; 1GBR A; 2DYB A; 3VS1 A; 2LMJ A; 3NGP A; 2KXC A; 2PTK A; 2YUQ A; 1ZBJ A; 2JS2 A; 3RBB B; 1EFN A; 1I1J A; 2DNU A; 1JU5 C; 1Z9Q A; 2DL5 A; 2JTE A; 1ZX6 A; 2LJ3 A; 1WXT A; 2CH4 W; 4R0K A; 1MV0 B; 3UA6 A; 2SRC A; 2KNB B; 1W6X A; 5IHN A; 4JZ3 A; 1Z9Z A; 3H41 A; 1AD5 A; 1K0S A; 2KT8 A; 2YDL A; 2KRO A; 4GLM A; 2K3B A; 4RUG A; 2D8H A; 4Z8A A; 2GTO A; 3A98 A; 4JZ4 A; 2J6O A; 2CDT A; 3H0F A; 2LP5 A; 1QKW A; 2JW4 A; 1YN8 A; 2HSP A; 1ARK A; 2RNA A; 2AKK A; 1UEC A; 1SEM A; 1IO6 A; 1NEG A; 2ESW A; 1Y57 A; 4DEX A; 3IQL A; 1ZUK A; 1WXB A; 2DA9 A; 1UHF A; 2KEA A; 2JT4 A; 2L3S A; 2DVJ A; 1YWP A; 1X43 A; 2O9S A; 1Y0M A; 3O5Z A; 3VS6 A; 2J05 A; 5FWB A; 1PNJ A; 2O31 A; 3VS2 A; 4AG2 C; 2I0N A; 1UFF A; 2V1R A; 2BTT A; 2DLP A; 2CRE A; 2J6K A; 4M4Z A; 4KRT A; 1VA7 A; 1WDX A; 1K76 A; 1NM7 A; 3M0T A; 1M3A A; 2ED1 A; 1OEB A; 1J3T A; 2ROT A; 3NHN A; 2OJ2 A; 1ZUY A; 2CUD A; 1CSK A; 4OMP A; 5I11 A; 1CKA A; 4JJC A; 1W70 A; 2DIL A; 2AKL A; 1S1N A; 1H8K A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1YCY A; 2JN0 A; 3HFO A; 2ABL A; 4BD3 A; 1D1A A; 4IIM A; 1YJN T; 4HA8 A; 1AVZ C; 2E12 A; 1PRL C; 3JB9 F; 3LGL A; 5GMK i; 2KY9 A; 1QCN A; 3KUF A; 3EAE A; 4CC4 B; 2KRS A; 3EGX B; 1RI0 A; 4JPB W; 2QDY B; 3NMZ C; 1FMW A; 3CCS A; 2QTX A; 2QG9 B; 3HHT B; 4QQG A; 3VU3 C; 1H64 1; 1W1F A; 2I2L A; 5J3B A; 4KGV B; 1MHN A; 2YUO A; 2HKN A; 3L2Q A; 2LQK A; 1M27 C; 1SSH A; 2R57 A; 3LH5 A; 4A4E A; 2E6Z A; 3G6E Q; 4OB2 B; 3G4S Q; 3V8K A; 1M1G A; 3MET A; 4M77 E; 1E6H A; 2WSE E; 2FPE A; 2OTJ A; 1M4Z A; 1IRX A; 4RTX A; 2KQW A; 3OA6 A; 2LJ0 A; 2A08 A; 3JB9 J; 3QZ9 B; 2MPX C; 3LW5 E; 2G3R A; 1AZE A; 1H3H A; 3TRE A; 3OSV A; 1WJQ A; 2EKO A; 2LTO A; 4A4G A; 4GLK A; 3VS7 A; 4WCI A; 2YRD A; 1WHM A; 3OSS C; 2HD0 A; 4ZN1 A; 2FRY A; 3RKX A; 5GAN 4; 2SEM A; 4JLG A; 4PJJ A; 2EFI A; 5KYW B; 1LNX A; 2L3P A; 2D8J A; 2EQM A; 4B6M A; 4PJN A; 1FMV A; 3JCM d; 5GAM j; 2OTJ T; 1KJW A; 2PZ1 A; 1G3T A; 3EG0 A; 2K3Y A; 4ZNX A; 1MUZ A; 2FPD A; 1QLY A; 4E7J A; 4M78 D; 2E1H A; 2DYI A; 3CPF A; 2B86 A; 5GAN 3; 3UDC A; 4EDU A; 4AFQ C; 3V7R A; 2L0A A; 1BI1 A; 4FL6 A; 2P0P A; 2X4W A; 2RI3 A; 3I56 A; 1VQ5 Q; 1QQJ A; 2J6F A; 5KYU A; 5IT9 E; 2CP7 A; 4N4I A; 2RH2 A; 2KE9 A; 1H92 A; 3QYG B; 3PMI A; 1WHL A; 2X4X A; 4M78 G; 1M8V A; 1VYV A; 4OVA A; 3M0Q A; 5J39 A; 2AZV A; 5CQX A; 1TH7 A; 2GFU A; 5CO7 A; 1FMK A; 2PVO B; 3TCJ A; 1LJO A; 1B3Q A; 3CCJ A; 3GNF B; 1ZA2 B; 4F7U A; 4OGC A; 5LJ3 g; 3SD4 A; 1VUB A; 1QVG P; 1C0M A; 4QVD A; 5DLO A; 3SHW A; 2GNC A; 3I56 T; 3CPW S; 3CQT A; 3M0S A; 2DAQ A; 3QZ5 B; 3QYH B; 2H3J A; 2FYK A; 4R55 A; 1XOV A; 3I55 A; 4WTO B; 3HKS A; 4QQD A; 4LDV A; 5GAO m; 1OOT A; 2NWM A; 3CBO A; 1TG0 A; 1UHC A; 2RHZ A; 4PJO G; 3CCV A; 3UWN A; 4II1 A; 4QVC A; 3CMA A; 4IKF A; 4HCK A; 3PFS A; 1WA7 A; 2J7I A; 3JAM E; 4XU3 A; 4ELY C; 2CT4 A; 3X26 B; 3EG9 A; 3P8B B; 2FVU A; 2YLC A; 2RK2 A; 2LQW A; 1R8O B; 4HKE A; 2AHJ B; 1SHF A; 4DOW A; 2H8H A; 1RAE B; 2L2P A; 2JOY A; 3PNW C; 1RAH B; 3PIP A; 1TUG B; 3CCS Q; 2EIF A; 3QHS A; 3CME Q; 3JB9 I; 3NTK A; 2EYW A; 3EHR A; 1T3L A; 5LJ5 g; 3I55 T; 4HVW A; 4RTV A; 4F7U E; 2BZ8 A; 4M78 E; 3CD6 A; 2HKQ B; 1M1F A; 1SRL A; 3CCV T; 2DXB A; 4PLL A; 1UGQ B; 2JS0 A; 1K0X A; 5LJ3 d; 1N5Z A; 4AG1 C; 3RKY A; 3CCE T; 3A8G B; 2OTJ Q; 2L5Q A; 2DJQ A; 3CMA T; 2EGA A; 1D09 B; 3JCM J; 4BE0 A; 1K73 R; 4J6W A; 1VQ6 A; 1VQM A; 4J6X A; 3RUX A; 4RG2 A; 4E6R A; 5GAO n; 3TEE A; 3VKI A; 2OTL A; 1YIT A; 2O4X A; 1YIJ T; 2V8J A; 4M7A F; 4AFS C; 1PKT A; 1QKX A; 1ZBX A; 3SDZ A; 4MDX A; 1UG1 A; 3R6O A; 1BBZ A; 1M30 A; 4J9D A; 4IUV A; 2NUZ A; 3J7A F; 2DPP B; 1NYF A; 4Z89 A; 4J9B A; 3LWH A; 2LVM A; 2ECZ A; 5GAN d; 2YT6 A; 1ABQ A; 2NUT A; 3QO3 A; 3GNG A; 2YUP A; 1KG1 A; 1UTI A; 2PUO B; 1W2B S; 1KIK A; 4B9X A; 1JXM A; 5D6Y A; 3X25 B; 1Q86 R; 1VQ6 T; 1VQM T; 4OMO A; 2LX7 A; 2OTL T; 2QA4 Q; 1YIT T; 2LC4 A; 4C8Q A; 5LJ5 d; 1IGQ A; 1E7O A; 3QJY A; 5I2M A; 2MMP A; 2FRW A; 4HXJ A; 1BI3 A; 1K73 U; 4DEY A; 1AWO A; 2DL3 A; 3I56 Q; 4JS5 A; 3ULR B; 4E7L A; 3MCA B; 2DL8 A; 1M1K R; 2DYB A; 2YUQ A; 1YJW A; 3QXE B; 1LOJ A; 2DNU A; 1KHI A; 3G1J A; 1VQL Q; 4IUT A; 5CR2 A; 2LQ8 A; 1ZX6 A; 5HK0 A; 1D1B A; 2LJ3 A; 5GAM g; 2P84 A; 3T9N A; 1MMN A; 1W6X A; 3DKM A; 5D7U A; 5IHN A; 4JZ3 A; 3CCJ Q; 3OMG A; 2KT8 A; 3LX7 A; 2KRO A; 3OYY A; 2DER A; 3CEY A; 4Z8A A; 2DXT A; 2GTO A; 2E5Q A; 3H0F A; 2LP5 A; 3OYM A; 2JW4 A; 1YN8 A; 2RHI A; 2AKK A; 1Q86 U; 1UB4 A; 3LGF A; 1NEG A; 1W2B P; 1M90 R; 1K73 C; 1ZUK A; 2YLB A; 3JCM Q; 2KEA A; 4Y28 E; 4C8Q E; 2AIR B; 1YJW T; 5FU7 B; 4JS4 A; 4MDW A; 3O5Z A; 2XG8 D; 4KGZ B; 3CCV Q; 3E1S A; 1HXD A; 4AG2 C; 4JRP A; 1H3Z A; 4C5H A; 3HPW A; 1LVK A; 2BE7 D; 1M1K U; 1UEB A; 1VA7 A; 1WDX A; 3AT1 B; 1D0X A; 2ED1 A; 2PQW A; 3C4S A; 2ZCF B; 3JRZ A; 3NHN A; 1PSE A; 5KYU B; 4M7A C; 4JJC A; 6AT1 B; 1S1N A; 3GOX A; 3WVE B; 2R58 A; 4NL2 A; 4L5G A; 1Q86 C; 3CC7 Q; 4OP0 A; 2VB6 A; 4A4F A; 2EW3 A; 4M75 F; 3FLG A; 5GAM d; 3OMC A; 1KQS S; 4OB1 B; 2KT1 A; 1ZA1 B; 1YI2 A; 2O01 E; 5GMK j; 1VQ8 A; 3CD6 Q; 2DRK A; 3EH2 A; 1M90 U; 2FZK B; 3BE3 A; 2DD5 A; 4F7U B; 5LJ3 f; 1WQW A; 4E7S A; 3V7C A; 1M1K C; 1ZQ1 A; 1VQ6 Q; 1YHQ Q; 2KVQ G; 4EIK A; 1OZ3 A; 2OTL Q; 1YIT Q; 3L2U A; 2DZ9 A; 1JEG A; 1VQ4 A; 2ZGW A; 2F2X A; 4EPC A; 1WHH A; 3M55 A; 2JTM A; 2EYX A; 2Y90 A; 1OX8 A; 2A3L A; 3HFN A; 1NLP C; 2EYY A; 1BU1 A; 3E9G A; 4PFP A; 1NEB A; 4M7D F; 1UGS B; 3NTI A; 4E2F B; 3EFS A; 1YI2 T; 2JM8 A; 5GAO p; 3OBW A; 5GAN f; 1VQN A; 2MIO A; 2LT1 A; 5L8R E; 4M77 G; 1M90 C; 1PD0 A; 3EG9 B; 1JBM A; 1UUE A; 1PHT A; 3CCU T; 1KFZ A; 3QWX X; 3GBQ A; 4RKU E; 1X2K A; 1SRM A; 2V26 A; 5GAN j; 2XD0 A; 1QMC A; 4IIO A; 1YJN A; 1JB0 E; 2RHX A; 1VQ4 T; 2FZG B; 5LJ5 f; 1QW1 A; 2VAS A; 2CSQ A; 4JLI A; 2WAC A; 1QCF A; 3VRZ A; 2DE0 X; 2RJD A; 3RMQ A; 2DIQ A; 3RER A; 1OU9 A; 4WF2 A; 1KQ2 A; 3A8H B; 1UGP B; 3ASK A; 4ZN3 A; 4DBF A; 3QJ6 A; 2JUF A; 3I5S A; 2QK0 A; 2KBT A; 3V7S A; 1RAA B; 2EQI A; 1VQN T; 1R0B G; 4C0D C; 1YJW Q; 1QVP A; 5GMK l; 2O88 A; 2XDB A; 1OZ2 A; 1MMD A; 2K5F A; 3QBY A; 3I35 A; 3QWY A; 4M77 F; 1UE9 A; 2HSE B; 2O4X B; 1Y71 A; 3VS3 A; 2JJ9 A; 1BIA A; 2EQJ A; 4ZTJ A; 5CCA A; 1M2O A; 2EQU A; 2XMF A; 2RQT A; 2E3H A; 1VQO T; 4OML A; 1G3S A; 2RB6 A; 1JJ2 P; 1FYN A; 3D7S B; 1Q82 R; 2RI2 A; 4HCC A; 4KGX B; 3JCM g; 1ZSZ C; 2QYZ A; 4J9I A; 2HZY A; 2KAF A; 2NUT B; 3HRT A; 2GGR A; 1E6G A; 4M75 C; 1N9S A; 3VV0 A; 5CVI A; 2PUK B; 1WLP B; 1HD3 A; 1YJ9 A; 2JM9 A; 3S3M A; 2MK5 A; 1XJW B; 1ZSG A; 3H9N A; 4DBR A; 5CKH A; 2LT4 A; 3N5B B; 3NPF A; 4CC3 A; 3JCM b; 1SSF A; 2K7A A; 1I81 A; 1T3S A; 2HQE A; 3EG2 A; 1I07 A; 5GAO r; 1X6O A; 3EFR A; 4C8Q B; 4FCY A; 1QVF S; 1X2Q A; 3CCQ A; 3M0U A; 4JJD A; 1RLQ C; 4BUG A; 2VWF A; 4XQ3 A; 1AEY A; 1WXU A; 3H0I A; 4CI0 C; 4RTY A; 1U5S A; 2EVR A; 5FU6 B; 2L8D A; 4KBM B; 2K4Y A; 4J5Y A; 4BY6 C; 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